<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">730</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-2018-2-127-138</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>REVIEWS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОБЗОРЫ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">THE PREVALENCE OF HIV RECOMBINANT FORMS IN RUSSIA AND COUNTRIES OF THE CIS: SYSTEMATIC REVIEW AND METAANALYSIS</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ РЕКОМБИНАНТНЫХ ФОРМ ВИЧ-1 В РЕГИОНАХ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ И СТРАН СНГ: СИСТЕМАТИЧЕСКИЙ ОБЗОР И МЕТААНАЛИЗ</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Pasechnik</surname><given-names>O. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Пасечник</surname><given-names>О. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Medicine), Senior Lecturer, Department of Epidemiology, Omsk State Medical University, Omsk, Russian Federation</p><p>644050, Russian Federation, Omsk, Mira str., 9</p><p>Phone: +7 (3812) 65-06-54 (office)</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>м.н., старший преподаватель кафедры эпидемиологии ФГБОУ ВО Омский  государственный медицинский университет, г. Омск, Россия</p><p>644050, Россия, г. Омск, ул. Мира, 9</p><p>Тел.: 8 (3812) 65-06-54 (служебн.)</p></bio><email>opasechnik@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Blokh</surname><given-names>A. I.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Блох</surname><given-names>А. И.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Assistant Professor, Department of Epidemiology, Omsk State Medical University, Omsk, Russian Federation</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>ассистент кафедры эпидемиологии ФГБОУ ВО Омский государственный  медицинский университет, г. Омск, Россия</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Omsk State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Омский государственный медицинский университет МЗ РФ</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2018-09-10" publication-format="electronic"><day>10</day><month>09</month><year>2018</year></pub-date><volume>8</volume><issue>2</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>127</fpage><lpage>138</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2018-09-07"><day>07</day><month>09</month><year>2018</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2018-09-07"><day>07</day><month>09</month><year>2018</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2018, Pasechnik O.A., Blokh A.I.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2018, Пасечник О.А., Блох А.И.</copyright-statement><copyright-year>2018</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Pasechnik O.A., Blokh A.I.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Пасечник О.А., Блох А.И.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/730">https://iimmun.ru/iimm/article/view/730</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>This review was to aimed to access the prevalence of HIV recombinant forms in Russia and countries of the CIS, which have  close social and economic ties. We conducted a search in Russian  Science Citation Index and PubMed for a depth of 8 years. We  included 22 articles, which contained the results of 35 independent  cross-sectional studies, in our review. Meta-analysis of HIV  recombinant forms prevalence was conducted in Open Meta-analyst  with the use of Der Simonian &amp; Laird method, arcsin transformation  and correction factor for zero values. Subgroup analysis was used  along with meta-regression (by date of collection). Pooled prevalence of HIV recombinant forms was 21.3% (95% CI 16.2–26.5) and was  highly