ВЛИЯНИЕ COVID-19 НА СТРУКТУРУ МИКРОБИОТЫ РЕСПИРАТОРНОГО ТРАКТА У ПАЦИЕНТОВ С ТЯЖЕЛОЙ ПНЕВМОНИЕЙ
- Авторы: Золотов М.О.1, Козлов А.В.1, Шафигуллина Л.Р.1, Лямин А.В.1
-
Учреждения:
- Научный образовательно-профессиональный центр генетических и лабораторных технологий, ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет»
- Раздел: КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ
- Дата подачи: 28.03.2025
- Дата принятия к публикации: 01.08.2025
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/17903
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-TIO-17903
- ID: 17903
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Резюме
COVID-19, ослабляя иммунную систему организма, предрасполагает к присоединению бактериальных ко-инфекций. Увеличивается количество сообщений об изменении этиологической структуры возбудителей пневмонии вследствие изменения микробиоты легких после перенесенной вирусной пневмонии, влияния SARS-CoV-2 на иммунную систему, приема антибиотиков в рамках профилактики вторичной бактериальной коинфекции. Целью нашего исследования было проанализировать динамическое изменение структуры микробиоты дыхательных путей у пациентов с тяжелой пневмонией в период с 2019 г. по 2023 г. Материалы и методы. В исследовании участвовало 304 пациента с диагнозом пневмония, установленным после рентгенологической диагностики, с января 2019 г. по декабрь 2023 г. включительно. В период пандемии у всех исследованных пациентов был положительный результат ПЦР-теста на SARS-CoV-2, а в период после пандемии – отрицательный. Образцы мокроты доставляли в лабораторию, где проводили микробиологический посев с идентификацией методом MALDI-TOF масс-спектрометрии. В период до пандемии COVID-19 было проанализировано 62 образца мокроты. Наиболее часто встречались Klebsiella pneumoniae и Stenotrophomonas maltophilia – 21% и 17,7%. В равной степени были выделены Acinetobacter baumannii и Staphylococcus aureus – 14,5%. Streptococcus pneumoniae высевался в 8,1% случаев. В пандемию COVID-19 была проведена оценка 122 анализов, по результатам которых половину от всех выделенных микроорганизмов составил K. pneumoniae (50,8%). Вторым по встречаемости являлся A. baumanii – 23,8%. В период после пандемии было проанализировано 120 образцов, из которых преимущественно высевался вид K. pneumoniae (31,7%). Следующими по частоте обнаружений являлись S. aureus и A. baumannii. – 23,3% и 18,3% соответственно. Таким образом, было выявлено статистически значимое изменение частоты обнаружения грамположительных и грамотрицательных микроорганизмов у пациентов ОРИТ в исследуемые периоды. До пандемии COVID-19 доля грамотрицательных микроорганизмов в структуре возбудителей составляла 67,7%, в период пандемии – 91,0%, в постпандемийный – приблизилась к значениям 2019-2020 гг. и составила 70,0% (p<0,001). Наиболее часто высевались K. pneumoniae и A. baumannii, однако статистическая значимость изменений была установлена только для K. pneumoniae (p≤0,005). Отмечалось снижение частоты обнаружения пневмококка, однако статистическая значимость не была установлена. Частота выделения стафилококков в период после коронавирусной инфекции превысила допандемийные значения (p<0,001).
Ключевые слова
Об авторах
Максим Олегович Золотов
Научный образовательно-профессиональный центр генетических и лабораторных технологий, ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет»
Email: m.o.zolotov@samsmu.ru
SPIN-код: 8327-4019
кандидат медицинских наук, Заведующий лабораторией междисциплинарных связей Научного образовательно-профессионального центра генетических и лабораторных технологий.
Россия, 443079, Россия, Самара, ул. Гагарина, 20Андрей Владимирович Козлов
Научный образовательно-профессиональный центр генетических и лабораторных технологий, ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет»
Email: a.v.kozlov@samsmu.ru
ORCID iD: 0000-0001-9384-6854
SPIN-код: 6871-1845
кандидат медицинских наук, Заведующий лабораторией молекулярной патологии Научного образовательно-профессионального центра генетических и лабораторных технологий.
Россия, 443079, Россия, Самара, ул. Гагарина, 20Лилия Ринатовна Шафигуллина
Научный образовательно-профессиональный центр генетических и лабораторных технологий, ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет»
Автор, ответственный за переписку.
Email: l.r.shafigullina@samsmu.ru
ORCID iD: 0009-0009-2363-3701
SPIN-код: 3191-3673
специалист лаборатории молекулярной патологии Научного образовательно-профессионального центра генетических и лабораторных технологий.
Россия, 443079, Россия, Самара, ул. Гагарина, 20Артем Викторович Лямин
Научный образовательно-профессиональный центр генетических и лабораторных технологий, ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет»
Email: avlyamin@rambler.ru
ORCID iD: 0000-0002-5905-1895
доктор медицинских наук, директор Научно-образовательного профессионального центра генетических и лабораторных технологий
Россия, 443099, Россия, Самара, ул. Гагарина, 20
Список литературы
- Авдеева М.Г., Кулбужева М.И., Зотов С.В., Журавлева Е.В., Яцукова А.В. Микробный пейзаж у госпитальных больных с новой коронавирусной инфекцией COVID-19, сравнительная антибиотикорезистентность с «доковидным» периодом: проспективное исследование // Кубанский научный медицинский вестник. 2021. Т. 28, № 5, С 14-28.
- Временные методические рекомендации «Профилактика, диагностика, и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19)». Версия 18. От 26.10.2023 г.
- Иванова И.А., Омельченко Н.Д., Филиппенко А.В., Труфанова А.А., Носков А.К. Роль клеточного звена иммунитета в формировании иммунного ответа при коронавирусных инфекциях // Медицинская иммунология. 2021. Т.23, №6. С.1229-1238.
- Теплова Н.В., Ромашов О.М., Амелина Я.Г. Коронавирусная инфекция и бактериальная пневмония: актуальные акценты и курс на рациональную антибиотикотерапию // Лечебное дело. 2024. №1. С.8-14.
- Chen N., Zhou M., Dong X., Qu J., Gong F., Han Y., Qiu Y., Wang J., Liu Y., Wei Y., Xia J., Yu T., Zhang X., Zhang L. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study. Lancet., 2020, vol. 395, no. 10223, pp. 507-513.
- Chung Y.S., Lam C.Y., Tan P.H., Tsang H.F., Wong S.C. Comprehensive Review of COVID-19: Epidemiology, Pathogenesis, Advancement in Diagnostic and Detection Techniques, and Post-Pandemic Treatment Strategies. Int. J. Mol. Sci., 2024, vol. 25, no 15, pp. 8155.
- Fazel P., Sedighian H., Behzadi E., Kachuei R., Imani Fooladi A. A. Interaction Between SARS-CoV-2 and Pathogenic Bacteria. Curr Microbiol, 2023, vol. 80, no. 7, pp. 223.
- Hespanhol V., Bárbara C. Pneumonia mortality, comorbidities matter?. Pulmonology, 2020, vol. 26, no. 3, pp. 123-129.
- Juan C.H., Fang S.Y., Chou C.H., Tsai T.Y., Lin Y.T. Clinical characteristics of patients with pneumonia caused by Klebsiella pneumoniae in Taiwan and prevalence of antimicrobial-resistant and hypervirulent strains: a retrospective study. Antimicrob Resist Infect Control., 2020, vol. 9, no. 1, pp. 4.
- Lansbury L., Lim B., Baskaran V., Lim W.S. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J. Infect., 2020, vol. 81, no. 2, pp. 266–275.
- Mirzaei R., Goodarzi P., Asadi M., Soltani A., Aljanabi H. A. A., Jeda A. S., Dashtbin S., Jalalifar S., Mohammadzadeh R., Teimoori A., Tari K., Salari M., Ghiasvand S., Kazemi S., Yousefimashouf R., Keyvani H., Karampoor S. Bacterial co-infections with SARS-CoV-2. IUBMB Life, 2020, vol. 72, no. 10, pp. 2097-2111.
- Principi N., Autore G., Ramundo G., Esposito S. Epidemiology of Respiratory Infections during the COVID-19 Pandemic. Viruses, 2023, vol. 15, no. 5, pp. 1160.
- Sulayyim H.J.A., Ismail R., Hamid A.A., Ghafar N.A. Antibiotic Resistance during COVID-19: A Systematic Review. Int J Environ Res, 2022, vol. 19, no. 19, pp. 11931.
- Westblade L.F., Simon M.S., Satlin M.J. Bacterial Coinfections in Coronavirus Disease 2019. Trends Microbiol, 2021, vol. 29, no. 10, pp. 930-941.
Дополнительные файлы
