КАРБАПЕНЕМАЗА-ПРОДУЦИРУЮЩИЕ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫЕ БАКТЕРИИ В СПЕЦИАЛИЗИРОВАННОМ СТАЦИОНАРЕ САНКТ-ПЕТЕРБУРГА

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Охарактеризованы видовой состав, чувствительность к антимикробным препаратам, частота встречаемости и типы карбапенемаз карбапенемаза-продуцирующих грамотрицательных бактерий, выделеных в ФГБУ «РНЦРХТ» МЗ РФ с февраля 2014 г. по апрель 2016 г. Скрининг карбапенем-резистентных бактерий проводился путем посева биоматериала на хромогенные среды (CHROMagar KPC, DRG, Франция), а их видовая идентификация — методом матричной лазерной десорбционной времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS) на анализаторе VITEK MS (bioMérieux, Франция). Чувствительность грамотрицательных бактерий к антимикробным препаратам определялась на анализаторе VITEK-2 (bioMérieux, Франция). Полученные результаты интерпретировались в соответствии с критериями EUCAST v. 6.0, 2016. Гены, кодирующие карбапенемазы групп КРС, ОХА-48/162, VIM, IMP, NDM, OXA-51, OXA40/24, OXA-23 и OXA-58 выявлялись методом мультиплексной ПЦР в реальном времени (АмплиСенс, Россия). Выделено 813 клинически значимых штаммов бактерий (602 пациента), в том числе 405 грамотрицательных, среди которых 5,1% (21 штамм от 16 пациентов) нечувствительных к меропенему и/или имипенему: Klebsiella pneumoniae (n = 5), Enterobacter cloacae (n = 2), Serratia marcescens (n = 1), Pseudomonas aeruginosa (n = 3), Acinetobacter baumannii (n = 10). Из клинического материала 4-х пациентов одновременно выделено до 3-х штаммов разных видов нечувствительных к карбапенемам бактерий. У 84% нечувствительных к карбапенемам изолятов обнаружены гены, кодирующие приобретенные карбапенемазы: у A. baumannii — OXA40/24 (n = 8); у K. pneumoniae — OXA-48 (n = 1), КРС (n = 1) и NDM (n = 2); у P. aeruginosa — VIM (n = 1) и KPC (n = 1); у E. cloacae — КРС (n = 1). OXA-48 карбапенемаза обнаружена также в одном карбапенем-чувствительном штамме K. pneumoniae. Все карбапенемаза-продуцирующие штаммы имели фенотип множественной резистентности к антимикробным препаратам. Результаты исследования показали, что хотя доля карбапенем-нечувствительных штаммов среди грамотрицательных бактерий сравнительно невелика, все они обладают множественной устойчивостью к антимикробным препаратам и в большинстве из них обнаружены гены приобретенных карбапенемаз. Видовой состав и типы обнаруженных приобретенных карбапанемаз характерны для территории России. У K. pneumoniae и P. aeruginosa не выявлено превалирования какого-либо одного типа карбапенемаз, в то время как у всех штаммов A. baumannii обнаружен ген OXA40/24 карбапенемазы.

Об авторах

А. Г. Полищук

ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: apolishchuk@rrcrst.ru

к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории генной инженерии,

197758, Санкт-Петербург, п. Песочный, ул. Ленинградская, 70

Россия

Е. И. Якубович

ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий Минздрава России

Email: fake@neicon.ru

к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории генной инженерии,

Санкт-Петербург

Россия

О. В. Полухина

ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий Минздрава России

Email: fake@neicon.ru

к.м.н, зав. бактериологической лабораторией,

Санкт-Петербург

Россия

В. В. Осовских

ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий Минздрава России

Email: fake@neicon.ru

к.м.н., руководитель группы анестезиологии и реаниматологии,

Санкт-Петербург

Россия

В. И. Евтушенко

ФГБУ Российский научный центр радиологии и хирургических технологий Минздрава России

