Способ фенотипической идентификации бактерий Acinetobacter nosocomialis
- Авторы: Сиволодский Е.П.1,2, Зуева Е.В.2
-
Учреждения:
- Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ
- НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
- Выпуск: Том 11, № 3 (2021)
- Страницы: 591-596
- Раздел: МЕТОДЫ
- Дата подачи: 28.03.2020
- Дата принятия к публикации: 24.05.2020
- Дата публикации: 23.08.2020
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/1422
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-MFP-1422
- ID: 1422
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Цель исследования — разработка способа идентификации бактерий вида Acinetobacter nosocomialis по совокупности фенотипических признаков группы Acinetobacter baumannii (Ab) с использованием признака уреазной активности. Объектами исследования были клинические штаммы группы Ab, выделенные в 2018—2019 гг. в бактериологической лаборатории Военно-медицинской академии (Санкт-Петербург), из них A. baumannii — 85, A. nosocomialis — 12, A. pittii — 10 штаммов. Еще 9 штаммов A. nosocomialis были выделены из воды реки Невы и 2 штамма A. calcoaceticus — из цианобактеральных матов. Принадлежность штаммов к группе Ab устанавливали по совокупности метаболических и физиологических признаков таксономическими тестами для данной группы. Видовая принадлежность всех штаммов была установлена методом матрично-ассоциированной лазерной десорбции/ионизации времяпролетной (MALDI-TOF) масс-спектрометрии. Уреазную активность бактерий определяли микрообъемным методом. Использовали среду с мочевиной следующего состава (г/л): Na2HPO4 — 1,1; KH2PO4 — 1,1; NaCI — 5,0; 0,4%-ный водно-щелочной раствор фенолового красного — 5 мл; мочевина — 10,0—15,0; вода дистиллированная — 1 л. Ингредиенты, кроме мочевины, растворяли в дистиллированной воде, разливали во флаконы, стерилизовали 20 мин при 121°С, затем добавляли во флаконы мочевину в расчетном количестве. Среду с мочевиной вносили по 0,1 мл в лунки планшета, затем засевали по полной петле (диаметром 2 мм) суточной агаровой культуры исследуемых и контрольных штаммов и инкубировали в аэробных условиях при 37°С. Результаты реакции на уреазу быстрой активности учитывали через 3 часа инкубации по изменению исходной окраски среды. Для выявления уреазы слабой активности реакцию учитывали через 7—24 часа. Было установлено, что у бактерий группы Ab уреазную активность имели 100% штаммов A. nosocomialis и 18,82% штаммов A. baumannii. При этом уреазу быстрой активности имели все штаммы A. nosocomialis и только один штамм A. baumannii (1,17%). Следовательно, уреаза быстрой активности имеет таксономическое значение как маркер бактерий вида A. nosocomialis, отличающий этот вид от других видов группы A. baumannii. Чувствительность и специфичность указанного способа идентификации бактерий вида A. nosocomialis относительно идентификации методом MALDI-TOF масс-спектрометрии составили 100 и 98,83% (х2 = 103,2; p < 0,0001).
Об авторах
Е. П. Сиволодский
Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова МО РФ; НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Email: es279@yandex.ru
Доктор медицинских наук, профессор кафедры микробиологии ВМА им. С.М. Кирова МО РФ; старший научный сотрудник лаборатории молекулярно-биологических технологий НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера.
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14.
РоссияЕ. В. Зуева
НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера
Автор, ответственный за переписку.
Email: elenazueva9@gmail.com
Зуева Елена Викторовна - кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера.
197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14.
Тел.: 8 (921) 382-50-07
РоссияСписок литературы
- Патент № 2712895 Российская Федерация, МПК C12Q 1/04 (2006.01), C12N 1/20 (2006.01), C12R 1/01 (2006.01). Способ идентификации бактерий Acinetobacter nosocomialis: № 2019129885; заявлено 2019.09.23: опубликовано 2020.01.31 / Сиволодский Е.П. Патентообладатель: Сиволодский Евгений Петрович. 9 с.
- Сиволодский Е.П. Пероксидводородный микрообъемный метод ОФ-теста: экспрессное определение окисления и ферментации глюкозы грамотрицательными бактериями // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1991. № 1. С. 14—17.
- Сиволодский Е.П., Кудакаев М.Т. Ускоренное определение нитратредуктазы неферментирующих грамотрицатель-ных бактерий // Лабораторное дело. 1991. № 1. С. 61—63.
- Bouvet P.J., Grimont P.A. Identification and biotyping of clinical isolates of Acinetobacter. Ann. Inst. Pasteur Microbiol., 1987, vol. 138, no. 2, pp. 569—578.
- Espinal P., Seifert H., Dijkshoorn L., Vila J., Roca I. Rapid and accurate identification of genjmic species from the Acinetobacter baumannii (Ab) group by MALDI-TOF MS. Clin. Microbiol. Infect., 2012, vol. 18, no. 11, pp. 1097—1103. doi: 10.1111/j.1469-0691.2011.03696.x
- Gerner-Smidt P., Tjernberg I., Ursing J. Reliablity of phenotypic tests for identification of Acinetobacter species. J. Clin. Microbiol, 1991, vol. 29, no. 2, pp. 277-282. doi: 10.1128/JCM.29.2.277-282.1991
- Nemec A., Krizova L., Maixnerova M., Van der Reijden T.J., Deschaght P., Passet V., Veneechoutte M., Brisse S., Dijkshoorn L. Genotypic and phenotypic characterization of the Acinetobacter calcoaceticus — Acinetobacter baumannii complex with the proposal of Acinetobacter pittii sp. nov. (formeily Acinetobacter genomic species 3) and Acinetobacter nosocomialis sp. nov. (formerly Acinetobacter genomic species 13 TU). Res. Microbiol., 2011, vol. 162, pp. 393-404. doi: 10.1016/j.resmic.2011.02.006
- Park G.N., Kang H.S., Kim H.R., Jung B.K., Kim D.H., Chang K.S. A comparison of genospecies of clinical isolates in the Acinetobacter spp. complex obtained fuom hospitalized patiens in Busan, Korea. Biomed. Sci. Letters, 2019, vol. 25, no. 1, pp. 4053. doi: 10.15616/bsl.2019.25.1.40
- Sedo O., Nemec A., Krizova L., Kacalova M., Zdrahal Z. Improvement of MALDI-TOF MS hrofilling for the differtntiation of species within the Acinetobacter calcoaceticus—Acinetobacter baumannii complex. Syst. Appl. Microbiol., 2013, vol. 36, no. 8, pp. 572-578. doi: 10.1016/j.syapm.2013.08.001
- Wang J., Ruan Z., Feng Y., Fu Y., Jiang Y., Wang H., Yu Y. Species distribution of clinical Acinetobacter isolates revealed by different identification techniques. PLoS One, 2014, vol. 9, no. 8: e104882. doi: 10.1371/journal.pone.0104882