СРАВНИТЕЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ОСОБЕННОСТЕЙ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА ЖИТЕЛЕЙ ГВИНЕЙСКОЙ РЕСПУБЛИКИ И РОССИИ

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Известно, что микробиота кишечника у клинически здоровых людей, проживающих в разных регионах, может значительно различаться. Цель исследования — сравнительное изучение качественного и количественного состава аэробной и анаэробной микробиоты кишечника на случайной малой выборке проб испражнений жителей Гвинейской Республики (46 человек) и России (60 человек). Содержание микроорганизмов (Enterobacteriaceae, Enterococcus spp., Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., Staphylococcus spp., дрожжепо- добные грибы рода Candida, неферментирующие грамотрицательные бактерии и др.) в 1,0 грамме фекалий определяли бактериологическим методом. Родовую и видовую идентификацию проводили с использованием бактериологического анализатора Vitek 2 Compact (bioMerieux, Франция), рутинных биохимических тестов, а также MALDI-TОF масс-спектрометрии (Bruker Daltonics, Германия). Для оценки различий результатов в сравниваемых группах применяли критерий χ2 Пирсона, p < 0,05 и точный критерий Фишера, вычисленные с использованием он-лайн калькулятора medstatistica.ru. 95% доверительные интервалы рассчитывали по методу Уилсона. Микробиологические нарушения характеризовались снижением количества облигатных, повышением количества факультативных (условно-патогенных) микроорганизмов (в количестве 106 и выше КОЕ/г.) и появлением их ассоциаций. Дисбиотические нарушения были выявлены в обеих сравниваемых группах: у 100% обследованных из Гвинейской Республики (95% ДИ:92,3–100) и у 86,7% обследованных из Санкт-Петербурга (95% ДИ:75,8–93,1). Выраженная степень нарушений микробиоциноза в группе жителей Гвинейской Республики встречалась в 19,6% (95% ДИ:10,7–33,2), в группе жителей Санкт-Петербурга в 9,6% (95% ДИ:4,2–20,6). Как у жителей Гвинейской Республики, так и у жителей Санкт-Петербурга нарушения третьей степени выявлялись реже, по сравнению с нарушениями второй степени. Исследование не выявило значимых различий в содержании облигатных бактерий (Bifidobacterium spp. и Lactobacillus spp.), однако, выявлены достоверные различия в видовом составе факультативной части микробиоты. У жителей Гвинейской Республики чаще обнаруживали «атипичные» Escherichia coli (гемолитические и лактозонегативные) и неферментирующие грамотрицательные бактерии Comamonas kerstersii. Ассоциации условно-патогенных микроорганизмов в разных по составу сочетаниях обнаружены в составе микробиоты у 30,4% обследованных жителей Гвинейской Республики (95% ДИ:19,1–44,8) и у 18,3% жителей Санкт-Петербурга (95% ДИ:10,6–29,9). Ассоциации микроорганизмов у жителей Гвинейской Республики всегда содержали Staphylococcus aureus. Выявлены отличия в сравниваемых группах в отношении Staphylococcus aureus и Hafnia alvei, однако необходимо проведение дальнейших исследований на большей выборке.

 

Об авторах

А. Ю. Попова

Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, Москва

Email: kaflidia@mail.ru
д.м.н., профессор, Главный государственный санитарный врач Российской Федерации, руководитель Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Роспотребнадзор) Россия

Л. А. Кафтырева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Автор, ответственный за переписку.
Email: kaflidia@mail.ru
д.м.н., профессор, зав. лабораторией кишечных инфекций Россия

Л. В. Сужаева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: kaflidia@mail.ru
младший научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций Россия

Е. В. Войтенкова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: kaflidia@mail.ru
к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций Россия

А. В. Забровская

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: kaflidia@mail.ru
к.в.н., старший научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций Россия

С. А. Егорова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: kaflidia@mail.ru
к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций Россия

М. А. Макарова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: kaflidia@mail.ru
к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций Россия

З. Н. Матвеева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: kaflidia@mail.ru
к.м.н., ведущий научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций Россия

Е. В. Зуева

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: kaflidia@mail.ru
к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии Россия

А. А. Порин

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург

Email: kaflidia@mail.ru
к.м.н., научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций Россия

М. Й. Буаро

НИИ прикладной биологии Гвинеи, Киндия

Email: kaflidia@mail.ru
к.б.н., профессор, генеральный директор Гвинея

О. К. Константинов

НИИ прикладной биологии Гвинеи, Киндия

Email: kaflidia@mail.ru
к.б.н., научный сотрудник Гвинея

А. А. Тотолян

НИИ прикладной биологии Гвинеи, Киндия

Email: kaflidia@mail.ru
академик РАН, д.м.н., профессор, зав. лабораторией молекулярной иммунологии, директор ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург Россия

Список литературы

  1. Бондаренко В.М., Малеев В.В., Лиходед В.Г. Кишечная микрофлора, ожирение и диабет 2 типа // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2014. № 3. С. 42–49. [Bondarenko V.M., Maleev V.V., Likhoded V.G. Intestinal microflora, obesity and type 2 diabetes. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2014, no. 3, pp. 42–49. (In Russ.)]
  2. Бондаренко В.М., Рыбальченко О.В. Анализ профилактического и лечебного действия пробиотических препаратов с позиций новых научных технологий // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015. № 2. С. 90–104. [Bondarenko V.M., Rybalchenko O.V. Analysis of prophylactic and therapeutic effect of probiotic preparations from position of new scientific technologies. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2015, no. 2, pp. 90–104. (In Russ.)]
  3. Бухарин О.В. Инфекционная симбиология // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2015. № 4. С. 4–9. [Bukharin O.V. Infectious symbiology. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2015, no. 4, pp. 4–9. (In Russ.)]
  4. Денисова С.Н., Тарасова О.В., Ильенко Л.И. Сенцова Т.Б., Богданова С.В., Ревякина В.А., Белицкая М.Ю. Биохимические маркеры в оценке функционального состояния кишечной микрофлоры у детей на искусственном вскармливании // Педиатрия. 2016. Т. 95, № 3. С. 109–117. [Denisova S.N., Tarasova O.V., Ilenko L.I., Sentsova T.B., Bogdanova S.V., Revyakina V.A., Belitskaya M.Yu. Biochemical markers in assessment of intestinal microflora functional state in formula-fed infants. Pediatriya = Pediatrics, 2016, vol. 95, no. 3, pp. 109–117. (In Russ.)]
  5. Домотенко Л.В., Шепелин А.П., Морозова Т.П. Питательные среды для основных представителей нормофлоры кишечника // Бактериология. 2016. Т. 1, № 1. С. 48–53. [Domotenko L.V., Shepelin A.P., Morozova T.P. Nutrient media for the main representatives of intestinal normal flora. Bakteriologiya = Bacteriology, 2016, vol. 1, no. 1, pp. 48–53. (In Russ.)]
  6. Ермоленко Е. И., Котылева М. П., Буй Тхи Лан Ань, Чан Тхи Ньай, Буй Тхи Тхань Нга, Нго Тхань Нам, Краева Л.А., Гончаров А.Е., Карасева А.Б., Киреева А.Г., Суворов А.Н. Исследования микробиоты жителей Вьетнама и России // J. Trop. Sci. Tech. 2016. Т. 11. С. 24–35. [Ermolenko E.I., Kotyleva M.P., Bui Thi Lan An, Chan Thi Nyai, Bui Thi Thanh Nga, Ngo Thanh Nam, Krayeva L.A., Goncharov A.E., Karaseva A.B., Kireeva A.G., Suvorov A.N. Studies of microbiome in Vietnam and Russia. J. Trop. Sci. Tech., 2016, vol. 11; pp. 24–35.]
  7. Коршунов В.М., Поташник Л.В., Ефимов Б.А., Володин Н.Н., Коршунова О.В., Gyr K., Frei R., Reber H., Иэрэндорж Д. Микрофлора кишечника у детей Монголии, России и Швейцарии // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2001. № 2. С. 61–64. [Korshunov V.M., Potashnik L.V., Efimov B.A., Volodin N.N., Korshunova O.V., Gyr K., Frei R., Reber H., Ierandorg D. Intestinal microflora in children in Mongolia, Russia and Switzerland. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2001, no. 2, pp. 61–64. (In Russ.)]
  8. Коршунов В.М., Поташник Л.В., Ефимов Б.А., Коршунова О.В., Смеянов В.В., Gyr K., Frei R. Качественный состав нормальной микрофлоры кишечника у лиц различных возрастных групп // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2001. № 2. С. 57–61. [Korshunov V.M., Potashnik L.V., Efimov B.A., Korshunova O.V., Smeyanov V.V., Gyr K., Frei R. Qualitative composition of normal intestinal microflora in persons of different age groups. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2001, no. 2, pp. 57–61. (In Russ.)]
  9. Костюкевич О.И. Влияние кишечной микрофлоры на здоровье человека. От патогенеза к современным методам коррекции дисбиоза // Российский медицинский журнал. 2011. № 5. С. 304. [Kostyukevich O.I. Influence of intestinal microflora on human health. From pathogenesis to modern methods of dysbiosis correction. Rossiiskii meditsinskii zhurnal = Russian Medical Journal, 2011, no. 5, p. 304. (In Russ.)]
  10. Максимова О.В., Гервазиева В.Б., Зверев В.В. Микробиота кишечника и аллергические заболевания // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2014. № 3. С. 49–60. [Maksimova O.V., Gervazieva V.B., Zverev V.V. Intestine microbiota and allergic diseases. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2014, no. 3, pp. 49–60. (In Russ.)]
  11. Нисевич Н.И., Гаспарян М.О., Новокшонов А.А. К вопросу о дисбактериозе кишечника детей // Педиатрия. 1999. № 1. С. 98–102. [Nisevich N.I., Gasparyan M.O., Novokshonov A.A. Problem of pediatric intestinal dysbiosis. Pediatriya = Pediatrics, 1999, no. 1, pp. 98–102. (In Russ.)]
  12. Нормофлора и дисбактериозы человека. Под ред. А.Л. Котовой. Алматы: ТОО «Люкс Биндер Сервис», 2008. С. 254– 255. [Normoflora i disbakteriozy cheloveka. Pod red. A.L. Kotovoi [Norm flora and human dysbiosis. Eds. Kotova A.L.]. Almaty: TOO “Lux Binder Service”, 2008, pp. 254–255. (In Russ.)]
  13. Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника: отраслевой стандарт (ОСТ 91500.11.0004), приказ МЗ РФ № 231 от 09.06.2003. М., 2003. 110 с. [Protokol vedenija bol’nyh. Disbakterioz kishechnika: otraslevoj standart (OST 91500.11.0004), prikaz MZ RF № 231 ot 09.06.2003. [Protocol of Patients Management. Dysbacteriosis of the Intestine: the Industry Standard (OST 91500.11.0004), order of the Ministry of Health of the Russian Federation No. 231 of 09.06.2003)]. Moscow, 2003, 110 p. URL: https://normativ.kontur.ru/document?moduleId=1&documentId=62571 (13.09.2017)
  14. Определение дисбиотических изменений желудочно-кишечного тракта по маркерам содержимого кишечника: федеральные клинические рекомендации. М., 2015. 35 с. [Opredelenie disbioticheskih izmenenij zheludochno-kishechnogo trakta po markeram soderzhimogo kishechnika: federal’nye klinicheskie rekomendacii. [Determination of dysbiotic changes in the gastrointestinal trace by markers of the intestinal content: federal clinical recommendations]. Moscow, 2015. 35 p. URL: http://nasci.ru/_resources/directory/222/common/Opredelenie_disbioz.pdf (13.09.2017)
  15. Шептулин А.А. Синдром избыточного роста бактерий и дисбактериоз кишечника: их место в современной гастроэнтерологии // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 1999. № 3. С. 54–56. [Sheptulin A.A. Bacterial overgrowth syndrome and “intestinal dysbacteriosis”: a place in modern gastroenterology. Rossiiskii zhurnal gastroenterologii, gepatologii, koloproktologii = Russian Journal of Gastroenterology, Hepatology, Coloproctology, 1999, no. 3, pp. 54–56. (In Russ.)]
  16. Chatterjee B., Thakur S.S. Microbial profiling: extend ethnicity of human microbiome. Nature, 2012, vol. 487, p. 39. doi: 10.1038/ 487039d
  17. David L.A., Maurice C.F., Carmody R.N., Gootenberg D.B., Button J.E., Wolfe B.T., Ling A.V., Devlin A.S., Varma Y., Fischbach M.A., Biddinger S.B., Dutton R.J., Turnbaugh P.J. Diet rapidly and reproducibly alters the human gut microbiome. Nature, 2014, vol. 505, pp. 559–563. doi: 10.1038/nature12820
  18. Dehingia M., Thangjam K., Talukdar N.C., Talukdar R., Reddy N., Mande S.S., Deka M., Khan M.R. Gut bacterial diversity of the tribes of India and comparison with the worldwide data. Sci. Rep., 2015, 5:18563. doi: 10.1038/srep18563
  19. Ding T., Schloss P.D. Dynamics and associations of microbial community types across the human body. Nature, 2014, vol. 509, pp. 357–360. doi: 10.1038/nature13178
  20. Faller R.J., LaMont J.T. Microbial factors in inflammatory bowel disease. Gastroenterol. Clin. North. Am., 2002, vol. 31, no. 1, pp. 41–62.
  21. Hill M., Grawther J., Drasar B. Bacteria and aetiology of cancer of the large bowel. Lancet, 1971, no. 7690, p. 95.
  22. Hooper L.V., Midtvedt T., Gordon J.I. How host – microbial interaction shape the nutrient environment of the mammalian intestine. Annual Review of Nutrition, 2002, vol. 22, pp. 283–307. doi: 10.1146/annurev.nutr.22.011602.092259
  23. Huycke M.M., Gaskins H.R. Commensal bacteria, redox stress, and colorectal cancer: mechanisms and models. Exp. Biol. Med. (Maywood), 2004, vol. 229, pp. 586–597.
  24. Kwok L.Y., Zhang J., Guo Z. Gesudu Q., Zheng Y., Qiao J., Huo D., Zhang H. Characterization of fecal microbiota across seven Chinese ethnic groups by quantitative polymerase chain reaction. PLoS One, 2014, vol. 9, iss. 4:е93631. doi: 10.1371/journal. pone.0093631
  25. Li L., Zhao X. Comparative analyses of fecal microbiota in Tibetan and Chinese Han living at low or high altitude by barcoded 454 pyrosequencing. Sci. Rep., 2015, no. 5:14682. doi: 10.1038/srep14682
  26. Mitsuoka T. Intestinal flora and host. Asian Med. J., 1988, vol. 31, no.7, pp. 400–409.
  27. Nakayama J., Watanabe K., Jiang J., Matsuda K., Chao S.H., Haryono P., La-Ongkham O., Sarwoko M.A., Sujaya I.N., Zhao L., Chen K.T., Chen Y.P.., Chiu H.H.., Hidaka T., Huang N.X., Kiyohara C., Kurakawa T., Sakamoto N., Sonomoto K., Tashiro K., Tsuji H., Chen MJ., Leelavatcharamas V., Liao C.C., Nitisinprasert S., Rahayu E.S., Ren F.Z., Tsai Y.C., Lee Y.K. Diversity in gut bacterial community of school-age children in Asia. Sci. Rep., 2015, no.5. doi: 10.1038/srep08397
  28. Opota O., Ney B., Zanttti G., Jatona K., Greuba G., Prod΄hom G. Bacteremia caused by Comamonas kerstersii in a patient with diverticulosis. J. Clin. Microbiol., 2014, vol. 52, no. 3, pp. 1009–1012. doi: 10.1128/jcm.02942-13

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Попова А.Ю., Кафтырева Л.А., Сужаева Л.В., Войтенкова Е.В., Забровская А.В., Егорова С.А., Макарова М.А., Матвеева З.Н., Зуева Е.В., Порин А.А., Буаро М.Й., Константинов О.К., Тотолян А.А., 2017

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах