Том 8, № 4 (2018)

Резюме. В статье приведены ранее не публиковавшиеся архивные данные и копии документов о первом директоре Петроградского Бактериологического Института имени Пастера (ныне — Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера) Якове Юльевиче Либермане. На основании личных показаний Я.Ю. Либермана, Петра Петровича Маслаковца и Георгия Дмитриевича Белоновского (учредителей и организаторов Института), содержащихся в фондах архива УФСБ РФ по г. Санкт-Петербургу и Ленинградской области, а также с учетом Акта комиссии по обследованию Института от декабря 1930 г., представленного в статье, прослеживается путь преобразований, которые претерпел Институт со дня своего основания. Эти данные проиллюстрированы копиями объявлений об Институте, содержащихся в справочниках «Весь Петербург» за 1910, 1911, 1912, 1914, 1923, 1924, 1925 гг. (из фондов Российской национальной библиотеки). В статье также приведены копии служебной документации, датированные 1913 и 1914 гг. и хранящиеся в фондах Центрального государственного исторического архива Санкт-Петербурга. Представленные документы фактически устанавливают, что датой создания Института является 1908 г.

Резюме. Пиразинамид (PZA) уникален тем, что является противотуберкулезным препаратом первого ряда как при лечении лекарственно-чувствительного туберкулеза, так и компонентом современных курсов лечения мультирезистентного туберкулеза. Также было показано, что PZA помогает обеспечить длительное лечение и предотвратить рецидив в более коротких схемах приема нескольких лекарств. Пиразинамид является неактивным пролекарством и фермент PncA Mycobacterium tuberculosis превращает его в активную форму — пиразиноевую кислоту (POA). Большинство клинических PZA-резистентных штаммов содержат мутации внутри гена pncA и поэтому остаются восприимчивыми к POA, поскольку не активируют PZA. Устойчивость к активному соединению POA требует альтернативного механизма резистентности, и полученные in vitro POA-резистентные спонтанные мутанты MTB имеют ряд мутаций в гене panD или в серии генов, большинство из которых связаны с регуляцией строгого ответа бактерий. Клинические штаммы MTB, устойчивые к PZA и POA с мутациями в любом из этих генов, являются нетипичными. Таким образом, вероятно, строгий ответ имеет важное значение для MTB в условиях in vivo, а нарушенный ответ приводит к снижению жизнеспособности микроорганизма. Были идентифицированы различные лекарственные соединения-прототипы, нарушающие строгий ответ MTB, которые могут стать основой для препаратов с активностью против латентных форм микобактерий с целью сокращения сроков противотуберкулезного лечения. В данном обзоре мы обсуждаем роль латентного периода в жизненном цикле MTB и возможные связи с активностью PZA с особым вниманием к потенциально новым мишенями и препаратам.

Резюме. Mycobacterium avium subsp. hominissuis является наиболее актуальным возбудителем микобактериоза человека. За последние несколько десятилетий в Италии заболеваемость микобактериозом M. avium subsp. hominissuis растет, как и во многих странах мира. Целью исследования была молекулярно-генетическая характеристика и оценка генетического родства штаммов M. avium subsp. hominissuis, выделенных от больных микобактериозом в Италии, с использованием VNTR (variable number of tandem repeats)-типирования. Аллельный полиморфизм 108 штаммов M. avium subsp. hominissuis оценивали методом VNTR-типирования по 8 локусам — 32, 292, X3, 25, 3, 7, 10 и 47. С помощью VNTR-типирования было выявлено 25 вариантов VNTRтипов; из них 13 профилей были уникальными, а 12 профилей представлены кластерами (включающими 2 и более изолятов), в состав которых входило 95 изолятов. Дискриминирующая способность VNTRтипирования (индекс Хантера–Гастона, Hunter Gaston discriminatory index) составила 0.990, что указывает на высокую дискриминирующую способность использованной схемы VNTR. Связи между профилем VNTR и клинической формой микобактериоза (генерализованная, легочная или внелегочная) не обнаружено. Анализ минимального связывающего дерева профилей VNTR показал, что 21 VNTR-тип (как уникальные изоляты, так и кластеры двух и более изолятов) входили в единый клональный комплекс в котором соседние узлы различались по одному локусу. Полученные результаты VNTR-типирования выявили близкое родство изученных штаммов M. avium subsp. hominissuis. Высокий уровень филогенетического родства по локусам VNTR для штаммов, выделенных в течение длительного периода, подтверждает концепцию о том, что M. avium subsp. hominissuis очень гомогенен в нашей географической области в Италии, что, в свою очередь, подкрепляет гипотезу о наличии возможных источников инфекции и путей ее передачи на местном уровне.

Резюме. Энтеровирусы — мелкие РНК-содержащие вирусы, которые распространены повсеместно и регулярно становятся причиной вспышек заболеваемости с различной симптоматикой. В Российской Федерации с 2006 г. действует надзор за энтеровирусами. За эти годы в России и в мире были отработаны молекулярно-биологические и биоинформатические инструменты для изучения эпидемиологии энтеровирусов. В настоящее время идентификация энтеровирусов в мире осуществляется практически исключительно на основании анализа нуклеотидной последовательности области генома VP1 (около 900 нуклеотидов). При этом в рутинной работе определяется только фрагмент этой области генома (около 300 нуклеотидов). В большинстве случаев этого достаточно, чтобы достоверно типировать вирус, однако точность анализа короткого участка генома ниже, и достоверным критерием типа для короткого фрагмента следует считать 80% сходства нуклеотидной последовательности, а не 75%, как в случае полной области генома VP1. Для даль нейшего анализа полученных нуклеотидных последовательностей в настоящее время широко применяются Байесовы филогенетические методики, которые позволяют использовать метод молекулярных часов в расследовании вспышек заболеваемости. Энтеровирусы накапливают порядка 0,5–1% нуклеотидных замен в год, поэтому даже короткий фрагмент генома позволяет анализировать филодинамику вирусов на уровне передачи между странами или смены циркулирующего варианта вируса. На более короткой временной шкале короткий фрагмент ограниченно пригоден для изучения молекулярной эпидемиологии, поскольку позволяет достоверно различать не более 1–2 случаев передачи вируса в год. Таким образом, для расследования вспышек желательно определение нуклеотидной последовательности полной области генома VP1 или полногеномной последовательности. В результате анализа имеющихся в базах данных нуклеотидных последовательностей энтеровирусов все более очевидными становятся ограничения, связанные с неравномерной эффективностью надзора в разных странах мира и короткой длиной фрагмента генома, определяемой при рутинном надзоре. Как следствие, полноценный анализ молекулярной эпидемиологии энтеровирусов в глобальном масштабе остается проблематичным. Количество известных нуклеотидных последовательностей энтеровирусов за последние 20 лет выросло в сотни раз, однако понимание закономерностей возникновения вспышек энтеровирусной инфекции практически отсутствует. Эффективное развитие надзора за энтеровирусами потребует внедрения новых методов исследования сточных вод, экономически эффективного высокопроизводительного секвенирования, гармонизации систем надзора в разных странах мира.

Резюме. Активизация вирусов гриппа в сезон 2017–2018 гг. началась значительно позже в сравнении с пятью предшествующими сезонами. Эпидемия гриппа продлилась в течение 12 недель (с 6 по 17 неделю), имела среднюю интенсивность с вовлечением 10,4% населения страны. Дети возрастных групп 0–2 и 3–6 лет, как обычно, болели наиболее часто. Средняя частота госпитализации пациентов с гриппом и ОРВИ составила 2,6% и была наиболее высокой (5,4%) в младшей возрастной группе (0–2 лет). Число смертельных исходов при гриппе в этом сезоне было в 2 раза выше, чем в сезон 2016–2017, что может быть объяснено распространением вирусов гриппа A(H1N1)pdm09, которые, по-прежнему, являются основной причиной летальных исходов при гриппе в стране. Всего за сезон в 55 сотрудничающих региональных базовых лабораториях было обследовано с помощью ОТ-ПЦР в реальном времени 72 759 пациентов. Грипп был лабораторно подтвержден с помощью ПЦР в 12 149 (20,7%) случаях, из числа которых 39,3% составили вирусы гриппа A(H1N1)pdm09, 29,6% — A(H3N2) и 31,1% — вирусы гриппа B (Ямагатской линии). Первые случаи гриппа были зарегистрированы в самом начале сезона (недели 40–45.2017), однако отчетливое увеличение частоты их детекции было установлено лишь на 2 неделе 2018 г. с пиком на 13–14 неделях и последующим постепенным снижением вплоть до конца сезона. Выявлены определенные отличия в этиологии гриппозной заболеваемости между федеральными округами. Определена роль вирусов гриппа и других возбудителей ОРВИ на разных стадиях эпидемического процесса. Так, в предэпидемический период рост заболеваемости был обусловлен, в основном (около 32,7% случаев) не гриппозными вирусами, в особенности риновирусами и респираторно-синцитиальным вирусом (10,2 и 8,0% случаев соответственно), тогда как лабораторно подтвержденные случаи гриппа (ЛПГ) регистрировались лишь в 3,4%. В период эпидемии частота ЛПГ увеличилась до 29,2% при одновременном снижении частоты заболеваний парагриппозной, аденовирусной, бокавирусной, коронавирусной и, особенно, риновирусной этиологии, в меньшей степени снизилась частота инфекции, вызванной респираторно-синцитиальным вирусом. В постэпидемический период роль вирусов гриппа A(H1N1)pdm09, A(H3N2) и В снизилась до 6,1; 6,9 и 3,6% соответственно, с увеличением значимости риновирусной инфекции (до 9,5% заболеваний). Антигенный и генетический анализ вирусов гриппа A(H1N1)pdm09 и A(H3N2), циркулировавших в сезон 2017–2018 гг., показал, что все проанализированные вирусы гриппа А, в отличие от вирусов гриппа В, по структуре поверхностных генов, соответствовали штаммам, введенным в состав вакцин для Северного полушария на сезон 2017–2018 гг. Вместе с тем, во внутренних генах циркулирующих вирусов был обнаружен ряд замен. Контроль чувствительности 316 вирусов гриппа А и В к противовирусным препаратам показал, что абсолютное большинство из них (99.7%) сохранили свою чувствительность к ингибиторам нейраминидазы.

Резюме. В связи с возросшей частотой выделения изолятов грамотрицательных микроорганизмов, резистентных к карбапенемам, важным остается поиск способов усиления действия этого класса антибиотиков. Одним из возможных способов решения этой проблемы является комбинация карбапенемов с препаратами — ингибиторами металло-бета-лактамаз (МБЛ). К сожалению, в настоящее время разрешенных для применения в клинике ингибиторов МБЛ карбапенемрезистентных микроорганизмов. Патогенные микроорганизмы могут переживать антибиотическую атаку, проявлять свойства толерантности и персистенции, при этом инфекционный процесс продолжается. В связи с этим важно определение зависимости между бактерицидным действием антимикробных средств и временем экспозиции их воздействия на микроорганизм не в одной временной точке через 24 ч инкубации, а в нескольких — через 4, 8, 12 и 24 ч, так называемая кривая зависимости «время — летальное действие» (time-kill assay). Синергидный эффект двух препаратов отмечается при условии снижения уровня микробной популяции на ≥ 3 log10. Для оценки эффективности синергидного действия карбапенемов и клодроновой кислоты использовали микрометод перекрестного титрования («шахматной доски») с последующим высевом содержимого ячеек на плотную питательную среду в разные временные промежутки. Исследования проводили в отношении клинического штамма Pseudomonas aeruginosa 532/14, выделенного от пациентов с инфекционными осложнениями, продуцирующего МБЛ генотипа VIM и характеризующегося высокой степенью резистентности к карбапенемам (МПК имипенама или меропенема 512 мкг/мл); микробная нагрузка 106 КОЕ/мл. На ридере ELx800 проводили измерение оптической плотности при двух длинах волн (490 и 630 нм) при экспозициях от 4 до 24 ч и выявляли время появления логарифмичес кой фазы роста тест-культуры. Следует отметить, что при бихроматическом измерении значение оптической плотности является разницей двух измерений, при этом значительно снижается погрешность результатов, вызванная царапинами или отпечатками пальцев на планшете. В исследовании показана способность клод роновой кислоты проявлять синергидный бактерицидный эффект с карбапенемами в отношении клиничес кого резистентного штамма P. aeruginosa 532/14, продуцирующего металло-бета-лактамазу генотипа VIM. При этом в таком сочетании антимикробное действия у имипенема начинается с 8 часов инкубации до уровня 1,4 log10 по сравнению с контролем, а с 12 ч отмечено полное подавление роста тест-культуры. При этом снижение роста тест-штамма составило 6 log10. Меропенем в комбинации с клодроновой кислотой проявлял более выраженную активность: полное отсутствие роста P. aeruginosa 532/14 к 8 часам инкубации, подавление роста на 3,2 log10. Этот показатель через 12–24 ч составил 6 log10. Получение кривой зависимости «время — летальное действие» позволяет выявлять эффективные комбинации карбапенемов и ингибиторов металло-бета-лактамаз грамотрицательных бактерий, что имеет большое значение для повышения эффективности лечения тяжелых гнойно-септических осложнений у пациентов.