МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ВИРУСНОГО ГЕПАТИТА В

Обложка
  • Авторы: Герасимова В.В.1, Левакова И.А.2, Бичурина М.А.2, Максимова Н.Р.3
  • Учреждения:
    1. ФГАОУ ВПО Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова, 677000, Россия, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. Кулаковского, 46, Арктический Инновационный Центр. Тел.: 8 (914) 223-11-67.
    2. ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия
    3. ФГАОУ ВПО Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова, 677000, Россия, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. Кулаковского, 46, Арктический Инновационный Центр.
  • Выпуск: Том 5, № 4 (2015)
  • Страницы: 297-302
  • Раздел: ОБЗОРЫ
  • Дата подачи: 11.02.2016
  • Дата принятия к публикации: 11.02.2016
  • Дата публикации: 16.12.2015
  • URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/345
  • DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-2015-4-297-302
  • ID: 345


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Резюме. Вирусный гепатит В является серьезной проблемой здравоохранения всего мира, России и ее регионов. Причиной этого является его широкая распространенность в разных этнических и географических группах, разнообразие проявления клинических форм, а также исходов. По данным ВОЗ, около 50 млн человек в мире ежегодно заражаются вирусом гепатита В. Развитие молекулярно-генетических методов исследования позволило расширить представления о биологии возбудителя. Генетическая вариабельность генома вируса гепатита В привела к появлению 10 различных географически распространенных генотипов, которые обозначены буквами от А до J. Внутри ряда генотипов выявлены субгенотипы, отличающиеся между собой на 4–8% полных геномных последовательностей. В работе дана таблица географической распространенности различных генотипов вируса гепатита В в мире. Географическое распределение генотипов вируса гепатита В тесно связано с эндемичными регионами и коренным населением, проживающим в них. Так генотипы В и С связаны с населением азиатских стран, генотипы А и D распространены среди европейских стран и в США. Генотип D является преобладающим типом среди пациентов с гепатитом В в различных регионах Турции. Филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей изолятов вируса гепатита В в африканских регионах показал наличие трех субгенотипов — А1, А2, А3. В странах Азии распространено шесть субгенотипов В: В1 — в Японии, В2–В5 и В7 — в Восточной Азии. Субгенотип В6 встречается среди коренных народов, проживающих в арктических регионах, в том числе на Аляске, севере Канады и в Гренландии. Генотип С имеет пять серотипов (С1–С5), которые распространены в Восточной и Юго-Восточной Азии. Генотип D также имеет пять субгенотипов (D1–D5), которые распространены в Африке, Индии, Средиземноморском регионе, Европе. Генотип F имеет четыре субгенотипа (F1–F4), которые циркулируют в Центральной и Южной Америке. Субгенотипы пока не выявлены среди генотипов E, G, H, I и J. На территории Российской Федерации циркулируют 3 генотипа вируса гепатита В (А, С, D). Среди них доминирует генотип D, распространенность которого составляет 88%.

Об авторах

В. В. Герасимова

ФГАОУ ВПО Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова, 677000, Россия, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. Кулаковского, 46, Арктический Инновационный Центр. Тел.: 8 (914) 223-11-67.

Автор, ответственный за переписку.
Email: virlab@mail.ru

научный сотрудник учебно-научной лаборатории геномной медицины клиники медицинского института ФГАОУ ВПО Северо-Восточный федеральный университет имени М.К. Аммосова

Россия

И. А. Левакова

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия

Email: fake@neicon.ru

зав. отделением диагностики и профилактики вирусных гепатитов ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Россия

М. А. Бичурина

ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-Петербург, Россия

Email: fake@neicon.ru

д.м.н., старший научный сотрудник, зав. лабораторией этиологии и контроля вирусных инфекций ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Россия

Н. Р. Максимова

ФГАОУ ВПО Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова, 677000, Россия, Республика Саха (Якутия), г. Якутск, ул. Кулаковского, 46, Арктический Инновационный Центр.

Email: fake@neicon.ru

д.м.н., профессор, руководитель учебно-научной лаборатории геномной медицины клиники медицинского института ФГАОУ ВПО Северо-Восточный федеральный университет имени М.К. Аммосова

Россия

Список литературы

  1. Балаян М.С., Михайлов М.И. Вирусные гепатиты: энциклопедический словарь. 2-е изд. М.: Амипресс, 1999. 302 с. [Balayan M.S., Mikhailov M.I. Virusnye gepatity: entsiklopedicheskiy slovar [Virus hepatitis: encyclopaedic dictionary]. 2nd ed. Moscow: Amipress, 1999, 302 p.]
  2. Баяндин Р.Б., Шустов А.В., Кочнева Г.В., Сиволобова Г.Ф., Гражданцева А.А., Локтев В.Б., Гранитов В.М., Нетесов С.В. Частота обнаружения маркеров, генотипы вируса и факторы риска гепатита В у пациентов инфекционного отделения городской больницы Барнаула // Инфекционные болезни. 2007. Т. 5, № 1. С. 5–10. [Bayandin R.B., Shustov A.V., Kochneva G.V., Sivolobova G.F., Grazhdantseva A.A., Loktev V.B., Granitov V.M., Netesov S.V. Frequency of detection of markers, genotypes of virus and hepatitis B risk factors at patients of the Infectious Disease Ward of the Barnaul City Hospital. Infektsionnye bolezni = Infectious Diseases, 2007, vol. 5, no. 1, pp. 5–10. (In Russ.)]
  3. Елпаева Е.А., Порецкова Е.А., Писарева М.А., Ковеленов А.Ю., Аликян И.С., Гольбрайх Р.Б., Грудинин М.П., Эсауленко Е.В. Генотипическая характеристика вируса гепатита В у хронически инфицированных больных // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2009. № 15. С. 55–58. [Elpaeva E.A., Poretskova E.A., Pisareva M.A., Kovelenov A.J., Alikyan I.S., Golbreich R.B., Grudinin M.P., Esaulenko E.V. Genotypic characteristic of hepatitis B virus at chronically infected patients. Dal’nevostochnyy zhurnal infektsionnoy patologii = Far East Journal of Infectious Pathology, 2009, no. 15, pp. 55–58. (In Russ.)]
  4. Елпаева Е.А., Писарева М.М., Никитина О.Е., Кижло С.Н., Грудинин М.П., Дудаева О.П. Роль мутантных форм вируса гепатита В в прогрессирующем течении хронического гепатита В // Ученые записки Петрозаводского государственного университета. 2014. № 6. С. 41–46. [Elpaeva E.A., Pisareva M.M., Nikitina O.E., Kizhlo S.N., Grudinin M.P., Dudaeva O.P. A role of mutant forms of hepatitis B virus in advanced chronic hepatitis B. Uchenye zapiski Petrozavodskogo gosudarstvennogo universiteta = Proceedings of Petrozavodsk State University, 2014, no. 6, pp. 41–46. (In Russ.)]
  5. Зотова А.В., Попова О.Е., Кюрегян К.К., Исаева О.В., Михайлов М.И. Распространенность вирусных гепатитов В и С среди оленеводов-кочевников в Республике Саха (Якутия) // Медицинская вирусология. 2007. Т. XXIV. С. 181–186. [Zotova A.V., Popova O.E., Kjuregyan K.K., Isaeva O.V., Mihajlov M.I. Prevalence of virus hepatitis B and C among reindeer breeders-nomads in the Republic Sakha (Yakutia). Meditsinskaya virusologiya = Medical Virology, 2007, vol. 24, pp. 181–186. (In Russ.)]
  6. Кочнева Г.В., Мануйлов В.А., Нетесова И.Г., Чуб Е.В., Баяндин Р.Б., Сиволобова Г.Ф., Гражданцева А.А., Нетесов С.В. Генотипы и субтипы изолятов вируса гепатита В на территории Сибири // Проблемы особо опасных инфекций. 2011. № 3 (109). С. 31–35. [Kochneva G.V., Manujlov V.A., Netesova I.G., Chub E.V., Bayandin R.B., Sivolobova G.F., Grazhdantseva A.A., Netesov S.V. Genotypes and subgenotypes of hepatitis B virus isolates in the territory of Siberia. Problemy osobo opasnykh infektsiy = Problems of Particularly Dangerous Infections, 2011, no. 3 (109), pp. 31–35. (In Russ.)]
