Ускоренный метод определения «свой-чужой» микроорганизмов в реакции агглютинации
- Авторы: Бухарин О.В.1, Перунова Н.Б.1, Чайникова И.Н.1, Иванова Е.В.1, Андрющенко С.В.1
-
Учреждения:
- Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН
- Выпуск: Том 10, № 4 (2020)
- Страницы: 792-796
- Раздел: МЕТОДЫ
- Дата подачи: 08.05.2020
- Дата принятия к публикации: 04.07.2020
- Дата публикации: 26.11.2020
- URL: https://iimmun.ru/iimm/article/view/1482
- DOI: https://doi.org/10.15789/2220-7619-AAM-1482
- ID: 1482
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Предложен простой ускоренный метод определения «свой—чужой» микроорганизмов в реакции агглютинации (РА) лечебно-профилактической сывороткой отечественного производства (КИП, лиофилизат иммуноглобулинов IgG, IgA, IgM, разработанный ЗАО «Иммуно-Гем», Москва), тестируемых патогенных, условно-патогенных и доминантных бифидобактерий пробиотического ряда. Параллельно все изученные культуры, зарегистрированные в базах отечественных и международных коллекций, были тестированы методом межмикробного распознавания «свой—чужой», ранее разработанным нами. Было протестировано 16 коллекционных штаммов различных микроорганизмов в РА с указанной лечебно-профилактической сывороткой. Материалом для исследования послужили коллекционные штаммы бактерий Bifidobacterium bifidum 791, Escherichia coli ЛЭГМ-18, Klebsiella pneumoniae 278, Lactobacillus fermentum 90Т-С4, Bifidobacterium longum МС-42, Escherichia coli M-17, Shigella sonnei 177б, Shigella flexneri 170, Escherichia coli 157, Staphylococcus aureus 209, Candida albicans 10231 и Salmonella серовар Enteritidis ATCC 10708. Также в работе были использованы культуры из музея ИКВС УрО РАН, Bifidobacterium longum ICIS-505, Lactobacillus acidophilus ICIS-1127, Bifidobacterium bifidum ICIS-202, Bifidobacterium bifidum ICIS-310. Для оценки чужеродности пептидогликана микроорганизмов был также использован метод межмикробного распознавания «свой—чужой» на основе индукции метаболитов тест-штамма Bifidobacterium longum MC-42 как «доминанта», путем предварительного соинкубирования с метаболитами исследуемых культур («ассоциантов») и формирования обратной связи в паре «доминант— ассоциант». Оценка результата проводилась по изменению параметров репродукции (рост/размножение) и адаптации (образование биопленок и антилизоцимный тест) микробных культур в соответствии с описанной методикой, после чего производилось сравнение результатов, полученных с использованием этих двух методов микробного распознавания «свой—чужой». Все полученные результаты в РА полностью совпадали с результатами исследований, проведенных ранее методом межмикробного распознавания «свой—чужой» в паре «доминант—ассоциант». Если к этому добавить простоту постановки РА и затраченное на получение результата время (1 сутки против 5 суток при межмикробном распознавании), то РА становится более предпочтительным методом для скрининговых исследований по отбору штаммов для научных и производственных целей.
Ключевые слова
Об авторах
О. В. Бухарин
Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН
Email: fake@neicon.ru
ORCID iD: 0000-0002-6039-5265
http://prof-ras.ru/index.php?option=com_k2&view=item&id=104-%D0%BF%D0%B5%D1%80%D1%83%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%B0-%D0%BD%D0%B0%D1%82%D0%B0%D0%BB%D1%8C%D1%8F-%D0%B1%D0%BE%D1%80%D0%B8%D1%81%D0%BE%D0%B2%D0%BD%D0%B0
Доктор медицинских наук, профессор, главный научный сотрудник Института клеточного и внутриклеточного симбиоза.
Оренбург РоссияН. Б. Перунова
Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН
Автор, ответственный за переписку.
Email: perunovanb@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-6352-8879
http://prof-ras.ru/index.php?option=com_k2&view=item&id=104-%D0%BF%D0%B5%D1%80%D1%83%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%B0-%D0%BD%D0%B0%D1%82%D0%B0%D0%BB%D1%8C%D1%8F-%D0%B1%D0%BE%D1%80%D0%B8%D1%81%D0%BE%D0%B2%D0%BD%D0%B0
Перунова Наталья Борисовна - доктор медицинских наук, профессор РАН, ведущий научный сотрудник (с исполнением обязанностей зав. лабораторией) лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований Института клеточного и внутриклеточного симбиоза.
460000, Оренбург, ул. Пионерская, 11, Тел.: 8 922 555-30-80
РоссияИ. Н. Чайникова
Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН
Email: inchainicova@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-8923-8829
Доктор медицинских наук, профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории биомониторинга и молекулярногенетических исследований Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН.
Оренбург
РоссияЕ. В. Иванова
Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН
Email: walerewna13@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-4974-8947
Доктор медицинских наук, доцент, ведущий научный сотрудник лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН.
Оренбург
РоссияС. В. Андрющенко
Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский федеральный исследовательский центр, УрО РАН
Email: rattus000@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-1691-7588
Кандидат медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН.
Оренбург
Список литературы
- Андрющенко С.В., Перунова Н.Б., Бухарин О.В. Молекулярные механизмы взаимодействия бактерий с лизоцимом и их роль в микросимбиоценозе // Успехи современной биологии. 2015. Т. 135, № 5. С. 453—463.
- Бухарин О.В. Инфекционная симбиология — новое понимание старых проблем // Вестник РАН. 2016. Т. 86, № 10. С. 915—920. doi: 10.7868/S0869587316070033 (In Russ.)
- Бухарин О.В. Персистенция патогенных бактерий. М.: Медицина, 1999. 365 с.
- Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Феномен микробного распознавания как медико-биологическая проблема. В кн.: Микросимбиоценоз. Екатеринбург: УрО РАН, 2014. С. 181—217.
- Andryuschenko S.V., Ivanova E.V., Perunova N.B., Bukharin O.V. Genome sequence and biochemical properties of Bifidobacterium longum strain ICIS-505, isolated from the intestine of a healthy woman. Microbiol. Recour. Announc., 2019, vol. 8, no. 33, pp. e00491—19. doi: 10.1128/MRA.00491-19
- Andryuschenko S.V., Ivanova E.V., Perunova N.B., Zdvizhkova I.A., Bekpergenova A.V., Bukharin O.V. Draft genome sequence of Bifidobacterium bifidum strain ICIS 310 Isolated from а feces of a healthy 5-year-old child from Orenburg. Microbiol. Recour. Announc., 2018, vol. 7, no. 18, pp. e01271—18. doi: 10.1128/MRA.01271—18
- Andryuschenko S.V., Zdvizhkova I.A., Perunova N.B., Bukharin O.V. Draft genome sequence of Klebsiella pneumoniae strain ICIS-278_PBV, isolated from the feces of a healthy 59-year-old man from Orenburg, Russia. Genome Announc., 2018, vol. 6, no. 27, pp. e00576—18. doi: 10.1128/genomeA.00576-18.
- Bukharin O.V. Adaptive strategies of pathogen-host interrelationships under infection. Her. Russ. Acad. Sci, 2018, vol. 88, no. 4, pp. 294 -299. doi: 10.1134/S1019331618040020
- Lilja E.E., Johnson D.R. Segregating metabolic processes into different microbial cells accelerates the consumption of inhibitory substrates. ISME J., 2016, vol. 10, no. 7, pp. 1568-1578. doi: 10.1038/ismej.2015.243
- Sakurai T., Hashikura N., Minami J., Yamada A., Odamaki T., Xiao J.Z. Tolerance mechanisms of human-residential bifidobac-terial against lysozyme. Anaerobe, 2017, no. 47, pp. 104-110. doi: 10.1016/j.anaerobe.2017.05.001