Роль генетических вариантов генов гемостаза в развитии венозных тромбозов у пациентов с атеросклерозом, перенесших инфекцию COVID-19

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. Новая коронавирусная инфекция — одна из важнейших проблем современной медицины. Одним из этиопатогенетических звеньев данного заболевания является нарушение в системе гемостаза, которое может быть ассоциировано с возникновением тромбозов различной локализации и с нарушением сосудистой циркуляции в мелких сосудах. Но нарушения свертывания могут патогенетически быть ассоциированы с атеросклеротическими процессами в сосудистом русле, которые могут активизироваться уже в возрасте 35–40 лет. Поэтому актуальным является изучение генетических факторов этиопатогенетической взаимосвязи COVID-19 с тромбогенными и атеросклеротическими патологическими процессами. Целью исследования было определение взаимосвязи между риском возникновения венозных тромбозов после перенесенной инфекции COVID-19 8 генетических вариантов (F2 20210G>A, F5 1691G>A, F7 10976G>A, F13 G>T, ITGA2 807C>T, ITGB3 1565 T>C, PAI-1-675 5G>4G) генов свертывающей системы у пациентов с атеросклерозом. Материалы и методы. Были обследованы 172 пациента в возрасте от 30 до 55 лет с признакими атерогенного поражения сосудов, у которых в течение года после перенесенной клинически выраженной COVID-19, подтвержденной методами молекулярно-генетической диагностики SARS-CoV-2, были выявлены эпизоды венозных тромбозов различных локализаций, и 151 пациент группы сравнения в возрасте от 30 до 54 лет, у которых после перенесенной инфекции данных эпизодов не наблюдалось. Молекулярно-генетический анализ генетических вариантов генов системы гемостаза проводился методом ПЦР в реальном времени с автоматическим анализом кривых плавления. Результаты. По результатам анализа ассоциации генетических вариантов с венозными тромбозами у пациентов, которые перенесли новую коронавирусную инфекцию, связь с данной патологией была установлена для 2 генетических вариантов, ITGA2 807C>T (TTOR = 5.59 (СI: 2.86–10.93, p < 0.001)) и ITGB3 1565 T>C (генотип СС, OR = 6.55 (СI: 2.23–19.22, p < 0.001)). Заключение. Таким образом, мы установили ассоциацию 2 генетических вариантов (ITGA2 807C>T и ITGB3 1565 T>C) с венозными тромбозами у пациентов с атеросклерозом, перенесших COVID-19.

Полный текст

Введение

Коронавирусы (СoV) (Coronoviridae) — семейство вирусов, содержащих в качестве генома одноцепочечную (+) РНК и специфические гликопротеидные шипы вокруг вирусного капсида, которые при электронном микрокопировании похожи на солнечную корону [14]. Семейство коронавирусов делится на несколько подсемейств, включающих четыре рода (от альфа до дельта), которые потенциально патогенны для различных видов млекопитающих, включая человека [6]. За последние 20 лет, кроме ранее известных четырех видов коронавирусов у человека, входящих в структуру сезонных ОРВИ, были описаны новые, более патогенные, виды данного семейства, а именно: SARS-CoV (подрод Sarbecovirus), описанный в 2002 г., и ставший в 2002–2003 гг. причиной вспышки атипичной пневмонии (тяжелый острый респираторный синдром — ТОРС, SARS) в Китае; MERS-CoV (подрод Merbecovirus), который 2012 г. вызвал вспышку ближневосточного респираторного синдрома в Саудовской Аравии и в 2015 г. — в Южной Корее (MERS), а также новый коронавирус SARS-CoV-2 (как и вирус атипичной пневмонии, относящийся к подроду Sarbecovirus), который привел к вспышке болезни, названной COVID-19, в китайской провинции Ухань, перешедшей в пандемию [8]. Высокая степень трансмиссии нового коронавируса (среднее медианное значение индекса репродукции 2,2, разброс 3,3–5,47), его способность, в отличие от вируса SARS-CoV, передаваться от человек к человеку и возможная тяжесть последствий заболевания СOVID19, вызываемого данным вирусом, превратили его в острейшую проблемы современной медицинской науки [7].

Исследование механизмов проявления патогенных свойств коронавирусаSARS-CoV-2 показало, что в клетки человека он инкорпорирует через рецепторы к ангиотензин-превращающему ферменту 2 типа (АПФ-2, ACE2), которые достаточно распространены в различных тканях [9]. Поэтому при COVID-19 потенциально могут поражаться не только дыхательная система, но и другие органы и ткани [9, 10, 14]. Таким образом, реализуется мультисистемный характер этиопатогенеза COVID-19 [3, 15, 18].

Показано, что с COVID-19 ассоциированы нарушения системы свертывания крови в виде повышения риска возникновения у пациентов венозных тромбозов различных локализаций, в частности, церебральных [4]. Вместе с тем известно, что тромбозы являются полигенным мультифакториальным заболеванием, в этиопатогенезе которого играют роль как внешние факторы (каким, потенциально, может быть перенесенная инфекция SARS-CoV-2), так и наследственная предрасположенность [1]. Был выявлен ряд генетических вариантов, обусловливающих дисфункцию факторов гемостаза, антикоагуляции и фибринолиза и объясняющих склонность больных к тому или иному виду нарушений в системе гемостаза [2, 13]. Одним из факторов риска развития венозных тромбозов является сопутствующее атерогенное поражение сосудов, что подтверждается рядом исследований [12, 16]. Поэтому, нам кажется интересным проанализировать взаимосвязь возникновения венозных тромбозов у пациентов с атеросклерозом, которые перенесли COVID-19, с рядом генетических вариантов генов системы свертывания крови.

Цель работы — провести анализ ассоциации между риском возникновения венозных тромбозов после перенесенной инфекции COVID-19 у пациентов с атерогенным поражением сосудов 8 генетических вариантов (F2 20210G>A, F5 1691G>A, F7 10976G>A, F13 G>T, ITGA2 807C>T, ITGB3 1565 T>C, PAI-1-675 5G>4G) генов системы гемостаза.

Материалы и методы

Были обследованы 172 пациента в возрасте от 30 до 55 лет (средний возраст — 39 лет) с установленным по данным УЗИ атерогенным поражением сосудов и лабораторными признаками дислипидемии (изменение липидограммы с повышением индекса атерогенности выше 4,0), у которых в течение года после перенесенной клинически выраженной COVID-19, подтвержденной методами молекулярно-генетической диагностики SARS-CoV-2 (ПЦР в реальном времени), были выявлены эпизоды венозных тромбозов различных локализаций, и 151 пациент группы сравнения также с признаками атеросклеротического поражения сосудов в возрасте от 30 до 54 лет (средний возраст 38 лет), у которых после перенесенной инфекции данных эпизодов не наблюдалось. Каждый участник исследование подписывал информированное согласие. Исследование было одобрено Этическим комитетом Ростовского государственного медицинского университета. Количество пациентов и индивидуумов группы сравнения, разделенных по тяжести перенесенного COVID-19 согласно анамнестическим данным, представлены в табл. 1.

 

Таблица 1. Распределение пациентов с венозными тромбозами и индивидуумов группы сравнения по степени тяжести перенесенного COVID-19

Table 1. Distribution of patients with venous thrombosis and comparison group individuals by severity of COVID-19

Степень тяжести перенесенного COVID-19

Severity of COVID-19

Пациенты

Patients

Группа сравнения

Comparison group

Легкая/Low

80

75

Средняя/Medium

83

73

Тяжелая/Hard

9

3

 

Из исследования были исключены пациенты, которые перенесли инфицирование SARS-CoV-2 бессимптомно или в крайне тяжелой форме, когда требовалась ИВЛ в ОРИТ, а также больные с рядом широко распространенных заболеваний, для этиопатогенеза которых характерны потенциальные нарушения свертывания крови: гипертоническая болезнь, а также диабет 2 типа.

ДНК выделялась из периферической крови набором «Проба-Рапид-Генетика» (ДНК-Технология, Россия). Молекулярно-генетическое исследование генетических вариантов (F2 20210G>A, F5 1691G>A, F7 10976G>A, F13 G>T, ITGA2 807C>T, ITGB3 1565 T>C, PAI-1-675 5G>4G) проводилось методом ПЦР в реальном времени с анализом кривых плавления с использованием набора «Кардиогенетика Тромбофилия» (ДНК-Технология, Россия) на детектирующем амплификаторе с 4 каналами детекции «ДТпрайм». Регистрация и учет результатов ПЦР проводился автоматически программным обеспечением для амплификатора. Для анализа ассоциации определенных генетических вариантов с венозными тромбозами использовались четырехпольные таблицы распределения с вычислением отношения шансов OR как критерия ассоциации с расчетом доверительного интервала CI. Статистический анализ проводился с использованием программы STATISTICA 8.0.

Результаты и обсуждение

По результатам анализа ассоциации отдельных генетических вариантов с венозными тромбозами у пациентов с атеросклерозом, которые перенесли COVID-19, связь с данной патологией была установлена для генетических вариантов ITGA2 807C>T, ITGB3 1565 T>C.

Абсолютные и относительные частоты аллельного распределения генетического варианта ITGA2 807C>T в группе сравнения и в исследуемой выборке даны в табл. 2.

 

Таблица 2. Частотное распределение генотипов генетического варианта ITGA2 807C>T в выборке пациентов с венозными тромбозами и в группе сравнения

Table 2. Frequency distribution of genotypes of the ITGA2 807C>T genetic variant in a sample of patients with venous thrombosis and in the comparison group

Генотип

Genotype

СС (частый генотип)

СС (common genotype)

(%)

СT (гетерозиготный генотип)

СT (heterozygous genotype)

(%)

TT (редкий генотип)

TT (rare genotype)

(%)

Общее количество

Summary

Больные/Patients

54 (31,5)

62 (36,0)

56 (32,5)

172

Группа сравнения

Comparison group

92 (61,0)

47 (31,1)

12 (7,9)

151

P

< 0,001

> 0,351

< 0,001

 

 

Мы проанализировали частоты генотипов CC, СT и TT в исследуемой выборке и в группе сравнения. Для редкого генотипа TTOR = 5,59 (СI: 2,86–10,93, p < 0,001), для гетерозиготного генотипа CT OR = 1,25 (СI: 0,78–1,98, p > 0,351), для частого генотипа СС OR = 0,29 (СI: 0,19–0,46, p < 0,001). Таким образом, мы видим, что с венозными тромбозами у лиц c признаками атеросклероза, перенесших COVID-19, ассоциирован редкий генотип TT. Интересно, что частый генотип по данному генетическому варианту ассоциирован с протективным эффектом. В литературе ассоциация данного варианта гена интегрина α2 была выявлена только у взрослых пациентов с отягощенным анамнезом по тромбофилическим состояниям без связи с перенесенным COVID-19 [5, 17].

Абсолютные и относительные частоты аллельного распределения генетического варианта ITGB3 1565 T>C в группе сравнения и в исследуемой выборке даны в табл. 3.

 

Таблица 3. Частотное распределение генотипов генетического варианта ITGB3 1565 T>C в выборке пациентов с венозными тромбозами и в группе сравнения

Table 3. Frequency distribution of genotypes of the ITGB3 1565 T>C genetic variant in the sample of patients with venous thrombosis and in the comparison group

Генотип

Genotype

TT (частый генотип)

TT (common genotype)

(%)

TC (гетерозиготный генотип)

TC (heterozygous genotype)

(%)

CC (редкий генотип)

CC (rare genotype)

(%)

Общее количество

Summary

Больные/Patients

99 (57,6)

47 (27,3)

26 (15,1)

172

Группа сравнения

Comparison group

108 (71,6)

39 (25,8)

4 (2,6)

151

 

После анализа частот генотипов TT, TC и CC в выборке пациентов с венозными тромбозами, которые перенесли коронавирусную инфекцию, и в группе сравнения получились следующие результаты: для редкого генотипа СС OR = 6,55 (СI: 2,23–19,22, p < 0,001); для гетерозиготного TCOR = 1,08 (СI: 0,66–1,77, p > 0,762), для частого TTOR составил 0,54 (СI: 0,34–0,86, p < 0,010). Таким образом, для данного генетического варианта ассоциация выявляется только для редкого гомозиготного генотипа СС, а частый генотип TT также показывает определенный протективный эффект. Таким образом, ген ITGB3 ассоциирован с наследственной предрасположенностью к тромбозам у пациентов c атеросклерозом, которые перенесли COVID-19. Ранее ассоциацию данного генетического варианта с тромбозами уже выявляли у взрослых пациентов с онкологической патологией, но также безучета перенесенного COVID-19 [11].

Заключение

Таким образом, мы установили ассоциацию 2 генетических вариантов (ITGA2 807C>T и ITGB3 1565 T>C) с венозными тромбозами у пациентов c атеросклерозом, которые переболели COVID-19. Следовательно, данные гены вносят вклад в наследственную предрасположенность к данной патологии и действуют в этиопатогенетической связке с вирусом SARS-CoV-2 и атерогенезом. Интересно, что ассоциацию показали гены интегринов, которые являются тромбоцитарными факторами гемостаза. Можно предположить, что возникающая при новой коронавирусной инфекции особенно, при тяжелом ее течении, гипоксия, потенциально, приводит к повреждению мембраны тромбоцитов, что в совокупности с определенными генетическими вариантами генов данных белков и при наличии сопутствующих атеросклеротических процессов на фоне нарушения обмена липопротеидов повышает риск тромбообразования. Резюмируя все выше сказанное, можно сделать вывод, что молекулярно-генетический анализ вариантов ITGA2 807C>T и ITGB3 1565 T>C можно рекомендовать пациентам с выявленным атеросклеротическим поражением сосудов, которые перенесли клинически выраженную инфекцию вирусом SARS-CoV-2, в качестве теста на предрасположенность к венозным тромбозам, что важно для профилактики данной патологии.

×

Об авторах

О. А. Перевезенцев

ФГБОУ ВО Ростовский государственный медицинский университет Минздрава РФ; ГБУ Научно-практический центр специализированной медицинской помощи детям им. В.Ф. Войно-Ясенецкого Департамента здравоохранения города Москвы

Автор, ответственный за переписку.
Email: PZPO@mail.ru

к.м.н., доцент кафедры персонализированной и трансляционной медицины ФГБОУ ВО Ростовский государственный медицинский университет Минздрава РФ; врач лабораторной генетики лаборатории клинико-диагностических и генетических исследований ГБУ Научно-практический центр специализированной медицинской помощи детям им. В.Ф. Войно-Ясенецкого Департамента здравоохранения города Москвы

Россия, Ростов-на-Дону; Москва

И. С. Мамедов

ГБУ Научно-практический центр специализированной медицинской помощи детям им. В.Ф. Войно-Ясенецкого Департамента здравоохранения города Москвы

Email: PZPO@mail.ru

к.м.н., ведущий научный сотрудник

Россия, Москва

Д. В. Бурцев

ФГБОУ ВО Ростовский государственный медицинский университет Минздрава РФ

Email: PZPO@mail.ru

д.м.н., профессор, зав. кафедрой персонализированной и трансляционной медицины 

Россия, Ростов-на-Дону

Список литературы

  1. Васильев С.А., Виноградов В.Л. Роль наследственности в развитии тромбозов // Тромбоз, гемостаз и реология. 2007. Т. 3. С. 32–40. [Vasil’yev S.A., Vinogradov V.L. The role of heredity in the development of thrombosis. Tromboz, gemostaz i reologiya = Thrombosis, Hemostasis and Rheology, 2007, vol. 3, pp. 32–40. (In Russ.)]
  2. Васильев С.А., Виноградов В.Л., Смирнов А.Н., Погорельская Е.П., Маркова М.Л. Тромбозы и тромбофилии: классификация, диагностика, лечение, профилактика // Русский медицинский журнал. 2013. Т. 17. С. 896–901. [Vasil’yev S.A., Vinogradov V.L., Smirnov A.N., Pogorel’skaya Ye.P., Markova M.L. Thrombosis and thrombophilia: classification, diagnosis, treatment, prevention. Russkii meditsinskii zhurnal = Russian Medical Journal, 2013, vol. 17, pp. 896–901. (In Russ.)]
  3. Перевезенцев О.А., Мамедов И.С., Крапивкин А.И. Ассоциация носительства SARS-CoV-2 c уровнем гиперметилированных форм аргинина в плазме крови как новых информативных биомаркеров эндотелиальной дисфункции // Лабораторная диагностика Восточная Европа. 2024. Т. 13, № 2. С. 209–218. [Perevezentsev O.A., Mamedov I.S., Krapivkin A.I. Association of SARS-CoV-2 carriage with the level of hypermethylated forms of arginine in blood plasma as new informative biomarkers of endothelial dysfunction. Laboratornaya diagnostika Vostochnaya Evropa = Laboratory Diagnostics Eastern Europe, 2024, vol. 13, no. 2, pp. 209–218. (In Russ.)] doi: 10.34883/PI.2024.13.2.001
  4. Сафина Д.Р., Гисматуллина Э.И., Есин Р.Г. Церебральные венозные тромбозы, ассоциированные с COVID-19 // Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. 2022. Т. 122, № 9. С. 128–131. [Safina D.R., Gismatullina E.I., Esin R.G. Cerebral venous thrombosis associated with COVID-19. Zhurnal nevrologii i psikhiatrii im. S.S. Korsakova = The Korsakov’s Journal of Neurology and Psychiatry, 2022, vol. 122, no. 9, pp. 128–131. (In Russ.)] doi: 10.17116/jnevro2022122091128
  5. Arterial Thromboembolism. Res. Pract. Thromb. Haemost., 2021, vol. 5 (suppl. 2): e12589. doi: 10.1002/rth2.12589
  6. Ashour H.M., Elkhatib W.F., Rahman M.M., Elshabrawy H.A. Insights into the recent 2019 Novel Coronavirus (SARS-CoV-2) in light of past human coronavirus outbreaks. Pathogens, 2020, vol. 9, no. 3: 186. doi: 10.3390/pathogens9030186
  7. Cascella M., Rajnik M., Cuomo A., Dulebohn S.C., Di Napoli R. Features, evaluation and treatment coronavirus (COVID-19). Stat Pearls Publishing, 2020. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK554776 (Accessed 3 Apr 2020)
  8. Center for Systems Science and Engineering. Coronavirus COVID-19 global cases. Johns Hopkins University, 2020. URL: https://coronavirus.jhu.edu/map.html (Accessed 3 Apr 2020)
  9. Chen Y., Guo Y., Pan Y., Zhao Z.J. Structure analysis of the receptor binding of 2019-nCoV. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2020, vol. 525, no. 1, pp. 135–140. doi: 10.1016/j.bbrc.2020.02.071
  10. Corman V.M., Landt O., Kaiser M., Molenkamp R., Meijer A., Chu D.K., Bleicker T., Brünink S., Schneider J., Schmidt M.L., Mulders D.G., Haagmans B.L., van der Veer B., van den Brink S., Wijsman L., Goderski G., Romette J.L., Ellis J., Zambon M., Peiris M., Goossens H., Reusken C., Koopmans M.P., Drosten C. Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) by real-time RT-PCR. Euro Surveill., 2020, vol. 25, no. 3: 2000045. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045
  11. Gunathilake K.M., Sirisena U.N., Nisansala P.K., Goonasekera H.W., Jayasekara R.W., Dissanayake V.H. The prevalence of the prothrombin (F2) 20210G>A mutation in a cohort of sri lankan patients with thromboembolic disorders. Indian J. Hematol. Blood Transfus., 2015, vol. 31, no. 3, pp. 356–361. doi: 10.1007/s12288-014-0452-7
  12. Guo Y.S., Yang N., Wang Z., Wei Y.M. Research progress on the pathogenesis and treatment of neoatherosclerosis. Curr. Med. Sci., 2024, vol. 44, no. 4, pp. 680–685. doi: 10.1007/s11596-024-2915-x
  13. Khan S., Dickerman J.D. Hereditary thrombophilia. Thromb. J., 2006, no. 4: 15. doi: 10.1186/1477-9560-4-15
  14. Paoli D., Pallotti F., Colangelo S., Basilico F., Mazzuti L., Turriziani O., Antonelli G., Lenzi A., Lombardo F. Study of SARS-CoV-2 in semen and urine samples of a volunteer with positive naso-pharyngeal swab. J. Endocrinol. Invest., 2020, vol. 43, no. 12, pp. 1819–1822. doi: 10.1007/s40618-020-01261-1
  15. Peng X., Xu X., Li Y., Cheng L., Zhou X., Ren B. Transmission routes of 2019-nCoV and controls in dental practice. Int. J. Oral Sci., 2020, vol. 12, no. 1: 9. doi: 10.1038/s41368-020-0075-9
  16. Protty M.B., Tyrrell V.J., Allen-Redpath K., Soyama S., Hajeyah A.A., Costa D., Choudhury A., Mitra R., Sharman A., Yaqoob P., Jenkins P.V., Yousef Z., Collins P.W., O’Donnell V.B. Thrombin generation is associated with extracellular vesicle and leukocyte lipid membranes in atherosclerotic cardiovascular disease. Arterioscler. Thromb Vasc. Biol., 2024, vol. 44, no. 9, pp. 2038–2052. doi: 10.1161/ATVBAHA.124.320902
  17. Weng Z., Li X., Li Y., Lin J., Peng F., Niu W. The association of four common polymorphisms from four candidate genes (COX-1, COX-2, ITGA2B, ITGA2) with aspirin insensitivity: a meta-analysis. PLoS One, 2013, vol. 8, no. 11: e78093. doi: 10.1371/journal.pone.0078093
  18. Xie C., Jiang L., Huang G., Pu H., Gong B., Lin H., Ma S., Chen X., Long B., Si G., Yu H., Jiang L., Yang X., Shi Y., Yang Z. Comparison of different samples for 2019 novel coronavirus detection by nucleic acid amplification tests. Int. J. Infect. Dis., 2020, vol. 93, pp. 264–267. doi: 10.1016/j.ijid.2020.02.050

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Перевезенцев О.А., Мамедов И.С., Бурцев Д.В., 2025

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах