<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">786</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-2018-3-349-354</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">ANTIMICROBIAL SUSCEPTIBILITY OF ENTEROBACTERIACAEISOLATED FROM INTESTINAL MICROBIOTA OF RESIDENTS OF THE REPUBLIC OF GUINEA AND RUSSIA (SAINT PETERSBURG)</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ К АНТИМИКРОБНЫМ ПРЕПАРАТАМ ШТАММОВ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ, ВЫДЕЛЕННЫХ ПРИ ИЗУЧЕНИИ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА ЖИТЕЛЕЙ ГВИНЕЙСКОЙ РЕСПУБЛИКИ И РОССИИ (САНКТ-ПЕТЕРБУРГ)</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Egorova</surname><given-names>S. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Егорова</surname><given-names>С. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p/><p>PhD (Medicine), Senior Researcher, Laboratory of Enteric Infections.</p>St. Petersburg.</bio><bio xml:lang="ru"><p/><p>к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций.</p>Санкт-Петербург.</bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Makarova</surname><given-names>M. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Макарова</surname><given-names>М. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p/><p>PhD (Medicine), Senior Researcher, Laboratory of Enteric Infections.</p>St. Petersburg.</bio><bio xml:lang="ru"><p/><p>к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций.</p>Санкт-Петербург.</bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kaftyreva</surname><given-names>L. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Кафтырева</surname><given-names>Л. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Professor, Head of the Laboratory of Enteric Infections.</p><p>197101, Russian Federation, St. Petersburg, Mira str., 14.</p><p>Phone: +7 (812) 232-48-83 (office).</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., профессор, зав. лабораторией кишечных инфекций.</p><p>197101, Россия, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14.</p><p>Тел.: 8 (812) 232-48-83 (служебн.).</p><p> </p></bio><email>kaflidia@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Suzhaeva</surname><given-names>L. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Сужаева</surname><given-names>Л. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Researcher, Laboratory of Enteric Infections.</p><p>St. Petersburg.</p></bio><bio xml:lang="ru"><p/><p>младший научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций.</p>Санкт-Петербург.</bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Zabrovskaia</surname><given-names>A. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Забровская</surname><given-names>А. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p/><p>PhD (Veterinary), Senior Researcher, Laboratory of Enteric Infections.</p>St. Petersburg.</bio><bio xml:lang="ru"><p/><p>к.в.н., старший научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций.</p>Санкт-Петербург.</bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Matveeva</surname><given-names>Z. N.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Матвеева</surname><given-names>З. Н.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p/><p>PhD (Medicine), Leading Researcher, Laboratory of Enteric Infection.</p>St. Petersburg.</bio><bio xml:lang="ru"><p/><p>к.м.н., ведущий научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций.</p>Санкт-Петербург.</bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Voitenkova</surname><given-names>E. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Войтенкова</surname><given-names>Е. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p/><p>PhD (Medicine), Senior Researcher, Laboratory of Enteric Infections.</p>St. Petersburg.</bio><bio xml:lang="ru"><p/><p>к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций.</p>Санкт-Петербург.</bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">St. Petersburg Pasteur Institute.</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера.</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2018-11-04" publication-format="electronic"><day>04</day><month>11</month><year>2018</year></pub-date><volume>8</volume><issue>3</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>349</fpage><lpage>354</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2018-11-02"><day>02</day><month>11</month><year>2018</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2018-11-02"><day>02</day><month>11</month><year>2018</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2018, Egorova S.A., Makarova M.A., Kaftyreva L.A., Suzhaeva L.V., Zabrovskaia A.V., Matveeva Z.N., Voitenkova E.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2018, Егорова С.А., Макарова М.А., Кафтырева Л.А., Сужаева Л.В., Забровская А.В., Матвеева З.Н., Войтенкова Е.В.</copyright-statement><copyright-year>2018</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Egorova S.A., Makarova M.A., Kaftyreva L.A., Suzhaeva L.V., Zabrovskaia A.V., Matveeva Z.N., Voitenkova E.