РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНОТИПОВ ЦИТОМЕГАЛОВИРУСА, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ СРЕДИ НОВОРОЖДЕННЫХ ДЕТЕЙ САНКТ-ПЕТЕРБУРГА

  • Авторы: Иголкина А.А.1, Кусакин А.В.2, Маркин И.В.2, Голева О.В.2, Чухловин А.Б.3, Базиян Е.В.2, Эйсмонт Ю.А.2, Рогозина Н.В.4,5, Васильев В.В.4,6, Глотов О.С.7
  • Учреждения:
    1. Федеральное государственное бюджетное учреждение "Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства"
    2. Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства России
    3. НИИ детской онкологии, гематологии и трансфузиологии им. Р.М. Горбачевой, ПСПбГПМУ им. И.П. Павлова, Санкт-Петербург, Россия 197089, Россия, Санкт-Петербург, ул. Л. Толстого, 6/8, НИИ детской онкологии, гематологии и трансфузиологии им. Р.М. Горбачевой, ПСПбГПМУ им. И.П. Павлова. Тел./факс: 8 (812) 499-70-79
    4. ФГБУ Детский научно-клинический центр инфекционных болезней ФМБА России
    5. ФГБОУ ВО Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет Минздрава России
    6. ФГБОУ ВО Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова
    7. Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства России НИИ АГиР им. Д.О. Отта
  • Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ
  • Дата подачи: 14.11.2024
  • Дата принятия к публикации: 23.03.2025
  • URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/17814
  • DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-DOC-17814
  • ID: 17814


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Целью данного исследовании было провести генотипирование трех наиболее полиморфных участков генома цитомегаловируса (ЦМВ): UL55 (gB), UL73 (gN), UL75 (gH) у новорожденных детей с врожденной цитомегаловирусной инфекцией (ЦМВИ), для определения распределения генотипов, циркулирующих в настоящей когорте пациентов на территории Санкт-Петербурга и сравнения этих генотипов с генотипами цитомегаловируса циркулирующего в мире и Российской Федерации. Исследование было выполнено на базе Детского научно-клинического центра инфекционных болезней ФМБА России. В исследование были включены 61 образец ДНК, выделенной из крови, слюны, мочи от 26 младенцев с клиническими проявлениями врожденной ЦМВИ. Применялись молекулярно-генетические методы - выделение ДНК вируса из образцов, затем качественное выявление ДНК ЦМВ в исследуемых образцах путем амплификации специфического фрагмента ДНК вируса методом ПЦР с детекцией продуктов амплификации в реальном времени, подготовка библиотек для секвенирования с обогащение библиотек за счет гибридизации с мечеными олигонуклеотидами. Полученных данные секвенирования были обработаны биоинформатическими методами.  По результатам исследования отмечено, что полученные результаты секвенирования ДНК ЦМВ из различных образцов биоматериала неоднородны. Так, в образцах мочи и слюны генотипы с удовлетворительным покрытием (по данным секвенирования) всех трех исследуемых регионов были получены чаще, по сравнению с периферической кровью. При анализе распределения генотипов региона UL55 преобладал генотип gB7, который был определен у 50% новорожденных пациентов. Анализ полученных данных секвенирования региона UL73 позволил выявить доминантный генотип gN4c (37,5%). По результатам секвенирования региона UL75 ЦМВ, кодирующего гликопротеин H, генотипы gH1 и gH2 распределились одинаково по 50%. При сравнении полученных генотипов в настоящем исследовании с похожими исследованиями в мире и России выявлены различия в нуклеотидной последовательности определяемых регионов цитомегаловируса. Филогенетический анализ ЦМВ позволил проиллюстрировать неоднородность распределения генных вариантов ЦМВ среди новорожденных детей Санкт-Петербурга.

Об авторах

Александра Александровна Иголкина

Федеральное государственное бюджетное учреждение "Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства"

Email: gribanovaalal@bk.ru
ORCID iD: 0009-0000-4310-9741

Аспирант НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и биобанкинга 

Россия, г. Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д. 9

Алексей Викторович Кусакин

Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства России

Email: kusakinax@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-9546-7831

лаборант-исследователь НИО экспериментальной медицинской вирусологии

197022, Россия, г. Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д. 9

Иван Васильевич Маркин

Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства России

Email: i.v.markin@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-9922-401X

аспирант НИО врожденных инфекционных заболеваний 

197022, Россия, г. Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д. 9

Ольга Владимировна Голева

Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства России

Email: golev.ao@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-3285-9699

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и биобанкинга 

197022, Россия, г. Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д. 9

Алексей. Борисович Чухловин

НИИ детской онкологии, гематологии и трансфузиологии им. Р.М. Горбачевой, ПСПбГПМУ им. И.П. Павлова, Санкт-Петербург, Россия 197089, Россия, Санкт-Петербург, ул. Л. Толстого, 6/8, НИИ детской онкологии, гематологии и трансфузиологии им. Р.М. Горбачевой, ПСПбГПМУ им. И.П. Павлова. Тел./факс: 8 (812) 499-70-79

Email: alexei.chukh@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-9449-574X

д.м.н., профессор, НИИ детской онкологии, гематологии и трансфузиологии им. Р.М. Горбачевой, ПСПбГПМУ им. И.П. Павлова, Санкт-Петербург, Россия

Россия

Елена Владимировна Базиян

Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства России

Email: waz2107gen@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-7837-3315

младший научный сотрудник НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и биобанкинга 

197022, Россия, г. Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д. 9;

Юрий Александрович Эйсмонт

Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства России

Email: y-eis@inbox.ru
ORCID iD: 0000-0002-4828-8053

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и биобанкинга

197022, Россия, г. Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д. 9;

Наталия Васильевна Рогозина

ФГБУ Детский научно-клинический центр инфекционных болезней ФМБА России; ФГБОУ ВО Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет Минздрава России

Email: lelekin96@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-0968-6291

к.м.н., старший научный сотрудник научно-исследовательского отдела врожденных инфекционных заболеваний; доцент кафедры инфекционных заболеваний у детей ФП и ДПО 

Санкт-Петербург 

Россия

Валерий Викторович Васильев

ФГБУ Детский научно-клинический центр инфекционных болезней ФМБА России; ФГБОУ ВО Северо-Западный государственный медицинский университет им. И.И. Мечникова

Email: vcubed@ya.ru
ORCID iD: 0000-0003-2579-2799

Васильев Валерий Викторович,  д.м.н., профессор, зав. научно-исследовательским отделом врожденных инфекционных заболеваний; профессор кафедры инфекционных болезней 

191015, Cанкт-Петербург, ул. Профессора Попова, 9

Тел.: 8 (812) 234-60-04 (служебн.), 8 921 940-93-84 (моб.),

Факс: 8 (812) 234-96-91

Россия

Олег Сергеевич Глотов

Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства России

НИИ АГиР им. Д.О. Отта

Автор, ответственный за переписку.
Email: olglotov@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-0091-2224

доктор биологических наук, заведующий НИО экспериментальной медицинской вирусологии, молекулярной генетики и биобанкинга ФГБУ ДНКЦИБ ФМБА России;

ведущий научный сотрудник лаборатории пренатальной диагностики наследственных и врожденных заболеваний человека НИИ АГиР им. Д.О. Отта

197022, Россия, г. Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д. 9

Список литературы

  1. Ванькова О. Е., Алексеева А. Е., Бруснигина Н. Ф. Молекулярное типирование цитомегаловирусов, циркулирующих среди населения Нижнего Новгорода // Молекулярная диагностика 2017 : сборник трудов IХ Всероссийской научно-практической конференции с международным участием. 2017. Vol. 2. P. 310–311. Vankova O. E., Alekseeva A. E., Brusnigina N. F. Molecular typing of cytomegaloviruses circulating among the population of Nizhny Novgorod // Molecular diagnostics 2017: collection of proceedings of the IX All-Russian scientific and practical conference with RIAC. 2017. Vol. 2. pp. 310–311. chrome extension://efaidnbmnnnibpcajpcglclefindmkaj/https://kpfu.ru/staff_files/F1634184337/Tom_2_s_oblozhkoj.pdf
  2. Ванькова О.Е., Бруснигина Н.Ф. Молекулярная и филогенетическая характеристика изолятов цитомегаловируса, выделенных у детей Нижнего Новгорода. Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2021;(4):25-30. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-337-4-25-30. Vankova O.E., Brusnigina N.F. Molecular and Phylogenetic Characteristics of Cytomegaloviruses Isolated from Children in Nizhny Novgorod. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2021;(4):25-30. (In Russ.) https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-337-4-25-30 https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-337-4-25-30
  3. Ванькова О.Е., Бруснигина Н.Ф. Генотипирование клинических изолятов цитомегаловируса, выделенных у реципиентов солидных органов // Инфекция и иммунитет. - 2022. - Т. 12. - №1. - C. 59-68. doi: 10.15789/2220-7619-GCC-1653. Vankova O.E., Brusnigina N.F. Genotyping clinical cytomegalovirus isolates in solid-organs-transplant recipients // Russian Journal of Infection and Immunity. - 2022. - Vol. 12. - N. 1. - P. 59-68. doi: 10.15789/2220-7619-GCC-1653 doi: 10.15789/2220-7619-GCC-1653
  4. Ванькова О.Е., Бруснигина Н.Ф., Новикова Н.А. NGS-технология в мониторинге генетического разнообразия штаммов цитомегаловируса // Соврем. технол. мед. 2023; 15(2): 41, https://doi.org/10.17691/stm2023.15.2.04 Vankova O.E., Brusnigina N.F., Novikova N.A. NGS technology in monitoring the genetic diversity of cytomegalovirus strains. Sovremennye tehnologii v medicine 2023; 15(2): 41, https://doi.org/10.17691/stm2023.15.2.04 https://doi.org/10.17691/stm2023.15.2.04
  5. Васильев В.В., Рогозина Н.В., Маркин И.В. Современные представления о механизмах развития врожденной цитомегаловирусной инфекции. Журнал инфектологии. 2023;15(2):35-46. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2023-15-2-35-46. Vasil’ev V.V., Rogozina N.V., Markin I.V. Modern concepts of the mechanisms of congenital cytomegalovirus infection development. Journal Infectology. 2023;15(2):35-46. (In Russ.) https://doi.org/10.22625/2072-6732-2023-15-2-35-46
  6. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2023-15-2-35-46.
  7. Демин М.В., Тихомиров Д.С., Бидерман Б.В., Глинщикова О.А., Дроков М.Ю., Судариков А.Б. и др. Мутации в гене UL97 цитомегаловируса, ассоциированные с устойчивостью к ганцикловиру, у реципиентов аллогенных гемопоэтических стволовых клеток. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2019; 21(4): 352–7. https://doi.org/10.36488/ cmac.2019.4.352-357. Demin M.V., Tikhomirov D.S., Biderman B.V., Glinshchikova O.A., Drokov M.Yu., Sudarikov A.B., et al. Mutations in the cytomegalovirus UL97 gene associated with ganciclovir resistance in recipients of allogeneic hematopoietic stem cell transplants. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. 2019; 21(4): 352–7. https://doi.org/10.36488/cmac.2019.4.352-357 https://doi.org/10.36488/ cmac.2019.4.352-357.
  8. Рогозина Н.В., Васильев В.В., Иванова Р.А., Ушакова Г.М., Безверхая Н.С. Поражения органов и систем у детей, родившихся от матерей с острой цитомегаловирусной инфекцией // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2023. Т. 12, № 2. С. 57-64. DOI: https://doi.org/10.33029/2305-3496-2023-12-2-57-64. Rogozina N.V., Vasil’ev V.V., Ivanova R.A., Ushakova G.M., Bezverkhaya N.S. Lesions of organs and systems in children born from mothers with acute cytomegalovirus infection. Infektsionnye bolezni: novosti, mneniya, obuchenie [Infectious Diseases: News, Opinions, Training]. 2023; 12 (2): 57–64. DOI: https://doi.org/10.33 029/2305-3496-2023-12-2-57-64 https://doi.org/10.33029/2305-3496-2023-12-2-57-64.
  9. Шахгильдян В.И., Александрова Е.П., Козырина Н.В., Шипулина О.Ю., Додонова Э.А., Шахгильдян Н.В. Цитомегаловирусная инфекция у беременных и новорожденных: эпидемиологический анализ, новые подходы к диагностике и лечению // Акушерство и гинекология: новости, мнения, обучение. 2020. Т. 8, № 2. С. 80-94. doi: 10.24411/2303-9698-2020-12008. Shakhgildyan V.I., Alexandrova E.P., Kozyrina N.V., Shipulina O.Yu., Domonova E.A., Shakhgildian N.V. Cytomegalovirus infection in pregnant women and newborns: epidemiological analysis, new approaches to diagnosis and treatment. Akusherstvo i ginekologiya: novosti, mneniya, obuchenie [Obstetrics and Gynecology: News, Opinions, Training]. 2020; 8 (2): С. 80–94. doi: 10.24411/2303-9698-2020-12008 doi: 10.24411/2303-9698-2020-12008.
  10. Лобзин Ю.В., Жданов К.В., Руководство по инфекционным болезням в 2 кн. Кн.2. 2011. 744 p. Lobzin Yu.V., Zhdanov K.V., Guide to infectious diseases in 2 books. Book 2. 2011. 744 p.
  11. Ahmad J, Sayedy N, Sanivarapu R, Akella J, Iqbal J. CMV Pancreatitis in an Immunocompromised Patient. Case Rep Crit Care. 2021 Feb 19; 2021:8811396. doi: 10.1155/2021/8811396. doi: 10.1155/2021/8811396.
  12. Dong N, Cao L, Su L, Lu L, Dong Z, Xu M, Xu J. Human cytomegalovirus envelope glycoprotein B, H, and N polymorphisms among infants of Shanghai area in China. J Med Virol. 2020 Dec;92(12):3674-3681. doi: 10.1002/jmv.26210. doi: 10.1002/jmv.26210.
  13. Dong N, Cao L, Zheng D, Su L, Lu L, Dong Z, Xu M, Xu J. Distribution of CMV envelope glycoprotein B, H and N genotypes in infants with congenital cytomegalovirus symptomatic infection. Front Pediatr. 2023 Mar 15;11:1112645. doi: 10.3389/fped.2023.1112645. doi: 10.3389/fped.2023.1112645.
  14. Fernandez, C., Chasqueira, MJ., Marques, A. et al. Lower prevalence of congenital cytomegalovirus infection in Portugal: possible impact of COVID-19 lockdown?. Eur J Pediatr 181, 1259–1262 (2022). https://doi.org/10.1007/s00431-021-04271-0 https://doi.org/10.1007/s00431-021-04271-0
  15. Grgic I, Gorenec L. Human Cytomegalovirus (HCMV) Genetic Diversity, Drug Resistance Testing and Prevalence of the Resistance Mutations: A Literature Review. Trop Med Infect Dis. 2024 Feb 15;9(2):49. doi: 10.3390/tropicalmed9020049. doi: 10.3390/tropicalmed9020049.
  16. Hu H, Cheng Y, Peng Q, Chen K. Clinical Features, Treatment Courses, and Distribution of Cytomegalovirus Genotypes among Thrombocytopenia Patients Aged Younger than 12 Months. Am J Perinatol. 2021 Nov;38(13):1403-1411. doi: 10.1055/s-0040-1713001. doi: 10.1055/s-0040-1713001.
  17. Hu H, Peng W, Peng Q, Cheng Y. Cytomegalovirus Genotype Distribution among Congenital and Perinatal Infected Patients with CMV-Associated Thrombocytopenia. Fetal Pediatr Pathol. 2022 Feb;41(1):77-86. doi: 10.1080/15513815.2020.1765916. doi: 10.1080/15513815.2020.1765916.
  18. Kenneson A, Cannon MJ. Review and meta-analysis of the epidemiology of congenital cytomegalovirus (CMV) infection. Rev Med Virol. 2007 Jul-Aug;17(4):253-76. doi: 10.1002/rmv.535. doi: 10.1002/rmv.535.
  19. Min X, Wang L, Cui A, Zhang C, Wang D, Liu Y, Li Z, Xu W. The nucleic acid positive rate and genotype distribution of human cytomegalovirus in human milk banks in China. Arch Virol. 2020 May;165(5):1099-1107. doi: 10.1007/s00705-020-04573-y. doi: 10.1007/s00705-020-04573-y.
  20. Mirsalehi N, Yavarian J, Ghavami N, Naseri M, Khodakhah F, Shatizadeh Malekshahi S, Zadheidar S, Mokhtari-Azad T, Shafiei-Jandaghi NZ. Congenital cytomegalovirus infection in newborns suspected of congenital rubella syndrome in Iran: a cross-sectional study. BMC Pediatr. 2024 Jan 10;24(1):31. doi: 10.1186/s12887-023-04502-3. doi: 10.1186/s12887-023-04502-3.
  21. Mu H, Qiao W, Zou J, Zhang H. Human cytomegalovirus glycoprotein B genotypic distributions and viral load in symptomatic infants. J Infect Dev Ctries. 2023 Dec 31;17(12):1806-1813. doi: 10.3855/jidc.18291. doi: 10.3855/jidc.18291.
  22. Mujtaba G, Khurshid A, Sharif S, Alam MM, Aamir UB, Shaukat S, Angez M, Rana MS, Umair M, Shah AA, Zaidi SS. Distribution of Cytomegalovirus Genotypes among Neonates Born to Infected Mothers in Islamabad, Pakistan. PLoS One. 2016 Jul 1;11(7):e0156049. doi: 10.1371/journal.pone.0156049. doi: 10.1371/journal.pone.0156049.
  23. Nguyen CC, Kamil JP. Pathogen at the Gates: Human Cytomegalovirus Entry and Cell Tropism. Viruses. 2018 Dec 11;10(12):704. doi: 10.3390/v10120704. doi: 10.3390/v10120704.
  24. Paradowska E, Jabłońska A, Studzińska M, Kasztelewicz B, Wiśniewska-Ligier M, Dzierżanowska-Fangrat K, Woźniakowska-Gęsicka T, Czech-Kowalska J. Distribution of the CMV glycoprotein gH/gL/gO and gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131A complex variants and associated clinical manifestations in infants infected congenitally or postnatally. Sci Rep. 2019 Nov 8;9(1):16352. doi: 10.1038/s41598-019-52906-y. doi: 10.1038/s41598-019-52906-y.
  25. Pignatelli S, Dal Monte P, Rossini G, Landini MP. Genetic polymorphisms among human cytomegalovirus (HCMV) wild-type strains. Rev Med Virol. 2004 Nov-Dec;14(6):383-410. doi: 10.1002/rmv.438. doi: 10.1002/rmv.438.
  26. Puhakka L, Pati S, Lappalainen M, Lönnqvist T, Niemensivu R, Lindahl P, Nieminen T, Seuri R, Nupponen I, Boppana S, Saxen H. Viral shedding, and distribution of cytomegalovirus glycoprotein H (UL75), glycoprotein B (UL55), and glycoprotein N (UL73) genotypes in congenital cytomegalovirus infection. J Clin Virol. 2020 Apr;125:104287. doi: 10.1016/j.jcv.2020.104287. doi: 10.1016/j.jcv.2020.104287.
  27. Ross SA, Fowler KB, Ashrith G, Stagno S, Britt WJ, Pass RF, Boppana SB. Hearing loss in children with congenital cytomegalovirus infection born to mothers with preexisting immunity. J Pediatr. 2006 Mar;148(3):332-6. doi: 10.1016/j.jpeds.2005.09.003. doi: 10.1016/j.jpeds.2005.09.003.
  28. Sapuan S, Theodosiou AA, Strang BL, Heath PT, Jones CE. A systematic review and meta-analysis of the prevalence of human cytomegalovirus shedding in seropositive pregnant women. Rev Med Virol. 2022; 32(6):e2399. https://doi.org/10.1002/rmv.2399. https://doi.org/10.1002/rmv.2399.
  29. Sarkar A, Das D, Ansari S, Chatterjee RP, Mishra L, Basu B, Ghosh SK, Bhattacharyay M, Chakraborty N. Genotypes of glycoprotein B gene among the Indian symptomatic neonates with congenital CMV infection. BMC Pediatr. 2019 Aug 22;19(1):291. doi: 10.1186/s12887-019-1666-5. doi: 10.1186/s12887-019-1666-5.
  30. Wang HY, Valencia SM, Pfeifer SP, Jensen JD, Kowalik TF, Permar SR. Common Polymorphisms in the Glycoproteins of Human Cytomegalovirus and Associated Strain-Specific Immunity. Viruses. 2021 Jun 9;13(6):1106. doi: 10.3390/v13061106. doi: 10.3390/v13061106.
  31. White JL, Patel EU, Abraham AG, Grabowski MK, Arav-Boger R, Avery RK, Quinn TC, Tobian AAR. Prevalence, Magnitude, and Genotype Distribution of Urinary Cytomegalovirus (CMV) Shedding Among CMV-Seropositive Children and Adolescents in the United States. Open Forum Infect Dis. 2019 Jun 5;6(7):ofz272. doi: 10.1093/ofid/ofz272. doi: 10.1093/ofid/ofz272.
  32. Zuhair M, Smit GSA, Wallis G, et al. Estimation of the worldwide seroprevalence of cytomegalovirus: A systematic review and meta-analysis. Rev Med Virol. 2019; 29:e2034. https://doi.org/10.1002/rmv.2034. https://doi.org/10.1002/rmv.2034.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Иголкина А.А., Кусакин А.В., Маркин И.В., Голева О.В., Чухловин А.Б., Базиян Е.В., Эйсмонт Ю.А., Рогозина Н.В., Васильев В.В., Глотов О.С.,

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах