<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">18104</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-EOL-18104</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Unknown</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">EFFECT OF LONG NONCODING RNA NEAT1 ON RIG-I-MEDIATED SIGNALING PATHWAY IN INFLUENZA A VIRAL INFECTION</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>ВЛИЯНИЕ ДЛИННОЙ НЕКОДИРУЮЩЕЙ РНК NEAT1 НА RIG-ОПОСРЕДОВАННЫЙ СИГНАЛЬНЫЙ ПУТЬ ПРИ ВИРУСЕ ГРИППА А</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-4334-1473</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">9721-4839</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Meremianina</surname><given-names>Ekaterina A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Меремьянина</surname><given-names>Екатерина Андреевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Medicine), Senior Researcher, Associate Professor, Department of Virology </p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии, доцент кафедры вирусологии </p></bio><email>ekaterina@meremianina.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Ammour</surname><given-names>Yulia I.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Аммур</surname><given-names>Юлия Игоревна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Head of the Laboratory of Oncolytic Viruses</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., зав. лабораторией онколитических вирусов </p></bio><email>yulia.ammour@yahoo.fr</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-7307-0515</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">1763-8942</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Abramova</surname><given-names>Natalya D.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Абрамова</surname><given-names>Наталья Дмитриевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Medicine), Researcher, Laboratory of Oncolytic Viruses and Laboratory of Molecular Immunology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.м.н., научный сотрудник лаборатории онколитических вирусов и лаборатории молекулярной иммунологии</p></bio><email>and960911@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-1757-8389</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Svitich</surname><given-names>Oxana A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Свитич</surname><given-names>Оксана Анатольевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>RAS Full Member, DSc (Medicine), Director, Professor</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>академик РАН, д.м.н, директор, профессор </p></bio><email>svitichoa@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1668-1846</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="scopus">58648143400</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">7169-6807</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kalyuzhnaya</surname><given-names>Natalia O.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Калюжная</surname><given-names>Наталия Олеговна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Junior Researcher, Laboratory of Oncolytic Viruses and Laboratory of Molecular Immunology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>младший научный сотрудник лаборатории онколитических вирусов и лаборатории молекулярной иммунологии </p></bio><email>nat_kalyuzhnaya@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">I. Mechnikov Research Institute of Vaccines and Sera, Moscow, Russian Federation</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова», Москва, Россия</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">FSBEI FPE "Russian Medical Academy of Continuous Professional Education" MOH, Moscow, Russian Federation</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования»</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff3"><aff><institution xml:lang="en">I.M. Sechenov State Medical University, Moscow, Russian Federation</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГАОУ ВО Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Минздрава России, Москва, Россия</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2026-02-26" publication-format="electronic"><day>26</day><month>02</month><year>2026</year></pub-date><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-12-18"><day>18</day><month>12</month><year>2025</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2026-02-19"><day>19</day><month>02</month><year>2026</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; , Kalyuzhnaya N.O., Meremianina E.A., Ammour Y.I., Svitich O.A.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; , Калюжная Н.О., Меремьянина Е.А., Аммур Ю.И., Свитич О.А.</copyright-statement><copyright-holder xml:lang="en">Kalyuzhnaya N.O., Meremianina E.A., Ammour Y.I., Svitich O.A.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Калюжная Н.О., Меремьянина Е.А., Аммур Ю.И., Свитич О.А.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/18104">https://iimmun.ru/iimm/article/view/18104</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Acute respiratory viral infections, including influenza A, pose a global medical, social, and economic challenge. The high variability and contagiousness of the influenza A virus necessitate an in-depth study of the molecular mechanisms for interaction between the pathogen and the host immune system to develop new efficient strategies. Noncoding RNAs – regulatory molecules that influence numerous cellular processes, including the immune response, – are of great interest in this context. Objective: To study an effect of long noncoding RNA NEAT1 on influenza A (H1N1) virus replication and the expression of key components of the innate immune response associated with RIG-I-like receptor signaling pathways. Methods: The study utilized the human lung carcinoma cell line A549. The cells were infected with influenza A virus strain A/WSN/1933 (H1N1). NEAT1 expression was inhibited using specific antisense oligonucleotides. Real-time PCR was used to assess the expression levels for NEAT1, viral RNA, genes of RLR family receptors (RIG-I, MDA5, LGP2) and immune response effector molecules (NF-κB, IL-1β, IFN-α, IFN-β) at 24 and 48 hours post-infection. Results: Infection with influenza A virus resulted in significantly increased NEAT1 expression. NEAT1 inhibition was accompanied by a 9.19- and 3.03-fold increase in intracellular viral RNA replication after 24 and 48 hours, respectively. At 24 hours post-infection, NEAT1 inhibition increased the expression of the RIG-I receptor gene as well as IFN-α and IFN-β interferon genes. At 48 hours, the opposite trend was observed: upon NEAT1 inhibition, the expression levels of IFN-α and IFN-β genes, as well as NF-κB p65 subunit were significantly reduced. Conclusions: Long non-coding RNA NEAT1 plays an important role in the antiviral response to influenza A, exerting a suppressive effect on H1N1 virus replication. The influence of NEAT1 on the expression of RLR signaling pathway components is complex and dynamic: early in infection (24 hours), NEAT1 can exert a suppressive effect on immune response factors, whereas later (48 hours), it acts as a positive regulator for the expression of key effector molecules (IFN-α, IFN-β, NF-κB). These findings expand our understanding on innate immunity mechanisms and indicate the potential for NEAT1 as a target for therapeutic and diagnostic strategies.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Острые респираторные вирусные инфекции, включая грипп А, представляют глобальную медико-социальную и экономическую проблему. Высокая изменчивость и контагиозность вируса гриппа А обусловливают необходимость углубленного изучения молекулярных механизмов взаимодействия патогена с иммунной системой хозяина для разработки новых стратегий борьбы с инфекцией. Особый интерес в этом контексте представляют некодирующие РНК — регуляторные молекулы, влияющие на множество клеточных процессов, включая иммунный ответ. Цель: Изучение влияния длинной некодирующей РНК NEAT1 на репликацию вируса гриппа А (H1N1) и на экспрессию ключевых компонентов врожденного иммунного ответа, ассоциированных с сигнальными путями от RIG-I-подобных рецепторов. Методы: В исследовании использовалась клеточная линия карциномы легких человека A549. Клетки инфицировали вирусом гриппа А штамма A/WSN/1933 (H1N1). Экспрессию NEAT1 ингибировали с помощью специфичных антисмысловых олигонуклеотидов. Методом ПЦР в реальном времени оценивали уровни экспрессии NEAT1, вирусной РНК, генов рецепторов семейства RLR (RIG-I, MDA5, LGP2), а также эффекторных молекул иммунного ответа (NF-κB, IL-1β, IFN-α, IFN-β) через 24 и 48 часов после инфицирования. Результаты: Инфицирование вирусом гриппа А приводило к значительному увеличению экспрессии NEAT1. Ингибирование NEAT1 сопровождалось усилением внутриклеточной репликации вирусной РНК в 9,19 и 3,03 раза через 24 и 48 часов соответственно. Через 24 часа после заражения ингибирование NEAT1 вызывало повышение экспрессии гена рецептора RIG-I и генов интерферонов IFN-α и IFN-β. Через 48 часов наблюдалась противоположная динамика: на фоне ингибирования NEAT1 уровни экспрессии генов IFN-α и IFN-β, а также субъединицы p65 фактора NF-κB были достоверно снижены. Выводы: Длинная некодирующая РНК NEAT1 играет важную роль в противовирусном ответе при гриппе А, оказывая супрессивное действие на репликацию вируса H1N1. Влияние NEAT1 на экспрессию компонентов RLR-сигнального пути носит сложный динамический характер: на ранних сроках инфекции (24 часа) NEAT1 может оказывать подавляющее действие на факторы иммунного ответа, тогда как на более поздних сроках (48 часов) она выступает как позитивный регулятор экспрессии ключевых эффекторных молекул (IFN-α, IFN-β, NF-κB). Полученные данные расширяют понимание механизмов врожденного иммунитета и указывают на потенциал NEAT1 в качестве мишени для терапевтических и диагностических стратегий.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>NEAT1</kwd><kwd>noncoding RNAs</kwd><kwd>influenza A</kwd><kwd>H1N1</kwd><kwd>innate immunity</kwd><kwd>RIG-I-like receptors</kwd><kwd>gene expression</kwd><kwd>viral infection</kwd><kwd>interferons.</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>NEAT1</kwd><kwd>некодирующие РНК</kwd><kwd>грипп A</kwd><kwd>H1N1</kwd><kwd>врожденный иммунитет</kwd><kwd>RIG-I-подобные рецепторы</kwd><kwd>экспрессия генов</kwd><kwd>вирусная инфекция</kwd><kwd>интерфероны.</kwd></kwd-group><funding-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова»</institution></institution-wrap><institution-wrap><institution xml:lang="en">I. Mechnikov Research Institute of Vaccines and Sera</institution></institution-wrap></funding-source></award-group></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2024 году: Государственный доклад. М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. 2025. С. 424. ISBN 978–5–7508–2350–5	On the state of sanitary and epidemiological well-being of the population in the Russian Federation in 2024: State report. Moscow: Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing. 2025, p. 424. ISBN 978–5–7508–2350–5	https://rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=30171</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Ahmad M., Weiswald L.-B., Poulain L., Denoyelle C., Meryet-Figuiere M. Involvement of lncRNAs in cancer cells migration, invasion and metastasis: cytoskeleton and ECM crosstalk. J. Exp. Clin. Cancer Res., 2023, vol. 42, no. 1, p. 173.	-	https://doi.org/10.1186/s13046-023-02741-x</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Beyleveld G., Chin D.J., Moreno Del Olmo E., Carter J., Najera I., Cillóniz C., Shaw M.L. Nucleolar Relocalization of RBM14 by Influenza A Virus NS1 Protein. mSphere, 2018, vol. 3, no. 6, p. e00549-18.	-	https://doi.org/10.1128/mSphereDirect.00549-18</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Imamura K., Imamachi N., Akizuki G., Kumakura M., Kawaguchi A., Nagata K., Kato A., Kawaguchi Y., Sato H., Yoneda M., Kai C., Yada T., Suzuki Y., Yamada T., Ozawa T., Kaneki K., Inoue T., Kobayashi M., Kodama T., Wada Y., Sekimizu K., Akimitsu N. Long noncoding RNA NEAT1-dependent SFPQ relocation from promoter region to paraspeckle mediates IL8 expression upon immune stimuli. Mol. Cell, 2014, vol. 53, no. 3, pp. 393-406.	-	https://doi.org/10.1016/j.molcel.2014.01.009</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Kesheh M.M., Mahmoudvand S., Shokri S. Long noncoding RNAs in respiratory viruses: A review. Rev. Med. Virol., 2022, vol. 32, Long noncoding RNAs in respiratory viruses, no. 2, pp. e2275.	-	https://doi.org/10.1002/rmv.2275</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Landeras-Bueno S., Jorba N., Pérez-Cidoncha M., Ortín J. The Splicing Factor Proline-Glutamine Rich (SFPQ/PSF) Is Involved in Influenza Virus Transcription. PLoS Pathog., 2011, vol. 7, no. 11, p. e1002397.	-	https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1002397</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Liu W., Ding C. Roles of LncRNAs in Viral Infections. Front. Cell. Infect. Microbiol., 2017, vol. 7. p.205.	-	https://doi.org/10.3389/fcimb.2017.00205</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Ma H., Han P., Ye W., Chen H., Zheng X., Cheng L., Zhang L., Yu L., Wu X., Xu Z., Lei Y., Zhang F. The Long Noncoding RNA NEAT1 Exerts Antihantaviral Effects by Acting as Positive Feedback for RIG-I Signaling. J. Virol., 2017, vol. 91, no. 9, pp. e02250-16.	-	https://doi.org/10.1128/JVI.02250-16</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Mattick J.S., Amaral P.P., Carninci P., Carpenter S., Chang H.Y., Chen L.-L., Chen R., Dean C., Dinger M.E., Fitzgerald K.A., Gingeras T.R., Guttman M., Hirose T., Huarte M., Johnson R., Kanduri C., Kapranov P., Lawrence J.B., Lee J.T., Mendell J.T., Mercer T.R., Moore K.J., Nakagawa S., Rinn J.L., Spector D.L., Ulitsky I., Wan Y., Wilusz J.E., Wu M. Long non-coding RNAs: definitions, functions, challenges and recommendations. Nat. Rev. Mol. Cell. Biol., 2023, vol. 24, no. 6, pp. 430-447.	-	https://doi.org/10.1038/s41580-022-00566-8</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Prinz F., Kapeller A., Pichler M., Klec C. The Implications of the Long Non-Coding RNA NEAT1 in Non-Cancerous Diseases. Int. J. Mol. Sci., 2019, vol. 20, no. 3, p. 627.	-	https://doi.org/10.3390/ijms20030627</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Qiu L., Wang T., Tang Q., Li G., Wu P., Chen K. Long Non-coding RNAs: Regulators of Viral Infection and the Interferon Antiviral Response. Front. Microbiol., 2018, vol. 9, p. 1621.	-	https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.01621</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Stok J. E., Vega Quiroz M. E., van der Veen A. G. Self RNA Sensing by RIG-I–like Receptors in Viral Infection and Sterile Inflammation. J. Immunol., 2020, vol. 205, no. 4, pp. 883-891. -	https://doi.org/10.4049/jimmunol.2000488</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Tan Y., Lin J., Li T., Li J., Xu R., Ju H. LncRNA‐mediated posttranslational modifications and reprogramming of energy metabolism in cancer. Cancer Commun (Lond), 2020, vol. 41, no. 2, pp. 109-120.	-	https://doi.org/10.1002/cac2.12108</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Wang S., Zuo H., Jin J., Lv W., Xu Z., Fan Y., Zhang J., Zuo B. Long noncoding RNA Neat1 modulates myogenesis by recruiting Ezh2. Cell Death Dis., 2019, vol. 10, no. 7, p. 505.	-	https://doi.org/10.1038/s41419-019-1742-7</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Wang Z., Fan P., Zhao Y., Zhang S., Lu J., Xie W., Jiang Y., Lei F., Xu N., Zhang Y. NEAT1 modulates herpes simplex virus-1 replication by regulating viral gene transcription. Cell Mol. Life Sci., 2017, vol. 74, no. 6, pp. 1117-1131.	-	https://doi.org/10.1007/s00018-016-2398-4</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>West J.A., Davis C.P., Sunwoo H., Simon M.D., Sadreyev R.I., Wang P.I., Tolstorukov M.Y., Kingston R.E. The long noncoding RNAs NEAT1 and MALAT1 bind active chromatin sites. Mol. Cell, 2014, vol. 55, no. 5, pp. 791-802.	-	https://doi.org/10.1016/j.molcel.2014.07.012</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Winterling C., Koch M., Koeppel M., Garcia-Alcalde F., Karlas A., Meyer T.F. Evidence for a crucial role of a host non-coding RNA in influenza A virus replication. RNA Biology, 2014, vol. 11, no. 1, pp. 66-75.	-	https://doi.org/10.4161/rna.27504</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Ye L., Shi H., Yu C., Fu J., Chen C., Wu S., Zhan T., Wang B., Zheng L. LncRNA Neat1 positively regulates MAPK signaling and is involved in the pathogenesis of Sjögren’s syndrome. Int. Immunopharmacol., 2020, vol. 88, p. 106992.	-	https://doi.org/10.1016/j.intimp.2020.106992</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Zhang Q., Chen C.-Y., Yedavalli V.S.R.K., Jeang K.-T. NEAT1 long noncoding RNA and paraspeckle bodies modulate HIV-1 posttranscriptional expression. mBio, 2013, vol. 4, no. 1, pp. e00596-00512.	-	https://doi.org/10.1128/mBio.00596-12</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Zhang Y., Liu H., Niu M., Wang Y., Xu R., Guo Y., Zhang C. Roles of long noncoding RNAs in human inflammatory diseases. Cell Death Discov., 2024, vol. 10, no. 1, pp. 1-11.	-	https://doi.org/10.1038/s41420-024-02002-6</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Zhou T., Kim Y., MacLeod A.R. Targeting Long Noncoding RNA with Antisense Oligonucleotide Technology as Cancer Therapeutics. Methods. Mol. Biol., 2016, vol. 1402, pp. 199-213.	-	https://doi.org/10.1007/978-1-4939-3378-5_16</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