Email: fake@neicon.ru

д.б.н., руководитель лаборатории генной инженерии,

Санкт-Петербург

Россия

Список литературы

  1. Бабенко Д.Б., Лавриненко А.В., Захарова Е.А., Шамбилова Н.А., Азизов И.С. Лабораторная детекция карбапенемазапродуцирующих энтеробактерий // Лабораторная медицина. 2012–2013. Т. 1–2, № 4. С. 47–61. [Babenko D.B., Lavrinenko A.V., Zakharova E.A., Shamilova N.A., Azizov I.S. Laboratory detection of carbapenemase-producing enterobacteria. Laboratornaya meditsina = Laboratory Medicine, 2012–2013, vol. 1–2, no. 4, pp. 47–61. (In Russ.)]
  2. Егорова С.А., Кафтырева Л.А., Липская Л.В., Коноваленко И.Б., Пясетская М.Ф., Курчикова Т.С., Ведерникова Н.Б., Морозова О.Т., Смирнова М.В., Попенко Л.Н., Любушкина М.И., Савочкина Ю.А., Макарова М.А., Сужаева Л.В., Останкова Ю.В., Иванова М.Н., Павелкович А.М., Наабер П., Сепп Э., Кыльялг С., Mицюлявичeне И., Балоде А. Штаммы энтеробактерий, продуцирующие бета-лактамазы расширенного спектра и металло-β-лактамазу NDM-1, выделены в стационарах в странах Балтийского региона // Инфекция и иммунитет. 2013. Т. 3, № 1. С. 29–36. [Egorova S.A., Kaftyreva L.A., Lipskaya L.V., Konovalenko I.B., Pyasetskaya M.F., Kurchikova T.S., Vedernikova N.B., Morozova O.T., Smirnova M.V., Popenko L.N., Lubushkina M.I., Savochkina J.A., Makarova M.A., Suzhaeva L.V., Ostankova J.V., Ivanova M.N., Pavelkovich A.M., Naaber P., Sepp E., Kõljalg S., Miciuleviciene J., Balode A. Enterobacteriacae, producing ESBLs and metallo-β-lactamase NDM-1, isolated in hospitals of Baltic region countries. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2013, vol. 3, no. 1, pp. 29–36. doi: 10.15789/2220-7619-2013-1-29-36 (In Russ.)]
  3. Мартинович А.А., Эйдельштейн М.В. Рост нечувствительности к карбапенемам и частоты продукции карбапенемаз у нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в России в 2002–2012 гг. // Вестник Смоленской Государственной Медицинской Академии. 2014. Т. 13, № 2. С. 34–39. [Martinovich A.A., Edelstein M.V. Increase of carbapenem-non-susceptibility and carbapenemase production rate in nosocomial Acinetobacter spp. in Russia in 2002–2012. Vestnik Smolenskoi Gosudarstvennoi Meditsinskoi Akademii = Herald of the Smolensk State Academy, 2014, vol. 13, no. 2, pp. 34–39. (In Russ.)]
  4. Светличная Ю.С. Распространение карбапенем устойчивых штаммов А. baumannii в многопрофильных стационарах Санкт-Петербурга // Медицинский альманах. 2015. Т. 5, № 40. С. 102–105. [Svetlichnaya Yu.S. Spread of carbapanemresistant strains of A. baumannii in multipurpose day-and-night clinics of Saint Petersburg. Meditsinskii al’manakh = Medical Almanac, 2015, vol. 5, no. 40, pp. 102–105. (In Russ.)]
  5. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Тимохова А.В., Шек Е.А., Дехнич А.В., Козлов Р.С. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011–2012 гг. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014. Т. 16, № 4. С. 254–265. [Sukhorukova М.V., Edelstein М.V., Skleenova Е.Yu., Ivanchik N.V., Timokhova А.V., Sheck Е.А., Dekhnich А.V., Kozlov R.S., «MARATHON» Study Group. Antimicrobial resistance of nosocomial Enterobacteriaceae isolates in Russia: results of national multicenter surveillance study «MARATHON» 2011–2012. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2014, vol. 16, no. 4, pp. 254–265. (In Russ.)]
  6. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Тимохова А.В., Шек Е.А., Дехнич А.В., Козлов Р.С. и исследовательская группа «МАРАФОН». Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Acinetobacter spp. в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011–2012 гг. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014. Т. 16, № 4. С. 266–272. [Sukhorukova М.V., Edelstein М.V., Skleenova Е.Yu., Ivanchik N.V., Timokhova А.V., Sheck Е.А., Dekhnich А.V., Kozlov R.S., «MARATHON» Study Group. Antimicrobial resistance of nosocomial Acinetobacter spp. isolates in Russia: results of national multicenter surveillance study «MARATHON» 2011–2012. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2014, vol. 16, no. 4, pp. 266–272. (In Russ.)]
  7. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Тимохова А.В., Шек Е.А., Дехнич А.В., Козлов Р.С. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Pseudomonas aeruginosa в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования МАРАФОН в 2011–2012 гг. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014. Т. 16, № 4. С. 273–279. [Sukhorukova М.V., Edelstein М.V., Skleenova Е.Yu., Ivanchik N.V., Timokhova А.V., Sheck Е.А., Dekhnich А.V., Kozlov R.S., «MARATHON» Study Group. Antimicrobial Resistance of Nosocomial Pseudomonas aeruginosa isolates in Russia: results of national multicenter surveillance study «MARATHON» 2011–2012. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2014, vol. 16, no. 4, pp. 273–279. (In Russ.)]
  8. Тапальский Д.В., Осипов В.А., Жаворонок С.В. Карбапенемазы грамотрицательных бактерий: распространение и методы детекции // Медицинский журнал. 2012. Т. 2, № 40. С. 10–15. [Tapalski D.V., Osipov V.A., Zhavoronok S.V. Carbapenemases of gram-negative pathogens: spread and methods of detection. Meditsinskii zhurnal = Medical Journal, 2012, vol. 2, no. 40, pp. 10–15. (In Russ.)]
  9. Ageevets V.A., Partina I.V., Lisitsyna E.S., Ilina E.N., Lobzin Yu.V., Shlyapnikov S.A., Sidorenko S.V. Emergence of carbapenemase-producing Gram-negative bacteria in Saint Petersburg, Russia. Int. J. Antimicrob. Agents, 2014, vol. 44, no. 2, pp. 152–155.
  10. Barantsevich E.P., Churkina I.V., Barantsevich N.E., Pelkonen J., Schlyakhto E.V., Woodford N. Emergence of Klebsiella pneumoniae producing NDM-1 carbapenemase in Saint Petersburg, Russia. J. Antimicrob. Chemother., 2013, vol. 68, no. 5, pp. 1204–1206.
  11. Carrër A., Poirel L., Eraksoy H., Cagatay A.A., Badur S., Nordmann P. Spread of OXA-48-positive carbapenem-resis tant Klebsiella pneumoniae isolates in Istanbul, Turkey. Antimicrob. Agents Chemother., 2008, vol. 52, no. 8, pp. 2950–2954. doi: 10.1128/AAC.01672-07
  12. Creighton J., Heffernan H., Howard J. Isolation of seven distinct carbapenemase-producing gram-negative organisms from a single patient. J. Antimicrob. Chemother., 2017, vol. 72, no. 1, pp. 317–319. doi: 10.1093/jac/dkw378
  13. Edelstein M.V., Skleenova E.N., Shevchenko O.V., D’souza J.W., Tapalski D.V., Azizov I.S., Sukhorukova M.V., Pavlukov R.A., Kozlov R.S., Toleman M.A., Walsh T.R. Spread of extensively resistant VIM-2-positive ST235 Pseudomonas aeruginosa in Belarus, Kazakhstan, and Russia: a longitudinal epidemiological and clinical study. Lancet Infect. Dis., 2013, vol. 13, no. 10, pp. 867–876. doi: 10.1016/S1473-3099(13)70168-3
  14. European Centre for Disease Prevention and Control. Carbapenemase-producing bacteria in Europe: interim results from the European Survey on carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE) project. Stockholm: ECDC 2013. URL: http://www.ecdc.europa.eu
  15. Evans B.A., Amyes S.G. OXA β-lactamases. Clin. Microbiol. Rev., 2014, vol. 27, no. 2, pp. 241–263. doi: 10.1128/CMR.00117-13
  16. Fursova N.K., Astashkin E.I., Knyazeva A.I., Kartsev N.N., Leonova E.S., Ershova O.N., Alexandrova I.A., Kurdyumova N.V., Sazikina S.Yu., Volozhantsev N.V., Svetoch E.A., Dyatlov I.A. The spread of bla OXA-48 and bla OXA-244 carbapenemase genes among Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis and Enterobacter spp. isolated in Moscow, Russia. Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob., 2015, vol. 14, pp. 46–53.
  17. Gutkind G., Di Conza J., Power P., Radice M. β-lactamase-mediated resistance: a biochemical, epidemiological and genetic overview. Curr. Pharm. Des., 2013, vol. 19, no. 2, pp. 164–208.
  18. Lauretti L., Riccio M., Mazzariol A., Cornaglia G., Amicosante G., Fontana R., Rossolini G.M. Cloning and characterization of blaVIM, a new integron-borne metallo-beta-lactamase gene from a Pseudomonas aeruginosa clinical isolate. Antimicrob. Agents Chemother., 1999, vol. 43, no. 7, pp. 1584–1590.
  19. Magiorakos A.P., Srinivasan A., Carey R.B., Carmeli Y., Falagas M.E., Giske C.G., Harbarth S., Hindler J.F., Kahlmeter G., Olsson-Liljequist B., Paterson D. L., Rice L.B., Stelling J., Struelens M.J., Vatopoulos A., Weber J.T., Monnet D.L. Multidrugresistant, extensively drug-resistant and pandrug-resistant bacteria: an international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance. Clin. Microbiol. Infect., 2012, vol. 18, pp. 268–281. doi: 10.1111/j.1469-0691.2011.03570.x
  20. Meletis G. Carbapenem resistance: overview of the problem and future perspectives. Ther. Adv. Infect. Dis., 2016, vol. 3, no. 1, pp. 15–21. doi: 10.1177/2049936115621709
  21. Nordmann P. Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae: overview of a major public health challenge. Med. Mal. Infect., 2014, vol. 44, no. 2, pp. 51–56. doi: 10.1016/j.medmal.2013.11.007
  22. Nordmann P., Poirel L. The difficult-to-control spread of carbapenemase producers among Enterobacteriaceae worldwide. Clin. Microbiol. Infect., 2014, vol. 20, pp. 821–830. doi: 10.1111/1469-0691.12719
  23. Poirel L., Potron A., Nordmann P. OXA-48-like carbapenemases: the phantom menace. J. Antimicrob. Chemother., 2012, vol. 67, no. 7, pp. 1597–1606. doi: 10.1093/jac/dks121
  24. Queenan A.M., Bush K. Carbapenemases: the versatile β-lactamases. Clin. Microbiol. Rev., 2007, vol. 20, no. 3, pp. 440–458. doi: 10.1128/CMR.00001-07
  25. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 6.0, 2016. URL: http://www.eucast.org
  26. Yigit H., Queenan A.M., Anderson G.J., Domenech-Sanchez A., Biddle J.W., Steward C.D., Alberti S., Bush K., Tenover F.C. Novel carbapenem-hydrolyzing beta-lactamase, KPC-1, from a carbapenem-resistant strain of Klebsiella pneumoniae. Antimicrob. Agents Chemother., 2001, vol. 45, no. 4, pp. 1151–1161. doi: 10.1128/AAC.45.4.1151-1161.2001
  27. Yong D., Toleman M.A., Giske C.G., Cho H.S., Sundman K., Lee K., Walsh T.R. Characterization of a new metallo-beta-lactamase gene, bla(NDM-1), and a novel erythromycin esterase gene carried on a unique genetic structure in Klebsiella pneumoniae sequence type 14 from India. Antimicrob. Agents Chemother., 2009, vol. 53, no. 12, pp. 5046–5054. doi: 10.1128/AAC.00774-09

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Полищук А.Г., Якубович Е.И., Полухина О.В., Осовских В.В., Евтушенко В.И., 2017

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах