MODELING RESPIRATORY VIRAL INFECTIONS ACTUAL IN THE FIRST QUARTER OF THE XXI CENTURY: FROM PRIMARY EPITHELIAL CULTURES TO ORGANOIDS



Cite item

Full Text

Abstract

Abstract

Respiratory viral infections pose a serious public health issue resulting in high morbidity and mortality, as well as profound socioeconomic losses. Therefore, it accounts for a need to research respiratory viral infections immunopathogenesis, development of effective vaccines and antiviral drugs, as well as measures to monitor viral infections.

The aim of the review is to analyze current methods for modeling respiratory viral infections ex vivo.

Material and methods. There were analyzed current data regarding development and application of models based on primary epithelial cells (PECC) derived from various anatomical sites of the human respiratory tract (RT) and 3D cell cultures. For this, there were assessed 157 publications retrieved from the main databases (Web of Science, PubMed, Scopus, Elsevier, Google Scholar and RSCI until January 2025) by querying the keywords: respiratory viruses; primary airway epithelium cultures; organoids; immunopathogenesis; tropism; cellular receptors; cytokines.

Results and Discussion. The analysis showed that models based on PECC are widely used in virological studies of respiratory viral infections, which, however, is coupled to certain disadvantages. More advanced are RT 3D models (organoids or mini-organs, spheroids, "organs on a chip"), which allow not only to reproduce infectious processes, but also to study immunopathogenesis taking into account the immunometabolic and immunoneurological status. Using RT PECs and 3D models, the properties of a number of respiratory viruses actual in the first quarter of the XXI century (influenza and parainfluenza, pneumoviruses, coronaviruses, rhinoviruses, bocaviruses, adenoviruses) such as tissue tropism, receptor interactions and innate immune response were assessed. Moreover, we also present information on promising models for respiratory viral infections that reproduce essential aspects of RT physiology.

Conclusion. The primary biotechnological aim for virological studies of respiratory viral infections is to generate a multiparameter, reproducible and cost-effective RT modeling system that imitates its morphological and functional structure.

About the authors

Tatyana Kuznetsova

G.Р. Somov Institute of Epidemiology and Microbiology, Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing, Vladivostok, Russian Federation

Email: takuznets@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-4315-6959

MD, Principal Researcher, Laboratory of Immunobiological Preparates G.P. Somov Institute of Epidemiology and Microbiology, Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing

Россия, 690087, Vladivostok, Selskya, 1

Anastasia Anatolievna Mikhalko

G.Р. Somov Institute of Epidemiology and Microbiology, Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing, Vladivostok, Russian Federation;
Far Eastern Federal University, School of Medicine and Life Sciences, Vladivostok, Russian Federation

Email: nastya.mikhalko@inbox.ru
ORCID iD: 0000-0001-8939-3696

Technician, Laboratory of Respiratory Infections, G.P. Somov Institute of Epidemiology and Microbiology, Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing, Vladivostok, Russia; Student of the Department of Biotechnology, School of Medicine and Life Sciences of the Far Eastern Federal University

Россия, 690087, Vladivostok, Selskya, 1

Egor Mikhailovich Shchelkanov

State University of Education, Moscow region, Mytishchi, Russian Federation

Email: egorshchelkanov@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-0202-958X

student of the Faculty of Natural Sciences, State University of Education

Россия, Moscow region, Mytishchi

Sergey Petrovich Kryzhanovsky

Medical Association of Far Eastern Branch of Russian Academy of Sciences, Vladivostok, Russian Federation

Email: priemmodvoran@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1981-1079

MD, Corresponding Member of the Russian Academy of Sciences, Deputy Chairman of the Far Eastern Branch of the Russian Academy of Sciences

Россия, Vladivostok

Mikhail Yurievich Shchelkanov

G.Р. Somov Institute of Epidemiology and Microbiology, Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing, Vladivostok, Russian Federation;
Far Eastern Federal University, School of Medicine and Life Sciences, Vladivostok, Russian Federation

Author for correspondence.
Email: adorob@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-8610-7623

D. Sci. (Biology), Director of G.P. Somov Institute of Epidemiology and Microbiology, Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing; Head of the Department of Epidemiology, Microbiology and Parasitology of the School of Medicine and Life Sciences of the Far Eastern Federal University

