<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">559</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-2017-3-271-278</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">COMMUNITY-ACQUIRED PNEUMONIA PNEUMOCOCCAL ETIOLOGY AND MICROBIOLOGICAL ASPECTS OF NASOPHARYNGEAL CARRIAGE IN CHILDREN IN THE REPUBLIC OF TATARSTAN</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>И МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ НАЗОФАРИНГЕАЛЬНОГО НОСИТЕЛЬСТВА STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE У ДЕТЕЙ В РЕСПУБЛИКЕ ТАТАРСТАН</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bayazitova</surname><given-names>L. T.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Баязитова</surname><given-names>Л. Т.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Lira T. Bayazitova - PhD (Medicine), Head of Scientific Research Laboratory of Microbiology KSRI EM, FSSCRPHW; Associate Professor, Microbiology Department KSMU.</p><p>420015, Republic of Tatarstan, Kazan, Bol’shaya Krasnaya str., 67. Phone: +7 (843) 236-67-91</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Баязитова Лира Табрисовна - кандидат медицинских наук, зав. научно-исследовательской лабораторией  микробиологии КНИИ ЭМР; доцент кафедры микробиологии КГМУ.</p><p>420015, Республика Татарстан, Казань, ул. Большая Красная, 67. Тел.: 8 (843) 236-67-91</p></bio><email>bajalt@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Tyupkina</surname><given-names>O. F.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Тюпкина</surname><given-names>О. Ф.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Senior Researcher, Scientific Research Laboratory of Microbiology KSRI EM, FSSCRPHW </p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Старший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории микробиологии КНИИ ЭМР</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Chazova</surname><given-names>T. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Чазова</surname><given-names>Т. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Junior Researcher, Scientific Research Laboratory of Microbiology KSRI EM, FSSCRPHW</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Младший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории микробиологии </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Tyurin</surname><given-names>Y. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Тюрин</surname><given-names>Ю. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Medicine), Head of Scientific Research Laboratory Of Immunology And Allergens Development KSRI EM, FSSCRPHW</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Кандидат медицинских наук, зав. научно-исследовательской лабораторией  иммунологии и разработки аллергенов КНИИ ЭМР; ассистент кафедры биохимии КГМУ </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Isaeva</surname><given-names>G. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Исаева</surname><given-names>Г. Ш.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Director of the KSRI EM, FSSCRPHW; Head of Microbiology Department KSMU</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Доктор медицинских наук, директор КНИИ ЭМР; зав. кафедрой микробиологии КГМУ </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Zaripova</surname><given-names>A. Z.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Зарипова</surname><given-names>А. З.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Junior Researcher, Scientific Research Laboratory of Microbiology, KSRI EM, FSSCRPHW </p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Младший научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории микробиологии</p></bio></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Patyashina</surname><given-names>M. А.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Патяшина</surname><given-names>М. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Head of the FSSCRPHW Department in Republic of Tatarstan</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Доктор медицинских наук, руководитель Управления Роспотребнадзора по Республике Татарстан</p></bio></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Avdonina</surname><given-names>L. G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Авдонина</surname><given-names>Л. Г.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Deputy Head, FSSCRPHW Department in Republic of Tatarstan</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Заместитель  руководителя Управления Роспотребнадзора по Республике Татарстан </p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff6"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Yuzlibaeva</surname><given-names>L. R.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Юзлибаева</surname><given-names>Л. Р.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Medicine), Head of the Department of Epidemiological Surveillance FSSCRPHW Department in Republic of Tatarstan</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Кандидат медицинских наук, начальник отдела эпидемиологического надзора Управления Роспотребнадзора по Республике Татарстан</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff6"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Kazan Scientific-Research Institute for Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФБУН Казанский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Kazan State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Казанский государственный медицинский университет</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff3"><aff><institution xml:lang="en">Kazan State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФБУН Казанский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff4"><aff><institution xml:lang="en">Kazan Scientific-Research Institute for Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Татарстан (Татарстан)</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff5"><aff><institution xml:lang="en">Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Республике Татарстан (Татарстан)</institution></aff></aff-alternatives><aff id="aff6"><institution>Federal Service for Supervision of Consumer Rights Protection and Human Welfare</institution></aff><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2017-09-29" publication-format="electronic"><day>29</day><month>09</month><year>2017</year></pub-date><volume>7</volume><issue>3</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>271</fpage><lpage>278</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2017-09-30"><day>30</day><month>09</month><year>2017</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2017-09-30"><day>30</day><month>09</month><year>2017</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2017, Bayazitova L.T., Tyupkina O.F., Chazova T.A., Tyurin Y.A., Isaeva G.S., Zaripova A.Z., Patyashina M.А., Avdonina L.G., Yuzlibaeva L.R.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2017, Баязитова Л.Т., Тюпкина О.Ф., Чазова Т.А., Тюрин Ю.А., Исаева Г.Ш., Зарипова А.З., Патяшина М.А., Авдонина Л.Г., Юзлибаева Л.Р.</copyright-statement><copyright-year>2017</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Bayazitova L.T., Tyupkina O.F., Chazova T.A., Tyurin Y.A., Isaeva G.S., Zaripova A.Z., Patyashina M.А., Avdonina L.G., Yuzlibaeva L.R.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Баязитова Л.Т., Тюпкина О.Ф., Чазова Т.А., Тюрин Ю.А., Исаева Г.Ш., Зарипова А.З., Патяшина М.А., Авдонина Л.Г., Юзлибаева Л.Р.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/559">https://iimmun.ru/iimm/article/view/559</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Prevalence estimate of pneumococcus carrier in preschool age children (medically fragile children with respiratory diseases and practically healthy organized children) have been carried out; microbiological features of clinical isolates S. pneumoniae have been studied. 511 S. pneumoniae strains isolated from medically fragile children with respiratory diseases aged between 6 months to 7 years during the period 2009–2016 and 47 isolates isolated from 200 practically healthy children attending preschool institutions of Kazan (2016) have been included in the research. Among 343 strains, 76 isolates were isolated during the period of 2009–2011; 82 strains — in 2012–2013; 87 strains — in 2014; 98 strains — in 2015; 168 strains — in 2016. Analysis of microbiocenosis of nasopharynx in medically fragile children showed that S. pneumoniae was sowed in 32.9% cases. In 58.4% of children it was as a monoculture (degree of colonization is 10<sup>4</sup>–10<sup>6 </sup> CFU/ml). S. pneumoniae contaminated nasopharynx in bacterial associations with other respiratory pathogens (S. aureus, Moraxella spp., Haemophilus spp.) in 41.6% of children. The analysis of microbiocenosis character of nasopharynx in children aged between 2.5–7 years attending preschool institutions in Kazan (n = 200) have showed that contamination S. pneumoniae (23.5%) was observed in 47 children. Pneumococcus have been isolated in monoculture in 82.9% of children; the contamination degree made 10<sup>3</sup>–10<sup>6</sup> CFU/ml. According to serotyping data, nasopharynx of often and long-term ill children living in Kazan is colonized by serotypes of pneumococcus which are covered with 13 valence conjugated serum. The obtained data on the dynamics of strain S. pneumoniae antibiotic sensitivity among medically fragile children with respiratory diseases in Kazan during 2009–2015 showed high activity of β-lactams antibiotics (from 96 to 90.8% sensitive isolates) and clyndamicin (94.7–91.8% sensitive straines). Macrolides (azytromicin, clarytromicin) and phtorchinolons (ciprof loxacin) are less active in regard to isolates S. рneumoniae. S. pneumoniae with multiple antibiotic resistance were detected in children nasopharynx: 3.8–9.95 in medically fragile children and 8.5% in organized children-bactericides. Identification of the carrier level S. pneumoniae and monitoring the dynamics on antibiotic resistance and serotyping composition of nasopharyngeal pneumococcus will optimize prevention and treatment of infections S. pneumoniae in preschool children.</p><p> </p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Проведена оценка распространенности пневмококкового носительства у детей дошкольного возраста (часто болеющих детей с респираторными заболеваниями и практически здоровых организованных детей); изучены микробиологические особенности выделенных клинических изолятов S. pneumoniae. В исследование включены 511 штаммов S. pneumoniaе, выделенных от часто болеющих детей с респираторными заболеваниями в возрасте от 6 месяцев до 7 лет в период с 2009 по 2016 гг., и 47 изолятов, выделенных от 200 практически здоровых детей, посещающих детские дошкольные учреждения г. Казани (2016 г.). Среди 343 штаммов S. pneumoniae 76 изолятов были выделены в 2009–2011 гг., 82 штамма — в 2012–2013 гг.; 87 штаммов — в 2014 г.; 98 штаммов — в 2015 г.; 168 штаммов — в 2016 г. А на лизмикробиоценоза носоглотки часто болеющих детей показал, что S. pneumoniae высевается в 32,9% случаев, причем у 58,4% детей — в виде монокультуры; степень колонизации (10<sup>4</sup>–10<sup>6</sup>  КОЕ/мл). У 41,6% детей пневмококки контаминирова ли носоглотку в составе бактериа льных ассоциаций с другими респираторными патогенами (S. aureus, Moraxellaspp., Haemophilusspp.). Анализ характера микробиоценоза носоглотки детей в возрасте 2,5–7 лет, посещающих детские дошкольные у чреждения г. Казани (n = 200), показал, что у 47 детей наблюдается контаминация S. pneumoniae (23,5%). При этом у 82,9% детей пневмококки выделены в монокультуре, степень контаминации составила 10<sup>3</sup>–10<sup>6</sup>  КОЕ/мл. По данным серотипирования, носоглотку часто и длительно болеющих детей в г. Казани колонизируют серотипы пневмококков, которые покрываются 13-ва лентной конъюгированной вакциной. Полученные данные о динамике антибиотикочувствительности изолятов S. pneumoniae, циркулирующих у часто болеющих детей с респираторной патологией, в г. Казани в 2009–2015 гг., позволяют констатировать высокую активность β-лактамных антибиотиков (от 96 до 90,8% чувствительных изолятов) и к линдамицина: (94,7–91,8% чувствительных штаммов). Макролиды (азитромицин, к ларитромицин) и фторхинолоны  (ципрофлоксацин)  обладают меньшей  антибактериальной  активностью в отношении изолятов S. рneumoniae. В носоглотке детей обнаружены штаммы S. pneumoniae, характеризующиеся множественной устойчивостью к антимикробным препаратам: 3,8–9,9% в у часто болеющих детей и у 8,5% организованных детей-бактерионосителей. Выявление уровня носительства S. рneumoniaе и слежение за динамикой антибиотикорезистентности и серотиповым составом назофарингеальных пневмококков позволит оптимизировать профилактику, лечение пневмококковых инфекций у детей дошкольного возраста.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>pneumococcal infection</kwd><kwd>community acquired pneumoniae</kwd><kwd>carrier</kwd><kwd>antibiotic resistance</kwd><kwd>serotyping</kwd><kwd>Streptococcus рneumoniaе</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>пневмококковые инфекции</kwd><kwd>внебольничная пневмония</kwd><kwd>носительство</kwd><kwd>антибиотикорезистентность</kwd><kwd>серотипирование</kwd><kwd>Streptococcus рneumoniaе</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1. Козлов Р.С. Динамика антибиотикорезистентности Streptococcus pneumoniae в России (по данным многоцентрового проспективного исследования ПЕГАС 2006–2009 гг.) // К линическая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2010. № 4. С. 329–341. [Kozlov R.S. The dynamics of antibiotic resistance in Streptococcus pneumoniae in Russia (according to a multicenter prospective study PEGASUS 2006–2009). Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2010, no. 4, pp. 329–341. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Cидоренко С.В., Лобзин Ю.В., Харит С.М., Королева И.С., Таточенко В.К. Пневмококковая инфекция и современные возможности ее профилактики: эпидемиологический обзор ситуации в мире и в России // Вопросы современной педиатрии. 2010. № 9 (1). С. 62–69. [Sidorenko S.V., Lobzin Yu.V., Kharit S.M., Koroleva I.S., Tatochenko V.K. Pneumococcal infection and modern opportunities of its prophylaxis — epidemiological review of situation in the world and russia. Voprosy sovremennoi pediatrii = Current Pediatrics. 2010, no. 9 (1), pp. 62–69. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Antimicrobial resistance surveillance in Europe. Surveillance report. Annual Report of the European Antimicrobial Resistance Surveillance Network. Stockholm, 2012, pp. 51–59.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Cilloniz C., Ardanuy C., Vila J., Torres A. What is the clinical relevance of drug-resistant pneumococcus? Curr. Opin. Pulm. Med., 2016, vol. 22, iss. 3, pp. 227–234. doi: 10.1097/MCP.0000000000000262</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Jain S., Self W.H., Wunderink R.G., Fakhran S., Balk R., Bramley A.M., Reed C., Grijalva C.G., Anderson E.J., Courtney D.M., Chappell J.D., Qi C., Hart E.M., Carroll F., Trabue C., Donnelly H.K., Williams D.J., Zhu Y., Arnold S.R., Ampofo K., Waterer G.W., Levine M., Lindstrom S., Winchell J.M., Katz J.M., Erdman D., Schneider E., Hicks L.A., McCullers J.A., Pavia A.T., Edwards K.M., Finelli L. Community-acquired pneumonia requiring hospitalization among U.S. adults. N. Engl. J. Med., 2015, vol. 373, iss. 5, pp. 415–427.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Musher D.M., Roig I.L., Cazares G., Stager C.E., Logan N., Safar H. Can an etiologic agent be identified in adults who are hospitalized for community-acquired pneumonia: results of a one-year study. J. Infect., 2013, vol. 67, iss. 1, pp. 11–18. doi: 10.1016/j.inf.2013.03.003</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Pletz M.W., Von Baum H., Van der Linden M., Schutte H., Welte T., Rohde G., Suttorp N. The burden of pneumococcal pneumonia — experience of the German competence network CAPNETZ. Pneumologie, 2012, vol. 66, iss. 8, pp. 470 –475. doi: 10.1055/s-00321310103</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8. Simell B., Auranen K., Käyhty H., Goldblatt D., Dagan R., O’Brien K.L. The fundamental link between pneumococcal carriage and disease. Expert Rev. Vaccines, 2012, vol. 11, no. 7, pp. 841–855.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Torres A., Blasi F., Peetermans W.E., Viegi G., Welte T. The aetiology and antibiotic management o0f community-acquired pneumonia in adults in Europe: a literature review. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 2014, vol. 33, iss. 7, pp. 1065–1079. doi: 10.1007/s10096-014-2067-1</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10. Welte T., Torres A., Nathwani D. Clinical and economic burden of community-acquired pneumonia among adults in Europe. Thorax, 2012, vol. 67, iss. 1, pp. 71–79. doi: 10.1136/thx.2009.129502</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
