Отправить статью по E-mail ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS (ПО МАТЕРИАЛАМ 15-ЛЕТНЕГО НАБЛЮДЕНИЯ В ЛЕНИНГРАДСКОЙ ОБЛАСТИ)
- Авторы: Вязовая А.А.1, Ветров В.В.1, Лялина Л.В.1, Мокроусов И.В.1, Соловьева Н.С.2, Журавлев В.Ю.2, Вишневский Б.И.2, Нарвская О.В.3
-
Учреждения:
- ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
- ФГБУ НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России
- ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера ФГБУ НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России
- Выпуск: Том 7, № 1 (2017)
- Страницы: 34-40
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
- Дата подачи: 28.03.2017
- Дата принятия к публикации: 28.03.2017
- Дата публикации: 28.03.2017
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/477
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-2017-1-34-40
- ID: 477
Цитировать
Полный текст
Аннотация
В конце 90-х гг. XX в. в России наблюдалось обострение эпидемической ситуация по туберкулезу и «взрывной» рост лекарственной устойчивости возбудителя. В последние годы на фоне снижения заболеваемости туберкулезом легких растет число случаев, вызванных микобактериями с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ), что приводит к снижению эффективности лечения. Среди 11 субъектов Северо-Западного федерального округа Ленинградская область лидирует по числу неэффективных курсов химиотерапии у впервые выявленных бактериовыделителей. Особенностью эпидемической ситуации по туберкулезу в Ленинградской области является превалирование (74,1% в 2014 г.) МЛУ штаммов возбудителя у ранее леченных больных туберкулезом легких. Цель исследования — сравнительная генотипическая характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных хроническим туберкулезом легких в Ленинградской области в 1999–2004 и 2010–2014 гг. По результатам сполиготипирования, среди штаммов M. tuberculosis ранее леченных больных Ленинградской области преобладали представители генетического семейства Beijing (сполиготипы SIT1 и SIT190), причем их доля возросла с 56,3% (27 из 48) в 1999–2004 гг. до 76,5% (52 из 68) в 2010–2014 гг. Доля штаммов других генотипов — LAM и T — сократилась с 16,7 и 12,5% до 10,3 и 2,9% соответственно. Удельный вес МЛУ в изученных субпопуляциях генотипа Beijing был практически неизменным (88,9 и 86,5%). Среди МЛУ штаммов Beijing в 1999–2004 гг. широкая лекарственная устойчивость (ШЛУ) не встречалась, тогда как в 2010–2014 гг. доля ШЛУ достигла 33,3%. MIRU-VNTR-типирование (12 локусов) 68 штаммов M. tuberculosis выявило 20 вариантов профилей, из них пять представлены кластерами MIT1, MIT46, MIT16, MIT17, MIT571, включавшими два и более штамма. Наиболее крупные кластеры MIT16 (223325153533) и MIT17 (223325173533) включали 25 (48,1%) и 21 (40,4%) штамм генотипа Beijing. При этом ранее установлена клиническая значимость и преимущественно эпидемический путь распространения МЛУ штаммов M. tuberculosis генотипа Beijing, принадлежащих к данным MIRU-VNTR-типам, в ряде регионов России, что требует углубленного анализа ситуации в Ленинградской области.
Об авторах
А. А. Вязовая
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Автор, ответственный за переписку.
