Том 12, № 6 (2022)

Обложка

Весь выпуск

ОБЗОРЫ

Филогенетическая структура глобальной популяции Helicobacter Pylori

Старкова Д.А., Сварваль А.В.

Аннотация

По мнению большинства исследователей Helicobacter pylori (H. pylori) является одной из самых древних бактерий в микробиоме человека. В ходе коэволюционных отношений человека и H. pylori, насчитывающих не менее 100 тыс. лет, высокая скорость адаптивных мутаций и рекомбинационных событий привели к необычайно высокому уровню геномного полиморфизма вида H. pylori. Несмотря на это, штаммы H. pylori были структурированы и разделены на различные популяции и субпопуляции в зависимости от их географического происхождения. На сегодняшний день определены семь современных популяций H. pylori: hpAfrica1, hpAfrica2, hpEastAsia, hpEurope, hpAsia2, hpNEAfrica и hspSahul, которые происходят по крайней мере от шести предковых популяций (ancestral European 1, ancestral European 2, ancestral EastAsia, ancestral Africa1, ancestral Africa2, ancestral Sahul). Многочисленные исследования позволили установить, что «прародиной» вида H. pylori является африканский континент. Глобальный филогенетический анализ последовательностей H. pylori выявил две суперлинии, одна из которых включала популяцию hpAfrica2, вторая — остальные популяции в единой монофилетической кладе. Это свидетельствует о том, что из всех популяций H. pylori, hpAfrica2 является самой древней, тогда как остальные продолжили свое эволюционное развитие по мере расселения человечества за пределы Африканского континента. Таким образом, популяционная диверсификация вида H. pylori, которая происходила параллельно с их хозяевами, позволила использовать генетические варианты H. pylori в качестве биологических маркеров, отражающих этнические и географические миграционные процессы в истории человека. Кроме того, быстрая и динамичная эволюция H. pylori информирует нас о продолжающихся до настоящего времени рекомбинационных событиях, что позволяет использовать H. pylori в качестве модели как для совместной эволюции патогенных бактерий и человека, так и для микроэволюции патогена в пределах одного индивидуума. В настоящем обзоре приводятся данные многочисленных исследований, касающихся эволюции и филогенетической структуры глобальной популяции H. pylori. Подробно описаны взаимоотношения между известными на сегодняшний день бактериальными популяциями и субпопуляциями, их географическое распределение, эволюционные траектории предковых популяций и пути появления новых субпопуляций патогена. Представлены новые данные о популяционной структуре российских штаммов H. pylori, а также штаммов, циркулирующих на территориях Северной, Центральной и Южной Америки. В ходе филогенетического анализа структуры популяции H. pylori представлена реконструкция тысячелетних миграционных и демографических процессов человека, а также сложного эволюционного пути бактериального вида H. pylori.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1009-1018
pages 1009-1018 views

Лептоспироз во Вьетнаме

Токаревич Н.К., Блинова О.В.

Аннотация

Лептоспироз представляет серьезную проблему для здравоохранения многих стран, так как в мире ежегодно около 1 млн людей болеют этой тяжелой инфекцией, часто оканчивающейся летальным исходом. В настоящее время значение этой проблемы возрастает, что связано с развитием интеграционных процессов, обусловленных глобализацией экономики, интенсификацией хозяйственной деятельности, приводящей к антропогенной трансформации ландшафтов и расширению контингента лиц, входящих в угрожаемые профессии, а также глобальными климатическими изменениями. Юго-Восточная Азия, включая Вьетнам, относится к числу самых неблагополучных в отношении лептоспироза регионов мира. Целью работы является современный анализ литературных данных о распространении лептоспирозной инфекции во Вьетнаме. В ходе данной работы было проанализировано более 100 научных статей. Это позволило констатировать, что основными источниками лептоспирозной инфекции во Вьетнаме являются синантропные грызуны (крысы), сельскохозяйственные (буйволы, крупный рогатый скот, свиньи) и домашние (кошки и собаки) животные. Существенной особенностью заражения жителей Вьетнама является употребление ими в пищу крыс, кошек и собак. Из сельскохозяйственных животных в качестве источника инфекции наибольшее значение имеют свиньи. Показатели инфицированности этих животных лептоспирами колеблются в широких пределах, достигая 73%. Значение этих показателей существенно различаются в зависимости от территории обитания животных, от размера фермы, возраста, пола свиней, от количество осадков и ряда других факторов. У свиней во Вьетнаме было выявлено большое разнообразие сероваров лептоспир среди которых преобладали Tarassovi, Bratislava, Australis, Javanica, Autumnalis, Grippotyphosa и другие. Официальная отчетность о заболеваниях лептоспирозом, основанная на клинических данных, не отражает реальное количество больных во Вьетнаме. В среднем около 10% жителей Вьетнама инфицировано лептоспирами. Работа в сельском хозяйстве является доминирующим фактором риска заражения. Наиболее высокие показатели серопревалентности к лептоспирам были выявлены у фермеров — 63,2%. Для Вьетнама характерно большое разнообразие сероваров циркулирующих лептоспир. Наиболее часто у людей выявляются антитела к лептоспирам сероваров Hebdomadis, Wolffi и Icterohaemorrhagiae, но частота их встречаемости существенно различалась между собой в разных регионах, что, можно полагать, связано с ландшафтно-климатическим своеобразием территории, а также обусловлено хозяйственной деятельностью людей. Географические, климатические и социальные различия северной, центральной и южной части Вьетнама в значительной степени определяют эпидемиологические особенности лептоспироза. Это усиливает целесообразность разработки конкретных мер профилактики этой инфекции для каждой территории с учетом их специфики.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1019-1028
pages 1019-1028 views

Эпидемиология и течение инфекционных заболеваний на фоне пандемии COVID-19. Сообщение 2. Реализация интерференции между SARS-COV-2 и возбудителями острых респираторных вирусных инфекций

Боева Е.В., Беляков Н.А., Симакина О.Е., Даниленко Д.М., Лиознов Д.А.

Аннотация

В настоящее время продолжает представлять особый интерес заболевание, вызванное новым коронавирусом (COVID-19), и возможность в условиях сложившейся эпидемической ситуации сочетанного инфицирования SARS-CoV-2 и другими патогенами. В обзоре, основанном на анализе литературных и собственных материалов, изложены особенности взаимоотношений SARS-CoV-2 и возбудителей острых респираторных вирусных инфекций (ОРВИ). Особое внимание уделено сочетанному течению COVID-19 и гриппа, сравнительной характеристике тяжести клинической картины. Оценка эпидемической обстановки на фоне пандемии COVID-19 на территории зарубежных стран и Российской Федерации (РФ) позволила выявить наличие феномена интерференции SARS-CoV-2 с другими вирусными респираторными агентами, основанного на фактах резкого угнетения циркуляции вирусов гриппа, респираторно-синцитиального вируса (РСВ) и других возбудителей ОРВИ в период активного распространения пандемического коронавируса. Сопоставлены основные эпидемиологические показатели течения коронавирусной инфекции и оценен вклад различных возбудителей в этиологию ОРВИ в ходе развития второй волны COVID-19 в РФ. Отмечено, что снижение числа новых случаев в 11,4 и летальных исходов в 2,1 раза вследствии COVID-19 на 6 и 13 неделе 2022 г. происходило при неизменных показателях лабораторного обнаружения вируса гриппа (0,8%) и увеличении частоты выявления возбудителей других ОРВИ. Результаты наблюдений показали, что на фоне снижения заболеваемости COVID-19, не последовало увеличение доли диагностированных случаев инфекций, вызванных другими патогенами, особенно гриппом. Полученные результаты подтверждают необходимость обеспечения эффективного эпидемиологического надзора и дополнительного применения методов идентификации возбудителей для мониторинга различных ОРВИ, которые могут существенно повлиять на подход к дифференциальной диагностике, на тактику ведения пациентов и принятие решения о надлежащих профилактических мерах.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1029-1039
pages 1029-1039 views

ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Особенности фенотипа NKT-клеток в зависимости от исхода распространенного гнойного перитонита

Савченко А.А., Борисов А.Г., Кудрявцев И.В., Беленюк В.Д.

Аннотация

Целью исследования было изучение особенностей фенотипа NKT-клеток у больных распространенным гнойным перитонитом (РГП) в динамике послеоперационного периода в зависимости от исхода заболевания. Обследовано 52 пациента с острыми хирургическими заболеваниями и травмами органов брюшной полости, осложнившимися РГП, и 68 здоровых людей в качестве лиц контрольной группы. Забор крови у больных производили перед операцией (дооперационный период), а также на 7-е, 14-е и 21-е сутки послеоперационного периода. В зависимости от исхода заболевания в послеоперационном периоде, все больные РГП были разделены на две группы: больные с благоприятным исходом заболевания (n = 34), пациенты с неблагоприятным исходом (n = 18). Исследование фенотипа NKT-лимфоцитов крови проводили методом проточной цитометрии с использованием прямой иммунофлуоресценции цельной периферической крови с моноклональными антителами. У обследованных пациентов с РГП независимо от исхода заболевания в дооперационном периоде понижено относительное и абсолютное содержание NKT-клеток, причем в обеих группах больных процентное количество клеток восстанавливается сразу после операции. В то же время абсолютный уровень NKT-клеток нормализуется только у больных с благоприятным исходом РГП и только к 21-м суткам после операции. К концу периода обследования у больных с благоприятным исходом РГП в периферической крови нормализуется содержание зрелых NKT-лимфоцитов и значительно снижается количество цитотоксических клеток, что, по-видимому, определяется их миграцией в зону воспаления. Только у больных с благоприятным исходом РГП пониженный уровень неклассических (экспрессирующих CD8-маркер) зрелых и цитокин-продуцирующих NKT-клеток в дооперационном периоде нормализуется до контрольных значений к концу периода послеоперационного обследования. В то же время у пациентов с неблагоприятным исходом заболевания содержание данных субпопуляций NKT-клеток к 21-м суткам послеоперационного лечения понижено. У больных с благоприятным исходом заболевания выявляется высокий уровень зрелых и цитотоксических CD11b+NKT-клеток уже в дооперационном периоде, тогда как при неблагоприятном исходе РГП повышенное содержание цитотоксических CD11b+NKT-клеток обнаружено только к 21-м суткам после операции. Содержание NKT-клеток с экспрессией активационных маркеров (CD28 и CD57), сниженное у больных в дооперационном периоде, при благоприятном исходе нормализуется сразу после операции, тогда как при неблагоприятном исходе — ближе к концу послеоперационного обследования. Установленные особенности фенотипа NKT-клеток у больных с неблагоприятным исходом РГП характеризуют нарушения в соотношении субпопуляционного состава и механизмах функционирования данной фракции клеток, что определяет необходимость разработки иммунотерапевтических методов, направленных на стимуляцию иммунорегуляторной активности NKT-клеток.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1040-1050
pages 1040-1050 views

Клеточный и гуморальный иммунный ответ после введения комбинированной векторной вакцины Гам-КОВИД-Вак

Инвияева Е.В., Вторушина В.В., Драпкина Ю.С., Кречетова Л.В., Долгушина Н.В., Хайдуков С.В.

Аннотация

В настоящее время по мере развития пандемии SARS-CoV-2 все больше внимания уделяется созданию естественного и индуцированного вакциной иммунитета против SARS-CoV-2 и вызываемого им заболевания COVID-19. Широко распространенная профилактическая вакцинация играет важную роль в эффективной защите людей от вирусных инфекций и может снизить экономические затраты государства. Целью данного исследования было изучение субпопуляционного состава периферической крови и выраженности гуморального ответа у вакцинированных комбинированной векторной вакциной Гам-КОВИД-Вак. Материалы и методы. В проспективное исследование были включены 352 пациента, из которых 194 (119 женщин и 75 мужчин) проведено исследование иммунограммы и определение уровня антител к SARS-CoV-2. У пациентов исследование субпопуляционного состава лимфоцитов и определения антител к SARS-CoV-2 было проведено дважды — до вакцинации и через 90 дней после введения 1-го компонента вакцины Гам-КОВИД-Вак. В целом вакцинация переносилась пациентами хорошо, не было отмечено серьезных побочных проявлений после иммунизации. Реакция на введение вакцины (лихорадка, недомогание, головная боль, местные реакции) чаще отмечалась после введения 2-го компонента и была кратковременной (1–2 дня). Результаты. При сравнительном анализе показателей иммунограммы у женщин до и после вакцинации было отмечено увеличение относительного содержания Т-лимфоцитов (CD3+), субпопуляции Т-хелперов (CD3+CD4+), повышение абсолютного и относительного содержания активированных T-лимфоцитов с фенотипом CD3+CD25+, снижение абсолютного и относительного содержания субпопуляций естественных киллеров (CD3CD56+CD16+), естественных киллерных Т-клеток (CD3+CD56+CD16+), а также снижение экспрессии рецептора CD147 на T-лимфоцитах. Сходные закономерности выявлены и при исследовании иммунограммы у мужчин, за исключением увеличения содержания лимфоцитов и снижения экспрессии рецептора CD147 как на T-, так и на В-лимфоцитах. Изменений в показателях Т-клеточного звена иммунитета выявлено не было. Высокая эффективность вакцины подтверждалась образованием специфических противовирусных антител класса G к SARS-CoV-2 у 97,5% вакцинированных женщин и у 92,3% вакцинированных мужчин. Выводы. Полученные данные свидетельствуют, во-первых, о том, что вакцинация индуцирует специфический гуморальный иммунный ответ, который определяется через три месяца после вакцинации, а во-вторых, не приводит к серьезным нарушениям в функционировании иммунной системы, которые могли бы найти отражение в субпопуляционном составе лимфоцитов. Таким образом, из представленных данных можно сделать вывод об эффективности вакцины Гам-КОВИД-Вак.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1051-1060
pages 1051-1060 views

Небелковая фракция секретома эмбриональных стволовых клеток обладает антибактериальным эффектом, в том числе против антибиотикорезистентных штаммов бактерий

Кайгородов Д.Г., Кайгородова А.Д.

Аннотация

В последние годы чрезвычайно актуален поиск новых возможных антибактериальных препаратов, а проблема антибиотикорезистентности и токсичность химиопрепаратов заставляет ученых обращать внимание на альтернативные противомикробные средства. Изучение применения секретома стволовых клеток, в том числе его небелковой части, является перспективной областью современной науки. В нашем исследовании было изучено влияние небелковой части секретома эмбриональных стволовых клеток на различные штаммы микроорганизмов, в том числе антибиотикорезистентные. Небелковую часть секретома стволовых клеток получали при помощи препаративной высокоэффективной жидкостной хроматографии. Тестирование бактерицидной активности производилось в отношении 8 музейных штаммов бактерий и 206 клинических штаммов микроорганизмов методом сравнения влияния секретома на рост бактериальных культур. При первичном анализе было выявлено, что на музейных штаммах в концентрации 25–100 мкг/мл исследуемый секретом имеет некоторый дозозависимый эффект. При оценке бактерицидной активности в концентрации 100 мкг/мл в отношении клинических штаммов грамотрицательных микроорганизмов разной видовой принадлежности было показана различная чувствительность штаммов к секретому, причем у некоторых штаммов обнаружена стимуляция роста. Применение более высоких концентраций 100–1000 мкг/мл не выявило дозозависимого эффекта. При этом на клинических штаммах E. coli и P. aeruginosa было показано снижение бактерицидной активности через сутки инкубации. Таким образом, проведенное исследование показало, что небелковая фракция секретома эмбриональных стволовых клеток также обладает бактерицидным эффектом. Однако требуются более детальные исследования для выявления механизма действия и определения наиболее эффективной дозы и частоты применения.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1061-1068
pages 1061-1068 views

Влияние микроскопических грибов Aspergillus fumigatus на регуляцию иммунного ответа больных бронхиальной астмой

Козлова Я.И., Фролова Е.В., Кудрявцев И.В., Учеваткина А.Е., Филиппова Л.В., Аак О.В., Тараскина А.Е., Соболев А.В., Васильева Н.В., Климко Н.Н.

Аннотация

Введение. Благодаря мелким размерам спор и термотолерантности, Aspergillus fumigatus, способны не только сенсибилизировать больных с атопией, но и колонизировать дыхательные пути, оставаясь постоянным источником аллергенов. В настоящее время роль микроскопических плесневых грибов в иммунопатогенезе бронхиальной астмы изучена недостаточно. Цель: оценить особенности регуляции иммунного ответа больных аллергическим бронхолегочным аспергиллезом (АБЛА) и бронхиальной астмой (БА) с сенсибилизацией к A. fumigatus. Материалы и методы. В исследование включили 15 больных АБЛА, 10 больных БА с сенсибилизацией к A. fumigatus, 16 больных БА без сенсибилизации к A. fumigatus. Группу контроля составили 16 условно здоровых добровольцев. Всем больным проводили клинико-функциональное обследование. Субпопуляционный состав лимфоцитов крови определяли методом проточной цитометрии. Для оценки продукции IFNγ, IL-10 и IL-13 к образцам периферической крови добавляли аллерген A. fumigatus. Иммуноферментным методом определяли содержание цитокинов в супернатантах клеточных культур, а также уровни общего IgE, специфических IgE (sIgE) к A. fumigatus, тимус-ассоциированного регуляторного хемокина (TARC) в сыворотке крови. Результаты. У больных АБЛА и БА с сенсибилизацией к A. fumigatus по сравнению с больными БА без сенсибилизации к A. fumigatus установлены значимо более высокие уровни общего IgE, sIgE к A. fumigatus и TARC в сыворотке крови. Анализ результатов иммунофенотипирования лимфоцитов выявил у всех больных БА значимое превышение показателей Th2 клеток памяти и Т-регуляторных клеток по сравнению с группой контроля. У больных с сенсибилизацией к A. fumigatus количество Tfh2 было выше, а Th17.1 клеток памяти ниже по сравнению с показателями условно здоровых добровольцев. У больных АБЛА установлены значимо более высокое количество Th2 клеток памяти и содержание TARC по сравнению с больными БА с сенсибилизацией к A. fumigatus. Усиление активности Th2 клеток памяти подтверждает повышенная секреция IL-13 и IL-10 на фоне снижения выработки IFNγ в ответ на специфическую стимуляцию клеток крови аллергеном гриба по сравнению с больными БА и группой контроля. Выявлена положительная корреляционная связь между количеством Тh2 клеток памяти и уровнями sIgE, IgE, TARC и отрицательная с ОФВ1. Заключение. Таким образом, контакт с A. fumigatus существенно усиливает активность Th2 клеток памяти у больных БА, что может приводить к тяжелому течению заболевания и формированию аллергического бронхолегочного аспергиллеза. Установленные особенности иммунного ответа диктуют необходимость персонифицированного подхода к выбору терапевтической тактики у данной категории больных.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1069-1080
pages 1069-1080 views

Серологическая структура и чувствительность к антибиотикам штаммов Salmonella, выделенных от людей и из пищевых продуктов в южных провинциях Вьетнама

Егорова С.А., Чуонг К.Н., Кафтырева Л.А., Кожухова Е.А., Макарова М.А., Куонг К.Х., Ву Х.Н., Хуонг Т.З., Лан T.К., Чам К.В., Лонг Т.Н., Диеп Т.Н., Ту Л.К., Тху Л.К.

Аннотация

В статье представлены современные данные о серогрупповой структуре и чувствительности к антибиотикам штаммов Salmonella, выделенных в южных провинциях Социалистической Республики Вьетнам. Всего исследовано 189 штаммов из коллекции Института Пастера в г. Хошимин: выделенных от людей — 86 и из свинины — 103 штамма. Штаммы идентифицировали до серовара с использованием реакции агглютинации на стекле с O- и H-сыворотками и мультиплексных ПЦР для выявления Н 1 и 2 фазы. Чувствительность к антибиотикам определяли диско-диффузионным методом согласно рекомендациям EUCAST (2019 г.). Штаммы, выделенные от людей, преимущественно принадлежали серогруппе O4 (69,8%), доля штаммов других серогрупп колебалась от 1,2% (редкая группа О16) до 11,6% (O9). Около половины штаммов (44,7%), выделенных из свинины, относились к серогруппе О3,10 (от людей — только 7,0% штаммов); штаммы серогрупп О7, О4 и О8 выделяли значительно реже (22,3%, 14,6% и 13,6%); к группам О9, О13 и О18 принадлежали единичные штаммы. Вне зависимости от источника выделения около 80,0% штаммов Salmonella были устойчивы к антибиотикам различных групп (исключая карбапенемы): 70,0% — к тетрациклинам, около половины (54,0%, 47,1% и 46,6%) — к пефлоксацину, аминопенициллинам и хлорамфениколу, почти 40% — к триметоприм/сульфаметоксазолу и налидиксовой кислоте. Доля устойчивых к цефтриаксону и гентамицину была значительно выше у штаммов, выделенных от людей, чем из свинины: 12,8% и 1,0%, 30,2% и 1,9% соответственно. Множественной резистентностью (к 3 и более группам антибиотиков) обладали 62,8% штаммов, выделенных от людей и 43,7% — из свинины. Следует отметить, что резистентность к 6 группам антибиотиков чаще выявляли у штаммов, выделенных от людей, чем из свинины (15,1% и 1,0% соответственно). Множественную резистентность отмечали у штаммов различных сероваров, но преимущественно у S. Typhimurium (36,4%). Наиболее часто встречали фенотип множественной устойчивости AMP, TE, QN, C, SXT (30,3%), выявленный у штаммов сероваров S. Typhimurium, S. Bredeney, S. Corvallis, S. Give, S. London, S. Rissen, S. Meleagridis. Таким образом, у штаммов Salmonella, выделенных в южных провинциях Вьетнама, выявлена устойчивость к современным препаратам выбора (фторхинолонам и цефалоспоринам), что, наряду с потерей чувствительности к «традиционным» антибиотикам (ампициллин, хлорамфеникол, триметоприм/ сульфаметоксазол), существенно сокращает арсенал антимикробных (этиотропных) препаратов, потенциально эффективных для терапии осложненных форм сальмонеллеза.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1081-1090
pages 1081-1090 views

Новые генетические маркеры для типирования штаммов Burkholderia pseudomallei

Леденева М.Л., Ткаченко Г.А., Захарова И.Б.

Аннотация

Burkholderia pseudomallei является возбудителем мелиоидоза — тяжелого инфекционного заболевания людей и животных, которое может длительное время не проявлять себя и быстро развиться до пневмонии и септицемии при снижении иммунитета и наличии предрасполагающих факторов. Мелиоидоз эндемичен для стран с тропическим и субтропическим климатом, где B. pseudomallei входит в состав микробиоты почвы и воды стоячих водоемов, а также ризосферы растений. Регистрация завозных случаев мелиоидоза в странах умеренного климатического пояса наряду с сохранением угрозы использования данного патогена в качестве агента биотерроризма свидетельствуют об актуальности исследований, направленных на разработку современных методов диагностики и типирования этого патогена. Тенденцией современных исследований при проведении внутривидовой дифференциации штаммов возбудителей инфекционных заболеваний является использование двух и более типов молекулярных маркеров. Перспективным направлением для генотипирования штаммов B. pseudomallei является использование комбинации VNTR-локусов, обеспечивающей высокую дискриминирующую способность метода мультилокусного анализа числа вариабельных тандемных повторов (MLVA), в сочетании с медленно эволюционирующими единичными нуклеотидными полиморфизмами (SNPs). Целью настоящей работы было выявление новых VNTR- и SNP-локусов, пригодных для использования в качестве генетических маркеров в молекулярном типировании возбудителя мелиоидоза. Объектами исследования служили 20 штаммов B. pseudomallei из коллекции ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора и полногеномные последовательности 85 штаммов B. pseudomallei из базы данных GenBank NCBI. При типировании штаммов возбудителя мелиоидоза из базы данных GenBank NCBI по 4 VNTR-локусам выявлено 74 генотипа, из которых 64 были уникальными (индекс Хантера–Гастона 0,997). Установлено, что высокий аллельный полиморфизм VNTR-локусов ограничивал возможность с помощью схемы MLVA-4 определять географические и филогенетические связи изолятов B. pseudomallei, а выявленные нуль-аллели увеличивали риск возникновения гомоплазии. В связи с этим схему MLVA-4 дополнили VNTR-маркером в составе локуса BPSS1974, кодирующего коллагеноподобный белок, и SNP-маркерами в генах лауроилацилтрансферазы биосинтеза липида-А, сигма-фактора RpoH РНК-полимеразы и глутаминамидотрансферазы. Для амплификации выбранных локусов в составе разработанной схемы сконструированы праймеры и зонды, которые апробированы при типировании коллекционных штаммов B. pseudomallei. По результатам кластерного анализа 105 штаммов возбудителя мелиоидоза оптимальным оказался комплексный подход, позволяющий на основании VNTR-профилей осуществлять дифференциацию штаммов внутри SNP-групп. Разработанный методический подход к генетическому типированию B. pseudomallei, основанный на комплексном анализе 4 SNP- и 5 MLVA-маркеров в нашей модификации, дает возможность дифференцировать штаммы в соответствии с географическими регионами их происхождения и устанавливать клональное происхождение изолятов при выявлении случаев мелиоидоза.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1091-1102
pages 1091-1102 views

Динамика клинической симптоматики и секреторного иммуноглобулина а у пациентов, перенесших коронавирусную инфекцию

Хасанова А.А., Костинов М.П., Соловьева И.Л., Никитина Т.Н., Хромова Е.А.

Аннотация

Период выздоровления от COVID характеризуется сохранением ряда симптомов, также большое значение имеют и иммунологические изменения. Разработка профилактических мер с целью нормализации мукозального иммунитета после перенесенной коронавирусной инфекции определяет актуальность проведенного исследования. Цель — изучить в динамике клиническую симптоматику и уровень sIgA у лиц после перенесенной коронавирусной инфекции и оценить эффективность применения препарата IFNa-2b. Материалы и методы. Проведено исследование пациентов от 18 до 60 лет (n = 130) с давностью после перенесенной инфекции от 1 до 9 месяцев и условно здоровых лиц, не болевших COVID-19 (n = 15). Факты о перенесенной коронавирусной инфекции и постковидных проявлениях установлены на основании медицинской документации, жалоб, данных анамнеза, физикального осмотра и анкетирования. Концентрацию sIgA в слюне и соскобах эпителия носоглотки определяли в динамике до применения местной терапии препаратом IFNa-2b (гель, интраназально 2 раза в день в течение 30 дней) и после нее. Результаты. Острый период COVID-19 характеризовался повышением температуры тела, аносмией, выраженной астенией (усталостью и слабостью), болью в мышцах и суставах. В группе ранних постковидных проявлений (1–3 мес.) достоверно чаще выявлена боль в суставах и мышцах (75,0%) и повышение температуры тела (21,2%), а в группе длительных постковидных проявлений (6–9 мес.) преобладание с одинаковой частотой одышки, мышечно-суставной боли (по 75,8%). По результатам обследования группы здоровых определена условная норма показателя секреторного IgA в слюне — 6,45±1,81 мг/мл и назальных смывах — 13,43±3,24 мг/мл. В группе ранних постковидных проявлений отмечен достоверный, более чем в 3 раза, прирост уровня секреторного IgA в слюне (с 1,84±0,28 до 5,78±1,96 мг/мл) и 1,5 раза в назальных смывах (с 28,61±3,0 до 39,83±3,85 мг/мл) спустя месяц на фоне терапии препаратом IFNa-2b. В группе больных без интерферонотерапии стойко сохраняющиеся сниженные показатели sIgA фиксируются в течение 9 мес. после перенесенной COVID-19. Так, уровень sIgA слюны определялся в значениях от 2,36±0,56 до 2,16±0,66 мг/мл, а в назальных смывах от 15,66±1,32 до 10,23±1,07 мг/мл без достоверной разницы с исходными данными. Частота респираторных заболеваний преобладала в этой группе (27,6% случаев), при полном их отсутствии у лиц, получавших препарат IFNa-2b. Заключение. В постковидный период сохраняются полиорганные нарушения и зарегистрированы сниженные показатели sIgA. Интраназальное применение препарата IFNa-2b позволило нормализовать уровень sIgA и предупредить наслоение респираторных инфекций.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1113-1122
pages 1113-1122 views

Оценка ятрогенных эффектов полипрагмазии и лекарственных взаимодействий у больных ВИЧ-инфекцией в отделении интенсивной терапии: одноцентровое ретроспективное исследование

Емероле К.Ч., Вознесенский С.Л., Самотолкина Е.С., Кожевникова Г.М., Климкова П.В.

Аннотация

Введение. Полипрагмазия и лекарственные взаимодействия вызывают особую озабоченность у людей, живущих с ВИЧ, особенно у тех, кто получает антиретровирусные препараты (АРВП). Полипрагмазия и лекарственные взаимодействия могут влиять на эффективность и безопасность антиретровирусной терапии. АРВП часто вступают во взаимодействие с другими лекарственными средствами, поскольку многие из них метаболизируются через систему цитохрома Р450. Фармакотерапия ВИЧ- инфицированных пациентов в отделении интенсивной терапии (ОИТ) обычно включает введение нескольких классов препаратов. Такая группа пациентов может подвергаться более высокому риску потенциального межлекарственного взаимодействия. Целью исследования была оценка ятрогенных эффектов полипрагмазии у ВИЧ-инфицированных пациентов, госпитализированных в ОИТ инфекционного стационара, и описание профиля лекарственных взаимодействий между АРВП и другими классами препаратов, назначаемыми в ОИТ. Материалы и методы. Проведено ретроспективное исследование историй болезни 59 ВИЧ-инфицированных пациентов, находившихся в ОИТ более 24 часов в 2018–2020 гг. в ГБУЗ ИКБ № 2 ДЗМ. Оценивалось влияние полипрагмазии на почечную, печеночную и кроветворную функции. Использовался онлайн-сервис «Ливерпульская база данных (Liverpool HIV Drug Interaction database)» для выявления различных межлекарственных взаимодействий возможных при терапии ВИЧ/СПИДа. Результаты. Все пациенты получали более 5 различных препаратов, что соответствуют определению полипрагмазии. Среднее количество одновременно назначаемых препаратов составило 15±6,713, максимум 40, минимум 6. Все зарегистрированные лекарственные взаимодействия были между АРВП и антибактериальными препаратами: зафиксировано 30 случаев потенциальных взаимодействий у 65,5% пациентов, получавших АРВП. 94% из этих пациентов подвергались как минимум двум потенциальным взаимодействиям. Сочетание тенофовира (TDF) и ванкомицина было наиболее частым зарегистрированным потенциальным взаимодействием (49,2%), за ним следовали лопинавир/ритонавир (LPV/r) и ципрофлоксацин (30,3%). Средние значение показателя креатинина было выше у пациентов, у которых наблюдалось потенциальное взаимодействие TDF и ванкомицина (345,7±45,2 ммоль/л), чем у тех пациентов, которые не получали TDF и ванкомицин (107,5±33,5 ммоль/л), p < 0,05. Выводы. Это исследование продемонстрировало, что потенциальные лекарственные взаимодействия часто возникают у ВИЧ-инфицированных пациентов в отделении интенсивной терапии, как сообщалось в других исследованиях. Необходимо осуществлять сотрудничество между клиническим фармакологом и врачом-инфекционистом, а также регулярный клинико-лабораторный мониторинг для разработки эффективных и действенных стратегий с целью снижения рисков межлекарственных взаимодействий у ВИЧ-инфицированных пациентов, получающих лечение в ОИТ.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1123-1128
pages 1123-1128 views

Изучение динамики биопленкообразования Сandida sp. в течение суток модифицированным макрометрическим методом

Николенко М.В., Барышникова Н.В., Малишевская О.И., Еноктаева О.В., Васева Е.М.

Аннотация

Целью исследования являлось изучение динамики биопленкообразования Сandida sp. в течение суток модифицированным макрометрическим методом. Предложенный макрометрический метод решает задачи по ускорению и упрощению количественной оценки процесса биопленкообразования, увеличивает чувствительность, так как позволяет исключить ошибки, связанные с использованием полистиролового материала. Простота выполнения приведенной методики делает ее доступной для любой лаборатории. Для исследования использованы эталонные штаммы из американской коллекции типовых культур (АТСС) и клинические изоляты Сandida sp., выделенные из женского репродуктивного тракта при кандидозном дисбиозе. Биопленкообразование Сandida sp. изучали по модифицированной авторами методике O’Toole G.A. и соавт. Биологическую активность пленкообразования Сandida sp. смотрели в течение двух суток с 4-часовым интервалом, в зимнее время года, IV фаза луны. Использовали 48-часовую культуру грибов, что соответствовало максимальной адгезии их на поверхности стекла. Хронодизайн исследований подразумевал получение по оцениваемой функции 6-ти измерений в сутки с 3–5-кратным повторением условий эксперимента. Для графического представления амплитудно-фазовых характеристик изученных биоритмов использован косинор-анализ, служащий базовым методом для выявления циклических процессов в биологических системах и их моделирования. В ходе исследования доказано, что способность клеток микромицетов к адгезии достоверно выше в стационарной фазе роста, чем логарифмической (р < 0,05). Используемый хронобиологический прием позволил выявить наличие пленкообразующей активности грибов в течение суток (р < 0,05) и обнаружить общие закономерности проявления свойств у представителей всех изучаемых видов. Экспериментально установлено, что последовательность и согласованность биологических свойств клинических изолятов Сandida sp. во времени принципиально не зависят от вида гриба. В ходе исследования установлены ритмометрические маркеры патогенности штамма — это вклад ритма и амплитудно-фазовая характеристика. Доказано, что активность биопленкообразования увеличивается в направлении «эталонные штаммы → клинические изоляты». Критерий Манна–Уитни у С. albicans составил 29, С. tropicalis — 26, C. krusei — 30 (р < 0,05). Использование хронобиологического метода, на наш взгляд, открывает новые перспективы при изучении физиологии Сandida sp., так как дает возможность прогнозировать динамику состояния микроорганизма и учитывать особенности срочной и долговременной адаптации к разным факторам внешней среды. Выявление суточных ритмов биопленкообразующей активности у различных штаммов Сandida sp. открывает возможность управлять жизнеспособностью бактериально-грибковых ассоциаций и прогнозировать их устойчивость к различным антимикробным средствам.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1129-1135
pages 1129-1135 views

Генотипирование возбудителей клещевых инфекций и определение видового состава клещей, нападающих на людей в Новосибирске и его пригородах

Карташов М.Ю., Кривошеина Е.И., Свирин К.А., Тупота Н.Л., Терновой В.А., Локтев В.Б.

Аннотация

Юг Западной Сибири традиционно относится к регионам с неблагополучной эпидемиологической обстановкой по инфекциям, переносимым клещами. В Новосибирске и его пригородах приблизительно 20 тыс. человек ежегодно обращаются за оказанием медицинской помощи после укуса клеща. Целью данной работы было определение видового состава клещей, атакующих человека на территории Новосибирска и его пригородов, путем определения нуклеотидной последовательности фрагментов митохондриального гена цитохромоксидазы COI клещей в течение весенне-летнего сезона 2018 г., определение инфицированности индивидуальных клещей возбудителями вирусных и бактериальных клещевых инфекций с генотипированием выявленных патогенов методами ПЦР с последующим определением нуклеотидных последовательностей и проведением филогенетического анализа секвенированных последовательностей для обнаруженных возбудителей клещевых инфекций. Установлено, что Новосибирском мегаполисе человека атакуют клещи пяти видов: Ixodes persulcatus, Ixodes pavlovskyi, Dermacentor reticulatus, Dermacentor marginatus, Dermacentor nuttali. Подавляющее число нападений на человека приходится на клещей I. pavlovskyi (43,6%) и D. reticulatus (41,2%). В клещах, снятых с человека, выявлен генетический материал вируса клещевого энцефалита в 3,6% случаев, боррелий — 13,8% и риккетсий — 23,1%. Генотипирование вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) в собранных клещах показало наличие сибирского генотипа в 83% случаев, а дальневосточного генотипа ВКЭ в 17% клещей. Вирус Кемерово обнаружить не удалось. Генетический материал боррелий и риккетсий был обнаружен во всех пяти видах клещей, атакующих местное население. Основная часть выявленных изолятов боррелий были отнесены к виду Borrelia garinii (86%) и 13% изолятов к Borrelia afzelii, а в одном клеще был обнаружен генетический материал Borrelia miyamotoi. У клещей рода Dermacentor обнаружен генетический материал Rickettsia raoultii, а клещи рода Ixodes в подавляющем числе случае были инфицированы Rickettsia tarasevichiae. Причем в единичном экземпляре клеща I. persulcatus был найден генетический материал Rickettsia helvetica. Таким образом, население Новосибирска и его пригородов атакуют иксодовые клещи пяти видов с преобладающим доминированием клещей I. pavlovskyi и D. reticulatus. В индивидуальных клещах, снятых с человека, обнаружен генетический материал следующих возбудителей клещевых инфекций: сибирского и дальневосточного генотипа ВКЭ, B. garinii, B. afzelii, B. miyamotoi, R. raoulti, R. tarasevichiae и R. helvetica.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1103-1112
pages 1103-1112 views

Корреляция уровней LP-PLA2 и моноцитов у людей с риском атеросклероза

Кумбойоно К., Чомси И.Н., Виджаядас Д., Вихастути Т.А.

Аннотация

Актуальность. Сердечно-сосудистые заболевания (ССЗ) являются наиболее серьезной причиной смертности во всем мире. От сердечно-сосудистых заболеваний умерло более 17,9 млн человек, из них 85% — от болезней сердца. С другой стороны, атеросклероз является одним из наиболее распространенных ССЗ в большинстве развивающихся и развитых стран. Lp-PLA2 является ферментом, синтезируемым воспалительными клетками, и проатерогенным белком при атеросклерозе. При этом моноциты продуцируют Lp-PLA2 для гидролиза окисленного липопротеина низкой плотности (oxLDL) в лизофосфатидилхолин (lysoPC) и окисленные жирные кислоты (oxFA), атерогенные белки, участвующие в атерогенезе. Хронический воспалительный процесс, возникающий при атеросклерозе, требует раннего выявления во избежание утяжеления ССЗ. Исследование направлено на определение корреляции между концентрацией Lp-PLA2 и количеством моноцитов, а также процентом в группах лиц, связанных с риском атеросклероза. Материалы и методы. Настоящее исследование представляло собой описательный корреляционный анализ населения с состояниями, подверженными риску атеросклероза. Общее количество лиц, отобранных в этом исследовании, составило 86. Мы использовали метод ELISA для измерения концентрации Lp-PLA2 и метод гематологического анализатора для измерения количества и процентного содержания моноцитов. Результаты. Взаимосвязь между уровнем моноцитов и Lp-PLA2 составляет значение вероятности 0,028. Коэффициент корреляции 0,789 относится к категории очень сильных. Заключение. Увеличение концентрации Lp-PLA2 коррелирует с количеством и процентом моноцитов в популяции с состояниями риска атеросклероза.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1136-1142
pages 1136-1142 views

Эффективность и безопасность трех 30-дневных курсов альбендазола у больных нейроцистицеркозом

Шинь Ц.Т., Тханг Ч.Т., Тханг Т.Д., Лой К.Б., Ань Л.Ч.

Аннотация

Альбендазол является одним из препаратов, показанных для лечения нейроцистицеркоза, однако данные об исходе лечения длительным курсом этого препарата немногочисленны. Настоящее исследование направлено на изучение эффективности и безопасности трех 30-дневных курсов альбендазола у пациентов с нейроцистицеркозом. Материалы и методы. Диагноз нейроцистицеркоза был основан на эпидемиологических, клинических и лабораторных критериях в соответствии с рекомендациями Министерства здравоохранения Вьетнама. В исследование вошли 60 пациентов мужского пола, средний возраст которых составил 50,17±10,03 года, из них 86,7% являлись лицами мужского пола (95% ДИ: 77,8–95,5%). Пациенты получали три 30-дневных курса альбендазола с перерывом в 20 дней. Дополнительное лечение включало стероиды, противосудорожные препараты или анальгетики. На основании магнитно-резонансной томографии головного мозга через 6 месяцев после терапии эффективность классифицировали как излечение (жизнеспособные кисты не были различимы), улучшение (исчезновение или кальцификация 50% и более кист) или неэффективность (изменения были зарегистрированы менее чем в 50% кист). Безопасность определяли по изменению биохимических показателей после каждого курса лечения. Результаты. Наиболее частыми клиническими проявлениями были головная боль (90,0%, 95% ДИ: 82,2–97,8), судороги (68,3%, 95% ДИ: 56,2–70,4), за которыми следовали такие симптомы как обморок, потеря памяти, онемение конечностей. Активные кисты были обнаружены во всех случаях и располагались преимущественно в паренхиме головоного мозга. После терапии частота излечения, улучшения и неэффективности составила 43,3% (95% ДИ: 30,4–56,2%), 51,7% (95% ДИ: 38,7–64,7%) и 5,0% (95% ДИ: 0–10,7%) соответственно. Показатели печеночных ферментов в сыворотке крови печени были несколько выше по сравнению с таковыми до терапии и в большинстве случаев возвращались к нормальным значениям после прекращения приема препарата. Уровень аланинаминотрансферазы перед 3-м курсом был выше, чем до первого и второго курсов. Отклонений в показателях мочевины и креатинина в крови после терапии не зарегистрировано. Выводы. Три 30-дневных цикла альбендазола характеризуются хорошей эффективностью и переносимостью у пациентов с нейроцистицеркозом.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1143-1148
pages 1143-1148 views

Оценка внедрения программ профилактики и инфекционного контроля в стационарах Армении на фоне пандемии COVID-19

Палозян Г.О., Аветисян Ш.М., Абовян Р.А., Мелик-Андреасян Г.Г., Ванян А.В.

Аннотация

Цель исследования: oпределить текущее состояние реализации в стационарах Армении ключевых аспектов профилактики инфекций и инфекционного контроля (ПИИК), определенных основными компонентами ВОЗ, с использованием инструмента опросника IPCAF (Infection Prevention and Control Assessment Framework). Материалы и методы. В исследование были включены все 113 стационаров страны. Все респонденты заполнили вопросник IPCAF, состоящий из 8 разделов (каждый оценивался максимально до 100 баллов), посвященных различным аспектам ПИИК. В зависимости от суммарной итоговой оценки программы ПИИК были разделены на следующие категории: продвинутая (601–800 баллов), средняя (401–600 баллов), базовая (201–400 баллов) и неадекватная (0–200 баллов). В ходе исследования был проведен описательный анализ общей оценки IPCAF, а также оценок соответствующих основных компонентов и некоторых отдельных вопросов, представляющих особый интерес Результаты. Суммарная средняя оценка по всем компонентам IPCAF для всех стационаров Армении в 2021 г. составляет 578,0±7,9 баллов, что на данный момент расценивается как «промежуточный» уровень. При этом 47 (41,6%) стационаров были отнесены к продвинутой, 63 (55,7%) — к средней и 3 (2,7%) — к базовой категории. Анализ по основным компонентам (CC, Core component) ПИИК выявил, что максимальные средние оценки были получены по компонентам СС2 (Руководство по ПИИК) — 80,8 баллов, СС8 (Создание безопасной среды в медицинских помещениях, а также материалы и оборудование для ПИИК) — 75,5 баллов и СС7 (Рабочая нагрузка, укомплектованность персоналом и количество койко-мест) — 75,2 балла. Наименьшие средние оценки были получены по ключевым компонентам: СС4 (Эпиднадзор за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи) — 54,7 баллов и СС3 (Образование и профессиональная подготовка по ПИИК) — 59,5 баллов. Заключение. Законодательные и практические изменения, осуществленные в реальной ситуации во время пандемии новой коронавирусной инфекции (COVID-19), внесли значительный вклад в улучшение оценок по многим ключевым компонентам программ ПИИК. Исследование показало, что IPCAF является полезным инструментом для оценки стандартов ПИИК и выявления недостатков, независимо от уровня экономического развития страны. На наш взгляд следует поощрять повторное применение IPCAF во всех медицинских учреждениях, что имеет важное значение для наблюдения за изменениями и тенденциями в ПИИК, а также разработки индивидуальных стратегий в развитии и совершенствовании ПИИК.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1149-1155
pages 1149-1155 views

КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ

Молекулярно-генетическая характеристика штамма Vibrio cholerae nono1/nono139 — возбудителя нового случая острой кишечной инфекции в Ростове-на-Дону

Монахова Е.В., Кругликов В.Д., Водопьянов А.С., Селянская Н.А., Ежова М.И., Носков А.К.

Аннотация

В Ростовской области России более 50 лет существует гетерогенная популяция холерных вибрионов неО1/неО139 (НАГ-вибрионов), представители которой периодически вызывают у людей острые кишечные инфекции; последний случай зарегистрирован в 2018 г., а 2022 г. в Ростове был снова выявлен больной ребенок, от которого выделили 2 субкультуры НАГ-вибриона. Цель исследования: биоинформационный анализ полногеномных сиквенсов (WGSs) выделенного в 2022 г. клинического штамма НАГ-вибриона, генетических детерминант факторов патогенности и продуктов их трансляции in silico. Материалы и методы. Выделение, идентификацию культур, определение антибиотикочуствительности осуществляли согласно МУК 4.2.3745-22, SNP-анализ WGSs, полученных на платформе MiSeq Illumina, — с помощью авторского программного обеспечения, для идентификации и анализа генов и продуктов их трансляции использовали программы BioEdit 7.2.5, Vector NTI Advance 11, базу данных CARD. Результаты. Выделенные культуры, идентичные по фенотипическим признакам и ПЦР-генотипам, результатам SNP-анализа, были идентифицированы как нетоксигенный НАГ-вибрион. Возбудитель проявлял чувствительность к левомицетину, цефтриаксону, стрептомицину, гентамицину, налидиксовой кислоте, ципрофлоксацину, ампициллину, амикацину и промежуточную устойчивость к тетрациклину, доксициклину, фуразолидону, ко-тримоксазолу. В WGSs отсутствовали профаги CTX, preCTX, остров патогенности VPI, гены термостабильного и cholix-токсинов, острова пандемичности VSP-I и VSP-II. Детерминанты системы секреции 6 типа (T6SS) были представлены не в полном составе, что свидетельствовало в пользу утраты ее функциональности. Выявлен интактный кластер T3SS, к которому прилегала область nan-nag острова патогенности VPI-2 при отсутствии проксимальной и дистальной частей последнего. Обнаружены кластер RTX, ответственный за синтез цитотоксина MARTX, гены гемолизина HlyA, цитотонического токсина Cef, нескольких сериновых и металлопротеаз. Большинство детерминант отличались по нуклеотидному составу от прототипов, но их продукты сохраняли характерные активные домены. Адгезивную активность могли обеспечивать не чувствительные к маннозе MSHA-подобные пили, поскольку msh-кластер содержал все необходимые для их продукции гены, а также жгутики, оба ответственных за их образование кластера были на 99% идентичны прототипу. Из детерминант антибиотикорезистентности выявлен только ген β-лактамазы VarG. Заключение. Исследуемый штамм НАГ-вибриона содержит достаточное количество интактных детерминант факторов патогенности, экспрессия которых могла внести свой вклад в развитие заболевания.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1156-1162
pages 1156-1162 views

Иммунохимическая активность ompF и ompC поринов Yersinia pseudotuberculosis, оцененная методом лазерной ловушки

Конышев И.В., Новикова О.Д., Портнягина О.Ю., Бывалов А.А.

Аннотация

Введение. Исследование особенностей взаимодействия в системе «антиген–антитело» имеет большое значение для разработки новых современных средств диагностики и терапии инфекционных заболеваний. В этой связи большой интерес представляет изучение природы связи, формируемой между бактериальными антигенами и антителами, с использованием современных биофизических методов. Одним из таких современных подходов является метод оптической ловушки, основанный на использовании лазерного пинцета. Значимость поверхностных антигенов в иммунохимической активности бактерий Yersinia pseudotuberculosis с использованием данного метода ранее не оценивалась. Целью настоящей работы явилось изучение возможности использования метода оптической ловушки для оценки взаимодействия трансмембранных белков, неспецифических поринов Y. pseudotuberculosis OmpF- и OmpC-типа, со специфическими антителами. Материалы и методы. Очищенные препараты поринов OmpF и OmpC наносили на полистирольные микросферы (d = 1 мкм) посредством пассивной адгезии; факт сенсибилизации микросфер верифицировали методом твердофазного иммуноферментного анализа комплементарных антисывороток, истощенных теми или иными микросферами. Антитела в составе мышиных сывороток сорбировали на поверхности стекла посредством химической сшивки. Определение силы связывания в системе «порины–антитела» производили с помощью лазерной ловушки согласно разработанному ранее алгоритму. Результаты. С помощью модельной системы, включающей полистирольные микросферы, сенсибилизированные поринами OmpF и OmpC, и подложку из аминированного стекла, покрытую иммунной или неиммунной сывороткой, были выявлены существенные различия в силе связывания поринов OmpF и OmpC с гомологичными антисыворотками по сравнению с неиммунной, контрольной сывороткой. Средняя сила связи при использовании иммунных сывороток составила 60 пН для микросфер «OmpF» (контроль — 40 пН) и 69 пН для микросфер «OmpC» (контроль — 49 пН). Доля необратимых связываний микросфер обоих типов с соответствующими комплементарными антисыворотками оказалась существенно выше по сравнению с использованием интактной сыворотки. Результаты оценки средней силы взаимодействия, а также преобладание доли необратимых связываний микросфер, нагруженных исследуемыми антигенами, с подложками, обработанными иммунными сыворотками, свидетельствует о том, что в сконструированной нами модельной системе специфические взаимодействия вносят значительный вклад в силу межмолекулярного связывания. Предложенный методический подход может быть применен для оценки сил межмолекулярного взаимодействия в аналогичных модельных системах с использованием иных микробных антигенов.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1163-1168
pages 1163-1168 views

Особенности структуры сообщества грибов рода Candida в кишечном биотопе больных туберкулезом

Холодов А.А., Захарова Ю.В., Отдушкина Л.Ю., Брюхачева Е.О., Пьянзова Т.В.

Аннотация

Грибы являются оппортунистическими микроорганизмами, колонизирующими все биотопы организма человека, в том числе кишечный. При возникновении неблагоприятных факторов (ВИЧ-инфекция, другие иммунодефициты, антибактериальная терапия) данные микроорганизмы начинают активное размножение, что приводит к необходимости назначения антимикотиков. Частое их применение в клинической практике индуцирует развитие лекарственной резистентности грибов к противогрибковым препаратам, что может влиять на эффективность лечения микозов. Цель исследования — оценить структуру и спектр лекарственной устойчивости грибов рода Candida в кишечном биотопе пациентов с туберкулезом органов дыхания и выявить факторы риска развития тотальной лекарственной устойчивости грибов к антимикотическим лекарственным средствам. Материалы и методы. В исследование включен 21 пациент с туберкулезом органов дыхания. В ходе исследования оценена структура видового разнообразия выделенных из фекалий грибов рода Candida, а также определен спектр их лекарственной резистентности к антимикотическим препаратам. Пациенты (n = 21) разделены на 2 группы: с тотальной резистентностью к антимикотикам (n = 10) и без нее (n = 11), после чего определены основные факторы риска ее развития. Результаты. Представители грибов рода Candida были выделены у всех включенных в исследование пациентов, при этом чистые культуры характеризовались высоким уровнем резистентности к антимикотикам. Устойчивость к трем препаратам отмечалась у 1 культуры (4,8%), к четырем — у 10 культур (47,6%), ко всем определяемым препаратам — также у 10 культур (47,6%). При статистической обработке получены данные о влиянии на формирование тотальной резистентности к антимикотикам сопутствующей патологии желудочно-кишечного тракта, наличия клинически значимого диспептического синдрома, антимикотической терапии в анамнезе, ВИЧ-инфекции с выраженным иммунодефицитом, установленным по снижению уровня CD4+ лимфоцитов в крови. Выводы. Выделенные от больных туберкулезом грибы рода Candida характеризовались высоким уровнем резистентности к антимикотикам. Тотальная резистентность при этом наблюдалась у 47,6% пациентов. Помимо того, основными грибами, колонизирующими кишечник больных туберкулезом являлись грибы вида Candida albicans. К факторам риска развития тотальной резистентности грибов к антимикотикам относились хронические энтероколиты, диспептический синдром, количество CD4+ лимфоцитов менее 350 кл./мкл, антимикотическая терапия в анамнезе.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1169-1174
pages 1169-1174 views

Полость рта как локус для формирования гетерогенной бактериальной популяции у пациентов с муковисцидозом

Кондратенко О.В., Сабурова М.С.

Аннотация

Муковисцидоз является важной медико-социальной проблемой. Несмотря на значительные успехи современной науки и практики, бактериальные осложнения по-прежнему остаются одной из основных причин летальности пациентов. Одним из значимых возбудителей бактериальной инфекции при муковисцидозе является Pseudomonas aeruginosa, способная приводить к быстрому снижению легочной функции. В то же время нижние дыхательные пути — это не единственный локус для микробной колонизации. Показана роль параназальных синусов как очага для первичного попадания и последующей адаптации клинически значимых при муковисцидозе патогенов. Полость рта также может служить резервуаром для первичного попадания и адаптации штаммов. Однако этому посвящены лишь единичные исследования. В сообщении приводится описание клинического случая выделения гетерогенной микробной популяции P. aeruginosa из различных локусов полости рта и мокроты пациента с муковисцидозом. При этом выделенные из полости рта и мокроты штаммы различались по своим культуральным свойствам и антибиотикорезистентности. Выполнен протеомный анализ масс-спектров 11 изолятов и их сопоставление между собой и контрольным штаммом P. aeruginosa ATCC 27853 с визуализацией с помощью CCI-матрицы. В результате проведенного анализа выявлен высокий уровень гетерогенности исследуемой популяции, при этом лишь для отдельных пар изолятов получены высокие значения CCI Score. Показано, что штаммы, выделенные из мокроты пациента, оказались более однородными по белковых профилям, чем культуры, выявленные с различных участков слизистой оболочки полости рта. При этом в случае выделения нескольких морфотипов P. aeruginosa из одного локуса в полости рта близкородственных штаммов выделено не было. Показано, что полость рта является более значимой с точки зрения микробной диссоциации при муковисцидозе, что может быть обусловлено более разнообразными микроэкологическими условиями. Представители микробиологического сообщества посредством микроаспирации могут реколонизировать трахеобронхиальное дерево, тем самым способствуя поддержанию инфекционного воспаления в нижних дыхательных путях и частично объясняя неэффективность небулайзерной антибактериальной терапии. В то же время и клоны, адаптировавшиеся в легочной ткани при откашливании мокроты способны реколонизировать локусы полости рта. Полученные данные актуализируют вопрос о необходимости комплексного микробиологического подхода при проведении обследования пациентов для повышения эффективности эрадикационных мероприятий при муковисцидозе.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1181-1185
pages 1181-1185 views

Влияние активации вируса Эпштейна–Барр и вируса герпеса человека 6 типа на течение и контроль бронхиальной астмы у детей Приамурья

Супрун Е.Н., Супрун С.В., Власова М.А., Кудерова Н.И., Евсеева Г.П., Лебедько О.А.

Аннотация

Роль вирусной инфекции при бронхиальной астме (БА) давно известна и отражена, в частности, в GINA. Особый интерес представляет влияние на течение БА внутриклеточных персистирующих вирусов группы герпеса. Наиболее распространенными из них являются цитомегаловирус, вирус Эпштейна–Барр (ВЭБ) и вирус герпеса человека 6 типа (ВГЧ-6). Роль цитомегаловируса рассматривалась в наших предыдущих работах, поэтому данное исследование посвящено ВЭБ и ВГЧ-6. Нами обследовано 167 детей с БА, постановка диагноза и клиническая оценка заболевания проводились согласно действующим национальным клиническим рекомендациям. Сформированы группы пациентов с контролируемой (n = 70), частично контролируемой и неконтролируемой БА (n = 97). У пациентов определялись ДНК ВЭБ и ВГЧ-6 в мазке из зева методом ПЦР; уровень IgA, IgM, IgG, IgE (общего и специфических), IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-18 и TNFα в сыворотке крови иммуноферментным методом; субпопуляции лимфоцитов — методом проточной цитометрии. Доза топического глюкокортикостероида (ТГКС) учитывалась в пересчете на эквивалент по флутиказону, функция внешнего дыхания исследовалась методом спирометрии. ДНК ВЭБ была обнаружена у 14,2% пациентов, ВГЧ-6 — у 19,0%, ДНК обоих возбудителей — у 14,4%, у 52,4% пациентов ДНК возбудителя не была выявлена. При этом у больных с неконтролируемой БА достоверно чаще (для ВЭБ 17,1% против 4,5%, для ВГЧ-6 19,5% против 13,6%) выделяют ДНК вирусов и, напротив, у детей с контролируемой БА достоверно чаще (63,6% против 51,2%) ДНК вирусов не обнаруживают. У больных с обнаруженной ДНК ВЭБ установлены более высокие уровни IL-5 и общего IgЕ — 0,91 пг/мл и 184,5 МЕ, с ДНК ВГЧ-6 — 0,29 пг/мл и 113,1 МЕ и с ДНК обоих возбудителей — 0,25 пг/мл и 371,7 МЕ соответственно по сравнению с пациентами, у которых генетический материал вирусов не определялся (IL-5 — 0,11 пг/мл и общий IgE — 95,2 МЕ). В то же время у пациентов с детектированной ДНК исследуемых вирусов отмечен более низкий уровень ОФВ1: при наличии ДНК ВЭБ — 96,6%, ВГЧ-6 — 98,8%, обоих вирусов — 106,2% против 109,8% у пациентов без обнаруженной ДНК ВЭБ и ВГЧ-6. Пациенты с обнаруженной ДНК ВЭБ и ВГЧ-6 требуют более высоких доз ТГКС для достижения контроля над заболеванием: 325,0 и 186,4 мкг соответственно, а в случае выявления ДНК обоих вирусов — 328,1 мкг против 198,6 мкг у пациентов, у которых ДНК вирусов не обнаруживалась. Таким образом, активация как ВЭБ, так и ВГЧ-6 ухудшает контроль бронхиальной астмы и утяжеляет ее течение, однако именно ВЭБ имеет более выраженное влияние на течение заболевания и контроль над ним.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1175-1180
pages 1175-1180 views

Искусственный интеллект в иммунодиагностике хронического пародонтита

Мудров В.П.

Аннотация

Искусственный интеллект используется для диагностики различных заболеваний полости рта. В области клинической лабораторной диагностики алгоритмы машинного обучения применяются в интерпретации сложных биохимических данных. Точную диагностическую информацию о пародонтите можно получить при создании комбинации соответствующих биомаркеров с необходимой чувствительностью и специфичностью. Целью настоящего исследования стал поиск значимых инфекционно-иммунологических клинико-лабораторных данных на основе алгоритма машинного обучения при хроническом пародонтите. Для этого обследовано 124 пациента в возрасте от 40 до 70 лет с диагнозом «Хронический пародонтит», которым методом ПЦР в реальном времени провели исследование кармана пародонта на ДНК вирусов герпеса человека и бактериальную пародонтопатогенную микрофлору Аggregatibacter actinomycetemcomitans, Fusobacterium nucleatum, Tannerella forsythia, Treponema denticola, Prevotella intermedia, Porphyromonas endodontalis, Porphyromonas gingivalis. Также изучались матричные РНК провоспалительных цитокинов и другие маркеры хронизации воспалительного процесса: IL-1β, IL-10, IL-18, TNFα, TLR4, GATA3, CD68. В пробе зубодесневой жидкости определяли TNFα, IFNγ, IL-1β, IL-4, IL-6, IL-10, IL-18, VEGF. Иммунные клетки ротовой полости оценивали по содержанию CD3+, CD4+, CD8+, CD3+HLA-DR+, CD64+CD16+CD14, Treg CD4+CD25+CD127+low, T-NK CD3+CD16+CD56+, NK CD3CD16+CD56+, СD14+, СD14+HLA-DR+, CD19+, CD19+HLA-DR+, B1 CD19+CD5+B27, B2 CD19+CD5B27, CD19+CD5B27+. Для оценки данных использовалось машинное обучение «random forest». Была выявлена связь между патогенной микрофлорой и характером иммунного ответа. Преобладал провоспалительный компонент, выраженный в экспрессии мРНК IL-1β, TNFα, IFNγ в иммунном ответе на агрессивные пародонтопатогены: Treponema denticola, Fusobacterium nucleatum и др. Алгоритм машинного обучения «random forest» выбрал из множества данных корреляционные отношения r ≥ 0,5 (как положительные, так и отрицательные) для проведения дальнейшего анализа оператором. Модель машинного обучения «random forest» на 10% с учителем показала следующие значимые сочетания данных: VEGF, CD3+, CD14+HLA-DR, CD19+CD5CD27+, а также мРНК TLR4, IL-1b, IL-10, TNFa, IL-18. Развитие примененной модели «random forest» машинного обучения с учителем уже на 25% показала отличия: P. endodontalis, GATA3, CD3+, CD14+, CD19+CD5CD27+, а также мРНК TLR4, TNFa, IL-1b, IL-10, IL-18. Поиск значимых инфекционно-иммунологических клинико-лабораторных данных на основе алгоритма машинного обучения при хроническом пародонтите показал значимость в развитии остеодеструктивного воспалительного процесса мРНК провоспалительных цитокинов, моноцитов, Т-лимфоцитов и В-клеток памяти. Для поиска взаимосвязей инфекционного иммунопатологического процесса может применяться машинное обучение с учителем на базе модели «random forest», что позволяет статистически обрабатывать большие массивы данных и выявлять неявные причинно-следственные факторы.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1186-1190
pages 1186-1190 views

Патоморфологические признаки острого респираторного дистресс-синдрома при конкурирующих заболеваниях легких: COVID-19 и саркоидоз

Воробьева О.В., Гималдинова Н.Е., Романова Л.П.

Аннотация

Пандемия COVID-19 является проблемой мирового масштаба. Клинический спектр инфицирования SARS-CoV-2 варьирует от бессимптомных или малосимптомных форм до таких состояний, как пневмония, острый респираторный дистресс-синдром (ОРДС) и полиорганная недостаточность. В статье приведено описание клинического случая инфицирования SARS-CoV-2 на фоне саркоидоза легких и сердечно-сосудистой патологии с развитием ОРДС и отека легких. Материалы и методы. Проведен анализ полученной сопроводительной медицинской документации (амбулаторная карта пациента, история болезни), клинико-морфологический анализ (описание макро- и микропрепаратов). Результаты. При гистологическом исследовании в легких выявлялись признаки диффузного альвеолярного повреждения в виде гиалиновых мембран, выстилающих и повторяющих контуры стенок альвеол. В стенках альвеол выявляются участки некроза, десквамация альвеолярного эпителия в виде разрозненных клеток или пластов, кровоизлияния и гемосидерофаги. В просвете альвеол определялся слущенный эпителий с геморрагическим компонентом, немногочисленные многоядерные клетки, макрофаги, белковые массы, скопление отечной жидкости. Легочные сосуды умеренно полнокровные, окружены периваскулярными инфильтратами. Выявлялись признаки саркоидоза легких. При гистологическом исследовании определялись эпителиоидно-клеточные гранулемы, состоящие из мононуклеарных фагоцитов и лимфоцитов, без признаков некроза. Определялись гранулемы с пролиферативным компонентом, с участками кровоизлияний. Выявлялись гигантские клетки с цитоплазматическими включениями — астероидные тельца и тельца Шаумана. В лимфатических узлах корней легких определялись неказеозные гранулемы, состоящие из скоплений эпителиоидных гистиоцитов и гигантских клеток Лангханса, окруженных лимфоцитами. В зонах периферических синусов лимфоузлов внутри гигантских клеток встречались тельца Хамазаки–Везенберга. В просвете бронхов обнаружен тотально слущенный эпителий, слизь. На слизистой оболочке, преимущественно субэндотелиально, определяются гранулемы, без казеозного некроза. При гистологическом исследовании сердца выявлялась фрагментация некоторых кардиомиоцитов, очаговая гипертрофия кардиомиоцитов с умеренным межуточным отеком, эритроцитарными сладжами, определялись зоны мелкоочагового склероза. Сосуды микроциркуляторного русла — малокровные, с гипертрофией стенок мелких артерий и артериол. При вирусологическом исследовании секционного материала в легких обнаружена РНК SARS-CoV-2. Заключение. Из данных медицинской документации и результатов патологоанатомического исследования следует, что причиной смерти больного Р.А., 50 лет стала новая коронавирусная инфекция COVID-19, вызвавшая двухстороннюю тотальную вирусную пневмонию. Наличие конкурирующих болезней, таких как саркоидоз легких и сердечно-сосудистые заболевания, усугубили течение болезни, привели к развитию раннего ОРДС и, в конечном итоге, к летальному исходу.

Инфекция и иммунитет. 2022;12(6):1191-1196
pages 1191-1196 views


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах