<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">839</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-2018-4-473-488</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>MOLECULAR BASES OF EPIDEMIOLOGY, DIAGNOSTICS, PREVENTION AND TREATMENT OF INFECTIOUS DISEASES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ОСНОВЫ ЭПИДЕМИОЛОГИИ, ДИАГНОСТИКИ, ПРОФИЛАКТИКИ И ЛЕЧЕНИЯ АКТУАЛЬНЫХ ИНФЕКЦИЙ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">SUMMARY OF INFLUENZA AND OTHER RESPIRATORY VIRUSES DETECTED AND CHARACTERIZED IN RUSSIA DURING 2017–2018 SEASON</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>РЕЗУЛЬТАТЫ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДЕТЕКЦИИ И ХАРАКТЕРИСТИКА ВИРУСОВ ГРИППА И ДРУГИХ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ РЕСПИРАТОРНЫХ ИНФЕКЦИЙ В РОССИИ, СЕЗОН 2017–2018 ГГ.</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sominina</surname><given-names>A. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Соминина</surname><given-names>А. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Professor, Honored Scientist of the Russian Federation, Head of the Laboratory of Risk Factors Assessment for Influenza and ARI </p><p>197376, Russian Federation, St. Petersburg, Professor Popov str., 15/17Phone: +7 (812) 499-15-29</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., профессор, заслуженный деятель науки РФ, зав. лабораторией изучения факторов риска при гриппе и ОРВИ, зам. руководителя НЦГ ВОЗ</p><p>197376, Россия, Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, 15/17</p><p>Тел.: 8 (812) 499-15-29</p></bio><email>anna.sominina@influenza.spb.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Danilenko</surname><given-names>D. M.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Даниленко</surname><given-names>Д. М.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Deputy Director on Science, Head of the Department of Etiology and Epidemiology of Influenza and ARVI</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., зам. директора по научной работе, зав. отделом этиологии и эпидемиологии гриппа и ОРВИ, зам. руководителя по организационным вопросам НЦГ ВОЗ</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Komissarov</surname><given-names>A. B.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Комиссаров</surname><given-names>А. Б.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Head of the Laboratory of Molecular Virology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>зав. лабораторией молекулярной вирусологии</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Fadeev</surname><given-names>A. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Фадеев</surname><given-names>А. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Researcher of the Laboratory of Molecular Virology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Pisareva</surname><given-names>M. M.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Писарева</surname><given-names>М. М.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Leading Researcher; Laboratory of Molecular Virology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной вирусологии</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Eropkin</surname><given-names>M. Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Еропкин</surname><given-names>М. Ю.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Biology), Head of the Laboratory of Evolutionary Variability of Influenza Viruses</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.б.н., зав. лабораторией эволюционной изменчивости вирусов гриппа</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Konovalova</surname><given-names>N. I.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Коновалова</surname><given-names>Н. И.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Leading Researcher, Laboratory of Evolutionary Variability of Influenza Viruses</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории эволюционной изменчивости вирусов гриппа</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Petrova</surname><given-names>P. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Петрова</surname><given-names>П. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Junior Researcher, Laboratory of Evolutionary Variability of Influenza Viruses</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>младший научный сотрудник лаборатории эволюционной изменчивости вирусов гриппа</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Shtro</surname><given-names>A. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Штро</surname><given-names>А. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Head of the Laboratory of Chemotherapy of Viral Infections</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., зав. лабораторией химиотерапии вирусных инфекций </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Stolyarov</surname><given-names>K. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Столяров</surname><given-names>К. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Leading Programmer, Laboratory of Epidemiology of Influenza and ARVI</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>ведущий программист лаборатории эпидемиологии гриппа и ОРЗ</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Karpova</surname><given-names>L. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Карпова</surname><given-names>Л. С.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Head of the Laboratory of Epidemiology of Influenza and ARVI</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., зав. лабораторией эпидемиологии гриппа и ОРЗ</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Burtseva</surname><given-names>E. I.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бурцева</surname><given-names>Е. И.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Head of the Laboratory of Etiology and Epidemiology of Influenza and ARVI</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., зав. лабораторией этиологии и эпидемиологии гриппа</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Vasin</surname><given-names>A. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Васин</surname><given-names>А. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Director;Head of WHO National Influenza Centre </p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., директор;</p><p>руководитель НЦГ ВОЗ</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Smorodintsev Research Institute of Influenza, St. Petersburg</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБУ НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева Минздрава России, Санкт-Петербург</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">N.F. Gamaleya Federal Rerearch Center of Epidemiology and Microbiology, Moscow</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБУ НИЦ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи Минздрава России, Москва</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2018-12-30" publication-format="electronic"><day>30</day><month>12</month><year>2018</year></pub-date><volume>8</volume><issue>4</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>473</fpage><lpage>488</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2018-12-17"><day>17</day><month>12</month><year>2018</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2018-12-17"><day>17</day><month>12</month><year>2018</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2018, Sominina A.A., Danilenko D.M., Komissarov A.B., Fadeev A.V., Pisareva M.M., Eropkin M.Y., Konovalova N.I., Petrova P.A., Shtro A.A., Stolyarov K.A., Karpova L.S., Burtseva E.I., Vasin A.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2018, Соминина А.А., Даниленко Д.М., Комиссаров А.Б., Фадеев А.В., Писарева М.М., Еропкин М.Ю., Коновалова Н.И., Петрова П.А., Штро А.А., Столяров К.А., Карпова Л.С., Бурцева Е.И., Васин А.В.</copyright-statement><copyright-year>2018</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Sominina A.A., Danilenko D.M., Komissarov A.B., Fadeev A.V., Pisareva M.M., Eropkin M.Y., Konovalova N.I., Petrova P.A., Shtro A.A., Stolyarov K.A., Karpova L.S., Burtseva E.I., Vasin A.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Соминина А.А., Даниленко Д.М., Комиссаров А.Б., Фадеев А.В., Писарева М.М., Еропкин М.Ю., Коновалова Н.И., Петрова П.А., Штро А.А., Столяров К.А., Карпова Л.С., Бурцева Е.И., Васин А.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/839">https://iimmun.ru/iimm/article/view/839</self-uri><abstract xml:lang="en"><p><bold>Abstract.</bold> The influenza season 2017–2018 started significantly later compared to the five previous seasons. Influenza epidemic lasted for 12 weeks (weeks 6–17), was of moderate intensity and 10,4% of the population of the country was involved with children aged 0–2 and 3–6 years being the most affected groups as usually. The average hospitalization rate of patients with ILI and ARI was 2,6% and was the highest in infants aged 0–2 years (5,4%). The number of influenzaassociated deaths was two times higher this season compared to 2016–2017 which can be attributed to the circulation of A(H1N1)pdm09 viruses that still is the major cause of lethal influenza outcomes in the country. A total 72 759 patients were investigated by RT-PCR in 55 collaborating RBLs. Laboratory confirmed influenza (LCI) was detected in 12 149 (20.7%) cases, of which 39.3% were influenza A(H1N1)pdm09 viruses, 29.6% were A(H3N2) and 31.1% influenza B (Yamagata lineage) viruses. The first cases of influenza viruses were detected at the very beginning of the season (weeks 40–45.2017), however a distinct increase in the rate of detection was registered only from the week 2.2018 with the peak on the week 13–14.2018 and subsequent gradual decline up to the end of the season. The certain differences in the etiology of morbidity between Federal Districts were registered. The impact of influenza and other ARI agents in different stage of epidemic was determined. In the pre-epidemic period, the incidence growth was occurred mainly due to ARI agents (about 32,7%), especially due to rhinoviruses (RhV) and RSV (10.2 and 8.0% cases, respectively) while LCI were registered in 3.4% only. During the epidemic, the rate of LCI detection increased up to 29.2% at simultaneous decrease in frequency of parainfluenza, adenovirus, bocavirus, coronavirus and, especially, rhinoviruses, to a lesser extent RSV infection. In the post-epidemic period, the role of influenza A(H1N1)pdm09, A(H3N2) and В viruses decreased up to 6.1; 6.9 and 3.6%, respectively, with increase of rhinoviruses (9.5% of diseases). Genetic analysis of influenza A(H1N1)pdm09 and A(H3N2) viruses circulating in 2017–2018 season showed that all analyzed viruses by the structure of surface genes encoding antigenic determinants, in difference from influenza B viruses, corresponded to the vaccine strains recommended by WHO for the Northern Hemisphere for 2017–2018 epidemic season. However, significant changes in the internal genes of circulating viruses were revealed. The control of the susceptibility of 316 influenza A and B viruses to antiviral drugs showed that the absolute majority of them (99.7%) retained their susceptibility to neuraminidase inhibitors.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p><bold>Резюме.</bold> Активизация вирусов гриппа в сезон 2017–2018 гг. началась значительно позже в сравнении с пятью предшествующими сезонами. Эпидемия гриппа продлилась в течение 12 недель (с 6 по 17 неделю), имела среднюю интенсивность с вовлечением 10,4% населения страны. Дети возрастных групп 0–2 и 3–6 лет, как обычно, болели наиболее часто. Средняя частота госпитализации пациентов с гриппом и ОРВИ составила 2,6% и была наиболее высокой (5,4%) в младшей возрастной группе (0–2 лет). Число смертельных исходов при гриппе в этом сезоне было в 2 раза выше, чем в сезон 2016–2017, что может быть объяснено распространением вирусов гриппа A(H1N1)pdm09, которые, по-прежнему, являются основной причиной летальных исходов при гриппе в стране. Всего за сезон в 55 сотрудничающих региональных базовых лабораториях было обследовано с помощью ОТ-ПЦР в реальном времени 72 759 пациентов. Грипп был лабораторно подтвержден с помощью ПЦР в 12 149 (20,7%) случаях, из числа которых 39,3% составили вирусы гриппа A(H1N1)pdm09, 29,6% — A(H3N2) и 31,1% — вирусы гриппа B (Ямагатской линии). Первые случаи гриппа были зарегистрированы в самом начале сезона (недели 40–45.2017), однако отчетливое увеличение частоты их детекции было установлено лишь на 2 неделе 2018 г. с пиком на 13–14 неделях и последующим постепенным снижением вплоть до конца сезона. Выявлены определенные отличия в этиологии гриппозной заболеваемости между федеральными округами. Определена роль вирусов гриппа и других возбудителей ОРВИ на разных стадиях эпидемического процесса. Так, в предэпидемический период рост заболеваемости был обусловлен, в основном (около 32,7% случаев) не гриппозными вирусами, в особенности риновирусами и респираторно-синцитиальным вирусом (10,2 и 8,0% случаев соответственно), тогда как лабораторно подтвержденные случаи гриппа (ЛПГ) регистрировались лишь в 3,4%. В период эпидемии частота ЛПГ увеличилась до 29,2% при одновременном снижении частоты заболеваний парагриппозной, аденовирусной, бокавирусной, коронавирусной и, особенно, риновирусной этиологии, в меньшей степени снизилась частота инфекции, вызванной респираторно-синцитиальным вирусом. В постэпидемический период роль вирусов гриппа A(H1N1)pdm09, A(H3N2) и В снизилась до 6,1; 6,9 и 3,6% соответственно, с увеличением значимости риновирусной инфекции (до 9,5% заболеваний). Антигенный и генетический анализ вирусов гриппа A(H1N1)pdm09 и A(H3N2), циркулировавших в сезон 2017–2018 гг., показал, что все проанализированные вирусы гриппа А, в отличие от вирусов гриппа В, по структуре поверхностных генов, соответствовали штаммам, введенным в состав вакцин для Северного полушария на сезон 2017–2018 гг. Вместе с тем, во внутренних генах циркулирующих вирусов был обнаружен ряд замен. Контроль чувствительности 316 вирусов гриппа А и В к противовирусным препаратам показал, что абсолютное большинство из них (99.7%) сохранили свою чувствительность к ингибиторам нейраминидазы.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>molecular diagnostics</kwd><kwd>influenza</kwd><kwd>ARVI</kwd><kwd>genetic analysis</kwd><kwd>antigenic properties</kwd><kwd>antivirals</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>молекулярная диагностика</kwd><kwd>грипп</kwd><kwd>ОРВИ</kwd><kwd>генетический анализ</kwd><kwd>антигенные свойства</kwd><kwd>антивирусные препараты</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1. Карпова Л.С., Волик К.М., Столяров К.А., Поповцева Н.М., Столярова Т.П., Соминина А.А., Бурцева Е.И. Особенности эпидемического процесса при гриппе A(H1N1)pdm09 и A(H3N2) в России с 2009 по 2017 годы // Вопросы вирусологии. 2018. Т. 63, № 4. С. 177–184. [Karpova L.S., Volik K.M., Stolyarov K.A., Popovtseva N.M., Stolyarova T.P., Sominina A.A., Burtseva E.I. Features of the epidemic process for influenza A (H1N1) pdm09 and A (H3N2) in Russia from 2009 to 2017. Voprosy Virusologii = Problems of Virology, 2018, vol. 63, no. 4, pp. 177–184. doi: 10.31631/2073-3046-2018-17-1-13-19 (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Методика расчета эпидемических порогов по гриппу и острым респираторным вирусным инфекциям по субъектам Российской Федерации: метод. рекомендации МР 3.1.0005-10. М., 2010. 86 c. [The method of calculation of the epidemic threshold for influenza and acute respiratory viral infections by the subjects of the Russian Federation: methodological recommendations МR 3.1.0005-10. Moscow: 2010. 86 p.]. URL: http://www.rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=6288 (20.09.2018)</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Выделение вирусов гриппа в клеточных культурах и куриных эмбрионах и их идентификация: метод. рекомендации № 0100/4430-06-34 (утв. Федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека от 18 апреля 2006 г.). 15 c. [Isolation of seasonal and potentially pandemic influenza viruses in cell cultures and chick embryos and their identification: methodological recommendations No. 0100/ 4430-06-34. (approved by Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare of April 18, 2006). 15 p.]</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Михайлова Е.В., Чудакова Т.К., Ярушкина М.С., Романовская А.В., Хворостухина Н.Ф. Респираторно-синцитиальная вирусная инфекция: клинические особенности и лабораторные показатели интоксикации // Детские инфекции. 2017. Т. 16, № 2. С. 23–25. [Mikhailova E.V., Chudakova T.K., Yarushkina M.S., Romanovskaya A.V., Khvorostukhina N.F. Respiratory syncytial viral infection: clinical features and laboratory indicators of intoxication. Detskie infektsii = Children’s infections, 2017, vol. 16, no. 2, pp. 23–25. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Соминина А.А., Смородинцева Е.А., Столяров К.А., Мельникова А.А. Совершенствование системы надзора за гриппом в Российской Федерации: основные результаты сигнального надзора за гриппом и другими острыми респираторными вирусными инфекциями // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2017. Т. 16, № 1. С. 7–15. [Sominina A.A., Smorodintseva E.A., Stolyarov K.A., Melnikova A.A. Improving the system of influenza surveillance in the Russian Federation: the main results of sentinel surveillance for influenza and other acute respiratory viral infections. Epidemiologiya i vaktsinoprofilaktika = Epidemiology and Vaccine Prevention, 2017, vol. 16, no. 1, pp. 7–15. doi: 10.31631/2073-3046-2017-16-1-7-15 (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Ilyicheva T., Durymanov A., Susloparov I, Kolosova N., Goncharova N., Svyatchenko S., Petrova O., Bondar A., Mikheev V., Ryzhikov A. Fatal cases of seasonal influenza in Russia in 2015–2016. PLoS ONE, 2016, vol. 11, no. 10: e0165332.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Komissarov A., Fadeev A., Sergeeva M., Petrov S., Sintsova K., Egorova A., Pisareva M., Buzitskaya Z., Musaeva T., Danilenko D., Konovalova N., Petrova P., Stolyarov K., Smorodintseva E., Burtseva E., Krasnoslobodtsev K., Kirillova E., Karpova L., Eropkin M., Sominina A., Grudinin M. Rapid spread of influenza A(H1N1)pdm09 viruses with a new set of specific mutations in the internal genes in the beginning of 2015/2016 epidemic season in Moscow and Saint Petersburg (Russian Federation). Influenza Other Respir. Viruses, 2016, vol. 4, pp. 247–253. doi: 10.1111/irv.12389</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8. Lozano R., Naghavi M., Foreman K., Lim S., Shibuya K., Aboyans V., Abraham J., Adair T., Aggarwal R., Ahn S.Y., Alvarado M., Anderson H.R., Anderson L.M., Andrews K.G., Atkinson C., Baddour L.M., Barker-Collo S., Bartels D.H., Bell M.L., Benjamin E.J., Bennett D., Bhalla K., Bikbov B., Bin Abdulhak A., Birbeck G., Blyth F., Bolliger I., Boufous S., Bucello C., Burch M., Burney P., Carapetis J., Chen H., Chou D., Chugh S.S., Coffeng L.E., Colan S.D., Colquhoun S., Colson K.E., Condon J., Connor M.D., Cooper L.T., Corriere M., Cortinovis M., de Vaccaro K.C., Couser W., Cowie B.C., Criqui M.H., Cross M., Dabhadkar K.C., Dahodwala N., De Leo D., Degenhardt L., Delossantos A., Denenberg J., Des Jarlais D.C., Dharmaratne S.D., Dorsey E.R., Driscoll T., Duber H., Ebel B., Erwin P.J., Espindola P., Ezzati M., Feigin V., Flaxman A.D., Forouzanfar M.H., Fowkes F.G., Franklin R., Fransen M., Freeman M.K., Gabriel S.E., Gakidou E., Gaspari F., Gillum R.F., Gonzalez-Medina D., Halasa Y.A., Haring D., Harrison J.E., Havmoeller R., Hay R.J., Hoen B., Hotez P.J., Hoy D., Jacobsen K.H., James S.L., Jasrasaria R., Jayaraman S., Johns N., Karthikeyan G., Kassebaum N., Keren A., Khoo J.P., Knowlton L.M., Kobusingye O., Koranteng A., Krishnamurthi R., Lipnick M., Lipshultz S.E., Ohno S.L., Mabweijano J., MacIntyre M.F., Mallinger L., March L., Marks G.B., Marks R., Matsumori A., Matzopoulos R., Mayosi B.M., McAnulty J.H., McDermott M.M., McGrath J., Mensah G.A., Merriman T.R., Michaud C., Miller M., Miller T.R., Mock C., Mocumbi A.O., Mokdad A.A., Moran A., Mulholland K., Nair M.N., Naldi L., Narayan K.M., Nasseri K., Norman P., O’Donnell M., Omer S.B., Ortblad K., Osborne R., Ozgediz D., Pahari B., Pandian J.D., Rivero A.P., Padilla R.P., PerezRuiz F., Perico N., Phillips D., Pierce K., Pope C.A. 3rd, Porrini E., Pourmalek F., Raju M., Ranganathan D., Rehm J.T., Rein D.B., Remuzzi G., Rivara F.P., Roberts T., De León F.R., Rosenfeld L.C., Rushton L., Sacco R.L., Salomon J.A., Sampson U., Sanman E., Schwebel D.C., Segui-Gomez M., Shepard D.S., Singh D., Singleton J., Sliwa K., Smith E., Steer A., Taylor J.A., Thomas B., Tleyjeh I.M., Towbin J.A., Truelsen T., Undurraga E.A., Venketasubramanian N., Vijayakumar L., Vos T., Wagner G.R., Wang M., Wang W., Watt K., Weinstock M.A., Weintraub R., Wilkinson J.D., Woolf A.D., Wulf S., Yeh P.H., Yip P., Zabetian A., Zheng Z.J., Lopez A.D., Murray C.J., AlMazroa M.A., Memish Z.A. Global and regional mortality from 235 causes of death for 20 age groups in 1990 and 2010: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2010. Lancet, 2012, vol. 380, no. 9859, pp. 2095–2128. doi: 10.1016/S0140-6736(12)61728-0</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Lopez-Labrador Х., Natividad-Sancho A., Pisareva M., Komissarov A., Salvatierra K., Fadeev A., Moya A., Grudinin M., DiezDomingo J., Afanasieva O., Konovalova N., Sominina A., Puig-Barbera J. Genetic characterization of influenza viruses from influenza-related hospital admissions in the St. Petersburg and Valencia sites of the Global Influenza Hospital Surveillance Network during the 2013/14 influenza season. J. Clin. Virol., 2016, vol. 84, pp. 32–38.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10. Manual for the laboratory diagnosis and virological surveillance of influenza. WHO, 2011. 139 p.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>11. Moe N., Stenseng I.H., Krokstad S., Christensen A., Skanke L.H., Risnes K.R., Nordbø S.A., Døllner H. The burden of human metapneumovirus and respiratory syncytial virus infections in hospitalized norwegian children. J. Infect. Dis., 2017, vol. 216, no. 1, pp. 110–116.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>12. Morbidity and Mortality Weekly Report. Influenza activity in the United States during the 2017–18 season and composition of the 2018–19 influenza vaccine. MMWR, 2018, vol. 67, no. 22, pp. 634–642.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>13. Nair H., Brooks W.A., Katz M., Roca A., Berkley J.A., Madhi S.A., Simmerman J.M., Gordon A., Sato M., Howie S., Krishnan A., Ope M., Lindblade K.A., Carosone-Link P., Lucero M., Ochieng W., Kamimoto L., Dueger E., Bhat N., Vong S., Theodoratou E., Chittaganpitch M., Chimah O., Balmaseda A., Buchy P., Harris E., Evans V., Katayose M., Gaur B., O’CallaghanGordo C., Goswami D., Arvelo W., Venter M., Briese T., Tokarz R., Widdowson M.A., Mounts A.W., Breiman R.F., Feikin D.R., Klugman K.P., Olsen S.J., Gessner B.D., Wright P.F., Rudan I., Broor S., Simões E.A., Campbell H. Global burden of respiratory infections due to seasonal influenza in young children: a systematic review and meta-analysis. Lancet, 2011, vol. 378, no. 9807, pp. 1917–1930. doi: 10.1016/S0140-6736(11)61051-9</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>14. Puig-Barberà J., Tormos A., Trushakova S., Burtseva E., Sominina A., Pisareva M., Ciblak M.A., Badur S., Yu H., Cowling B.J., Burtseva E. The Global Influenza Hospital Surveillance Network (GIHSN): a new platform to describe the epidemiology of severe influenza. Influenza Other Respir. Viruses, 2015, vol. 9, no. 6, pp. 277–286. doi: 10.1111/irv.12335</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>15. Ray R., Dos Santos G., O Buck P., Claeys C., Matias G., Innis B., Bekkat-Berkani R.. A review of the value of quadrivalent influenza vaccines and their potential contribution to influenza control. Human Vaccines &amp; Immunotherapeutics, 2017, vol. 13, no. 7, pp. 1640–1652. doi: 10.1080/21645515.2017.1313375</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>16. Ruggiero T., De Rosa F., Cerutti F., Pagani N., Allice T., Stella M., Milia M.G., Calcagno A., Burdino E., Gregori G., Urbino R., Di Perri G., Ranieri M.V., Ghisetti V. A(H1N1)pdm09 hemagglutinin D222G and D222N variants are frequently harbored by patients requiring extracorporeal membrane oxygenation and advanced respiratory assistance for severe A(H1N1)pdm09 infection. Influenza Other Respir. Viruses, 2013, vol. 7, no. 6, pp. 1416–1426.</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>17. Shi T., McAllister D.A., O’Brien K.L., Simoes E.A.F., Madhi S.A., Gessner B.D., Polack F.P., Balsells E., Acacio S., Aguayo C., Alassani I., Ali A., Antonio M., Awasthi S., Awori J.O., Azziz-Baumgartner E., Baggett H.C., Baillie V.L., Balmaseda A., Barahona A., Basnet S., Bassat Q., Basualdo W., Bigogo G., Bont L., Breiman R.F., Brooks W.A., Broor S., Bruce N., Bruden D., Buchy P., Campbell S., Carosone-Link P., Chadha M., Chipeta J., Chou M., Clara W., Cohen C., de Cuellar E., Dang D.A., Dash-yandag B., Deloria-Knoll M., Dherani M., Eap T., Ebruke B.E., Echavarria M., de Freitas Lázaro Emediato C.C., Fasce R.A., Feikin D.R., Feng L., Gentile A., Gordon A., Goswami D., Goyet S., Groome M., Halasa N., Hirve S., Homaira N., Howie S.R.C., Jara J., Jroundi I., Kartasasmita C.B., Khuri-Bulos N., Kotloff K.L., Krishnan A., Libster R., Lopez O., Lucero M.G., Lucion F., Lupisan S.P., Marcone D.N., McCracken J.P., Mejia M., Moisi J.C., Montgomery J.M., Moore D.P., Moraleda C., Moyes J., Munywoki P., Mutyara K., Nicol M.P., Nokes D.J., Nymadawa P., da Costa Oliveira M.T., Oshitani H., Pandey N., Paranhos-Baccalà G., Phillips L.N., Picot V.S., Rahman M., Rakoto-Andrianarivelo M., Rasmussen Z.A., Rath B.A., Robinson A., Romero C., Russomando G., Salimi V., Sawatwong P., Scheltema N., Schweiger B., Scott J.A.G., Seidenberg P., Shen K., Singleton R., Sotomayor V., Strand T.A., Sutanto A., Sylla M., Tapia M.D., Thamthitiwat S., Thomas E.D., Tokarz R., Turner C., Venter M., Waicharoen S., Wang J., Watthanaworawit W., Yoshida L.-M., Yu H., Zar H.J., Campbell H., Nair H., RSV Global Epidemiology Network. Global, regional, and national disease burden estimates of acute lower respiratory infections due to respiratory syncytial virus in young children in 2015: a systematic review and modelling study. Lancet, 2017, vol. 390, no. 10098, pp. 946–958. doi: 10.1016/S0140-6736(17)30938-8</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>18. Sominina A., Burtseva E., Eropkin M., Karpova L., Zarubaev V., Smorodintseva E., Konovalova N., Danilenko D., Prokopetz A., Grudinin M., Pisareva M., Anfimov P., Stolyarov K., Kiselev O., Shevchenko E., Ivanova V., Trushakova S., Breslav N., Lvov D., Klimov A., Moen A., Cox N. Influenza surveillance in Russia based on epidemiological and laboratory data for the period from 2005 to 2012. Am. J. Infect. Dis., 2013, vol. 9, no. 3, pp. 77–93. doi: 10.3844/ajidsp.2013.77.93</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>19. Sominina A.A., Pisareva M.M., Grudinin M.P., Eropkin M.Y., Konovalova N.I., Sukhovetskaya V.F., Afanasieva O.I., Voloshuk L.V., Komissarov A.B., Buzitskaya Z.V., Fadeev A.V., Stolyarov K.A., Smorodintseva E.A., Afanasieva V.S., Yanina M.A., Gonchar V.V., Osidak L.V., Go A.A. Two years of experience in hospital surveillance for the severe influenza like illnesses in St. Petersburg: etiology, clinical characterization of diseases, antigenic and genetic properties of isolated influenza viruses. Microbiol. Mol. Biol. Rev, 2015, vol. 2, no. 1, pp. 44–55. doi:10.18527/2500-2236-2015-2-1-44-55</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>20. Vega T., Lozano J., Meerhoff T., Snaken R., Mott J., Ortiz de Lejarazu, Nunes B. Influenza surveillance in Europe: establishing epidemic thresholds by the moving epidemic method. Influenza Other Respir. Viruses, 2013, vol. 7, no. 4, pp. 546–558. doi: 10.1111/j.1750-2659.2012.00422x</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>21. World Health Organization. Vaccines against influenza WHO position paper — November 2012. Wkly Epidemiol. Rec., 2012, vol. 87 (47), pp. 461–476.</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>22. Zheng X.Y., Xu Y.J., Guan W.J., Lin L.F. Regional, age and respiratory-secretion-specific prevalence of respiratory viruses associated with asthma exacerbation: a literature review. Arch. Virol., 2018, vol. 163, no. 4, pp. 845–853.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
