ВЫДЕЛЕНИЕ И ОСОБЕННОСТИ ИДЕНТИФИКАЦИИ СOMAMONAS KERSTERSII ПРИ ИЗУЧЕНИИ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА ЖИТЕЛЕЙ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ И ГВИНЕЙСКОЙ РЕСПУБЛИКИ

Род Сomamonas, описанный в 1985 году, включал один вид — Сomamonas terrigena. В настоящее время род Сomamonas включает 21 вид. Способность бактерий рода Сomamonas  выживать в объектах внешней среды (пробах воды, почвы и растений), в том числе во  влажных условиях госпитальной среды и на медицинском оборудовании, позволяет считать  их условно-патогенными микроорганизмами. Цель исследования состояла в изучении  биологических свойств и чувствительности к антибиотикам штаммов Сomamonas kerstersii, выделенных из проб испражнений здоровых людей, проживающих в Санкт- Петербурге и Гвинейской Респуб лике. Работа проводилась в лаборатории кишечных  инфекций ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург.  Исследованы 1532 пробы фекалий, полученных от жителей Санкт-Петербурга и 46 проб  жителей Гвинейской Республики. Родовую и видовую идентификацию выделенных  микроорганизмов проводили, используя рутинные биохимические тесты; коммерческую  тест-систему «НЕФЕРМ тест24» (MIKROLATEST, Эрба Рус, РФ) и бактериологический  анализатор Vitek 2 Compact (BioMerieux). Трудноидентифицируемые микроорганизмы  исследовали масс-спектрометрическим методом на MALDI-TOF масс-спектрометре «Microflex  LRF». Чувствительность к антибиотикам определяли методом градиентных концентраций с  полосками M.I.C.Evaluator™ (OXOID, Великобритания) на агаре Мюллера-Хинтон (НИЦФ,  Россия). В составе микробиоты кишечника у 1532 жителей Санкт-Петербурга были выделены 2 штамма С. kerstersii (0,13%). При обследовании 46 жителей Гвинейской  Республики в 8 случаях (17,4%) были выделены С. kerstersii. Идентификация штаммов С.  kerstersii с использованием различных методов дала различные результаты: рутинные  биохимические тесты позволили отнести штаммы к группе неферментирующих  грамотрицательных бактерий; «НЕФЕРМ тест24» идентифицировал штаммы как С.  testosteroni; анализатор VITEC 2 отнес штаммы к С. testosteroni; методом масс- спектрометрии с коэффициентом совпадения 2,19–2,33 все штаммы идентифицированы как  С. kerstersii. Следует учесть, что бактерии С. kerstersii не могут быть идентифицированы  тестами, входящими в набор «НЕФЕРМ тест24» и карту GN VITEC 2, так как в базах данных  обоих методов представлена характеристика только С. testosteroni. Таксономическая база  масс-спектрометрии включает эталонные спектры пяти видов Сomamonas из 21 известных,  в том числе и С. kerstersii. Штаммы, выделенные от жителей Гвинейской Республики,  характеризовались нечувствительностью хотя бы к одному тестируемому антибиотику:  ципрофлоксацину (4 штамма), тетрациклину (5 штаммов) и триметоприм/сульфаметоксазолу (5 штаммов), причем практически все штаммы характеризовались одновременно  нечувствительностью к нескольким АМП: ципрофлоксацину и триметоприм/сульфаметоксазолу (2 штамма), тетрациклину и триметоприм/сульфаметоксазолу (2  штамма), ципрофлоксацину и тетрациклину (1 штамм). Один штамм был нечувствителен  одновременно к ципрофлоксацину, тетрациклину и триметоприм/сульфаметоксазолу.