Этиология гриппоподобных заболеваний у населения Новосибирска во время эпидемического сезона 2018–2019 гг.

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Грипп и другие острые респираторные вирусные инфекции, приводя к значительному числу тяжелых случаев заболевания, требующих госпитализации пациентов, остаются глобальной проблемой здравоохранения. В рамках исследований «Глобальной сети по госпитальному надзору за гриппом» (Global Influenza Hospital Surveillance Network, GIHSN) мы оценили вклад вируса гриппа и других респираторных вирусов в развитие тяжелых форм гриппоподобных заболеваний, регистрируемых в условиях инфекционных стацио наров г. Новосибирска в 2018–2019 гг. Методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с помощью коммерческих тест-систем нами было проанализировано 484 назофарингеальных мазка от пациентов, госпитализированных с симптомами острых респираторных вирусных заболеваний. Вирусная этиология заболеваний была подтверждена у 69,8% обследованных пациентов. Вирусы гриппа выявлены в 47,1% случаев, при этом наблюдалась совместная циркуляция вирусов гриппа A(H1N1)pdm09 и A(H3N2) у 20,7 и 26% пациентов соответственно, в то время как вирус гриппа В выявлен только в одном образце. Все проанализированные штаммы вируса гриппа А, выделенные в ходе исследования, антигенно были подобны вакцинным штаммам. Генетически штаммы, циркулировавшие в г. Новосибирске, были родственны вариантам вируса гриппа А, распространенным в России и в мире. Все случаи заболевания гриппом, требовавшие госпитализации в отделение реанимации и интенсивной терапии, отмечались у пациентов в возрасте от 0 до 14 лет и были вызваны вирусом A(H1N1)pdm09. Другие респираторные вирусы были выявлены у 36,4% детей и у 5,8% взрослых, причем у 8,3% детей наблюдалась вирусная коинфекция, в то время как у взрослых случаев коинфекции выявлено не было. Наиболее часто встречающимися вирусами у детей были метапневмовирус — 12,8%, риновирус — 9,3% и респираторно-синцитиальный вирус — 8,0%. У взрослых были выявлены метапневмовирус, аденовирус, вирус парагриппа и риновирус с уровнем детекции не более 2%. В ходе данного исследования нами не было обнаружено различий в частоте выявления вируса гриппа в связи с наличием фоновой патологии, беременности или привычки к курению. В то же время уровень выявления других респираторных вирусов у некурящих пациентов был достоверно ниже, чем у курящих и тех, кто курил ранее (26,15, 66,67 и 62,50% соответственно). Кроме того, уровень детекции респираторных вирусов у детей с хронической патологией был достоверно выше, чем у детей без фоновых состояний (55,3 и 38,7% соответственно). Таким образом, подобные исследования имеют важное значение для отслеживания и контроля инфекции.

Об авторах

О. Г. Курская

ФГБНУ Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины

Автор, ответственный за переписку.
Email: kurskaya_og@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1931-2026

Курская Ольга Григорьевна,  к.м.н., старший научный сотрудник отдела экспериментального моделирования и патогенеза инфекционных заболеваний 

630117, г. Новосибирск, ул. Тимакова, 2

Тел.: 8 913 741-23-46 (моб.)

Россия

А. В. Аношина

ГБУЗ НО Детская городская клиническая больница № 6

Email: anzhelika.anoshina2010@yandex.ru

к.м.н., зав. инфекционным отделением 

г. Новосибирск 

Россия

Н. В. Леонова

ГБУЗ НО Детская городская клиническая больница № 6

Email: mbuz_dgb6@mail.ru

главный врач 

г. Новосибирск 

Россия

О. А. Симкина

ГБУЗ НО Детская городская клиническая больница № 3

Email: olgasimkina83@yandex.ru

врач-эпидемиолог

г. Новосибирск 

Россия

Т. В. Комиссарова

ГБУЗ НО Детская городская клиническая больница № 3

Email: dgkb3@nso.ru

к.м.н., главный врач

г. Новосибирск 

Россия

Е. Ю. Есикова

ГБУЗ НО Городская инфекционная клиническая больница № 1

Email: elenaesikov@yandex.ru

врач-инфекционист

г. Новосибирск 

Россия

Л. Л. Позднякова

ГБУЗ НО Городская инфекционная клиническая больница № 1

Email: gikb1@nso.ru

к.м.н., заслуженный врач РФ, главный врач

г. Новосибирск 

Россия

И. А. Соболев

ФГБНУ Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины

Email: sobolev_i@hotmail.com
ORCID iD: 0000-0002-4561-6517

к.б.н., научный сотрудник

г. Новосибирск 

Россия

Е. А. Прокопьева

ФГБНУ Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины

Email: e.prokopeva@g.nsu.ru
ORCID iD: 0000-0002-5349-8362

к.б.н., старший научный сотрудник

г. Новосибирск 

Россия

Т. А. Мурашкина

ФГБНУ Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины

Email: murashkinatatiana89@gmail.com

младший научный сотрудник

г. Новосибирск 

Россия

Е. А. Казачкова

ФГБНУ Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины

Email: evgesha_c@mail.ru

младший научный сотрудник

г. Новосибирск 

Россия

А. Ю. Алексеев

ФГБНУ Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины

Email: al-alexok@ngs.ru

к.б.н., старший научный сотрудник, руководитель лаборатории моделирования и мониторинга инфекционных процессов

г. Новосибирск 

Россия

Д. М. Даниленко

ФГБУ Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава РФ

Email: daria.baibus@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-6174-0836

к.б.н., зам. директора по научной работе, руководитель отдела этиологии и эпидемиологии

Санкт-Петербург 

Россия

А. Б. Комиссаров

ФГБУ Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава РФ

Email: andrey.komissarov@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0003-1733-1255

зав. лабораторией молекулярной вирусологии

Санкт-Петербург 

Россия

К. А. Столяров

ФГБУ Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава РФ

Email: kirill@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0002-1765-2799

ведущий программист

Санкт-Петербург 

Россия

А. В. Фадеев

ФГБУ Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава РФ

Email: afadeew@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-3558-3261

научный сотрудник

Санкт-Петербург 

Россия

А. А. Соминина

ФГБУ Научно-исследовательский институт гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава РФ

Email: anna.sominina@influenza.spb.ru
ORCID iD: 0000-0001-9671-0629

к.м.н., профессор, заслуженный деятель науки РФ, руководитель лаборатории изучения факторов риска при гриппе и ОРВИ

Санкт-Петербург 

Россия

А. М. Шестопалов

ФГБНУ Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины

Email: shestopalov2@ngs.ru

д.б.н., профессор, зав. отделом экспериментального моделирования и патогенеза инфекционных заболеваний

г. Новосибирск 

Россия

К. А. Шаршов

ФГБНУ Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины

Email: sharshov@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-3946-9872

к.б.н., старший научный сотрудник, зав. лабораторией разработки и испытания фармакологических средств

г. Новосибирск 

Россия

Список литературы

  1. Львов Н.И., Писарева М.М., Мальцев О.В., Бузицкая Ж.В., Афанасьева В.С., Михайлова М.А., Го А., Янина М.А., Резниченко Н.А., Грудинин М.П., Жданов К.В., Лобзин Ю.В. Особенности этиологической структуры ОРВИ в отдельных возрастных и профессиональных группах населения Санкт-Петербурга в эпидемический сезон 2013–2014 гг. // Журнал инфектологии. 2014. Т. 6, № 3, C. 62–70. [Lvov N.I., Pisareva M.M., Maltsev O.V., Buzitskaya J.V., Afanasieva V.S., Mikhailova M.A., Go A., Yanina M.A., Reznichenko N.A., Grudinin M.P., Zhdanov K.V., Lobzin Y.V. The features of ARVD etiological structure in different age and professional population groups in Saint-Petersburg during 2013–2014 epidemic season. Zhurnal infektologii = Journal of Infectology, 2014, vol. 6, no. 3, pp. 62–70. (In Russ.)] doi: 10.22625/2072-6732-2014-6-3-62-70
  2. Роспотребнадзор. Итоги прошлого эпидсезона гриппа (2018–2019 гг.) и прогноз на новый сезон 2019–2020 гг. [Russian Federal Service on Surveillance for Consumer Rights Protection and Human Well-being (Rospotrebnadzor). About the results of the epidemic season of influenza (2018–2019), forecast for the 2019–2020 epidemic season. (In Russ.)] URL: http://41.rospotrebnadzor.ru/content/itogi-proshlogo-epidsezona-grippa-2018-2019-gg-i-prognoz-na-novyy-sezon-2019-2020-gg (12.02.2021)
  3. Asha K., Kumar B. Emerging influenza D virus threat: what we know so far! J. Clin. Med., 2019, vol. 8, no. 2: 192. doi: 10.3390/jcm8020192
  4. Baselga-Moreno V., Trushakova S., McNeil S., Sominina A., Nunes M.C., Draganescu A., Unal S., Koul P., Kyncl J., Zhang T., Kuatbayeva A., Ben-Salah A., Burtseva E., Puig-Barberà J., Díez-Domingo J. for the Global Influenza Hospital Surveillance Network (GIHSN). Influenza epidemiology and influenza vaccine effectiveness during the 2016–2017 season in the Global Influenza Hospital Surveillance Network (GIHSN). BMC Public Health, 2019, no. 19: 487. doi: 10.1186/s12889-019-6713-5
  5. Dong W., Chen Q., Hu Y., He D., Liu J., Yan H. Epidemiological and clinical characteristics of respiratory viral infections in children in Shanghai, China. Arch. Virol., 2016, no. 161, pp. 1907–1913. doi: 10.1007/s00705-016-2866-z
  6. Feng L., Li Z., Zhao S., Nair H., Lai S., Xu W., Li M., Wu J., Ren L., Liu W., Yuan Z., Chen Y., Wang X., Zhao Z., Zhang H., Li F., Ye X., Li S., Feikin D., Yu H., Yang W. Viral etiologies of hospitalized acute lower respiratory infection patients in China, 2009–2013. PLoS One, 2014, vol. 9, no. 6: e99419. doi: 10.1371/journal.pone.0099419
  7. Global Influenza Hospital Surveillance Network. The Global Influenza Hospital Surveillance Network (GIHSN). GIHSN, 2018. 11 p.
  8. Ju X., Fang Q., Zhang J., Xu A., Liang L., Ke C. Viral etiology of influenza-like illnesses in Huizhou, China, from 2011 to 2013. Arch. Virol., 2014, vol. 159, no. 8, pp. 2003–2010. doi: 10.1007/s00705-014-2035-1
  9. Kurskaya O., Ryabichenko T., Leonova N., Shi W., Bi H., Sharshov K., Kazachkova E., Sobolev I., Prokopyeva E., Kartseva T., Alekseev A., Shestopalov A. Viral etiology of acute respiratory infections in hospitalized children in Novosibirsk City, Russia (2013–2017). PLoS One, 2018, vol. 13, no. 9: e0200117. doi: 10.1371/journal.pone.0200117
  10. McCauley J.W., Hongo S., Kaverin N.V., Kochs G., Lamb R.A., Matrosovich M.N., Perez D.R., Palese P., Presti R.M., Rimstad E. Virus taxonomy. In: Classification and nomenclature of viruses: ninth report of the international committee on taxonomy of viruses. Ed. by King A.M.Q., Lefkowitz E., Adams M.J., Carstens E.B. San Diego: Elsevier Academic Press, 2012, pp. 749–761.
  11. Ortiz J.R., Neuzil K.M., Shay D.K., Rue T.C., Neradilek M.B., Zhou H., Seymour C.W., Hooper L.G., Cheng P.Y., Goss C.H., Cooke C.R. The burden of influenza-associated critical illness hospitalizations. Crit. Care Med., 2014, vol. 42, no. 11, pp. 2325– 2332. doi: 10.1097/ccm.0000000000000545
  12. Puig-Barberà J., Mira-Iglesias A., Burtseva E., Cowling B.J., Serhat U., Ruiz-Palacios G.M., Launay O., Kyncl J., Koul P., Siqueira M.M., Sominina A.; Global Influenza Hospital Surveillance. Network Influenza epidemiology and influenza vaccine effectiveness during the 2015–2016 season: results from the Global Influenza Hospital Surveillance Network. BMC Infect. Dis., 2019, vol. 19: 415. doi: 10.1186/s12879-019-4017-0
  13. Puig-Barberà J., Tormos A., Sominina A., Burtseva E., Launay O., Ciblak M.A., Natividad-Sancho A., Buigues-Vila A., Martínez-Úbeda S., Mahé C.; GIHSN Group. First-year results of the Global Influenza Hospital Surveillance Network: 2012– 2013 Northern hemisphere influenza season. BMC Public Health, 2014, vol. 14: 564. doi: 10.1186/1471-2458-14-564
  14. Puig-Barberà J., Tormos A., Trushakova A., Sominina A., Pisareva M., Ciblak M.A., Badur S., Yu H., Cowling B.J., Burtseva E., on behalf of the GIHSN Group. The Global Influenza Hospital Surveillance Network (GIHSN): a new platform to describe the epidemiology of severe influenza. Influenza Other Respir. Viruses, 2015, vol. 9, no. 6, pp. 277–286. doi: 10.1111/irv.12335
  15. WHO. Guidelines for pharmacological management of pandemic influenza A (H1N1) 2009 and other influenza viruses. Revised February 2010. Part I. Recommendations. WHO, 2010. 32 p.
  16. WIC, WHO CC for Reference and Research on Influenza, FCI. Report prepared for the WHO annual consultation on the composition of influenza vaccines for the Southern Hemisphere 2020. 23rd – 26th September 2019. WIC, WHO CC for Reference and Research on Influenza, FCI, 2019. 149 p.
  17. Zhou B., Lin X., Wang W., Halpin R.A., Bera J., Stockwell T.B., Barr I.G., Wentworth D.E. Universal Influenza B virus genomic amplification facilitates sequencing, diagnostics, and reverse genetics. J. Clin. Microbiol., 2014, vol. 52, no. 5, pp. 1330–1337. doi: 10.1128/jcm.03265-13

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Курская О.Г., Аношина А.В., Леонова Н.В., Симкина О.А., Комиссарова Т.В., Есикова Е.Ю., Позднякова Л.Л., Соболев И.А., Прокопьева Е.А., Мурашкина Т.А., Казачкова Е.А., Алексеев А.Ю., Даниленко Д.М., Комиссаров А.Б., Столяров К.А., Фадеев А.В., Соминина А.А., Шестопалов А.М., Шаршов К.А., 2021

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах