Biological properties and pathogenetic potential of Weeksellaceae family bacteria
- Authors: Zubova K.V.1, Kuznetsova V.A.2, Kanevsky M.V.1, Kondratenko O.V.3, Glinskaya E.V.1, Nechaeva O.V.2,4, Afinogenova A.G.5
-
Affiliations:
- Saratov State University
- National Medical Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology named after Academician V.I.Kulakov
- Samara State Medical University of Ministry of Healthсare of Russian Federation
- Russian Medical Academy of Continuous Professional Education
- St. Petersburg Pasteur Institute
- Issue: Vol 15, No 3 (2025)
- Pages: 505-516
- Section: ORIGINAL ARTICLES
- Submitted: 04.02.2025
- Accepted: 18.05.2025
- Published: 15.09.2025
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/17859
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-BPA-17859
- ID: 17859
Cite item
Full Text
Abstract
In recent years, the role of former saprophyte bacteria in the etiology of human infectious diseases has become an increasingly pressing issue. Of particular interest are non-fermenting gram-negative bacteria, many of which are members of the rhizobiome in some plants, soil and water microbiome. Increasingly, scientific literature covers cases of infections caused by members of the order Flavobacteriales, namely the genus Chryseobacterium, Elizabethkingia and Empedobacter of the Weeksellaceae family. Microorganisms of the latter are causative agents in several human diseases, including urinary tract and respiratory tract infections. The aim of our study was to investigate the biological properties of bacteria of the genus Chryseobacterium, Elizabethkingia and Empedobacter of the Weeksellaceae family isolated from patients with cystic fibrosis and to assess their pathogenetic potential. To analyze the biological properties and pathogenetic potential, 32 clinical strains of bacteria belonging to the Weeksellaceae family, isolated from biological material samples of the respiratory tract from cystic fibrosis patients, were selected for the study. Differential diagnostic media and plate test systems were used. DNA was isolated using 5X ScreenMix (ZAO Evrogen) and PCR with gel electrophoresis was performed. Bacteria of the Weeksellaceae family are characterized by a wide range of enzymes, especially C. arthrosphaerae and E. meningoseptica. It was found that strains of the Chryseobacterium, Elizabethkingia and Empedobacter genus are carriers of virulence genes, exhibit pathogenicity and participate in chronic respiratory infections in patients with cystic fibrosis. Phenotypic methods for studying enzymatic activity showed that all the examined strains of bacteria of the Weeksellaceae family are characterized by gelatinase activity, and representatives of the genus Chryseobacterium spp. — also by the ability to synthesize plasma coagulase. The potential to produce other enzymes of aggression is less pronounced and was strain specific. Analysis of the genetic profile of virulence factors in the studied bacteria showed that in their genome, genes encoding the enzymes lecithinase, hyaluronidase, elastase and hemolysin were most often found, and in bacteria of the genus Chryseobacterium spp. and Empedobacter spp. — neuroaminidase, which contribute to overcoming tissue barriers, pathogen invasion and spread throughout host tissues. The obtained results and scientific literature data indicate a special clinical role for bacteria of the Weeksellaceae family, which determines the importance of a deep study of the biological properties and virulence factors in members of the genus Chryseobacterium spp., Elizabethkingia spp. and Empedobacter spp.
Full Text
Введение
В последние годы вопрос о роли бактерий, ранее являвшихся сапрофитами, в этиологии инфекционных заболеваний человека стоит крайне остро. Особый интерес вызывают неферментирующие грамотрицательные бактерии, многие из которых являются представителями ризобиома ряда растений, почвенного и водного микробиома. Все чаще в научной литературе освещают случаи инфекций, которые вызваны представителями порядка Flavobacteriales, а именно родов Chryseobacterium, Elizabethkingia и Empedobacter семейства Weeksellaceae [2, 15, 25]. Микроорганизмы этого семейства являются возбудителями ряда заболеваний человека, в том числе инфекций мочевыводящих и дыхательных путей.
Chryseobacterium spp. могут вызывать бактериемию, пневмонию, менингит, пиомиозит, кератит, хирургические инфекции и инфекции ожоговых ран, в том числе и у детей [6, 7]. Описаны случаи внутрибольничных инфекций, вызванных C. indologenes, которые возникали у госпитализированных пациентов при использовании различных медицинских устройств (респираторы, эндотрахеальные трубки, инкубаторы для новорожденных и др.) [13]. Elizabethkingia spp. являются этиологическим фактором развития менингита, кератита и сепсиса [12, 24, 27]. Empedobacter spp. выделяли из патологического материала при абсцессах, инфекционных поражениях дыхательных и мочевыделительных путей, из каловых масс больного, а также при бактериемии [17, 18, 22, 30].
Особую опасность данные инфекционные агенты представляют для иммунокомпрометированных лиц, пациентов с хроническими заболеваниями или находящихся на длительной внутривенной антибиотикотерапии, а также для недоношенных детей [11]. Бактерии семейства Weeksellaceae характеризуются высокой адаптивностью к факторам внешней среды, а также природной мультирезистентностью по отношению к широкому спектру антимикробных препаратов (АМП) [10, 19, 23, 29]. Так, например, Elizabethkingia spp. содержат различные типы β-лактамаз: β-лактамазы расширенного спектра действия класса A и металло-β-лактамазы класса B, что определяет их устойчивость, в том числе и к широко используемым карбапенемам [29]. В геноме Empedobacter spp. содержатся гены, которые обуславливают устойчивость бактерий к цефалоспоринам и карбапенемам [30]. Кроме того, встречаются штаммы Empedobacter spp., устойчивые к колистину [29].
Chryseobacterium spp. характеризуются природной устойчивостью не только к аминогликозидам, тетрациклинам, хлорамфениколу, макролидам, аминопенициллинам, клиндамицину, тейкопланину, но и к цефалоспоринам нового поколения, а также азтреонаму, тикарциллин-клавуланату и карбапенемам [14]. Среди применяемых АМП наиболее эффективными в отношении хризиобактерий являются хинолоны (гатифлоксацин и левофлоксацин), миноциклин и триметоприм-сульфаметоксазол, однако в последнее время появляется все больше публикаций, отмечающих тревожную тенденцию к росту устойчивости к ним [14, 15, 26, 31].
Представители семейства Weeksellaceae обладают широким набором факторов вирулентности. Гены вирулентности детерминируют синтез различных компонентов, таких как липоолигосахариды, полисахариды капсулы, каталазы, протеазы и пероксидазы, также выявлено наличие двухкомпонентной регуляторной системы, супероксиддисмутазы, белка теплового шока [9, 28].
Отсутствие структурированных данных о клинической роли микроорганизмов семейства Weeksellaceae, факторах патогенности и механизмов инфицирования человека, а также методах лечения вызываемых ими инфекций диктует необходимость во всестороннем изучении этой многочисленной группы бактерий.
Целью нашего исследования являлось изучение биологических свойств бактерий родов Chryseobacterium, Elizabethkingia и Empedobacter семейства Weeksellaceae, выделенных от пациентов с муковисцидозом (МВ), и оценка их патогенетического потенциала.
Материалы и методы
Бактериальный материал для исследования получен от пациентов клиник Самарского государственного медицинского университета (Самара, Россия). Исследования проводили на базе кафедры микробиологии и физиологии растений биологического факультета Саратовского национального исследовательского государственного университета имени Н.Г. Чернышевского, кафедры общей и клинической микробиологии, иммунологии и аллергологии СамГМУ.
Для оценки биологических свойств и патогенетического потенциала в исследование отобраны 32 клинических штамма бактерий, относящихся к семейству Weeksellaceae, выделенных из образцов биологического материала респираторного тракта пациентов с муковисцидозом: Chryseobacterium arthrosphaerae (n = 8), Chryseobacterium indolegens (n = 4), Chryseobacterium tructae (n = 4), Chryseobacterium gleum (n = 2), Elizabethkingia meningoseptica (n = 3), Elizabethkingia anopheles (n = 3), Empedobacter falsenii (n = 5), Empedobacter brevis (n = 1), Chryseobacterium oncorhynchi (n = 1), Chryseobacterium ureilyticum (n = 1). Chryseobacterium arthrosphaerae (n = 8), Chryseobacterium indolegens (n = 4), Chryseobacterium tructae (n = 4), Chryseobacterium gleum (n = 2), Elizabethkingia meningoseptica (n = 3), Elizabethkingia anopheles (n = 3), Empedobacter falsenii (n = 5), Empedobacter brevis (n = 1), Chryseobacterium oncorhynchi (n = 1), Chryseobacterium ureilyticum (n = 1). Выбор этих микроорганизмов обусловлен их высокой частотой встречаемости при посевах биологического материала среди всех представителей изучаемого семейства бактерий [10].
Первичный посев биологического материала и идентификацию выделяемых бактерий осуществляли сотрудники микробиологического отдела клинико-диагностической лаборатории СамГМУ в соответствии с методикой, описанной в патенте РФ на изобретение № 2668406 «Способ первичного посева биоматериала, выделенного из нижних дыхательных путей пациентов с муковисцидозом» (патент РФ № 2668406). Идентификацию выделенных культур микроорганизмов проводили с использованием методики MALDI-TоF MS масс-спектрометрии (Bruker Daltonics, США) с использованием прибора «Microflex» и программного обеспечения MALDI Biotyper 3 RTC (Bruker Daltonics, Германия).
Биологические свойства. Морфологические свойства изучали при помощи микроскопа «Биомед-4» (ООО «Биомед», Россия) в мазках, окрашенных по Граму, и в нативных препаратах («раздавленная капля»). Культуральные свойства оценивали на ГРМ-агаре (ФБУН ГНЦ ПМБ, Россия), мясопептонном агаре (МПА) (ФБУН ГНЦ ПМБ, Россия) и Колумбийском агаре (ФБУН ГНЦ ПМБ, Россия) с добавлением 5% дефибрированной бараньей крови (Азимут, Россия). Бактерии выращивали при температуре 37°C в течение 1–5 суток.
Изучение ферментативной активности проводили с помощью планшетных тест-систем (ООО НПО «Диагностические системы», Россия). Для этого готовили взвесь суточных культур изучаемых штаммов, выращенных при температуре 37°C в течение 24 часов. Культуры разводили в 5 мл физиологического раствора до 10 единиц по оптическому стандарту мутности McFarland. Разведенные культуры раскапывали с помощью автоматического дозатора по 0,1 мл в лунки. Культивировали при температуре 37°C в течение 1–3 суток. Далее учитывали изменение цвета индикатора.
Проведены тесты на амилазную, лецитиназную и пептидазную активности [5]. Культуры засевали на чашки Петри со средой ГРМ (ФБУН ГНЦ ПМБ, Россия) с добавлением крахмала, куриного желтка и стерильного обезжиренного молока и инкубировали в течение от 3-х до 7 суток в зависимости от теста. После окончания срока инкубации на поверхность чашки с крахмалом наливали раствор Люголя, на чашки с обезжиренным молоком — 10% раствор соляной кислоты. Во всех случаях положительным результатом считали образование вокруг культуры микроорганизма прозрачной зоны, свидетельствующей о действии фермента.
Патогенетический потенциал. Патогенетический потенциал изучали с помощью стандартных дифференциально-диагностических сред и планшетных тест-систем, а также молекулярно-генетических методов (табл. 1).
Таблица 1. Спектр исследуемых ферментов
Table 1. Spectrum of the studied enzymes
Роль в инфекционном процессе Role in the infectious process | Класс Class | Фермент The enzyme |
Фактор защиты и персистенции Protection and persistence factor | Гидролаза, протеаза Hydrolase, protease | Плазмокоагулаза Plasmocoagulase |
Фактор инвазии и персистенции The factor of invasion and persistence | Гидролаза, протеаза Hydrolase, protease | Фосфолипаза, желатиназа, фибринолизин, гемолизин, нейраминидаза, гиалуронидаза, коллагеназа, эластаза Phospholipase, gelatinase, fibrinolysin, hemolysin, neuraminidase, hyaluronidase, collagenase, elastase |
Фактор персистенции The persistence factor | Гидролаза Hydrolase | Лизиндегидролаза, аргининдегидролаза Lysine dehydrolase, arginine dehydrolase |
С помощью дифференциально-диагностических сред поставлены тесты на желатиназную (ГРМ-бульон (ФБУН ГНЦ ПМБ, Россия) + 12% желатин (РЕАХИМ-ПЕНЗА, Россия)), гемолитическую Колумбийский агар (ФБУН ГНЦ ПМБ, Россия) + 5% дефибрированной бараньей крови (Азимут, Россия)), плазмакоагулазную и фибринолитическую (плазма кролика (Эколаб, Россия) + физиологический раствор (ОАО Дальхимфарм, Россия)) активности. Тесты проводили согласно стандартным методикам [1].
Детекцию генов, кодирующих ферменты, которые являются факторами вирулентности, проводили с помощью ПЦР-тестов. Определяли наличие генов коллагеназы, эластазы, нейраминидазы, гиалуронидазы, уреазы, гемолизина и фосфолипазы у исследуемых бактерий. Анализ ДНК на наличие искомых генов проводили с помощью готовой реакционной смеси 5X ScreenMix (ЗАО «Евроген», Россия), предназначенной для проведения ПЦР с последующим анализом на гель-электрофорезе. Праймеры составлены с помощью сайта BLAST (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) и синтезированы компанией ЗАО «Евроген» (ЗАО «Евроген», Россия). В качестве маркера молекулярного веса выступал O’RangeRuler 100 bp DNA Ladder (Thermo Fisher Scientific, США). Амплификацию осуществляли на ДНК-амплификаторе «BIO-RAD S1000» (Bio-Rad Laboratories, США) (табл. 2).
Таблица 2. Характеристика ПЦР-праймеров для выявления ряда генов, кодирующих ферменты, которые являются факторами патогенности
Table 2. Characterization of PCR primers to identify a number of genes encoding enzymes that are pathogenicity factors
Фермент The enzyme | Праймер The primer | Молекулярный вес Molecular weight |
Нейроминидаза Neuraminidase | F GAACATGTACCGCCTTCCCA | 945 |
R AGAGGCATTGAGTTCCACCG | ||
Гиалуронидаза Hyaluronidase | F AGCAATGAGCGTAAAACGCAA | 985 |
R TTCCGTGCCCTAACTCATGT | ||
Коллагеназа Collagenase | F ATCGAACTCATGTCTCCGGC | 954 |
R TGCCGATCCTGGAATATCGC | ||
Эластаза Elastase | F AGCAATGAGCGTAAAACGCAA | 985 |
R TTCCGTGCCCTAACTCATGT | ||
Уреаза Urease | F TTGGCGGTGGTAAAACCGTA | 976 |
R CTTCCCATCGCCTGAGAGTC | ||
Гемолизин Hemolysin | F AGCCGCCGAATTTTCAATCG | 927 |
R ATTCCCTCTGTACCCCCGAA | ||
Фосфолипаза Phospholipase | F AGATCCGGTAAGCGGAGAGA | 987 |
R GGCCCGAATACTTCCCAGTC |
Визуализацию продуктов ПЦР осуществляли с помощью прибора горизонтального электрофореза серии ЕС 12–13 (Biocom, Россия), детекцию продуктов ПЦР-амплификации осуществляли с использованием трансиллюминатора UVT-1 (Biocom, Россия) в ультрафиолетовом диапазоне.
Статистическую обработку результатов проводили с помощью программного обеспечения Microsoft Excel 2003 (for Windows XP). Статистические результаты считались достоверными при p ≤ 0,05.
Результаты
Биологические свойства
Все изученные представители семейства Weeksellaceae являлись грамотрицательными, аэробными, неподвижными, неспорообразующими бактериями, часто имеющими вид тонких, слегка изогнутых палочек.
Согласно данным литературы, исследуемые бактерии демонстрируют неприхотливость к питательным средам и успешно растут не только на кровяном и Колумбийском агаре, но и на мясо-пептонном агаре (МПА) и средах ГРМ [10]. Однако в ходе исследования в результате многочисленных пересевов на стандартных средах (ГРМ, МПА) рост бактерий отсутствовал, поэтому для дальнейшей работы бактерии культивировали на средах с витаминными добавками и Колумбийском агаре с добавлением крови.
На плотных средах исследуемые бактерии образовывали круглые колонии с желтым или белым пигментом и глянцевой поверхностью (рис.). Отличительной особенностью являлся интенсивный фруктовый запах, продуцируемый микроорганизмами в процессе роста.
Рисунок. Стадии роста бактерий C. indologenes семейства Weeksellaceae, где изображения А) и Б) соответствуют культивированию на 1 и на 5 сутки
Figure. The growth stages of C. indologenes bacteria of the Weeksellaceae family, where the photos A) and B) correspond to cultivation on days 1 and 5
Примечание. На плотных средах исследуемые бактерии образовывали круглые колонии с желтым или белым пигментом и глянцевой поверхностью. Отличительной особенностью являлся интенсивный фруктовый запах, продуцируемый микроорганизмами в процессе роста.
Note. On solid media, the studied bacteria formed round colonies with a yellow or white pigment and a glossy surface. A distinctive feature was the intense fruity smell produced by the microorganisms during the growth process.
Анализ биохимической активности представителей семейства Weeksellaceae показал ее значительное разнообразие, при этом у всех изученных бактерий выявлена протеолитическая активность.
Все исследуемые штаммы бактерий рода Chryseobacterium оказались способны к индолообразованию, продуцировали фермент фосфатазу и не были способны к редукции нитратов и нитритов (табл. 3). Гидролиз эскулина вызывали 70% изучаемых штаммов. Оценка сахаролитической активности показала, что все штаммы бактерий рода Chryseobacterium расщепляли фруктозу, глюкозу, лецитин и триптофан, у 55% штаммов обнаружена способность к расщеплению β-глюкозы. Как известно, β-глюкоза представляет собой аномер глюкозы, который может быть использована только некоторыми бактериями в качестве источника углерода и энергии, а также для синтеза клеточных стенок и других структур клетки [16]. Среди изучаемых штаммов рода Chryseobacterium 55% используют галактозу и β-галактозу в качестве источника энергии (табл. 3).
Таблица 3. Биохимическая активность бактерий рода Chryseobacterium
Table 3. Biochemical activity of bacteria of the genus Chryseobacterium
Субстрат The substrate | Виды/Species | |||||
C. arthrosphaerae | C. gleum | C. indologenes | C. ureilyticum | C. tructae | C. oncorhynchi | |
Количество штаммов с положительным результатом (абс./%) The number of strains with a positive result (abs./%) | ||||||
Фруктоза Fructose | 8/100,0 | 2/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 |
Глюкоза Glucose | 8/100,0 | 1/50,0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 |
Галактоза Galactose | 3/37,5 | 0 | 3/75,0 | 1/100,0 | 3/75,0 | 1/100,0 |
Ксилоза Xylose | 5/62,5 | 2/100,0 | 3/75,0 | 1/100,0 | 3/75,0 | 1/100,0 |
N-ацетил-β-D-глюкозаминидаза N-acetyl-β-D-glucosaminidase | 6/75,0 | 1/50,0 | 3/75,0 | 1/100,0 | 4/100,0 | 0 |
β-глюкоза β-glucose | 6/75,0 | 2/100,0 | 1/25,1 | 1/100,0 | 1/25,0 | 0 |
β-галактоза β-galactose | 3/37,5 | 1/50,0 | 1/25,1 | 0 | 0 | 0 |
Целлобиоза Cellobiosis | 0 | 0 | 0 | 0 | 1/25,0 | 0 |
Трегалоза Trehalose | 3/37,5 | 1/50,0 | 3/75,0 | 1/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 |
Мальтоза Maltose | 1/12,5 | 0 | 1/25,1 | 0 | 0 | 0 |
Лактоза Lactose | 2/25,0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1/100,0 |
Сахароза Sucrose | 2/25,0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
Лецитин Lecithin | 8/100,0 | 2/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 |
γ-глутамилтранспептидаза γ-glutamyltranspeptidase | 4/50,0 | 2/100,0 | 1/25,1 | 0 | 0 | 0 |
Глюкозид Glucoside | 7/87,5 | 2/100,0 | 2/50,0 | 0 | 0 | 0 |
Триптофан Tryptophan | 8/100,0 | 2/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 |
Маннит Mannitol | 1/12,5 | 1/50,0 | 1/25,1 | 0 | 2/50,0 | 0 |
Инозитол Inositol | 4/50,0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1/100,0 |
Цитрат Citrate | 2/25,0 | 0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 3/75,0 | 1/100,0 |
Нитриты Nitrites | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
Нитраты Nitrates | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
Также, как и бактерии рода Chryseobacterium spp., все исследуемые штаммы бактерий родов Elizabethkingia spp. и Empedobacter spp. расщепляли пептон с образованием индола, не редуцировали нитраты и нитриты, фермент фосфатаза присутствовал у 90% исследуемых штаммов, а к гидролизу эскулина оказались способны 50% штаммов (табл. 4). Большинство штаммов Elizabethkingia spp. и Empedobacter spp. в качестве источника энергии использовали глюкозу, β-глюкозу, галактозу и β-галактозу. Самая низкая ферментативная активность выявлена у E. brevis, поскольку данный штамм способен утилизировать ограниченное количество субстратов. Высокой ферментативной активностью характеризовались штаммы E. meningoseptica, которые обладали выраженной сахаролитической активностью, но из всех углеродсодержащих субстратов не расщепляли галактозу и инозитол.
Таблица 4. Ферментативная активность штаммов бактерий родов Elizabethkingia и Empedobacter
Table 4. Biochemical activity of bacteria of the genus Elizabethkingia and Empedobacter
Субстрат The substrate | Виды/Species | |||
E. meningoseptica | E. anophelis | E. falsenii | E. brevis | |
Количество штаммов с положительным результатом (абс./%) The number of strains with a positive result (abs./%) | ||||
Фруктоза Fructose | 3/100,0 | 1/33,3 | 5/100,0 | 1/100,0 |
Глюкоза Glucose | 3/100,0 | 1/33,3 | 5/100,0 | 1/100,0 |
Галактоза Galactose | 0 | 1/33,3 | 4/80,0 | 1/100,0 |
Ксилоза Xylose | 2/66,6 | 3/100,0 | 5/100,0 | 1/100,0 |
N-ацетил-β-D-глюкозаминидаза N-acetyl-β-D-glucosaminidase | 2/66,6 | 1/33,3 | 0 | 0 |
β-глюкоза β-glucose | 3/100,0 | 3/100,0 | 2/40,0 | 0 |
β-галактоза β-galactose | 1/33,3 | 1/33,3 | 2/40,0 | 0 |
Целлобиоза Cellobiosis | 1/33,3 | 1/33,3 | 2/40,0 | 0 |
Трегалоза Trehalose | 1/33,3 | 1/33,3 | 3/60,0 | 0 |
Мальтоза Maltose | 1/33,3 | 0 | 3/60,0 | 0 |
Лактоза Lactose | 1/33,3 | 0 | 1/20,0 | 0 |
Сахароза Sucrose | 1/33,3 | 0 | 0 | 0 |
Лецитин Lecithin | 3/100,0 | 1/33,3 | 5/100,0 | 1/100,0 |
γ-глутамилтранспептидаза γ-glutamyltranspeptidase | 2/66,6 | 3/100,0 | 2/40,0 | 0 |
Глюкозид Glucoside | 3/100,0 | 3/100,0 | 0 | 0 |
Триптофан Tryptophan | 3/100,0 | 3/100,0 | 5/100,0 | 1/100,0 |
Маннит Mannitol | 2/66,6 | 0 | 2/40,0 | 0 |
Инозитол Inositol | 0 | 0 | 2/40,0 | 0 |
Цитрат Citrate | 3/100,0 | 3/100,0 | 1/20,0 | 1/100,0 |
Нитриты Nitrites | 0 | 0 | 0 | 0 |
Нитраты Nitrates | 0 | 0 | 0 | 0 |
Патогенетический потенциал
Все исследованные штаммы бактерий рода Chryseobacterium оказались способны к протеолизу желатина и продукции плазмокоагулазы (табл. 5). Большинство видов характеризовались лецитиназной активностью, однако данный фермент обнаружен только у 62,5% штаммов C. arthrosphaerae, а у C. oncorhynchi — отсутствовал.
Таблица 5. Ферментативная активность штаммов бактерий рода Chryseobacterium spp.
Table 5. Enzymatic activity of bacteria Chryseobacterium spp.
Фермент The enzyme | Виды/Species | |||||
C. arthrosphaerae | C. gleum | C. indologenes | C. ureilyticum | C. tructae | C. oncorhynchi | |
Количество штаммов с положительным результатом (абс./%) The number of strains with a positive result (abs./%) | ||||||
Желатиназа Gelatinase | 8/100,0 | 2/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 |
Плазмокоагулаза Plasmocoagulase | 8/100,0 | 2/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 |
Фибринолизин Fibrinolysin | 6/75,0 | 1/50,0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
Лецитиназа Lecithinase | 5/62,5 | 2/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 4/100,0 | 0 |
Гемолизин Hemolysin | 1/12,5 | 0 | 2/50.0 | 0 | 0 | 0 |
Лизиндегидролаза Lysine Dehydrolase | 2/25,0 | 2/100,0 | 1/25,0 | 0 | 0 | 0 |
Аргининдегидролаза Arginine Dehydrolase | 4/50,0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
Пептидаза Peptidase | 4/50,0 | 2/100,0 | 2/50,0 | 1/100,0 | 3/75,0 | 1/100,0 |
Среди исследуемых бактерий фибринолитической активностью обладали 75% штаммов C. arthrosphaerae и 50% штаммов C. gleum, а 12,5% штаммов C. arthrosphaerae и 50% штаммов C. indologenes обладали способностью к гемолизу. Лизиндегидролаза обнаружена у всех штаммов C. gleum и у 25% штаммов C. arthrosphaerae и C. indologenes, а аргининдегидролаза — только у 50% штаммов C. arthrosphaerae. От 50 до 100% штаммов бактерий рода Chryseobacterium spp. продуцировали пептидазу.
Все исследованные штаммы бактерий родов Elizabethkingia и Empedobacter разжижали желатин, не продуцировали фибринолизин, лецитиназная активность установлена для всех штаммов E. meningoseptica и E. anopheles и для 60% штаммов E. falsenii (табл. 6). К продукции плазмокоагулазы способен E. brevis, 33,3% штаммов E. anopheles и 20% E. falsenii. У всех штаммов родов Elizabethkingia и Empedobacter фермент фибринолизин не был активен. Способностью к гемолизу обладали 60% штаммов E. falsenii и 33,3% штаммов E. meningoseptica, лизиндегидролаза обнаружена у всех штаммов E. meningoseptica и у 40% штаммов E. falsenii, аргининдегидролаза — у 33,3% штаммовE. meningoseptica и у 20% штаммов E. falsenii, пептидаза — у всех штаммов E. brevis и E. anopheles, у 33,3% штаммов E. meningoseptica, у 60% штаммов E. anopheles.
Таблица 6. Ферментативная активность штаммов бактерий родов Elizabethkingia spp. и Empedobacter spp.
Table 6. Enzymatic activity of bacteria Elizabethkingia spp. and Empedobacter spp.
Фермент The enzyme | Виды/Species | |||
E. meningoseptica | E. anophelis | E. falsenii | E. brevis | |
Количество штаммов с положительным результатом (абс./%) The number of strains with a positive result (abs./%) | ||||
Желатиназа/Gelatinase | 3/100,0 | 3/100,0 | 5/100,0 | 1/100,0 |
Плазмокоагулаза/Plasmocoagulase | 0 | 1/33,3 | 1/20,0 | 1/100,0 |
Фибринолизин/Fibrinolysin | 0 | 0 | 0 | 0 |
Лецитиназа/Lecithinase | 3/100,0 | 3/100,0 | 3/60,0 | 0 |
Гемолизин/Hemolysin | 1/33,3 | 0 | 3/60,0 | 0 |
Лизиндегидролаза/Lysine Dehydrolase | 3/100,0 | 0 | 2/40,0 | 0 |
Аргининдегидролаза/Arginine Dehydrolase | 1/33,3 | 0 | 1/20,0 | 0 |
Пептидаза/Peptidase | 1/33,3 | 3/100,0 | 3/60,0 | 1/100,0 |
Анализ полученных результатов показал, что представители семейства Weeksellaceae характеризуются широким набором ферментативных систем, наиболее выраженных для C. arthrosphaerae и E. meningoseptica, благодаря которым реализуется их патогенетический потенциал.
По результатам ПЦР показано, что все изученные штаммы бактерий рода Chryseobacterium имели ген, кодирующий синтез фермента коллагеназы (табл. 7). В геноме 37,5–87,5% штаммов бактерий C. arthrosphaerae обнаружены гены ферментов нейраминидазы, гиалуронидазы, эластазы, уреазы, гемолизина и фосфолипазы, у всех штаммов C. gleum — гены, детерминирующие синтез эластазы, уреазы, гемолизина и фосфолипазы, а у 50% штаммов бактерий C. arthrosphaerae и C. gleum — нейраминидазы и гиалуронидазы. Генетические детерминанты нейраминидазы и эластазы выявлены у всех штаммов C. indologenes, у 75% штаммов — гиалуронидазы и 50% этих штаммов — уреазы, гемолизина и фосфолипазы. У штамма C. ureilyticum не обнаружены гены, детерминирующие синтез уреазы и гемолизина. В геноме штамма C. oncorhynchi обнаружен ген нейраминидазы, у 75% штаммов C. tructae — гены нейраминидазы, эластазы, уреазы, гемолизина, а 50% этих штаммов — гиалуронидазы и фосфолипазы.
Таблица 7. Детекция генов, ответственных за продукцию ферментов — факторов вирулентности бактерий рода Chryseobacterium
Table 7. Detection of genes responsible for the production of enzymes — virulence factors of bacteria of the genus Chryseobacterium
Ген/Кодируемый фермент Gene/Encoded enzyme | Виды/Species | |||||
C. arthrosphaerae | C. gleum | C. indologenes | C. ureilyticum | C. tructae | C. oncorhynchi | |
Количество штаммов с положительным результатом (абс./%) The number of strains with a positive result (abs./%) | ||||||
f2z28_rs08635/Нейраминидаза Neuraminidase | 6/75,0 | 1/50,0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 3/75,0 | 1/100,0 |
bstab16_rs23140/Гиалуронидаза Hyaluronidase | 3/37,5 | 1/50,0 | 3/75,0 | 1/100,0 | 2/50,0 | 0 |
e5165_rs04885/Коллагеназа Collagenase | 8/100,0 | 2/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 |
lasB/Эластаза Elastase | 4/50,0 | 2/100,0 | 4/100,0 | 1/100,0 | 3/75,0 | 0 |
ureC/Уреаза Urease | 5/62,5 | 2/100,0 | 2/50,0 | 0 | 3/75,0 | 0 |
bbd35-rs01550/Гемолизин Hemolysin | 7/87,5 | 2/100,0 | 2/50,0 | 0 | 3/75,0 | 0 |
bbd35_rs12855/Фосфолипаза Phospholipase | 6/75,0 | 2/100,0 | 2/50,0 | 1/100,0 | 2/50,0 | 0 |
В составе генома всех штаммов бактерий Elizabethkingia spp. и Empedobacter spp. также присутствовал ген, кодирующий синтез фермента коллагеназы (табл. 8). У 66,6% штаммов E. meningoseptica обнаружены гены, детерминирующие синтез эластазы и фосфолипазы, у 33,3% штаммов — нейраминидазы, гиалуронидазы, уреазы и гемолизина. Генетические детерминанты синтеза гиалуронидазы, эластазы, уреазы, гемолизина и фосфолипазы обнаружены у 66,6% штаммов E. anopheles, нейраминидазы — у 33,3% этих штаммов. У всех штаммов E. falsenii обнаружены гены гиалуронидазы и гемолизина, у 80% этих штаммов — ген нейраминидазы, у 60% штаммов — ген эластазы и у 20% — ген фосфолипазы; у штамма E. brevis обнаружены гены нераминидазы и уреазы.
Таблица 8. Детекция генов, ответственных за продукцию ферментов — факторов вирулентности бактерий рода Elizabethkingia и Empedobacter
Table 8. Detection of genes responsible for the production of enzymes — virulence factors of bacteria of the genus Elizabethkingia and Empedobacter
Ген/Кодируемый фермент Gene/Encoded enzyme | Виды/Species | |||
E. meningoseptica | E. anophelis | E. falsenii | E. brevis | |
Количество штаммов с положительным результатом (абс./%) The number of strains with a positive result (abs./%) | ||||
f2z28_rs08635/Нейраминидаза Neuraminidase | 1/33,3 | 1/33,3 | 4/80,0 | 1/100,0 |
bstab16_rs23140/Гиалуронидаза Hyaluronidase | 1/33,3 | 2/66,6 | 5/100,0 | 0 |
e5165_rs04885/Коллагеназа Collagenase | 3/100,0 | 3/100,0 | 5/100,0 | 1/100,0 |
lasB/Эластаза Elastase | 2/66,6 | 2/66,6 | 3/60,0 | 0 |
ureC/Уреаза Urease | 1/33,3 | 2/66,6 | 2/40,0 | 1/100,0 |
bbd35-rs01550/Гемолизин Hemolysin | 1/33,3 | 2/66,6 | 5/100,0 | 0 |
bbd35_rs12855/Фосфолипаза Phospholipase | 2/66,6 | 2/66,6 | 1/20,0 | 0 |
Обсуждение
В настоящее время в инфекционной патологии человека возрастает роль некогда сапрофитных бактерий. Особую настороженность в этом отношении вызывают представители семейства Weeksellaceae. Несмотря на то, что первое упоминание о них относится к 1923 г. [11], данные об их клинической роли в патогенезе инфекционных заболеваний появились в последние два десятилетия. Чаще всего они являются причиной возникновения бактериемий, менингитов, заболеваний респираторного тракта и мочевыводящих путей, а наиболее уязвимыми для них становятся пациенты с ослабленным иммунитетом, хроническими заболеваниями, а также находящиеся на длительном госпитальном лечении [3, 4, 21]. Согласно данным литературы большинство представителей семейства Weeksellaceae характеризуется природной устойчивостью к широкому спектру противомикробных препаратов и обладают значительным набором разнообразных факторов вирулентности, в том числе отвечающих за инвазию и персистенцию бактерий, что позволяет им успешно участвовать в развитии инфекционного процесса [18, 22]. Это и определяет актуальность изучения данной группы бактерий.
Проведенные нами исследования показали, что морфологические свойства и биохимическая активность бактерий родов Chryseobacterium, Elizabethkingia и Empedobacter согласуются с данными, представленными в работах отечественных и зарубежных авторов [8, 22].
По данным ряда авторов, важнейшими факторами вирулентности представителей семейства Weeksellaceae являются протеазы и способность к образованию биопленки [22]. Однако до настоящего времени спектр факторов, детерминирующий их патогенетический потенциал, остается малоизученным. Фенотипические методы исследования ферментативной активности показали, что все исследуемые штаммы бактерий семейства Weeksellaceae характеризуются желатиназной активностью, а представители рода Chryseobacterium spp. — еще и способностью к синтезу плазмокоагулазы. Способность к продукции других ферментов агрессии менее выражена и носила штаммовую специфичность. Анализ генетического профиля факторов вирулентности исследуемых бактерий показал, что в составе генома исследуемых штаммов чаще всего обнаруживали гены, кодирующие ферменты лецитиназу, гиалуронидазу, эластазу и гемолизин, а у бактерий рода Chryseobacterium spp. и Empedobacter spp. — нейроаминидазу, которые способствуют преодолению тканевых барьеров, инвазии и распространению возбудителя по макроорганизму. Полученные результаты согласуются с опубликованными ранее данными, в которых приведена характеристика генетических детерминант условно-патогенных представителей семейства Weeksellaceae, в частности, описание 44 генов, кодирующих разные факторы патогенности бактерий рода Elizabethkingia и консервативные факторы вирулентности микроорганизмов рода Chryseobacterium spp. [4, 8, 22]
Таким образом, анализ современной литературы и полученные результаты указывают на особую клиническую роль бактерий семейства Weeksellaceae, что определяет значимость глубокого изучения биологических свойств и факторов вирулентности представителей родов Chryseobacterium spp., Elizabethkingia spp. и Empedobacter spp.
Благодарности
Авторы выражают сердечную признательность коллективам кафедр микробиологии и физиологии растений и биохимии и биофизики Саратовского национального исследовательского государственного университета имени Н.Г. Чернышевского и сотрудникам микробиологического отдела КДЛ клиник ФГБОУ СамГМУ Минздрава России за помощь в проведении научного исследования и ценным рекомендациям.
About the authors
Ksenia V. Zubova
Saratov State University
Email: zubovaksushechka@mail.ru
Assistant Professor, Department of Microbiology and Plant Physiology
Россия, SaratovVictoria A. Kuznetsova
National Medical Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology named after Academician V.I.Kulakov
Email: kuznecovaviktoria803@yandex.ru
Specialist of the Laboratory for the Collection and Storage of Biomaterials
Россия, MoscowMatvey V. Kanevsky
Saratov State University
Email: matvejkanev@mail.ru
PhD (Biology), Associate Professor of the Department of Biochemistry and Biophysics, Head of the Educational and Scientific Laboratory of Molecular Biology
Россия, SaratovOlga V. Kondratenko
Samara State Medical University of Ministry of Healthсare of Russian Federation
Email: helga1983@yandex.ru
DSc (Medicine), Associate Professor, Acting Head of the Department of Medical Microbiology and Immunology
Россия, SamaraElena V. Glinskaya
Saratov State University
Email: elenavg-2007@yandex.ru
PhD (Biology), Associate Professor, Department of Microbiology and Plant Physiology, Biological Faculty
Россия, SaratovOlga V. Nechaeva
National Medical Research Center for Obstetrics, Gynecology and Perinatology named after Academician V.I.Kulakov; Russian Medical Academy of Continuous Professional Education
Email: olgav.nechaeva@rambler.ru
DSc (Biology), Associate Professor, Leading Researcher, Laboratory of Molecular Microbiology, Department of Molecular Microbiology and Bioinformatics, Institute of Microbiology, Antimicrobial Therapy and Epidemiology, Professor of the Department of Medical Microbiology named after Academician Z.V. Ermolyeva
Россия, Moscow; MoscowAnna G. Afinogenova
St. Petersburg Pasteur Institute
Author for correspondence.
Email: spbtestcenter@mail.ru
DSc (Biology), Leading Researcher, Head of Laboratory Testing Centre
Россия, St. PetersburgReferences
- Боронина Л.Г., Кукушкина М.П., Крутова К.В., Блинова С.М. Род Chryseobacterium (Flavobacterium): клиническое значение, идентификация, чувствительность к антибиотикам // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2003. Т. 5, № 3. С. 243–250. [Boronina L.G., Kukushkina M.P., Krutova K.V., Blinova S.M. Chryseobacterium (Flavobacterium): Clinical Significance, Identification, Antimicrobial Susceptibility. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2003, vol. 5, no. 3, pp. 243–250. (In Russ.)]
- Канашенко М.Е., Карцев Н.Н., Мицевич И.П., Храмов М.В., Светоч Е.А. Elizabethkingia meningoseptica как значимый клинический патоген // Бактериология. 2019. Т. 4, № 1. С. 58–63. [Kanashenko M.E., Kartsev N.N., Mitsevich I.P., Khramov М.V., Svetoch E.A. Elizabethkingia meningoseptica as a significant clinical pathogene. Bakteriologiya = Bacteriology, 2019, vol. 4, no. 1, pp. 58–63. (In Russ.)] doi: 10.20953/2500-1027-2019-1-58-63
- Кондратенко О.В., Зубова К.В., Бочкарева П.В., Исматуллин Д.Д. Распространенность представителей порядка Flavobacteriales у пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации // Проблемы медицинской микологии. 2023. № 1. С. 55–59. [Kondratenko O.V., Zubova K.V., Bochkareva P.V., Ismatullin D.D. Prevalence of representatives of the order Flavobacterales in patients with cysistic fibriosis in the Russian Federation. Problemy meditsinskoi mikologii = Problems of Medical Mycology, 2023, vol. 25, no. 1, pp. 55–59. (In Russ.)] doi: 10.24412/1999-6780-2023-1-55-59
- Лабинская А.С., Блинкова Л.П., Ещина А.С. Общая и санитарная микробиология с техникой микробиологических исследований: Учебное пособие. М.: Медицина, 2004. 576 с. [Labinskaya A.S., Blinkova L.P, Yeshina A.S. General and Sanitary Microbiology with Microbiological Research Techniques: A Textbook. Moscow: Meditsina, 2004. 576 p. (In Russ.)]
- Петерсон А.М., Чиров П.А. Практические рекомендации для идентификации сапрофитных и условно-патогенных бактерий по фенотипическим признакам. Саратов: Изд-во Саратовского университета, 2005. 23 с. [Peterson A.M., Chirov P.A. Practical recommendations for the identification of saprophytic and opportunistic bacteria by phenotypic characteristics. Saratov: Izdatel’stvo Saratovskogo universiteta, 2005. 23 p. (In Russ.)]
- Abdalhamid B., Elhadi N., Alsamman K., Aljindan R. Chryseobacterium gleum pneumonia in an infant with nephritic syndrome. ID Case, 2016, vol. 5, pp. 34–36. doi: 10.1016/j.idcr.2016.06.004
- Ahsan M.J., Ahmad S., Latif A., Reddy J.T. Chryseobacterium spp-associated bacteraemia in a haemodialysis patient: a diagnostic challenge. BMJ Case Rep., 2019, vol. 12: e232000. doi: 10.1136/bcr-2019-232000
- Alon D., Karniel E., Zohar I., Stein G.Y. Chryseobacterium indologenes bacteremia: clinical and microbiological characteristics of an emerging infection. Int. J. Clin. Med., 2018, vol. 9, pp. 520–527. doi: 10.4236/ijcm.2018.96045
- Andriyanov P.A., Zhurilov P.A., Kashina D.D., Tutrina A.I., Liskova E.A., Razheva I.V., Kolbasov D.V., Ermolaeva S.V. Antimicrobial resistance and comparative genomic analysis of Elizabethkingia anophelis subsp. Endophytica isolated from raw milk. Antibiot. (Basel), 2022, vol. 11, no. 5: 648. doi: 10.3390/antibiotics11050648
- Bernardet J.F. Order I. Flavobacteriales ord. nov. Bergey’s Manual Syst. Bacteriol., 2010, vol. 2, no. 4, pp. 105–106. doi: 10.1002/9781118960608.obm00033
- Bernardet J.F., Nakagawa Y. An introduction to the family Flavobacteriaceae. New York: Springer, 2006, pp. 455–480. doi: 10.1007/0-387-30747-8_16
- Chiang M.H., Chang F.J., Kesavan D.K., Vasudevan A., Xu H., Lan K.L., Huang S.W., Shang H.S., Chuang Y.P., Yang Y.S., Chen T.L. Proteomic network of antibiotic-induced outer membrane vesicles released by extensively drug-resistant Elizabethkingia anopheles. Microbiol. Spectr., 2022: e0026222. doi: 10.1128/spectrum.00262-22
- Choi M.H., Kim M., Jeong S.J., Choi J.Y., Lee I.Y., Yong T.S., Yong D., Jeong S.H., Lee K. Risk factors for Elizabethkingia acquisition and clinical characteristics of patients, South Korea. Emerg. Infect. Dis., 2019, vol. 25, no. 1, pp. 42–51. doi: 10.3201/eid2501.171985
- Corbella M., Brandolini M., Cambieri P., Decambrino N., Pagani M., Bottazzi A., Muzzi A., Zecca M., Mariani B., Marone P. A catheter-related bloodstream infection caused by Chryseobacterium indologenes successfully treated with antibiotic-lock rescue therapy. New Microbiol., 2017, vol. 40, pp. 223–225.
- Damas M.S.F., Ferreira R.L., Campanini E.B., Soares G.G., Campos L.C., Laprega P.M., Soares da Costa A., Freire C.C.M., Pitondo-Silva A., Cerdeira L.T., da Cunha A.F., da Silva Pranchevicius M.C. Whole genome sequencing of the multidrug-resistant Chryseobacterium indologenes isolated from a patient in Brazil. Front. Med., 2022, vol. 9: 931379. doi: 10.3389/fmed.2022.931379
- Izaguirre-Anariba D.E., Sivapalan V. Chryseobacterium indologenes, an emerging bacteria: a case report and review of literature. Cureus, 2020, vol. 12, no. 1: e6720. doi: 10.7759/cureus.6720
- Lim H.G., Seo S.W., Jung G.Y. Engineered Escherichia coli for simultaneous utilization of galactose and glucose. Bioresour. Technol., 2013, vol. 135, pp. 564–567. doi: 10.1016/j.biortech.2012.10.124
- Maaroufi R., Dziri O., Hadjadj L., Diene S.M., Rolain J.M., Chouchani C. Detection by whole-genome sequencing of a novel metallo-β-lactamase produced by Wautersiella falsenii causing urinary tract infection in Tunisia. Pol. J. Microbiol., 2022, vol. 71, no. 1, pp. 73–81. doi: 10.33073/pjm-2022-010
- Martinez V., Matabang M.A., Miller D., Aggarwal R., LaFortune A. First case report on Empedobacter falsenii bacteremia. IDCases, 2023, vol. 33: e01814. doi: 10.1016/j.idcr.2023.e01814
- McBride M.J. The Family Flavobacteriaceae. The Prokaryotes, 2014, pp. 643–667. doi: 10.1007/978-3-642-38954-2_130
- Mirza H.C., Tuncer Ö., Ölmez S., Şener B., Tuğcu G.D., Özçelik U., Gürsoy N.C., Otlu B., Büyükçam A., Kara A., Sancak B. Clinical strains of Chryseobacterium and Elizabethkingia spp. isolated from pediatric patients in a university hospital: Performance of MALDI-TOF MS-based identification, antimicrobial susceptibilities, and baseline patient characteristics. Microb. Drug Resist., 2018, vol. 24, no. 6, pp. 816–821. doi: 10.1089/mdr.2017.0206
- Mwanza E.P., Hugo A., Charimba G., Hugo C.J. Pathogenic potential and control of Chryseobacterium species from clinical, fish, food and environmental sources. Microorganisms, 2022, vol. 25, no. 5: 895. doi: 10.3390/microorganisms10050895
- Olowo-Okere A., Ibrahim Y.K.E., Olayinka B.O., Mohammed Y., Nabti L.Z., Lupande-Mwenebitu D., Rolain J.M., Diene S.M. Genomic features of an isolate of Empedobacter falsenii harbouring a novel variant of metallo-β-lactamase, blaEBR-4 gene. Infect. Genet. Evol., 2022, vol. 98: 105234. doi: 10.1016/j.meegid.2022.105234
- Pickett M.J. Methods for identification of Flavobacteria. J. Clin. Microbiol., 1989, vol. 27, pp. 2309–2315. doi: 10.1128/jcm.27.10.2309-2315.1989
- Reed T.A.N., Watson G., Kheng C., Tan P., Roberts T., Ling C.L., Miliya T., Turner P. Elizabethkingia anophelis infection in infants, Cambodia, 2012–2018. Emerg. Infect. Dis., 2020, vol. 26, no. 2, pp. 320–322. doi: 10.3201/eid2602.190345
- Snesrud E., McGann P., Walsh E. Clinical and genomic features of the first cases of Elizabethkingia anophelis infection in New York, including the first case in a healthy infant without previous nosocomial exposure. J. Pediatr. Infect. Dis. Soc., 2019, vol. 8, no. 3, pp. 269–271. doi: 10.1093/jpids/piy071
- Sud A., Chaudhary M., Baveja C.P., Pandey P.N. Rare case of meningitis due to an emerging pathogen Chryseobacterium indologenes. SAGE Open Med. Case Rep., 2020, vol. 8, pp. 1–4. doi: 10.1177/2050313X20936098
- Swami M., Mude P., Kar S., Sarathi S., Mohapatra A., Devi U., Mohanty P.K., Som T.K., Bijayini B., Sahoo T. Elizabethkingia meningoseptica Outbreak in NICU: An Observational Study on a Debilitating Neuroinfection in Neonates. Pediatr. Infect. Dis. J., 2024, vol. 43, no. 1, pp. 63–68. doi: 10.1097/INF.0000000000004117
- Tang H.J., Lin Y.T., Chen C.C., Chen C.W., Lu Y.C., Ko W.C., Chen H.J., Su B.A., Chang P.C., Chuang Y.C., Lai C.C. Molecular characteristics and in vitro effects of antimicrobial combinations on planktonic and biofilm forms of Elizabethkingia anophelis. J. Antimicrob. Chemother., 2021, vol. 76, no. 5, pp. 1205–1214. doi: 10.1093/jac/dkab018
- Wu C., Xiong L., Liao Q., Zhang W., Xiao Y., Xie Y. Clinical manifestations, antimicrobial resistance and genomic feature analysis of multidrug-resistant Elizabethkingia strains. Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob., 2024, vol. 23, no. 32, pp. 23–32. doi: 10.1186/s12941-024-00691-6
- Zeng Y., Dong N., Zhang R., Liu C., Sun Q., Lu J., Shu L., Cheng Q., Chan E.W., Chen S. Emergence of an Empedobacter falsenii strain harbouring a tet(X)-variant-bearing novel plasmid conferring resistance to tigecycline. J. Antimicrob. Chemother., 2020, vol. 75, no. 3, pp. 531–536. doi: 10.1093/jac/dkz489
- Zhang Y., Li D., Yang Y., Su J., Xu X., Wang M., Chen Y., Li Y. Clinical and molecular characteristics of Chryseobacterium indologenes isolates at a teaching hospital in Shanghai, China. Ann. Transl. Med., 2021, vol. 9: 668. doi: 10.21037/atm-21-933
Supplementary files





