Отправить статью по E-mail ВСПЫШКА СЕРОТИПОВ ВИРУСА ДЕГЕ У БОЛЬНЫХ ГЕМОРРАГИЧЕСКОЙ ЛИХОРАДКОЙ ДЕГЕ В ПЕШАВАРЕ, ПАКИСТАН
- Авторы: Рехман Ф.1,2, Хан С.2, Хасан Ф.1,3, Хан Х.2, Ахмед И.4, Хан З.5
-
Учреждения:
- Государственный высший научный колледж Пешавара, ХП, 25000, Пакистан
- Факультет зоологии Пешаварского университета, ХП, 25000 Пакистан
- Кафедра микробиологии, Кохатский университет науки и технологий, КП, Кохат 26000, Пакистан
- Харбинский институт ветеринарных исследований, CAAS – Объединенная лаборатория врожденного иммунитета Мичиганского государственного университета, Основная лаборатория ветеринарной биотехнологии, Китайская академия сельскохозяйственных наук, Харбин, Китай
- Государственный высший научный колледж Пешавара
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/2062
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-OOD-2062
- ID: 2062
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Резюме
История вопроса: Лихорадка Денге является наиболее серьезной медицинской проблемой в тропических и субтропических регионах мира, передающейся через укус комара Aedes aegypti. Вирус денге (DENV) подразделяется на 4 серотипа: DENV1, DENV2, DENV3 и DENV4. В Пакистане недостаточно изучена роль разных серотипов вируса денге в возникновении первичной геморрагической лихорадки денге (ГЛД) среди больных денге. Настоящее исследование было направлено на определение связи между серотипами DENV с DHF у пациентов с геморрагической лихорадкой денге в районе Пешавар, Пакистан.
Методы: у пациентов с ЛД и ГЛД всего было взято 200 образцов крови. Все образцы были признаны положительными с помощью NS1 Elisa. РНК экстрагировали с помощью набора РНК (TRIzol, США) согласно протоколу производителя. Далее выделенную РНК конвертировали в кДНК с помощью обратной транскриптазы Revert AID (Thermofisher Scientific). Целевой областью для транскрипции и амплификации является область c-prM, которую амплифицировали с помощью стандартного протокола ПЦР и с помощью Nested ПЦР идентифицировали серотипы DENV (1-4) (Thermofisher Scientific) с использованием праймеров, специфичных для серотипов (TS1, TS2, TS3 и TS4), после чего образцы анализировались гель-электрофорезом с определением размера продукта.
Результаты: в общей сложности 164 (82%) образца были признаны положительными как с помощью NS1 Elisa, так и с помощью RT-PCR, тогда как 36 (18%) были отрицательными по результатам RT-PCR. Исследуемая популяция состоит из 60% мужчин и 40% женщин. Среди положительных образцов у 40 пациентов была ГЛД: 24 (15%) мужчин и 16 (10%) женщин. Большинство заболевших пациентов имеют возрастной диапазон от 10 до 30 лет, и далее лица в возрасте 30-40 лет. Все пациенты с ГЛД были первичными пациентами и ранее не имели истории лихорадки денге. Благодаря использованию серотип-специфических праймеров все образцы ГЛД оказались положительными по серотипу 2 (DENV2). Это показывает, что DENV2 был в первую очередь связан с ГЛД.
Вывод: DENV2 является доминирующим серотипом при вспышке лихорадки Денге у больных в Пешаваре.
Ключевые слова
Об авторах
Фаиз ур Рехман
Государственный высший научный колледж Пешавара, ХП, 25000, Пакистан;Факультет зоологии Пешаварского университета, ХП, 25000 Пакистан
Email: faiz02140@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-5970-9346
ResearcherId: Zoology/Virology
преподаватель правительства Верховного научного колледжа Пешавар (5 лет)
Пакистан, Government Superior Science College Peshawar Affiliated with University of Peshawar PakistanСана Улла Хан
Факультет зоологии Пешаварского университета, ХП, 25000 Пакистан
Email: sanaullahkhan@uop.edu.pk
ResearcherId: Virology
доцент кафедры зоологического университета Пешаварского Пакистана (20 лет)
Пакистан, Department Of Zoology University of Peshawar PakistanФаиз уль Хасан
Государственный высший научный колледж Пешавара, ХП, 25000, Пакистан;Кафедра микробиологии, Кохатский университет науки и технологий, КП, Кохат 26000, Пакистан
Email: fhassan.mb@gmail.com
ResearcherId: Microbiology
кандидат наук, стипендиат кафедры микробиологии Кохатский университет науки и технологий (3 года)
Пакистан, Department of Microbiology Kohat University of Science and TechnologyХафиз Улла Хан
Факультет зоологии Пешаварского университета, ХП, 25000 Пакистан
Email: hafeez_ullah300@yahoo.com
факультет зоологического университета Пешаварского Пакистана (5 лет)
Пакистан, University of Peshawar PakistanИкбал Ахмед
Харбинский институт ветеринарных исследований, CAAS – Объединенная лаборатория врожденного иммунитета Мичиганского государственного университета, Основная лаборатория ветеринарной биотехнологии, Китайская академия сельскохозяйственных наук, Харбин, Китай
Email: iqbal_microbiologist@yahoo.com
ResearcherId: Microbiology /Virology
доктор наук, стипендиат Харбинского института ветеринарных исследований, Объединенная лаборатория врожденного иммунитета Мичиганского государственного университета, Основная лаборатория ветеринарной биотехнологии, Китайская академия сельскохозяйственных наук, Харбин, Китай (5 лет)
Пакистан, Harbin Veterinary Research Institute, CAAS- Michigan State University Joint Laboratory of Innate Immunity Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Chinese academy of Agricultural sciences, Harbin ChinaЗахур Хан
Государственный высший научный колледж Пешавара
Автор, ответственный за переписку.
Email: zahoor303@gmail.com
магистр философии, факультет зоологии Исламийского университета Пешавар, Пакистан (3 года)
Пакистан, Islamia College University Peshawar PAkistanСписок литературы
- Ali L., Gul Z., Ijaz A., Khalid N., Zeb F., Afzal S., Ullah A., Subhan F., Ahmed S. An overview of dengue viral infection circulating in Pakistan. J Vector Borne Dis, 2022,vol. 59, no.2, pp.109-114
- https://doi.org/10.4103/0972-9062.331412.
- Atif M., Raheel U., Alam F., Arshad H.U., BALOCH F., IMRAN M., ZAIDI N., WAQAR A. Serotyping of dengue virus from deadly outbreaks of Pakistan. Journal of Human Virology & Retro-virology, 2016, vol. 3, pp. 1-7.
- Ali A., ur Rehman H., Nisar M., Rafique S., Ali S., Hussain A & Hussain S. Seroepidemiology of dengue fever in Khyber Pakhtunkhawa, Pakistan. International Journal of Infectious Diseases, 2013, vol. 17, no.7, pp. e518-e523.
- https://doi.org/10.1016/j.ijid.2013.01.007.
- Gebhard L. G., Filomatori C. V & Gamarnik A. V. Functional RNA elements in the dengue virus genome, Viruses, 2011,vol. 3, no.9,pp. 1739-1756.
- doi: 10.3390/v3091739
- Halstead S.B., SuayaJ.A., Shepard D.S. The burden of dengue infection. Lancet, 2007, vol. 369, vol.9571, pp. 1410-1410.
- https://doi.org/10.1016/S0140-6736(07)60645-X
- Harapan H., Michie A., Mudatsir M., Sasmono R. T., Imrie A. Epidemiology of dengue hemorrhagic fever in Indonesia: analysis of five decades data from the National Disease Surveillance. BMC research notes, 2019, vol. 12, no.1, pp. 1-6.
- Jelinek T., Mühlberger N., Harms G., Corachan M., Grobusch M. P., Knobloch, J. European Network on Surveillance of Imported Infectious Diseases. Epidemiology and clinical features of imported dengue fever in Europe: sentinel surveillance data from Trop Net Europ. Clinical infectious diseases, 2002. Vol.35.no.9, pp. 1047-1052.
- https://doi.org/10.1086/342906.
- Khan M. A., Ellis E. M., Tissera H. A., Alvi M. Y., Rahman F. F., Masud F., Gubler D. J. Emergence and diversification of dengue 2 cosmopolitan genotype in Pakistan, 2011. PLoS One, 2013, vol. 8, pp.3, pp. e56391.
- https://doi.org/10.1371/journal.pone.0056391
- Khalid B., Ghaffar A. Dengue transmission based on urban environmental gradients in different cities of Pakistan. International journal of biometeorology, 2015, vol.59, no.3, pp. 267-283.
- 1007/s00484-014-0840-6
- Khan M..M., Khan H. Dengue fever in pakistan: What to do now? GJMS., 2016.vol.13,no.4, pp.197-198.
- Khan E., Kisat M., Khan N., Nasir A., Ayub S & Hasan R. Demographic and clinical features of dengue fever in Pakistan from 2003–2007: a retrospective cross-sectional study. PloS one, 2010.vol. 5, no.9,pp. e12505.
- https://doi.org/10.1371/journal.pone.0012505
- Mehmood A., Khan F. K., Chaudhry A., Hussain Z., Laghari M. A., Shah I., Ikram A. Risk Factors Associated with a Dengue Fever Outbreak in Islamabad, Pakistan: Case-Control Study. JMIR Public Health and Surveillance, 2021, vol. 7, no.12, pp. e27266.
- Messina M. J. P., Brady O. J., Scott T. W., Zou C., Pigott D. M., Duda K. A., Hay S. I. Global spread of dengue virus types: mapping the 70 year history. Trends in microbiology, 2014.vol. 22, no.3, pp. 138-146.
- https://doi.org/10.1016/j.tim.2013.12.011
- Mahmood N., Rana M. Y., Qureshi Z., Mujtaba G., Shaukat U. Prevalence and molecular characterization of dengue viruses serotypes in 2010 epidemic. The American journal of the medical sciences, 2012, vol. 343, no.1, pp. 61-64.
- doi: 10.1097/MAJ.0b013e3182217001.
- Qamash T., Jamil J., Khan F. A., Sultan A., Begum N & Din S. U. Epidemiological study of dengue fever in District Swabi, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan. Brazilian Journal of Biology, 2020; volume. 81, pp. 237-240.
- Suleman M., Faryal R., Aamir U. B., Alam M. M., Nisar N., Sharif S & Zaidi S. S. Z. Dengue outbreak in Swat and Mansehra, Pakistan 2013: An epidemiological and diagnostic perspective. Asian Pacific journal of tropical medicine, 2016, vol.9, no.4, pp.380-384.
- Shahid M., Amin I., Afzal S., Fatima Z., Zahid S., Ashraf U & Idrees M. Prevalence and molecular detection of dengue virus in 2013 outbreak in KPK and Punjab, Pakistan. P JZ, 2017, vol. 49, no.3, pp.1119-1122.
- http://dx.doi.org/10.17582/journal.pjz/2017.49.3.sc4.
- Tahir Z., Hafeez S., Chaudhry A. Spatial and seasonal variation of dengue fever in Lahore 2008. Biomedica, 2010.vol.26, no.pp.166-172.
- World Health Organization. (2017). Dengue and Severe Dengue–Fact Sheet Updated on April 2017
Дополнительные файлы
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).