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Егорова С.А., Макарова М.А., Кафтырева Л.А., Сужаева Л.В., Забровская А.В., Матвеева З.Н., Войтенкова Е.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/786">https://iimmun.ru/iimm/article/view/786</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>It is known that resistant Enterobacteriacaestrains can be a part of human microbiota. While colonizing the body of a healthy person, resistant strains do not cause diseases, while the healthy person becomes carrier and source of such strains or the resistance genes to the external environment. The aim of the study was to compare the antimicrobial susceptibility of opportunistic Enterobacteriacaeisolated from feces of residents of the Republic of Guinea (121 strains) and Russia, Saint Petersburg (897 strains). The antimicrobial susceptibility was determined by the disc-diffusion method according to the national russian Clinical Guideline “Antimicrobial susceptibility testing of microorganisms” using discs and Muller-Hinton agar manufactured by Oxoid. Resistance mechanisms were tested in bacterial strains non-susceptible to beta- lactams using confirmatory phenotypic and molecular tests. Resistant strains were detected significantly more often in the intestinal microbiota of residents of the Republic of Guinea, than of Saint Petersburg (83.5 and 28.7 per 100 strains studied, respectively), including strains with multidrug resistance (47.9 and 11.1, respectively). The residents of the Republic of Guinea have a high frequency of isolation of Enterobacteriacaeresistant to “old” antibiotics, which were often used in the 1970s, but rarely used in Russia and other European countries: tetracyclines (63.2), trimethoprim/ sulfamethoxazole (59.5) and aminopenicillins (48.4). The frequency of detection of strains resistant to modern clinically significant antibiotics (extended spectrum cephalosporins, f luoroquinolones, aminoglycosides) was the same in residents of the Republic of Guinea and Saint Petersburg. Resistance to beta-lactams in Enterobacteriacaestrains isolated both from the residents of the Republic of Guinea and from Saint Petersburg is due to the same mechanism — the production of beta-lactamases — broadspectrum and extended spectrum- of various genetic families. This data corresponds to world global trends in the antimicrobial resistance in Enterobacteriacae: resistance to aminopenicillins in E. coliis due to the production of broad-spectrum beta-lactamases TEM-1 (80% of strains from residents of the Republic of Guinea and 86.5% from Saint Petersburg), and resistance to extended spectrum cephalosporins — the production of extended spectrum beta-lactamases of the CTX-M1 genetic group (72.7 and 67.6% respectively). Our research has shown that the intestinal microbiota of the inhabitants of different continents (Europe and Africa) contains the strains (Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli) resistant to clinically significant antibiotics (beta-lactams) due to single mechanism globally spread in Enterobacteriacae.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Известно, что резистентные к антибиотикам штаммы энтеробактерий могут входить в состав микробиоты кишечника. Колонизируя организм здорового человека, устойчивые штаммы не вызывают заболеваний желудочно-кишечного тракта, при этом здоровый человек становится носителем и источником выделения таких штаммов или детерминант резистентности во внешнюю среду. Цель исследования состояла в сравнительной оценке чувствительности к антибиотикам штаммов условно-патогенных энтеробактерий, выделенных из проб испражнений жителей Гвинейской Республики (121 штамм) и Санкт-Петербурга (897 штаммов). Чувствительность к антибиотикам определяли диско-диффузионным методом согласно Клиническим рекомендациям «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам» с использованием дисков производства Oxoid. У штаммов бактерий, нечувствительных к бета-лактамным препаратам, изучили механизмы резистентности, используя подтверждающие фенотипические тесты и молекулярные методы. У жителей Гвинейской Республики устойчивые к антибиотикам штаммы в составе микробиоты кишечника выявлены достоверно чаще, чем у жителей Санкт-Петербурга (83,5 и 28,7 на 100 исследованных штаммов со-ответственно), включая штаммы с множественной резистентностью (47,9 и 11,1 соответственно). У жителей Гвинейской Республики высока частота выделения штаммов энтеробактерий, устойчивых к «старым» АМП, которые часто применяли в 70-е гг. прошлого столетия, но редко используются в настоящее время в РФ и других европейских странах: тетрациклинам (63,2), триметопримсульфаметоксазолу (59,5) и аминопенициллинам (48,4). Частота выявления штаммов, устойчивых к современным клинически значимым антибиотикам (цефалоспорины, фторхинолоны, аминогликозиды) практически не отличалась у жителей Гвинейской Республики и Санкт-Петербурга. Резистентность к бета-лактамным препаратам штаммов, выделенных как у жителей Гвинейской Республики, так и Санкт-Петербурга, обусловлена практически одним механизмом — продукцией бета-лактамаз широкого и расширенного спектра различных генетических семейств. Выявленные закономерности соответствуют глобальным тенденциям формирования резистентности к антибиотикам у штаммов энтеробактерий в мире: устойчивость к аминопенициллинам у E. coli обусловлена продукцией бета-лактамазы широкого спектра ТЕМ-1 (80,0% штаммов от жителей Гвинейской Республики и 86,5% — Санкт-Петербурга), а устойчивость к цефалоспоринам расширенного спектра — продукцией бета-лактамаз расширенного спектра генетической группы СТХ-М1 (72,7 и 67,6% соответственно). Наши исследования показали, что в составе нормальной микробиоты кишечника жителей разных континентов (Европа и Африка) присутствуют бактерии (K. pneumoniaeи E. coli), штаммы которых характеризуются резистентностью к клинически значимым антибиотикам (бета-лактамам), обусловленной единым механизмом, глобально распространенным в популяциях энтеробактерий.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>resistance</kwd><kwd>Enterobacteriacae</kwd><kwd>Republic of Guinea</kwd><kwd>intestine microbiota</kwd><kwd>antimicrobial susceptibility</kwd><kwd>beta-lactamase</kwd><kwd>E. coli</kwd><kwd>K. pneumonia</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>резистентность</kwd><kwd>Enterobacteriacae</kwd><kwd>Гвинейская Республика</kwd><kwd>нормальная микробиота кишечника</kwd><kwd>чувствительность к антибиотикам</kwd><kwd>бета-лактамазы</kwd><kwd>E. coli</kwd><kwd>K. Pneumoniae</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1. ВОЗ: Глобальный план действий по борьбе с устойчивостью к противомикробным препаратам. URL: http://apps.who.int/iris/bitstream/10665/254884/1/9789244509760-rus.pdf?ua=1</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Егорова С.А., Кафтырева Л.А., Липская Л.В., Коноваленко И.Б., Пясетская М.Ф., Курчикова Т.С., Ведерни кова Н.Б., Морозова О.Т., Смирнова М.В., Попенко Л.Н., Любушкина М.И., Савочкина Ю.А., Макарова М.А., Сужаева Л.В., Останкова Ю.В., Иванова М.Н., Павелкович А.М., Наабер П., Сепп Э., Кыльялг С., Mицюля вичeнe И., Балоде А. Штаммы энтеробактерий, продуцирующие бета-лактамазы расширенного спектра и металло-бета-лактамазу NDM-1, выделенные в стационарах в странах Балтийского региона // Инфекция и иммунитет. 2013. Т. 3, № 1. С. 29–36.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Определение чувствительности к антимикробным препаратам: клинические рекомендации, версия 2015-2. URL: http://www.antibiotic.ru/minzdrav/files/docs/clrec-dsma2015.pdf</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Светличная Ю.С., Колосовская Е.Н., Кафтырева Л.А., Дарьина М.Г., Егорова С.А., Макарова М.А. Микробио-логический мониторинг в системе эпидемиологического надзора за госпитальными инфекциями // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2014. Т. 1, № 74. C. 9–14.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Сухорукова М.В., Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В., Микотина А.В., Дехнич А.В., Козлов Р.С. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» 2013–2014 // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017. Т. 19, № 1. С. 49–56.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Antimicrobial resistance surveillance in Europe. Annual report of the European EARS-Net 2015. URL: https://ecdc.europa.eu/sites/portal/files/media/en/publications/Publications/antimicrobial-resistance-europe-2015.pdf</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Dallenne C., Da Costa A., DecréD., Favier C., Arlet G. Development of a set of multiplex PCR assays for the detection of genes encoding important b-lactamases in Enterobacteriaceae. J. Antimicrob. Chemother. 2010; 65: 490–495. doi:10.1093/jac/dkp498</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8. Pavelkovich A., Balode A., Edquist P., Egorova S., Ivanova M., Kaftyreva L., Konovalenko I., Kõljalg S., Lillo J., Lipskaya L., Miciuleviciene J., Pai K., Parv K., Pärna K., Rööp T., Sepp E., Štšepetova J., Naaber P. Detection of carbapenemase-producing Enterobacteriacae in the Baltic Countries and St. Petersburg Area. BioMed Res. Int. 2014: ID 548960. doi: 10.1155/2014/548960</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Popova A.Yu., Kaftyreva L.A., Suzhaeva L.V., Voitenkova E.V., Zabrovskaya A.V., Egorova S.A., Makarova M.A., Matveeva Z.N., Zueva E.V., Porin A.A., Buaro M.Y., Konstantinov O.K., Totolian A.A. Comparative characteristics of the microbiome of the intestines of the residents of the Republic of Guinea and Russia. Russian Journal of Infection and Immunity = Infektsiya i immunitet, 2017, vol. 7, no. 4, pp. 325–330. doi: 10.15789/2220-7619-2017-4-375-382</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10. Woodford N., Wareham D.W., Guerra B., Teale C. Carbapenemase-producing Enterobacteriaceae and non-Enterobacteriaceae from animals and the environment: an emerging public health risk of our own making? J. Antimicrob. Chemother., 2014, vol. 69, pp. 287–291. doi: 10.1093/jac/dkt392</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
