Исходы заболевания туберкулезом в зависимости от генотипа Mycobacterium tuberculosis
- Авторы: Пасечник О.А.1, Вязовая А.А.2, Дымова М.А.3, Блох А.И.1, Стасенко В.Л.1, Татаринцева М.П.4, Мокроусов И.В.2
-
Учреждения:
- Омский государственный медицинский университет МЗ РФ
- ФБУН Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
- Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
- Клинический противотуберкулезный диспансер
- Выпуск: Том 9, № 3-4 (2019)
- Страницы: 531-538
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
- Дата подачи: 21.11.2018
- Дата принятия к публикации: 18.03.2019
- Дата публикации: 15.11.2019
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/799
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-2019-3-4-531-538
- ID: 799
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Штаммы Mycobacterium tuberculosis, относящиеся к разным генетическим группам или линиям, характеризуются вариабельностью ряда биологических свойств, что в известной мере определяет эпидемиологические и клинические особенности течения туберкулезного процесса у больных.
Целью исследования являлась оценка риска неблагоприятного исхода заболевания у больных туберкулезом, вызванным различными генотипами возбудителя.
Материалы и методы. В исследование были включены 425 больных туберкулезом органов дыхания, состоявших на диспансерном учете в медицинских организациях фтизиатрического профиля Омской области в период с марта 2015 г. по июнь 2017 г. Мужчины составили 73,1%, средний возраст 39,9 лет, средний возраст женщин 42 года. Культивирование M. tuberculosis, определение лекарственной чувствительности, выделение ДНК проведено стандартными методами. Принадлежность штаммов M. tuberculosis к генотипу Beijing и его эпидемиологически значимым кластерам B0/W148 и 94-32 определяли на основе анализа специфических маркеров с помощью ПЦР. Генотипирование штаммов других генотипов осуществляли методом сполиготипирования.
Результаты. 66,5% изолятов принадлежали генотипу Beijing, 12,8% — LAM, 10,1% — T, 4,7% — к генотипу Ural. Множественная лекарственная устойчивость к противотуберкулезным препаратам была обнаружена у 195 исследованных штаммов (45,9%).Штаммы генотипа Beijing чаще выделяли от больных мультирезистентным туберкулезом (PR = 2,09 (1,6–2,74) и туберкулезом, ассоциированным с ВИЧ-инфекцией (PR = 1,14; 95% ДИ 1,01–1,31). Летальный исход в 2 раза чаще регистрировался в группе больных, инфицированных микобактериями генотипа Beijing — 28,6% против 14,0% других генотипов. Риск смерти у больных туберкулезом связан с такими факторами, как молодой возраст в диапазоне от 18 до 44 лет (RR = 1,7; 95% ДИ 1,18–2,7), наличие коинфекции ВИЧ (RR = 5,0; 95% ДИ 3,39–7,45), наличие множественной (RR = 1,7; 95% ДИ 1,14–2,55) и широкой лекарственной устойчивости M. tuberculosis (RR = 2,57; 95% ДИ 1,35–4,92), а также с генотипом Beijing штамма M. tuberculosis, вызвавшего заболевание туберкулезом (RR = 2,0; 95% ДИ 1,3–3,17).
Выводы. Особенностью популяции M. tuberculosis на территории Омской области является значительное распространение штаммов генотипа Beijing, обладающих множественной и широкой лекарственной устойчивостью. Выявленная статистическая связь неблагоприятных исходов болезни с рядом факторов, включая принадлежность возбудителя к генотипу Beijing, требует разработки новых подходов в борьбе с туберкулезом.
Ключевые слова
Об авторах
О. А. Пасечник
Омский государственный медицинский университет МЗ РФ
Автор, ответственный за переписку.
Email: opasechnik@mail.ru
к.м.н., старший преподаватель кафедры эпидемиологии,
644050, г. Омск, ул. Мира, 9
РоссияА. А. Вязовая
ФБУН Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Email: elmtree2001@mail.ru
к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики,
Санкт-Петербург
РоссияМ. А. Дымова
Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
Email: maya.a.rot@gmail.com
к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории биотехнологии,
г. Новосибирск
РоссияА. И. Блох
Омский государственный медицинский университет МЗ РФ
Email: spy_spirit@mail.ru
ассистент кафедры эпидемиологии,
г. Омск
РоссияВ. Л. Стасенко
Омский государственный медицинский университет МЗ РФ
Email: vlstasenko@yandex.ru
д.м.н., профессор, зав. кафедрой эпидемиологии,
г. Омск
РоссияМ. П. Татаринцева
Клинический противотуберкулезный диспансер
Email: buzoo_kptd@mail.ru
главный врач,
г. Омск
РоссияИ. В. Мокроусов
ФБУН Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Email: imokrousov@mail.ru
д.б.н., зав. лабораторией молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики,
Санкт-Петербург
РоссияСписок литературы
- ВОЗ. Доклад о глобальной борьбе с туберкулезом 2018 год. URL: https://www.who.int/tb/publications/global_report/gtbr2018_executive_summary_ru.pdf?ua=1 (22.07.2019)
- Исаева Т.Х., Васильева И.А., Черноусова Л.Н. Особенности течения впервые выявленного туберкулеза легких в зависимости от генотипа M. tuberculosis // Инфекционные болезни. 2011. Т. 9, № 2. С. 68–72.
- Стратегия ВОЗ по ликвидации туберкулеза: цели и показатели. URL: https://www.who.int/tb/strategy/end-tb/ru (22.07.2019)
- Caws M., Thwaites G., Stepniewska K., Nguyen T.N., Nguyen T.H., Nguyen T.P., Mai N.T., Phan M.D., Tran H.L., Tran T.H., van Soolingen D., Kremer K., Nguyen V.V., Nguyen T.C., Farrar J. Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis is significantly associated with human immunodeficiency virus infection and multidrug resistance in cases of tuberculous meningitis. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, no. 11, pp. 3934–3939. doi: 10.1128/JCM.01181-06
- Coscolla M. Biological and epidemiological consequences of MTBC Diversity. Adv. Exp. Med. Biol., 2017, vol. 1019, pp. 95–116. doi: 10.1007/978-3-319-64371-7_5
- Coscolla M., Gagneux S. Consequences of genomic diversity in Mycobacterium tuberculosis. Semin. Immunol., 2014, vol. 26, no. 6, pp. 431–444. doi: 10.1016/j.smim.2014.09.012
- Folkvardsen D.B., Norman A., Andersen Å.B., Rasmussen E.M., Lillebaek T., Jelsbak L. A major Mycobacterium tuberculosis outbreak caused by one specific genotype in a low-incidence country: Exploring gene profile virulence explanations. Sci. Rep., 2018, vol. 8, no. 1, p. 11869. doi: 10.1038/s41598-018-30363-3
- Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A., van Agterveld M., van Soolingen D., Kuijper S., Bunschoten A., Molhuizen H., Shaw R., Goyal M., van Embden J. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J. Clin. Microbiol., 1997, vol. 35, no. 4, pp. 907–914.
- Kong Y., Cave M.D., Zhang L., Foxman B., Marrs C.F., Bates J.H., Yang Z.H. Association between Mycobacterium tuberculosis Beijing/W lineage strain infection and extrathoracic tuberculosis: insights from epidemiologic and clinical characterization of the three principal genetic groups of M. tuberculosis clinical isolates. J. Clin. Microbiol., 2007, vol. 45, no. 2, pp. 409–414. doi: 10.1128/JCM.01459-06
- Mokrousov I., Vyazovaya A., Zhuravlev V., Otten T., Millet J., Jiao W.W., Shen A.D., Rastogi N., Vishnevsky B., Narvskaya O. Realtime PCR assay for rapid detection of epidemiologically and clinically significant Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype isolates. J. Clin. Microbiol., 2014, vol. 52, pp. 1691–1693. doi: 10.1128/JCM.03193-13
- Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A., Otten T., Jiao W.W., Gomes L.L., Suffys P.N., Shen A.D., Vishnevsky B. Russian “successful” clone В0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: multiplex PCR assay for rapid detection and global screening. J. Clin. Microbiol., 2012, vol. 50, no. 11, pp. 3757–3759. doi: 10.1128/JCM.02001-12
- Mokrousov I., Chernyaeva E., Vyazovaya A., Skiba Y., Solovieva N., Valcheva V., Levina K., Malakhova N., Jiao W.W., Gomes L.L., Suffys P.N., Kütt M., Aitkhozhina N., Shen A.D., Narvskaya O., Zhuravlev V. Rapid assay for detection of the epidemiologically important Central Asian/Russian strain of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype. J. Clin. Microbiol., 2018, vol. 24, no. 56 (2): e01551-17. doi: 10.1128/JCM.01551-17
- Ribeiro S.C., Gomes L.L., Amaral E.P., Andrade M.R., Almeida F.M., Rezende A.L., Lanes V.R., Carvalho E.C., Suffys P.N., Mokrousov I., Lasunskaia E.B. Mycobacterium tuberculosis strains of the modern sublineage of the Beijing family are more likely to display increased virulence than strains of the ancient sublineage. J. Clin. Microbiol., 2014, vol. 52, no. 7, pp. 2615–2624. doi: 10.1128/JCM.00498
- Thwaites G., Caws M., Chau T.T., D’Sa A., Lan N.T., Huyen M.N., Gagneux S., Anh P.T., Tho D.Q., Torok E., Nhu N.T., Duyen N.T., Duy P.M., Richenberg J., Simmons C., Hien T.T., Farrar J. Relationship between Mycobacterium tuberculosis genotype and the clinical phenotype of pulmonary and meningeal tuberculosis. J. Clin. Microbiol., 2008, vol. 46, no. 4, pp. 1363–1368. doi: 10.1128/JCM.02180-07
- Van Embden J.D., Cave M.D., Crawford J.T., Dale J.W., Eisenach K.D., Gicquel B., Hermans P., Martin C., McAdam R., Shinnick T.M. Strain identification on Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology. J. Clin. Microbiol., 1993, vol. 31, pp. 406–409.
- Viegas S.O., Machado A., Groenheit R., Ghebremichael S., Pennhag A., Gudo P.S., Cuna Z., Langa E., Miotto P., Cirillo D.M., Rastogi N., Warren R.M., van Helden P.D., Koivula T., Källenius G. Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype is associated with HIV infection in Mozambique. PLoS One, 2013, vol. 8, no. 8: e71999. doi: 10.1371/journal.pone.0071999
- Wada T., Iwamoto T., Maeda S. Genetic diversity of the Mycobacterium tuberculosis Beijing family in East Asia revealed through refined population structure analysis. FEMS Microbiol Lett., 2009, vol. 291, no. 1, pp. 35–43. doi: 10.1111/j.1574-6968.2008.01431.x