Выявление роли метициллинрезистентных Staphylococcus aureus и их молекулярно-генетических особенностей в развитии гнойно-некротических форм синдрома диабетической стопы
- Авторы: Хохлова О.Е.1, Ивао Я.2, Камшилова В.В.3, Теплякова О.В.1,4, Мотова А.И.3, Дробушевская А.И.4, Перьянова О.В.1,5, Винник Ю.С.1, Поткина Н.К.1,5, Здзитовецкий Д.Э.1,4, Ямамото Т.5,2
-
Учреждения:
- ФГБОУ ВО Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ
- Международный медицинский образовательно-исследовательский центр (IMERC)
- КГБУЗ Красноярская межрайонная клиническая больница скорой медицинской помощи им. Н.С. Карповича
- КГБУЗ Красноярская межрайонная клиническая больница № 7
- Российско-Японский центр микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний
- Выпуск: Том 9, № 1 (2019)
- Страницы: 95-106
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
- Дата подачи: 16.05.2018
- Дата принятия к публикации: 18.03.2019
- Дата публикации: 21.03.2019
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/662
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-2019-1-95-106
- ID: 662
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Гнойно-некротические осложнения у больных с синдромом диабетической стопы являются одной из главных причин ампутаций и инвалидизации и даже гибели пациентов. Целью данной работы явилось изучение роли MRSA и их молекулярно-генетических особенностей, а также антибиотикорезистентности в развитии гнойно-некротических форм синдрома диабетической стопы пациентов г. Красноярска за период 2010–2016 гг. Исследована в динамике микрофлора гнойно-некротических осложнений у 240 пациентов с синдромом диабетической стопы, ее антибиотикочувствительность, а также молекулярно-генетические особенности метициллинрезистентных Staphylococcus aureus. Для изучения микрофлоры гнойных осложнений использован бактериологический метод. Антибиотикочувствительность определяли диско-диффузионным методом; чувствительность стафилококков к антибиотикам проводили методом скрининга, ПЦР, методом серийных разведений в плотной среде в соответствии с международными рекомендациями СLSI, EUCAST. Для генотипирования и определения молекулярно-генетических особенностей — ПЦР, М-ПЦР, секвенирование. Обработку результатов проводили с использованием компьютерной программы WHONET (ВОЗ). Уровень значимости p < 0,05. Микрофлора гнойно-некротических форм синдрома диабетической стопы представлена грамотрицательными микроорганизмами — на долю представителей семейства Enterobacteriaceae приходилось 34,4%, неферментирующих грамотрицательных бактерий — 19,1%; грамположительными микроорганизмами — в 46,5% случаев, доля S. aureus — 18,4%. Микроорганизмы характеризовались полирезистентностью к антимикробным препаратам: доля БЛРС-продуцентов — 36,4%; доля МБЛ-продуцентов — 30,3%; доля MRSA — 36,4%. Доминирующим клоном MRSA среди пациентов с гнойно-некротическими формами синдрома диабетической стопы, госпитализированных в правобережный и левобережный стационары г. Красноярска являлся ST239/spa3(t037)/agr1/SCCmecIII.1.1.2(IIIA)/coaIV/tst+, характеризуюшийся высоким уровнем вирулентности и мультирезистентностью. Вторыми по значимости генетическими вариантами MRSA являлись ST8/spa1(t008)/agr1/SCCmecIV.3.1.1/CoaIII и ST12/spanew(t156)/agr1/SCCmecUT/coaIorVII, которые характеризовались устойчивостью к 1–2 группам антимикробных препаратов, помимо β-лактамов. Среди пациентов с гнойно-некротическими формами синдрома диабетической стопы, госпитализированных в стационары г. Красноярска распространены в основном генетические варианты MRSA, соответствующие клонам, выявленным ранее от пациентов с другими нозологиями на данной территории. Установлено, что среди от пациентов с гнойно-некротическими формами синдрома диабетической стопы, госпитализированных как в правобережный, так и левобережный стационары г. Красноярска, выделяются изоляты MRSA, преимущественно относящиеся к одним и тем же генетическим вариантам. Длительная госпитализация пациентов с данной патологией, а также их последующая неоднократная госпитализация в другие стационары г. Красноярска, способствует переносу госпитальных штаммов из одного стационара в другой.
Об авторах
О. Е. Хохлова
ФГБОУ ВО Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ
Автор, ответственный за переписку.
Email: khokhlovaol@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-2829-5117
Хохлова Ольга Евгеньевна - кандидат биологических наук, доцент микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.
660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1.
Тел.: 8 (391) 220-13-61; 8 (908) 018-99-84 (моб.).
РоссияЯ. Ивао
Международный медицинский образовательно-исследовательский центр (IMERC)
Email: indiansign_64@hotmail.com
Ивао Ясухиса - PhD, научный сотрудник лаборатории молекулярной бактериологии.
Ниигата.
ЯпонияВ. В. Камшилова
КГБУЗ Красноярская межрайонная клиническая больница скорой медицинской помощи им. Н.С. Карповича
Email: kamshylova@mail.ru
Камшилова Вера Владимировна - кандидат биологических наук, врач-бактериолог.
РоссияО. В. Теплякова
ФГБОУ ВО Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ; КГБУЗ Красноярская межрайонная клиническая больница № 7
Email: teplyakova-olga@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-0005-3316
Теплякова Ольга Валерьевна - кандидат медицинских наук, доцент кафедры общей хирургии им. проф. М.И. Гульмана ФГБОУ ВО КрасГМУ имени проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ; врач-хирург КГБУЗ Красноярская межрайонная клиническая больница № 7.
660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1.
РоссияА. И. Мотова
КГБУЗ Красноярская межрайонная клиническая больница скорой медицинской помощи им. Н.С. Карповича
Email: tihotay@mail.ru
Мотова Анастасия Ивановна - врач-клинический фармаколог КГБУЗ Красноярская межрайонная клиническая больница скорой медицинской помощи им. Н.С. Карповича.
РоссияА. И. Дробушевская
КГБУЗ Красноярская межрайонная клиническая больница № 7
Email: annushkadoc@mail.ru
Дробушевская АннаИвановна - кандидат медицинских наук, врач-хирург. Россия
О. В. Перьянова
ФГБОУ ВО Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ; Российско-Японский центр микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний
Email: perianova@mail.ru
Перьянова Ольга Владимировна - кандидат биологических наук, заведующая кафедрой микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича ФГБОУ ВО КрасГМУимени проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ; руководитель Российско-Японского центра микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний.
660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1.
РоссияЮ. С. Винник
ФГБОУ ВО Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ
Email: yuvinnik@yandex.ru
Винник Юрий Семенович - доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой общей хирургии им. проф. М.И. Гульмана, председатель диссертационного совета.
660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1.
РоссияН. К. Поткина
ФГБОУ ВО Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ; Российско-Японский центр микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний
Email: potkinanad@mail.ru
Поткина Надежда Константиновна - научный сотрудник, ФГБОУ ВО КрасГМУ имени проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ; научный сотрудник Российско-Японского центра микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний.
660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1.
РоссияД. Э. Здзитовецкий
ФГБОУ ВО Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ; КГБУЗ Красноярская межрайонная клиническая больница № 7
Email: zdz64@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-2498-3844
Здзитовецкий Дмитрий Эдуардович - доктор медицинских наук, доцент, заведующий кафедрой и клиникой хирургических болезней им. проф. Ю.М. Лубенского ФГБОУ ВО КрасГМУ имени проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого МЗ РФ; врач-хирург КГБУЗ Красноярская межрайонная клиническая больница № 7.
660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1.
РоссияТ. Ямамото
Российско-Японский центр микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний; Международный медицинский образовательно-исследовательский центр (IMERC)
Email: tatsuoy@imerc.jp
Ямамото Татсуо - PhD, профессор, куратор Российско-Японского центра микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний; директор Международного медицинского образовательно-исследовательского центра (IMERC).
Ниигата.
ЯпонияСписок литературы
- Бахарев И.В., Редькин Ю.А. Синдром диабетической стопы: диагностика, лечение, профилактика. Качество жизни // Медицина. 2003. № 1. С. 35–38.
- Гостев В.В., Калиногорская О.С., Попенко Л.Н., Черненькая Т.В., Науменко З.С., Ворошилова Т.М., Захарова Ю.А., Хох лова О.Е., Круглов А.Н., Ершова М.Г., Молчанова И.В., Сидоренко С.В. Антибиотикорезистентность метициллинрезистентных Staphylococcus aureus, циркулирующих в Российской Федерации // Антибиотики и химиотерапия. 2015. Т. 60, № 1–2. C. 3–10.
- Доброквашин С.В., Якупов Р.Р., Валеев А.З. Лечение больных с гнойно-некротическими осложнениями синдрома диабетической стопы // Акушерство. Гинекология. Эндокринология. 2011. Т. 54, № 6. С. 97–99.
- Митиш В.А., Пасхалова Ю.С., Ерошкин И.А., Галстян Г.Р., Блатун Л.А. Гнойно-некротические поражения при нейроишемической форме синдрома диабетической стопы // Хирургия. 2014. № 1. С. 48–53.
- Попова Т.Е., Шнайдер Н.А., Петрова М.М., Говорина Ю.Б., Николаева Т.Я. Диагностика нарушений микроциркуляции у пациентов с преимущественно сенсорным вариантом хронической воспалительной демиелинизирующей полиневропатии: пилотное исследование // Сибирское медицинское обозрение. 2015. № 1. С. 32–37.
- Привольнев В.В., Решедько Г.К., Савкин В.А., Кречикова О.И. Структура возбудителей и их антибиотикорезистентность при инфекциях нижних конечностей у больных сахарным диабетом // Клиническая микробиология и антимикробная химитерапия. 2009. Т. 11, № 1. С. 86–89.
- Рундо А.И. Современные аспекты этиологии и патогенеза синдрома диабетической стопы // Новости хирургии. 2015. Т. 23, № 1. С. 97–104.
- Токмакова А.Ю. Современная концепция диагностики и лечения хронических ран у больных с синдромом диабетической стопы // Сахарный диабет. 2009. № 1. С. 14-17.
- Фенотипическое определение Enterobacter – продуцентов β-лактамаз расширенного спектра: обзор и руководство по проведению испытаний. Европейское общество к линической микробиологии и инфекционных болезней // К линическая микробиология и инфекционные заболевания. 2008. Т. 14 (Прил. 1). С. 90–103.
- Bal A.M., Coombs G.W., Holden M.T., Lindsay J.A., Nimmo G.R., Tattevin P., Skov R.L. Genomic insights into the emergence and spread of international clones of healthcare-, community- and livestock-associated meticillin-resistant Staphylococcus aureus: Blurring of the traditional definitions. J. Glob. Antimicrob. Resist., 2016, vol. 95–101, pp. 8–34. doi: 10.1016/j.jgar.2016.04.004
- Сavanagh P., Lipsky B.A., Bradbury A.W., Botek G. Treatment for diabetic foot ulcers. Lancet, 2005, vol. 366, pp. 1725–1735. doi: 10.1016/S0140-6736(05)67699-4
- Drieux L., Brossier F., Sougakoff W., Jarlier V. Phenotypic detection of extended-spectrum β-lactamase production in Enterobacteriaceae: review and bench guide. Clin. Microbiol. Infect., 2008, vol. 14 (suppl. 1), pp. 90 –103. doi: 10.1111/j.1469-0691.2007.01846.x
- Echaniz-Aviles G., Velazquez-Meza M.E., Vazquez-Larios Mdel R., Soto-Noguerón A., Hernández-Dueñas A.M. Diabetic foot infection caused by community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (USA300). J. Diabetes, 2015, vol. 7 (6), pp. 891–892. doi: 10.1111/1753-0407.12324
- Gostev V., Kruglov A., Kalinogorskaya O., Dmitrenko O., Khokhlova O., Yamamoto T., Lobzin Y., Ryabchenko I., Sidorenko S. Molecular epidemiology and antibiotic resistance of methicillin-resistant Staphylococcus aureus circulating in the Russian Federation. Infect. Genet. Evol., 2017, vol. 53, pp. 189–194. doi: 10.1016/j.meegid.2017.06.006
- Hiramatsu K., Ito T., Tsubakishita S., Sasaki T., Takeuchi F., Morimoto Y., Katayama Y., Matsuo M., Kuwahara-Arai K., Hishinuma T., Baba T. Genomic basis for methicillin resistance in Staphylococcus aureus. Infect. Chemother., 2013, vol. 45, pp. 117–136. doi: 10.3947/ic.2013.45.2.117
- International working group on the classification of staphylococcal cassette chromosome elements (IWG-SCC). Classification of staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec): guidelines for reporting novel SCCmec elements. Agents Chemother., 2009, vol. 53, pp. 4961–4967. doi: 10.1128/AAC.00579-09
- Jeffcoate W.J., Harding K.G. Diabetic foot ulcers. Lancet, 2003, vol. 361, no. 9368, pp. 1545–1551. doi: 10.1016/S0140-6736(03)13169-8
- Kado C.I., Liu S.T. Rapid procedure for detection and isolation of large and small plasmids. J. Bacteriol., 1981, vol. 145, pp. 1365–1373.
- Khokhlova O.E., Hung W.C, Wan T.W. Iwao Y., Takano T., Higuchi W., Yachenko S.V., Teplyakova O.V., Kamshilova V.V., Kotlovsky Y.V., Nishiyama A., Reva I.V., Sidorenko S.V., Peryanova O.V., Reva G.V., Teng L.J., Salmina A.B., Yamamoto T. Healthcare- and community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and fatal pneumonia with pediatric deaths in Krasnoyarsk, Siberian Russia: unique MRSA’s multiple virulence factors, genome, and stepwise evolution. PLoS One, 2015, vol. 1, pp. 1–30. doi: 10.1371/journal.pone.0128017
- Kondo Y., Ito T., Ma X.X., Watanabe S., Kreiswirth B.N., Etienne J., Hiramatsu K. Combination of multiplex PCRs for staphylococcal cassette chromosome mec type assignment: rapid identification system for mec, ccr, and major differences in junkyard regions. Antimicrob. Agents Chemother., 2007, vol. 51, pp. 264–274. doi: 10.1128/AAC.00165-06
- Lindsay J.A. Genomic variation and evolution of Staphylococcus aureus. Int. J. Med. Microbiol., 2010, vol. 300, pp. 98–103. doi: 10.1016/j.ijmm.2009.08.013
- Morbach S., Müller E., Reike H., Risse A., Rümenapf G., Spraul M. Diabetic foot syndrome. Exp. Clin. Endocrinol. Diabetes, 2014, vol. 122, no. 7, pp. 416–424. doi: 10.1055/s-0034-1366455
- Nelson A., Wright-Hughes A., Backhouse M.R., Lipsky B.A., Nixon J., Bhogal M.S., Reynolds C., Brown S. CODIFI (Concordance in Diabetic Foot Ulcer Infection): a crosssectional study of wound swab versus tissue sampling in infected diabetic foot ulcers in England. BMJ Open, 2018, vol. 8 (1): e019437, pp. 1–12. doi: 10.1136/bmjopen-2017-019437
- Post V., Wahl P., Uckay I., Ochsner P., Zimmerli W., Corvec S., Loiez C., Richards R.G., Moriarty T.F. Phenotypic and genotypic characterisation of Staphylococcus aureus causing musculoskeletal infections. Int. J. Med. Microbiol., 2014, vol. 304 (5–6), pp. 565–576. doi: 10.1016/j.ijmm.2014.03.003
- Prevost G., Jaulhac B., Piemont Y. DNA fingerprinting by pulsed-field gel electrophoresis is more effective than ribotyping in distinguishing among methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates. J. Clin. Microbiol, 1992, vol. 30, pp. 967–973.
- Reveles K.R., Duhon B.M., Moore R.J., Hand E.O., Howell C.K. Epidemiology of methicillin-resistant Staphylococcus aureus diabetic foot infections in a large academic hospital: implications for antimicrobial stewardship. PLoS One, 2016, vol. 24, no. 11 (8): e0161658. doi: 10.1371/journal.pone.0161658
- Sorensen A.I., Toft N., Boklund A., Espinosa-Gongora C., Græsbøll K., Larsen J., Halasa T. A mechanistic model for spread of livestock-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (LA-MRSA) within a pig herd. PLoS One, 2017, vol. 12, no. 11: e0188429, pp. 1–18. doi: 10.1371/journal.pone.0188429
- Takano T., Hung W.C., Shibuya M., Higuchi W., Iwao Y., Nishiyama A., Reva I., Khokhlova O.E., Yabe S., Ozaki K., Takano M., Yamamoto T. A new local variant (ST764) of the globally disseminated ST5 lineage of hospital-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) carrying the virulence determinants of community-associated MRSA. Antimicrob. Agents Chemother., 2013, vol. 57, pp. 1589–1595. doi: 10.1128/AAC.01147-12
- Tenover F.C., Arbeit R., Archer G., Biddle J., Byrne S., Goering R., Hancock G., Hébert G.A., Hill B., Hollis R. Comparison of traditional and molecular methods of typing isolates of Staphylococcus aureus. J. Clin. Microbiol., 1994, vol. 32, pp. 407–415.
- Van der Zwaluw K., de Haan A., Pluister G.N., Bootsma H.J., de Neeling A.J., Schouls L.M. The carbapenem inactivation method (CIM), a simple and low-cost alternative for the Carba NP test to assess phenotypic carbapenemase activity in gram-negative rods. PLoS One, 2015, vol. 10, no. 3: e0123690, pp. 1–13. doi: 10.1371/journal.pone.0123690