Россия, 690087, Vladivostok, Selskya, 1

References

  1. Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Углева С.В., Дубоделов Д.В., Кузин С.Н., Яцышина С.Б., Хафизов К.Ф., Петров В.В., Черкашина А.С., Гасанов Г.А., Сванадзе С.Х. COVID-19 в России: эпидемиология и молекулярно-генетический мониторинг // Вестник Российской академии медицинских наук. 2022. Т. 77, № 4. С. 254-260. Akimkin V.G., Semenenko T.A., Ugleva S.V., Dubodelov D.V., Kuzin S.N., Yacyshina S.B., Khafizov K.F., Petrov V.V., Cherkashina A.S., Gasanov G.A., Svanadze N.K. COVID-19 in Russia: epidemiology and molecular genetic monitoring. Annals of the Russian Academy of Medical Sciences, 2022, vol.77, no 4, pp. 254-260. (in Russ.) URL: 10.15690/vramn2121' target='_blank'>https://doi: 10.15690/vramn2121
  2. Александров В.Н., Камилова Т.А., Фирсанов Д.В., Калюжная Л.И., Кривенцов А.В., Кондратенко А.А., Фигуркина М.А. Тканевая инженерия трахеи // Вестник Российской военно-медицинской академии. 2016. № 3. С. 212-219. Alexandrov V.N., Kamilova T.A., Firsanov D.V., Kalyuzhnaya L.I., Kriventzov A.V., Kondratenko A.A., Figurkina M.A. Trachea tissue engineering. Bulletin of the Russian Military Medical Academy. 2016, no 3, pp. 212-219. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/yjmfzj
  3. Анатомия человека / Ред.: М.Р. Сапин. М.: Медицина, 1997. 544 с. Human anatomy / Ed.: M.R. Sapin. M.: Medicine, 1997, 544 p. (in Russ.)
  4. Бурцева Е.И., Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Прилипов А.Г., Альховский С.В., Лаврищева В.В., Шевченко Е.С., Федякина И.Т., Иванова В.Т., Белякова Н.В., Прошина Е.С., Абрамов Д.Д., Трушакова С.В., Меркулова Л.Н., Вартанян Р.В., Кистенева Л.Б., Самохвалов Е.И., Оскерко Т.А., Феодоритова Е.Л., Силуянова Э.В., Мукашева Е.А., Беляев А.Л., Маликов В.Е., Малышев Н.А. Особенности социркуляции вирусов гриппа в постпандемический период 2010-2011 гг. по итогам деятельности Центра экологии и эпидемиологии гриппа ФГУ «НИИ вирусологии им. Д.И. Ивановского» Минздравсоцразвития России // Вопросы вирусологии. 2012. Т. 57. № 1.С. 20-28. Burtseva E.I., Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Kolobukhina L.V., Prilipov A.G., Alkhovsky S.V., Lavrishcheva V.V., Shevchenko E.S., Fedyakina I.T., Ivanova V.T., Belyakova N.V., Proshina E.S., Abramov D.D., Trushakova S.V., Merkulova L.N., Vartanyan R.V., Kisteneva L.B., Samokhvalov E.I., Oskerko T.A., Feodoritova E.L., Siluyanova E.V., Mukasheva E.A., Belyaev A.L., Malikov V.E., Malyshev N.A. The specific features of cocirculation of influenza viruses in 2010–2011 postpandemic period according to the results of activities of the D.I. Ivanovsky Research Institute of Virology, Ministry of Health and Social Development of Russia. Voprosy virusologii = Problems of Virology, 2012. vol. 57, no 1, pp. 20-28. (in Russ.)
  5. URL: https://api.semanticscholar.org/
  6. Геппе Н.А., Озерская И.В., Малявина У.С. Цилиарный эпителий при респираторных вирусных инфекциях у детей. Влияние лекарственных препаратов // Русский медицинский журнал. 2012. Т. 20., № 24. С. 1222-1227.
  7. Geppe N.A., Ozerskaya I.V., Malyavina U.S. Ciliary epithelium in respiratory viral infections in children. The effect of drugs. Russian Medical Journal, 2012, vol. 20, no 24, pp. 1222-1227. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/pnbuel
  8. Ерофеева М.К., Стукова М.А., Шахланская Е.В., Бузицкая Ж.В., Максакова В.Л., Крайнова Т.И., Писарева М.М., Попов А.Б., Позднякова М.Г., Лиознов Д.А. Оценка профилактической эффективности гриппозных вакцин // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2021. Т. 20. № 5. С. 52-60. Yerofeeva M.K., Stukova M.A., Shakhlanskaya E.V., Buzitskaya Zh.V., Maksakova V.L., Krainova T.I., Pisareva M.M., Popov A.B., Pozdnyakova M.G., Lioznov D.A. Evaluation of the preventive effectiveness of influenza vaccines. Epidemiology and Vaccine Prevention, 2021, vol. 20, no 5, pp. 52-60. (in Russ) URL: http:10.31631/2073-3046-2021-20-5-52-60-52-60
  9. Запорожец Т.С., Беседнова Н.Н., Калинин А.В., Сомова Л.М., Щелканов М.Ю. 80 лет на страже биологической безопасности у восточных рубежей России // Здоровье населения и среда обитания. 2021. № 5. С. 5-15. Zaporozhets T.S., Besednova N.N., Kalinin A.V., Somova L.M., Shchelkanov M.Yu. 80 years on guard of biological safety at the eastern borders of Russia. Public Health and Life Environment, 2021, no 5, pp. 5-15. (in Russ) doi: 10.35627/2219-5238/2021-338-5-5-15
  10. Иванова В.Т., Курочкина Я.Е., Бурцева Е.И., Оскерко Т.А., Трушакова С.В., Шевченко Е.С., Черкасов Е.Г., Щелканов М.Ю., Матюшина Р.О., Колобухина Л.В., Феодоритова Е.Л., Слепушкин А.Н. Распространение и биологические свойства эпидемических штаммов вирусов гриппа А и В, циркулировавших в сезоне 2006–2007 гг. в России // Вопросы вирусологии. 2008. Т. 53. № 5. С. 19-23. Ivanova V.T., Kurochkina Ya.E., Burtseva E.I., Oskerko T.A., Trushakova S.V., Shevchenko E.S., Cherkasov E.G., Shchelkanov M.Yu., Matyushina R.O., Kolobukhina L.V., Feodoritova Ye.L., Slepushkin A.N. The spread and biological properties of epidemic influenza viruses A and B strains circulating in the 2006–2007 season in Russia. Voprosy Virusologii. = Problems of Virology, 2008, vol. 53, no 5. pp. 19–23. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/kaxfpl
  11. Инновации в диагностике, лечении и профилактике инфекционных заболеваний / Ред.: Д.А. Лиознов, Л.М. Цыбалова. – М.: МИА, 2022. 152 с. Innovations in the diagnosis, treatment and prevention of infectious diseases / Ed.: D.A. Lioznov, L.M. Tsybalova. – M.: MIA, 2022, 152 p. (in Russ.)
  12. Инфекционные болезни: национальное руководство / Ред.: Н.Д. Ющук, Ю.Я. Венгеров. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2021, 1104 с. Infectious diseases: National guidelines / Ed.: N.D. Yushchuk, Yu.Ya. Vengerov. – Moscow: GEOTAR-Media, 2021, 1104 p. (in Russ.) doi: 10.33029/9704-6122-8-INB-2021-1-1104
  13. Колобухина Л.В., Меркулова Л.Н., Малышев Н.А., Кружкова И.С., Щелканов М.Ю., Бурцева Е.И., Исаева Е.И., Лаврищева В.В., Базарова М.В., Арсеньева Т.В., Амброси О.Е., Суточникова О.А., Чучалин А.Г., Львов Д.К. Стратегия ранней противовирусной терапии при гриппе как профилактика тяжелых осложнений // Пульмонология. Приложение. 2010. № 1. С. 9-14. Kolobukhina L.V., Merkulova L.N., Malyshev N.A., Kruzhkova I.S., Shchelkanov M.Yu., Burtseva E.I., Isaeva E.I., Lavrishcheva V.V., Bazarova M.V., Arsenieva T.V., Ambrosi O.E., Sutochnikova O.A., Chuchalin A.G., Lvov D.K. A strategy of early antiviral therapy of influenza could prevent severe complications. Pulmonology (Moscow). Supplement. 2010, no 1, pp. 9-14. (in Russ.)
  14. URL: https://www.elibrary.ru/ztcist
  15. Колобухина Л.В., Щелканов М.Ю.Вирусные инфекции дыхательных путей // В кн.: Пульмонология. Национальное руководство / Ред.: академик РАН А.Г. Чучалин. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2013. Глава 6. С. 143-170. Kolobukhina L.V., Shchelkanov M.Yu. Virus infections of respiratory tract. In: Pulmonology. National guidance / Ed.: A.G. Chuchalin. Moscow: GEOTAR-Media, 2013, Chapter 6, pp. 143-170. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/yjejlh
  16. Краснослободцев К.Г., Львов Д.К., Альховский С.В., Бурцева Е.И., Федякина И.Т., Колобухина Л.В., Кириллова Е.С., Трушакова С.В., Оскерко Т.А., Щелканов М.Ю., Дерябин П.Г. Полимофизм аминокислот в позиции 222 рецепторсвязывающего сайта гемагглютинина вируса гриппа А (H1N1) pdm09 у пациентов с летальной вирусной пневмонией в 2012-2014 гг. // Вопросы вирусологии. 2016. Т. 61. № 4. С. 166-171. Krasnoslobodtsev K.G., Lvov D.K., Alkhovsky S.V., Burtseva E.I., Fedyakina I.T., Kolobukhina L.V., Kirillova E.S., Trushakova S.V., Oskerko T.A., Shchelkanov M.Yu., Deryabin P.G. Amino acid polymorphism at residue 222 of the receptor-binding site of the hemagglutinin of the pandemic influenza A(H1N1)pdm09 from patients with lethal virus pneumonia in 2012-2014. Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2016, vol. 61, vol. 4, pp. 166–171. (in Russ.) doi: 10.18821/0507-4088-2016-61-4-166-171
  17. Кузнецова Т.А., Алиев М.Р., Михалко А.А., Щелканов М.Ю. 3D клеточные культуры: перспективы использования в вирусологии // Инфекция и иммунитет. 2024. Т. 14. № 6. С. 1045-1062. Kuznetsova T.A., Aliev M.R., Mikhalko A.А., Shchelkanov M.Yu. 3D cell cultures: prospects for use in virology. Russian Journal of Infection and Immunity. = Infektsiya i immunitet, 2024, vol. 14, no 6, pp. 1045-1062. (in Russ.) doi: 10.15789/2220-7619-DCC-17656
  18. Кузнецова Т.А., Беседнова Н.Н., Алиев М.Р., Щелканов М.Ю. Клеточные культуры в вирусологии: от прошлого к будущему // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024. Т. 101. № 1. С. 143-153. Kuznetsova T.A., Besednova N.N., Aliev M.R., Shchelkanov M.Yu. The cell cultures in virology: from the past to the future. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2024, vol. 101, no 1, pp. 143-153. (in Russ.) doi: 10.36233/0372-9311-421
  19. Лаврищева В.В., Бурцева Е.И., Хомяков Ю.Н., Шевченко Е.С., Оскерко Т.А., Иванова С.М., Данилевская М.М., Щелканов М.Ю., Федякина И.Т., Альховский С.В., Прилипов А.Г., Журавлёва М.В., Колобухина Л.В., Малышев Н.А., Львов Д.К. Этиология летальных пневмоний в период развития пандемии, вызванной вирусом гриппа А (H1N1) pdm09 в России // Вопросы вирусологии. 2013. Т. 58. № 3. С. 17-21. Lavrischeva V.V., Burtseva E.I., Khomyakov Yu.N., Shevchenko E.S., Oskerko T.A., Ivanova S.M., Danilevskaya M.M., Shchelkanov M.Yu., Fedyakina I.T., Alkhovsky S.V., Prilipov A.G., Zhuravleva M.V., Kolobukhina L.V., Malyshev N.A., Lvov D.K. Etiology of fatal pneumonia cause by influenza A (H1N1) pdm09 virus during the pandemic in Russia. Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2013, vol. 58, no 3, pp. 17–21. (in Russ.) URL: https://elibrary.ru/pzxttx
  20. Львов Д.К., Бурцева Е.И., Щелканов М.Ю., Прилипов А.Г., Колобухина Л.В., Малышев Н.А., Базарова М.В., Меркулова Л.Н., Дерябин П.Г., Кузьмичев А.Г., Федякина И.Т., Гребенникова Т.В., Усачев Е.В., Садыкова Г.К., Шевченко Е.С., Трушакова С.В., Лаврищева В.В., Альховский С.В., Самохвалов Е.И., Белякова Н.В., Иванова В.Т., Оскерко Т.А., Латышев О.Е., Беляев А.М., Беляев А.Л., Феодоритова Е.Л. Распространение нового пандемического вируса гриппа A (H1N1) в России // Вопросы вирусологии. 2010. Т. 55. № 3. С. 4-9.
  21. Lvov D.K., Burtseva E.I., Shchelkanov M.Yu., Prilipov A.G., Kolobukhina L.V., Malyshev N.A., Bazarova M.V., Merkulova L.N., Deryabin P.G., Kuzmichev A.G., Fedyakina I.T., Grebennikova T.V., Usachev E.V., Sadykova G.K., Shevchenko E.S., Trushakova S.V., Lavrishcheva V.V., Alkhovsky S.V., Samokhvalov E.I., Belyakova N.V., Ivanova V.T., Oskerko T.A., Latyshev O.E., Belyaev A.M., Beliaev A.L., Feodoritova E.L. Spread of new pandemic influenza A (H1N1) virus in Russia. Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2010, vol. 55, no 3, pp. 4-9. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/muekip
  22. Львов Д.К., Малышев Н.А., Колобухина Л.В., Меркулова Л.Н., Бурцева Е.И., Щелканов М.Ю., Базарова М.В. Грипп, вызванный новым пандемическим вирусом А / H1N1 swl: клиника, диагностика, лечение. Методические рекомендации. – М.: Департамент здравоохранения г. Москвы, 2009. 18 с. Lvov D.K., Malyshev N.A., Kolobukhina L.V., Merkulova L.N., Burtseva E.I., Shchelkanov M.Yu., Bazarova M.V. Influenza provoked by new pandemic virus A / H1N1 swl: clinics, diagnostics, treatment. Methodological recommendations. Moscow: Department of Healthcare of Moscow, 2009, 18 p. (in Russ.) URL: https://elibrary.ru/xygiud
  23. Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Бовин Н.В., Малышев Н.А., Чучалин А.Г., Колобухина Л.В., Прилипов А.Г., Богданова В.С., Альховский С.В., Самохвалов Е.И., Федякина И.Т., Бурцева Е.И., Дерябин П.Г., Журавлёва М.М., Шевченко Е.С., Лаврищева В.В., Львов Д.Н., Прошина Е.С., Стариков Н.С., Морозова Т.Н., Базарова М.В., Григорьева Т.А., Кириллов И.М., Шидловская Е.В., Келли Е.И., Маликов В.Е., Яшкулов К.Б., Ананьев В.Ю., Баранов Н.И., Гореликов В.Н., Цой О.В., Гарбуз Ю.А., Резник В.И., Иванов Л.И., Феделеш И.Ю., Пономаренко Р.А., Сахарова Е.А., Лебедев Г.Б., Маслов А.И. Корреляция между рецепторной специфичностью штаммов пандемического вируса гриппа А (H1N1) pdm09, изолированных в 2009 2011 гг., структурой рецептор-связывающего сайта и вероятностью развития летальной первичной вирусной пневмонии // Вопросы вирусологии. 2012. Т. 57. № 1. С. 14-20.
  24. Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Bovin N.V., Malyshev N.A., Chuchalin A.G., Kolobukhina L.V., Prilipov A.G., Bogdanova V.S., Alkhovsky S.V., Samokhvalov E.I., Fedyakina I.T., Burtseva E.I., Deryabin P.G., Zhuravleva M.M., Shevchenko E.S., Lavrishcheva V.V., Lvov D.N., Proshina E.S., Starikov N.S., Morozova T.N., Bazarova M.V., Grigorieva T.A.., Kirillov I.M., Shidlovskaya E.V., Kelly E.I., Malikov V.E., Yashkulov K.B., Ananiev V.Yu., Baranov N.I., Gorelikov V.N., Tsoi O.V., Garbuz Yu.A., Reznik V.I., Ivanov L.I., Fedelesh I.Yu., Ponomarenko R.A., Sakharova E.A., Lebedev G.B., Maslov A.I. Correlation between the receptor specificities of pandemic influenza A (H1N1) pdm09 virus strains isolated in 2009–2011 and the structure of the receptor-binding site and the probabilities of fatal primary virus pneumonia.Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2012, vol. 57, no 1, pp. 14-20. (in Russ.)
  25. URL: https://www.elibrary.ru/oximwz
  26. Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Дерябин П.Г., Гребенникова Т.В., Прилипов А.Г., Непоклонов Е.А., Онищенко Г.Г., Власов Н.А., Алипер Т.И., Забережный А.Д., Киреев Д.Е., Крашенинников О.П., Кирюхин С.Т., Бурцева Е.И., Слепушкин А.Н. Изоляция штаммов вируса гриппа А/H5N1 от домашних и диких птиц в период эпизоотии в Западной Сибири (июль 2005 г.) и их депонирование в Государственную Коллекцию вирусов РФ (08 августа 2005 г.) // Вопросы вирусологии. 2006. Т. 51. № 1. С. 11-14. Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Deryabin P.G., Grebennikova T.V., Prilipov A.G., Nepoklonov E.A., Onishchenko G.G., Vlasov N.A., Aliper T.I., Zaberezhny A.D., Kireev D.E., Krascheninnikov O.P., Kiryukhin S.T., Burtceva E.I., Slepuschkin A.N. Isolation of influenza А/H5N1 virus strains from poultry and wild birds during epizootic outbreak in Western Siberia (July 2005) and their incorporation in Russian State Collection of viruses (August 08, 2005). Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2006, vol. 51, no 1, pp. 11-14. (in Russ.) URL: https://elibrary.ru/hsuyel
  27. Львов Д.К., Щелканов М.Ю., Прилипов А.Г., Дерябин П.Г., Аканина Д.С., Галкина И.В., Гребенникова Т.В., Федякина И.Т., Альховский С.В., Усачёва О.В., Киреев Д.Е., Славский А.А., Стариков Н.С., Петренко М.С., Михайлова В.В., Усачёв Е.В., Садыкова Г.К., Морозова Т.Н., Самохвалов Е.И., Юдин А.Н., Виткова О.Н., Щербакова Л.О., Забережный А.Д., Калмыков М.В., Громашевский В.Л., Алипер Т.И., Яковлев С.С., Власов Н.А., Непоклонов Е.А., Suarez D. Молекулярно-генетическая характеристика штамма A/chicken/Moscow/2/2007 (H5N1) из очага эпизоотии высокопатогенного гриппа А среди сельскохозяйственных птиц в Подмосковье (февраль 2007 г.) // Вопросы вирусологии. 2007. Т. 52. № 6. С. 40-47.
  28. Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Prilipov A.G., Deryabin P.G., Akanina D.S., Galkina I.V., Grebennikova T.V., Fedyakina I.T., Alkhovsky S.V., Usacheva O.V., Kireev D.E., Slavsky A.A., Starikov N.S., Petrenko M.S., Mikhailova V.V., Usachev E.V., Sadykova G.K., Morozova T.N., Samokhvalov E.I., Yudin A.N., Vitkova O.N., Shcherbakova L.O., Zaberezhny A.D., Kalmykov M.V., Gromashevsky V.L., Aliper T.I., Yakovlev S.S., Vlasov N.A., Nepoklonov E.A., Suarez D. Molecular genetic characteristics of the strain A/chicken/Moscow/2/2007 (H5N1) strain from a epizootic focus of highly pathogenic influenza A among agricultural birds in the near-Moscow region (February 2007). Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2007, vol. 52, no 6, pp. 40-47. (in Russ.) URL: https://elibrary.ru/icdgdr
  29. Львов Д.К., Ямникова С.С., Федякина И.Т., Аристова В.А., Львов Д.Н., Ломакина Н.Ф., Петрова Е.С., Злобин В.И., Хаснатинов М.А., Чепургина Е.А., Ковтунов А.И., Джаркенов А.Ф., Санков М.Н., Леонова Г.Н., Маслов В.А., Щелканов М.Ю., Непоклонов Е.А., Алипер Т.И. Экология и эволюция вирусов гриппа в России (1979-2002 гг.) // Вопросы вирусологии. 2004. Т. 49. № 3. С. 17-24. Lvov D.K., Yamnikova S.S., Fedyakina I.T., Aristova V.A., Lvov D.N., Lomakina N.F., Petrova E.S., Zlobin V.I., Khasnatinov M.A., Chepurgina E.A., Kovtunov A.I., Dzharkenov A.F., Sankov M.N., Leonova G.N., Maslov D.V., Shchelkanov M.Yu., Nepoklonov E.A., Aliper T.I. Ecology and evolution of influenza viruses in Russia (1979-2002). Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2004, vol. 49, no 3, pp. 17–24. (in Russ.)
  30. URL: https://www.elibrary.ru/oiwqjz
  31. Медицинская микробиология, вирусология и иммунология / Ред.: В.В. Зверев, М.Н. Бойченко.  М.: ГЭОТАР-Медиа, 2010. 448 с. Medical microbiology, virology and immunology / Eds.: V.V. Zverev, M.N. Boychenko. Moscow: GEOTAR-Media, 2010, 448 p. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/hbxxgx
  32. Никифоров В.В., Колобухина Л.В., Сметанина С.В., Мазанкова Л.Н., Плавунов Н.Ф., Щелканов М.Ю., Суранова Т.Г., Шахмарданов М.З., Бургасова О.А., Кардонова Е.В., Базарова М.В., Антипят Н.А., Серова М.А., Орлова Н.В., Забозлаев Ф.Г., Кружкова И.С., Кадышев В.А. Новая коронавирусная инфекция (COVID-19): этиология, эпидемиология, клиника, диагностика, лечение и профилактика. Учебно-методическое пособие. М.: Департамент здравоохранения города Москвы, 2020. 71 с. Nikiforov V.V., Kolobukhina L.V., Smetanina S.V., Mazankova L.N., Plavunov N.F., Shchelkanov M.Yu., Suranova T.G., Shakhmardanov M.Z., Burgasova O.A., Kardonova E.V., Bazarova M.V., Antipyat N.A., Serova M.A., Orlova N.V., Zabozlaev F.G., Kruzhkova I.S., Kadyshev V.A. Novel coronavirus infection (COVID-19): etiology,epidemiology, clinics, diagnostics, treatment, and prophylaxis.Educational and methodological guide. Moscow: Department of Public Health of Moscow City, 2020, 71 p. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/hgqiyk
  33. Петрова П.А., Коновалова Н.И., Бояринцева А.Ю., Даниленко Д.М., Васильева А.Д., Шелепанова Т.Н., Прокопец А.В., Еропкин М.Ю. Этиологическая характеристика эпидемий гриппа на территории России в период пандемии COVID-19 в 2020-2023 гг. // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2024. Т. 23. № 3. С. 88-97. Petrova P.A., Konovalova N.I., Boyarintseva A.Yu., Danilenko D.M., Vasilyeva A.D., Shelepanova T.N., Prokopets A.V., Eropkin M.Yu. Etiological characteristics of influenza epidemics in Russia during the COVID-19 pandemic in 2020-2023. Epidemiology and Vaccine Prevention, 2024, vol. 23, no 3, pp. 88-97. (in Russ.) doi: 10.31631/2073-3046-2024-23-3-88-97
  34. Попова А.Ю., Щелканов М.Ю., Крылова Н.В., Белик А.А., Семейкина Л.М., Запорожец Т.С., Смоленский В.Ю., Персиянова Е.В., Просянникова М.Н., Белов Ю.А., Иунихина О.В., Потт А.Б., Хомичук Т.Ф., Симакова А.И., Абрамова С.А., Романова О.Б., Детковская Т.Н., Крыжановский С.П., Беседнова Н.Н. Генотипический портрет SARS-CoV-2 на территории Приморского края в период пандемии COVID-19 // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024. Т. 101, № 1. pp. 19-35. Popova A.Yu., Shchelkanov M.Yu., Krylova N.V., Belik A.A., Semeikina L.M., Zaporozhets T.S., Smolenskiy V.Yu., Persianova E.V., Prosyannikova M.N., Belov Yu.A., Iunikhina O.V., Pott A.B., Khomichuk T.F., Simakova A.I., Abramova S.A., Romanova O.B., Detkovskaya T.N., Kryzhanovskiy S.P., Besednova N.N. Genotypic portrait of SARS-CoV-2 in Primorsky Krai during the COVID-19 pandemic. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2024, vol. 101, no 1, pp. 19-35. (in Russ.) doi: 10.36233/0372-9311-497
  35. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных / Ред.: академик РАН Д.К. Львов. – М.: МИА, 2013. 1200 с. Handbook of Virology. Viruses and viral infections of humans and animals / Ed.: D.K. Lvov. – Moscow: MIA, 2013, 1200 p. (in Russ.) URL: https://elibrary.ru/tlzmhf
  36. Свистушкин В.М., Старостина С.В., Свистушкин М.В., Побиванцева А.А., Архипов М.В. Возможности регенеративной медицины в оториноларингологии // Consilium Medicum. – 2019. Т. 21., № 11. С. 15-19. Svistushkin V.M., Starostina S.V., Svistushkin M.V., Pobivantseva A.A., Arkhipov M.V. Possibilities of regenerative medicine in otorhinolaryngology. Consilium Medicum, 2019. vol. 21, no 11, pp. 15-19. (in Russ.) doi: 10.26442/20751753.2019.11.190641
  37. Федякина И.Т., Щелканов М.Ю., Дерябин П.Г., Ленёва И.А., Гудова Н.В., Кондратьева Т.В., Львов Д.К. Изучение чувствительности пандемических вирусов гриппа А H1N1 и высоковирулентных вирусов гриппа птиц А (H5N1) к противогриппозным химиопрепаратам // Антибиотики и химиотерапия. 2011. Т. 56. № (3-4). С. 3-9. Fedyakina I.T., Shchelkanov M.Yu., Deryabin P.G., Leneva I.A., Gudova N.V., Kondratyeva T.V., Lvov D.K. Susceptibility of pandemic influenza virus A 2009 H1N1 and highly pathogenic avian influenza virus A H5N1 to anti-influenza agents in cell culture. Antibiotics and Chemotherapy, 2011, vol. 56, no 3-4, pp. 3-9. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/rxlpzx
  38. Хайманова Ю.В., Косяков С.Я. Морфологические и функциональные особенности слизистой оболочки верхних дыхательных путей и среднего уха и способы их изучения // Вестник оториноларингологии. 2012. Т. 77. № 3. С. 104-109. Khaimanova Yu.V., Kosiakov S.Ya. Specific morphological and functional features of the mucous membrane in the upper respiratory tract and the middle ear and the methods for their study. Russian Bulletin of Otorhinolaryngology, 2012, vol. 77, no 3, pp. 104-109. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/teujnt
  39. Целуйко С.С., Кушнарев В.А. 3D биопечать на службе дыхательной системы (обзор литературы) // Бюллетень физиологии и патологии дыхания. 2016. № 61. – С. 128-134. Tseluyko S.S., Kushnarev V.A. 3D bioprinting in the service of the respiratory system (review). Bulletin of Physiology and Pathology of Respiration, 2016, no 61, pp. 128-134. (in Russ.) doi: 10.12737/21464
  40. Чучалин А.Г. Тяжёлый острый респираторный синдром // Терапевтический архив. 2004. Т. 76. № 3. С. 5-11. Chuchalin A.G. Severe acute respiratory syndrome. Therapeutic Archive, 2004, vol. 76, no 3, pp. 5-11. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/ojztgl
  41. Шестопалов А.М., Кононова Ю.В., Гаджиев А.А., Гуляева М.А., Васфи М.М., Алексеев А.Ю., Джамалутдинов Д.М., Щелканов М.Ю. Биоразнообразие и эпидемический потенциал коронавирусов (Nidovirales: Coronaviridae) рукокрылых // Юг России: экология, развитие. 2020. Т. 15. № 2. С. 17-34. Shestopalov A.M., Kononova Yu.V., Gadzhiev A.A., Gulyaeva M.A., Vasfi M.M., Alekseev A.Yu., Jamalutdinov J.M., Shchelkanov M.Yu. Biodiversity and epidemic potential of chiropteran coronaviruses (Nidovirales: Coronaviridae). South of Russia: ecology, development, 2020, vol. 15, no 2, pp. 17-34 (in Russ.) doi: 10.18470/1992-1098-2020-2-17-34
  42. Щеглов Б.О., Галкина И.В., Лембиков А.О., Щелканов Е.М., Баранчугов И.А., Щеглова С.Н., Щелканов М.Ю. Риноларингологические симуляторы на основе 3D-печати: новые возможности профессиональной подготовки // Якутский медицинский журнал. 2020. №3. C. 60-63. Shcheglov B.O., Galkina I.V., Lembikov A.O., Shchelkanov E.M., Baranchugov I.A., Shcheglova S.N., Shchelkanov M.Yu. Rhinolaryngological simulators based on 3D printing open up new opportunities for professional training. Yakut Medical Journal, 2020, no 3, pp. 58-60. (in Russ.) doi: 10.25789/YMJ.2020.71.16
  43. Щеглов Б.О., Галкина И.В., Щеглова С.Н., Щелканов М.Ю.Эффективность внедрения лаборатории 3D-моделирования в лечебно-диагностических учреждениях // Якутский медицинский журнал. 2019. №3. C. 109-111. Shcheglov B.O., Galkina I.V., Shcheglova S.N., Shchelkanov M.Yu. Effectiveness of 3D modelling laboratory implementation into therapeutic and diagnostic medical institutions. Yakut medical journal, 2019, no 3, pp. 102-104. (in Russ.) doi: 10.25789/YMJ.2019.67.30
  44. Щеглов Б.О., Дунаева М.Н., Баранчугов И.А., Лембиков А.О., Щелканов Е.М., Щеглова С.Н., Галкина И.В., Щелканов М.Ю. Макет дыхательных путей человека. Патент Российской Федерации на изобретение RU 2740727 C1 по заявке 2020122209 с приоритетом от 06.07.2020; дата государственной регистрации: 20.01.2021. 18 с. Shcheglov B.O., Dunaeva M.N., Baranchugov I.A., Lembikov A.O., Shchelkanov E.M., Shcheglova S.N., Galkina I.V., Shchelkanov M.Yu. Model of human respiratory tract. Patent of Russian Federation for invention RU 2740727 C1 on application 2020122209 with priority from 06.07.2020; date of state registration: 20.01.2021, 18 p. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/HMLSZK
  45. Щеглов Б.О., Семейкина Л.М., Щелканов Е.М., Галкина И.В., Щеглова С.Н., Щелканов М.Ю. Программа для прогнозирования эпидемической динамики COVID-19. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ в Российской Федерации № 2022611150; дата государственной регистрации: 20.01.2022. Shcheglov B.O., Semeykina L.M., Shchelkanov E.M., Galkina I.V., Shcheglova S.N., Shchelkanov M.Yu. Program for predicting epidemic dynamics COVID-19. Certificate of state registration of a computer program in the Russian Federation No. 2022611150. Date of state registration: 20.01.2022. (in Russ.)
  46. URL: https://elibrary.ru/zmxdxm
  47. Щелканов М.Ю. Этиология COVID-19 // В кн.: COVID-19: от этиологии до вакцинопрофилактики. Руководство для врачей. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2023. С. 11-53. Shchelkanov M.Yu. Etiology of COVID-19. In: COVID-19: from etiology to vaccination. A guide for doctors. – Moscow: GEOTAR-Media, 2023, pp. 11-53. (in Russ.) doi: 10.33029/9704-7967-4-COV-2023-1-288
  48. Щелканов М.Ю., Ананьев В.Ю., Кузнецов В.В., Шуматов В.Б. Ближневосточный респираторный синдром: когда вспыхнет тлеющий очаг? // Тихоокеанский медицинский журнал. 2015. № 2. С. 94-98. [Shchelkanov M.Yu., Ananiev V.Yu., Kuznetsov V.V., Shumatov V.B. Middle East respiratory syndrome: when will smouldering focus outbreak? Pacific Medical Journal, 2015, no 2, pp. 94-98. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/ulfnff
  49. Щелканов М.Ю., Ананьев В.Ю., Кузнецов В.В., Шуматов В.Б. Эпидемическая вспышка Ближневосточного респираторного синдрома в Республике Корея (май-июль 2015 г.): причины, динамика, выводы // Тихоокеанский медицинский журнал. 2015. № 3. С. 89-93. Shchelkanov M.Yu., Ananiev V.Yu., Kuznetsov V.V., Shumatov V.B. Epidemic outbreak of Middle East respiratory syndrome in the Republic of Korea (May-July, 20015): reasons, dynamics, conclusions. Pacific Medical Journal, 2015, no 3, pp. 89-93. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/ulhaer
  50. Щелканов М.Ю., Аристова В.А., Чумаков В.М., Львов Д.К. Историография термина «природный очаг». Новые и возвращающиеся инфекции в системе биобезопасности Российской Федерации. Учебно-методическое пособие. – М.: Изд-во Первого МГМУ им. И.М. Сеченова, 2014. С. 21-32. Shchelkanov M.Yu., Aristova V.A., Chumakov V.M., Lvov D.K. Historiography of the “natural focus” term // In: Emerging-reemerging infections in the system of biological safety of Russian Federation. Textbook. – Moscow: I.M. Sechenov Moscow Medical Academy Press, 2014, pp. 21-32. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/sawqmx
  51. Щелканов М.Ю., Власов Н.А., Киреев Д.Е., Славский А.А., Гребенникова Т.В., Прилипов А.Г., Забережный А.Д., Алипер Т.И., Кирюхин С.Т., Петренко М.С., Крашенинников О.П., Непоклонов Е.А., Онищенко Г.Г., Дерябин П.Г., Львов Д.К. Клинические признаки заболевания у птиц, вызванного высокопатогенными вариантами вируса гриппа А/H5N1, в эпицентре эпизоотии на юге Западной Сибири (июль 2005 г.) // Журнал инфекционной патологии. 2005. Т. 12. № 3-4. С. 121-124. Shchelkanov M.Yu., Vlasov N.A., Kireev D.E., Slavsky A.A., Grebennikova T.V., Prilipov A.G., Zaberezhny A.D., Aliper T.I., Kiryukhin S.T., Petrenko M.S., Krasheninnikov O.P., Nepoklonov E.A., Onishchenko G.G., Deryabin P.G., Lvov D.K. Clinical symptoms of bird disease provoked by highly pathogenic variants of influenza A / H5N1 virus in the epicenter of epizooty on the south of Western Siberia. Journal of Infectious Pathology, 2005, vol. 12, no 3–4, pp. 121-124. (in Russ.) URL: https://elibrary.ru/xhalux
  52. Щелканов М.Ю., Дунаева М.Н., Белик А.А., Гетке М.В., Потт А.Б., Чаленко И.С., Иунихина О.В., Домбровская И.Э., Панкратов Д.В. Эпизоотическая вспышка гриппа А / H5N1 среди диких и сельскохозяйственных птиц в окрестностях Комсомольска-на-Амуре осенью 2022 г. // Юг России: экология, развитие. 2024. Т. 19. № 4. C. 41‐56. Shchelkanov M.Yu., Dunaeva M.N., Belik A.A., Getke M.V., Pott A.B., Chalenko I.S., Iunikhina O.V., Dombrovskaya I.E., Pankratov D.V. Epizootic outbreak of influenza A / H5N1 among wild and farm birds in the vicinity of Komsomolsk‐on‐Amur in the autumn of 2022. South of Russia: Ecology, Development, 2024, vol. 19, no 4, pp. 41‐56. (in Russia) doi: 10.18470/1992-1098-2024-4-4
  53. Щелканов М.Ю., Дунаева М.Н., Москвина Т.В., Воронова А.Н., Кононова Ю.В., Воробьёва В.В., Галкина И.В., Янович В.А., Гаджиев А.А., Шестопалов А.М. Каталог вирусов рукокрылых (2020) // Юг России: экология, развитие. 2020. Т. 15. № 3. C 6-30. Shchelkanov M.Yu., Dunaeva M.N., Moskvina N.V., Voronova A.N., Kononova Yu.V., Vorobyeva V.V., Galkina I.V., Yanovich V.A., Gadzhiev A.A., Shestopalov A.M. Catalog of bat viruses (2020). South of Russia: Ecology, Development, 2020, vol. 15, no 3, pp. 6-30. (in Russ.) doi: 10.18470/1992‐1098‐2020‐3‐6‐30
  54. Щелканов М.Ю., Кириллов И.М., Шестопалов А.М., Литвин К.Е., Дерябин П.Г., Львов Д.К. Эволюция вируса гриппа А / H5N1 (1996-2016) // Вопросы вирусологии. 2016. Т. 61. № 6. С. 7-18. Shchelkanov M.Yu., Kirillov I.M., Shestopalov A.M., Litvin K.E., Deryabin P.G., Lvov D.K. Evolution of influenza A / H5N1 virus (1996-2016). Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2016, vol. 61, no 6, pp. 7-18. (in Russ.) doi: 10.18821/0507-4088-2016-61-6-245-256
  55. Щелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Бургасова О.А., Кружкова И.С., Малеев В.В. COVID-19: этиология, клиника, лечение // Инфекция и иммунитет. 2020. Т. 10. № 3. С. 421-445. Shchelkanov M.Yu., Kolobukhina L.V., Burgasova O.A., Kruzhkova I.S., Maleev V.V. COVID-19: etiology, clinic, treatment. Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet, 2020, vol. 10, no 3, pp. 421-445. (in Russ.) doi: 10.15789/2220-7619-CEC-1473
  56. Щелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Львов Д.К. Грипп: история, клиника, патогенез // Лечащий врач. 2011. № 10. С. 33-38. Shchelkanov M.Yu., Kolobukhina L.V., Lvov D.K. Influenza: history, clinics, pathogenesis. The Attending Physician, 2011, no 10, pp. 33-38. (in Russ.) URL: https://www.lvrach.ru/2011/10/15435275/
  57. Щелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Львов Д.К. Коронавирусы человека (Nidovirales, Coronaviridae): возросший уровень эпидемической опасности // Лечащий врач. 2013. № 10. С. 49-54. Shchelkanov M.Yu., Kolobukhina L.V., Lvov D.K. Human coronaviruses (Nidovirales, Coronaviridae): increased level of epidemic threat, The Attending Physician, 2013, no 10, pp. 49-54. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/takhvr
  58. Щелканов М.Ю., Леонова Г.Н., Галкина И.В., Андрюков Б.Г. У истоков концепции природной очаговости // Здоровье населения и среда обитания. 2021. № 5. С. 16-25. Shchelkanov M.Yu., Leonova G.N., Galkina I.V., Andryukov B.G. At the origins of the natural focality concept. Public Health and Life Environment, 2021, no 5, pp. 16-25. (in Russ.) doi: 10.35627/2219-5238/2021-338-5-16-25
  59. Щелканов М.Ю., Львов Д.К. Генотипическая структура рода Influenza A virus // Вестник РАМН. 2011. № 5. С. 19-23. Shchelkanov M.Yu., Lvov D.K. Genotypic structure of the genus influenza A virus. Vestnik Rossiiskoi Akademii Meditsinskikh Nauk, 2011, no 5, pp. 19-23. (in Russ.) URL: https://elibrary.ru/nweykv
  60. Щелканов М.Ю., Львов Д.К. Новый субтип вируса гриппа А от летучих мышей и новые задачи эколого-вирусологического мониторинга // Вопросы вирусологии. 2012. Приложение 1. С. 159-168. Shchelkanov M.Yu., Lvov D.K. New subtype of influenza A virus from bats and new tasks for ecologo-virological monitoring. Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2012, Suppl. 1, pp. 159-168. (in Russ.) URL: https://elibrary.ru/qjanvz
  61. Щелканов М.Ю., Львов Д.Н., Федякина И.Т., Баранов Н.И., Гореликов В.Н., Резник В.Я., Здановская Н.И., Пуховская Н.М., Авдошина Л.Н., Шапиро Н.П., Снеткова И.П., Кожан В.Н., Яровенко Г.М., Калаева Е.Е., Громова М.А., Еловский О.В., Еремеева Ю.В., Довгаль М.А., Кученков А.А., Ананьев В.Ю., Буртник В.И., Иванов Л.И., Гарбуз Ю.А., Подолянко И.А., Григорьев С.Н., Прошина Е.С., Самохвалов Е.И., Альховский С.В., Бурцева Е.И., Прилипов А.Г., Аббасова Е.И., Мироненко Е.С., Колобухина Л.В., Дерябин П.Г., Отт В.А., Маслов Д.В., Янович В.А., Львов Д.К. Динамика распространения пандемического гриппа А / H1N1 swl на Дальнем Востоке в 2009 г. // Вопросы вирусологии. 2010. Т. 55. № 3. С. 10-15. Shchelkanov M.Yu., Lvov D.N., Fedyakina I.T., Baranov N.I., Gorelikov V.N., Reznik V.Ya., Zdanovskaya N.I., Pukhovskaya N.M., Avdoshina L.N., Shapiro N.P., Snetkova I.P., Kozhan V.N., Yarovenko G.M., Kalaeva E.E., Gromova M.A., Elovsky O.V., Eremeeva Yu.V., Dovgal M.A., Kuchenkov A.A., Ananiev V.Yu., Burtnik V.I., Ivanov L.I., Garbuz Yu.A., Podolyanko I.A., Grigoriev S.N., Proshina E.S., Samokhvalov E.I., Alkhovskyy S.V., Burtseva E.I., Prilipov A.G., Abbasova E.I., Mironenko E.S., Kolobukhina L.V., Deryabin P.G., Ott V.A., Maslov D.V., Yanovich V.A., Lvov D.K. Trends in the spread of pandemic influenza A(H1N1) swl in the Far East in 2009. Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2010, vol. 55, no 3, pp. 10-15. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/muekiz
  62. Щелканов М.Ю., Попов А.Ф., Симакова А.И., Зенин И.В., Прошина Е.С., Кириллов И.М., Дмитриенко К.А., Шевчук Д.В. Патогенез гриппа: механизмы модуляции белками возбудителя // Журнал инфектологии. 2015. Т. 7. № 2. С. 31-46. Shchelkanov M.Yu., Popov A.F., Simakova A.I., Zenin I.V., Proshina E.S., Kirillov I.M., Dmitrienko K.A., Shevchuk D.V. Influenza pathogenesis: mechanisms of modulation by agent proteins. Zhurnal Infektologii, 2015, vol. 7, no 2. pp. 31-46. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/vzhuwt
  63. Щелканов М.Ю., Попова А.Ю., Дедков В.Г., Акимкин В.Г., Малеев В.В. История изучения и современная классификация коронавирусов (Nidovirales: Coronaviridae) // Инфекция и иммунитет. 2020. Т. 10. № 2. С. 221-246. Shchelkanov M.Yu., Popova A.Yu., Dedkov V.G., Akimkin V.G., Maleev V.V. History of investigation and current classification of coronaviruses (Nidovirales: Coronaviridae). Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet, 2020, vol. 10, no 2, pp. 221-246. (in Russ.) doi: 10.15789/2220-7619-HOI-1412
  64. Щелканов М.Ю., Суняйкин А.Б., Коваленко Т.С., Львов Д.К. Современная таксономия пикорнавирусов (Picornavirales, Picornaviridae) // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2015. № 3. С. 53-64. Shchelkanov M.Yu., Sunyaykin A.B., Kovalenko T.S., Lvov D.K. Modern taxonomy of picornaviruses (Picornavirales, Picornaviridae). Infectious diseases: news, opinions, education, 2015, no 3, pp. 53-64. (in Russ.) URL: https://www.elibrary.ru/ukllbv
  65. Щелканов М.Ю., Татонова Ю.В., Табакаева Т.В., Щелканов Е.М., Наумов Н.А., Хотько У.Е., Калинина К.А., Шуменко П.Г., Израильская А.В., Галкина И.В. Эндопаразиты рукокрылых: нематоды. Владивосток: Изд-во ДФВУ, 2023. 112 с. Shchelkanov M.Yu., Tatonova Yu.V., Tabakaeva T.V., Shchelkanov E.M., Naumov N.A., Khotko U.E., Kalinina K.A., Shumenko P.G., Israelskaya A.V., Galkina I.V. Endoparasites of bats: nematodes. Vladivostok: Far Eastern Federal University, 2023. 112 p. (in Russ.)
  66. doi: 10.61726/5457.2024.48.27.001
  67. Щелканов М.Ю., Федякина И.Т., Прошина Е.С., Пономаренко Р.А., Львов Д.Н., Чумаков В.М., Галкина И.В., Бурцева Е.И., Львов Д.К. Таксономическая структура Orthomyxoviridae: современное состояние и ближайшие перспективы // Вестник РАМН. – 2011. – № 5. – С. 12-19. Shchelkanov M.Yu., Fedyakina I.T., Proshina E.S., Lvov D.N., Ponomarenko R.A., Chumakov V.M., Burtseva E.I., Galkina I.V., Lvov D.K. Taxonomic structure of Orthomyxoviridae: current views and immediate prospects. Vestnik Rossiiskoi Akademii Meditsinskikh Nauk, 2011. no 5, pp. 12-19. (in Russ.) URL: https://elibrary.ru/nweykl
  68. Эсауленко Е.В., Новак К.Е. Современные возможности этиотропной и патогенетический терапии при респираторных инфекциях // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2024. Т. 13. № 3. С. 62-69. Esaulenko E.V., Novak K.E. Modern possibilities of etiotropic and pathogenetic therapy in respiratory infections. Infectious diseases: news, opinions, education, 2024, vol. 13, no. 3, pp. 62-69. (in Russ.) doi: 10.33029/2305-3496-2024-13-3-62-69
  69. Яковлев А.А., Шафигулин А.В., Попов А.Ф., Щелканов М.Ю. Динамика эпидемического процесса COVID-19 и других ОРВИ на Российском Дальнем Востоке (2019-2023 гг.) // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2025. Т. 24. № 1. С. 18-30. Yakovlev A.A., Shafigulin A.V., Popov A.F., Shchelkanov M.Yu. Dynamics of the COVID-19 epidemic process and other acute respiratory viral infection in the Russian Far East (2019-2023). Epidemiology and Vaccinal Prevention, 2025, vol. 24, no 1. pp. 18-30. (in Russ.) doi: 10.31631/2073-3046-2025-24-1-18-30
  70. Aguiar J.A., Tremblay B.J., Mansfield M.J., Woody O., Lobb B., Banerjee A., Chandiramohan A., Tiessen N., Cao Q., Dvorkin-Gheva A., Revill S., Miller M.S., Carlsten C., Organ L., Joseph C., John A., Hanson P., Austin R.C., McManus B.M., Jenkins G., Mossman K., Ask K., Doxey A.C., Hirota J.A. Gene expression and in situ protein profiling of candidate SARS-CoV-2 receptors in human airway epithelial cells and lung tissue. European Respiratory Journal, 2020, vol. 56, N 3:2001123.
  71. doi: 10.1183/13993003.01123-2020
  72. Allander T., Tammi M.T., Eriksson M., Bjerkner A., Tiveljung-Lindell A., Andersson B. Cloning of a human parvovirus by molecular screening of respiratory tract samples. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2005, vol. 102, no 36, pp.12891-12896. doi: 10.1073/pnas.0504666102
  73. Andrewes C.H., Laidlaw P.P., Smith W. The susceptibility of mice to the viruses of human and swine influenza. Lancet, 1934, vol. 2, pp. 859-862.
  74. Aydin M., Naumova E.A., Bellm A., Behrendt A.K., Giachero F., Bahlmann N., Zhang W., Wirth S., Paulsen F., Arnold W.H., Ehrhardt A. From submerged cultures to 3D сell culture models: Evolution of nasal epithelial cells in asthma research and virus infection. Viruses. 2021, vol. 13. no 3: 387. doi: 10.3390/v13030387
  75. Berbers G., Mollema L., van der Klis F., den Hartog G., Schepp R. Antibody responses to respiratory syncytial virus: A cross-sectional serosurveillance study in the Dutch population focusing on infants younger than 2 years. J Infect Dis., 2021, vol. 224, no 2, pp. 269-278. doi: 10.1093/infdis/jiaa483
  76. Bochkov Y.A., Palmenberg A.C., Lee W.M., Rathe J.A., Amineva S.P., Sun X., Pasic T.R., Jarjour N.N., Liggett S.B., Gern J.E. Molecular modeling, organ culture and reverse genetics for a newly identified human Rhinovirus C. Nature Medicine, 2011, vol. 17, no 5, pp. 627-632. doi: 10.1038/nm.2358
  77. Brewington J.J., Filbrandt E.T., LaRosa F.J., Moncivaiz J.D., Ostmann A.J., Strecker L.M., Clancy J.P. Generation of human nasal epithelial cell spheroids for individualized cystic fibrosis transmembrane conductance regulator study. Journal of Visualized Experiments, 2018, vol. 134: e57492.
  78. doi: 10.3791/57492
  79. Broadbent L., Villenave R., Guo-Parke H., Douglas I., Shields M.D., Power U.F. In vitro modeling of RSV infection and cytopathogenesis in well-differentiated human primary airway epithelial cells (WD-PAECs). Methods in Molecular Biology, 2016, vol. 1442, pp. 119-139. doi: 10.1007/978-1-4939-3687-8-9
  80. Bruckova M., McIntosh K., Kapikian A.Z., Chanock R.M. The adaptation of two human coronavirus strains (OC38 and OC43) to growth in cell monolayers. Proceedings of the Society for Experimental Biology and Medicine, 1970, vol. 135, no 2, pp. 431-435. doi: 10.3181/00379727-135-35068
  81. Bui C.H.T., Chan R.W.Y., Ng M.M.T., Cheung M.C., Ng K.C., Chan M.P.K., Chan L.L.Y., Fong J. H.M., Nicholls J.M., Peiris J.S. M., Chan M. C.W. Tropism of Influenza B Viruses in Human Respiratory Tract Explants and Airway Organoids. Eur Respir J., 2019, vol. 54(2):1900008. doi: 10.1183/13993003.00008-2019
  82. Chan R.W., Yuen K.M., Yu W.C., Ho C.C., Nicholls J.M., Peiris M.J., Chan M.C. Influenza H5N1 and H1N1 virus replication and innate immune responses in bronchial epithelial cells are influenced by the state of differentiation. PLoS One, 2010, vol. 5, no 1: e8713. doi: 10.1371/journal.pone.0008713
  83. Chanock R., Roizman B., Myers R. Recovery from infants with respiratory illness of a virus related to chimpanzee coryza agent (CCA). I. Isolation, properties and characterization. American Journal of Hygiene, 1957, vol. 66, no 3, pp. 281-290. doi: 10.1093/oxfordjournals.aje.a119901
  84. Chen Y.W., Huang S.X., De Carvalho A.L.T., Ho S.H., Islam M.N., Volpi S., Notarangelo L.D., Ciancanelli M., Casanova J.L., Bhattacharya J., Liang A.F., Palermo L.M., Porotto M., Moscona A., Snoeck H.W. A three-dimensional model of human lung development and disease from pluripotent stem cells. Nature Cell Biology, 2017, vol. 19, no 5, pp. 542-549. doi: 10.1038/ncb3510
  85. Chen Y.X., Xie G.C., Pan D., Du Y.R., Pang L.L., Song J.D., Duan Z.J., Hu B.R. Three-dimensional culture of human airway epithelium in Matrigel for evaluation of human Rhinovirus C and Bocavirus infections. Biomedical and Environmental Science, 2018, vol. 31, no2, pp. 136-145. doi: 10.3967/bes2018.016
  86. Chiok K.R., Dahlan N.A., Banerjee A., Dhar N. Establishing air-liquid interface (ALI) airway culture models for infectious disease research. Methods in Molecular Biology, 2024, vol. 2813, pp. 137-144. doi: 10.1007/978-1-0716-3890-3-10
  87. Choi S.S., van Unen V., Zhang H., Rustagi A., Alwahabi S.A., Santos A.J.M., Chan J.E., Lam B., Solis D., Mah J., Röltgen K., Trope W., Guh-Siesel A., Lin Z., Beck A., Edwards C., Mallajosyula V., Martin B.A., Dunn J.C.Y., Shrager J., Baric R.A., Pinsky B., Boyd S.D., Blish C.A., Davis M.M., Kuo C.J. Organoid modeling of lung-resident immune responses to SARS-CoV-2 infection. Res Sq. [Preprint]. 2023:rs.3.rs-2870695. doi: 10.21203/rs.3.rs-2870695/v1
  88. Davis A.S., Chertow D.S., Moyer J.E., Suzich J., Sandouk A., Dorward D.W., Logun C., Shelhamer J.H., Taubenberger J.K. Validation of normal human bronchial epithelial cells as a model for influenza A infections in human distal trachea. Journal of Histochemistry and Cytochemistry, 2015, vol., 63, no 5, pp. 312-328. doi: 10.1369/0022155415570968
  89. Diagne M.L., Rwezaura H., Tchoumi S.Y., Tchuenche J.M. A mathematical model of COVID-19 with vaccination and treatment. Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2021, vol. 2021: 1250129. doi: 10.1155/2021/1250129
  90. Dijkman R., Koekkoek S.M., Molenkamp R., Schildgen O., van der Hoek L. Human bocavirus can be cultured in differentiated human airway epithelial cells. Journal of Virology, 2009, vol. 83, no 15, no. 7739-7748. doi: 10.1128/JVI.00614-09
  91. Dronina J., Samukaite-Bubniene U., Ramanavicius A. Advances and insights in the diagnosis of viral infections. Journal of Nanobiotechnology, 2021, vol. 19: 348. doi: 10.1186/s12951-021-01081-2
  92. Erickson R., Huang C., Allen C., Ireland J., Roth G., Zou Z., Lu J., Lafont B.A.P., Garza N.L., Brumbaugh B., Zhao M., Suzuki M., Olano L., Brzostowski J., Fischer E.R., Twigg H.L. 3rd, Johnson R.F., Sun P.D. SARS-CoV-2 infection of human lung epithelial cells induces TMPRSS-mediated acute fibrin deposition. Nature Communications, 2023, vol. 14, no 1:6380. doi: 10.1038/s41467-023-42140-6
  93. Forrest I.A., Murphy D.M., Ward C., Jones D., Johnson G.E., Archer L., Gould F.K., Cawston T.E., Lordan J.L., Corris P.A. Primary airway epithelial cell culture from lung transplant recipients. Eur Resp J, 200, vol. 26, no 6, pp. 1080-1085. doi: 10.1183/09031936.05.00141404
  94. Francis T. Jr. A new type of virus from epidemic influenza. Science,1940,vol. 92, no 2392, pp. 405-408. doi: 10.1126/science.92.2392.405
  95. Gamage A.M., Tan K.S., Chan W.O.Y., Lew Z.Z.R., Liu J., Tan C.W., Rajagopalan D., Lin Q.X.X., Tan L.M., Venkatesh P.N., Ong Y.K., Thong M., Lin R.T.P., Prabhakar S., Wang Y., Wang L.F. Human nasal epithelial cells sustain persistent SARS-CoV-2 infection in vitro, despite eliciting a prolonged antiviral response. mBio, 2022, vol. 13. no 1: e0343621.
  96. DOI:
  97. 1128/mbio.03436-21
  98. Geiser J., Boivin G., Huang S., Constant S., Kaiser L., Tapparel C., Essaidi-Laziosi M. RSV and HMPV infections in 3D tissue cultures: Mechanisms involved in virus-host and virus-virus interactions. Viruses, 2021, vol. 13, no 1: 139. doi: 10.3390/v13010139
  99. Gowers K.H.C., Hynds R.E., Thakrar R.M., Carroll B., Birchall M.A., Janes S.M. Optimized isolation and expansion of human airway epithelial basal cells from endobronchial biopsy samples. Journal of Tissue Engineering and Regeneration Medicine, 2018, vol. 12, no 1:e313-e317. doi: 10.1002/term.2466
  100. Griggs T.F., Bochkov Y.A., Basnet S., Pasic T.R., Brockman-Schneider R.A., Palmenberg A.C., Gern J.E. Rhinovirus C targets ciliated airway epithelial cells. Respiratory Research, 2017, vol. 18, no 1: 84. doi: 10.1186/s12931-017-0567-0
  101. Guo Y.J., Jin F.G., Wang P., Wang M., Zhu J.M. Isolation of influenza C virus from pigs and experimental infection of pigs with influenza C virus. Journal of General Virology, 1983, vol. 64, pp. 177-182. doi: 10.1099/0022-1317-64-1-177
  102. Hamre D., Procknow J.J. A new virus isolated from the human respiratory tract. Proceedings of the Society for Experimental Biology and Medicine, 1966, vol. 121, no 1, pp. 190-193. doi: 10.3181/00379727-121-30734
  103. Han Y., Yang L., Lacko L.A., Chen S. Human organoid models to study SARS-CoV-2 infection. Nature Methods, 2022, vol. 19, no 4, pp. 418-428. doi: 10.1038/s41592-022-01453-y
  104. Hara K., Beare A.S., Tyrrell D.A. Growth and pathogenicity of influenza viruses in organ cultures of ciliated epithelium. I. Experiments in ferret and human tissue. Archiv Gesamte Virusforschung, 1974, vol. 44, no 3, pp. 227-236. doi: 10.1007/BF01240610
  105. Hause B.M., Ducatez M., Collin E.A., Ran Z., Liu R., Sheng Z., Armien A., Kaplan B., Chakravarty S., Hoppe A.D., Webby R.J., Simonson R.R., Li F. Isolation of a novel swine influenza virus from Oklahoma in 2011 which is distantly related to human influenza C viruses. PLoS Pathogens, 2013, vol. 9, no 2: e1003176. doi: 10.1371/journal.ppat.1003176
  106. Hoke C.H. Jr., Hopkins J.A., Meiklejohn G., Mostow S.R. Comparison of several wild-type influenza viruses in the ferret tracheal organ culture system. Reviews in Infection Diseases, 1979, vol. 1, no 6, pp. 946-954. doi: 10.1093/clinids/1.6.946
  107. Hoorn B., Tyrrell D.A. A new virus cultivated only in organ cultures of human ciliated epithelium. Archiv Gesamte Virusforschung, 1966, vol. 18, no 2, pp. 210-225. doi: 10.1007/BF01241842
  108. Hoorn B., Tyrrell D.A. On the growth of certain “newer” respiratory viruses in organ cultures. British Journal of Experimental Pathology, 1965, vol. 46, no 2, pp. 109-118.
  109. Hoorn B., Tyrrell D.A. Organ cultures in virology. Progress in Medical Virology, 1969, vol. 11, pp. 408-450.
  110. Huang S.X., Islam M.N., O’Neill J., Hu Z., Yang Y.G., Chen Y.W., Mumau M., Green M.D., Vunjak-Novakovic G., Bhattacharya J., Snoeck H.W. Efficient generation of lung and airway epithelial cells from human pluripotent stem cells. Nature Biotechnology, 2014, vol. 32, no 1, pp. 84-91. doi: 10.1038/nbt.2754
  111. Huebner R.J., Rowe W.P., Ward T.G., Parrott R.H., Bell J.A. Adenoidal-pharyngeal-conjunctival agents: a newly recognized group of common viruses of the respiratory system. New England Journal of Medicine, 1954, vol. 251, no 27, pp. 1077-1086. doi: 10.1056/NEJM195412302512701
  112. Jia HP, Look DC, Shi L, Hickey M, Pewe L, Netland J, et al. ACE2 Receptor Expression and Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Infection Depend on Differentiation of Human Airway Epithelia. J Virol, 2005, vol. 79, no.23:14614–21. doi: 10.1128/JVI.79.23.14614-14621.2005
  113. Kang J., Ismail A.M., Dehghan S., Rajaiya J., Allard M.W., Lim H.C., Dyer D.W., Chodosh J., Seto D. Genomics-based re-examination of the taxonomy and phylogeny of human and simian Mastadenoviruses: an evolving whole genomes approach, revealing putative zoonosis, anthroponosis, and amphizoonosis. Cladistics, 2020, vol. 36, no 4, pp. 358-373. doi: 10.1111/cla.12422
  114. Khales P., Razizadeh M.H., Ghorbani S., Moattari A., Sarvari J., Saadati H., Sayyahfar S., Salavatiha Z., Hasanabad M.H., Poortahmasebi V., Tavakoli A. Human adenoviruses in children with gastroenteritis: a systematic review and meta-analysis. BMC Infect Dis, 2024, vol. 24, no 1: 478. doi: 10.1186/s12879-024-09386-x
  115. Khalfaoui S., Eichhorn V., Karagiannidis C., Bayh I., Brockmann M., Pieper M., Windisch W., Schildgen O., Schildgen V. Lung infection by human bocavirus induces the release of profibrotic mediator cytokines in vivo and in vitro. PLoS One, 2016, vol. 11, no 1: e0147010. doi: 10.1371/journal.pone.0147010
  116. Khotimchenko Yu.S., Shchelkanov M.Yu. Viruses of the Ocean: On the shores of the aqua incognita. Horizons of taxonomic diversity. Russian Journal of Marine Biology. 2024, vol. 50, no 1, pp. 1-24. doi: 10.1134/S106307402401005X
  117. Kogure T., Suzuki T., Takahashi T., Miyamoto D., Hidari K.I., Guo C.T., Ito T., Kawaoka Y., Suzuki Y. Human trachea primary epithelial cells express both sialyl(α2-3)Gal receptor for human parainfluenza virus type 1 and avian influenza viruses, and sialyl(α2-6)Gal receptor for human influenza viruses. Glycoconjugate Journal. 2006, vol. 23, no 1-2, pp. 101-106. doi: 10.1007/s10719-006-5442-z
  118. Lam E., Ramke M., Warnecke G., Schrepfer S., Kopfnagel V., Dobner T., Heim A. Effective apical infection of differentiated human bronchial epithelial cells and induction of proinflammatory chemokines by the highly pneumotropic human adenovirus type 14p1. PLoS One. 2015, vol. 10, no 7: e0131201. doi: 10.1371/journal.pone.0131201
  119. Lamson D., Renwick N., Kapoor V., Liu Z., Palacios G., Ju J., Dean A., St. George K., Briese T., Lipkin W.I. MassTag polymerase-chain-reaction detection of respiratory pathogens, including a new rhinovirus genotype, that caused influenza-like illness in New York State during 2004-2005. Journal of Infectious Diseases. 2006, vol. 194, no 10, pp. 1398-1402. doi: 10.1086/508551
  120. Leung C., Wadsworth S.J., Yang S.J., Dorscheid D.R. Structural and functional variations in human bronchial epithelial cells cultured in air-liquid interface using different growth media. American Journal of Physiology – Lung Cellular and Molecular Physiology. 2020, vol. 318:L1063-L1073. doi: 10.1152/ajplung.00190.2019
  121. Li C., Huang J., Yu Y., Wan Z., Chiu M.C., Liu X., Zhang S., Cai J.P., Chu H., Li G., Chan J.F., To K.K., Yang Z., Jiang S., Yuen K.Y., Clevers H., Zhou J. Human airway and nasal organoids reveal escalating replicative fitness of SARS-CoV-2 emerging variants. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2023, vol. 120, no 17:e2300376120. doi: 10.1073/pnas.2300376120
  122. Lin Y.T., Lin C.F., Yeh T.H. Influenza A virus infection induces indoleamine 2,3-dioxygenase (IDO) expression and modulates subsequent inflammatory mediators in nasal epithelial cells. Acta Otolaryngologica, 2020, vol. 140, no 2, pp. 149-156. doi: 10.1080/00016489.2019.1700304
  123. Liu Z., Anderson J.D., Deng L., Mackay S., Bailey J., Kersh L., Rowe S.M., Guimbellot J.S. Human nasal epithelial organoids for therapeutic development in cystic fibrosis. Genes, 2020, vol. 11, no 6: 603. doi: 10.3390/genes11060603
  124. McIntosh K., Dees J.H., Becker W.B., Kapikian A.Z., Chanock R.M. Recovery in tracheal organ cultures of novel viruses from patients with respiratory disease. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1967, vol. 57, no 4, pp. 933-940. doi: 10.1073/pnas.57.4.933
  125. Medvedev S.P., Shevchenko A.I., Zakian S.M. Induced pluripotent stem cells: Problems and advantages when applying them in regenerative medicine. Acta Naturae, 2010, vol. 2, no 2, pp. 18-28. doi: 10.32607/20758251-2010-2-2-18-27
  126. Mohd-Qawiem F., Nawal-Amani A.R., Faranieyza-Afiqah F., Yasmin A.R., Arshad S.S., Norfitriah M.S., Nur-Fazila S.H. Paramyxoviruses in rodents: A review. Open Veterinary Journal, 2022, vol. 12, no 6, pp. 868-876. doi: 10.5455/OVJ.2022.v12.i6.14
  127. Montgomery S.T., Frey D.L., Mall M.A., Stick S.M., Kicic A. Rhinovirus infection is associated with airway epithelial cell necrosis and inflammation via Interleukin-1 in young children with cystic fibrosis. Frontiers in Immunology, 2020, vol. 11:596. doi: 10.3389/fimmu.2020.00596
  128. Morris G.J., Buckland R., Rubenstein D., Farrant J. Preservation of human tracheal organ cultures at -196 degrees C. Journal of Medical Microbiology, 1973, vol. 6, no 1, pp. 123-126. DOI:
  129. 1099/00222615-6-1-123
  130. Mostow S.R., Flatauer S., Paler M., Murphy B.R. Temperature-sensitive mutants of influenza virus. XIII. Evaluation of influenza A/Hong Kong/68 and A/Udorn/72 ts and wild-type viruses in tracheal organ culture at permissive and restrictive temperatures. Journal of Infectious Diseases, 1977, vol. 136, no 1, pp. 1-6. doi: 10.1093/infdis/136.1.1
  131. Müller M., Kohl Y., Germann A., Wagner S., Zimmermann H., von Briesen H. Alveolar epithelial-like cell differentiation in a dynamic bioreactor: a promising 3D-approach for the high-throughput generation of lung cell types from human induced pluripotent stem cells. In vitro Models, 2023, no 2, pp. 249-262. doi: 10.1007/s44164-023-00052-1
  132. Nakagome K., Bochkov Y.A., Ashraf S., Brockman-Schneider R.A., Evans M.D., Pasic T.R., Gern J.E. Effects of rhinovirus species on viral replication and cytokine production. Journal of Allergy and Clinical Immunology, 2014, vol. 134, no 2, pp. 332-341. DOI:
  133. 1016/j.jaci.2014.01.029
  134. Okabayashi T., Kojima T., Masaki T., Yokota S., Imaizumi T., Tsutsumi H., Himi T., Fujii N., Sawada N. Type-III interferon, not type-I, is the predominant interferon induced by respiratory viruses in nasal epithelial cells. Virus Research, 2011, vol. 160, no 1-2, pp. 360-366. DOI:
  135. 1016/j.virusres.2011.07.011
  136. Osterhaus A.D., Rimmelzwaan G.F., Martina B.E., Bestebroer T.M., Fouchier R.A. Influenza B virus in seals. Science, 2000, vol. 288, no 5468, pp. 1051-1053. DOI:
  137. 1126/science.288.5468.1051
  138. Park J.H., Hong S.B., Huh J.W., Jung J., Kim M.J., Chong Y.P., Sung H., Do K.H., Kim S.H., Lee S.O., Kim Y.S., Lim C.M., Koh Y., Choi S.H. Severe human parainfluenza virus community- and healthcare-acquired pneumonia in adults at tertiary hospital, Seoul, South Korea, 2010-2019. Emerging Infection Diseases, 2024, vol. 30, no 6, pp. 1088-1095. DOI:
  139. 3201/eid3006.230670
  140. Peretz J, Pekosz A, Lane AP, Klein SL. Estrogenic Compounds Reduce Influenza a Virus Replication in Primary Human Nasal Epithelial Cells Derived From Female, But Not Male, Donors. Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol, 2016, vol.310, no5:L415–25. DOI:
  141. 1152/ajplung.00398.2015
  142. Pickles RJ. Human Airway Epithelial Cell Cultures for Modeling Respiratory Syncytial Virus Infection. Curr Top Microbiol Immunol, 2013, vol. 372, pp. 371–387. DOI:
  143. 1007/978-3-642-38919-1-19
  144. Porotto M., Ferren M., Chen Y.W., Siu Y., Makhsous N., Rima B., et al. Authentic modeling of human respiratory virus infection in human pluripotent stem cell-derived lung organoids. MBio, 2019, vol. 10, no 3, pp. 1360-1381. DOI:
  145. 1128/mBio.00723-19
  146. Price W.H. The isolation of a new virus associated with respiratory clinical disease in humans. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 1956, vol. 42, no 12, pp. 892-896. DOI:
  147. 1073/pnas.42.12.892
  148. Ramos I., Smith G., Ruf-Zamojski F, Martínez-Romero C, Fribourg M, Carbajal EA, et al. Innate Immune Response to Influenza Virus at Single-Cell Resolution in Human Epithelial Cells Revealed Paracrine Induction of Interferon Lambda 1. J Virol, 2019, vol.93, no 20:e00559-19. DOI:
  149. 1128/JVI.00559-19
  150. Ribo-Molina P., van Nieuwkoop S., Mykytyn A.Z., van Run P., Lamers M.M., Haagmans B.L., Fouchier R.A.M., van den Hoogen B.G. Human metapneumovirus infection of organoid-derived human bronchial epithelium represents cell tropism and cytopathology as observed in in vivo models. mSphere, 2024, vol. 9, no 2: e0074323. DOI:
  151. 1128/msphere.00743-23
  152. Rijsbergen L.C., van Dijk L.L.A., Engel M.F.M., de Vries R.D., de Swart R.L. In vitro modelling of respiratory virus infections in human airway epithelial cells – a systematic review. Frontiers in Immunology, 2021, vol. 12: 683002. DOI:
  153. 3389/fimmu.2021.683002
  154. Rowe W.P., Huebner R.J., Gilmore L.K., Parrott R.H., Ward T.G. Isolation of a cytopathogenic agent from human adenoids undergoing spontaneous degeneration in tissue culture. Proceedings of the Society for Experimental Biology and Medicine, 1953, vol. 84, no 3, pp. 570-573. DOI:
  155. 3181/00379727-84-20714
  156. Rubin B.A. Clinical picture and epidemiology of adenovirus infections (a review). Acta Microbiologica Hungarica, 1993, vol. 40, no 4, pp. 303-323.
  157. Schaap-Nutt A, Liesman R, Bartlett EJ, Scull MA, Collins PL, Pickles RJ, et al. Human Parainfluenza Virus Serotypes Differ in Their Kinetics of Replication and Cytokine Secretion in Human Tracheobronchial Airway Epithelium. Virology, 2012, vol. 433, no2, pp. 320–3288. DOI:
  158. 1016/j.virol.2012.08.027
  159. Schalk A.F., Hawn M.C. An apparently new respiratory disease of baby chicks. Journal of American Veterinary Medicine Association, 1931, vol. 78, pp. 413-423.
  160. Scherzad A., Hagen R., Hackenberg S. Current understanding of nasal epithelial cell mis-differentiation. Journal of Inflammation Research, 2019, vol. 12, pp. 309-317. DOI:
  161. 2147/JIR.S180853
  162. Sharp C.P., LeBreton M., Kantola K., Nana A., Diffo Jle D., Djoko C.F., Tamoufe U., Kiyang J.A., Babila T.G., Ngole E.M., Pybus O.G., Delwart E., Delaporte E., Peeters M., Soderlund-Venermo M., Hedman K., Wolfe N.D., Simmonds P. Widespread infection with homologues of human parvoviruses B19, PARV4, and human bocavirus of chimpanzees and gorillas in the wild. Journal of Virology, 2010, vol. 84, no 19, pp. 10289-10296. DOI:
  163. 1128/JVI.01304-10
  164. Shope R.E. Swine influenza: I. Experimental transmission and pathology. Journal of Experimental Medicine, 1931, vol. 54, pp. 349-359. DOI:
  165. 1084/jem.54.3.349
  166. Sims A.C., Burkett S.E., Yount B., Pickles R.J. SARS-CoV Replication and Pathogenesis in an In Vitro Model of the Human Conducting Airway Epithelium. Virus Research, 2008, vol. 133, no 1, pp. 33-44. DOI:
  167. 1016/j.virusres.2007.03.013
  168. Stell P.M., Stell I.M., Watt J. Age changes in the epithelial lining of the human larynx. Gerontology, 1982, vol. 28, no 3, pp. 208-214. DOI:
  169. 1159/000212533
  170. Suzuki T, Yamaya M, Kamanaka M, Jia YX, Nakayama K, Hosoda M, et al. Type 2 Rhinovirus Infection of Cultured Human Tracheal Epithelial Cells: Role of LDL Receptor. Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol, 2001, vol. 280, no 3, pp. 24-30:L409–20. DOI:
  171. 1152/ajplung.2001.280.3.L409
  172. Taylor R.M. Studies on survival of influenza virus between epidemics and antigenic variants of the virus. American Journal of Public Health and the Nation's Health, 1949, vol. 39, no 2. pp. 171-178. DOI:
  173. 2105/ajph.39.2.171
  174. Thangam T., Parthasarathy K., Supraja K., Haribalaji V., Sounderrajan V., Sudhanarayani S.R., Jayaraj S. Lung organoids: Systematic review of recent advancements and its future perspectives. Tissue Engineering and Regenerative Medicine, 2024, vol. 21, pp. 653-671. DOI:
  175. 1007/s13770-024-00628-2
  176. Tong S., Li Y., Rivailler P., Conrardy C., Castillo D.A., Chen L.M., Recuenco S., Ellison J.A., Davis C.T., York I.A., Turmelle A.S., Moran D., Rogers S., Shi M., Tao Y., Weil M.R., Tang K., Rowe L.A., Sammons S., Xu X., Frace M., Lindblade K.A., Cox N.J., Anderson L.J., Rupprecht C.E., Donis R.O. A distinct lineage of influenza A virus from bats. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2012, vol. 109, pp. 4269-4274. DOI:
  177. 1073/pnas.1116200109
  178. Toulmin S.A., Bhadiadra C., Paris A.J., Lin J.H., Katzen J., Basil M.C., Morrisey E.E., Worthen G.S., Eisenlohr L.C. Type II alveolar cell MHCII improves respiratory viral disease outcomes while exhibiting limited antigen presentation. Nature Communications, 2021, vol. 12, no 1: 3993. DOI:
  179. 1038/s41467-021-23619-6
  180. Turner D.L., Amoozadeh S., Baric H., Stanley E., Werder R.B. Building a human lung from pluripotent stem cells to model respiratory viral infections. Respiratory Research, 2024, vol. 25, no 1: 277. DOI:
  181. 1186/s12931-024-02912-0
  182. Tyrrell D.A., Bynoe M.L. Cultivation of a novel type of common-cold virus in organ cultures. British Medical Journal, 1965, vol. 1, pp. 1467-1470. DOI:
  183. 1136/bmj.1.5448.1467
  184. Tyrrell D.A., Hoorn B. The growth of some myxoviruses in organ cultures. British Journal of Experimental Pathology, 1965, vol. 46, no 5, pp. 514-518.
  185. Van den Hoogen B.G., de Jong J.C., Groen J., Kuiken T., de Groot R., Fouchier R.A., Osterhaus A.D. A newly discovered human pneumovirus isolated from young children with respiratory tract disease. Nature Med, 2001, vol. 7, no 6, pp. 719-724. DOI:
  186. 1038/89098
  187. Villenave R., Shields M.D., Power U.F. Respiratory syncytial virus interaction with human airway epithelium. Trends in Microbiology, 2013, vol. 21, no 5, pp. 238-244. DOI:
  188. 1016/j.tim.2013.02.004
  189. Vries R.D., Herfst S., Richard M. Avian influenza A virus pandemic preparedness and vaccine development. Vaccines (Basel), 2018, Vol. 6, no 3:46. doi: 10.3390/vaccines6030046
  190. Wu C.T., Lidsky P.V., Xiao Y., Cheng R., Lee I.T., Nakayama T., Jiang S., He W., Demeter J., Knight M.G., Turn R.E., Rojas-Hernandez L.S., Ye C., Chiem K., Shon J., Martinez-Sobrido L., Bertozzi C.R., Nolan G.P., Nayak J.V., Milla C., Andino R., Jackson P.K. SARS-CoV-2 replication in airway epithelia requires motile cilia and microvillar reprogramming. Cell, 2023, vol. 186, no 1, pp. 112-130. DOI:
  191. 1016/j.cell.2022.11.030
  192. Xu M., Perdomo M.F., Mattola S., Pyöriä L., Toppinen M., Qiu J., Vihinen-Ranta M., Hedman K., Nokso-Koivisto J., Aaltonen L.M., Söderlund-Venermo M. Persistence of human Bocavirus 1 in tonsillar germinal centers and antibody-dependent enhancement of infection. mBio, 2021, vol. 12, no 1: e03132-20. DOI:
  193. 1128/mBio.03132-20
  194. Yaghi A., Dolovich M.B. Airway epithelial cell cilia and obstructive lung disease. Cells, 2016, vol. 5, no 4: 40. DOI:
  195. 3390/cells5040040
  196. Yang T.I., Li W.L.,Chang T.Н., Lu C.-Y, Chen J.-M., Lee P.-I., Huang L.-M., Chang L.-Y. Adenovirus replication and host innate response in primary human airway epithelial cells. J Microbiol, Immunol Infect, 2019, vol. 52, no 2, pp. 207-214. DOI:
  197. 1016/j.jmii.2018.08.010
  198. Yang W., Schountz T., Ma W. Bat influenza viruses: Current status and perspective. Viruses, 2021, vol. 13, no 4:547. DOI:
  199. 3390/v13040547
  200. Yu X., Lakerveld A.J., Imholz S., Hendriks M., Ten Brink S.C.A., Mulder H.L., de Haan K., Schepp R.M., Luytjes W., de Jong M.D., van Beek J., van Kasteren P.B. Antibody and local cytokine response to respiratory syncytial virus infection in community-dwelling older adults. mSphere, 2020, vol. 5, no 5: e00577-20. DOI:
  201. 1128/mSphere.00577-20
  202. Zehender G., De Maddalena C., Canuti M., Zappa A., Amendola A., Lai A., Galli M., Tanzi E. Rapid molecular evolution of human bocavirus revealed by Bayesian coalescent inference. Infection, Genetics and Evolution, 2010, vol. 10, no 2, pp. 215-220. DOI:
  203. 1016/j.meegid.2009.11.011
  204. Zepp J.A., Morrisey E.E. Cellular crosstalk in the development and regeneration of the respiratory system. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2019, vol. 20, no 9, pp. 551-566. DOI:
  205. 1038/s41580-019-0141-3
  206. Zhang L., Bukreyev A., Thompson C.I., Watson B., Peeples M.E., Collins P.L., Pickles R.J. Infection of ciliated cells by human parainfluenza virus type 3 in an in vitro model of human airway epithelium. Journal of Virology, 2005, vol. 79, no 2, pp. 1113-1124. DOI:
  207. 1128/JVI.79.2.1113-1124.2005
  208. Zhang M., Wang P., Luo R., Wang Y., Li Z., Guo Y., Yao Y., Li M., Tao T., Chen W., Han J., Liu H., Cui K., Zhang X., Zheng Y., Qin J. A human disease model of SARS-CoV-2-induced lung injury and immune responses with a microengineered organ chip. BioRxiv, 2020. DOI:
  209. 1101/2020.07.20.211789
  210. Zhao Y, Jamaluddin M, Zhang Y, Sun H, Ivanciuc T, Garofalo RP, et al. Systematic Analysis of Cell-Type Differences in the Epithelial Secretome Reveals Insights Into the Pathogenesis of Respiratory Syncytial Virus-Induced Lower Respiratory Tract Infections. J Immunol, 2017, vol. 198, no 8:3345–3364. DOI:
  211. 4049/jimmunol.1601291

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) Kuznetsova T., Mikhalko A.A., Shchelkanov E.M., Kryzhanovsky S.P., Shchelkanov M.Y.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies