МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ИЗОЛЯТОВ ВИРУСА ГЕПАТИТА C ИЗ РАЗНЫХ РЕГИОНОВ РЕСПУБЛИКИ САХА (ЯКУТИЯ)

Обложка
  • Авторы: Семенов А.В.1, Останкова Ю.В.2, Герасимова В.В.3, Бичурина М.А.2, Козлов А.В.4, Мукомолов С.Л.2, Тотолян А.А.5
  • Учреждения:
    1. ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия ГБОУ ВПО Первый Санкт-Петербургский Государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия ГБОУ ВПО Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия
    2. ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия
    3. ФГАОУ ВПО Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова, Санкт-Петербург, Россия
    4. ГБОУ ВПО Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия
    5. ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия ГБОУ ВПО Первый Санкт-Петербургский Государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия
  • Выпуск: Том 5, № 4 (2015)
  • Страницы: 359-372
  • Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
  • Дата подачи: 15.02.2016
  • Дата принятия к публикации: 15.02.2016
  • Дата публикации: 16.12.2015
  • URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/353
  • DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-2015-4-359-372
  • ID: 353


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Количество инфицированных вирусом гепатита С в мире составляет почти 3% от населения земного шара, при этом хронический гепатит С развивается приблизительно у 70–80% инфицированных. Хронический гепатит С является ведущей причиной цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы, таким образом становясь одной из глобальных проблем общественного здравоохранения. Клинические проявления разнообразны, и зависят в основном от биологических свойств вируса и его взаимодействия с иммунной системой хозяина. Генотип вируса гепатита C является важным фактором, определяющим как вирусный ответ на противовирусную терапию, так и риск развития тяжелого заболевания печени. Определение генотипов и субтипов вируса важно для лучшего понимания эпидемиологических и вирусологических особенностей заболевания. Распространенность генотипов вируса гепатита С варьируется в разных географических регионах. Данные о распределении генотипов ВГС для некоторых субъектов Российской Федерации весьма ограничены, особенно это касается сельских регионов, Северной Сибири, Дальнего Востока, полярных регионов. Молекулярные характеристики циркулирующих на данных территориях вирусов практически не представлены в литературе. Одним из таких регионов является Якутия. В настоящем исследовании методом прямого секвенирования NS5B области РНК ВГС определены генетические варианты ВГС у жителей Якутии, страдающих ХВГС с умеренной и высокой вирусной нагрузкой. На основании филогенетического анализа показано, что среди обследованных больных ХВГС при умеренной и высокой вирусной нагрузке ВГС преобладает генотип 1 (88,3%) по сравнению с генотипом 2 (6,7%) и 3 (3,2%). Полученные результаты о распространенности субтипа 1b согласуются с данными о связи этого субтипа с высоким уровнем виремии, большей длительностью и тяжестью течения заболевания печени, а также преимущественным развитием ХВГС у пациентов с субтипом 1b, по сравнению с лицами, инфицированными иными субтипами вируса гепатита C. Для некоторых изолятов вируса гепатита С из Якутии показано сходство нуклеотидной последовательности региона NS5B с соответствующими фрагментами изолятов из США, Бразилии и Ирландии. Обсуждается тесная связь выявленных в нашей работе изолятов вирусного гепатита C субтипа 2а с изолятами, найденными в Китае. Впервые на территории РФ выявлен вирусный гепатит C субтипа 3g, предположительно завезенный из стран Южной Азии. Комплексное использование молекулярных, вирусологических, демографических и эпидемиологических методов и информации для наблюдения за инфекциями будет способствовать пониманию текущей эпидемиологической ситуации по вирусному гепатиту C в России. Масштабное исследование генотипов ВГС в Российской Федерации позволит оценить пути распространения и время эволюционного разделения изолятов вируса. 

Об авторах

А. В. Семенов

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия
ГБОУ ВПО Первый Санкт-Петербургский Государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия
ГБОУ ВПО Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия

Email: fake@neicon.ru

к.б.н., зав. лабораторией вирусологии и иммунологии ВИЧ-инфекции ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера; доцент кафедры иммунологии ГБОУ ВПО Первый Санкт-Петербургский Государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова МЗ РФ; доцент кафедры клинической лабораторной диагностики ГБОУ ВПО Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия

Россия

Ю. В. Останкова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия

Автор, ответственный за переписку.
Email: shenna1@yandex.ru

научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии и сероэпидемиологии ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия

Россия

В. В. Герасимова

ФГАОУ ВПО Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова, Санкт-Петербург, Россия

Email: fake@neicon.ru

научный сотрудник учебно-научной лаборатории геномной медицины клиники медицинского института ФГАОУ ВПО Северо-Восточный федеральный университет имени М.К. Аммосова, Якутск, Республика Саха (Якутия), Россия

Россия

М. А. Бичурина

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия

Email: fake@neicon.ru

д.м.н., зав. лабораторией этиологии и контроля вирусных инфекций ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия

Россия

А. В. Козлов

ГБОУ ВПО Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия

Email: fake@neicon.ru

д.м.н., профессор, зав. кафедрой клинической лабораторной диагностики ГБОУ ВПО Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия

Россия

С. Л. Мукомолов

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия

Email: fake@neicon.ru

д.м.н., профессор, зав. лабораторией вирусных гепатитов ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия

Россия

Арег А. Тотолян

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия
ГБОУ ВПО Первый Санкт-Петербургский Государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия

Email: fake@neicon.ru

член-корреспондент РАН, д.м.н., профессор, зав. лабораторией молекулярной иммунологии и сероэпидемиологии, ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия; зав. кафедрой иммунологии ГБОУ ВПО Первый Санкт-Петербургский Государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова МЗ РФ, Санкт-Петербург, Россия

Россия

Список литературы

  1. Вирусные гепатиты в Российской Федерации. Аналитический обзор. 9 выпуск / Под ред. Покровского В.И., Жебруна А.Б. СПб.: ФБУН НИИЭМ им. Пастера, 2013. 168 с. [Virusnye gepatity v Rossiiskoi Federatsii. Analiticheskii obzor. 9 vypusk. Pod red. Pokrovskogo V.I., Zhebruna A.B. [Viral hepatitis in the Russian Federation. Analytical review. 9th issue. Eds V.I. Pokrovskiy, A.B. Zhebrun]. St. Petersburg Pasteur Institute, 2013, 168 p.]
  2. О санитарно-эпидемиологической обстановке в Республике Саха (Якутия) в 2013 г.: Госуд. доклад. Якутск: Управление Роспотребнадзора по Республике Саха (Якутия). 2013. 282 c. [About sanitary and epidemiological situation in the Republic of Sakha (Yakutia) in 2013. Yakutsk: State report. Yakutsk Rospotrebnadzor for the Republic of Sakha (Yakutia). 2013, 282 p. (In Russ.)]
  3. Самохвалов Е.И., Николаева Л.И., Альховский С.В., Хлопова И.Н., Макашова В.В., Петрова Е.В., Сапронов Г.В., Беляева Н.М., Львов Д.К. Частота встречаемости отдельных субтипов вируса гепатита С в Московском регионе // Вопросы вирусологии. 2013. № 58 (1). С. 36–40. [Samokhvalov E.I., Nikolaeva L.I., Al’khovskii S.V., Khlopova V.V., Petrova E.V., Sapronov G.V., Beliaeva N.M., L’vov D.K. Frequency of detection of different hepatitis C virus subtypes in the Moscow region]. Voprosy virusologii = Problems of Virology, 2013, vol. 58, no. 1, pp. 36–40. (In Russ.)]
  4. Семенов С.И., Терехова М.В., Индеева Л.Д., Павлов Н.Н., Тихонова Н.Н., Кузин С.Н., Писарева М.М., Грудинин М.П., Балахонцева Л.А., Серкина Т.П. Распространенность и генетическая характеристика вируса гепатита С в Якутии // Якутский медицинский журнал. 2009. № 2 (26). С. 129–132. [Semenov S.I., Terehova M.V., Indeeva L.D., Pavlov N.N., Tihonova N.N., Cusin S.N., Pisareva M.M., Grudinin M.P., Balahontseva L.A., Serkina T.P. Hepatitis C prevalence and genetic characteristic in Yakutia]. Yakutskii meditsinskii zhurnal = Yakut Medical Journal, 2009, vol. 2 no. 26, pp. 129–132. (In Russ.)]
  5. Степанова Г.И., Алексеева М.Н., Слепцова С.С. Клинические особенности хронического вирусного гепатита С в Республике (Саха) Якутия // Фундаментальные исследования. 2004. № 2. С. 97–98 [Stepanova G.I., Alekseeva M.N., Sleptsova S.S. Clinical features of chronic hepatitis C in the republic (Sakha) Yakutia]. Fundamental’nye issledovaniya = Basic Research, 2004, no. 2, pp. 97–98. (In Russ.)]
  6. Ahmed A.M., Hassan M.S., Abd-Elsayed A., Hassan H., Hasanain A.F., Helmy A. Insulin resistance, steatosis, and fibrosis in Egyptian patients with chronic hepatitis C virus infection. Saudi J. Gastroenterol., 2011, vol. 17 no. 4, pp. 245–251. doi: 10.4103/1319-3767.82578
  7. Ambrozaitis A., Agminas K.S., Balc I.G., Widell A. Hepatitis C in Lithuania: incidence, prevalence, risk factors and viral genotypes. Clin. Diagn. Virol., 1995, vol. 4 no. 4, pp. 273–284.
  8. Batash S., Khaykis I., Raicht R.F., Bini E.J. High prevalence of hepatitis C virus infection among immigrants from the former Soviet Union in the New York City metropolitan area: results of a community based screening program. Am. J. Gastroenterol., 2008, vol. 103, no. 4, pp. 922–927. doi: 10.1111/j.15720241.2008.01789.x
  9. Blatt L.M., Mutchnick M.G., Tong M.J., Klion F.M., Lebovics E., Freilich B., Bach N., Smith C., Herrera J., Tobias H., Conrad A., Schmid P., McHutchison J.G. Assessment of hepatitis C virus RNA and genotype from 6807 patients with chronic hepatitis C in the United States. J. Viral. Hepat., 2000, vol. 7, no. 3, pp. 196–202. doi: 10.1046/j.1365-2893.2000.00221.x
  10. Bracho M.A., Saludes V., Martró E., Bargalló A., González-Candelas F., Ausina V. Complete genome of a european hepatitis C virus subtype 1g isolate: phylogenetic and genetic analyses. Virol. J., 2008, vol. 5, pp. 72–79. doi: 10.1186/1743-422X-5-72
  11. Cavalheiro Nde P., De La Rosa A., Elagin S., Tengan F.M., Araújo E.S., Barone A.A. Hepatitis C: sexual or intrafamilial transmission? Epidemiological and phylogenetic analysis of hepatitis C virus in 24 infected couples. Rev. Soc. Bras. Med. Trop., 2009, vol. 42, no. 3, pp. 239–244.