heterogeneous. Blood samples from 3,494 HIV patients living  in various regions of the Russian Federation and CIS countries —  Belarus, Kazakhstan, Kyrgyzstan, Uzbekistan, Tajikistan, Armenia,  Georgia — were examined. Among subtypes of HIV-1, the main  share was occupied by subtype A — 75.6% (n = 2643), subtype B —  5.5% (n = 193), C — 0.8% (n = 31), G — 0.2% (n = 7), F —  0.14% (n = 5). Among the recombinant forms (n = 616), the  fraction of CRF02_ AG was 39.6% (n = 244), CRF02_AG/A was  32.9% (n = 203), CRF63_02A1 was 15.9% (n = 98), CRF03_AB —  5.2% (n = 32), CRF06_cpx — 2.1% (n = 13). Unique recombinant  forms were 2.7% (n = 17), including URF63_A1 (2.5%). In Russia, the highest prevalence of recombinant forms of HIV-1 was  registered in the Siberian Federal District (33.2% (95% CI 12.2– 54.1), the lowest in the Northwest Federal District — 1.6% (95% CI  0.9–2.3). In the CIS countries, the highest prevalence of  recombinant forms of HIV-1 is found in a subgroup of the Central  Asian republics — Uzbekistan, Tajikistan, Kyrgyzstan, Kazakhstan —  51.7% (95% CI 38.5–64.9). The significant upward trend was shown with a meta-regression. Our review is the first such research in  Russia and thus is of significant interest, but the result should be  applied with caution due to high risk of publication bias as well as significant heterogeneity of our results.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Настоящий обзор посвящен оценке распространенности рекомбинантных форм ВИЧ в России и странах СНГ, с которыми имеются тесные социально-экономические связи. Был  проведен поиск на глубину 8 лет по базам данных Russian Science Citation Index и PubMed. В обзор включены 22 статьи, в которых приведены результаты 35 самостоятельных  поперечных исследований. Проведен метаанализ распространенности рекомбинантных форм ВИЧ в приложении Open Meta-analyst по методу Der Simonian &amp; Laird с использованием  арксинусовой трансформации и поправочного коэффициента для нулевых результатов.  Дополнительно использованы анализ в подгруппах и метарегрессия (по дате сбора  материала). Обобщенная распространенность рекомбинантных форм ВИЧ составила 21,3%  (95% ДИ 16,2–26,5) и характеризовалась высокой гетерогенностью. Были исследованы  образцов крови от 3494 больных ВИЧ-инфекцией, проживающих в различных субъектах РФ  и стран СНГ — Беларуси, Казахстане, Кыргызстане, Узбекистане, Таджикистане, Армении, Грузии. Среди субтипов ВИЧ-1 основную долю занимал субтип А (75,6%, n =  2643), субтип В — 5,5% (n = 193), С — 0,8% (n = 31), G — 0,2%, (n = 7), F — 0,14% (n =  5). Среди рекомбинантных форм (n = 616) доля CRF02_AG составляла 39,6% (n = 244),  CRF02_AG/A — 32,9% (n = 203), CRF63_02A1 — 15,9% (n = 98), CRF03_АВ — 5,2% (n = 32), CRF06_cpx — 2,1% (n = 13). Уникальные рекомбинантные формы составили 2,7% (n = 17),  в том числе URF63_A1 (2,5%). На территории России наибольшая распространенность  рекомбинантных форм ВИЧ-1 отмечена на территории Сибирского федерального округа —  33,2% (95% ДИ 12,2–54,1), наименьшая — в Северо-Западном федеральном округе — 1,6%  (95% ДИ 0,9–2,3). В странах СНГ наибольшая распространенность рекомбинантных форм  ВИЧ-1 выявлена в подгруппе среднеазиатских республик — Узбекистана, Таджикистана,  Кыргызстана, Казахстана — 51,7% (95% ДИ 38,5–64,9). Обнаружен статистически значимый восходящий тренд метарегрессии. Данный обзор является первым подобным исследованием  в России и представляет определенный интерес, однако результаты должны использоваться  с осторожностью из-за высокого риска публикационного смещения и существенной гетерогенности обобщенной оценки.