Email: annavyazovaya@pasteurorg.ru
к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики
197101, Россия, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14, Тел.: (812) 233-21-49. Факс: (812) 233-20-92
В. В. Ветров
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Email: fake@neicon.ru
научный сотрудник лаборатории эпидемиологии инфекционных и неинфекционных заболеваний
РоссияЛ. В. Лялина
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Email: fake@neicon.ru
д.м.н., профессор, зав. лабораторией эпидемиологии инфекционных и неинфекционных заболеваний
РоссияИ. В. Мокроусов
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Email: fake@neicon.ru
д.б.н., зав. лабораторией молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики
РоссияН. С. Соловьева
ФГБУ НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России
Email: fake@neicon.ru
к.м.н., зав. бактериологической лабораторией Россия
В. Ю. Журавлев
ФГБУ НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России
Email: fake@neicon.ru
к.м.н., руководитель отдела лабораторной диагностики
РоссияБ. И. Вишневский
ФГБУ НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России
Email: fake@neicon.ru
д.м.н., профессор, главный научный сотрудник отдела лабораторной диагностики
РоссияО. В. Нарвская
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. ПастераФГБУ НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России
Email: fake@neicon.ru
д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия; научный консультант отдела лабораторной диагностики Санкт-Петербургского НИИ фтизиопульмонологии, Санкт-Петербург, Россия
РоссияСписок литературы
- Габбасова Л.А., Касаева Т.Ч., Стерликов С.А., Нечаева О.Б., Обухова О.В., Одинцов В.Е., Чебагина Т.Ю. Отраслевые и экономические показатели противотуберкулезной работы в 2009–2014 гг. Методика расчета показателей и статистические материалы по результатам пятилетнего наблюдения. М.: РИО ЦНИИОИЗ, 2015. 68 с. [Gabbasova L.A., Kasayeva T.C., Sterlikov S.A., Nechayev O.B., Obukhov O.V., Odintsov V.E., Chebagina T.Y. Otraslevye i ekonomicheskie pokazateli protivotuberkuleznoi raboty v 2009–2014 gg. Metodika rascheta pokazatelei i statisticheskie materialy po rezul’tatam pyatiletnego nablyudeniya [Industry and economic indicators of antituberculosis activities in 2009–2014. The methodology of calculation of indicators and statistical data based on results of the five-year surveillance]. Moscow: FPHI RIO, 2015. 68 p.]
- Маркелов Ю.М., Нарвская О.В. Циркуляция штаммов возбудителя туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью на территории Республики Карелия // Туберкулез и болезни легких. 2010. № 2. С. 54–56. [Markelov Yu.M., Narvskaya O.V. Circulation of multidrug-resistant tuberculosis pathogen strains in the Republic of Karelia. Tuberkulez i bolezni legkih = Tuberculosis and Lung Diseases, 2010, no. 2, pp. 54–56. (In Russ.)]
- Огарков О.Б., Медведева Т.В., Zozio T., Погорелов В.И., Некипелов О.М., Гутникова М.Ю., Купцевич Н.Ю., Ушаков И.В., Sola C. Молекулярное типирование штаммов микобактерий туберкулеза в Иркутской области (Восточная Сибирь) в 2000–2005 гг. // Молекулярная медицина. 2007. № 2. С. 33–38. [Ogarkov О.В., Medvedeva T.V., Zozio Т., Pogorelov V.I., Nekipelov O.M., Gutnikova M.Yu., Kuptsevich N.Yu., Ushakov I.V., Sola С. Molecular typing of Mycobacterium tuberculosis strains in the Irkutsk Region (Eastern Siberia) in 2000–2005. Molekulyarnaya meditsina = Molecular Medicine, 2007, no. 2, pp. 33–38. (In Russ.)]
- Умпелева Т.В., Вязовая А.А., Еремеева Н.И., Кравченко М.А., Нарвская О.В., Скорняков С.Н. Генетические особенности возбудителя туберкулеза в Уральском федеральном округе России // Туберкулез и болезни легких. 2016. Т. 94, № 8. C. 60–65. [Umpeleva T.V., Vyazovaya A.A., Eremeeva N.I., Kravchenko M.A., Narvskaya O.V., Skorniakov S.N. Specific genetic features of Mycobacterium tuberculosis in Ural Federal District of Russia. Tuberkulez i bolezni legkih = Tuberculosis and Lung Diseases, 2016, vol. 94, no. 8, pp. 60–65. (In Russ.)]
- Яблонский П.К., Вишневский Б.И., Соловьева Н.С., Маничева О.А., Догонадзе М.З., Мельникова Н.Н., Журавлев В.Ю. Лекарственная устойчивость Mycobacterium tuberculosis при различных локализациях заболевания // Инфекция и иммунитет. 2016. Т. 6, № 2. С. 133–140. [Yablonskii P.K., Vishnevskiy B.I., Solovyeva N.S., Manicheva O.A., Dogonadze M.Z., Melnikova N.N., Zhuravlev V.Yu. Drug resistance of Mycobacterium tuberculosis in different localizations of the disease. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity. 2016, vol. 6, no. 2, pp. 133–140. doi: 10.15789/2220- 7619-2016-2-133-140 (In Russ.)]
- Drobniewski F., Balabanova Y., Nikolayevsky V., Ruddy M., Kuznetzov S., Zakharova S., Melentyev A., Fedorin I. Drug-resistant tuberculosis, clinical virulence, and the dominance of the Beijing strain family in Russia. JAMA, 2005, vol. 293, no. 22, pp. 2726–2731.
- Gibson A., Huard R., Gey van Pittius N., Lazzarini L., Driscoll J., Kurepina N., Zozio T., Sola C., Spindola S., Kritski A., Fitzgerald D., Kremer K., Mardassi H., Chitale P., Brinkworth J., Garcia de Viedma D., Gicquel B., Pape J., Van Soolingen D., Kreiswirth B., Warren R., Van Helden P., Rastogi N., Suffys P., Lapa e Silva J., Ho J. Application of sensitive and specific molecular methods to uncover global dissemination of the major RDRio Sublineage of the Latin American-Mediterranean Mycobacterium tuberculosis spoligotype family. J. Clin. Microbiol., 2008, vol. 46, no. 4, pp. 1259–1267.
- Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A., Van Agterveld M., Van Soolingen D., Kuijper S., Bunschoten A., Molhuizen H., Shaw R., Goyal M., Van Embden J. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J. Clin. Microbiol., 1997, vol. 35, no. 4, pp. 907–914.
- Mokrousov I. Genetic geography of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: a multifacet mirror of human history? Infect. Genet. Evol., 2008, vol. 8, no. 6, pp. 777–785. doi: 10.1016/j.meegid.2008.07.003
- Mokrousov I. Mycobacterium tuberculosis phylogeography in the context of human migration and pathogen’s pathobiology: Insights from Beijing and Ural families. Tuberculosis (Edinb). 2015, no. 95 (suppl.), pp. S167–176.
- Mokrousov I., Vyazovaya A., Otten T., Zhuravlev V., Pavlova E., Tarashkevich L., Krishevich V., Vishnevsky B., Narvskaya O. Mycobacterium tuberculosis population in northwestern Russia: an update from Russian-EU/Latvian border region. PLoS One. 2012, vol. 7, no. 7:e41318. doi: 10.1371/journal.pone.0041318.
- Mokrousov I., Vyazovaya A., Solovieva N., Sunchalina T., Markelov Y., Chernyaeva E., Melnikova N., Dogonadze M., Starkova D., Vasilieva N.,Gerasimova A., Kononenko Y., Zhuravlev V., Narvskaya O. Trends in molecular epidemiology of drug-resistant tuberculosis in Republic of Karelia, Russian Federation. BMC Microbiol., 2015, no. 15: 279. doi: 10.1186/s12866-015-0613-3
- Supply P., Allix C., Lesjean S., Cardoso-Oelemann M., Rüsch-Gerdes S., Willery E., Savine E., De Haas P., Van Deutekom H., Roring S., Bifani P., Kurepina N., Kreiswirth B., Sola C., Rastogi N., Vatin V., Gutierrez M.C., Fauville M., Niemann S., Skuce R., Kremer K., Locht C., Van Soolingen D. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unitvariable- number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis. J. Clin. Microbiol., 2006, vol. 44, no. 12, pp. 4498–4510.
- Van Embden J., Cave M., Crawford J., Dale J., Eisenach K., Gicquel B., Hermans P., Martin C., McAdam R., Shinnick T., Small P. Strain identification on Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized metho dology. J. Clin. Microbiol., 1993, no. 31, pp. 406–409.
- Vyazovaya A., Mokrousov I., Solovieva N., Mushkin A., Manicheva O., Vishnevsky B., Zhuravlev V., Narvskaya O. Tuberculous spondylitis in Russia and prominent role of multidrug-resistant clone Mycobacterium tuberculosis Beijing B0/W148. Antimicrob. Agents Chemother., 2015, vol. 59, no. 4, pp. 2349–2357.
Дополнительные файлы
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).