Email this article Genotyping of rickettsias circulating in the territories of the Altai Republic and Khabarovsk krai
- Authors: Shtrek S.V.1,2, Rudakov N.V.1,2, Shpynov S.N.1,2, Sannikov A.V.1, Samoylenko I.E.1, Shchuchinova L.D.3, Trotsenko O.E.4, Dragomeretskaya A.G.4, Matushchenko E.V.1,2
-
Affiliations:
- Omsk Research Institute of Natural-Focal Infections
- Omsk State Medical University of the Ministry of Health of Russia
- Office of the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing in the Altai Republic
- Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing
- Issue: Vol 13, No 1 (2023)
- Pages: 100-106
- Section: ORIGINAL ARTICLES
- Submitted: 12.08.2022
- Accepted: 11.02.2023
- Published: 01.04.2023
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/2014
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-GOR-2014
- ID: 2014
Cite item
Full Text
Abstract
The aim of the study was to verificate of the causative agent of Siberian tick-borne typhus (STT) upon ixodic tick mixed infection on the territory of the Altai Republic and Khabarovsk Krai using an integrated molecular biological approach. Materials and methods. The material for the study was presented as 304 imago of ixodic mites of six species. The ticks were collected on the territory of the Altai Republic and the Khabarovsk Krai in the years 2014–2022. Rickettsia DNA was identified by two-round PCR using genus- and species-specific primers for gltA and ompA genes, followed by sequencing and using PCR reagent kits “RealBest DNA R. sibirica/R. heilongjiangensis” (Vector-Best, Novosibirsk). Results. The detection of rickettsia in ticks in the Altai Republic was 82.6% (CI: 69.1–96.1), in the Khabarovsk Krai — 53.1% (CI: 44.9–61.3). The species composition of rickettsias in various species of ixodic mites in these territories, endemic to Siberian tick typhus, is characterized by the presence of mixed forms. Rickettsia sibirica and R. raoultii were found in ticks Dermacentor nuttalli, Haemaphysalis concinna, D. silvarum. Only Candidatus R. tarasevichiae were detected in Ixodes persulcatus, I. pavlovsky mites and I. pavlovsky/persulcatus hybrids. The DNA of R. heilongjiangensis was found in H. mites. concinna in the Khabarovsk Krai. The DNA of Candidatus R. tarasevichiae is also present in the ticks of D. nuttalli and H. concinna from the Altai Republic. The DNA of the “classic” pathogenic species, R. sibirica, was detected in ticks D. nuttalli and H. concinna in the Altai Republic, ticks D. silvarum, H. concinna and H. japonica douglasi in the Khabarovsk Krai. In addition, in the Khabarovsk Krai, the DNA of R. heilongjiangensis was detected in H. concinna ticks, and a DNA fragment common to R. sibirica subsp. mongolitimonae and R. conorii was detected in H. japonica douglasi ticks, which requires further study. Candidatus R. tarasevichiae is common in Ixodes mites (I. persulcatus, I. pavlovsky and their hybrids), in the Altai Republic in D. nuttalli and H. concinna. R mites. raoultii was detected in ticks of the genus Dermacentor — D. nuttalli in the Altai Republic and D. silvarum in the Khabarovsk Krai. Conclusions. During molecular biological monitoring of rickettsias in endemic territories, the detection of R. raoultii “masks” the presence of the etiological agent of STT — R. sibirica. This phenomenon makes it possible to explain the high incidence of STT in the studied territories, with the rare detectability of R. sibirica DNA during molecular biological screening in ixodic mites.
Full Text
Введение
Впервые описанные случаи ранее неизвестного риккетсиального заболевания, возникающего на эндемичных территориях Азиатской части России после присасывания клещей и протекающего с высокой температурой, первичным аффектом, розеолезно-петехиальной сыпью, изменениями со стороны центральной нервной системы, выявлены практически одновременно (1934–1935 гг.) в Приморье — «клещевая лихорадка Приморья», в Хабаровском крае — «дальневосточная сыпная клещевая лихорадка», в Красноярском крае — «клещевая сыпная лихорадка» [6].
