Ускоренный метод определения «свой-чужой» микроорганизмов в реакции агглютинации

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Предложен простой ускоренный метод определения «свой—чужой» микроорганизмов в реакции агглютинации (РА) лечебно-профилактической сывороткой отечественного производства (КИП, лиофилизат иммуноглобулинов IgG, IgA, IgM, разработанный ЗАО «Иммуно-Гем», Москва), тестируемых патогенных, условно-патогенных и доминантных бифидобактерий пробиотического ряда. Параллельно все изученные культуры, зарегистрированные в базах отечественных и международных коллекций, были тестированы методом межмикробного распознавания «свой—чужой», ранее разработанным нами. Было протестировано 16 коллекционных штаммов различных микроорганизмов в РА с указанной лечебно-профилактической сывороткой. Материалом для исследования послужили коллекционные штаммы бактерий Bifidobacterium bifidum 791, Escherichia coli ЛЭГМ-18, Klebsiella pneumoniae 278, Lactobacillus fermentum 90Т-С4, Bifidobacterium longum МС-42, Escherichia coli M-17, Shigella sonnei 177б, Shigella flexneri 170, Escherichia coli 157, Staphylococcus aureus 209, Candida albicans 10231 и Salmonella серовар Enteritidis ATCC 10708. Также в работе были использованы культуры из музея ИКВС УрО РАН, Bifidobacterium longum ICIS-505, Lactobacillus acidophilus ICIS-1127, Bifidobacterium bifidum ICIS-202, Bifidobacterium bifidum ICIS-310. Для оценки чужеродности пептидогликана микроорганизмов был также использован метод межмикробного распознавания «свой—чужой» на основе индукции метаболитов тест-штамма Bifidobacterium longum MC-42 как «доминанта», путем предварительного соинкубирования с метаболитами исследуемых культур («ассоциантов») и формирования обратной связи в паре «доминант— ассоциант». Оценка результата проводилась по изменению параметров репродукции (рост/размножение) и адаптации (образование биопленок и антилизоцимный тест) микробных культур в соответствии с описанной методикой, после чего производилось сравнение результатов, полученных с использованием этих двух методов микробного распознавания «свой—чужой». Все полученные результаты в РА полностью совпадали с результатами исследований, проведенных ранее методом межмикробного распознавания «свой—чужой» в паре «доминант—ассоциант». Если к этому добавить простоту постановки РА и затраченное на получение результата время (1 сутки против 5 суток при межмикробном распознавании), то РА становится более предпочтительным методом для скрининговых исследований по отбору штаммов для научных и производственных целей.

Об авторах

О. В. Бухарин

Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН

Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-6039-5265
http://prof-ras.ru/index.php?option=com_k2&view=item&id=104-%D0%BF%D0%B5%D1%80%D1%83%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%B0-%D0%BD%D0%B0%D1%82%D0%B0%D0%BB%D1%8C%D1%8F-%D0%B1%D0%BE%D1%80%D0%B8%D1%81%D0%BE%D0%B2%D0%BD%D0%B0

Доктор медицинских наук, профессор, главный научный сотрудник Института клеточного и внутриклеточного симбиоза.

Оренбург Россия

Н. Б. Перунова

Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: perunovanb@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-6352-8879
http://prof-ras.ru/index.php?option=com_k2&view=item&id=104-%D0%BF%D0%B5%D1%80%D1%83%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%B0-%D0%BD%D0%B0%D1%82%D0%B0%D0%BB%D1%8C%D1%8F-%D0%B1%D0%BE%D1%80%D0%B8%D1%81%D0%BE%D0%B2%D0%BD%D0%B0

Перунова Наталья Борисовна - доктор медицинских наук, профессор РАН, ведущий научный сотрудник (с исполнением обязанностей зав. лабораторией) лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований Института клеточного и внутриклеточного симбиоза.

460000, Оренбург, ул. Пионерская, 11, Тел.: 8 922 555-30-80

Россия

И. Н. Чайникова

Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН

Email: inchainicova@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-8923-8829

Доктор медицинских наук, профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории биомониторинга и молекулярногенетических исследований Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН.

Оренбург

Россия

Е. В. Иванова

Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН

Email: walerewna13@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-4974-8947

Доктор медицинских наук, доцент, ведущий научный сотрудник лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН.

Оренбург

Россия

С. В. Андрющенко

Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН

Email: rattus000@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-1691-7588

Кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН.
Оренбург

Россия

Список литературы

  1. Андрющенко С.В., Перунова Н.Б., Бухарин О.В. Молекулярные механизмы взаимодействия бактерий с лизоцимом и их роль в микросимбиоценозе // Успехи современной биологии. 2015. Т. 135, № 5. С. 453—463.
  2. Бухарин О.В. Инфекционная симбиология — новое понимание старых проблем // Вестник РАН. 2016. Т. 86, № 10. С. 915—920. doi: 10.7868/S0869587316070033 (In Russ.)
  3. Бухарин О.В. Персистенция патогенных бактерий. М.: Медицина, 1999. 365 с.
  4. Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Феномен микробного распознавания как медико-биологическая проблема. В кн.: Микросимбиоценоз. Екатеринбург: УрО РАН, 2014. С. 181—217.
  5. Andryuschenko S.V., Ivanova E.V., Perunova N.B., Bukharin O.V. Genome sequence and biochemical properties of Bifidobacterium longum strain ICIS-505, isolated from the intestine of a healthy woman. Microbiol. Recour. Announc., 2019, vol. 8, no. 33, pp. e00491—19. doi: 10.1128/MRA.00491-19
  6. Andryuschenko S.V., Ivanova E.V., Perunova N.B., Zdvizhkova I.A., Bekpergenova A.V., Bukharin O.V. Draft genome sequence of Bifidobacterium bifidum strain ICIS 310 Isolated from а feces of a healthy 5-year-old child from Orenburg. Microbiol. Recour. Announc., 2018, vol. 7, no. 18, pp. e01271—18. doi: 10.1128/MRA.01271—18
  7. Andryuschenko S.V., Zdvizhkova I.A., Perunova N.B., Bukharin O.V. Draft genome sequence of Klebsiella pneumoniae strain ICIS-278_PBV, isolated from the feces of a healthy 59-year-old man from Orenburg, Russia. Genome Announc., 2018, vol. 6, no. 27, pp. e00576—18. doi: 10.1128/genomeA.00576-18.
  8. Bukharin O.V. Adaptive strategies of pathogen-host interrelationships under infection. Her. Russ. Acad. Sci, 2018, vol. 88, no. 4, pp. 294 -299. doi: 10.1134/S1019331618040020
  9. Lilja E.E., Johnson D.R. Segregating metabolic processes into different microbial cells accelerates the consumption of inhibitory substrates. ISME J., 2016, vol. 10, no. 7, pp. 1568-1578. doi: 10.1038/ismej.2015.243
  10. Sakurai T., Hashikura N., Minami J., Yamada A., Odamaki T., Xiao J.Z. Tolerance mechanisms of human-residential bifidobac-terial against lysozyme. Anaerobe, 2017, no. 47, pp. 104-110. doi: 10.1016/j.anaerobe.2017.05.001

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Чайникова И.Н., Иванова Е.В., Андрющенко С.В., 2020

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 64788 от 02.02.2016.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах