Russian Journal of Infection and ImmunityRussian Journal of Infection and ImmunityИнфекция и иммунитет2220-76192313-7398SPb RAACI1814110.15789/2220-7619-HMG-918141ORIGINAL ARTICLESОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИUnknownHHV6A/B MOLECULAR GENETIC DIVERSITY IN HIV-INFECTED INDIVIDUALSМОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ВГЧ6A/B У ВИЧ-ИНФИЦИРОВАННЫХ ЛИЦhttps://orcid.org/0009-0006-1407-68845168-7308SuslovNikita A.СусловНикита Алексеевич
Russian Federation

Laboratory Assistant, Laboratory of Molecular Biology and Biotechnology

лаборант лаборатории молекулярной биологии и биотехнологии

suslovnikita.2000@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-6683-71911986-8147FilatovaElena N.ФилатоваЕлена Николаевна
Russian Federation

PhD (Biology), Leading Researcher, Laboratory of Molecular Biology and Biotechnology

к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии и биотехнологии

el.filatova83@mail.ruhttps://orcid.org/0009-0004-9476-62147707-4985MinaevaStella V.МинаеваСтелла Валерьевна
Russian Federation

PhD (Мedicine), Associate Professor of the Epidemiology, Microbiology and Evidence-Based Medicine Department

к.м.н., доцент кафедры эпидемиологии, микробиологии и доказательной медицины

mistella@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3965-20338457-3501SakharnovNikolai A.СахарновНиколай Александрович
Russian Federation

Researcher, Laboratory of Molecular Biology and Biotechnology

старший научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии и биотехнологии

sakharnov_n@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-7571-525X1174-6500UtkinOleg V.УткинОлег Владимирович
Russian Federation

PhD (Biology), Head of Laboratory of Molecular Biology and Biotechnology

кандидат биологических наук, заведующий лабораторией молекулярной биологии и биотехнологии

utkino2004@mail.ruAcademician I.N. Blokhina Nizhny Novgorod Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology, Nizhny Novgorod, Russian FederationФБУН Нижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора, г. Нижний Новгород, РоссияPrivolzhskiy Research Medical University, Nizhniy Novgorod, Russian FederationФГБОУ ВО Приволжский исследовательский медицинский университет Минздрава России, г. Нижний Новгород, Россия060320260502202604032026Copyright ©; , Suslov N.A., Filatova E.N., Minaeva S.V., Sakharnov N.A., Utkin O.V.Copyright ©; , Суслов Н.А., Филатова Е.Н., Минаева С.В., Сахарнов Н.А., Уткин О.В.Suslov N.A., Filatova E.N., Minaeva S.V., Sakharnov N.A., Utkin O.V.Суслов Н.А., Филатова Е.Н., Минаева С.В., Сахарнов Н.А., Уткин О.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://iimmun.ru/iimm/article/view/18141

Human herpesviruses 6A and 6B (HHV6A, HHV6B) are ubiquitous pathogens with lifelong host persistence. HHV6A/B infection often accompanies HIV infection, however, data on the interaction between the two viruses are contradictory. The discrepancy in study results assessing an impact of HHV6A/B on the course of HIV infection may be due to the molecular genetic variability related to betaherpesviruses. The aim of this work was to assess the molecular genetic diversity of HHV6A and HHV6B in HIV-infected adults in the Nizhny Novgorod region. Materials and methods. Blood leukocyte isolates from the blood leukocytes collected from 138 HIV-infected patients (HIV(+)) and 68 HIV-uninfected (HIV(-)) individuals were studied. HHV6A/B species were identified by PCR with agarose gel electrophoresis. Nucleotide sequences of the U90A (206 bp) and U90B (431 bp) gene fragments were obtained by Sanger sequencing. The intra-species genovariant of the examined betaherpesviruses was determined based on signature nucleotide substitutions of the sequenced sequences and in accordance with the author's classification. Results. HHV6A/B DNA was detected in 39% of HIV(+) and 46% of HIV(-) examined individuals. HHV6A (genovariant GV3a) was identified in one HIV(+) sample. The remaining samples from both groups contained HHV6B. In the group of HIV-infected patients, dominant genovariants GV1a, GV2b, and GV2e (~30% each) were evenly distributed, and the minor GV2a (7,3%) was also detected. In the group of clinically healthy virus carriers, genovariant GV2e predominated (72,4%), while GV1a and GV2b were less common. The likelihood of detecting GV2e decreased (OR=0,18 (0,04; 0,76), p=0,031), whereas that of for GV1a and GV2b variants increased (in both cases OR=5,48 (1,31; 28,52), p=0,016) in HIV(+) individuals compared to control group. Analyzing age pattern for HHV6B genovariants showed that in HIV-infected patients, the diversity of genovariants declines with decreasing patient age. Сonclusion. The data obtained evidence about a need to investigate molecular genetic diversity of HHV6A and HHV6B to effectively diagnose and interpret related results in patients with HIV infection.

Вирусы герпеса человека 6A и 6B (ВГЧ6А, ВГЧ6В) являются повсеместно распространенными патогенами с пожизненной персистенцией в организме. ВГЧ6А/В-инфекция часто сопутствует ВИЧ-инфекции, однако сведения о взаимодействии двух вирусов носят противоречивый характер. Причиной разногласий результатов исследования влияния ВГЧ6А/В на течение ВИЧ-инфекции может служить молекулярно-генетическая изменчивость самих бета-герпесвирусов. Целью работы стала оценка молекулярно-генетического разнообразия ВГЧ6А и ВГЧ6В у взрослых ВИЧ-инфицированных лиц в Нижегородском регионе. Материалы и методы. Были исследованы изоляты, выделенные из лейкоцитов крови 138 ВИЧ-инфицированных пациентов (ВИЧ(+)) и 68 ВИЧ-неинфицированных (ВИЧ(-)) лиц. Видовую принадлежность ВГЧ6А/В определяли методом ПЦР с электрофорезом в агарозном геле. Нуклеотидные последовательностей фрагмента гена U90A (206 н.о.) и U90B (431 н.о.) получали методом секвенирования по Сэнгеру. Внутривидовой геновариант рассматриваемых бета-герпесвирусов устанавливали на основании сигнатурных нуклеотидных замен секвенированных последовательностей и в соответствии с авторской классификацией. Результаты. ДНК ВГЧ6А/В была обнаружена у 39% ВИЧ(+) и 46% ВИЧ(-) обследованных лиц. ВГЧ6А (геновариант GV3a) был идентифицирован в одном ВИЧ(+) образце. Остальные образцы обеих групп содержали ВГЧ6В. В группе ВИЧ-инфицированных пациентов наблюдалось равное распределение доминирующих геновариантов GV1a, GV2b и GV2e (~30% каждый), а также был выявлен минорный GV2a (7,3%). В группе клинически здоровых вирусоносителей преобладал геновариант GV2e (72,4%), тогда как GV1a и GV2b встречались реже. Вероятность обнаружения GV2e снижалась (OR=0,18 (0,04; 0,76), p=0,031), а вариантов GV1a и GV2b увеличивалась (в обоих случаях OR=5,48 (1,31; 28,52), p=0,016) у ВИЧ(+) лиц по сравнению с контрольной группой. Анализ возрастной структуры геновариантов ВГЧ6В показал, что в группе ВИЧ-инфицированных с уменьшением возраста пациентов снижается разнообразие геновариантов. Заключение. Полученные результаты свидетельствуют о необходимости изучения молекулярно-генетического разнообразия ВГЧ6A и ВГЧ6В для осуществления эффективной диагностики и интерпретации ее результатов у пациентов с ВИЧ-инфекцией.

HHV6AHHV6BHIVmolecular genetic diversitygenovariantpolymorphism.ВГЧ6AВГЧ6ВВИЧмолекулярно-генетическое разнообразиегеновариантполиморфизм.Возраст // Малая медицинская энциклопедия. Под ред. В.И. Покровского. 1991. Т. 1. С. 358-359. Age. In Pokrovskiy V.I., editor. Malaya meditsinskaya entsiklopediya = Small Medical Encyclopedia, 1991, vol. 1, pp. 358-359. -Никольский М.А., Голубцова В.С. Хромосомно-интегрированный вирус герпеса человека 6 типа // Инфекция и иммунитет. 2015. Т. 5. №1. C. 7-14.Nikolskiy M.A., Golubcova V.S. Сhromosomally integrated human herpesvirus 6. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2015, vol. 5, no. 1, pp. 7-14. doi: 10.15789/2220-7619-2015-1-7-14Попкова М.И., Филатова Е.Н., Минаева С.В., Сахарнов Н.А., Уткин О.В. Молекулярно-генетическая характеристика изолятов вируса Эпштейна–Барр у взрослых пациентов с ВИЧ-инфекцией в Нижегородской области // Инфекция и иммунитет. 2025. Т. 15. №1. C. 88-102. Popkova M.I., Filatova E.N., Minaeva S.V., Sakharnov N.A., Utkin O.V. Molecular and genetic characteristics of Epstein-Barr virus isolates in adult patients with HIV infection in Nizhny Novgorod region. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2025, vol. 15, no. 1, pp. 88-102. doi: 10.15789/2220-7619-MAG-17562Попкова М.И., Филатова Е.Н., Минаева С.В., Сахарнов Н.А., Уткин О.В. Оценка взаимосвязи основных типов и геновариантов вируса Эпштейна–Барр с клинико-лабораторными показателями у ВИЧ-инфицированных взрослых // Инфекция и иммунитет. 2024. Т. 14. №5. C. 936-950.Popkova M.I., Filatova E.N., Minaeva S.V., Sakharnov N.A., Utkin O.V. Assessment of the relationship between Epstein–Barr virus major types and genovariants as well as clinical and laboratory parameters in HIV-infected adults. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2024, vol. 14, no. 5. pp. 936-950. doi: 10.15789/2220-7619-AOT-17623Филатова Е.Н., Сахарнов Н.А., Суслов Н.А., Попкова М.И., Уткин О.В. Первые данные о молекулярно-генетическом разнообразии ВГЧ6В и его влиянии на клинико-лабораторное течение мононуклеозоподобного синдрома у детей // Инфекция и иммунитет. 2025. Т.15. №3. С. 476-488. Filatova E.N., Sakharnov N.A., Suslov N.A., Popkova M.I., Utkin O.V. First data on the molecular genetic diversity of HHV6B and its impact on the clinical and laboratory course of mononucleosis-like syndrome in children. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2025, vol. 15, no. 3, pp. 476-488. (In Russ.) doi:10.15789/2220-7619-FDO-17827Филатова Е.Н., Уткин О.В., Хрулев А.Е., Зайцева Н.Н. Разработка и обоснование внутривидовой классификации молекулярно-генетического разнообразия ВГЧ6А и ВГЧ6В // Инфекция и иммунитет. 2025. Т. 15. №6. C. 1087-1100. Filatova E.N., Utkin O.V., Khrulev A.E., Zaitseva N.N. Development and validation for intra-species classification of HHV6A and HHV6B molecular genetic diversity. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2025, vol. 15, no. 6. pp. 1087-1100. doi: 10.15789/2220-7619-DAV-17810Ablashi D., Agut H., Alvarez-Lafuente R., Clark D.A., Dewhurst S., DiLuca D., Flamand L., Frenkel N., Gallo R., Gompels U.A., Höllsberg P., Jacobson S., Luppi M., Lusso P., Malnati M., Medveczky P., Mori Y., Pellett P.E., Pritchett J.C., Yamanishi K., Yoshikawa T. Classification of HHV-6A and HHV-6B as distinct viruses. Arch. Virol., 2014, vol. 159, no. 5, pp. 863-870. - doi: 10.1007/s00705-013-1902-5Dominguez G., Dambaugh T.R., Stamey F.R., Dewhurst S., Inoue N., Pellett P.E. Human herpesvirus 6B genome sequence: coding content and comparison with human herpesvirus 6A. J. Virol., 1999, vol. 73, no. 10, pp. 8040-8052. - doi: 10.1128/JVI.73.10.8040-8052.1999Ensoli B., Lusso P., Schachter F., Josephs S.F., Rappaport J., Negro F., Gallo R.C., Wong-Staal F. Human herpes virus-6 increases HIV-1 expression in co-infected T cells via nuclear factors binding to the HIV-1 enhancer. EMBO J., 1989, vol. 8, no. 10, pp. 3019-3027.- doi: 10.1002/j.1460-2075.1989.tb08452.xGrivel J.C., Ito Y., Fagà G., Santoro F., Shaheen F., Malnati M.S., Fitzgerald W., Lusso P., Margolis, L. Suppression of CCR5- but not CXCR4-tropic HIV-1 in lymphoid tissue by human herpesvirus 6. Nat Med., 2001, vol. 7, no. 11, pp. 1232-1235.- doi: 10.1038/nm1101-1232Kostare G., Kostares E., Kostares M., Halkitis P. N., Tsakris A., Xanthos T., Kantzanou M. Prevalence of HHV-6 Detection Among People Living with HIV: A Systematic Review and Meta-Analysis. Viruses, 2025, vol. 17, no. 4: 531. - doi: 10.3390/v17040531Lusso P. HHV-6 and HIV-1 Infection. Perspectives in Medical Virology, 2006, vol. 12, pp. 263-277. - doi: 10.1016/S0168-7069(06)12021-2Lusso P., Ensoli B., Markham P.D., Ablashi D.V., Salahuddin S.Z., Tschachler E., Wong-Staal F., Gallo R.C. Productive dual infection of human CD4+ T lymphocytes by HIV-1 and HHV-6. Nature, 1989, vol. 337, no. 6205, pp. 370-373. - doi:10.1038/337370a0Munawwar A., Singh S. Human Herpesviruses as Copathogens of HIV Infection, Their Role in HIV Transmission, and Disease Progression. J. Lab. Physicians, 2016, vol. 8, no. 1, pp. 5-18. - doi: 10.4103/0974-2727.176228Murphy P.M. Viral exploitation and subversion of the immune system through chemokine mimicry. Nat. Immunol., 2001, vol. 2, no. 2, pp. 116-122. - doi: 10.1038/84214Pantry S.N., Medveczky P.G. Latency, Integration, and Reactivation of Human Herpesvirus-6. Viruses, 2017; vol. 9, no. 7: 194.- doi: 10.3390/v9070194Okonechnikov K., Golosova O., Fursov M., UGENE team. Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit. Bioinformatics, 2012, vol. 28, no. 8, pp. 1166-1167. - doi: 10.1093/bioinformatics/bts091Oktafiani D., Megasari N.L.A., Ana E. F., Nasronudin Lusida M.I., Soetjipto. First Report on HHV-6 Infection Among HIV-Infected Individuals Residing in Surabaya, Indonesia. HIV AIDS, 2020, vol. 12, pp. 107-112. - doi: 10.2147/HIV.S232146Pinheiro R.dosS., Ferreira D.deC., Nóbrega F., Santos N.S., Souza I.P., Castro G.F. Current status of herpesvirus identification in the oral cavity of HIV-infected children. Rev. Soc. Bras. Med. Trop., 2013, vol. 46, no. 1, pp. 15-19. - doi: 10.1590/0037-868217172013Ren L., Wang B., Miao Z., Liu P., Zhou S., Feng Y., Yang S., Xia X., Wang K.A correlation analysis of HHV infection and its predictive factors in an HIV-seropositive population in Yunnan, China. J. Med. Virol., 2020, vol. 92, no. 3, pp. 295-301. - doi: 10.1002/jmv.25609Schliep K.P. phangorn: phylogenetic analysis in R. Bioinformatics, 2011, vol. 27, no. 4, pp. 592-593.- doi: 10.1093/bioinformatics/btq706Sufiawati I., Harmiyati R., Nur'aeny N., Indrati A. R., Lesmana R., Wisaksana R., Amalia R. Detection of Human Herpesviruses in Sera and Saliva of Asymptomatic HIV-Infected Individuals Using Multiplex RT-PCR DNA Microarray. Pathogens, 2023, vol. 12, no. 8: 993. - doi: 10.3390/pathogens12080993Suligoi B., Dorrucci M., Uccella I., Andreoni M., Rezza G., Italian Seroconversion Study. Effect of multiple herpesvirus infections on the progression of HIV disease in a cohort of HIV seroconverters. J. Med. Virol., 2003, vol. 69, no. 2, pp. 182-187. - doi: 10.1002/jmv.10281Tweedy J., Spyrou M.A., Pearson M., Lassner D., Kuhl U., Gompels U.A. Complete Genome Sequence of Germline Chromosomally Integrated Human Herpesvirus 6A and Analyses Integration Sites Define a New Human Endogenous Virus with Potential to Reactivate as an Emerging Infection. Viruses, 2016, vol. 8, no. 1: 19.- doi: 10.3390/v8010019Wickham H. ggplot2: elegant graphics for data analysis. Springer New York, 2016. - -Xu S., Lin L., Luo X., Chen M., Tang W., Zhan L., Dai Z., Lam T. T., Guan Y., Yu G. Ggtree: A serialized data object for visualization of a phylogenetic tree and annotation data. iMeta, 2022, vol. 1, no. 4: e56. - doi: 10.1002/imt2.56