РЕТРОСПЕКТИВНЫЙ АНАЛИЗ СЛОВЕНСКИХ ИЗОЛЯТОВ MYCOBACTERIUM AVIUM COMPLEX И MYCOBACTERIUM ABSCESSUS COMPLEX И МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ПРОФИЛЬ УСТОЙЧИВОСТИ

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Резюме. Микобактерии, принадлежащие к Mycobacterium avium complex (MAC) и Mycobacterium abscessus complex (MABSC), являются наиболее частыми причинами микобактериоза в мире. В последние несколько лет таксономия MAC и MABSC быстро менялась в результате появления новых молекулярно-генетических методов, позволяющих выявлять различия в пределах вида. Это позволило идентифицировать вид M. chimaera, который ранее относили к M. intracellulare, а также дифференцировать подвиды MABSC. Нетуберкулезные микобактерии являются типичными обитателями окружающей среды и в значительной мере подвержены воздействию различных концентраций противомикробных препаратов и других химических веществ, что привело к развитию различных механизмов природной резистентности. Макролиды и аминогликозиды наиболее часто используются для лечения инфекций, вызванных МАС и MABSC. Целью общенационального исследования являлась оценка распространенности подвидов MABSC в Словении, а также выявление случаев ошибочной идентификации изолятов M. chimaera как M. intracellulare ранее. Вместе с тем целью работы было выявить, какой из двух видов M. intracellulare или M. chimaera являлся клинически значимым на территории Словении, а также обнаружение мутаций в генах erm(41), rrl и rrs, которые, как известно, ассоциированы с развитием устойчивости к макролидам (erm(41) и rrl) и аминогликозиду (rrs). Нами были проанализированы 132 изолята MAC и MABSC, полученных из Национальной коллекции микобактерий Словении. GenoType NTM-DR использовался для дифференциации видов M. intracellulare и M. chimaera, а также подвидов MABSC. Результаты исследования показали, что 48% изолятов, ранее идентифицированных как M. intracellulare, относились к виду M. chimaera; наиболее распространенным подвидом MABSC являлся M. abscessus subsp. abscessus. Большинство изолятов MABSC обладали генами устойчивости к макролидам (erm (41) и rrl), однако ни один из изолятов MAC и MABSC не выявлено мутаций устойчивости к аминогликозиду в гене rrs.

Об авторах

С. Труден

Университетская клиника респираторных и аллергических заболеваний Голник, г. Голник

Автор, ответственный за переписку.
Email: sara.truden@klinika-golnik.si

магистр, аналитик Национальной микобактериологической референс-лаборатории

Голник 36, 4204 Голник, Словения, Национальная референслаборатория
Тел.: +386 4 2569 409. Факс: +386 4 2569 117

Словения

М. Жолнир-Довч

Университетская клиника респираторных и аллергических заболеваний Голник, г. Голник

Email: fake@neicon.ru
к.б.н., зав. Национальной микобактериологической референс-лабораторией Словения

Э. Содья

Университетская клиника респираторных и аллергических заболеваний Голник, г. Голник

Email: fake@neicon.ru
к.б.н., научный сотрудник Национальной микобактериологической референс-лаборатории Словения

М. Старчич Эрьявец

Люблянский университет, Любляна

Email: fake@neicon.ru
к.б.н., профессор молекулярной биологии, ассистент отдела биологии биотехнического факультета Словения

Список литературы

  1. Falkinham J.O. Surrounded by mycobacteria: nontuberculous mycobacteria in the human environment. J. App. Microbiol., 2009, vol. 107, no. 2, pp. 356–367. doi: 10.1111/j.1365-2672.2009.04161.x
  2. Kehrmann J., Kurt N., Rueger K., Bange F.C., Buer J. GenoType NTM-DR for identifying Mycobacterium abscessus subspecies and determining molecular resistance. J. Clin. Microbiol., 2016, vol. 54, no. 6, pp. 1653–1655. doi: 10.1128/JCM.00147-16
  3. Kim H.Y., Kook Y., Yun Y.J., Park C.G., Lee N.Y., Shim T.S., Kim B.J., Kook Y.H. Proportions of Mycobacterium massiliense and Mycobacterium bolletii strains among Korean Mycobacterium chelonae-Mycobacterium abscessus group isolates. J. Clin. Microbiol., 2008, vol. 46, pp. 3384–3390. doi: 10.1128/JCM.00319-08
  4. Mok S., Rogers T.R., Fitzgibbon M. Evaluation of GenoType NTM-DR assay for identification of Mycobacterium chimaera. J. Clin. Microbiol., 2017, vol. 55, no. 6, pp. 1821–1826. doi: 10.1128/JCM.00009-17
  5. Mougari F., Bouziane F., Crockett F., Nessar R., Chau F., Veziris N., Sapriel G., Raskine L., Cambau E. Selection of resistance to clarithromycin in Mycobacterium abscessus subspecies. Antimicrob. Agents Chemother., 2016, vol. 61, no. 1, pp. 9. doi: 10.1128/AAC.00943-16
  6. Mougari F., Loiseau J., Veziris N., Bernard C., Bercot B., Sougakoff W., Jarlier V., Raskine L., Cambau E. Evaluation of the new GenoType NTM-DR kit for the molecular detection of antimicrobial resistance in non-tuberculous mycobacteria. J. Antimicrob. Chemother., 2017, vol. 72, no. 6, pp. 1669–1677. doi: 10.1093/jac/dkx021
  7. Roux A.-L., Catherinot E., Ripoll F., Soismier N., Macheras E., Ravilly S., Bellis G., Vibet M.-A., Le Roux E., Lemonnier L., Gutierrez C., Vincent V., Fauroux B., Rottman M., Guillemot D., Gaillard J.L. Multicenter study of prevalence of nontuberculous mycobacteria in patients with cystic fibrosis in France. J. Clin. Microbiol., 2009, vol. 47, pp. 4124–4128. doi: 10.1128/JCM.01257-09
  8. Sax H., Bloemberg G., Hasse B., Sommerstein R., Kohler P., Achermann Y., Rössle M., Falk V., Kuster P.S., Böttger C.E., Weber R. Prolonged outbreak of Mycobacterium chimaera infection after open-chest heart surgery. Clin. Infect. Dis., 2015, vol. 61, no. 1, pp. 67–75. doi: 10.1093/cid/civ198
  9. Schweickert B., Goldenberg O., Richter E., Göbel U. B., Petrich A., Buchholz P., Moter A. Occurrence and clinical relevance of Mycobacterium chimaera sp. nov., Germany. Emerg. Infect. Dis., 2008, vol. 14, no. 9, pp. 1443–1446. doi: 10.3201/eid1409.071032: 1443-1446
  10. Stout J.E., Koh W.J., Yew W.W. Update on pulmonary disease due to non-tuberculous mycobacteria. Int. J. Infect. Dis., 2016, vol. 45, pp. 123–134. doi: 10.1016/j.ijid.2016.03.006
  11. Tortoli E., Rindi L., Garcia M.J., Chiaradonna P., Dei R., Garzelli C., Kroppenstedt R.M., Lari N., Mattei R., Mariottini A., Mazzarelli G., Murcia M.I., Nanetti A., Piccoli P., Scarparo C. Proposal to elevate the genetic variant MAC-A, included in the Mycobacterium avium complex, to species rank as Mycobacterium chimaera sp. nov.. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2004, vol. 54, no. 4, pp. 1277–1285. doi: 10.1099/ijs.0.02777-0
  12. Van der Werf M.J., Ködmön C., Katalinić-Janković V., Kummik T., Soini H., Richter E., Papaventsis D., Tortoli E., Perrin M., van Soolingen D., Žolnir-Dovč M., Thomsen V.Ø. Inventory study of non-tuberculous mycobacteria in the European Union. BMC Infect. Dis., 2014, vol. 14, no. 62. doi: 10.1186/1471-2334-14-62
  13. Zelazny A.M., Root J.M., Shea Y.R., Colombo R.E., Shamputa I.C., Stock F., Conlan S., McNulty S., Brown-Elliott B.A., Wallace R.J. Jr., Olivier K.N., Holland S.M., Sampaio E.P. Cohort study of molecular identification and typing of Mycobacterium abscessus, Mycobacterium massiliense, and Mycobacterium bolletii. J. Clin. Microbiol., 2009, vol. 47, no. 7, pp. 1985–1995. doi: 10.1128/JCM.01688-08

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Труден С., Жолнир-Довч М., Содья Э., Старчич Эрьявец М., 2018

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах