Recently, both in Russia and around the world, the number of cases detecting acid-fast microbial members from the order Actinomycetales while developing human bacterial infections has been increased. The most important pathogens in this bacterial order are the members from the families Mycobacteriaceae, Nocardiaceae, Gordoniaceae, Tsukamurellaceae, Promicromonosporaceae, Brevibacteriaceae, Streptomycetaceae. This work is devoted to analyzing prevalence and species diversity of representatives of the family Streptomycetaceae from the genus Streptomyces isolated from clinical material upon examining for tuberculosis. There were examined 865 cultures of clinical material samples while examining for tuberculosis, in which signs of growth of contaminating microflora were revealed, as well as 316 cultures of clinical material samples obtained during examination for tuberculosis, in which signs of growth of non-tuberculosis mycobacteria (NTM) were detected. The material was collected from January 2016 to January 2019. Samples with signs of growth of contaminating microflora allowed to identify 1,093 strains, samples with signs of growth of NTM — 352 strains. Among them, the number of representatives of the genus Streptomyces comprised 39 strains. All Streptomyces strains were isolated from sputum. Variety of isolated Streptomyces: S. phaeochromogenes (13 strains), S. albus (1 train), S. avidinii (1 strain), S. badius (2 strains), S. chartreusis (2 strains), S. griseus (1 strain), S. hirsutus (2 strains), S. lavendulae (3 strains), S. violaceoruber (10 strains). Species identification was not possible for 4 strains. Analyzing the data obtained, it is possible to draw a conclusion about the moderate distribution of representatives of the genus Streptomyces in pattern of contaminating microflora while examining for tuberculosis. In pattern structure of isolated microorganisms, Streptomyces accounted for 3.3%. Among the microflora isolated from culture with signs of NTM growth, Streptomyces was presented by single strains. However, it should be noted that Streptomyces was the dominant group among acid-resistant actinomycetes in pattern of contaminating microflora and accounted for 38.3%. Taking into account the fact that a significant proportion of them were isolated as microbial associations, it can be concluded that Streptomyces turned out to be classical contaminants in this case. Nevertheless, we believe that the isolation of Streptomyces in association with clinically significant NTMs can be considered as an unfavorable factor due to the fact that antibiotic resistance genes are widespread among Streptomyces and may be transmitted to other types of microorganisms from the group of acid-resistant actinomycetes, including mycobacteria. Thus, the clinical material examining for tuberculosis is an interesting research object from which various representatives of acid-fast actinomycetes, including Streptomyces, can be isolated.
В последнее время как в России, так и во всем мире наблюдается увеличение количества случаев обнаружения представителей кислотоустойчивых микроорганизмов из порядка Actinomycetales при развитии бактериальных инфекций у человека. Из данных бактерий наибольшее значение имеют патогены из семейств Mycobacteriaceae, Nocardiaceae, Gordoniaceae, Tsukamurellaceae, Promicromonosporaceae, Brevibacteriaceae, Streptomycetaceae. Настоящая статья посвящена анализу распространенности и видового разнообразия представителей семейства Streptomycetaceae рода Streptomyces, выделенных из клинического материала при обследовании на туберкулез. Нами было проведено изучение 865 посевов проб клинического материала при обследовании на туберкулез, в которых были выявлены признаки роста контаминирующей микрофлоры, а также 316 посевов проб клинического материала при обследовании на туберкулез, в которых были выявлены признаки роста нетуберкулезных микобактерий (НТМ). Материал был собран в период с января 2016 по январь 2019 г. Из проб с признаками роста контаминирующей микрофлоры идентифицировано 1093 штамма микроорганизмов, из проб с признаками роста НТМ — 352 штамма. Из них количество представителей рода Streptomyces составило 39 штаммов. Все штаммы стрептомицет были выделены из мокроты. Разнообразие выделенных стрептомицет: S. phaeochromogenes (13 штаммов), S. albus (1 штамм), S. avidinii (1 штамм), S. badius (2 штамма), S. chartreusis (2 штамма), S. griseus (1 штамм), S. hirsutus (2 штамма), S. lavendulae (3 штамма), S. violaceoruber (10 штаммов). Для 4 штаммов не удалось осуществить видовую идентификацию. Анализируя полученные данные, можно сделать заключение об умеренном распространении представителей рода Streptomyces в структуре контаминирующей микрофлоры при обследовании на туберкулез. В структуре выделенных микроорганизмов стрептомицеты составили 3,3%. Среди микрофлоры, выделенной из посевов с признаками роста НТМ, стрептомицеты были представлены единичными штаммами. Однако следует отметить, что стрептомицеты оказались доминирующей группой среди кислотоустойчивых актиномицет в структуре контаминирующей микрофлоры и составили 38,3%. С учетом того, что значительная часть из них была выделена в составе микробных ассоциаций, можно сделать вывод о том, что стрептомицеты оказались в данном случае классическими контаминантами. Тем не менее выделение стрептомицет в ассоциациях с клинически значимыми НТМ, на наш взгляд, можно рассматривать как неблагоприятный фактор. Это связано с тем, что среди стрептомицет широко распространены гены антибиотикорезистентности, которые могут быть переданы другим видам микроорганизмов из группы кислотоустойчивых актиномицет, в том числе и микобактериям. Таким образом, клинический материал для диагностики туберкулеза представляет собой интересный объект исследования, поскольку из него могут быть выделены различные представители кислотоустойчивых актиномицет, в том числе и стрептомицеты.