Отправить статью по E-mail ОЦЕНКА СПОСОБНОСТИ ШТАММОВ SARS-COV-2 ГЕНЕТИЧЕСКИХ ВАРИАНТОВ B.1.1 И JN.1 УКЛОНЯТЬСЯ ОТ НЕЙТРАЛИЗУЮЩИХ АНТИТЕЛ РЕКОНВАЛЕСЦЕНТОВ 2020 И 2023 ГОДОВ
- Авторы: Пьянков С.А.1, Зайковская А.В.1, Рыбель А.В.1, Боднев С.А.1, Пьянков О.В.1
-
Учреждения:
- Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
- Дата подачи: 14.04.2025
- Дата принятия к публикации: 29.06.2025
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/17915
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-AOT-17915
- ID: 17915
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Резюме
Введение. Вирус SARS-CoV-2 обладает высокой изменчивостью за счет спонтанных мутаций, приводящих к возникновению новых генетических вариантов. Их естественный отбор, это в том числе результат воздействия иммунитета носителей на популяционном уровне. Чтобы спрогнозировать эффективность противодействия распространению COVID-19, необходимо изучить возможность сформированного ранее иммунитета противостоять актуальным штаммам вируса для оценки способности новых генетических вариантов уклоняться от нейтрализующих антител к ранее циркулировавшим. Цель работы - сравнение титров нейтрализующих антител у реконвалесцентов после COVID-19 2020 и 2023 годов к штаммам генетических вариантов B.1.1 и JN.1 SARS-CoV-2. Материалы и методы. Сыворотки крови от 76 и 68 реконвалесцентов соответственно для выборок 2020 и 2023 года были собраны и хранились при температуре минус 70 ℃ до эксперимента. Титр антител определяли методом нейтрализации исследуемой сывороткой цитопатического воздействия вируса на монослой чувствительной культуры. Анализ нейтрализующей активности сывороток проводили в отношении двух разновидностей SARS-CoV-2 VOC Ухань и Омикрон. Статистическую значимость разницы титров антител оценивали с помощью F‑критерия, достоверной считали разницу при p < 0,01. Результаты. Достоверны отличия нейтрализующих титров между всеми четырьмя выборками: сыворотки 2020 г к JN.1, сыворотки 2023 г к JN.1, сыворотки 2020 г к B.1.1, сыворотки 2023 г к B.1.1. Выводы. Антигенные изменения позволяют актуальному варианту JN.1 в ряде случаев ускользать от воздействия нейтрализующих антител, выработанных против штаммов предыдущих генетических вариантов. Выборка 2023 г показала более высокие значения титров антител при нейтрализации штаммов старого генетического варианта В.1.1 за счет повторной стимуляции при вакцинациях и реинфекции. Спонтанные мутации не привели к изменению критически важных для нейтрализации вируса антигенных детерминант, были не принципиальные. Повторные контакты с измененными генетическими вариантами SARS-CoV-2 повысили протективность против исходного дикого типа.
Об авторах
Степан Александрович Пьянков
Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Автор, ответственный за переписку.
Email: pyanstep@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-6593-6614
ведущий научный сотрудник, отдел Коллекция микроорганизмов
Россия, 630559, Кольцово, Новосибирская область, РоссияАнна Владимировна Зайковская
Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Email: zaykovskaya_av@vector.nsc.ru
ORCID iD: 0000-0002-0450-5212
к.б.н., старший научный сотрудник, отдел Коллекция микроорганизмов
Россия, 630559, Кольцово, Новосибирская область, РоссияАнна Вячеславовна Рыбель
Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Email: ann2539@yandex.ru
ORCID iD: 0009-0000-1111-9435
младший научный сотрудник, отдел Коллекция микроорганизмов
Россия, 630559, Кольцово, Новосибирская область, РоссияСергей Александрович Боднев
Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Email: bodnev@vector.nsc.ru
ORCID iD: 0000-0003-0599-3817
к.м.н., ведущий научный сотрудник, отдел Коллекция микроорганизмов
Россия, 630559, Кольцово, Новосибирская область, РоссияОлег Викторович Пьянков
Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Email: pyankov@vector.nsc.ru
ORCID iD: 0000-0003-3340-8750
к.б.н., ведущий научный сотрудник, отдел Коллекция микроорганизмов
Россия, 630559, Кольцово, Новосибирская область, РоссияСписок литературы
- Зайковская А.В., Евсеенко В.А., Олькин С.Е., Пьянков О.В. Изучение антигенных свойств штаммов коронавируса SARS-CoV-2, выделенных на территории РФ В 2020–2022 гг., в реакции нейтрализации с использованием гипериммунных сывороток мышей. Инфекция и иммунитет. 2023, Т. 13, № 1, с. 37–45. Zaykovskaya A.V., Evseenko V.A., Olkin S.E., Pyankov O.V. Investigating antigenic features of the SARS-CoV-2 isolated in Russian Federation in 2021–2022 by hyperimmune mouse serum neutralization. Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet. 2023, vol. 13, no. 1, pp. 37–45. doi: 10.15789/2220-7619-IAF-1998
- Зайковская А.В., Евсеенко В.А., Олькин С.Е., Пьянков О.В. Изучение антигенных свойств штаммов коронавируса SARS-CoV-2, относящихся к разным сублиниям Омикрон-варианта, в реакции нейтрализации с использованием гипериммунных сывороток мышей // Инфекция и иммунитет. 2024. Т. 14, № 5. C. 881–890. Zaykovskaya A.V., Evseenko V.A., Olkin S.E., Pyankov O.V. Antigenic features of the strains SARS-CoV-2 of omicron sublines assessed by hyperimmune mouse serum neutralization. Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i mmunitet. 2024, vol. 14, no. 5, pp. 881–890. doi: 10.15789/2220-7619-AFO-17591
- Brangel P., Tureli S., Mühlemann B., Liechti N., Zysset D., Engler O., Hunger-Glaser I., Ghiga I., Mattiuzzo G., Eckerle I., Bekliz M., Rössler A., Schmitt M.M., Knabl L., Kimpel J., Tort L.F.L., de Araujo M.F., de Oliveira A.C.A., Caetano B.C., Siqueira M.M., Budt M., Gensch J.M., Wolff T., Hassan T., Selvaraj F.A., Hermanus T., Kgagudi P., Crowther C., Richardson S.I., Bhiman J.N., Moore P.L., Cheng S.M.S., Li J.K.C., Poon L.L.M., Peiris M., Corman V.M., Drosten C., Lai L., Hunsawong T., Rungrojcharoenkit K., Lohachanakul J., Sigal A., Khan K., Thiel V., Barut G.T., Ebert N., Mykytyn A.Z., Owusu Donkor I., Aboagye J.O., Nartey P.A., Van Kerkhove M.D., Cunningham J., Haagmans B.L., Suthar M.S., Smith D., Subissi L. A Global Collaborative Comparison of SARS-CoV-2 Antigenicity Across 15 Laboratories. Viruses, 2024, vol. 18, no. 16(12), p. 1936. doi: 10.3390/v16121936. PMID: 39772242; PMCID: PMC11680265.
- Geurtsvan Kessel C.H., Geers D., Schmitz K.S., Mykytyn A.Z., Lamers M.M., Bogers S., Scherbeijn S., Gommers L., Sablerolles R.S.G., Nieuwkoop N.N., Rijsbergen L.C., van Dijk L.L.A., de Wilde J., Alblas K., Breugem T.I., Rijnders B.J.A., de Jager H., Weiskopf D., van der Kuy P.H.M., Sette A., Koopmans M.P.G., Grifoni A., Haagmans B.L., de Vries R.D. Divergent SARS-CoV-2 Omicron-reactive T and B cell responses in COVID-19 vaccine recipients. Sci Immunol., 2022, vol. 25, no. 7(69), p. 2202. doi: 10.1126/sciimmunol.abo2202. Epub 2022 Mar 25. PMID: 35113647; PMCID: PMC8939771
- Jassat W., Abdool Karim S.S., Mudara C., Welch R., Ozougwu L., Groome M.J., Govender N., von Gottberg A., Wolter N., Wolmarans M., Rousseau P., DATCOV author group, Blumberg L., Cohen C. Clinical severity of COVID-19 in patients admitted to hospital during the omicron wave in South Africa: a retrospective observational study. Lancet Glob Health, 2022, no. 10(7), pp. 961-969. doi: 10.1016/S2214-109X(22)00114-0. Epub 2022 May 18. PMID: 35597249; PMCID: PMC9116895.
- Karim S.S.A., Karim Q.A. Omicron SARS-CoV-2 variant: a new chapter in the COVID-19 pandemic. Lancet, 2021, vol. 11, no. 398(10317), pp. 2126-2128. doi: 10.1016/S0140-6736(21)02758-6. PMID: 34871545; PMCID: PMC8640673.
- Khoury D.S., Cromer D., Reynaldi A., Schlub T.E., Wheatley A.K., Juno J.A., Subbarao K., Kent S.J., Triccas J.A., Davenport M.P. Neutralizing antibody levels are highly predictive of immune protection from symptomatic SARS-CoV-2 infection. Nat Med., 2021, no. 27(7), pp. 1205-1211. doi: 10.1038/s41591-021-01377-8. PMID: 34002089.
- Markov PV, Ghafari M, Beer M, Lythgoe K, Simmonds P, Stilianakis NI, Katzourakis A. The evolution of SARS-CoV-2. Nat Rev Microbiol. 2023 Jun;21(6):361-379. doi: 10.1038/s41579-023-00878-2. Epub 2023 Apr 5. PMID: 37020110.
- Mazzotti L., Borges de Souza P., Azzali I., Angeli D., Nanni O., Sambri V., Semprini S., Bravaccini S., Cerchione C., Gaimari A., Nicolini F., Ancarani V., Martinelli G., Pasetto A., Calderon H., Juan M., Mazza M. Exploring the Relationship Between Humoral and Cellular T Cell Responses Against SARS-CoV-2 in Exposed Individuals From Emilia Romagna Region and COVID-19 Severity. HLA, 2025, no. 105(1), pp. 70011. doi: 10.1111/tan.70011. PMID: 39807702; PMCID: PMC11731316.
- Pons S., Uhel F., Frapy E., Sérémé Y., Zafrani L., Aschard H., Skurnik D. How Protective are Antibodies to SARS-CoV-2, the Main Weapon of the B-Cell Response? Stem Cell Rev Rep., 2023, no.19(3), pp. 585-600. doi: 10.1007/s12015-022-10477-y. PMID: 36422774; PMCID: PMC9685122.
- Sievers C., Zacher B., Ullrich A., Huska M., Fuchs S., Buda S., Haas W., Diercke M., An der Heiden M., Kröger S. SARS-CoV-2 Omicron variants BA.1 and BA.2 both show similarly reduced disease severity of COVID-19 compared to Delta, Germany, 2021 to 2022. Euro Surveill., 2022, no. 27(22), pp. 2200396. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2022.27.22.2200396. PMID: 35656831; PMCID: PMC9164675.
- Stephenson E., Reynolds G., Botting R.A., Calero-Nieto F.J., Morgan M.D., Tuong Z.K., Bach K., Sungnak W., Worlock K.B., Yoshida M., Kumasaka N., Kania K., Engelbert J., Olabi B., Spegarova J.S., Wilson N.K., Mende N., Jardine L., Gardner L.C.S., Goh I., Horsfall D., McGrath J., Webb S., Mather M.W., Lindeboom R.G.H., Dann E., Huang N., Polanski K., Prigmore E., Gothe F., Scott J., Payne R.P., Baker K.F., Hanrath A.T., Schim van der Loeff I.C.D., Barr A.S., Sanchez-Gonzalez A., Bergamaschi L., Mescia F., Barnes J.L., Kilich E., de Wilton A., Saigal A., Saleh A., Janes S.M., Smith C.M., Gopee N., Wilson C., Coupland P., Coxhead J.M., Kiselev V.Y., van Dongen S., Bacardit J., King H.W., Cambridge Institute of Therapeutic Immunology and Infectious Disease-National Institute of Health Research (CITIID-NIHR) COVID-19 BioResource Collaboration, Rostron A.J., Simpson A.J., Hambleton S., Laurenti E., Lyons P.A., Meyer K.B., Nikolić M.Z., Duncan C.J.A., Smith K.G.C., Teichmann S.A., Clatworthy M.R., Marioni J.C., Göttgens B., Haniffa M. Single-cell multi-omics analysis of the immune response in COVID-19. Nat Med., 2021, no. 27(5), pp. 904-916. doi: 10.1038/s41591-021-01329-2. PMID: 33879890; PMCID: PMC8121667.
- Strong MJ. SARS-CoV-2, aging, and Post-COVID-19 neurodegeneration. J Neurochem., 2023, no. 165(2), pp. 115-130. doi: 10.1111/jnc.15736. PMID: 36458986; PMCID: PMC9877664.
- Trimbake D., Singh D., K Y.G., Babar P., S V.D., Tripathy A.S. Durability of Functional SARS-CoV-2-Specific Immunological Memory and T Cell Response up to 8-9 Months Postrecovery From COVID-19. J Immunol Res., 2025, no. 10, p. 2025:9743866. doi: 10.1155/jimr/9743866. PMID: 39963186; PMCID: PMC11832264
- WHO. Enhancing Readiness for Omicron (B.1.1.529): Technical Brief and Priority Actions for Member States. 2021, accessed on 03 March 2025. Available online: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/2021-12-17-technical-brief-and-priority-action-on-omicron-en.pdf
- WHO. World Health Organization COVID-19 Epidemiological Update - 13 February 2025. Edition 176, Emergency Situational Updates. 2025, accessed on 03 March 2025. Available online: https://www.who.int/publications/m/item/covid-19-epidemiological-update-edition-176
- Yuan M., Wilson I.A. Structural Immunology of SARS-CoV-2. Immunol Rev., 2025, no. 329(1), p. 13431. doi: 10.1111/imr.13431. PMID: 39731211; PMCID: PMC11727448
- Zhou P., Yang X.L., Wang X.G., Hu B., Zhang L., Zhang W., Si H.R., Zhu Y., Li B., Huang C.L., Chen H.D., Chen J., Luo Y., Guo H., Jiang R.D., Liu M.Q., Chen Y., Shen X.R., Wang X., Zheng X.S., Zhao K., Chen Q.J., Deng F., Liu L.L., Yan B., Zhan F.X., Wang Y.Y., Xiao G.F., Shi Z.L. Addendum: A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature, 2020, no. 588(7836), p. 6. PMID: 33199918; PMCID: PMC9744119. doi: 10.1038/s41586-020-2012-7.
- Zhu N., Zhang D., Wang W., Li X., Yang B., Song J., Zhao X., Huang B., Shi W., Lu R., Niu P., Zhan F., Ma X., Wang D., Xu W., Wu G., Gao G.F., Tan W., China Novel Coronavirus Investigating and Research Team. A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019. N Engl J Med., 2020, no. 382(8), pp. 727-733. doi: 10.1056/NEJMoa2001017. PMID: 31978945; PMCID: PMC7092803
Дополнительные файлы
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).