<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">404</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-2016-2-179-183</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT COMMUNICATIONS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">GENOTYPES OF EXTENSIVELY DRUG-RESISTANT MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS STRAINS: CLINICAL AND EPIDEMIOLOGICAL FEATURES OF PULMONARY TUBERCULOSIS</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>ГЕНОТИПЫ ШТАММОВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS С ШИРОКОЙ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТЬЮ И КЛИНИКО- ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ТУБЕРКУЛЕЗА ЛЕГКИХ</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Vasilieva</surname><given-names>N. R.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Васильева</surname><given-names>Н. Р.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Epidemiologist;</p><p>PhD Candidate, Epidemiology, Parasitology and Disinfectology Department,</p><p>191036, Russian Federation, St. Petersburg, Ligovsky av., 2-4</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>врач-эпидемиолог;</p><p>аспирант кафедры эпидемиологии, паразитологии и дезинфектологии,</p><p>191036, Санкт-Петербург, Лиговский пр., 2-4</p></bio><email>sagievanr@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Vyazovaya</surname><given-names>A. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Вязовая</surname><given-names>А. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of Molecular Microbiology,</p><p>St. Petersburg</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии,</p><p>Санкт-Петербург</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Zhuravlev</surname><given-names>V. Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Журавлев</surname><given-names>В. Ю.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Head of the Department of the Laboratory Diagnostics,</p><p>St. Petersburg</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.м.н., руководитель отдела лабораторной диагностики,</p><p>Санкт-Петербург</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Solovieva</surname><given-names>N. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Соловьева</surname><given-names>Н. С.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Medicine), Head of the Bacteriological Laboratory,</p><p>St. Petersburg</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.м.н., зав. бактериологической лабораторией,</p><p>Санкт-Петербург</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Mokrousov</surname><given-names>I. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Мокроусов</surname><given-names>И. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Biology), Head of the Laboratory of Molecular Microbiology,</p><p>St. Petersburg</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.б.н., зав. лабораторией молекулярной микробиологии эпидемиологии и микробиологии,</p><p>Санкт-Петербург</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Narvskaya</surname><given-names>O. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Нарвская</surname><given-names>О. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Leading Researcher, Laboratory of Molecular Microbiology,</p><p>St. Petersburg</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии,</p><p>Санкт-Петербург</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Research Institute of Phthisiopulmonology</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБУ НИИ фтизиопульмонологии Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">North-Western State Medical University named after I.I. Mechnikov</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff3"><aff><institution xml:lang="en">St. Petersburg Pasteur Institute</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2016-06-25" publication-format="electronic"><day>25</day><month>06</month><year>2016</year></pub-date><volume>6</volume><issue>2</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>179</fpage><lpage>183</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2016-06-25"><day>25</day><month>06</month><year>2016</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2016-06-25"><day>25</day><month>06</month><year>2016</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2016, Vasilieva N.R., Vyazovaya A.A., Zhuravlev V.Y., Solovieva N.S., Mokrousov I.V., Narvskaya O.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2016, Васильева Н.Р., Вязовая А.А., Журавлев В.Ю., Соловьева Н.С., Мокроусов И.В., Нарвская О.В.</copyright-statement><copyright-year>2016</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Vasilieva N.R., Vyazovaya A.A., Zhuravlev V.Y., Solovieva N.S., Mokrousov I.V., Narvskaya O.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Васильева Н.Р., Вязовая А.А., Журавлев В.Ю., Соловьева Н.С., Мокроусов И.В., Нарвская О.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/404">https://iimmun.ru/iimm/article/view/404</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Here, we present clinical and epidemiological analysis of 85 Russian cases of pulmonary tuberculosis caused by an extensively drug-resistant M. tuberculosis strains. As defined by spoligotyping, M. tuberculosis strains belonged to the following genetic families: Beijing — 81.2%, which significantly exceeds the prevalence rate of this genotype (50%) in M. tuberculosis population across Russia; LAM — 14.1% and Ural — 4.7%. Among patients infected with Beijing strains prevailed alcohol and tobacco abused males; the main source of infection were family and penitentiary contacts. This group of patients has been characterized by a variety of clinical forms of lung disease with the prevalence of fibro-cavernous tuberculosis and a significant proportion of patients with interrupted treatment. Regardless of the M. tuberculosis strain genotype, the extensively drug-resistant pulmonary tuberculosis is characterized by severe course leading to the chronic disease with the relapses and poor response to anti-tuberculosis treatment, requiring repeated hospitalizations and surgical treatments.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Проведен клинико-эпидемиологический анализ 85 случаев туберкулеза легких с широкой лекарственной устойчивостью возбудителя. Установлена принадлежность штаммов M. tuberculosis к семи сполиготипам следующих генетических семейств: Beijing (81,2%), что существенно превышает долю данного генотипа (около 50%) в общей популяции возбудителя в России, LAM (14,1%) и Ural (4,7%). Среди обследованных больных, инфицированных штаммами M. tuberculosis Beijing, преобладали мужчины со склонностью к вредным привычкам (алкоголизм и табакокурение); основными местами заражения были не только квартирные, но и пенитенциарные очаги. Данную группу характеризовали разнообразие клинических форм поражения легких с преобладанием фиброзно-кавернозного туберкулеза и значительная доля пациентов с отрывами от лечения. Вне зависимости от генотипа штамма M. tuberculosis туберкулез легких с широкой лекарственной устойчивостью возбудителя отличает тяжелое течение с исходом в хроническую рецидивирующую форму, плохо поддающуюся противотуберкулезной химиотерапии, требующую повторных госпитализаций и хирургических методов лечения.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Mycobacterium tuberculosis</kwd><kwd>extensively drug-resistant</kwd><kwd>spoligotyping</kwd><kwd>Beijing genotype</kwd><kwd>clinical and epidemiological analysis</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>Mycobacterium tuberculosis</kwd><kwd>широкая лекарственная устойчивость</kwd><kwd>сполиготипирование</kwd><kwd>генотип Beijing</kwd><kwd>клинико-эпидемиологическая характеристика</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1. Балабанова Я.М., Федорин И.М., Маломанова Н.А., Дробниевский Ф., Николаевский В.В., Сун Х., Машкова Ю.А., Симак Т.Г., Концевая И.С., Игнатьева О.А., Миронова С.А. Использование автоматизированной системы ВАСТЕС MGIT 960 в диагностике лекарственной устойчивости к резервным препаратам в г. Самаре // Туберкулез и болезни легких. 2009. Т. 86, № 10. С. 63–70. [Balabanova Ya.M., Fedorin I.M., Malomanova N.A., Drobnievski F., Nikolayevsky V.V., Sun H., Mashkova Yu.A., Simak T.G., Kontsevaya I.S., Ignatyeva O.A., Mironova S.A. Use of automated BACTEC MGIT 960 system in the diagnosis of resistance to reserve drugs agents in Samara. Tuberkulez i bolezni legkikh = Tuberculosis and Lung Diseases, 2009, vol. 86, no. 10, pp. 63–70. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2. Вязовая А.А., Мокроусов И.В., Журавлев В.Ю., Соловьева Н.С., Оттен Т.Ф., Маничева О.А., Вишневский Б.И., Нарвская О.В. Молекулярная характеристика мультирезистентных штаммов Mycobacterium tuberculosis, выделенных на Северо-Западе России // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2016. № 1. С. 30–33. [Vyazovaya A.A., Mokrousov I.V., Zhuravlev V.Yu., Solovieva N.S., Otten T.F., Manicheva O.A., Vishnevsky B.I., Narvskaya O.V. Molecular characteristics of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains in Northwest Russia. Molekulyarnaya genetika, mikrobiologiya i virusologiya = Molecular Genetics, Microbiology and Virology, 2016, no. 1, pp. 30–33. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3. Гайда А.И., Никишова Е.И., Марьяндышев А.О. Регистрация и лечение больных туберкулезом с широкой лекарственной устойчивостью микобактерий туберкулеза в гражданском секторе Архангельской области // Туберкулез и болезни легких. 2013. Т. 90, № 12. С. 55–58. [Gaida A.I., Nikishova E.I., Maryandyshev A.O. The registration and treatment of patients with broad drug-resistant Mycobacterium tuberculosis in the civil sector of the Arkhangelsk region. Tuberkulez i bolezni legkikh = Tuberculosis and Lung Diseases, 2013, vol. 90, no. 12, pp. 55–58. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4. Маркелов Ю.М. Клинико-эпидемиологические особенности туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью и причины его распространения в Карелии // Туберкулез и болезни легких. 2011. Т. 88, № 8. С. 11–17. [Markelov Yu.M. The clinical and epidemiological features of multidrug-resistant tuberculosis and reasons for its spread in Karelia. Tuberkulez i bolezni legkikh = Tuberculosis and Lung Diseases, 2011, vol. 88, no. 8, pp. 11–17. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5. Эпидемическая ситуация по туберкулезу в России в 2014 году // Федеральный Центр мониторинга противодействия распространению туберкулеза [Epidemicheskaya situatsiya po tuberkulezu v Rossii v 2014 godu [The epidemic situation of tuberculosis in Russia in 2014]. Federal’nyi Tsentr monitoringa protivodeistviya rasprostraneniyu tuberkuleza [Federal Center for counteraction to monitor the spread of tuberculosis]. URL: http://www.mednet.ru/images/stories/files/CMT/tub_epidsituaciya.pdf (дата обращения: 15.01.2015)</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6. Balabanova Y., Nikolayevskyy V., Ignatyeva O., Kontsevaya I., Rutterford C.M., Shakhmistova A., Malomanova N., Chinkova Y., Mironova S., Fedorin I., Drobniewski F.A. Survival of civilian and prisoner drug-sensitive, multi- and extensive drug-resistant tuberculosis cohortsprospectively followed in Russia. PLoS One, 2011, vol. 6, no. 6, e:20531. doi: 10.1371/journal.pone.0020531</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7. Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A., Van Agterveld M., Van Soolingen D., Kuijper S., Bunschoten A., Molhuizen H., Shaw R., Goyal M., Van Embden J. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J. Clin. Microbiol., 1997, vol. 35, no. 4, pp. 907–914.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8. Mokrousov I., Vyazovaya A., Otten T., Zhuravlev V., Pavlova E., Tarashkevich L., Krishevich V., Vishnevsky B., Narvskaya O. Mycobacterium tuberculosis population in northwestern Russia: an update from Russian-EU/Latvian border region. PLoS One, 2012, vol. 7, no. 7, e:41318. doi: 10.1371/journal.pone.0041318</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9. Punga V.V., Jakubowiak W.M., Danilova I.D., Somova T.R., Volchenkov G.V., Kazionnyy B.Y., Nemtsova E.S., Kiryanova E.V., Kourbatova E.V. Prevalence of extensively drug-resistant tuberculosis in Vladimir and Orel regions, Russia. Int. J. Tuberc. Lung. Dis., 2009, vol. 13, no. 10, pp. 1309–1312.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10. Van Embden J., Cave M., Crawford J., Dale J., Eisenach K., Gicquel B., Hermans P., Martin C., McAdam R., Shinnick T., Small P. Strain identification on Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: recommendations for a standardized methodology. J. Clin. Microbiol. 1993, vol. 31, no. 2, pp. 406–409.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>11. WHO. Global tuberculosis report 2014. WHO/HTM/TB/2014.08. WHO, Geneva, Switzerland, 2014. URL: apps.who.int/iris/bitstream/10665/137094/1/9789241564809_eng.pdf</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>12. WHO. Multidrug and extensively drug-resistant TB (M/XDR-TB): 2010 global report on surveillance and response. WHO/HTM/TB/2010.3. WHO, Geneva, Switzerland, 2010. URL: http://apps.who.int/iris/bitstream/10665/44286/1/9789241599191_eng.pdf</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
