<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="brief-report" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">1992</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-TOC-1992</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT COMMUNICATIONS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Short Communication</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">The oral cavity as a site for developing a heterogeneous bacterial population in patients with cystic fibrosis</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Полость рта как локус для формирования гетерогенной бактериальной популяции у пациентов с муковисцидозом</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-7750-9468</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="scopus">5719485453</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="researcherid">DNW-4596-2022</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">9605-3821</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kondratenko</surname><given-names>Olga V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Кондратенко</surname><given-names>Ольга Владимировна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Associate Professor, Department of General and Clinical Microbiology, Immunology and Allergology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., доцент кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии</p></bio><email>o.v.kondratenko@samsmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Saburova</surname><given-names>Maria S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Сабурова</surname><given-names>Мария Сергеевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Assistant Professor, Department of Therapeutic Dentistry</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>ассистент кафедры терапевтической стоматологии</p></bio><email>m.s.saburova@samsmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Samara State Medical University of the Ministry of Healthcare of the Russian Federation</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Самарский государственный медицинский университет Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2022-09-06" publication-format="electronic"><day>06</day><month>09</month><year>2022</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2022-12-30" publication-format="electronic"><day>30</day><month>12</month><year>2022</year></pub-date><volume>12</volume><issue>6</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>1181</fpage><lpage>1185</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2022-06-29"><day>29</day><month>06</month><year>2022</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2022-08-18"><day>18</day><month>08</month><year>2022</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2022, Kondratenko O.V., Saburova M.S.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2022, Кондратенко О.В., Сабурова М.С.</copyright-statement><copyright-year>2022</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Kondratenko O.V., Saburova M.S.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Кондратенко О.В., Сабурова М.С.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/1992">https://iimmun.ru/iimm/article/view/1992</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Cystic fibrosis is an important medical and social problem. Despite significant advances in modern science and practice, bacterial complications are still among the main causes of patient mortality. One of the crucial bacterial pathogens in cystic fibrosis is <italic>Pseudomonas aeruginosa</italic>, which can lead to rapidly decreased pulmonary function. At the same time, the lungs are not the only site for microbial colonization. The oral cavity can also serve as a reservoir for initial entry and adaptation of microbial strains, which, however, were only sparsely investigated. A clinical case of isolated heterogeneous microbial population of <italic>P. aeruginosa</italic> from various loci of the oral cavity and sputum of a patient with cystic fibrosis is described. A proteomic mass-spectrum analysis obtained from eleven isolates as well as their mutual comparison with the control strain of <italic>P. aeruginosa</italic> ATCC 27853 visualized with CCI matrix was performed. As a result, a high level of heterogeneity of the studied population was revealed, while high CCI Score values were obtained only for individual pairs of isolates. It was shown that the bacterial strains isolated from the patient sputum turned out to be more homogeneous in protein profiles than cultures detected from various oral sites. At the same time, in case of isolated several morphotypes of <italic>P. aeruginosa</italic> from single oral site, no closely related strains were found. Thus, it is shown that the oral cavity is more important viewed from microbial dissociation in cystic fibrosis, which may be due to more diverse microecological conditions. Representatives of the microbiological community can recolonize the tracheobronchial tree through microaspiration, thereby contributing to the maintenance of infectious inflammation in the lower respiratory tract and partially accounting for ineffectiveness of nebulized antibacterial therapy. At the same time, clones adapted to the lung tissue upon coughing up sputum are able to colonize oral sites. The data obtained actualize the question of the need for a comprehensive microbiological approach while examining patients to increase effectiveness of eradication measures in cystic fibrosis.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Муковисцидоз является важной медико-социальной проблемой. Несмотря на значительные успехи современной науки и практики, бактериальные осложнения по-прежнему остаются одной из основных причин летальности пациентов. Одним из значимых возбудителей бактериальной инфекции при муковисцидозе является <italic>Pseudomonas aeruginosa</italic>, способная приводить к быстрому снижению легочной функции. В то же время нижние дыхательные пути — это не единственный локус для микробной колонизации. Показана роль параназальных синусов как очага для первичного попадания и последующей адаптации клинически значимых при муковисцидозе патогенов. Полость рта также может служить резервуаром для первичного попадания и адаптации штаммов. Однако этому посвящены лишь единичные исследования. В сообщении приводится описание клинического случая выделения гетерогенной микробной популяции <italic>P. aeruginosa</italic> из различных локусов полости рта и мокроты пациента с муковисцидозом. При этом выделенные из полости рта и мокроты штаммы различались по своим культуральным свойствам и антибиотикорезистентности. Выполнен протеомный анализ масс-спектров 11 изолятов и их сопоставление между собой и контрольным штаммом <italic>P. aeruginosa</italic> ATCC 27853 с визуализацией с помощью CCI-матрицы. В результате проведенного анализа выявлен высокий уровень гетерогенности исследуемой популяции, при этом лишь для отдельных пар изолятов получены высокие значения CCI Score. Показано, что штаммы, выделенные из мокроты пациента, оказались более однородными по белковых профилям, чем культуры, выявленные с различных участков слизистой оболочки полости рта. При этом в случае выделения нескольких морфотипов <italic>P. aeruginosa</italic> из одного локуса в полости рта близкородственных штаммов выделено не было. Показано, что полость рта является более значимой с точки зрения микробной диссоциации при муковисцидозе, что может быть обусловлено более разнообразными микроэкологическими условиями. Представители микробиологического сообщества посредством микроаспирации могут реколонизировать трахеобронхиальное дерево, тем самым способствуя поддержанию инфекционного воспаления в нижних дыхательных путях и частично объясняя неэффективность небулайзерной антибактериальной терапии. В то же время и клоны, адаптировавшиеся в легочной ткани при откашливании мокроты способны реколонизировать локусы полости рта. Полученные данные актуализируют вопрос о необходимости комплексного микробиологического подхода при проведении обследования пациентов для повышения эффективности эрадикационных мероприятий при муковисцидозе.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>cystic fibrosis</kwd><kwd>oral cavity</kwd><kwd>sputum</kwd><kwd>Pseudomonas aeruginosa infection</kwd><kwd>mass-spectrometry</kwd><kwd>heterogeneity</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>муковисцидоз</kwd><kwd>полость рта</kwd><kwd>мокрота</kwd><kwd>синегнойная инфекция</kwd><kwd>масс-спектрометрия</kwd><kwd>гетерогенность</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Красовский С.А., Амелина Е.Л., Каширская Н.Ю., Воронкова А.Ю., Зоненко О.Г. Динамика показателей национального регистра больных муковисцидозом за 2011–2017 года // Сибирское медицинское обозрение. 2019. № 2 (116). С. 14–18. [Krasovsky S.A., Amelina E.L., Kashirskaya N.Yu., Voronkova A.Yu., Zonenko O.G. Dynamics of indicators of the national register of patients with cystic fibrosis for 2011–2017. Sibirskoe meditsinskoe obozrenie = Siberian Medical Review, 2019, no. 2 (116), pp. 14–18. (In Russ.)] doi: 10.20333/2500136-2019-2-14-18</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Сиянова Е.А., Чернуха М.Ю., Аветисян Л.Р., Шагинян И.А., Прилипов А.Г., Усачев Е.В., Кондратьева Е.И., Припутневич Т.В., Гордеев А.Б., Каширская Н.Ю., Капранов Н.И., Ильенкова Н.А., Красовский С.А., Шерман В.Д., Воронкова А.Ю., Амелина Е.Л., Усачева М.В. Мониторинг хронической инфекции легких у больных муковисцидозом, вызванной бактериями Pseudomonas aeruginosa // Педиатрия. Журнал им. Г.Н. Сперанского. 2018. Т. 97, № 2. С. 77–86. [Siyanova E.A., Chernukha M.Yu., Avetisyan L.R., Shaginyan I.A., Prilipov A.G., Usachev E.V., Kondratieva E.I., Priputnevich T.V., Gordeev A.B., Kashirskaya N.Yu., Kapranov N.I., Ilyenkova N.A., Krasovsky S.A., Sherman V.D., Voronkova A.Yu., Amelina E.L., Usacheva M.V. Monitoring of chronic lung infection in patients with cystic fibrosis caused by Pseudomonas aeruginosa bacteria. Pediatriya. Zhurnal im. G.N. Speranskogo = Pediatrics. The journal named after G.N. Speransky, 2018, vol. 97, no. 2, pp. 77–86. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Coffey N., O’ Leary F., Burke F., Roberts A., Hayes M. Periodontal and oral health status of people with cystic fibrosis: a systematic review. J. Dent., 2020, vol. 103: 103509. doi: 10.1016/j.jdent.2020.103509</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Hansen S.K., Rau M.H., Johansen H.K., Ciofu O., Jelsbak L., Yang L., Folkesson A., Jarmed H.O., Aanaes K., von Buchwald C., Hoiby N., Molin S. Evolution and diversification of Pseudomonas aeruginosa in paranasal sinuses of cystic fibrosis children have implications for chronic lung infection. ISME J., 2012, vol. 6, no. 1, pp. 31–45. doi: 10.1038/ismej.2011.83</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