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>HIV-1</kwd><kwd>prevalence</kwd><kwd>subtypes</kwd><kwd>genotypes</kwd><kwd>circulating recombinant forms</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>ВИЧ-1</kwd><kwd>распространенность</kwd><kwd>субтипы</kwd><kwd>генотипы</kwd><kwd>циркулирующие рекомбинантные формы</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1. Беляков Н.А., Розенталь В.В., Дементьева Н.Е., Виноградова Т.Н., Сизова Н.В. Моделирование и общие закономерности циркуляции субтипов и рекомбинантных форм ВИЧ // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2012. Т. 4, № 2. С. 7–18. [Belyakov N.A., Rosental V.V., Dementeva N.E., Vinogradova T.M., Sizova N.V. Mathematical modelling and general trends of circulation of HIV subtypes and recombinant forms. VICh-infektsiya i immunosupressii = HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, vol. 4, no. 2, pp. 7–18. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Бобкова М.Р. История и некоторые результаты генотипирования ВИЧ в России // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015. Т. 7, № 4. С. 7–16. [Bobkova M.R. History and some results of HIV genotyping in Russia. VICh-infektsiya i immunosupressii = HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2015, vol. 7, no. 4, pp. 7–16. doi: 10.22328/2077-9828- 2015-7-4-7-16 (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Гашникова Н.М., Тотменин А.В., Саухат С.Р., Шемшура А.Б., Колпаков Д.С., Кучеренко И.Б., Матузкова А.Н., Козырев О.А. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика распространения ВИЧ-инфекции на юге России // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2013. Т. 5, № 4. С. 73–81. [Gashnikova N.M., Totmenin A.V., Sauhat S.R., Shemshura A.B., Kolpakov D.S., Kucherenko L.B., Matuzkova A.N., Kozyrev O.A. Molecular epidemiological characteristics of the HIV-1 transmission in Southern Russia. VICh-infektsiya i immunosupressii = HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2013, vol. 5, no. 4, pp. 73–81. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Елиссева В.С., Кругляк С.П. Скляр Л.Ф., Махно Е.С. Распространенность мутаций резистентности ВИЧ-1 к препаратам АРВТ в Приморском крае // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015. Т. 7, № 2. С. 49–54. [Eliseeva V.S., Kruglyak S.P., Sklyar L.F., Smahno E. Prevalence of HIV-1 drug resistance mutations in Primorsky Region. VICh- infektsiya i immunosupressii = HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2015, vol. 7, no. 2, pp. 49–54. doi: 10.22328/2077-9828-2015-7-2-49-55 (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Еремин Е.Ф., Гасич Е.Л., Сосинович С.В., Суетнов О.Н., Грушко П.Н., Грушко Т.П., Ильенкова В.С., Горбунова Н.А., Амбарцумян Е.Г., Карпов И.А. Молекулярная эпидемиология ВИЧ/СПИД в Беларуси (2008–2011) // Здравоохранение (Минск). 2012. № 1. С. 25–34. [Yeryomin V.F., Gasich E.L., Sosinovich S.V., Suyetnov O.N., Grushko P.N., Grushko T.P., Iliyenkova V.S., Gorbunova N.A., Karpov I.A. Molecular epidemiology of HIV/AIDS in Belarus (2008–2011). Zdravookhranenie (Minsk) = Public Health (Minsk), 2012, no. 1, pp. 25–34. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Казачинская А.Г., Богачев В.В., Барышев П.Б., Тотменин А.В., Чубарева Е.А., Ачигечева П.Ю., Золотарева И.В., Мирджамалова Ф.О., Топчин Ю.А., Черноусова Н.Я., Чичамкина Н.В., Абрамов В.А., Гашникова Н.М. Территориальные особенности распространения генетических вариантов ВИЧ-1 в Сибирском федеральном округе // Медицина и образование в Сибири. 2013. № 3. 12 с. [Kazachinskaya А.G., Bogachev V.V., Baryshev P.B., Tommenin А.V., Chybareva Е.А., Achigecheva P.Y., Zolotareva I.V., Mirdzhamalova F.O., Topchin Y.А., Chernousova N.Y., Chichamkina N.V., Abramov V.А., Gashnikova N.M. Territorial features of spread of HIV-1 genetic options in Siberian federal district. Meditsina i obrazovanie v Sibiri = Medicine and Education in Siberia, 2013, no. 3, 12 p. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Казеннова Е.В., Васильев А.В., Лаповок И.А., Гришечкин А.Е., Лага В.Ю., Саламов Г.Г., Туманов А.С., Парыгина О.А., Рузаева Л.А., Грезина Л.А., Серкина Т.П., Кауфман О.А., Ооржак Н.Д., Лукашов В.В., Бобкова М.Р. Генетические варианты ВИЧ-1 в азиатской части России (2005–2010) // Вопросы вирусологии. 2013. Т. 58, № 4. С. 28–35. [Kazennova E.V., Vasilyev A.V., Lapovok I.A., Grishechkin A.E., Laga V.Yu., Salamov G.G., Tumanov A.S., Parygina O.V., Ruzaeva L.A., Grezina L.A., Serkina T.P., Kaufman O.A., Oordjak N.D., Lukashov V.V., Bobkova M.R. HIV-1 genetic variants in the Asian Part of Russia: a study (2005–2010). Voprosy virusologii = Problems of Virology, 2013, vol. 58, no. 4, pp. 28–35. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8. Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лебедев А.В., Лага В.Ю., Глущенко Н.В., Зверев С.Я., Нистратова Ю.И., Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Герасимов В.В., Шошокин В.А., Бобкова М.Р. Анализ резистентности ВИЧ в Приволжском федеральном округе Российской Федерации // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2015. Т. 7, № 3. С. 56–66. [Kazennova Y.V., Lapovok I.A., Lebedev A.V., Laga V.J., Glushchenko N.V., Zverev S.Y., Nistratova Y.I., Zaytseva N.N., Parfenova O.V., Gerasimov V.V., Shoshokin V.A., Bobkova M.R. Analysis of HIV drugs resistance in Privolzhskiy federal district of the Russian Federation. VICh-infektsiya i immunosupressii = HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2012, vol. 4, no. 2, pp. 7–18. doi: 10.22328/2077-9828-2015-7-3-56-66 (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Казеннова Е.В., Нешумаев Д.А., Рукавицин Д.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Ракчеева О.В., Васильев А.В., Туманов А.С., Воронцова Г.А., Кузнецова А.В., Лойфман Е.А., Старухина И.Н., Кустова О.И., Половица Н.В., Липская Н.А., Бобкова М.Р. Молекулярно- эпидемиологический анализ эпидемии ВИЧ-инфекции в Благовещенске и Хабаровске (Дальний Восток России) // Вопросы вирусологии. 2014. Т. 59, № 4. С. 31–36. [Kazennova E.V., Neshumaev D.A., Rukavitsyn D.V., Lapovok I.A., Laga V.Yu., Rakcheeva O.V., Vasilyev A.V., Tumanov A.S., Vorontsova G.A., Kuznetsova A.V., Loyfman E.A., Staruchina I.N., Kustova O.I., Polovica N.V., Lipskaya N.A., Bobkova M.R. Molecular epidemiological analysis of the HIV infection in the Blagoveshchensk and Khabarovsk Area (Russian Far East). Voprosy virusologii = Problems of Virology, 2014, vol. 59, no. 4, pp. 31–36. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10. Котова В.О., Балахонцева Л.А., Троценко О.Е. Анализ лекарственной устойчивости ВИЧ-1 в регионах Дальневосточного федерального округа // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2016. Т. 8, № 3. С. 53–58. [Kotova V.O., Balakhontseva L.A., Trotsenko O.E. Analysis of HIV-1 drug resistance in regions of the Far Easten federal district. VICh- infektsiya i immunosupressii = HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2016, vol. 8, no. 3, pp. 53–58. doi: 10.22328/2077-9828-2016-8-3-53-58 (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>11. Лага В.Ю., Казеннова Е.В., Васильев А.В., Лаповок И.А., Исмаилова А., Бейшеева А., Асыбалиева Н., Бобкова М.Р. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1 на территории Киргизии. Вопросы вирусологии. 2012. Т. 57, № 5. С. 26–32. [Laga V.Yu., Kazennova E.V., Vasilev A.V., Lapovok I.A., Ismailova A., Beisheeva N., Asybalieva N., Bobkova M.R. Molecular-genetic characterization of the HIV-1 variants abundant in Kirghizia. Voprosy virusologii = Problems of Virology, 2012, vol. 57, no. 5, pp. 26–32. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>12. Лаповок И.А., Лага В.Ю., Казеннова Е.В., Васильев А.В., Дзисюк Н.В., Утегенова А.К., Абишев А.Т., Тукеев М.С., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологический анализ ВИЧ-1 в Казахстане в 2009–2013 гг. // Вопросы вирусологии. 2015. Т. 60, № 4. С. 29–37. [Lapovok I.A., Laga V.Y., Kazennova E.V., Vasilyev A.V., Dzissyuk N.V., Utegenova A.K., Abishev A.T., Tukeev M.S., Bobkova M.R. Molecular epidemiological analysis of HIV-1 in Kazakhstan in 2009–2013. Voprosy virusologii = Problems of Virology, 2015, vol. 60, no. 4, pp. 29–37. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>13. Москалейчик Ф.Ф., Лага В.Ю., Дельгадо Е., Вега И., Фернандес-Гарсия А., Перес-Альварес Л., Корнилаева Г.В., Пронин А.Ю., Жернов Ю.В., Томпсон М.М., Бобкова М.Р., Карамов Э.В. Стремительное распространение рекомбинантной формы CRF02_AG ВИЧ-1 на территории России и сопредельных стран // Вопросы вирусологии. 2015. Т. 60, № 6. С. 14–19. [Moskaleychik F.F., Laga V.Yu., Delgado E., Vega Y., Fernandez-Garcia A., Perez-Alvarez L., Kornilaeva G.V., Pronin A.Yu., Zhernov Yu.V., Thomson M.M., Bobkova M.R., Karamov E.V. Rapid spread of the HIV-1 circular recombinant CRF02-AG in Russia and neighboring countries. Voprosy virusologii = Problems of Virology, 2015, vol. 60, no. 6, pp. 14–19. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>14. Мусатов Б.В., Яковлев А.А., Тыргина Т.В., Ладная Н.Н. Прогностическое значение результатов генотипирования вирусов иммунодефицита человека, выделенных от больных первичной ВИЧ-инфекцией в 2009 и 2011 годах в Санкт-Петербурге // Вестник Санкт-Петербургского университета. 2013. Сер. 11, вып. 1. С. 171–178. [Musatov V.B., Yakovlev A.A., Tirgina T.V., Ladnaya N.N. The prognostic signifi cance of the results of genotyping human immunodeficiency virus isolated from the patients with primary HIV- infection in 2009 and 2011 in St. Petersburg. Vestnik Sankt-Peterburgskogo universiteta = Bulletin of St. Petersburg University, 2013, ser. 11, iss. 1, pp. 171–178. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>15. Понамарева О.А., Ревизор А.О., Круглова Е.А., Плотникова Ю.К., Наумова Е.С. Генетическое разнообразие ВИЧ-1 на территории Иркутской области // Лабораторная служба. 2016. № 1. С. 33–37. [Ponomareva O.A., Revizor A.O., Kruglova E.A., Plotnikova Yu.K., Naumova E.S. Genetic diversity of HIV-1 in Irkutsk region. Laboratornaya sluzhba = Laboratory service, 2016, no. 1, pp. 33–37. doi: 10.17116/labs20165133-37 (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>16. Чурина М.А., Останкова Ю.В., Семенов А.В., Никитина Н.А., Росоловский А.П., Гребенкина Е.В., Ткаченко Т.Н., Жандармова Т.А., Трофимова Т.С., Асадуллаев М.Р., Беляков Н.А., Тотолян А.A. Молекулярная эпидемиология и фармакорезистентность ВИЧ-1 у пациентов с неэффективностью АРВТ в Великом Новгороде // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2017. Т. 9, № 1. С. 82–92. [Churina M.A., Ostankova Y.V., Semenov A.V., Nikitina N.A., Rosolovsky A.P., Grebyonkina E.V., Tkachenko T.N., Zhandarmova T.А., Trofimova T.S., Asadullayev M.R., Belyakov N.A., Totolian A.A. HIV-1 drug-resistance and molecular epidemiology in patients with art failure in Veliky Novgorod. VICh-infektsiya i immunosupressii = HIV Infection and Immunosuppressive Disorders, 2017, vol. 9, no. 1, pp. 82–92. doi: 10.22328/2077-9828-2017-9-1-82-92 (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>17. Barendregt J.J., Doi S.A., Lee Y.Y., Norman R.E., Vos T. Meta-analysis of prevalence. J. Epidemiol. Community Health, 2013, no. 67, pp. 974–978. doi: 10.1136/jech-2013-203104</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>18. Beyrer C., Patel Z., Stachowiak J.A., Tishkova F.K., Stibich M.A., Eyzaguirre L.M., Carr J.K., Mogilnii V., Peryshkina A., Latypov A., Strathdee S.A. Characterization of the emerging HIV type 1 and HCV epidemics among injecting drug users in Dushanbe, Tajikistan. AIDS Res. Hum. Retroviruses, 2009, vol. 25, no. 9, pp. 853–860. doi: 10.1089/aid.2008.0206</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>19. Brodley C.E., Lau J., Schmid C.H. Open meta-analyst. URL: http://www.cebm.brown.edu/openmeta/downloads/open_meta_analyst_win8.zip (11.05.2018)</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>20. Castley A., Sawleshwarkar S., Varma R., Herring B., Thapa K., Dwyer D., Chibo D., Nguyen N., Hawke K., Ratcliff R., Garsia R., Kelleher A., Nolan D. A national study of the molecular epidemiology of HIV-1 in Australia 2005–2012. PLoS ONE, 2017, vol. 12, no. 5: e0170601. doi: 10.1371/journal.pone.0170601</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>21. Chow W.Z., Takebe Y., Syafina N.E., Prakasa M.S., Chan K.G., Abed Al-Darraji H.A., Koh C., Kamarulzaman A., Tee K.K. A newly emerging HIV-1 recombinant lineage (CRF58_01B) disseminating among people who inject drugs in Malaysia. PLoS ONE, 2014, vol. 9, no. 1: e85250. doi: 10.1371/journal.pone.0085250</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>22. Chu M., Zhang W., Zhang X., Jiang W., Huan X., Meng X., Zhu B., Yang Y., Tao Y., Tian T., Lu Y., Jiang L., Zhang L., Zhuang X. HIV-1 CRF01_AE strain is associated with faster HIV/AIDS progression in Jiangsu Province, China. Sci. Rep., vol. 7, pp. 1570. doi: 10.1038/s41598-017-01858-2</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>23. Dvali N., Parker M.M., Chkhartishvili N., Sharvadze L., Gochitashvili N., Abutidze A., Karchava M., De Hovitz J.A., Tsertsvadze T. Characterization of HIV-1 subtypes and drug resistance mutations among individuals infected with HIV in Georgia. J. Med. Virol., 2012, vol. 84, no. 7, pp. 1002–1008. doi: 10.1002/jmv.23269</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>24. Esbjornsson J., Mild M., Audelin A., Fonager J., Skar H., Jorgensen L., Liitsola K., Björkman P., Bratt G., Gisslén M., Sönnerborg A., Nielsen C., Medstrand P., Albert J. HIV-1 transmission between MSM and heterosexuals, and increasing proportions of circulating recombinant forms in the Nordic Countries. Virus Evol., 2016, vol. 2, iss. 1. doi: 10.1093/ve/vew010</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>25. Gashnikova N., Astakhova E., Gashnikova M., Bocharov E., Petrova S.V., Pun’ko O., Popkov A.V., Totmenin A.V. HIV-1 epidemiology, genetic diversity, and primary drug resistance in the Tyumen oblast, Russia. BioMed Res. Int., 2016, 13 p. doi: 10.1155/2016/2496280</mixed-citation></ref><ref id="B26"><label>26.</label><mixed-citation>26. Gashnikova N.M., Bogachev V.V., Baryshev P.B., Totmenin A.V., Gashnikova M.P., Kazachinskaya A.G., Ismailova T., Stepanova S.A., Chernov A.S., Mikheev V.N. A rapid expansion of HIV-1 CRF63_02A1 among newly diagnosed HIV-infected individuals in the Tomsk Region, Russia. AIDS Res. Hum. Retroviruses, 2015, vol. 31, no. 4, pp. 456–460. doi: 10.1089/aid.2014.0375</mixed-citation></ref><ref id="B27"><label>27.</label><mixed-citation>27. Gashnikova N.M., Zyryanova D.P., Astakhova E.M., Ivlev V.V., Gashnikova M.P., Moskaleva N.V., Aikin S.S., Bulatova T.N., Pustylnikov S.V., Bocharov E.F., Totmenin A.V. Predominance of CRF63_02A1 and multiple patterns of unique recombinant forms of CRF63_A1 among individuals with newly diagnosed HIV-1 infection in Kemerovo Oblast, Russia. Arch. Virol., 2017, vol. 162, no. 2, pp. 379–390. doi: 10.1007/s00705-016-3120-4</mixed-citation></ref><ref id="B28"><label>28.</label><mixed-citation>28. Global AIDS Response Progress Reporting 2016. URL: https://aidsreportingtool.unaids.org/static/docs/GARPR_Guidelines_2016_EN.pdf (11.05.2018)</mixed-citation></ref><ref id="B29"><label>29.</label><mixed-citation>29. Gottlieb G.S., Nickle D.C., Jensen M.A., Wong K.G., Grobler J., Li F., Liu S.L., Rademeyer C., Learn G.H., Karim S.S., Williamson C., Corey L., Margolick J.B., Mullins J.I. Dual HIV-1 infection associated with rapid disease progression. Lancet, 2004, vol. 363, pp. 619–622.</mixed-citation></ref><ref id="B30"><label>30.</label><mixed-citation>30. Higgins J.P., Thompson S.G., Deeks J.J., Altman D.G. Measuring inconsistency in meta-analysis. BMJ, 2003, vol. 327, pp. 557–560. doi: 10.1136/bmj.327.7414.557</mixed-citation></ref><ref id="B31"><label>31.</label><mixed-citation>31. Laga V., Lapovok I., Kazennova E., Ismailova A., Beisheeva N., Asybalieva N., Glushchenko N., Bobkova M. The genetic vari ability of HIV-1 in Kyrgyzstan: the spread of CRF02_AG and subtype A1 recombinants. J. HIV AIDS, 2015, vol. 1 (2), 5 p. doi: 10.16966/jha.106</mixed-citation></ref><ref id="B32"><label>32.</label><mixed-citation>32. Laga V., Vasilyev A., Lapovok I., Grigoryan S., Papoyan A., Glushchenko N., Kazennova E., Bobkova M. HIV type 1 subtype A1 dominates in Armenia. Curr. HIV Res., 2015, vol. 13, iss. 3, pp. 219–225. doi: 10.2174/1570162X13666150407142834</mixed-citation></ref><ref id="B33"><label>33.</label><mixed-citation>33. Lapovok I., Laga V., Kazennova E., Bobkova M. HIV type 1 integrase natural polymorphisms in viral variants circulating in FSU countries. Curr. HIV Res., 2017, vol. 15, no. 5, pp. 318–326. doi: 10.2174/1570162X15666170815162052</mixed-citation></ref><ref id="B34"><label>34.</label><mixed-citation>34. Lau K.A., Wong J.L. Current trends of HIV recombination worldwide. Infect. Dis. Rep., 2013, vol. 6, no. 5, suppl. 1: e4. doi: 10.4081/idr.2013.s1.e4</mixed-citation></ref><ref id="B35"><label>35.</label><mixed-citation>35. Neogi U., Häggblom A., Santacatterina M., Bratt A., Gisslén M., Albert J., Sonnerborg A. Temporal trends in the Swedish HIV-1 epidemic: increase in non-B subtypes and recombinant forms over three decades. PLoS One, 2014, vol. 9, no. 6: e99390. doi: 10.1371/journal.pone.0099390</mixed-citation></ref><ref id="B36"><label>36.</label><mixed-citation>36. Palm A.A., Esbjornsson J., Mansson F., Kvist A., Isberg P.E., Biague A., da Silva Z.J., Jansson M., Norrgren H., Medstrand P. Faster progression to AIDS and AIDS-Related death among seroincident individuals infected with recombinant HIV-1 A3/CRF02_AG compared with sub-subtype A3. J. Infect. Dis., 2013, vol. 209, no. 5, pp. 721–728. doi: 10.1093/infdis/jit416</mixed-citation></ref><ref id="B37"><label>37.</label><mixed-citation>37. Peeters M., Delaporte E. Genetic diversity of HIV infection worldwide and its consequences. Med. Trop. (Mars), 1999, vol. 59, no. 2, pp. 449–455.</mixed-citation></ref><ref id="B38"><label>38.</label><mixed-citation>38. Tebit D.M., Arts E.J. Tracking a century of global expansion and evolution of HIV to drive understanding and to combat disease. Lancet Infect. Dis., 2011, vol. 11, no. 1, pp. 45–56. doi: 10.1016/S1473-3099(10)70186-9</mixed-citation></ref><ref id="B39"><label>39.</label><mixed-citation>39. Wang X., Wu Y., Mao L., Xia W., Zhang W., Dai L., Mehta S.R., Wertheim J.O., Dong X., Zhang T., Wu H., Smith D.M. Targeting HIV prevention based on molecular epidemiology among deeply sampled subnetworks of men who have sex with men. Clin. Infect. Dis., 2015, vol. 61, no. 9, pp. 1462–1468. doi: 10.1093/cid/civ526</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
