<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">672</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-2018-1-54-60</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">SOCIETY OF ENVIRONMENTAL NICHE: ORAL CAVITY OF THE HEALTHY CHILDREN</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>МИКРОБНЫЙ СОЦИУМ ЭКОЛОГИЧЕСКОЙ НИШИ: РОТОВАЯ ПОЛОСТЬ ЗДОРОВЫХ ДЕТЕЙ</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Burmistrova</surname><given-names>A. L.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бурмистрова</surname><given-names>А. Л.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Professor, Head of the Department of Microbiology, Immunology and General Biology, Dean of the Faculty of Biology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Доктор медицинских наук, профессор, заведующая кафедрой микробиологии, иммунологии и общей биологии, декан биологического факультета</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Filippova</surname><given-names>Yu. Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Филиппова</surname><given-names>Ю. Ю.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Yuliya Yu. Filippova - PhD (Biology), Associate Professor, Department of Microbiology, Immunology and General Biology, Faculty of Biology.</p><p>454001, Chelyabinsk, Bratiev Kashirinykh str., 129, Phone: +7 (351) 799-71-76 (office), Fax: +7 (351) 742-09-25</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Филиппова Юлия Юрьевна - кандидат биологических наук, доцент кафедры микробиологии,  иммунологии и общей биологии биологического факультета.</p><p>454001, Челябинск, ул. Братьев Кашириных, 129, тел.: 8 (351) 799-71-76 (служебн.), факс: 8 (351) 742-09-25</p></bio><email>julse@rambler.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Nokhrin</surname><given-names>D. Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Нохрин</surname><given-names>Д. Ю.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Associate Professor, Department of Microbiology, Immunology and General Biology, Faculty of Biology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Кандидат биологических наук, доцент кафедры микробиологии иммунологии и общей биологии биологического факультета</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Timofeeva</surname><given-names>A. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Тимофеева</surname><given-names>А. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Head of the Educational Laboratory of Microbiology and Immunology, PhD Student, Department of Microbiology and Immunology, PhD Student, Department of Microbiology, Immunology and General Biology of the Faculty of Biology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Заведующая учебной лабораторией микробиологии и иммунологии, очный аспирант второго года обучения кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии  биологического факультета</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Chelyabinsk State University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Челябинский государственный университет</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2018-05-16" publication-format="electronic"><day>16</day><month>05</month><year>2018</year></pub-date><volume>8</volume><issue>1</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>54</fpage><lpage>60</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2018-05-17"><day>17</day><month>05</month><year>2018</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2018-05-17"><day>17</day><month>05</month><year>2018</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2018, Burmistrova A.L., Filippova Y.Y., Nokhrin D.Y., Timofeeva A.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2018, Бурмистрова А.Л., Филиппова Ю.Ю., Нохрин Д.Ю., Тимофеева А.В.</copyright-statement><copyright-year>2018</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Burmistrova A.L., Filippova Y.Y., Nokhrin D.Y., Timofeeva A.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Бурмистрова А.Л., Филиппова Ю.Ю., Нохрин Д.Ю., Тимофеева А.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/672">https://iimmun.ru/iimm/article/view/672</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>In recent years, saliva is increasingly being used as a diagnostic fluid for the evaluation of various biological parameters, namely, the levels of activity of the information signal molecules of the metaorganism — the immune-neuroendocrine nature, but less often the metabolites of the microbial community and the structure of the bacterial society. The paper assesses the microbial society of the oral cavity (saliva/smear from the surfaces of the microbiota) healthy children in order to create microbial images of «health» — control that can be used in the study of the microbial community in the development of local and/or systemic pathophysiological processes, including infections, in the child’s body. Using the method of Gas chromatography mass spectrometry of microbial markers, specific chemical markers of 38 taxa of microorganisms in the oral cavity of healthy children from 1.5 to 14 years have been determined. To determine the distribution of various representatives of microbial societies between ecological niches (saliva/smear) in the oral cavity and assess the effect on them of the age of children, a Canonical Correspondences Analysis was used. A high similarity of the microbiota