  12. Chamberlain R.W., Adams N.J., Taylor L.A., Simmonds P., Elliott R.M. The complete coding sequence of hepatitis C virus genotype 5a, the predominant genotype in South Africa. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1997, vol. 236, pp. 44–49.
  13. Chuang W.L., Yu M.L. Host factors determining the efficacy of hepatitis C treatment. J. Gastroenterol., 2013, vol. 48, no. 1, pp. 22–30. doi: 10.1007/s00535-012-0669-x
  14. Cramp M.E., Rosenberg W.M., Ryder S.D., Blach S., Parkes J. Modelling the impact of improving screening and treatment of chronic hepatitis C virus infection on future hepatocellular carcinoma rates and liverrelated mortality. BMC Gastroenterol., 2014, vol. 14, pp. 137–47. doi: 10.1186/1471-230X-14-137
  15. De Bruijne J., Schinkel J., Prins M., Koekkoek S.M., Aronson S.J., van Ballegooijen M.W., Reesink H.W., Molenkamp R., van de Laar T.J. Emergence of hepatitis C virus genotype 4: phylogenetic analysis reveals three distinct epidemiological profiles. J. Clin. Microbiol., 2009, vol. 47, no. 12, pp. 3832–3838. doi: 10.1128/JCM.01146-09
  16. Debojyoti B., Kheya M., Goutam C., Ranadeep G., Nabarun M., Mohua B. Correlation study between HCV genotypes distribution pattern and viral load in a tertiary care hospital in Kolkata, India. J. Clin. Diagn. Res., 2015, vol. 9 no. 5, pp. DC15–17. doi: 10.7860/JCDR/2015/12701.5977
  17. Demetriou V.L., Kostrikis L.G. Nearfull genome characterization of unclassified hepatitis C virus strains relating to genotypes 1 and 4. J. Med. Virol., 2011, vol. 83, pp. 2119–2127. doi: 10.1002/jmv.22237
  18. Dustin L.B., Rice C.M. Flying under the radar: the immunobiology of hepatitis C. Annu. Rev. Immunol., 2013, vol. 25, pp. 71–99.
  19. EASL clinical practice guidelines: management of hepatitis C virus infection. J. Hepatol., 2011, vol. 55, pp. 245–264. doi: 10.1016/j.jhep.2011.02.023
  20. Esmat G., Hashem M., El-Raziky M., El-Akel W., El-Naghy S., El-Koofy N. Risk factors for hepatitis C virus acquisition and predictors of persistence among Egyptian children. Liver Int., 2012, vol. 32, no. 3, pp. 449–456. doi: 10.1111/j.1478-3231.2011.02643.x
  21. Gededzha M.P., Selabe S.G., Kyaw T., Rakgole J.N., Blackard J.T., Mphahlele M.J. Introduction of new subtypes and variants of hepatitis C virus genotype 4 in South Africa. J. Med. Virol., 2012, vol. 84. no. 4, pp. 601–607. doi: 10.1002/jmv.23215
  22. Ghany M.G., Strader D.B., Thomas D.L., Seeff L.B., American association for the study of liver diseases. Diagnosis, management, and treatment of hepatitis C: an update. Hepatology, 2009, vol. 49, no. 4, pp. 1335–1374. doi: 10.1002/hep.22759
  23. Higgins D.G., Bleasby A.J., Fuchs R. CLUSTAL V: improved software for multiple sequence alignment. Comput. Appl. Biosci., 1992, vol. 8, no. 2, pp. 189–191.
  24. Karchava M., Waldenström J., Parker M., Hallack R., Sharvadze L., Gatserelia L., Chkhartishvili N., Dvali N., Dzigua L., Dolmazashvili E., Norder H., Tsertsvadze T. High incidence of the hepatitis C virus recombinant 2k/1b in Georgia: Recommendations for testing and treatment. Hepatol. Res., 2015. doi: 10.1111/hepr.12505
  25. Kavita S.L., Jyotsna A.J., Sandhya P.S., Badri N.T., Mohan Prasad V.G., Vidya A.A. Comparison of hepatitis C virus genotyping by 5 noncoding regionand corebased reverse transcriptase PCR assay with sequencing and use of the assay for determining subtype distribution in India. J. Clin. Microbiol., 2003, vol. 41, no. 11, pp. 5240–5244.
  26. Kuiken C., Combet C., Bukh J., Shin I., Deleage G., Mizokami M., Richardson R., Sablon E., Yusim K., Pawlotsky J.M., Simmonds P. A comprehensive system for consistent numbering of HCV sequences, proteins and epitopes. Hepatology, 2006, vol. 44, no. 5, pp. 1355–1361.
  27. Kuiken C., Simmonds P. Nomenclature and numbering of the hepatitis C virus. Methods. Mol. Biol., 2009, vol. 510, pp. 33–53. doi: 10.1007/978-1-59745-394-3_4
  28. Kurbanov F., Tanaka Y., Sugauchi F., Kato H., Ruzibakiev R., Zalyalieva M., Yunusova Z., Mizokami M. Hepatitis C virus molecular epidemiology in Uzbekistan. J. Med. Virol., 2003, vol. 69. no. 3, pp. 367–375.
  29. Lavanchy D. The global burden of hepatitis C. Liver. Int., 2009, vol. 29, suppl. 1, pp. 74–81. doi: 10.1111/j.14783231.2008.01934.x
  30. Li C., Lu L., Wu X., Wang C., Bennett P., Lu T., Murphy D. Complete genomic sequences for hepatitis C virus subtypes 4b, 4c, 4d, 4g, 4k, 4l, 4m, 4n, 4o, 4p, 4q, 4r and 4t. J. Gen. Virol., 2009, vol. 90, pt. 8, pp. 1820–1826. doi: 10.1099/vir.0.010330-0
  31. Li C., Cao H., Lu L., Murphy D. Full-length sequences of 11 hepatitis C virus genotype 2 isolates representing five subtypes and six unclassified lineages with unique geographical distributions and genetic variation patterns. J. Gen. Virol., 2012, vol. 93, pt. 6, pp. 1173–1184. doi: 10.1099/vir.0.038315-0
  32. Linqi Z., Zhiwei C., Yunzhen C., Jian Y., Guanghan L., Wenjie Y., Ning Y., Shan M., Li L., Balfe P., Tian H., Lei B., Fengwen Z., His-Hsun L., Man-Fung Y., Ching-Lung L., David D.H. Molecular characterization of human immunodeficiency virus type 1 and hepatitis C virus in paid blood donors and injection drug users in China. J. Virol., 2004, vol. 78, no. 24, pp. 13591–13599. doi: 10.1128/JVI.78.24.1359113599.2004
  33. Lu L., Li C., Fu Y., Thaikruea L., Thongswat S., Maneekarn N., Apichartpiyakul C., Hotta H., Okamoto H., Netski D., Pybus O.G., Murphy D., Hagedorn C.H., Nelson K.E. Complete genomes for hepatitis C virus subtypes 6f, 6i, 6j and 6m: viral genetic diversity among Thai blood donors and infected spouses. J. Gen. Virol., 2007, vol. 88, pt. 5, pp. 1505–1518.
  34. Maksyutov R.A., Gavrilova E.V., Maksyutov A.Z., Kanev A.N. Genotyping of hepatitis B and C virus Russian isolates for reference serum panel construction. J. Med. Virol., 2015, vol. 87, no. 7, pp. 1192–1198. doi: 10.1002/jmv.24170
  35. Murphy D.G., Sablon E., Chamberland J., Fournier E., Dandavino R., Tremblay C.L. Hepatitis C virus genotype 7, a new genotype originating from central Africa. J. Clin. Microbiol., 2015, vol. 53, no. 3, pp. 967–972. doi: 10.1128/JCM.02831-14
  36. Myers R.P., Krajden M., Bilodeau M., Kaita K., Marotta P., Peltekian K., Ramji A., Estes C., Razavi H., Sherman M. Burden of disease and cost of chronic hepatitis C infection in Canada. Can. J. Gastroent. Hepatol., 2014, vol. 28, no. 5, pp. 243–250.
  37. Newman R.M., Kuntzen T., Weiner B., Berical A., Charlebois P., Kuiken C., Murphy D.G., Simmonds P., Bennett P., Lennon N.J., Birren B.W., Zody M.C., Allen T.M., Henn M.R. Whole genome pyrosequencing of rare hepatitis C virus genotypes enhances subtype classification and identification of naturally occurring drug resistance variants. J. Infect. Dis., 2013, vol. 208, no. 1, pp. 17–31. doi: 10.1093/infdis/jis679
  38. Nishiya A.S., de Almeida-Neto C., Ferreira S.C., Alencar C.S., Di-Lorenzo-Oliveira C., Levi J.E., Salles N.A., Mendrone A. Jr, Sabino E.C. HCV genotypes, characterization of mutations conferring drug resistance to protease inhibitors, and risk factors among blood donors in São Paulo, Brazil. PLoS One, 2014, vol. 9, no. 1, e86413. doi: 10.1371/journal.pone.0086413
  39. Ohno T., Lau J.Y. The “gold-standard”, accuracy, and the current concepts: hepatitis C virus genotype and viremia. Hepatology, 1996, vol. 24, no. 5, pp. 1312–1315.
  40. Olinger C.M., Lazouskaya N.V., Eremin V.F., Muller C.P. Multiple genotypes and subtypes of hepatitis B and C viruses in Belarus: similarities with Russia and western European influences. Clin. Microbiol. Infect., 2008, vol. 14, no. 6, pp. 575–581. doi: 10.1111/j.14690691.2008.01988.x
  41. Paintsil E., Verevochkin S.V., Dukhovlinova E., Niccolai L., Barbour R., White E., Toussova O.V., Alexander L., Kozlov A.P., Heimer R. Hepatitis C virus infection among drug injectors in St. Petersburg, Russia: social and molecular epidemiology of an endemic infection. Addiction, 2009, vol. 104, no. 11, pp. 1881–1890. doi: 10.1111/j.13600443.2009.02687.x
  42. Panigrahi A.K., Roca J., Acharya S.K., Jameel S., Panda S.K. Genotype determination of hepatitis C virus from northern India: identification of a new subtype. J. Med. Virol., 1996, vol. 48, no. 2, pp. 191–198.