Планомерное изучение новой инфекции в 1937–1938 гг. в Красноярском крае под руководством М.К. Кронтовской позволило выделить клещевой сыпной тиф (в настоящее время регистрируют как сибирский клещевой тиф — СКТ) в самостоятельную нозологическую форму. Установлена риккетсиозная этиология заболевания (по современной номенклатуре Rickettsia sibirica subsp. sibirica), классический переносчик — клещи Dermacentor nuttalli Ol., основные эпидемиологические закономерности. В 1940 г. экспедицией, возглавляемой М.К. Кронтовской, в Хабаровском крае выделены штаммы риккетсий от больных, клещей Haemaphysalis concinna и Dermacentor silvarum [4].
В результате многолетних исследований выявлен широкий нозоареал СКТ с наибольшим эпидемическим потенциалом очагов на юге Сибири и Дальнего Востока России. Применительно к эндемичным территориям число эпидемически значимых переносчиков в очагах колеблется от одного-двух (D. nuttalli — горные степи Алтая, лесостепи Минусинской и Канской котловин, Тувы, Предбайкалья и Забайкалья; D. marginatus и в меньшей степени D. reticulatus — равнинные степные и лесостепные ландшафты Западно-Сибирской низменности, D. silvarum и H. concinna — лесостепи Салаира, Кузнецкой котловины, юга Дальнего Востока) до четырех видов (D. marginatus, H. concinna, D. silvarum, D. reticulatus — северная лесостепь Алтайского края, Северный Алтай) [7]. В Республике Алтай находятся наиболее эпидемически активные очаги СКТ и отмечается наиболее высокий уровень заболеваемости в России: среднемноголетний показатель заболеваемости достигает 72 на 100 тыс. населения, что примерно в 50 раз превышает аналогичный показатель по РФ [9].
Уже в первый период изучения клещевых риккетсиозов (КР) возникли вопросы об отличиях циркулирующих на очаговых территориях штаммов риккетсий. Удалось установить этиологию случаев КР на юге Хабаровского края как вызванных R. heilongjiangensis [2, 17]. Эта риккетсия выявлена в «пятнах» H. concinna в пределах нозоареала КР в Приморском, Хабаровском, Алтайском и Красноярском краях, в последнем — также в клещах D. nuttalli [18, 19]. В Хабаровском крае в клещах Ixodes persulcatus молекулярными методами выявляли Candidatus R. tarasevichiae, R. helvetica и R. heilongjiangensis [1, 3]
По современным представлениям, основанным на многолетнем изучении штаммов риккетсий из коллекции Омского НИИ природно-очаговых инфекций, на Дальнем Востоке России, наряду с классическим возбудителем СКТ R. sibirica subsp. sibirica, циркулируют R. heilongjiangensis и геновариант R. sibirica subsp. BJ-90 [5].
Целью данного исследования является верификация возбудителя СКТ при микст-инфицированности риккетсиями иксодовых клещей на территории Республики Алтай и Хабаровского края с применением комплексного молекулярно-биологического подхода.
Материалы и методы
Материалом для исследования служили 304 имаго клещей шести видов (D. nuttalli, D. silvarum, H. concinna, H. japonica douglasi, I. persulcatus, I. pavlovskyi, I. pavlovskyi/persulcatus). Сбор клещей проводился на флаг на территории Республики Алтай и Хабаровского края в 2014–2022 гг. (табл. 1). Идентификацию клещей осуществляли по морфологическим признакам по Филипповой [10]. Из клещей, полученных в 2014, 2018 и 2019 гг. готовили гомогенизированную суспензию, у клещей, собранных в 2022 г., для исследования забирали гемолимфу с последующим выделением ДНК.
Таблица 1. Характеристика исследованных клещей
Table 1. Characteristics of the studied ticks
Вид клещей Species of ticks | Год сбора Year of collection | Место сбора Gathering place | Количество Quantity |
D. nuttalli | 2014 | Кош-Агачский р-н Р.А.*/Kosh-Agachsky district A.R.* | 65 |
2019 | Усть-Коксинский р-н Р.А./Ust-Koksinsky district A.R. | 1 | |
2022 | Онгудайский р-н Р.А./Ongudai district A.R. | 50 | |
H. concinna | 2019 | Горно-Алтайский р-н Р.А./Gorno-Altaisky district A.R. | 3 |
Майминский р-н Р.А./Maiminsky district A.R. | 4 | ||
Чойский р-н Р.А./Choysky district A.R. | 16 | ||
2018 | Хабаровский р-н Х.К.**/Khabarovsk district Kh.K.** | 18 | |
I. persulcatus | 2019 | Чойский р-н Р.А./Choysky district A.R. | 5 |
2018 | Хабаровский р-н Х.К./Khabarovsk district Kh.K. | 9 | |
Р-н имени Лазо Х.К./Lazo District Kh.K. | 2 | ||
H. japonica douglasi | 2018 | Хабаровский р-н Х.К./Khabarovsk district Kh.K. | 23 |
I. pavlovskyi | 2018 | Хабаровский р-н Х.К./Khabarovsk district Kh.K. | 63 |
Р-н имени Лазо Х.К./Lazo District Kh.K. | 27 | ||
I. pavlovskyi/persulcatus | 2018 | Хабаровский р-н Х.К./Khabarovsk district Kh.K. | 12 |
Р-н им. Лазо Х.К./Lazo District Kh.K. | 4 | ||
D. silvarum | 2018 | Р-н им. Лазо Х.К./Lazo District Kh.K. | 2 |
Примечание. *Республика Алтай; **Хабаровский Край.
Note. *Altai Republic; **Khabarovsk Krai.
Выделение нуклеиновых кислот проводили наборами «АмплиПрайм РИБО-преп» компании «ИнтерЛабСервис» (Москва, Россия) и набором реагентов «РеалБест экстракция 100» ЗАО «Вектор-Бест» (Новосибирск, Россия). ДНК риккетсий выявляли (табл. 2) методом двухраундовой ПЦР с использованием родо- и видоспецифических праймеров генов gltA и ompA [15] с последующим секвенированием и в ПЦР-РВ с помощью наборов реагентов «РеалБест ДНК R. sibirica/R. heilongjiangensis» (ЗАО «Вектор-Бест», Новосибирск).
Таблица 2. Результаты исследования иксодовых клещей, собранных на территориях Республики Алтай и Хабаровского края на наличие ДНК риккетсий
Table 2. The results of the study of ixodic ticks collected in the territories of the Altai Republic and the Khabarovsk Krai for the presence of Rickettsia DNA
Вид клеща Species of tick | Республика Алтай/Altai Republic | Хабаровский край/Khabarovsk Krai | ||||
Вид возбудителя Species of pathogen | Количество Quantity | % (ДИ/CI) | Вид возбудителя Species of pathogen | Количество Quantity | % (ДИ/CI) | |
D. nuttalli | R. sibirica* | 16 | 13,8% (11,7–15,9) | Данный вид клещей отсутствует на указанной территории This species of ticks is not present in the specified territory | ||
Candidatus R. tarasevichiae** | 2 | 1,7% (1,5–2,0) | ||||
R. raoultii* | 55 | 47.4% (40,1–54,8) | ||||
R. sibirica****/R. raoultii* | 25 | 21,6% (18,2–24,9) | ||||
H. concinna | R. sibirica**** | 1 | 4,4% (2,8–5,9) | R. sibirica**** | 3 | 16,7% (10,1–23,2) |
R. raoultii*** | 5 | 21,7% (14,2–29,3) | R. heilongjiangensis**** | 1 | 5,6% (3,4–7,7) | |
Candidatus R. tarasevichiae** | 8 | 34,8% (22,7–46,9) | ||||
R. sibirica****/R. raoultii*** | 2 | 8,7% (5,7–11,7) | Риккетсия не идентифицирована* Rickettsia has not been identified | 1 | 5,6% (3,4–7,7) | |
R. raoultii***/R. tarasevichiae** | 1 | 4,4% (2,8–5,9) | ||||
I. persulcatus | Candidatus R. tarasevichiae** | 4 | 80,0% (20,3–100) | Candidatus R. tarasevichiae** | 10 | 90,9% (45,2–100) |
H. japonica douglasi | Данный вид клещей отсутствует на указанной территории This species of ticks is not present in the specified territory | R. sibirica subsp. mongolitimonae/R. conorii** | 1 | 4,4% (2,8–5,9) | ||
R. sibirica**** | 2 | 8,7% (5,7–11,7) | ||||
I. pavlovskyi | Данный вид клещей в этой работе не исследовался This species of mites has not been studied in this work | Candidatus R. tarasevichiae** | 54 | 60,0% (49,5–70,6) | ||
I. pavlovskyi/persulcatus | Данный вид клещей в этой работе не исследовался This species of mites has not been studied in this work | Candidatus R. tarasevichiae** | 11 | 68,8% (40,1–97,5) | ||
D. silvarum | Данный вид клещей в этой работе не исследовался This species of mites has not been studied in this work | R. sibirica**** | 1 | 50,0% (0–100) | ||
R. sibirica****/R. raoultii** | 1 | 50,0% (0–100) | ||||
Примечание. * — ПЦР с видоспецифическими праймерами к гену ompA; ** — ПЦР+секвенирование фрагмента гена gltA; *** — ПЦР+секвенирование фрагмента гена ompA; **** — Наборов реагентов для ПЦР в режиме реального времени «РеалБест ДНК R. sibirica/R. heilongjiangensis».
Note. * — PCR with species-specific primers for the OmpA gene; ** — PCR+sequencing of gltA gene fragment; *** — PCR+sequencing of OmpA gene fragment; **** — Sets of reagents for real-time PCR “RealBest DNA R. sibirica/R. heilongjiangensis”.
95% доверительный интервал (ДИ) уровня выявляемости риккетсий в клещах был рассчитан в программе MS Excel.
Результаты
В результате ПЦР-анализа установлена суммарная выявляемость ДНК риккетсий в 82,6% (ДИ: 69,1–96,1) иксодовых клещей на территории Республики Алтай. ДНК риккетсий была выявлена в 84,4% (ДИ: 69,0–99,8) исследованных клещей D. nuttalli. Самым распространенным видом риккетсий в клещах этого вида оказалась R. raoultii, обнаруженная в 47,4% (ДИ: 38,8–56,0) иксодид. В D. nuttalli также в высоком количестве выявлена ДНК R. sibirica в 35,3% (ДИ: 28,9–41,7) и Ca. R. tarasevichiae в 1,7% (1,4–2,0). В 21,6% (ДИ: 17,7–25,5) этого вида клещей установлена микст-инфицированность R. sibirica и R. raoultii. ДНК риккетсий была выявлена в 73,9% (ДИ: 43,7–100) клещей H. concinna. Среди выявленных риккетсий преобладающим видом была Ca. R. tarasevichiae (39,1%; ДИ: 23,2–55,0). Реже была выявлена ДНК R. sibirica и R. raoultii. В одной пробе выявлены одновременно Ca. R. tarasevichiae и R. raoultii. В клещах I. persulcatus идентифицировали только Ca. R. tarasevichiae.
При исследовании клещей, собранных на флаг в 2018 г. на территории Хабаровского края, уровень выявляемости ДНК риккетсий составил 53,1% (ДИ: 44,9–61,3). ДНК риккетсий была выявлена в 22,2% (ДИ: 11,9–32,5) исследованных клещей H. concinna. Чаще всего в клещах этого вида выявлялась ДНК R. sibirica, в одном экземпляре генотипировали R. heilongjiangensis. ДНК риккетсий была обнаружена в 13,0% (ДИ: 7,7–18,3) исследованных клещей H. japonica douglasi. Чаще выявлялась ДНК R. sibirica, фрагмент последовательности гена gltA у одного из образцов был идентичен последовательности R. sibirica subsp. mongolitimonae/R. conorii (GenBank: KT345979.1). В 60,0% (ДИ: 47,6–72,4) исследованных клещей I. pavlovskyi была выявлена ДНК риккетсий, идентифицированная как Ca. R. tarasevichiae. Схожая картина наблюдалась в клещах I. persulcatus и гибридах I. pavlovskyi/persulcatus, где так же выявляли ДНК Ca. R. tarasevichiae, уровень выявляемости составил 90,9% (ДИ: 37,2–100), и 68,8% (ДИ: 35,1–100) соответственно. В клещах D. silvarum выявлена ДНК R. sibirica, в том числе одновременно с R. raoultii.
Обсуждение
В данной работе установлено, что у основных переносчиков возбудителя СКТ (D. nuttalli, H. concinna, D. silvarum) [7] с применением комплексного молекулярно-биологического подхода ДНК R. sibirica выявляется значительно чаще при микст-инфицированности с R. raoultii, чем индивидуально. В единичных случаях может встречаться микст-инфицированность Ca. R. tarasevichiae и R. raoultii клещей вида H. concinna, при этом первый вид риккетсий является преобладающим. В одном экземпляре клеща H. japonica douglasi из Хабаровского края получен сиквенс фрагмента (512 п.о.) гена цитратсинтазы (gltA) имеющий 100% гомологии по 501 нуклеотиду с R. sibirica subsp. mongolitimonae и с R. conorii, что требует дальнейшего изучения.
Установлена суммарная выявляемость риккетсий в 82,6% (ДИ: 69,1–96,1) клещей на территории Республики Алтай, что подтверждает полученные нами ранее данные при исследовании иксодовых клещей на наличие антигенов риккетсий группы КПЛ с помощью разработанной ИФА тест-системы [11].
Удалось доказать ранее высказанное предположение о недостаточной информативности применения ПЦР с «классическими» (gltA, OmpA) праймерами в очагах СКТ [20], не позволяющее выявлять в индивидуальных пробах иксодовых клещей R. sibirica при более массовом присутствии копий ДНК R. raoultii [8].
При очевидных преимуществах метода секвенирования по Сэнгеру, на этапе ПЦР с применением родоспецифичных праймеров осуществляется амплификация варианта гена только одного вида риккетсий, при этом ДНК остальных видов не выявляется. Комплексный подход, основанный на применении различных модификаций ПЦР с разными видами праймеров, включая родо- и видоспецифичные, с последующим секвенированием позволило получить более объективную информацию при скриннинге ДНК различных видов риккетсий в индивидуальных пробах иксодовых клещей. В результате применения этого подхода ДНК «классического» патогенного вида — R. sibirica выявлена в клещах D. nuttalli и H. concinna в Республике Алтай, клещах D. silvarum, H. concinna и H. japonica douglasi в Хабаровском крае. В то же время при генотипировании риккетсий в пробах клинического материала от пациентов в очагах СКТ в Республике Алтай, Алтайском и Хабаровском краях удалось выявить ДНК R. sibirica и R. heilongjiangensis [12, 13, 16]. При этом на территории Новосибирской области в пробах клинического материала от пациентов с подозрением на «клещевые» инфекции ДНК R. sibirica выявлялась в 2,3 раза чаще, чем R. raoultii [14].
Выводы
При молекулярно-биологическом мониторинге риккетсий на эндемичных территориях выявление R. raoultii «маскирует» присутствие этиологического агента СКТ — R. sibirica. Этот феномен позволяет объяснить высокий уровень заболеваемости СКТ на изучаемых территориях при редкой выявляемости ДНК R. sibirica при молекулярно-биологическом скрининге в иксодовых клещах.
Необходимо внедрение комплексного молекулярно-биологического подхода для совершенствования эпидемиологического надзора за природными очагами СКТ за счет молекулярно-биологического скрининга ДНК риккетсий в иксодовых клещах и изучения значимости различных видов риккетсий в структуре региональной инфекционной патологии.
Конфликт интересов
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
About the authors
Sergey V. Shtrek
Omsk Research Institute of Natural-Focal Infections; Omsk State Medical University of the Ministry of Health of Russia
Author for correspondence.
Email: studi1990@mail.ru
PhD (Medicine), Senior Researcher, Head of the Laboratory of Zoonotic Infections, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses; Associate Professor, Department of Microbiology and Virology and Immunology
Россия, Omsk; OmskNikolay V. Rudakov
Omsk Research Institute of Natural-Focal Infections; Omsk State Medical University of the Ministry of Health of Russia
Email: studi1990@mail.ru
DSc (Medicine), Professor, Director; Head of the Department of Microbiology and Virology and Immunology
Россия, Omsk; OmskStanislav N. Shpynov
Omsk Research Institute of Natural-Focal Infections; Omsk State Medical University of the Ministry of Health of Russia
Email: studi1990@mail.ru
DSc (Medicine), Head Researcher, Laboratory of Natural Focal Infections, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses; Professor, Department of Microbiology and Virology and Immunology
Россия, Omsk; OmskAlexey V. Sannikov
Omsk Research Institute of Natural-Focal Infections
Email: studi1990@mail.ru
Junior Researcher, Laboratory of Natural Focal Infections, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses
Россия, OmskI. E. Samoylenko
Omsk Research Institute of Natural-Focal Infections
Email: studi1990@mail.ru
PhD (Medicine), Leading Researcher, Laboratory of Natural Focal Infections, Department of Natural Focal Bacterial Zoonoses
Россия, OmskLiliya D. Shchuchinova
Office of the Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing in the Altai Republic
Email: studi1990@mail.ru
DSc (Medicine), Head of the Department
Россия, Gorno-AltaiskOlga E. Trotsenko
Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing
Email: studi1990@mail.ru
DSc (Medicine), Director
Россия, KhabarovskAnna G. Dragomeretskaya
Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing
Email: studi1990@mail.ru
PhD (Medicine), Head of the Department of Natural Focal Infections
Россия, KhabarovskElena V. Matushchenko
Omsk Research Institute of Natural-Focal Infections; Omsk State Medical University of the Ministry of Health of Russia
Email: studi1990@mail.ru
PhD (Medicine), Associate Professor, Department of Microbiology and Virology and Immunology
Россия, Omsk; OmskReferences
- Бондаренко Е.И., Мокрецова Е.В., Здановская Н.И., Высочина Н.П., Пуховская Н.М., Тимофеев Д.И., Иванов М.К. Выявление возбудителей клещевого риккетсиоза в клещах и крови пациентов на Дальнем Востоке с помощью ПЦР-анализа в режиме реального времени. Поликлиника. 2014. № 4–1. С. 44–48. [Bondarenko E.I., Mokrecova E.V., Zdanovskaya N.I., Vysochina N.P., Puhovskaya N.M., Timofeev D.I., Ivanov M.K. Detection of tick-borne rickettsiosis pathogens in ticks and blood of patients in the Far East using real-time PCR analysis. Poliklinika = Polyclinic, 2014, no. 4–1, pp. 44–48. (In Russ.)]
- Григорьева Я.Е., Карань Л.С., Мокрецова Е.В., Щучинова Л.Д., Федорова М.В., Журенкова О.Б., Шипулин Г.А., Малеев В.В. Сравнительный анализ ПЦР- и ИФА-методов в лабораторной диагностике риккетсиозов группы КПЛ на примере трехлетних исследований в Республике Алтай и Хабаровском крае // Молекулярная диагностика. 2017. Т. 2. С. 192–194. [Grigor’eva Ya.E., Karan’ L.S., Mokrecova E.V., Shchuchinova L.D., Fedorova M.V., Zhurenkova O.B., Shipulin G.A., Maleev V.V. Comparative analysis of PCR and ELISA methods in laboratory diagnostics of rickettsioses of the KPL group on the example of three-year studies in the Altai Republic and Khabarovsk Krai. Molekulyarnaya diagnostika = Molecular Diagnostics, 2017, vol. 2, pp. 192–194. (In Russ.)]
- Иголкина Я.П., Бондаренко Е.И., Рар В.А., Епихина Т.И., Панов В.В., Высочина Н.П., Пуховская Н.М., Малькова М.Г., Василенко А.Г., Якименко В.В., Танцев А.К., Иванов М.К., Тикунова Н.В. Молекулярно-генетический анализ риккетсий, переносимых клещами Ixodes persulcatus schulze на территории юга Западной Сибири и Дальнего Востока // Национальные приоритеты России. 2014. № 3 (13). С. 100–103. [Igolkina Y.P., Bondarenko E.I., Rar V.A., Epikhina T.I., Panov V.V., Vysochina N.P., Pukhovskaya N.M., Malkova M.G., Vasilenko A.G., Yakimenko V.V., Tantsev A.K., Ivanov M.K., Tikunova N.V. Molecular genetic analysis of Rickettsia spp. Transmitted by Ixodes persulcatus ticks in the south-Western Siberia and the Far East. Nacional’nye prioritety Rossii = Russia’s National Priorities, 2014, no. 3 (13), pp. 100–103. (In Russ.)]
- Рудаков Н.В. К 75-летию открытия Rickettsia sibirica – возбудителя клещевого сыпного тифа: история изучения и современные представления // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2014. № 1. С. 4–5. [Rudakov N.V. 75th anniversary of the Rickettsia sibirica discovery: history of study and modern ideasi. Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika = Epidemiology and Vaccine Prevention, 2014, no. 1, pp. 4–5. (In Russ.)]
- Рудаков Н.В. Риккетсии и риккетсиозы: руководство для врачей. Омск: ИЦ «Омский научный вестник», 2016. 424 с. [Rudakov N.V. Rickettsia and rickettsioses: a guidebook for doctors. Omsk: Omsk Science Bulletin, 2016. 424 p. (In Russ.)]
- Рудаков Н.В., Оберт А.С. Клещевой риккетсиоз. Омск: Изд-во Омской государственной медицинской академии, 2001. 120 с. [Rudakov N.V., Obert A.S. Tick-borne rickettsiosis. Omsk: Omsk State Medical Academy Publishing, 2001. 120 p. (In Russ.)]
- Рудаков Н.В., Рудакова С.А. Клещевые трансмиссивные инфекции Сибири. Практическое руководство. Омск: ООО ИЦ «Омский научный вестник», 2019. 146 с. [Rudakov N.V., Rudakova S.A. Tick-borne vector-borne infections of Siberia. Practical guide. Omsk: LLC Omskiy nauchnyy vestnik Publishing Center, 2019. 146 p. (In Russ.)]
- Рудаков Н.В., Самойленко И.Е., Решетникова Т.А. Проблемы лабораторной диагностики риккетсиозов группы клещевой пятнистой лихорадки в России // Клиническая лабораторная диагностика. 2015. № 1. С. 50–52. [Rudakov N.V., Samoilenko I.E, Reshetnikova T.A. The problems of laboratory diagnostic of rickett siosis of group spott ed tick-bite fever in Russia. Clinicheskay laboratornay diagnostika = Russian Clinical Laboratory Diagnostics, 2015, no. 1, pp. 50–52. (In Russ.)]
- Рудаков Н.В., Шпынов С.Н., Транквилевский Д.В., Пакскина Н.Д., Савельев Д.А., Самойленко И.Е., Решетникова Т.А., Кумпан Л.В., Пеньевская Н.А. Особенности эпидемической ситуации по сибирскому клещевому тифу и другим клещевым риккетсиозам в Российской Федерации, прогноз на 2019 г. // Проблемы особо опасных инфекций. 2019. № 1. С. 89–97. [Rudakov N.V., Shpynov S.N., Trankvilevsky D.V., Pakskina N.D., Savel’ev D.A., Samoylenko I.E., Reshetnikova T.A., Kumpan L.V., Pen’evskaya N.A. Features of the epidemiological situation on siberian tick typhus and other tick-borne ricketsioses in the Russian Federation, prognosis for. Problemy osobo opasnyh infekcij = Problems of Particularly Dangerous Infections, 2019, no. 1, pp. 89–97. (In Russ.)] doi: 10.21055/0370-1069-2019-1-89-97
- Филиппова Н.А. Таксономическая внутривидовая дифференциация у иксодовых клещей (Acari: Ixodidae) с позиций морфологической концепции вида // Паразитология. 2007. Т. 41, № 6. С. 409–427. [Filippova N.A. Intraspecific taxonomic differentiation in ticks (Acari: Ixodidae) in the view of the morphological conception of species. Parazitologiya = Parasitology, 2007, vol. 41, no. 6, pp. 409–427. (In Russ.)]
- Шпынов С.Н., Рудаков Н.В. Иммуноферментная тест-система для выявления риккетсий группы клещевой пятнистой лихорадки // Лабораторное дело. 1991. № 11. С. 67–69. [Shpynov S.N., Rudakov N.V., Enzyme immunoassay system for detecting rickettsias of the tick-spot fever group. Laboratornoe delo = Laboratornoe Delo, 1991, no. 11, pp. 67–69. (In Russ.)]
- Щучинова Л.Д., Злобин В.И., Ечешева А.В., Бондаренко Е.И. Современные эпидемиологические черты сибирского клещевого тифа в Республике Алтай // Современные проблемы науки и образования. 2017. № 6. [Schuchinova L.D., Zlobin V.I., Echesheva A.V., Bondarenko E.I. Modern epidemiological featuresof the siberian tick typhus in the Altai Republic. Sovremennye problemy nauki i obrazovaniya = Modern Problems of Science and Education, 2017, no. 6. (In Russ.)] URL: https://science-education.ru/ru/article/view?id=27089 (19.02.2023)
- Granitov V., Shpynov S., Beshlebova O., Arsenjeva I., Dedkov V., Safonova M., Stukolova O., Pantjukhina A., Tarasevich I. New evidence on tick-borne rickettsioses in the Altai region of Russia using primary lesions, serum and blood clots of molecular and serological study. Microbes Infect., 2015, vol. 17, no. 11–12, pp. 862–865. doi: 10.1016/j.micinf.2015.08.011
- Igolkina Y., Krasnova E., Rar V., Savelieva M., Epikhina T., Tikunov A., Khokhlova N., Provorova V., Tikunova N. Detection of causative agents of tick-borne rickettsioses in Western Siberia, Russia: identification of Rickettsia raoultii and Rickettsia sibirica DNA in clinical samples. Clin. Microbiol. Infect., 2018, vol. 24, no. 2, pp. 199.e9–199.e12. doi: 10.1016/j.cmi.2017.06.003
- Igolkina Y., Rar V., Yakimenko V., Malkova M., Tancev A., Tikunov A., Epikhina T., Tikunova N. Genetic variability of Rickettsia spp. in Ixodes persulcatus/Ixodes trianguliceps sympatric areas from Western Siberia, Russia: Identification of a new Candidatus Rickettsia species. Infection, Genetics and Evolution, 2015, no. 34, pp. 88–93. doi: 10.1016/j.meegid.2015.07.015
- Mediannikov O., Sidelnikov Y., Ivanov L., Fournier P.E., Tarasevich I., Raoult D. Far eastern tick-borne rickettsiosis: identification of two new cases and tick vector. Ann. NY Acad. Sci., 2006, vol. 1078, pp. 80–88. doi: 10.1196/annals.1374.010
- Mediannikov O., Sidelnikov Y., Ivanov L., Mokretsova E., Fournier P.-E., Tarasevich I., Raoult D. Acute tick-borne rickettsiosis caused by Rickettsia heilongjiangensis in Russian Far East. Emerg. Infect. Dis., 2004, vol. 10, no. 5, pp. 810–817. doi: 10.3201/eid1005.030437
- Shpynov S., Fournier P.E., Rudakov N., Tankibaev M., Tarasevich I., Raoult D. Detection of a rickettsia closely related to Rickettsia aeschlimannii, “Rickettsia heilongjiangensis”, Rickettsia sp. strain RpA4, and Ehrlichia muris in ticks collected in Russia and Kazakhstan. J. Clin. Microbiol., 2004, vol. 42, no. 5, pp. 2221–2223. doi: 10.1128/JCM.42.5.2221-2223.2004
- Shpynov S., Fournier P.E., Rudakov N., Tarasevich I., Raoult D. Detection of members of the genera Rickettsia, Anaplasma, and Ehrlichia in ticks collected in the Asiatic part of Russia. Ann. NY Acad. Sci., 2006, vol. 1078, pp. 378–383. doi: 10.1196/annals.1374.075
- Shpynov S., Parola P., Rudakov N., Samoilenko I., Tankibaev M., Tarasevich I., Raoult D. Detection and identification of spotted fever group rickettsiae in Dermacentor ticks from Russia and central Kazakhstan. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2001, vol. 20, no. 12, pp. 903–905. doi: 10.1007/s10096-001-0638-4
Supplementary files
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).