Эффективность GeneXpert MTB/RIF в диагностике внелегочного туберкулеза в Марокко
- Авторы: Аайнус А.1,2, Момен Г.1,2, Белгити А.1, Беннани К.3, Ламаамал А.2, Шетиуи Ф.2, Мессауди М.2, Благен М.1,4, Муслим Д.1, Кьятти М.2, Эль Мессауди М.Д.2
-
Учреждения:
- Университет Хасана II
- Институт Пастера Марокко
- Министерство здравоохранения
- Университет Шуаиба Дукали
- Выпуск: Том 12, № 1 (2022)
- Страницы: 78-84
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
- Дата подачи: 07.03.2021
- Дата принятия к публикации: 09.08.2021
- Дата публикации: 11.10.2021
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/1695
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-POG-1695
- ID: 1695
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Туберкулез (ТБ), хроническое бактериальное заболевание, вызываемое Mycobacterium tuberculosis, обычно поражает легкие, но также может затрагивать и другие анатомические области (внелегочный туберкулез, ВЛТ). Для начала специфического эффективного лечения необходимо проведение быстрой диагностики. Хотя культивирование микобактерий остается золотым стандартом для диагностики ВЛТ, все больший интерес вызывают молекулярные методы. GeneXpert MTB/RIF — быстрый автоматизированный диагностический тест, который позволяет обнаруживать M. tuberculosis, а также мутации в «горячем участке» гена rpoB, связанные с устойчивостью к рифампицину. Настоящее исследование было выполнено для оценки эффективности теста GeneXpert MTB/RIF для диагностики внелегочного туберкулеза в сравнении со стандартным методом. Данное проспективное исследование было проведено на 304 клинических образцах, собранных у 192 пациентов, посещавших лабораторию микобактерий и туберкулеза Института Пастера в Марокко в период с 2016 по 2017 гг. Из 304 образцов 113 составляла плевральная жидкость, очищенная с использованием метода Петрова, а 191 образец биопсии (78 лимфатических узлов и 113 биопсий плевры), деконтаминированные с использованием метода Левейнштейна. Обнаружение и идентификацию Mycobacterium tuberculosis проводили для всех образцов с использованием микроскопии мазка, культивирования на среде Левенштейна–Йенсена и теста GeneXpert MTB/RIF. Наши результаты показали, что 54,5% (103/189) составляли мужчины и 45,5% (86/189) — женщины. Возраст пациентов составлял от 2 до 78 лет, большинство пациентов были в возрастной группе от 25 до 45 лет. Внелегочные образцы были взяты из лимфатических узлов, плевральной жидкости и плевральных тканей с процентным соотношением 25,66, 37,17 и 37,17% соответственно. Интересно, что чувствительность GeneXpert составила 51,4% для всех образцов и 83,3% для лимфатических узлов. Таким образом, настоящее исследование показало, что эффективность теста GeneXpert значительно зависит от типа образца, при этом высокая чувствительность наблюдается для лимфатических узлов. Кроме того, мы показали, что тест GeneXpert MTB/RIF имеет ограничения в диагностике плеврального туберкулеза. Мы рекомендуем совместное использование GeneXpert MTB/RIF и традиционных методов для диагностики внелегочного туберкулеза.
Ключевые слова
Об авторах
А. Аайнус
Университет Хасана II; Институт Пастера Марокко
Автор, ответственный за переписку.
Email: achraf.aainouss@gmail.com
Ашраф Аайнус - аспирант, центр медицинской биологии лаборатории микобактерий и туберкулеза, Институт Пастера; аспирант кафедры биологии, лаборатория экологии и окружающей среды, отделение микробиологии научного факультета Бен М’Сик, Университет Хасана II.
27182, Касабланка, Нуасёр, ул. Тарика ибн Зияда, 19.
Тел.: +212 611-42-48-19.
МароккоГ. Момен
Университет Хасана II; Институт Пастера Марокко
Email: Momenghizlane2016@gmail.com
Момен Гхизлане - аспирант, центр медицинской биологии лаборатории микобактерий и туберкулеза, Институт Пастера Марокко; лаборатория микробиологии, фармакологии, биотехнологии и окружающей среды, факультет науки Айн Чок, Университет Хасана II.
Касабланка.
МароккоА. Белгити
Университет Хасана II
Email: Belghiti.ayoub@gmail.com
Белгити Аёуб - кандидат наук, лаборатория экологии и окружающей среды, отделение микробиологии научного факультета Бен М’Сик, Университет Хасана II.
Касабланка.
МароккоК. Беннани
Министерство здравоохранения
Email: kenzabennani20@gmail.com
Беннани Кенза - магистр здравоохранения, департамент эпидемиологии и контроля заболеваний, Министерство здравоохранения.
Рабат.
МароккоА. Ламаамал
Институт Пастера Марокко
Email: abdelmajid.lamaammal@pasteur.ma
Ламаамал Абделмайид - инженер-экспериментатор лаборатории микобактерий и туберкулеза, Институт Пастера Марокко.
Касабланка.
МароккоФ. Шетиуи
Институт Пастера Марокко
Email: chetioui.fouad@gmail.com
Шетиуи Фоуад - инженер-экспериментатор лаборатории микобактерий и туберкулеза, Институт Пастера Марокко.
Касабланка.
МароккоМ. Мессауди
Институт Пастера Марокко
Email: malika.messaoudi@pasteur.ma
Мессауди Малика - инженер-экспериментатор лаборатории микобактерий и туберкулеза, Институт Пастера Марокко.
Касабланка.
МароккоМ. Благен
Университет Хасана II; Университет Шуаиба Дукали
Email: blaghen@hotmail.com
Благен Мохамед - заведующий лабораторией микробиологии, фармакологии, биотехнологии и окружающей среды, факультет науки Айн Чок, Университет Хасана II; декан факультета наук Эль-Джадида, Университет Шуаиба Дукали.
Касабланка; Эль-Джадида.
МароккоД. Муслим
Университет Хасана II
Email: jammouslim@yahoo.fr
Муслим Ямал - кандидат наук, профессор, лаборатория экологии и окружающей среды, отделение микробиологии научного факультета Бен М’Сик, Университет Хасана II.
Касабланка.
МароккоМ. Кьятти
Институт Пастера Марокко
Email: meriem.khyatti@pasteur.ma
Кьятти Мерием - кандидат наук, ведущий научный сотрудник лаборатории вирусной онкологии, Институт Пастера Марокко.
Касабланка.
МароккоМ. Д. Эль Мессауди
Институт Пастера Марокко
Email: mydriss.elmessaoudi@gmail.com
Эль Мессауди Моулаы Дрисс - магистр здравоохранения, заведующий лабораторией микобактерий и туберкулеза, Институт Пастера Марокко.
Касабланка.
МароккоСписок литературы
- Bennani K., Khattabi A., Akrim M., Mahtar M., Benmansour N., Essakalli Hossyni L., Karkouri M., Cherradi N., El Messaoudi M.D., Lahlou O., Cherkaoui I., Khader Y., Maaroufi A., Ottmani S.E. Evaluation of the yield of histopathology in the diagnosis of lymph node tuberculosis in Morocco, 2017. JMIR Public Health Surveill., 2019, vol. 5, no. 4: e14252. doi: 10.2196/14252
- Christopher D.J., Schumacher S.G., Michael J.S., Luo R., Balamugesh T., Duraikannan P., Pollock N.R., Pai M., Denkinger C.M. Performance of Xpert MTB/RIF on pleural tissue for the diagnosis of pleural tuberculosis. Eur. Respir. J., 2013, vol. 42, no. 5, pp. 1427–1429. doi: 10.1183/09031936.00103213
- Du J., Huang Z., Luo Q., Xiong G., Xu X., Li W., Liu X., Li J. Rapid diagnosis of pleural tuberculosis by Xpert MTB/RIF assay using pleural biopsy and pleural fluid specimens. J. Res. Med. Sci., 2015, vol. 20, no. 1, pp. 26–31.
- Friedrich S.O., von Groote-Bidlingmaier F., Diacon A.H. Xpert MTB/RIF assay for diagnosis of pleural tuberculosis. J. Clin. Microbiol., 2011, vol. 49, no. 12, pp. 4341–4342. doi: 10.1128/JCM.05454-11
- Ghariani A., Jaouadi T., Smaoui S., Mehiri E., Marouane C., Kammoun S., Essalah L., Driss M., Messadi F., Slim-Saidi L. Diagnosis of lymph node tuberculosis using the GeneXpert MTB/RIF in Tunisia. Int. J. Mycobacteriol., 2015, vol. 4, no. 4, pp. 270–275. doi: 10.1016/j.ijmyco.2015.05.011
- GLI. GLI model TB diagnostic algorithms. 2018. 37 p. URL: http://www.stoptb.org/wg/gli/assets/documents/gli_algorithms.pdf
- Hamzaoui G., Amro L., Sajiai H., Serhane H., Moumen N., Ennezari A., Yazidi A.A. Tuberculose ganglionnaire: aspects épidémiologiques, diagnostiques et thérapeutiques, à propos de 357 cas. Pan Afr. Med. J., 2014, vol. 19: 157. doi: 10.11604/pamj.2014.19.157.4916
- Ketata W., Rekik W.K., Ayadi H., Kammoun S. Les tuberculoses extrapulmonaires. Rev. Pneumol. Clin., 2015, vol. 71, no. 2–3, pp. 83–92. doi: 10.1016/j.pneumo.2014.04.001
- Lawn S.D., Zumla A.I. Diagnosis of extrapulmonary tuberculosis using the Xpert® MTB/RIF assay. Expert Rev. Anti. Infect. Ther., 2012, vol. 10, no. 6, pp. 631–635. doi: 10.1586/eri.12.43
- Le Ministre de la santé du Maroc. Ensemble pour un Maroc sans tuberculose, 2018. URL: https://www.sante.gov.ma/Pages/Communiques.aspx?IDCom=277
- Lu Y., Zhu Y., Shen N., Tian L, Sun Z. Evaluating the diagnostic accuracy of the Xpert MTB/RIF assay on bronchoalveolar lavage fluid: a retrospective study. Int. J. Infect. Dis., 2018, vol. 71, pp. 14–19. doi: 10.1016/j.ijid.2018.01.030
- Marouane C., Smaoui S., Kammoun S., Slim L., Messadi-Akrout F. Evaluation of molecular detection of extrapulmonary tuberculosis and resistance to rifampicin with GeneXpert® MTB/RIF. Med. Mal. Infect., 2016, vol. 46, no. 1, pp. 20–24. doi: 10.1016/j.medmal.2015.10.012
- Marrakchi C., Maâloul I., Lahiani D., Hammami B., Boudawara T., Zribi M., Ben Jemaâ M. Diagnostic de la tuberculose ganglionnaire périphérique en Tunisie. Méd. Mal. Infect., 2010, vol. 40, no. 2, pp. 119–122. doi: 10.1016/j.medmal.2009.10.014
- Mechal Y., Benaissa E., El Mrimar N., Benlahlou Y., Bssaibis F., Zegmout A., Chadli M., Malik Y.S., Touil N., Abid A., Maleb A., Elouennass M. Evaluation of GeneXpert MTB/RIF System performances in the diagnosis of extrapulmonary tuberculosis. BMC Infect. Dis., 2019, vol. 19, no. 1: 1069. doi: 10.1186/s12879-019-4687-7
- Moure R., Martin R., Alcaide F. Effectiveness of an integrated real-time PCR method for detection of the Mycobacterium tuberculosis complex in smear-negative extrapulmonary samples in an area of low tuberculosis prevalence. J. Clin. Microbiol., 2012, vol. 50, no. 2, pp. 513–515. doi: 10.1128/JCM.06467-11
- Naveen P., Nirmal C.K., Balbir M., Kuldip K. Role of geneXpert MTB/RIF in diagnosis of extrampulmonary tuberculosis at Gouvernment Medical College, Amritsar. Int. J. Curr. Res. Med. Sci., 2018, vol. 4, no. 3, pp. 134–141. doi: 10.22192/ijcrms.2018.04.03.017
- Nicol M.P., Whitelaw A., Wendy S. Using Xpert MTB/RIF. Curr. Respir. Med. Rev., 2013, vol. 9, no. 3, pp. 187–192. doi: 10.2174/1573398X113099990015
- Peirse M., Houston A. Extrapulmonary tuberculosis. Medicine, 2017, vol. 45, no. 12, pp. 747–752. doi: 10.1016/j.mpmed.2017.09.008
- Porcel J.M., Palma R., Valdés L., Bielsa S., San-José E., Esquerda A. Xpert® MTB/RIF in pleural fluid for the diagnosis of tuberculosis. Int. J. Tuberc. Lung Dis., 2013, vol. 17, no. 9, pp. 1217–1219. doi: 10.5588/ijtld.13.0178
- Rakotoarivelo R., Ambrosioni J., Rasolofo V., Raberahona M., Rakotosamimanana N., Andrianasolo R., Ramanampamonjy R., Tiaray M., Razafimahefa J., Rakotoson J., Randria M., Bonnet F., Calmy A.; MadaXpert Study Group. Evaluation of the Xpert MTB/RIF assay for the diagnosis of smear-negative pulmonary and extrapulmonary tuberculosis in Madagascar. Int. J. Infect. Dis., 2018, vol. 69, pp. 20–25. doi: 10.1016/j.ijid.2018.01.017
- Sharma B. Polyfunctional T cells as biomarkers in diagnosis of extrapulmonary tuberculosis. Respir. Med., 2017, vol. 5, no. 1, 2 p.
- Tortoli E., Russo C., Piersimoni C., Mazzola E., Dal Monte P., Pascarella M., Borroni E., Mondo A., Piana F., Scarparo C., Coltella L., Lombardi G., Cirillo D.M. Clinical validation of Xpert MTB/RIF for the diagnosis of extrapulmonary tuberculosis. Eur. Respir. J., 2012, vol. 40, no. 2, pp. 442–447. doi: 10.1183/09031936.00176311
- Tripathi K., Tripathi P.C., Nema S., Shrivastava A.K., Dwiwedi K., Dhanvijay A.K. Modified Petroff’s Method: an excellent simplified decontamination technique in comparison with Petroff’s method, IJRTSAT, 2014, vol. 10, no. 3, pp. 461–464.
- WHO. Automated real-time nucleic acid amplification technology for rapid and simultaneous detection of tuberculosis and rifampicin resistance: Xpert MTB/RIF assay for the diagnosis of pulmonary and extrapulmonary TB in adults and children. Geneva: WHO, 2013. URL: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25473701
- WHO. Global tuberculosis report, 2019. Geneva: WHO, 2019, pp. 88–92.
- Wright C.A., van der Burg M., Geiger D., Noordzij J.G., Burgess S.M., Marais B.J. Diagnosing mycobacterial lymphadenitis in children using fine needle aspiration biopsy: Cytomorphology, ZN staining and autofluorescence — making more of less. Diagn. Cytopathol., 2008, vol. 36, no. 4, pp. 245–251. doi: 10.1002/dc.20788
- Zeka A.N., Tasbakan S., Cavusoglu C. Evaluation of the GeneXpert MTB/RIF assay for rapid diagnosis of tuberculosis and detection of rifampin resistance in pulmonary and extrapulmonary specimens. J. Clin. Microbiol., 2011, vol. 49, no. 12, pp. 4138– 4141. doi: 10.1128/JCM.05434-11