<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="brief-report" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">17912</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-FOF-17912</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT COMMUNICATIONS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Short Communication</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">“Friend or foe” microbial recognition for selection criteria of oral cavity microsymbiont antagonists</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Критерии отбора антагонистов микросимбионтов ротовой полости методом микробного распознавания «свой–чужой»</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1099-0656</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">2565-2054</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Nikolenko</surname><given-names>M. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Николенко</surname><given-names>М. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Biology), Professor of the Department of Microbiology, Head of Laboratory of Microbiome, Regenerative Medicine and Cellular Technologies</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>доктор биологических наук , профессор кафедры микробиологии, зав. лабораторией микробиома, регенеративной медицины и клеточных технологий</p></bio><email>nikolenko-marina@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0009-0006-5672-4608</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">4598-3067</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sivkova</surname><given-names>Daria S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Сивкова</surname><given-names>Дарья Сергеевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Assistant Professor of the Department of Microbiology, Junior Researcher of the Laboratory of Microbiome, Regenerative Medicine and Cell Technologies</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>ассистент кафедры микробиологии, младший научный сотрудник лаборатории микробиома, регенеративной медицины и клеточных технологий</p></bio><email>sivkovads@tyumsmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4424-9049</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Chepis</surname><given-names>M. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Чепис</surname><given-names>М. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Associate Professor of the Department of Medical Informatics and Biological Physics, Researcher of the Laboratory of Microbiome, Regenerative Medicine and Cell Technologies</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>кандидат биологических наук , доцент кафедры медицинской информатики и биологической физики, научный сотрудник лаборатории микробиома, регенеративной медицины и клеточных </p></bio><email>89829174553@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Tyumen State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Тюменский государственный медицинский университет Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2025-08-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>08</month><year>2025</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2025-12-08" publication-format="electronic"><day>08</day><month>12</month><year>2025</year></pub-date><volume>15</volume><issue>5</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>993</fpage><lpage>996</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-04-15"><day>15</day><month>04</month><year>2025</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2025-08-12"><day>12</day><month>08</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2025, Nikolenko M.V., Sivkova D.S., Chepis M.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2025, Николенко М.В., Сивкова Д.С., Чепис М.В.</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Nikolenko M.V., Sivkova D.S., Chepis M.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Николенко М.В., Сивкова Д.С., Чепис М.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/17912">https://iimmun.ru/iimm/article/view/17912</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Lactoflora viewed from associative symbiosis standpoint will allow for a comprehensive study of the various functions of these bacteria that determine the mechanisms of integrative interactions of microbiota with human body. The aim of the study: to search for effective antagonists targeting pathogens that cause oral cavity and periodontal inflammatory diseases based on “friend or foe” microbial recognition. The study involved 19 volunteers. Clinical material samples collected from patients were examined in the Laboratory of Microbiome, Regenerative Medicine and Cell Technologies at the Tyumen State Medical University. The smears from the inflammatory tissues of the oral mucosa were analyzed using standard bacteriological method. Biofilm formation was examined using the modified macrometric method. Metabolite output and “friend or foe” microbial recognition in the oral microsymbiocenosis were carried out according to the method, with its activity not including metabolites-related effect serving as a control. Microsymbionts-related biofilm formation as a universal physiological function was selected as a system-forming factor in microsymbiocenosis establishment. <italic>Lactobacillus</italic> spp. were chosen as the study object as normobiota and because they are found in both studied biotopes and can serve as a basis for new probiotics. <italic>Streptococcus</italic><italic> </italic>spp.<italic>, </italic><italic>Staphylococcus</italic><italic> </italic><italic>aureus</italic><italic>, </italic><italic>Candida</italic><italic> </italic><italic>а</italic><italic>lbicans</italic><italic> </italic>were chosen as the associative microbiota as the etiological factors of inflammatory diseases in oral cavity and periodontal tissues. It was experimentally proven that the metabolic products of <italic>Lactobacillus</italic><italic> </italic>spp. obtained from the oral cavity and pre-incubated with same biotope <italic>Streptococcus</italic><italic> </italic>spp. (separately with each) significantly increased the activity of biofilm formation of the latter suggesting increased or preserved adaptive capabilities as an indicator of «relevant» microsymbionts for lactobacilli (p &lt; 0.05). Metabolic products derived from <italic>Lactobacillus</italic><italic> </italic>spp., obtained from two study biotopes, pre-incubated with metabolites of <italic>Staphylococcus</italic><italic> </italic><italic>aureus</italic><italic>, </italic><italic>Candida</italic><italic> </italic><italic>а</italic><italic>lbicans</italic>, significantly reduced biofilm-forming activity of pathogens (p &lt; 0.05). A decrease in film-forming activity is a marker of microsymbiont “foreignness” for lactobacilli during formation of bacterial-fungal associations. <italic>Lactobacillus</italic><italic> </italic>spp., isolated from the gastrointestinal tract, are antagonists of <italic>Streptococcus</italic><italic> </italic><italic>mutans</italic><italic>, </italic><italic>Streptococcus</italic><italic> </italic><italic>mitis</italic><italic>, </italic><italic>Streptococcus</italic><italic> </italic><italic>uberis</italic>. And <italic>Lactobacillus</italic><italic> </italic>spp., obtained from the oral cavity, on the contrary, are synergists of such pathogens. The data obtained open up avenues for understanding inter-microbial microsymbiont interactions and can be used both as diagnostic tools and for optimal selection of “candidates” in proposing new probiotics and synbiotics.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Рассмотрение лактофлоры с позиции ассоциативного симбиоза позволит провести комплексное изучение разнообразных функции данных бактерий, определяющих механизмы интегративных взаимодействий микробиоты с организмом человека. Цель исследования: поиск эффективных антагонистов в отношении патогенов, вызывающих воспалительные заболевания полости рта и пародонта методом микробного распознавания «свой–чужой». В исследовании приняло участие 19 добровольцев. В лаборатории микробиома, регенеративной медицины и клеточных технологий Тюменского ГМУ проведено исследование образцов клинического материала пациентов. Анализ мазков с воспалительных тканей слизистой оболочки полости рта производили классическим бактериологическим методом. Изучение биопленкообразования проводилось модифицированным макрометрическим методом. Получение метаболитов и изучение феномена микробного распознавания «свой–чужой» в микросимбиоценозе ротовой полости проводили по методике Н.Б. Перуновой (2013). Контролем служили показатели данного свойства выбранных микросимбионтов без воздействия метаболитов. В качестве системообразующего фактора формирования микросимбиоценоза авторами выбрана универсальная физиологическая функция — образование биопленок микросимбионтами. В качестве объекта исследований выбраны<italic> </italic><italic>Lactobacillus</italic> spр. как нормобиота, и данные микроорганизмы встречаются в обоих изучаемых биотопах и могут служить основой для новых пробиотиков. В качестве ассоциативной микробиоты выбраны<italic> </italic><italic>Streptococcus</italic> spp., <italic>Staphylococcus</italic><italic> </italic><italic>aureus</italic><italic>, </italic><italic>Candida</italic><italic> а</italic><italic>lbicans</italic> как этиологические факторы воспалительных заболеваний полости рта и тканей пародонта. Экспериментально доказано, что продукты метаболизма <italic>Lactobacillus</italic><italic> </italic>spp., полученных из ротовой полости и предварительно соинкубированные <italic>Streptococcus</italic><italic> </italic>spp. с из того же биотопа (с каждым в отдельности), достоверно повышали активность биопленкообразования последних, что указывает на усиление или сохранение адаптивных возможностей и является показателем «своих» микросимбионтов для лактобактерий (p &lt; 0,05). Продукты метаболизма <italic>Lactobacillus</italic><italic> </italic>spp., полученных из двух изучаемых биотопов, предварительно соинкубированные с метаболитами <italic>Staphylococcus</italic><italic> </italic><italic>aureus</italic><italic>, </italic><italic>Candida</italic><italic> а</italic><italic>lbicans</italic><italic>,</italic> достоверно снижали биопленкообразующую активность патогеннов (p &lt; 0,05). Уменьшение активности пленкообразования, являются маркером «чужеродности» микросимбиотнов для лактобацилл при формировании бактериально-грибковых ассоциаций. <italic>Lactobacillus</italic><italic> </italic>spp., выделенные из ЖКТ, являются антагонистами <italic>Streptococcus</italic><italic> </italic><italic>mutans</italic><italic>, </italic><italic>Streptococcus</italic><italic> </italic><italic>mitis</italic><italic>, </italic><italic>Streptococcus</italic><italic> </italic><italic>uberis</italic>, а <italic>Lactobacillus</italic><italic> </italic>spp., полученные из ротовой полости, напротив, синергисты этих возбудителей. Полученные данные открывают перспективу понимания межмикробных взаимодействий микросимбионтов и могут быть использованы как для диагностических целей, так и для оптимального отбора «кандидатов» при создании новых пробиотиков и синбиотиков.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Lactobacillus spp.</kwd><kwd>“friend or foe”</kwd><kwd>biofilms</kwd><kwd>periodontitis</kwd><kwd>gingivitis</kwd><kwd>microsymbionts</kwd><kwd>Streptococcus spp.</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>Lactobacillus spp.</kwd><kwd>«свой–чужой»</kwd><kwd>биопленки</kwd><kwd>пародонтит</kwd><kwd>гингивит</kwd><kwd>микросимбионты</kwd><kwd>Streptococcus spp.</kwd></kwd-group><funding-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">Правительство РФ</institution></institution-wrap><institution-wrap><institution xml:lang="en">Government of the Russian Federation</institution></institution-wrap></funding-source></award-group></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Роль микробиоты в регуляции гомеостаза организма человека при инфекции // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. 2020. Т. 97, № 5. С. 458–467. [Bukharin O.V., Perunova N.B. The role of microbiota in the regulation of homeostasis in the human body during infection. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2020, vol. 97, no. 5, pp. 458–467. (In Russ.)] doi: 10.36233/0372-9311-2020-97-5-8</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Микробное распознавание «свой–чужой» в условиях кишечного микросимбиоценоза человека // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2011. Т. 88, № 6. C. 46–51. [Bukharin O.V., Perunova N.B. Microbial “friend-foe” identification in human intestine microsymbiocenosis. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2011, vol. 88, no. 6, pp. 46–51. (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-AAM-1482</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Николенко М.В., Барышникова Н.В., Малишевская О.И., Еноктаева О.В., Васева Е.М. Изучение динамики биопленкообразования Сandida sp. в течение суток модифицированным макрометрическим методом // Инфекция и иммунитет. 2022. Т. 12, № 6. C. 1129–1135. [Nikolenko M.V., Baryshnikova N.V., Malishevskaya O.I., Enoktaeva O.V., Vaseva E.M. A 24-hour Сandida sp. biofilm formation dynamically assesed with modified macrometric method. Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2022, vol. 12, no. 6, pp. 1129–1135. (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-AHC-1929</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Nishimoto Y., Salim F., Yama K., Kumagai K., Jo R., Harada M., Maruyama Y., Aita Y., Fujii N., Inokuchi T., Kawamata R., Sako M., Ichiba Y., Tsutsumi K., Kimura M., Mori Y., Murakami S., Kakizawa Y., Kumagai T., Fukuda S. Integrated analysis of the oral and intestinal microbiome and metabolome of elderly people with more than 26 original teeth: a pilot study. Front. Microbiol., 2023, vol. 14: 1233460. doi: 10.3389/fmicb.2023.1233460</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Park S.Y., Hwang B.O., Lim M., Ok S.H., Lee S.K., Chun K.S., Park K.K., Hu Y., Chung W.Y., Song N.Y. Oral-Gut Microbiome Axis in Gastrointestinal Disease and Cancer. Cancers, 2021, vol. 13, no. 9: 2124. doi: 10.3390/cancers13092124</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Sharma N., Bhatia S., Sodhi A.S., Batra N. Oral microbiome and health. AIMS Microbiol., 2018, vol. 4, no. 1, pp. 42–66. doi: 10.3389/fmicb.2023.1233460</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