  7. Кочнева Г.В., Гражданцева А.А., Сиволобова Г.Ф., Шустов А.В., Гаврилова И.В., Чуб Е.В., Баяндин Р.Б., Терновой В.А., Чаусов Е.В., Акинфеева Л.А., Гранитов В.М., Сахарова Е.Г., Губанова Л.И., Орловский В.Г., Нетесов С.В. Этиология острых гепатитов и генотипическое разнообразие вирусов гепатитов А, В, С и Е в трех регионах Сибири // Инфекционные болезни. 2005. Т. 3, № 1. С. 26–31. [Kochneva G.V., Grazhdantseva A.A., Sivolobova G.F., Shustov A.V., Gavrilova I.V., Chub E.V., Bayandin R.B., Ternova V.А., Chausov E.V., Akinfeeva L.A., Granitov V.M., Saharova E.G., Gubanova L.I., Olovskiy V.G., Netesov S.V. Etiology of acute hepatitis and genotypic variety of hepatitis A, B, C and Е viruses in three regions of Siberia. Infektsionnye bolezni = Infectious Diseases, 2005, vol. 3, no. 1, pp. 26–31. (In Russ.)]
  8. Кузин С.Н., Забелин Н.Н., Самохвалов Е.И., Семенов С.И., Павлов Н.Н., Терехова М.В., Зверяева И.К., Кузина Л.Е., Кожевников А.А. Генетическое разнообразие вируса гепатита В на территории Республики Саха (Якутия) // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2008. № 5. С. 10–15. [Cuzin S.N., Zabelin N.N., Samohvalov E.I., Semenov S.I., Pavlov N.N., Terekhova M.V., Zveryaeva I.K., Kuzina L.E., Kozhevnikov A.A. Genetic variety of hepatitis B virus in the territory of Republic Sakha (Yakutia). Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika = Epidemiology and Vaccination, 2008, no. 5, pp. 10–15. (In Russ.)]
  9. Мануйлов В.А., Чуб Е.В., Нетесова И.Г. Различная встречаемость субгенотипов вируса гепатита В и субтипов HBsAg у коренного населения Сибири // Мир вирусных гепатитов. 2007. № 4. С. 9–10. [Manuilov V.A., Chub E.V., Netesova I.G. Various occurrence of subgenotypes of hepatitis B virus and subtypes HBsAg at indigenous population of Siberia. Mir virusnykh gepatitov = The World of Virus Hepatitis, 2007, no. 4, pp. 9–10. (In Russ.)]
  10. Мануйлов В.А., Осипова Л.П., Нетесова И.Г., Чуб Е.В. Распространенность различных генотипов и субтипов HBs-антигена вируса гепатита В в группах коренного населения Сибири // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2015. № 1. С. 28–35. [Manuilov V.A., Osipova L.P., Netesova I.G., Chub E.V. Prevalence of various genotypes and subtypes HBs-antigene of hepatitis B virus in groups of indigenous population of Siberia. Molekulyarnaya genetika, mikrobiologiya i virusologiya = Molecular Genetics, Microbiology and Virology, 2015, no. 1, pp. 28–35. (In Russ.)]
  11. О мероприятиях, направленных на стабилизацию заболеваемости парентеральными вирусными гепатитами в Российской Федерации // Постановление Главного Государственного санитарного врача Российской Федерации. № 9 от 11 марта 2013 г. [O meropriyatiyakh, napravlennykh na stabilizatsiyu zabolevaemosti parenteral’nymi virusnymi gepatitami v Rossiyskoy Federatsii [On measures directed on prevention of parenteral virus hepatitis in the Russian Federation]. The Decision of the chief state health officer of the Russian Federation, no. 9, March of 11th, 2013. (In Russ.)]
  12. Рафаилова М.А., Слепцова С.С., Федосеева Л.Р., Алексеева М.А. Генотипы HBV в Республике Саха (Якутия) с учетом клинической формы заболевания // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2005. № 7. С. 14–19. [Rafailova M.A., Sleptsova S.S., Fedoseeva L.R., Alekseeva M.A. HBV genotypes in the Republic Sakha (Yakutia) in respect to the disease clinical form. Dal’nevostochnyy zhurnal infektsionnoy patologii = Far East Journal of Infectious Pathology, 2005, no. 7, pp. 14–19. (In Russ.)]
  13. Семенов С.И., Павлов Н.Н., Кривошапкин В.Г. Генотипы вируса гепатита В и субтипы HBsAg в Якутии // Якутский медицинский журнал. 2009. № 2 (26). С. 114–117. [Semenov S.I., Pavlov N.N., Krivoshapkin V.G. Genotypes of hepatitis B virus and HBsAg subtypes in Yakutia. Yakutskiy meditsinskiy zhurnal = The Yakutsk Medical Journal, 2009, no. 2 (26), pp. 114–117. (In Russ.)]
  14. Семенов С.И., Кривошапкин В.Г., Саввин Р.Г., Индеева Л.Д., Павлов H.H. Хронические вирусные гепатиты В, С и D в условиях Крайнего Севера. Якутск: Триада, 2003. 119 с. [Semenov S.I., Krivoshapkin V.G., Savvin R.G., Indeeva L.D., Pavlov N.N. Khronicheskie virusnye gepatity V, S i D v usloviyakh Kraynego Severa [Chronic virus hepatitis B, C and D in the conditions of the Far North]. Yakutsk: Triad, 2003. 119 p.]
  15. Слепцова С.С. Роль генотипов вирусов гепатитов В, С и D в развитии первичного рака печени // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 4. С. 67–73. [Sleptsova S.S. A role of genotypes of hepatitis B, C and D viruses in development of liver primary cancer. VICh-infektsiya i immunosupressii = HIV-infection and Immune Suppressions, 2012, vol. 4, no. 4, pp. 67–73. (In Russ.)]
  16. Arauz-Ruiz P., Norder H., Robertson B.H., Magnius L.O. Genotype H: a new Amerindian genotype of hepatitis B virus revealed in Central America. J. Gen. Virol., 2002, vol. 83, pp. 2059–2073. doi: 10.1099/0022-1317-83-8-2059
  17. Baha W., Ennaji M.M., Lazar F., Melloul M., El Fahime E., El Malki A., Bennani A. HBV genotypes prevalence, precore and basal core mutants in Morocco. Infect. Genet. Evol., 2012, vol. 12, no. 6, pp. 1157–1162. doi: 10.1016/j.meegid.2012.04.026
  18. Brichler S., Lagathu G., Chekaraou M.A., Le Gal F., Edouard A., Dény P., Césaire R., Gordien E. African, Amerindian and European hepatitis B virus strains circulate on the Caribbean Island of Martinique. J. Gen. Virol., 2013, vol. 94, pp. 2318–2329. doi: 10.1099/vir.0.055459-0
  19. Cui C., Shi J., Hui L., Xi H., Zhuoma, Quni, Tsedan, Hu G. The dominant hepatitis B virus genotype identified in Tibet is a C/D hybrid. J. Gen. Virol., 2002, vol. 83, pp. 2773–2777. doi: 10.1099/0022-1317-83-11-2773
  20. Datta S. An overview of molecular epidemiology of hepatitis B virus (HBV) in India. Virol. J., 2008, vol. 5, p. 156. doi: 10.1186/1743-422X-5-156
  21. Emekdas G., Tezcan S., Aslan G., Serin M.S., Sezgin O., Uçbilek E., Ulger M., Altıntaş E., Döğen A. Determination of hepatitis B virus genotypes in chronic hepatitis B patients in Mersin province, Turkey. Mikrobiyol. Bul., 2012, vol. 46, no. 3, pp. 432–445.
  22. Ezzikouri S., Pineau P., Benjelloun S. Hepatitis B virus in the Maghreb region: from epidemiology to prospective research. Liver Int., 2013, vol. 33, no. 6, pp. 811–819. doi: 10.1111/liv.12135
  23. Ferraro D., Urone N., Pizzillo P., Gussio M., Magliocco S., Cacopardo B., Craxì A., Di Marco V., Di Stefano R. Phylogenetic analysis of isolates from new cases of HBV infection in Southern Italy. Infect. Genet. Evol., 2012, vol. 12, no. 8, p. 1591. doi: 10.1016/j.meegid.2012.07.006
  24. Forbi J.C., Ben-Ayed Y., Xia G.L., Vaughan G., Drobeniuc J., Switzer W.M., Khudyakov Y.E. Disparate distribution of hepatitis B virus genotypes in four sub-Saharan African countries. J. Clin. Virol., 2013, vol. 58, no. 1, pp. 59–66.
  25. Kao J.H., Chen D.S. HBV genotypes: epidemiology and implications regarding natural history. Curr. Hepat. Rep., 2006, vol. 5, pp. 5–13.
  26. Kim B.K., Revill P.A., Ahn Sh. HBV genotypes: relevance to natural history, pathogenesis and treatment of chronic hepatitis B. Antivir. Ther., 2011, vol. 16, no. 8, pp. 1169–1186. doi: 10.3851/IMP1982
  27. Kramvis A., Kew M., François G. Hepatitis B virus genotypes. Vaccine, 2005, vol. 23, pp. 2409–2423. doi: 10.1016/j.vaccine.2004.10.045
  28. Kurbanov F., Tanaka Y., Mizokami M. Geographical and genetic diversity of the human hepatitis B virus. Hepatol. Res., 2010, vol. 40, pp. 14–30. doi: 10.1111/j.1872-034X.2009.00601.x
  29. Lin C.L., Kao J.H. Hepatitis B viral factors and clinical outcomes of chronic hepatitis B. J. Biomed. Sci., 2008, vol. 15, pp. 137–145.
  30. Lin C.L., Kao J.H. The clinical implications of hepatitis B virus genotype: Recent advances. J. Gastroenterol. Hepatol., 2011, suppl. 1, pp. 123–130. doi: 10.1111/j.1440-1746.2010.06541.x
  31. Ma M., He M., Liao L., Guo Y., Yu D., Xiong Z., Liu Y., Zeng P., Liao P. Molecular epidemiology and population dynamics of hepatitis B virus in Dianjiang County, Chongqing, China. Arch. Virol., 2014, vol. 159, no. 1, pp. 117–124. doi: 10.1007/s00705-013-1765-9
  32. Miyakawa Y., Mizokami M. Classifying hepatitis B virus genotypes. Intervirology, 2003, vol. 46, no. 6, pp. 329–338. doi: 10.1159/000074988
  33. Norder H., Hammas B., Löfdahl S., Couroucé A.M., Magnius L.O. Comparison of the amino acid sequences of nine different serotypes of hepatitis B surface antigen and genomic classification of the corresponding hepatitis B virus strains. J. Gen. Virol., 1992, vol. 73 (pt. 5), pp. 1201–1208. doi: 10.1099/0022-1317-73-5-1201
  34. Norder H., Courouce A.M., Magnius L.O. Complete genomes, phylogenetic relatedness, and structural proteins of six strains of the hepatitis B virus, four of which represent two new genotypes. Virology, 1994, vol. 198, pp. 489–503. doi: 10.1006/viro.1994.1060
  35. Okamoto H., Tsuda F., Sakugawa H., Sastrosoewignjo R.I., Imai M., Miyakawa Y., Mayumi M. Typing hepatitis B virus by homology in nucleotide sequence: comparison of surface antigen subtypes. J. Gen. Virol., 1988, vol. 69 (pt. 10), pp. 2575–2583. doi: 10.1099/0022-1317-69-10-2575
  36. Phung T.B., Alestig E., Nguyen T.L., Hannoun C., Lindh M. Genotype X/C recombinant (putative genotype I) of hepatitis B virus is rare in Hanoi, Vietnam: genotypes B4 and C1 predominate. J. Med. Virol., 2010, vol. 82, pp. 1327–1333. doi: 10.1002/jmv.21775
  37. Roman S., Panduro A. HBV endemicity in Mexico is associated with HBV genotypes H and G. World J. Gastroenterol., 2013, vol. 19, no. 33, pp. 5446–5453. doi: 10.3748/wjg.v19.i33.5446
  38. Schaefer S. Hepatitis B virus taxonomy and hepatitis B virus genotypes. World J. Gastroenterol., 2007, no. 13, pp. 14–21.
  39. Schaefer S., Magnius L., Norder H. Under construction: classification of hepatitis B virus genotypes and subgenotypes. Intervirology, 2009, vol. 52, pp. 323–325. doi: 10.1159/000242353
  40. Stuyver L., De Gendt S., Van Geyt C., Zoulim F., Fried M., Schinazi R.F., Rossau R. A new genotype of hepatitis B virus: complete genome and phylogenetic relatedness. J. Gen. Virol., 2000, vol. 81, pp. 67–74. doi: 10.1099/0022-1317-81-1-67
  41. Tatematsu K., Tanaka Y., Kurbanov F., Sugauchi F., Mano S., Maeshiro T., Nakayoshi T., Wakuta M., Miyakawa Y., Mizokami M. A genetic variant of hepatitis B virus divergent from known human and ape genotypes isolated from a Japanese patient and provisionally assigned to new genotype J. J. Virol., 2009, vol. 83, pp. 10538–10547. doi: 10.1128/JVI.00462-09
  42. Uchida Y., Kouyama J.I., Naiki K., Sugawara K., Inao M., Nakayama N., Mochida S. Novel hepatitis B virus strain developing due to recombination between genotypes H and B strains isolated from a Japanese patient. Hepatol. Res., 2014, vol. 44, no. 11, pp. 1130–1141. doi: 10.1111/hepr.12238
  43. Wang Z., Liu Z., Zeng G., Wen S., Qi Y., Ma S., Naoumov N.V., Hou J. A new intertype recombinant between genotypes C and D of hepatitis B virus identified in China. J. Gen. Virol., 2005, vol. 86, pp. 985–990. doi: 10.1099/vir.0.80771-0

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Герасимова В.В., Левакова И.А., Бичурина М.А., Максимова Н.Р., 2015

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах