<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="brief-report" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">2086</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-AOT-2086</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT COMMUNICATIONS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Short Communication</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Adhesiveness of the specific phages to yersiniae cells assessed by optical trapping</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Адгезивность специфических бактериофагов к клеткам иерсиний, оцененная методом лазерной ловушки</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Konyshev</surname><given-names>Ilya V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Конышев</surname><given-names>Илья Владимирович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of Microbial Physiology, Associate Professor, Department of Biotechnology, Institute of Biology and Biotechnology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории физиологии микроорганизмов, доцент кафедры биотехнологии кафедры биотехнологии Института биологии и биотехнологии</p></bio><email>konyshevil@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Dudina</surname><given-names>Lyubov G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Дудина</surname><given-names>Любовь Геннадьевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Junior Researcher, Laboratory of Physiology of Microorganisms, Associate Professor, Department of Biotechnology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>кандидат биологических наук, младший научный сотрудник лаборатории физиологии микроорганизмов, доцент кафедры биотехнологии</p></bio><email>necdew@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Morozova</surname><given-names>Nadezhda A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Морозова</surname><given-names>Надежда Александровна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD Student, Department of Biotechnology </p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Студент, магистр кафедры биотехнологии</p></bio><email>nadymor2000@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Byvalov</surname><given-names>Andrey A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бывалов</surname><given-names>Андрей Анатольевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, PhD, Professor, Senior Researcher of the Center of Excellence, head of the Laboratory of Microbial Physiology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>доктор медицинских наук, профессор, старший научный сотрудник Центра превосходства, зав. лабораторией физиологии микроорганизмов Института физиологии Коми</p></bio><email>byvalov@nextmail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Institute of Physiology of the Komi Scientific Center of the Ural Branch of the Russian Academy of Sciences</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБУН Институт физиологии Коми научного центра Уральского отделения РАН</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Vyatka State University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФБОУ ВО Вятский государственный университет</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff3"><aff><institution xml:lang="en">Vyatka State University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФБОУ ВО Вятский государственный университет,</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2023-06-28" publication-format="electronic"><day>28</day><month>06</month><year>2023</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2023-06-26" publication-format="electronic"><day>26</day><month>06</month><year>2023</year></pub-date><volume>13</volume><issue>3</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>573</fpage><lpage>578</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2022-12-02"><day>02</day><month>12</month><year>2022</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2023-06-21"><day>21</day><month>06</month><year>2023</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2023, Konyshev I.V., Dudina L.G., Morozova N.A., Byvalov A.A.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2023, Конышев И.В., Дудина Л.Г., Морозова Н.А., Бывалов А.А.</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Konyshev I.V., Dudina L.G., Morozova N.A., Byvalov A.A.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Конышев И.В., Дудина Л.Г., Морозова Н.А., Бывалов А.А.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/2086">https://iimmun.ru/iimm/article/view/2086</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>In recent years, there has been increasing interest in using bacteriophages in the complex therapy of some infectious diseases. Objectively, it is related to the spread of antibiotic resistance and a small number of side effects triggered by phages applied locally and parenterally. Yersiniae are no exception to this rule, but their interaction with virions has not been studied thoroughly. In three types of lytic Yersiniae bacteriophages are used for diagnostic purposes, which differ in specificity, virulence, and morphological features. We evaluated the interaction force between phages and bacteriae by optical trapping.</p> <p><bold><italic>Materials and methods. </italic></bold>Live <italic>Yersinia</italic> <italic>pseudotuberculosis</italic> and <italic>Y</italic><italic>. </italic><italic>pestis</italic> cells with different LPS structure and preparations of three bacteriophages — Pokrovskaya’s phage, d’Herelle’s phage (also named as the pseudotuberculosis phage) and the phage L-413C were used. The Pokrovskaya’s phage is well studied and widely used in diagnostics, but the mechanism of its adsorption on <italic>Y</italic><italic>. </italic><italic>pestis</italic> and <italic>Y</italic><italic>. </italic><italic>pseudotuberculosis</italic> cells is not well-understood. The phage L-413C lyses plague bacteria, while d’Herrel’s phage can lyse both pathogens. Virions were linked to the surface of aminated glass. Optically trapped microbial cells were approached to the glass surface and then retracted in the opposite direction. The amplitude of the leap was recalculated into force through calibration coefficients. The primary data were processed in the program “R”; statistical analysis was performed using “Matlab 7.0” and “Statistica 12”</p> <p><bold><italic>Results</italic></bold> <bold><italic>and</italic></bold> <bold><italic>discussion</italic></bold><bold><italic>.</italic></bold> The analysis of histograms revealed the presence of a specific component in the «<italic>Y</italic><italic>. </italic><italic>pseudotuberculosis</italic>–d’Herrell’s phage» (Fmean = 7.46±3.52 pN) system, as well as in all pairs involving plague microbe. In the latter case, the interaction forces were comparable: 8.64±3.83 pN for d’Herelle’s phage,11.03±4.22 pN for Pokrovskaya’s phage, and 10.42±4.79 pN for phage L-413C. The average detachment force from the substrate treated with bovine serum albumin (BSA) was comparable for both cell types. Our results convincingly prove an opportunity for using the optical trapping to estimate interaction force in other «bacterium–phage» systems.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>В последние годы возрастает интерес к использованию бактериофагов в комплексной терапии некоторых инфекционных заболеваний. Объективно это связано с распространением антибиотикорезистентности и малым числом побочных эффектов при местном и парентеральном назначении фагов. Бактерии рода <italic>Yersinia</italic> не являются исключением из этого правила, однако начальные стадии их взаимодействия с вирионами подробно не изучены. В России в диагностических целях применяются три вида литических иерсиниозных бактериофагов, различающихся по специфичности, вирулентности, морфологическим свойствам. Мы оценили силу взаимодействия в системе «фаг–бактерия» методом лазерной ловушки.</p> <p><bold><italic>Материалы и методы. </italic></bold>В работе использовали живые клетки <italic>Yersinia</italic> <italic>pseudotuberculosis</italic> и <italic>Yersinia</italic> <italic>pestis</italic>, различные по структуре ЛПС, и препараты трех иерсиниозных бактериофагов — Покровской, L-413C и д’Эрреля (псевдотуберкулезного диагностического). Фаг Покровской хорошо изучен и широко применяется в диагностике, однако механизм его адсорбции на клетках <italic>Y</italic><italic>. </italic><italic>pestis</italic> практически не изучен. Высокоспецифичный фаг L-413С лизирует чумные бактерии, но не псевдотуберкулезные, в то время как фаг д’Эрреля вирулентен для бактерий обоих видов. Вирионы наносили на поверхность аминированных стеклянных подложек. Микробные клетки, захваченные лазерной ловушкой, подводили к поверхности, обработанной фагами, до их соприкосновения, после чего их отводили в обратном направлении, добиваясь разрыва связи. Амплитуду сигнала пересчитывали в силу через калибровочные коэффициенты. Первичные данные обрабатывали в программе «R»; статистический анализ проводили с использованием пакетов «Matlab 7.0» и «Statistica 12».</p> <p><bold><italic>Результаты и обсуждение</italic></bold><italic>.</italic> Анализ гистограмм распределения силы, необходимой для разрыва связи, выявил присутствие специфического компонента в паре «<italic>Y</italic><italic>. </italic><italic>pseudotuberculosis</italic>–фаг д’Эрреля» (Fср. = 7,46±3,52 пН), а также во всех парах с участием чумного микроба. В последнем случае сила связи оказалась сопоставимой с вышеуказанной и составила: для фага д’Эрреля — 8,64±3,83 пН, для фага Покровской — 11,03±4,22 пН, для фага L-413С — 10,42±4,79 пН. Средняя сила отрыва от подложки, обработанной бычьим сывороточным альбумином (БСА) сопоставима для обоих типов клеток. Проведенные эксперименты свидетельствуют о возможности использования метода оптической ловушки для оценки силовых характеристик взаимодействия в системе «бактерия–фаг».</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>phage</kwd><kwd>Yersinia pseudotuberculosis</kwd><kwd>Yersinia pestis</kwd><kwd>sensitization</kwd><kwd>laser trap</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>бактериофаг</kwd><kwd>Yersinia pseudotuberculosis</kwd><kwd>Yersinia pestis</kwd><kwd>сенсибилизация</kwd><kwd>лазерная ловушка</kwd></kwd-group><funding-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">НИР ИФ ФИЦ Коми НЦ УрО РАН FUUU-2022-0065</institution></institution-wrap></funding-source><award-id>1021051201894-0</award-id></award-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">Грант Президента РФ для молодых кандидатов наук</institution></institution-wrap></funding-source><award-id>МК-3383.2021.1.4</award-id></award-group></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Лабинская А.С. Микробиология с техникой микробиологических исследований. М.: Медицина,1978. 394 с. [Labinskaya A.S. Microbiology and methods of microbiology. Moscow: Meditsina,1978. 394 p. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Филиппов А.А., Эллиотт Дж.М., Бобров А.Г., Кириллина О.А., Мотин В.Л., Чейн П.С., Гарсия Э. Определение нуклеотидной последовательности генома чумного диагностического бактериофага L-413C // Проблемы особо опасных инфекций. 2005, № 2. С. 49–52. (Filippov A.A., Elliott J.M., Bobrov A.G., Kirillina O.A., Motin V.L., Cheyne P.S., Garcia E. Determination of the nucleotide sequence of the genome of the plague diagnostic bacteriophage L-413C. Problemy osobo opasnykh infektsiy = Problems of Particularly Dangerous Infections,2005, no. 2, pp. 49–52. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Cabanel N., Bouchier C., Rajerison M., Carniel E. Plasmid-mediated doxycycline resistance in a Yersinia pestis strain isolated from a rat. Int. J. Antimicrob. Agents.,2008, vol. 51, pp. 249–254. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2017.09.015</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Capilla S., Ruiz J., Goñi P., Castillo J., Rubio M.C., Jiménez de Anta M.T., Gómez-Lus R., Vila J. Characterization of the molecular mechanisms of quinolone resistance in Yersinia enterocolitica O:3 clinical isolates. J. Antimicrob. Chemother.,2004, vol. 53, pp. 1068–1071. doi: 10.1093/jac/dkh22.5</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Cover T.L., Aber R.C. Yersinia enterocolitica. N. Engl. J. Med.,1989, vol. 321, pp. 16–24. doi: 10.1056/NEJM198907063210104</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Deacon A.G., Hay A., Duncan J. Septicemia due to Yersinia pseudotuberculosis — a case report. Clin. Microbiol. Infect.,2003, vol. 9, pp. 1118–1119. doi: 10.1046/j.1469-0691.2003.00746.x</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Filippov A.A., Sergueev K.V., He, Y., Huang X.-Z., Gnade B.T., Mueller A.J., Fernandez-Prada C.M., Nikolich M.P. Bacteriophage-resistant mutants in Yersinia pestis: identification of phage receptors and attenuation for mice. PLoS One,2011, vol. 6., no. 9: e25486. doi: 10.1371/journal.pone.0025486</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Filippov A.A., Sergueev K.V., He Y., Nikolich M.P. Bacteriophages capable of lysing Yersinia pestis and Yersinia pseudotuberculosis: efficiency of plating tests and identification of receptors in Escherichia coli K-12. Adv. Exp. Med. Biol.,2012, pp. 123–134. doi: 10.1007/978-1-4614-3561-7_16</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Filippov A.A., Sergueev K.V., He Y., Huang X.Z., Gnade B.T., Mueller A.J., Fernandez-Prada C.M., Nikolich M.P. Bacteriophage therapy of experimental bubonic plague in mice. Adv. Exp. Med. Biol.,2012, vol. 954, pp. 337–348. doi: 10.1007/978-1-4614-3561-7_41</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Filippov A.A., Sergueev K.V., Nikolich M.P. Can phage effectively treat multidrug-resistant plague? Bacteriophage,2012, vol. 2, pp. 186–189. doi: 10.4161/bact.22407</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Galimand M., Carniel E., Courvalin P. Resistance of Yersinia pestis to antimicrobial agents. Antimicrob. Agents Chemother.,2006, vol. 50, pp. 3233–3236. doi: 10.1128/AAC.00306-06</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Galindo C.L., Rosenzweig J.A., Kirtley M.L., Chopra A.K. Pathogenesis of Y. enterocolitica and Y. pseudotuberculosis in Human Yersiniosis. J. Pathog.,2011: 182051. doi: 10.4061/2011/182051</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Garcia E., Chain P., Elliott J.M., Bobrov A.G., Motin V.L., Kirillina O., Lao V., Calendar R., Filippov A.A. Molecular characterization of L-413C, a P2-related plague diagnostic bacteriophage. Virology,2008, vol. 372, no. 1, pp. 85–96. doi: 10.1016/ j.virol.2007.10.032</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Górski A., Międzybrodzki R., Jończyk-Matysiak E., Borysowski J., Letkiewicz S., Weber-Dąbrowska B. The fall and rise of phage therapy in modern medicine. Expert. Opin. Biol. Ther.,2019, vol. 19, pp. 1115–1117. doi: 10.1080/14712598.2019.1651287</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Hill A.A., Diehl G.E. The infectious cause of the chronic effect. Cell Host Microbe,2015, vol. 18, pp. 383–385. doi: 10.1016/ j.chom.2015.09.011</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Vagima Y., Gur D., Aftalion M., Moses S., Levy Y., Makovitzki A., Holtzman T., Oren Z., Segula Y., Fatelevich E., Tidhar A., Zauberman A., Rotem S., Mamroud E., Steinberger-Levy I. Phage therapy potentiates second-line antibiotic treatment against pneumonic plague. Viruses,2022, vol. 14: 688. doi: 10.3390/v14040688</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Zhao X., Skurnik M. Bacteriophages of Yersinia pestis. Adv. Exp. Med. Biol.,2016, vol. 918, pp. 361–375. doi: 10.1007/978-94-024-0890-4_13.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
