<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">556</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-2017-3-245-250</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">THE OCCURRENCE OF THE MARKERS OF HEPATITIS C AMONG PRACTICALLY HEALTHY RESIDENTS OF THE REPUBLIC OF GUINEA: A PILOT STUDY</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>ВСТРЕЧАЕМОСТЬ МАРКЕРОВ ВИРУСА ГЕПАТИТА С У ПРАКТИЧЕСКИ ЗДОРОВЫХ ЖИТЕЛЕЙ ГВИНЕЙСКОЙ РЕСПУБЛИКИ: ПИЛОТНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kalinina</surname><given-names>O. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Калинина</surname><given-names>О. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Olga V. Kalinina - PhD, MD (Biology), Leading Researcher, Laboratory of Molecular Evolution and Evolutionary Genetics.</p><p>197101, St. Petersburg, Mira str., 14, Phone: +7 (812) 233-29-41 (office); +7 921 746-39-07 (mobile)</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Калинина Ольга Викторовна - доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики.</p><p>197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14. Тел.: 8 (812) 233-29-41 (служебн.); +7 921 746-39-07 (моб.)</p></bio><email>olgakalinina@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Lichnaia</surname><given-names>E. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Личная</surname><given-names>Е. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Junior Researcher, Laboratory of Viral Hepatitis</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Младший научный сотрудник лаборатории вирусных гепатитов.</p><p>Санкт-Петербург</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Boiro</surname><given-names>M. Y.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Буаро</surname><given-names>М. Й.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="GN">Guinea</country></address><bio xml:lang="en"><p/><p>Professor, General Director, Institute of Applied Biology in Guinea.</p>Kindia</bio><bio xml:lang="ru"><p/><p>Профессор, директор НИИ прикладной биологии Гвинеи.</p>Киндия</bio><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Totolian</surname><given-names>Areg A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Тотолян</surname><given-names>Арег А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>RAS Full Member, PhD, MD (Medicine), Professor, Head of the Laboratory of Molecular Immunology, Director.</p><p>St. Petersburg </p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Академик РАН, доктор медицинских наук, профессор, зав. лабораторией  молекулярной иммунологии, директор.</p><p>Санкт-Петербург</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">St. Petersburg Pasteur Institute</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Institute of Applied Biology in Guinea</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">НИИ прикладной биологии Гвинеи</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2017-09-29" publication-format="electronic"><day>29</day><month>09</month><year>2017</year></pub-date><volume>7</volume><issue>3</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>245</fpage><lpage>250</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2017-09-29"><day>29</day><month>09</month><year>2017</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2017-09-29"><day>29</day><month>09</month><year>2017</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2017, Kalinina O.V., Lichnaia E.V., Boiro M.Y., Totolian A.A.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2017, Калинина О.В., Личная Е.В., Буаро М.Й., Тотолян А.А.</copyright-statement><copyright-year>2017</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Kalinina O.V., Lichnaia E.V., Boiro M.Y., Totolian A.A.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Калинина О.В., Личная Е.В., Буаро М.Й., Тотолян А.А.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/556">https://iimmun.ru/iimm/article/view/556</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Phylogeographical and philodinamic studies have shown that the hepatitis C virus began to circulate in the human population about 500–2000 years ago on the A frican continent and only in the 20th century, this virus received the ubiquitary distribution. According to WHO in the world more than 71 million people are chronically infected by the hepatitis C virus, more than half of them live in A frica and South-East Asia. At the same time, the actual prevalence of hepatitis C in most countries of sub-Saharan A frica, including the Republic of Guinea, remains poorly understood.</p><p><bold>The aim</bold> of this study was to evaluate the occurrence of serological and molecular markers of hepatitis C on a random small selection of blood samples obtained from healthy adults of the Republic of Guinea.</p><p><bold>Materials and methods</bold>. Serum and plasma blood samples obtained from thirty one healthy adults of 24–71 years old of the Republic of Guinea were examined. Blood samples were collected in 2015–2016 years. The serum samples were analyzed for the presence of total anti-HCV (IgG+IgM),  of specific antibodies to the core, the NS3, the NS4 and the NS5B HCV proteins, of core antigene with “DS-ELISA-ANTI-HCV-GM”, “DS-ELISA-ANTI-HCV-SPEKTRE-GM”, “DS-ELISA-HCV-Ag” detection kits (RPC “Diagnostic Systems”, Russia), respectively. RNA HCV were detected by RT-PCR with detection kit “A mpliSens HCV-FRT” (CRIE, Moscow) and by nested-PCR using the primers from 5’UTR region. HCV genotypes were determined by RT-PCR  with detection kit “A mpliSens HCV-genotype FRT” (CRIE, Moscow) and by phylogenetic analysis based on the 5’UTR region.</p><p><bold>Results and discussion</bold>. In this pilot study, the presence of HCV markers was confirmed in 3 (9.68%, 95% CI 3.35–24.90) of 31 examined persons. Two of them had RNA HCV. Based on the phylogenetic analysis of the 5’UTR region of the HCV genome, the isolate obtained from person No. 5 belonged to genotype 1, and the isolate obtained from person No. 6 belonged to genotype 2. The obtained results together with the analyzed literature data indicate a significant burden of hepatitis C in the Republic of Guinea, and also indicate the need to develop both an algorithm of diagnostic criteria and the improvement of diagnostic test systems for mass screening of the A frican population in order to establish the proportion of persons involved in epidemic process.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Филогеографические и филодинамические  исследования показа ли, что вирус гепатита С начал циркулировать в человеческой популяции около 500–2000  лет тому назад на африканском  континенте, но лишь в XX веке получил убиквитарное распространение. Согласно расчетным данным ВОЗ на 2017 г. в мире более 71 млн человек хронически инфицировано  вирусом гепатита С, более половины из которых проживает на территории Африки и Юго-Восточной Азии. При этом до сих пор фактическая распространенность вируса гепатита С в большинстве стран Африки южнее Сахары, в том числе в Гвинейской Республике, остается малоизученной.</p><p><bold>Цель</bold> исследования: оценить встречаемость серологических и молекулярных маркеров гепатита С на случайной малой выборке образцов крови, полученных от практически здоровых жителей Гвинейской Республики.</p><p><bold>Материалы и методы</bold>. Изучены образцы сыворотки и плазмы крови, полученные в 2015–2016 гг. от 31 практически здорового жителя Гвинейской Республики в возрасте от 24 до 71 года. Наличие суммарных анти-HCV (IgG+IgM), специфических антител к core, NS3, NS4 и NS5 белкам,  свободного сore антигена определяли методом ИФА с использованием  тест-систем «ДС-ИФААНТИ-HCV», «ДС-ИФА-АНТИ-HCV-СПЕКТР-GM», «ДС-ИФА-HCV-АГ» (ООО «Диагностические системы», Россия) соответственно. Детекцию РНК ВГС проводили двумя методами: ПЦР в режиме реального времени с использованием тест-системы «А мплиСенс HCV-FL» (ФБУН ЦНИИЭ,  Россия) и методом гнездной ПЦР с праймерами из 5’UTR области генома. Генотипы изолятов ВГС определяли методом ОТ-ПЦР в режиме реального времени с использованием «А мплиСенс HCV-генотип-FL» вариант 1–6, определяющей генотипы 1а, 1b, 2, 3а, 4, 5а, 6 (ФБУН ЦНИИЭ,  Россия), а так же на основе филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей из 5’UTR области генома.</p><p><bold>Результаты и обсуждение</bold>. В данном пилотном исследовании наличие маркеров ВГС подтверждено у 3 (9,68%, 95% СI 3,35–24,90) из 31 обследованного. У двух из них обнаружена РНК ВГС. На основе филогенетического анализа 5’UTR области генома изолят, полученный от пациента № 5, принадлежа л к генотипу 1, а изолят, полученный от пациента № 6, — к генотипу 2. Полученные результаты в совокупности с проанализированными литературными данными свидетельствуют о существенном бремени гепатита С в Гвинейской Республике, а так же указывают на необходимость разработки как алгоритма диагностических критериев, так и совершенствования диагностических тест-систем для проведения массового скрининга африканского населения с целью установления доли вовлеченных в эпидемический процесс лиц.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>hepatitis C virus</kwd><kwd>Republic of Guinea</kwd><kwd>serological markers</kwd><kwd>molecular markers</kwd><kwd>genotype</kwd><kwd>diagnostic test systems</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>вирус гепатита С</kwd><kwd>Гвинейская Республика</kwd><kwd>серологические маркеры</kwd><kwd>молекулярные маркеры</kwd><kwd>генотип</kwd><kwd>диагностические тест-системы</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1. Жебрун А.Б., Калинина О.В. Вирусный гепатит С: эволюция эпидемического процесса, эволюция вируса // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2016. № 1. С. 102–112. [Zhebrun A.B., Kalinina O.V. Viral hepatitis C: evolution of the epidemiologic process, evolution of the virus. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2016, no. 1, pp. 102–112. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Калинина О.В. Вирус гепатита С: механизмы изменчивости, к лассификация, эволюция // Вопросы вирусологии. 2015. T. 60, № 5. C. 5–10. [Kalinina O.V. Hepatitis C virus: variability mechanisms, classification, evolution. Voprosy virusologii = Problems of Virology, 2015, vol. 60, no. 5, pp. 5–10. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Bah A.O., Lamine C., Balde M.C., Bah M.L., Rostaing L. Epidemiology of chronic kidney diseases in the Republic of Guinea; future dialysis needs. J. Nephropathol., 2015, vol. 4, no. 4, pp. 127–133. doi: 10.12860/jnp.2015.24</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Daw M.A., El-Bouzedi A., Ahmed M.O., Dau A.A, Agnan M.M. In association with the Libyan Study Group of Hepatitis &amp; HIV. Epidemiology of hepatitis C virus and genotype distribution in immigrants crossing to Europe from North and sub-Saharan Africa. Travel Med. Infect. Dis., 2016, vol. 14, no. 5, pp. 517–526. doi: 10.1016/j.tmaid.2016.05.020</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Forbi J.C., Purdy M.A., Campo D.S., Vaughan G., Dimitrova Z.E., Ganova-Raeva L.M., Xia G.L., Khudyakov Y.E. Epidemic history of hepatitis C virus infection in two remote communities in Nigeria, West Africa. J. Gen. Virol., 2012, vol. 93, pt. 7, pp. 1410 –1421. doi: 10.1099/vir.0.042184-0</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Gower E., Estes C., Blach S., Razavi-Shearer K., Razavi H. Global epidemiology and genotype distribution of the hepatitis C virus infection. J. Hepatol., 2014, vol. 1, suppl. 1, pp. S45–S57. doi: 10.1016/j.jhep.2014.07.027</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Kalinina O., Norder H., Vetrov T., Zhdanov K., Barzunova M., Plotnikova V., Mukomolov S., Magnius L. Shift in predominating subtype of HCV from 1b to 3a in St. Petersburg mediated by increase in injecting drug use. J. Med. Virol., 2001, vol. 65, pp. 517–524. doi: 10.1002/jmv.2066</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8. Markov P.V., Pepin J., Frost E., Deslandes S., Labbe A.-C., Pybus O.G. Phylogeography and molecular epidemiology of hepatitis C virus genotype 2 in Africa. J. Gen. Virol., 2009, vol. 90, no. 9, pp. 2086–2096. doi: 10.1099/vir.0.011569-0</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Messina J.P., Humphreys I., Flaxman A., Brown A., Cooke G.S., Pybus O.G., Barnes E. Global distribution and prevalence of hepatitis C virus genotypes. Hepatology, 2015, vol. 61, no. 1, pp. 77–87. doi: 10.1002/hep.27259</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10. Mora N., Adams W.H., Kliethermes S., Dugas L., Balasubramanian N., Sandhu J., Nde H., Small C., Jose J., Scaglione S., Layden J.E. A Synthesis of Hepatitis C prevalence estimates in Sub-Saharan Africa: 2000–2013. BMC Infect. Dis., 2016, vol. 16, pp. 283. doi: 10.1186/s12879-016-1584-1</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>11. Mullis C.E., Laeyendecker O., Reynolds S.J., Ocama P., Quinn J., Boaz I., Gray R.H., Kirk G.D., Thomas D.L., Quinn T.C., Stabinski L. High frequency of false-positive hepatitis C virus enzyme-linked immunosorbent assay in Rakai, Uganda. Clin. Infect. Dis., 2013, vol. 57, no. 12, pp. 1747–1750. doi: 10.1093/cid/cit602</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>12. Njouom R., Frost E., Deslandes S., Mamadou-Yaya F., Labbé A.C., Pouillot R., Mbélesso P., Mbadingai S., Rousset D., Pépin J. Predominance of hepatitis C virus genotype 4 infection and rapid transmission between 1935 and 1965 in the Central African Republic. J. Gen. Virol., 2009, vol. 90, no. 10, pp. 2452–2456. doi: 10.1099/vir.0.011981-0</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>13. Onakewhor J.U., Okonofua F.E. Seroprevalence of Hepatitis C viral antibodies in pregnancy in a tertiary health facility in Nigeria. Niger. J. Clin. Pract., 2009, vol. 12, no. 1, pp. 65–73.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>14. Purdy M.A., Forbi J.C., Sue A., Layden J.E., Switzer W.M., Opare-Sem O.K., Phillips R.O., Khudyakov Y.E. A re-evaluation of the origin of hepatitis C virus genotype 2 in West Africa. J. Gen. Virol., 2015, vol. 96, no. 8, pp. 2157–2164. doi: 10.1099/vir.0.000153</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>15. Ruggieri A., Argentini C., Kouruma F., Chionne P., D’Ugo E., Spada E., Dettori S., Sabbatani S., Rapicetta M. Heterogeneity of hepatitis C virus genotype 2 variants in West Central Africa (Guinea Conakry). J. Gen. Virol., 1996, vol. 77, pp. 2073–2076. doi: 10.1099/0022-1317-77-9-2073</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>16. Tagny C.T., Mbanya D., Murphy E.L., Lefrère J.J., Laperche S. Screening for hepatitis C virus infection in a high prevalence country by an antigen/antibody combination assay versus a rapid test. J. Virol. Methods, 2014, vol. 199, pp. 119–123. doi: 10.1016/j.jviromet.2014.01.002</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>17. World Health Organization. Hepatitis C. WHO. Fact Sheet, April 2017.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