structure of saliva and smear from microbiota living surfaces in healthy children was found, which may indicate cross paths of bacterial representatives of different species and genera of the microbial community, or their functional plasticity. Of greatest interest are the data on the number of bacteria of the genus Alcaligenes spp. in the smear from the surfaces of the microbiota, which is twice higher, than in saliva. Alcaligenes presents itself as a professional organizer of security measures in relation to the place of residence: it produces antibiotics and original antibacterial components that disorganize the growth of a wide variety of bacteria. In addition, it is able to initiate B-lymphocytes of lymphoid follicles to produce Alcaligenes-specific antibodies, to create from them their own «cloaking» coating, facilitating its entry into Peyer’s plaques through M-cells. It can be assumed that the level of Alcaligenes spp. in saliva to some extent reflects the migration of representatives of this genus, both from the palatine and from the nasopharyngeal tonsils. The age features of the microbiota of the ecological niche — the oral cavity are determined: the number of representatives of the genus Clostridium spp. increases with age in children. And the number of bifidobacteria decreases. The results obtained by us can be used as a control in systemic pathophysiological processes, including infectious etiology, as well as during therapy.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>В последние годы слюна все чаще используется в качестве диагностической жидкости для оценки различных биологических параметров, а именно уровней активности информационных сигнальных молекул метаорганизма — иммуннонейроэндокринной природы, но реже — метаболитов микробного сообщества и структуры бактериального социума. В работе проведена оценка микробного социума ротовой полости (слюна/мазок с поверхностей проживания микробиоты) здоровых детей с целью создания микробных образов «здоровья» — контроля, который может использоваться в изучении микробного сообщества при развитии локальных и/или системных патофизиологических процессов, в том числе инфекционной природы, в организме ребенка. С помощью метода газовой хромaто-масс-спектрометрии микробных маркеров определены специфические химические маркеры 38 таксонов микроорганизмов в полости рта здоровых детей от 1,5 до 14 лет. Для выявления распределения различных представителей микробных социумов между экологическими нишами (слюна/мазок) в ротовой полости и оценки влияния на них возраста детей был использован многомерный статистический метод — канонический анализ соответствий. Обнаружено высокое сходство структуры микробиоты слюны и мазка с поверхностей проживания микробиоты у здоровых детей, что, возможно, свидетельствует о перекрестных путях движения бактериальных представителей различных видов и родов микробного сообщества или об их функциональной пластичности. Наибольший интерес представляют данные о количестве бактерий рода Alcaligenes spp. в мазке с поверхностей проживания микробиоты, которое в два раза превышает аналогичный показатель в слюне. Alcaligenes продуцирует антибиотики и оригинальные антибактериальные компоненты, дезорганизующие рост широкого круга бактерий, а также инициирует В-лимфоциты лимфоидных фолликулов к продукции Alcaligenes-специфичных антител, для создания из них собственного «плащевого» покрытия, облегчающего ее поступление в Пейеровы бляшки через М-клетки. Можно предположить, что уровень Alcaligenes spp. в слюне в какой-то степени отражает миграцию представителей данного рода как из небных, так и из назофарингеальных миндалин. Определены возрастные особенности микробиоты экологической ниши — ротовой полости: с возрастом у детей повышается число представителей рода Clostridium spp. и снижается количество бифидобактерий. Полученные нами результаты могут использоваться в качестве контроля при системных патофизиологических процессах, в том числе инфекционной этиологии, а также в ходе терапии.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>microbiota</kwd><kwd>oral cavity</kwd><kwd>saliva</kwd><kwd>smear</kwd><kwd>healthy children</kwd><kwd>Alcaligenes spp</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>микробиота</kwd><kwd>ротовая полость</kwd><kwd>слюна</kwd><kwd>мазок</kwd><kwd>здоровые дети</kwd><kwd>Alcaligenes spp.</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1. Джонгман Р.Г.Г., Тер Брак С.Дж.Ф., Ван Тонгерен О.Ф.Р. Анализ данных в экологии сообществ и ландшафтов: пер. с англ. М.: РАСХН, 1999. 306 с.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Aas J.A., Paster B.J., Stokes L.N., Olsen I., Dewhirst F.E. Defining the normal bacterial flora of the oral cavity. J. Clin. Microbiol., 2005, vol. 43, no. 11, pp. 5721–5732. doi: 10.1128/JCM.43.11.5721-5732.2005</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Adam P., Gernert C., Schmitt S., Haralambieva E., Ott G., Muller-Hermelink H.K., Hentschel U. The spectrum of microbiological agents causing pulmonary MALT-type lymphomas. A 16S rRNA-based analysis of microbial diversity. Der Pathologe, 2008, vol. 29, suppl. 2, pp. 290–296. doi: 10.1007/s00292-008-1068-1</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Armstrong J.L., Shigeno D.S., Calomiris J.J., Seidler R.J. Antibiotic-resistant bacteria in drinking water. Appl. Environ Microbiol., 1981, vol. 42, no. 2, pp. 277–283.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Ben-Jacob E. Social behavior of bacteria: from physics to complex organization. Eur. Phys. J. B, 2008, vol. 65, iss. 3, pp. 315–322. doi: 10.1140/epjb/e2008-00222-x</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Bik E.M., Davis Long C., Armitage G.C., Loomer P., Emerson J., Mongodin E.F., Nelson K.E., Gill S.R., Fraser-Liggett C.M., Relman D.A. Bacterial diversity in the oral cavity of ten healthy individuals. ISME J., 2010, vol. 4, no. 8, pp. 962–974. doi: 10.1038/ismej.2010.30</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Brandtzaeg P. Immunology of tonsils and adenoids: everything the ENT surgeon needs to know. Int. J. Pediatr. Otorhinolaryngol., 2003, vol. 67, suppl. 1, pp. S69-S76. doi: 10.1016/j.ijporl.2003.08.018</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8. Busse H.J., Stolz A. Achromobacter, alcaligenes and related genera. The Prokaryotes. Eds. Dworkin M., Falkow S., Rosenberg E., Schleifer K.H., Stackebrandt E. New York: Springer, 2006, pp. 675–700. doi: 10.1007/0-387-30745-1_28</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Dewhirst F.E., Chen T., Izard J., Paster B.J., Tanner A.C., Yu W.H., Lakshmanan A., Wade W.G. The human oral microbiome. J. Bacteriol., 2010, vol. 192, no. 19, pp. 5002–5017. doi: 10.1128/JB.00542-10</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10. Ding T., Schloss P.D. Dynamics and associations of microbial community types across the human body. Nature, 2014, vol. 509, pp. 357–360. doi: 10.1038/nature13178</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>11. Fung T.C., Artis D., Sonnenberg G.F. Anatomical localization of commensal bacteria in immune cell homeostasis and disease. Immunol. Rev., 2014, vol. 260, iss. 1, pp. 35–49. doi: 10.1111/imr.12186</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>12. Hammer О., Harper D.A.T., Ryan P.D. PAST: paleontological statistics software package for education and data analysis. Palaeontologia Electronica, 2001, vol. 4, no.1, pp. 9.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>13. Lazarevic V., Whiteson K., Hernandez D., Francois P., Schrenzel J. Study of inter- and intra-individual variations in the salivary microbiota. BMC Genomics, 2010, vol. 11:523. doi: 10.1186/1471-2164-11-523</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>14. Legendre P., Birks H.J.B., Lotter A.F., Juggins S., Smol J.P. From classical to canonical ordination. Tracking Environmental Change using Lake Sediments. Volume 5: Data handling and numerical techniques. Chapter 8. Eds: Birks H.J.B., Lotter A.F., Juggins S., Smol J.P. Dordrecht: Springer, 2012, pp. 201–248.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>15. Obata T., Goto Y., Kunisawa J., Sato S., Sakamoto M., Setoyama H., Matsuki T., Nonaka K., Shibata N., Gohda M., Kagiyama Y., Nochi T., Yuki Y., Fukuyama Y., Mukai A., Shinzaki S., Fujihashi K., Sasakawa C., Iijima H., Goto M., Umesaki Y., Benno Y., Kiyono H. Indigenous opportunistic bacteria inhabit mammalian gut-associated lymphoid tissues and share a mucosal antibodymediated symbiosis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2010, vol. 107 (16), pp. 7419–7424. doi: 10.1073/pnas.1001061107</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>16. Osipov G.A., Boiko N.B., Fedosova N.F., Kasikhina S.A., Lyadov K.V. Comparative gas chromatography-mass spectrometry study of the composition of microbial chemical markers in feces. Microb. Ecol. Health Dis., 2009, vol. 21, pp. 159–171. doi: 10.3109/08910600903462657</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>17. Perry M., Whyte A. Immunology of the tonsils. Immunol. Today, 1998, vol. 19, iss. 9, pp. 414–421. doi: 10.1016/S0167-5699(98)01307-3</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>18. Segata N., Kinder Haake S., Mannon P., Lemon K. P., Waldron L., Gevers D., Huttenhower C., Izard J. Composition of the adult digestive tract bacterial microbiome based on seven mouth surfaces, tonsils, throat and stool samples. Genome Biol., 2012, vol. 13, R42. doi: 10.1186/gb-2012-13-6-r42</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>19. Sizova M.V., Hohmann T., Hazen A., Paster B.J., Halem S.R., Murphy C.M., Panikov N.S., Epstein S.S. New approaches for isolation of previously uncultivated oral bacteria. Appl. Environ. Microbiol., 2012, vol. 78, no. 1, pp. 94–203. doi: 10.1128/AEM.06813-11</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>20. Sonnenberg G.F., Monticelli L.A., Alenghat T., Fung T.C., Hutnick N.A., Kunisawa J., Shibata N., Grunberg S., Sinha R., Zahm A.M., Tardif M.R., Sathaliyawala T., Kubota M., Farber D.L., Collman R.G., Shaked A., Fouser L.A., Weiner D.B., Tessier P.A., Friedman J.R., Kiyono H., Bushman F.D., Chang K.M., Artis D. Innate lymphoid cells promote anatomical containment of lymphoid-resident commensal bacteria. Science, 2012, vol. 336 (6086), pp. 1321–1325. doi: 10.1126/science.1222551</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>21. Wong D.T. Salivaomics. J. Am. Dent. Assoc., 2012, vol. 143, suppl. 10, pp. 19S–24S. doi: 10.14219/jada.archive.2012.0339</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>22. Zaura E., Keijser B.J., Huse S.M., Crielaard W. Defining the healthy “core microbiome” of oral microbial communities. BMC Microbiol., 2009, vol. 9:259. doi: 10.1186/1471-2180-9-259</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
