<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="brief-report" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">18045</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-LSA-18045</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT COMMUNICATIONS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Short Communication</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en"><italic>Lactobacillus</italic> spp. as microbial markers for assessing the state of human microsymbiocenoses</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Виды <italic>Lactobacillus</italic> spp. как микробные маркеры оценки состояния микроэкологии биотопа</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0006-5672-4608</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="scopus">59353775600</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">4598-3067</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sivkova</surname><given-names>Daria S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Сивкова</surname><given-names>Дарья Сергеевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Assistant Professor of the Department of Microbiology, Junior Researcher of the Laboratory of Microbiome, Regenerative Medicine and Cell Technologies</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>ассистент кафедры микробиологии, младший научный сотрудник лаборатории микробиома, регенеративной медицины и клеточных технологий</p></bio><email>dasivkova@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1099-0656</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">2565-2054</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Nikolenko</surname><given-names>Marina V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Николенко</surname><given-names>Марина Викторовна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Biology), Professor of the Department of Microbiology, Head of Laboratory of Microbiome, Regenerative Medicine and Cellular Technologies</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.б.н., профессор кафедры микробиологии, зав. лабораторией микробиома, регенеративной медицины и клеточных технологий</p></bio><email>nikolenko-marina@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4424-9049</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Chepis</surname><given-names>Maria V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Чепис</surname><given-names>Мария Владимировна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Associate Professor of the Department of Medical Informatics and Biological Physics, Researcher of the Laboratory of Microbiome, Regenerative Medicine and Cell Technologies</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., доцент кафедры медицинской информатики и биологической физики, научный сотрудник лаборатории микробиома, регенеративной медицины и клеточных технологий</p></bio><email>89829174553@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Tyumen State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Тюменский государственный медицинский университет Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2026-02-25" publication-format="electronic"><day>25</day><month>02</month><year>2026</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2026-06-01" publication-format="electronic"><day>01</day><month>06</month><year>2026</year></pub-date><volume>16</volume><issue>2</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>386</fpage><lpage>390</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-11-24"><day>24</day><month>11</month><year>2025</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2026-02-19"><day>19</day><month>02</month><year>2026</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2026, Sivkova D.S., Nikolenko M.V., Chepis M.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2026, Сивкова Д.С., Николенко М.В., Чепис М.В.</copyright-statement><copyright-year>2026</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Sivkova D.S., Nikolenko M.V., Chepis M.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Сивкова Д.С., Николенко М.В., Чепис М.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/18045">https://iimmun.ru/iimm/article/view/18045</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>The human body and its microbiota are closely related to each other and are in dynamic equilibrium, being a single ecological system. The study involved 59 volunteers divided into 2 age groups: group 1 — from 20 to 39 years old and group 2 — from 40 to 59 years old, with a history of inflammatory diseases of the oral mucosa and periodontal tissues. According to the survey results, a higher risk of developing oral dysbiosis followed by an inflammatory process was revealed in group 2. In the conducted study, autochthonous species such as <italic>L. plantarum, L. paracasei</italic>, and <italic>L. fermentum</italic> prevailed in the digestive tract of the Tyumen residents. The authors proved that a high degree of seeding of 10<sup>7</sup> CFU/ml of <italic>L. paracasei</italic> in group 1 individuals is a marker for normobiota, whereas <italic>L. fermentum and L. rhamnosus</italic> are indicators of dysbiosis in this biotope. No such pattern was found in group 2 patients. Low rates of <italic>Lactobacillus </italic>spp. up to 10<sup>4</sup> CFU/ml indicates an imbalanced microbiota composition and indicates health issues. In inflammatory diseases of the oral cavity, a specific lactobacillus deficiency was observed in all subjects, regardless of age. In dental lesions of the oral cavity, two strains were found to prevail: <italic>L. fermentum</italic> and <italic>L. plantarum</italic>. The isolation of these lactobacillus strains in the studied pathological processes proves their indicator etiological significance. Presumably, the species diversity of <italic>Lactobacillus </italic>spp. in patient oral cavity was influenced by comorbidities in the anamnesis. The study of the species composition for bacterial and fungal associations in the gastrointestinal tract and oral cavity allowed to determine that the presence of certain species of <italic>Lactobacillus </italic>spp. correlates with detected pathogenic and opportunistic microorganisms. It is verified that, regardless of the biotope, <italic>L. fermentum</italic> species is as an indicator of the dysbiotic microsymbiocenosis.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Организм человека и его микробиота тесно связаны друг с другом и находятся в динамическом равновесии, являясь единой экологической системой. Рассмотрение лактобиоты с позиции ассоциативного симбиоза позволяет провести комплексное изучение микрофлоры и выявить ее значение как индикатора некоторых воспалительных состояний человека. В исследовании приняло участие 59 добровольцев, проживающих в г. Тюмени, которые были поделены на 2 группы по возрастам: I группа — от 20 до 39 лет и II группа — от 40 до 59 лет, имеющие в анамнезе воспалительные заболевания слизистой оболочки полости рта и тканей пародонта. По результатам анкетирования выявлено, что в II группе был выше риск развития дисбиоза ротовой полости с последующим воспалительным процессом. В проведенном исследовании в ЖКТ преобладали аутохтонные виды, такие как <italic>L. plantarum, L. paracasei, L. fermentum</italic>. У единичных пациентов (7%) встречались<italic> L. rhamnosus</italic>,<italic> L. lactis</italic>, скорее всего принадлежащие к аллохтонным вариантам. Авторами доказано, что высокая степень высеваемости (10<sup>7</sup> КОЕ/мл)<italic> L. paracasei</italic> у людей из I группы является маркером нормобиоты, а<italic> L. fermentum</italic> и<italic> L. rhamnosus</italic> — индикатором дисбиоза данного биотопа. Подобной закономерности у пациентов II группы не обнаружено. Низкие показатели<italic> Lactobacillus </italic>spp. (до 10<sup>4</sup> КОЕ/мл) говорят о дисбалансе микробиоты и указывают на проблемы со здоровьем. Поэтому анализ количества лактобактерий — важный инструмент для определения состояния микрофлоры и оценки здоровья организма в целом. При воспалительных заболеваниях полости рта наблюдался видовой дефицит лактобактерий у всех обследуемых независимо от возраста. При стоматологических поражениях полости рта установлено превалирование двух видов:<italic> L. fermentum</italic> и<italic> L. plantarum</italic>. Выделение данных видов лактобактерий при изучаемых патологических процессах доказывает их индикаторную этиологическую значимость. Предположительно, на видовое разнообразие<italic> Lactobacillus </italic>spp. полости рта повлияли сопутствующие заболевания пациентов в анамнезе. Изучение видового состава бактериально-грибковых ассоциаций ЖКТ и ротовой полости позволило определить, что присутствие некоторых видов<italic> Lactobacillus </italic>spp. коррелирует с наличием патогенных и условно-патогенных микроорганизмов. Доказано, что в независимости от биотопа вид<italic> L. fermentum</italic> выступает индикатором дисбиотического состояния микросимбиоценоза.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Lactobacillus spp.</kwd><kwd>periodontitis</kwd><kwd>bacterial-fungal associations</kwd><kwd>bacteriological method</kwd><kwd>mass spectrometry</kwd><kwd>dysbacteriosis</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>Lactobacillus spp.</kwd><kwd>пародонтит</kwd><kwd>бактериально-грибковые ассоциации</kwd><kwd>бактериологический метод</kwd><kwd>масс-спектрометрия</kwd><kwd>дисбактериоз</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Годовалов А.П., Даниелян Т.Ю., Карпунина Т.И. Характеристики штаммов лактобактерий, обладающие диагностической значимостью в гинекологической практике // Клиническая лабораторная диагностика. 2019. № 2. C. 111–116. [Godovalov A.P., Danielyan T.Yu., Karpunina T.I. Characteristics of Lactobacillus Strains with Diagnostic Significance in Gynecological Practice. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika = Russian Clinical Laboratory Diagnostics, 2019, no. 2, pp. 111–116. (In Russ.)] doi 10.18821/0869-2084-2019-64-2-111-116</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2025621762 Российская Федерация. Данные о видовом составе микросимбиоценозов полости рта и ЖКТ у пациентов со стоматитами, гингивитами, пародонтитами; заявл. 27.03.2025: опубл. 21.04.2025 / Сивкова Д.С., Николенко М.В., Храмова Е.Б., Цымбал И.Н.; заявитель: Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Тюменский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации. [Certificate of State registration of the database No. 2025621762 Russian Federation. Data on the species composition of microsymbiocenoses of the oral cavity and gastrointestinal tract in patients with stomatitis, gingivitis, periodontitis; application 03.27.2025: published 04.21.2025 / Sivkova D.S., Nikolenko M.V., Khramova E.B., Tsymbal I.N.; applicant: Federal State Budgetary Educational Institution of Higher Education “Tyumen State Medical University” Ministry of Health of the Russian Federation Federation.]</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Ташланова В.В., Катаева Л.В., Степанова Т.Ф. Видовая характеристика бактерий рода Lactobacillus, циркулирующих в различных локусах организма человека (обзор литературы) // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2023. Т. 100, № 4. С. 364–375. [Tashlanova V.V., Kataeva L.V., Stepanova T.F. Species characteristics of bacteria of the genus Lactobacillus circulating in various loci of the human body (literature review) Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2023, vol. 100, no. 4, pp. 364–375. (In Russ.)] doi: 10.36233/0372-9311-332</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Alizadeh M., Yousefi L., Pakdel F., Ghotaslou R., Rezaee M.A., Khodadadi E., Oskouei M.A., Soroush Barhaghi M.H., &amp; Kafil H.S. MALDI-ToF Mass Spectroscopy Applications in Clinical Microbiology. Adv. Pharmacol. Pharm. Sci., 2021: 9928238. doi: 10.1155/2021/9928238</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
