АССОЦИАЦИЯ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ ТОЛЛ-ПОДОБНЫХ РЕЦЕПТОРОВ (TLR-2, TLR-4 И TLR-6) С ИНФЕКЦИЕЙ SARS COV-2 В ЗАПАДНО-СИБИРСКОМ РЕГИОНЕ РОССИИ
- Авторы: Шевченко А.В.1, Прокофьев В.Ф.1, Коненков В.И.1, Карасева А.А.2, Афанасьева А.Д.2, Логвиненко И.И.2
-
Учреждения:
- Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» (НИИКЭЛ - филиал ИЦиГ СО РАН), Новосибирск, Российская Федерация
- Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины - филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» (НИИТПМ — филиал ИЦиГ СО РАН), г. Новосибирск, Российская Федерация
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
- Дата подачи: 28.02.2025
- Дата принятия к публикации: 18.05.2025
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/17871
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-ABT-17871
- ID: 17871
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Резюме
Наличие предшествующего сердечно-сосудистого заболевания является важным фактором риска тяжелого клинического течения COVID-19. Кроме того, COVID-19 часто усугубляется сердечно-сосудистыми осложнениями. Взаимосвязь между COVID-19 и сердечно-сосудистой системой представляется весьма сложной и не изученной. При заражении SARS-CoV-2 активируется врожденный иммунный ответ через семейство толл-подобных рецепторов (TLR). С другой стороны, важна роль TLR в патогенезе сердечно-сосудистых заболеваний. Цель исследования – проведение комплексного сравнительного анализа полиморфизма генов толл-подобных рецепторов TLR2 (rs5743708), TLR4 (rs4986790, rs4986791), TLR6 (rs5743810), у пациентов перенесших COVID-19 для выявления маркеров восприимчивости к развитию заболевания, тяжести течения и развитию сердечно-сосудистых осложнений. Обследовано 260 пациентов перенесших COVID-19 с разной степенью тяжести. Выделены группы с легкой, средней, тяжелой степенью протекания заболевания, группы с сердечно-сосудистыми проблемами в анамнезе и вновь выявленными после перенесенного заболевания. Однонуклеотидный полиморфизм TLR2 (rs5743708), TLR4 (rs4986790, rs4986791), TLR6 (rs5743810) анализировали методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Статистическая обработка проводилась с использованием программного пакета SPSS 23.0. Анализ частот аллелей и генотипов рассчитывали с использованием двухстороннего точного критерия Фишера, в случаях множественных сравнений вводилась поправка Бонферрони. Выявлено увеличение частоты TLR2 G аллельного варианта и GG генотипа у пациентов, перенесших инфекционное заболевание относительно популяционной группы. Гетерозиготность в данной позиции значимо снижена в группе переболевших. Не выявлено различий частот генотипов между группами с разной степенью протекания заболевания. Однако при анализе комплексов показано снижение частоты TLR2-753 ArgArg:TLR4-299 AspGly:TLR4-399 ThrThr у пациентов с объединенной средне - тяжелой формой протекания заболевания относительно перенесших его в легкой форме. Пациенты с ССЗ при наличии TLR4-299 AspAsp и комплекса TLR4-299 AspAsp:TLR4-399ThrThr достоверно чаще переносили COVID-19 в более тяжелой форме. Комплексные маркеры TLR4-299 AspGly:TLR4-399 ThrThr и TLR2-753 ArgArg:TLR4-299 AspGly:TLR4-399 ThrThr ассоциированы с более легким протеканием инфекционного процесса. Выявлено шесть комплексов, частота которых значимо выше у пациентов с развитием сердечно-сосудистых осложнений после перенесенного COVID-19. Полученные данные подтверждают, что однонуклеотидный полиморфизм генов толл-подобных рецепторов влияет на развитие и клинический полиморфизм характера течения COVID-19. Наши исследования свидетельствуют о необходимости перехода от оценки значимости отдельных генетических вариантов к разработке полигенных показателей риска с учетом межгенных взаимодействий, которые лучше подходят для оценки риска и прогрессирования заболевания путем одновременного анализа нескольких генетических вариантов и учетом популяционных особенностей анализируемых групп.
Об авторах
Алла Владимировна Шевченко
Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» (НИИКЭЛ - филиал ИЦиГ СО РАН), Новосибирск, Российская Федерация
Email: shalla64@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5898-950X
ведущий научный сотрудник лаборатории клиничеcкой иммуногенетики
РоссияВиктор Федорович Прокофьев
Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» (НИИКЭЛ - филиал ИЦиГ СО РАН), Новосибирск, Российская Федерация
Email: vf_prok@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-7290-1631
кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник лаборатории клинической иммуногенетики НИИКЭЛ - филиал ИЦиГ СО РАН
РоссияВладимир Иосифович Коненков
Научно-исследовательский институт клинической и экспериментальной лимфологии – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» (НИИКЭЛ - филиал ИЦиГ СО РАН), Новосибирск, Российская Федерация
Email: vikonenkov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-7385-6270
доктор медицинских наук, профессор, академик РАН, Научный руководитель НИИКЭЛ - филиал ИЦиГ СО РАН, руководитель лаборатории клинической иммуногенетики
РоссияАлександра Александровна Карасева
Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины - филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» (НИИТПМ — филиал ИЦиГ СО РАН), г. Новосибирск, Российская Федерация
Email: Sas96@bk.ru
ORCID iD: 0000-0002-0423-5021
мл.науч.сотрудник лаборатории генетических и средовых детерминант жизненного цикла человека НИИТПМ — филиал ИЦиГ СО РАН
РоссияАлёна Дмитриевна Афанасьева
Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины - филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» (НИИТПМ — филиал ИЦиГ СО РАН), г. Новосибирск, Российская Федерация
Email: alena.dmytryevna@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7875-1566
канд.мед.наук, зав. лабораторией генетических и средовых детерминант жизненного цикла человека НИИТПМ — филиал ИЦиГ СО РАН
РоссияИрина Ивановна Логвиненко
Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины - филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук» (НИИТПМ — филиал ИЦиГ СО РАН), г. Новосибирск, Российская Федерация
Автор, ответственный за переписку.
Email: 111157@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-1348-0253
д-р мед. наук, профессор, гл. науч. сотрудник лаборатории профилактической медицины НИИТПМ — филиал ИЦиГ СО РАН
РоссияСписок литературы
- Евдокимов А.В., Суслова Т.А., Беляева С.В., Бурмистрова А.Л., Сташкевич Д.С. Полиморфизм генов TLR и течение двусторонней пневмонии при COVID-19 // Медицинский академический журнал. 2021. Т. 21. № 4. C. 57-66. doi: 10.17816/MAJ90324 (Evdokimov A.V., Suslova T.A., Belyaeva S.V., Burmistrova A.L., Stashkevich D.S. Polymorphism of TLR genes and the course of COVID-19 bilateral pneumonia. Medical academic journal, 2021, vol. 21, no. 4, pp. 57-66. doi: 10.17816/MAJ90324)
- Наркевич А. Н., Виноградов К. А., Гржибовский А. М. Множественные сравнения в биомедицинских исследованиях: проблема и способы решения // Экология человека. 2020. № 10. С. 55–64. doi: 10.33396/1728-0869-2020-10-55-64 (Narkevich A. N., Vinogradov K. A., Grjibovski A. M. Multiple Comparisons in Biomedical Research: the Problem and its Solutions. Ekologiya cheloveka [Human Ecology]. 2020, no.10, pp. 55-64. doi: 10.33396/1728-0869-2020-10-55-64)
- Решетникова И.Д., Тюрин Ю.А., Мустафин И.Г., Агафонова Е.В., Шайхразиева Н.Д. Изучение молекулярно-генетических и иммунологических предикторов течения COVID-19 в группе риска «медицинские работники» // Инфекция и иммунитет. 2024. Т. 14. №2. C. 289-298. doi: 10.15789/2220-7619-AMG-10359 (Reshetnikova I.D., Tyurin Y.A., Mustafin I.G., Agafonova E.V., Shaуkhrazieva N.D. Assessing molecular genetic and immunological predictors of COVID-19 course in healthcare worker risk group. Russian Journal of Infection and Immunity, 2024, Vol. 14, no. 2, pp. 289-298. doi: 10.15789/2220-7619-AMG-10359)
- Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Временные методические рекомендации. Версия 15 (22.02.2022). М.: Министерство здравоохранения Российской Федерации, 2022. (Prevention, diagnosis and treatment of new coronavirus infection (COVID-19). Temporary methodological recommendations. Version 15 (02/22/2022). Moscow: Ministry of Health of the Russian Federation, 2022). URL: https://static-0.minzdrav.gov.ru/ system/attachments/attaches/000/059/392/original/ВМР_COVID-19_V15.pdf
- Aboudounya M.M., Heads R.J. COVID-19 and Toll-like receptor 4 (TLR4): SARS-CoV-2 may bind and activate TLR4 to increase ACE2 expression, facilitating entry and causing hyperinflammation. Hind. Mediat. Inflamm., 2021, Vol. 2021, Article ID 8874339, 18 page. doi: 10.1155/2021/8874339
- Akira S., Takeda K., Kaisho T. Toll-like receptors: critical proteins linking innate and acquired immunity. Nat Immunol., 2001, Vol. 2, no. 8, pp. 675-80. doi: 10.1038/90609
- Alhabibi A.M., Hassan A.S., Abd Elbaky N.M., Eid H.A., Khalifa M.A., Wahab M.A., Althoqapy A.A., Abdou A.E., Zakaria D.M., Nassef E.M., Kasim S.A., Saleh O.I., Elsheikh A.A., Lotfy M., Sayed A. Impact of Toll-Like Receptor 2 and 9 Gene Polymorphisms on COVID-19: Susceptibility, Severity, and Thrombosis. J Inflamm Res., 2023, Vol. 17, no. 16, pp. 665-675. doi: 10.2147/JIR.S394927
- Ali H.N., Niranji S.S., Al-Jaf S.M.A. Association of Toll-like receptor-4 polymorphism with SARS CoV-2 infection in Kurdish Population. Human Gene, 2022, Vol. 34, pp. 201115. doi: 10.1016/j.humgen.2022.201115
- Bagheri B., Feyzabadi Z.K., Nouri A., Azadfallah A., Ari M.M, Hemmati M., Darban M., Toosi P.A, Banihashemian S.Z. Atherosclerosis and Toll-Like Receptor4 (TLR4), Lectin-LikeOxidized Low-Density Lipoprotein-1 (LOX-1), and ProproteinConvertase Subtilisin/Kexin Type9 (PCSK9). Hindawi Mediators of Inflammation, 2024, Vol. 2024, Article ID 5830491, 13 pages. doi: 10.1155/2024/5830491
- Bakaros E., Voulgaridi I., Paliatsa V., Gatselis N., Germanidis G., Asvestopoulou E., Alexiou S., Botsfari E., Lygoura V., Tsachouridou O., Mimtsoudis I., Tseroni M., Sarrou S., Mouchtouri V.A., Dadouli K., Kalala F., Metallidis S., Dalekos G., Hadjichristodoulou C., Speletas M. Innate Immune Gene Polymorphisms and COVID-19 Prognosis. Viruses, 2023, Vol. 15, no. 9, pp. 1784. doi: 10.3390/v15091784
- Bavishi C., Bonow R.O., Trivedi V., Abbott J. D., Messerli F.H., Bhatt D.L. Special Article - Acute myocardial injury in patients hospitalized with COVID-19 infection: A review. Progress in Cardiovascular Diseases, 2020, Vol. 63, no. 5, pp. 682-689. doi: 10.1016/j.pcad.2020.05.013
- Brandão S.C.S., de Ramos J.O.X., Dompieri L.T., Godoi E.T.A.M., Figueiredo J.L., Sarinho E.S.C., Chelvanambi S., Aikawa M. Is Toll-like receptor 4 involved in the severity of COVID-19 pathology in patients with cardiometabolic comorbidities? Cytokine Growth Factor Rev., 2021, Vol. 58, pp. 102-110. doi: 10.1016/j.cytogfr.2020.09.002
- Chen R., Gu N., Gao Y., Cen W. TLR4 Asp299Gly (rs4986790) polymorphism and coronary artery disease: a meta-analysis. Peer J., 2015, 3:e1412. doi: 10.7717/peerj.1412.
- Choudhury A., Mukherjee S. In Silico Studies on the Comparative Characterization of the Interactions of SARS-CoV-2 Spike Glycoprotein with ACE-2 Receptor Homologs and Human TLRs. J. Med. Virol., 2020, Vol. 92, pp. 2105–2113. doi: 10.1002/jmv.25987
- Duan T., Du Y., Xing C., Wang H.Y., Wang R.-F. Toll-Like Receptor Signaling and Its Role in Cell-Mediated Immunity. Frontiers in Immunology, 2022, Vol 13, pp. 812774. doi: 10.3389/fimmu.2022.812774
- Flores-Gonzalez J., Chavez-Galan L., Falfán-Valencia R., Roldán I.B., Fricke-Galindo I., Veronica-Aguilar A., Martínez-Morales A., Hernández-Zenteno R.J., Guzmán-Guzmán I.P., Pérez-Rubio G. Variant rs4986790 of toll-like receptor 4 affects the signaling and induces cell dysfunction in patients with severe COVID-19. Int J Infect Dis., 2024, Vol. 138, pp. 102-109. doi: 10.1016/j.ijid.2023.11.032
- Fore F., Indriputri C., Mamutse J., Nugraha J. TLR10 and its unique antiinflammatory properties and potential use as a target in therapeutics. Immune Netw., 2020, Vol. 20, no. 3, pp. e21. doi: 10.4110/in.2020.20.e21
- Hold G.L., Berry S., Saunders K.A., Drew J., Mayer C., Brookes H., Gay N.J., El-Omar E.M., Bryant C.E. The TLR4 D299G and T399I SNPs are constitutively active to up-regulate expression of trif-dependent genes. PLoS One, 2014, Vol .9, Article e111460. doi: 10.1371/journal.pone.0111460
- Hua Z., Hou B. TLR Signaling in B-Cell Development and Activation. Cell Mol Immunol., 2013, Vol. 10, no. 2, pp. 103–106. doi: 10.1038/cmi.2012.6118
- Kemerley A., Gupta A., Thirunavukkarasu M., Maloney M., Burgwardt S., Maulik N. COVID-19 Associated Cardiovascular Disease - Risks, Prevention and Management: Heart at Risk Due to COVID-19. Review. Curr. Issues Mol. Biol., 2024, Vol. 46, no. 3, pp. 1904-1920. doi: 10.3390/cimb46030124
- Kiechl S., Lorenz E., Reindl M., Wiedermann C. J., Oberhollenzer F., Bonora E., Willeit J., Schwartz D.A. Toll-like Receptor 4 Polymorphisms and Atherogenesis. N Engl J Med., 2002, Vol. 347, no. 3, pp. 185-192. doi: 10.1056/NEJMoa012673
- Lester S.N., Li K. Toll-like receptors in antiviral innate immunity. J Mol Biol., 2014, Vol. 426, no. 6, pp. 1246-1264. doi: 10.1016/j.jmb.2013.11.024
- McClure R., Massari P. TLR-Dependent Human Mucosal Epithelial Cell Responses to Microbial Pathogens. Front Immunol, 2014, Vol. 5, pp. 386. doi: 10.3389/fimmu.2014.00386
- Mukherjee S., Bayry J. The Yin and Yang of TLR4 in COVID-19. Cytokine & Growth Factor Reviews, 2024, Vol. 24, pp. 1359-6101. doi: 10.1016/j.cytogfr.2024.10.001
- Ntchana A., Shrestha S., Pippin M. Cardiovascular Complications of COVID-19: A Scoping Review of Evidence. Cureus. 2023, Vol. 15, no. 11, pp. e48275. doi: 10.7759/cureus.48275
- Sharma S., Garg I., Ashraf M.Z. TLR signalling and association of TLR polymorphism with cardiovascular diseases. Vascul Pharmacol., 2016, Vol. 87, pp. 30-37. doi: 10.1016/j.vph.2016.10.008
- Sutmuller R.P.M., Morgan M.E., Netea M.G., Grauer O., Adema G.J. Toll-Like Receptors on Regulatory T Cells: Expanding Immune Regulation. Trends Immunol., 2006, Vol. 27, no. 8, pp. 387-93. doi: 10.1016/j.it.2006.06.005
- Taha S.I., Shata A.K., Baioumy S.A., Fouad S.H., Anis S.G., Mossad I.M., Moustafa N.M., Abdou D.M., Youssef M.K. Toll-Like Receptor 4 Polymorphisms (896A/G and 1196C/T) as an Indicator of COVID-19 Severity in a Convenience Sample of Egyptian Patients. J Inflamm Res., 2021, Vol. 14, pp. 6293-6303. doi: 10.2147/JIR.S343246
- Taha S.I., Shata A.K., El-Sehsah E.M., Mohamed M.F., Moustafa N.M., Youssef M.K. Comparison of COVID-19 characteristics in Egyptian patients according to their Toll-Like Receptor-4 (Asp299Gly) polymorphism. Infez Med., 2022, Vol. 30, pp. 96–103. doi: 10.53854/liim-3001-11
- Tapping R.I., Omueti K.O., Johnson C.M. Genetic polymorphisms within the human Toll-like receptor 2 subfamily. Biochem. Soc. Trans. journal., 2007, Vol. 35, no. Pt 6, pp. 1445-1448. doi: 10.1042/BST0351445
- Vidal-Perez R., Brandão M., Pazdernik M., Kresoja K.P., Carpenito M., Maeda S., Casado-Arroyo R., Muscoli S., Pöss J., Fontes-Carvalho R., Vazquez-Rodriguez J.M. Cardiovascular disease and COVID-19, a deadly combination: A review about direct and indirect impact of a pandemic. World J Clin Cases., 2022, Vol. 10, no. 27, pp. 9556-9572. doi: 10.12998/wjcc.v10.i27.9556
- Xie X. , Shi X., Liu M. The Roles of TLR Gene Polymorphisms in Atherosclerosis: A Systematic Review and Meta-Analysis of 35,317 Subjects. Scand J Immunol., 2017, Vol. 86, no. 1, pp. 50-58. doi: 10.1111/sji.12560
- Zacher C., Schönfelder K., Rohn H., Siffert W., Möhlendick B. The single nucleotide polymorphism rs4986790 (c.896A>G) in the gene TLR4 as a protective factor in corona virus disease 2019 (COVID-19). Front Immunol., 2024, Vol. 15, pp. 1355193. doi: 10.3389/fimmu.2024.1355193
- Zhang K., Zhang L., Zhou B., Wang Y., Song Y., Rao L., Zhang L. Lack of association between TLR4 Asp299Gly polymorphism and atherosclerosis: evidence from meta-analysis. Thrombosis Research, 2012, Vol, 130, no. 4, pp. e203-e208. doi: 10.1016/j.thromres.2012.07.008
- Zhang Y., Liu J., Wang C., Liu J., Lu W. Toll-Like receptors gene polymorphisms in autoimmune disease. Front. Immunol., 2021, Vol. 12, pp. 672346. doi: 10.3389/fimmu.2021.672346
- Zhao Y., Kuang M., Li J., Zhu L., Jia Z., Guo X., Hu Y., Kong J., Yin H., Wang X., You F. Publisher Correction: SARS-CoV-2 Spike Protein Interacts with and Activates TLR4. Cell Res., 2021, Vol. 31, pp. 825. doi: 10.1038/s41422-021-00501-0
- Zheng M., Karki R., Williams E.P., Yang D., Fitzpatrick E., Vogel P., Jonsson C.B., Kanneganti T.D. TLR2 Senses the SARS-CoV-2 Envelope Protein to Produce Inflammatory Cytokines. Nat. Immunol., 2021, Vol. 22, pp. 829–838. doi: 10.1038/s41590-021-00937-x
- Ziakas P.D., Prodromou M.L., Khoury J., Zintzaras E., Mylonakis E. The role of TLR4 896 A>G and 1196 C>T in susceptibility to infections: a review and meta-analysis of genetic association studies. PLoS One., 2013, Vol. 8, no. 11, pp. e81047. doi: 10.1371/journal.pone.0081047
Дополнительные файлы
