The HIV infection epidemic in Russia continues to evolve, and HIV infection cases have been registered in all territorial entities of the Russian Federation. 2021 Treatment coverage was 82.2% and 56.4% individuals under dispensary observation and living with diagnosed HIV infection. 79.9% receiving ART subjects were shown to achieve undetectable viral load. Highly active antiretroviral therapy (HAART) currently represents a combination of three (less frequently four) antiretroviral drugs targeting pathways involved in various stages of HIV replication in vivo. Treatment failure is a problem facing doctors and patients using HAART. The most common cause of therapeutic failure is the development of HIV drug resistance. The emergence of resistance is associated with processes involving mutation occurring in the viral genome influenced by evolutionary factors. Therefore, it is important clinically and programmatically to learn more about the rate of first-line treatment failure, the rate of switching to a second-line ART regimen, and to identify patients at risk to develop strategies for preventing development of further failure cases. The study was aimed at analyzing ineffectiveness of first-line ART therapy in patients in Northwestern Federal District of the Russian Federation. Materials and methods. Sequencing reactions were performed using the AmpliSens HIV Resist-Seq. Assembly of consensus sequences from fragments obtained during sequencing was carried out using Unipro UGENE software. Isolate genotyping was performed using the MEGA-X software with the Neighbor-joining algorithm. Results. The HIV pol genes in 239 patients with first-line ART failure and 100 naïve patients were sequenced; all sequences genotyped as HIV-1 subsubtype A6. According to analysis, 82% of patients had at least one significant mutation associated with drug resistance for the corresponding viral subtype. In total, we encountered 87 different drug resistance mutations. Conclusion. We have shown increased proportion of patients with first-line ART failure among all patients with treatment failure. The main cause for such changes is probably related to the prevalence of primary drug resistance, estimated here at 8%. Specific differences were found between drug resistance mutation profiles in patients without suppressed viral load and patients with virological breakthrough. The overall results of the study indicate a need to diagnose and characterize HIV drug resistance prior to initiation of therapy in order to avoid ineffective first-line antiretroviral treatment.
Введение. Эпидемия ВИЧ-инфекции в России продолжает развиваться, случаи ВИЧ-инфекции зарегистрированы во всех субъектах Российской Федерации. Охват лечением в 2021 г. составил 82,2% от числа находящихся на диспансерном наблюдении и 56,4% от всех лиц с ВИЧ-инфекцией. У 79,9% получавших АРТ, была достигнута неопределяемая вирусная нагрузка. Высокоактивная антиретровирусная терапия (ВААРТ) в настоящее время представляет собой комбинацию трех (реже четырех) антиретровирусных препаратов; эти пути-мишени участвуют в различных стадиях репликации ВИЧ в организме. Неэффективность лечения — проблема, с которой сталкиваются врачи и пациенты, применяющие ВААРТ. Наиболее распространенной причиной терапевтической неудачи является развитие лекарственной устойчивости ВИЧ. Возникновение резистентности связано с процессами, сопровождающимися мутациями, происходящими в вирусном геноме под влиянием эволюционных факторов. Таким образом, важно больше узнать о частоте неудач лечения первого ряда, частоте перехода на схему АРТ второго ряда, а также определить, какие пациенты подвержены риску, чтобы разработать стратегии предотвращения случаев неэффективности. Цель работы — проанализировать неэффективность терапии первой линии у больных в Северо-Западном федеральном округе России. Материалы и методы. Реакции секвенирования проводили с использованием AmpliSens HIV Resist-Seq. Сборку консенсусных последовательностей из фрагментов, полученных при секвенировании, проводили с помощью программного обеспечения Unipro UGENE. Генотипирование изолятов проводили с помощью программы MEGA-X с использованием алгоритма Neighbor-joining. Результаты. Были получены последовательности гена pol 239 пациентов с неэффективностью АРТ первой линии и 100 пациентов, ранее не получавших АРТ; все последовательности генотипированы как суб-субтип A6. Согласно анализу, у 82% пациентов была хотя бы одна значимая мутация, связанная с лекарственной устойчивостью для соответствующего подтипа вируса. Всего мы столкнулись с 87 различными мутациями лекарственной устойчивости. Выводы. Мы показали увеличение доли пациентов с неэффективностью АРТ первой линии среди всех пациентов с неэффективностью лечения. Основной причиной этих изменений, вероятно, является распространенность первичной лекарственной устойчивости, оцененная в этой статье в 8%. Определенные различия были обнаружены между профилями мутаций лекарственной устойчивости у пациентов без подавления вирусной нагрузки и у пациентов с вирусологическим прорывом. Общие результаты работы свидетельствуют о необходимости диагностики и характеристики лекарственной устойчивости ВИЧ до начала терапии во избежание неэффективности антиретровирусной терапии первой линии.