  43. Semjonov S.I., Savvin R.G., Nikitina S.G., Maximova S.S., Sleptsova S.S. Parenteral viral hepatitis (В, С, D) in the Sakha Republic (Yakutia). Life Sci. J., 2014, vol. 11, no. 8, pp. 454–458.
  44. Sharma S., Carballo M., Feld J.J., Janssen H.L. Immigration and viral hepatitis. J. Hepatol., 2015, vol. 63, no. 2, pp. 515–522. doi: 10.1016/j.jhep.2015.04.026
  45. Sharvadze L., Nelson K.E., Imnadze P., Karchava M., Tsertsvadze T. Prevalence of HCV and genotypes distribution in general population of Georgia. Georgian Med. News, 2008, vol. 165, pp. 71–77.
  46. Shustov A.V., Kochneva G.V., Sivolobova G.F., Grazhdantseva A.A., Gavrilova I.V., Akinfeeva L.A., Rakova I.G., Aleshina M.V., Bukin V.N., Orlovsky V.G., Bespalov V.S., Robertson B.H., Netesov S.V. Molecular epidemiology of the hepatitis C virus in Western Siberia. J. Med. Virol., 2005, vol. 77, no. 3, pp. 382–389.
  47. Simmonds P., Bukh J., Combet C., Deleage G., Enomoto N., Feinstone S., Halfon P., Inchauspe G., Kuiken C., Maertens G., Mizokami M., Murphy D.G., Okamoto H., Pawlotsky J.M., Penin F., Sablon E., ShinI T., Stuyver L.J., Thiel H.J., Viazov S., Weiner A.J., Widell A. Consensus proposals for a unified system of nomenclature of hepatitis C virus genotypes. Hepatology, 2005, vol. 42, no. 4, pp. 962–973. doi: 10.1002/hep.20819
  48. Simmonds P., Mellor J., Sakuldamrongpanich T., Nuchaprayoon C., Tanprasert S., Holmes E.C., Smith D.B. Evolutionary analysis of variants of hepatitis C virus found in South-East Asia: comparison with classifications based upon sequence similarity. J. Gen. Virol., 1996, vol. 77, pt. 12, pp. 3013–3024.
  49. Singh P., Bhatia V., Pandey M., Shashank M., Tidke P., Jha N., Dutt S. HCV genotypes distribution pattern & its association with viral load in India. Int. J. Recent Sci. Res., 2013, vol. 4, no. 11, pp. 1682–1684.
  50. Smith D.B., Bukh J., Kuiken C., Muerhoff A.S., Rice C.M., Stapleton J.T., Simmonds P. Expanded classification of hepatitis C virus into 7 genotypes and 67 subtypes: updated criteria and genotype assignment web resource. Hepatology, 2014, vol. 59, no. 1, pp. 318–327. doi: 10.1002/hep.26744
  51. Sominskaya I., Mihailova M., Jansons J., Emelyanova V., Folkmane I., Smagris E., Dumpis U., Rozentals R., Pumpens P. Hepatitis B and C virus variants in longterm immunosuppressed renal transplant patients in Latvia. Intervirology, 2005, vol. 48, no. 2–3, pp. 192–200.
  52. Tallo T., Norder H., Tefanova V., Krispin T., Schmidt J., Ilmoja M., Orgulas K., Pruunsild K., Priimagi L., Magnius L.O. Genetic characterization of hepatitis C virus strains in Estonia: fluctuations in the predominating subtype with time. J. Med. Virol., 2007, vol. 79, no. 4, pp. 374–382.
  53. Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G. Nei M., Kumar S. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol., 2011, vol. 28, no. 10, pp. 2731–2739. doi: 10.1093/molbev/msr121
  54. Van de Laar T.J., Koppelman M.H., van der Bij A.K., Zaaijer H.L., Cuijpers H.T., van der Poel C.L., Coutinho R.A., Bruisten S.M. Diversity and origin of hepatitis C virus infection among unpaid blood donors in the Netherlands. Transfusion, 2006, vol. 46, no. 10, pp. 1719–1728.
  55. Viazov S., Kuzin S., Paladi N., Tchernovetsky M., Isaeva E., Mazhul L., Vasychova F., Widell A., Roggendorf M. Hepatitis C virus genotypes in different regions of the former Soviet Union (Russia, Belarus, Moldova and Uzbekistan). J. Med. Virol., 1997, vol. 53, no. 1, pp. 36–40.
  56. Yu M.L., Chuang W.L. Treatment of chronic hepatitis C in Asia: when East meets West. J. Gastroenterol. Hepatol., 2009, vol. 24, no. 3, pp. 336–345. doi: 10.1111/j.1440-1746.2009.05789.x
  57. Zein N.N. Clinical significance of hepatitis C virus genotypes. Clin. Microbiol. Rev., 2000, vol. 13, no. 2, pp. 223–235.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Семенов А.В., Останкова Ю.В., Герасимова В.В., Бичурина М.А., Козлов А.В., Мукомолов С.Л., Тотолян А.А., 2015

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах