Подавление цикла вируса гепатита в под действием нуклеолитических систем CRISPR/Cas9 и белка HBx

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Вирус гепатита В (ВГВ) может вызывать хронический гепатит В (ХГВ) — тяжелое хроническое заболевание печени инфекционной природы. По последним данным официального статистического наблюдения, число больных ХГВ в мире превышает 250 млн человек, а в Российской Федерации составляет около 3 млн человек. Противовирусные препараты (аналоги нуклеоз(т)идов и пегилированный интерферон) подавляют репликацию и транскрипцию вируса, однако не способны полностью элиминировать его из организма. Причиной этого является стабильная форма генома ВГВ — кольцевая ковалентно замкнутая ДНК (ккзДНК), которая представляет из себя компактную минихромосому, экранированную от воздействия противовирусных препаратов. Необходимым шагом для излечения ХГВ является разработка новых терапевтических подходов, направленных на разрушение или инактивацию матриц ккзДНК. Системы сайтспецифических нуклеаз CRISPR/Cas9 способны вносить двуцепочечные разрывы в практически любые заданные участки ДНК. Ранние работы по использованию сайт-специфичных нуклеаз CRISPR/Cas9 для ВГВ продемонстрировали эффективное разрезание ккзДНК, однако деградации всех матриц добиться не удалось. Вероятно, причиной этого являются структурные особенности ккзДНК, которая может существовать в гетерохроматизированном состоянии, недоступном для действия белков-нуклеаз CRISPR/Cas9. Один из активаторов транскрипции, вирусный белок HBx, способен релаксировать структуру ккзДНК, привлекая к ним факторы, ремоделирующие хроматин. Белок HBx активирует транскрипцию ВГВ и способствует расплетению структуры ккзДНК, делая ее более доступной для систем CRISPR/Cas9. В данной работе было изучено влияние белка HBx дикого типа, а также мутантных, более безопасных форм НВх белка (HBxMut, который не взаимодействует с факторами Bcl-2 и Bcl-xL, и HBxNESM, который не вызывает образование активных форм кислорода и не индуцирует двуцепочечные разрывы в геноме) на эффективность систем CRISPR/Cas9. Выяснилось, что Нbх белок и его мутантные формы способны значительно увеличить эффективность систем CRISPR/Cas9, подавляя транскрипцию вирусной прегеномной РНК вплоть до 98%. Были определены оптимальные соотношения и концентрации плазмид, кодирующих элементы систем CRISPR/ Cas9 и белков HBx. Кроме того, было показано, что белки HBx в выбранном диапазоне концентраций не вызывают изменений пролиферации и жизнеспособности клеток. Таким образом, совместное действие систем сайт-специфических нуклеаз CRISPR/Cas9 и вирусного белка-активатора HBx значительно подавляет транскрипцию вируса гепатита В.

Об авторах

С. А. Брезгин

ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора;
ФГБУ ГНЦ Институт иммунологии ФМБА России

Email: sb@rcvh.ru

младший научный сотрудник лаборатории вирусных гепатитов;

аспирант лаборатории № 73 клинической фармакологии,

Москва

Россия

А. П. Костюшева

ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Автор, ответственный за переписку.
Email: ak@rcvh.ru

младший научный сотрудник лаборатории вирусных гепатитов,

111123, Москва, ул. Новогиреевская, 3А

Россия

В. Н. Симирский

Институт биологии развития имени Н.К. Кольцова РАН

Email: simir@mail.ru

к.б.н., старший научный сотрудник,

Москва

Е. В. Волчкова

ГБОУ ВПО Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова МЗ РФ

Email: fake@neicon.ru

д.м.н., профессор кафедры инфекционных болезней, зав. кафедрой инфекционных болезней медико-профилактического факультета,

Москва

Россия

Д. С. Чистяков

ГБОУ ВПО Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова МЗ РФ

Email: fake@neicon.ru

лаборант,

Москва

Д. С. Костюшев

ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора

Email: dchistakoff@gmail.com

научный сотрудник,

Москва

В. П. Чуланов

ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора;
ГБОУ ВПО Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова МЗ РФ

Email: vladimir.chulanov@rcvh.ru

д.м.н., зав. лабораторией вирусных гепатитов;

профессор кафедры инфекционных болезней медико-профилактического факультета,

Москва

Список литературы

  1. Allweiss L., Dandri M. The Role of cccDNA in HBV Maintenance. Viruses, 2017, vol. 9, no. 6: 156. doi: 10.3390/v9060156
  2. Belloni L., Pollicino T., De Nicola F., Guerrieri F., Raffa G., Fanciulli M., Levrero M. Nuclear HBx binds the HBV minichromosome and modifies the epigenetic regulation of cccDNA function. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2009, vol. 106, no. 47, pp. 19975– 19979. doi: 10.1073/pnas.0908365106
  3. Bock C.T., Schwinn S., Locarnini S., Fyfe J., Manns M.P., Trautwein C., Zentgraf H. Structural organization of the hepatitis B virus minichromosome. J. Mol. Biol., 2001, vol. 307, no. 1, pp. 183–196. doi: 10.1006/jmbi.2000.4481
  4. Cha M.-Y., Kim C.-M., Park Y.-M., Ryu W.-S. Hepatitis B virus X protein is essential for the activation of Wnt/beta-catenin signaling in hepatoma cells. Hepatology, 2004, vol. 39, no. 6, pp. 1683–1693. doi: 10.1002/hep.20245
  5. Dong C., Qu L., Wang H., Wei L., Dong Y., Xiong S. Targeting hepatitis B virus cccDNA by CRISPR/Cas9 nuclease efficiently inhibits viral replication. Antiviral Res., 2015, vol. 118, pp. 110–117. doi: 10.1016/j.antiviral.2015.03.015
  6. Forgues M., Marrogi A.J., Spillare E.A., Wu C.G., Yang Q., Yoshida M., Wang X.W. Interaction of the hepatitis B virus X protein with the Crm1-dependent nuclear export pathway. J. Biol. Chem., 2001, vol. 276, no. 25, pp. 22797–22803. doi: 10.1074/jbc.M101259200
  7. Ganem D., Prince A.M. Hepatitis B virus infection — natural history and clinical consequences. N. Engl. J. Med., 2004, vol. 350, no. 11, pp. 1118–1129. doi: 10.1056/NEJMra031087
  8. Geng X., Huang C., Qin Y., McCombs J.E., Yuan Q., Harry B.L., Xue D. Hepatitis B virus X protein targets Bcl-2 proteins to increase intracellular calcium, required for virus replication and cell death induction. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2012, vol. 109, no. 45, pp. 18471–18476. doi: 10.1073/pnas.1204668109
  9. Kim S., Lee H.-S., Ji J.-H., Cho M.-Y., Yoo Y.-S., Park Y.-Y., Cho H. Nuclear expression of hepatitis B virus X protein is associated with recurrence of early-stage hepatocellular carcinomas: role of viral protein in tumor recurrence. J. Pathol. Transl. Med., 2016, vol. 50, no. 3, pp. 181–189. doi: 10.4132/jptm.2016.03.18
  10. Konerman M.A., Lok A.S. Interferon treatment for hepatitis B. Clin. Liver Dis., 2016, vol. 20, no. 4, pp. 645–665. doi: 10.1016/j.cld.2016.06.002
  11. Liu Y., Zhao M., Gong M., Xu Y., Xie C., Deng H., Wang Z. Inhibition of hepatitis B virus replication via HBV DNA cleavage by Cas9 from Staphylococcus aureus. Antiviral Res., 2018, vol. 152, pp. 58–67. doi: 10.1016/j.antiviral.2018.02.011
  12. Lucifora J., Xia Y., Reisinger F., Zhang K., Stadler D., Cheng X., Volz T. Specific and nonhepatotoxic degradation of nuclear hepatitis B virus cccDNA. Science, 2014, vol. 343, no. 6176, pp. 1221–1228.
  13. Nassal M. HBV cccDNA: viral persistence reservoir and key obstacle for a cure of chronic hepatitis B. Gut, 2015, vol. 64, no. 12, pp. 1972–1984. doi: 10.1136/gutjnl-2015-309809
  14. Ramanan V., Shlomai A., Cox D.B.T., Schwartz R.E., Michailidis E., Bhatta A., Bhatia S.N. CRISPR/Cas9 cleavage of viral DNA efficiently suppresses hepatitis B virus. Sci. Rep., 2015, vol. 5: 10833. doi: 10.1038/srep10833
  15. Seeger C., Sohn J.A. Targeting hepatitis B virus with CRISPR/Cas9. Mol. Ther. Nucleic Acids, 2014, vol. 3: e216. doi: 10.1038/mtna.2014.68
  16. Seeger C., Sohn J.A. Complete spectrum of CRISPR/Cas9-induced mutations on HBV cccDNA. Mol. Ther., 2016, vol. 24, no. 7, pp. 1258–1266. doi: 10.1038/mt.2016.94
  17. Shi H., Lu L., Zhang N.-P., Zhang S.-C., Shen X.-Z. Effect of interferon-gamma and tumor necrosis factor-alpha on hepatitis B virus following lamivudine treatment. World J. Gastroenterol., 2012, vol. 18, no. 27, pp. 3617–3622. doi: 10.3748/wjg.v18.i27.3617
  18. Uusi-Mäkelä M.I.E., Barker H.R., Bäuerlein C.A., Häkkinen T., Nykter M., Rämet M. Chromatin accessibility is associated with CRISPR-Cas9 efficiency in the zebrafish (Danio rerio). PLoS One, 2018, vol. 13, no. 4: e0196238–e0196238. doi: 10.1371/journal. pone.0196238
  19. Verkuijl S.A., Rots M.G. The influence of eukaryotic chromatin state on CRISPR-Cas9 editing efficiencies. Curr. Opin. Biotechnol., 2018, vol. 55, pp. 68–73. doi: 10.1016/j.copbio.2018.07.005
  20. WHO. Global hepatitis report 2017. World Health Organization, 2017.
  21. Yue D., Zhang Y., Cheng L., Ma J., Xi Y., Yang L., Xiang R. Hepatitis B virus X protein (HBx)-induced abnormalities of nucleic acid metabolism revealed by 1 H-NMR-based metabonomics. Sci. Rep., 2016, vol. 6: 24430. doi: 10.1038/srep24430

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Брезгин С.А., Костюшева А.П., Симирский В.Н., Волчкова Е.В., Чистяков Д.С., Костюшев Д.С., Чуланов В.П., 2019

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах