Russian Journal of Infection and ImmunityRussian Journal of Infection and ImmunityИнфекция и иммунитет2220-76192313-7398SPb RAACI1790410.15789/2220-7619-POD-17904ORIGINAL ARTICLESОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИResearch ArticlePolymorphism of DNA repair system protein genes and its association with chronic viral hepatitis CПолиморфизм генов белков систем репарации ДНК и его связь с хроническим вирусным гепатитом СBabushkinaNadezhda P.БабушкинаНадежда Петровна
Russian Federation

PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of Population Genetics, Research Institute of Medical Genetics

к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории популяционной генетики НИИ медицинской генетики

nad.babushkina@medgenetics.ruShavrakV. E.ШавракВ. Е.
Russian Federation

Junior Researcher, Laboratory of Genomics of Orphan Diseases, Research Institute of Medical Genetics

младший научный сотрудник лаборатории геномики орфанных болезней НИИ медицинской генетики

nad.babushkina@medgenetics.ruGoncharovaI. A.ГончароваИ. А.
Russian Federation

PhD (Biology), Researcher, Population Genetics Laboratory, Research Institute of Medical Genetics

к.б.н., научный сотрудник лаборатории популяционной генетики НИИ медицинской генетики

nad.babushkina@medgenetics.ruBeloborodovaE. V.БелобородоваЕ. В.
Russian Federation

DSc (Medicine), Professor of the Department of Hospital Therapy with a Course of Rehabilitation, Physiotherapy and Sports Medicine

д.м.н., профессор кафедры госпитальной терапии с курсом реабилитации, физиотерапии и спортивной медицины

nad.babushkina@medgenetics.ruTomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of SciencesТомский национальный исследовательский медицинский центр РАНSiberian State Medical UniversityФГБОУ ВО Сибирский государственный медицинский университет Минздрава России0207202506112025154Russian Journal of Infection and ImmunityИнфекция и иммунитет6496632803202530062025Copyright ©; 2025, Babushkina N.P., Shavrak V.E., Goncharova I.A., Beloborodova E.V.Copyright ©; 2025, Бабушкина Н.П., Шаврак В.Е., Гончарова И.А., Белобородова Е.В.2025Babushkina N.P., Shavrak V.E., Goncharova I.A., Beloborodova E.V.Бабушкина Н.П., Шаврак В.Е., Гончарова И.А., Белобородова Е.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://iimmun.ru/iimm/article/view/17904

Hepatitis C is an infectious disease that causes liver inflammation and often leads to a chronic process. The genes encoding proteins involved in DNA repair systems participate in developing immune responses and inflammation, making them promising candidates for studying genetic predisposition to a wide range of common diseases, including infections. However, this group of genes is rarely studied to assess their role in genetic susceptibility to infectious diseases. In the present study, we investigated a role for polymorphisms in DNA repair system protein genes (ATM (rs189037 and rs1801516), NBN (rs709816 and rs1805800), MRE11 (rs473297), TP53BP1 (rs560191), MLH1 (rs1799977), PMS2 (rs1805321)) in the pathogenesis of chronic hepatitis C. As a result, associations were found both between some studied markers (rs1805321 in the PMS2 gene and rs1801516 in the ATM gene) and chronic hepatitis C as well as relations of various quantitative traits and the polymorphisms of these genes. For example, variability in blood biochemical parameters (levels of cholesterol, glucose, iron, prothrombin index values, and thymol test results) was shown to depend on genotypes of two markers in the NBN gene (rs709816 and rs1805800). Clinical and morphological indicators are associated with variants in the NBN (rs1805800), MRE11 (rs473297), and PMS2 (rs1805321) genes. The absolute and relative levels of neutrophils are influenced by rs1805800 (NBN), rs473297 (MRE11), and rs1799977 (MLH1), whereas lymphocyte counts are affected by both markers in the NBN gene, rs473297 (MRE11), rs1799977 (MLH1), and rs1805321 (PMS2). The lowest post-treatment IgG levels are observed in carriers of rarer genotypes in rs1805800 and rs709816 in NBN gene. Thus, our study demonstrates an impact of the studied genes on the pathogenesis of chronic hepatitis C, although the mechanism underlying such associations is not always clear. Nevertheless, our findings suggest about pleiotropic effects of DNA repair protein genes and their involvement in developing chronic hepatitis C.

Вирусный гепатит C представляет собой инфекционное заболевание, которое приводит к воспалению печени, и, часто, к хронизации этого процесса. Гены белков систем репарации ДНК участвуют в развитии иммунного ответа и воспаления, что делает их перспективными кандидатами для изучения генетической предрасположенности к широкому спектру многофакторных заболеваний, включая инфекционные. Тем не менее эта группа генов редко привлекается для изучения генетической составляющей подверженности инфекционным заболеваниям. Таким образом, целью настоящего исследования было изучение вовлеченности полиморфизма генов белков систем репарации ДНК (ATM (rs189037 и rs1801516), NBN (rs709816 и rs1805800), MRE11 (rs473297), TP53BP1 (rs560191), MLH1 (rs1799977), PMS2 (rs1805321)) в патогенез хронического вирусного гепатита С. В результате работы были получены как ассоциации некоторых изученных маркеров (rs1805321 в гене PMS2 и rs1801516 в гене ATM) непосредственно с патологией, так и зависимость ряда количественных признаков от полиморфизма изученных генов. Так, показана изменчивость биохимических показателей крови (уровни холестерина, глюкозы, железа, значения ПТИ и тимоловой пробы) в зависимости от генотипов по двум маркерам гена NBN (rs709816 и rs1805800). Клинико-морфологические показатели ассоциированы с вариантами в генах NBN (rs1805800), MRE11 (rs473297), PMS2 (rs1805321). На абсолютный и относительный уровень содержания нейтрофилов оказывают влияние rs1805800 (NBN), rs473297 (MRE11), rs1799977 (MLH1); на уровни лимфоцитов — оба маркера в гене NBN, rs473297 (MRE11), rs1799977 (MLH1), rs1805321 (PMS2). Наименьшие значения уровней иммуноглобулина G после лечения определяются у носителей более редких генотипов по rs1805800 и rs709816 гена NBN. Таким образом, в результате исследования зарегистрированы ассоциации изученных маркеров как непосредственно с ХВГС, так и с патогенетически значимыми признаками, хотя механизм реализации выявленных ассоциаций не всегда очевиден. Тем не менее наши исследования указывают на наличие плейотропных эффектов генов белков репарации ДНК и на их вовлеченность в развитие ХВГС.

DNA repairSNPassociationsgenetic predispositionchronic hepatitis Cclinical signsрепарация ДНКSNPассоциациигенетическая предрасположенностьХВГСклинические признакиГосзаданиеState task№ 122020300041-7Бабушкина Н.П., Гончарова И.А., Постригань А.Е., Кучер А.Н. Ген PMS2 ассоциирован с хроническим вирусным гепатитом С // Медицинская генетика. 2022. Т. 21, № 7. С. 19–23. [Babushkina N.P., Goncharova I.A., Postrigan’ A.E., Kucher A.N. The PMS2 gene is associated with HCVC. Meditsinskaya genetika = Medical Genetics, 2022, vol. 21, no. 7, pp. 19–23. (In Russ.)] doi: 10.25557/2073-7998.2022.07.19-23Белобородова Е.В., Гончарова И.А., Белобородова Э.И., Пурлик И.Л., Калачева Т.П., Акбашева О.Е., Рачковский М.И., Бурковская В.А. Иммуногенетика и прогрессирование хронических вирусных гепатитов // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2015. Т. 3, № 115. С. 45–49. [Beloborodova E.V., Goncharova I.A., Beloborodova E.I., Purlik I.L., Kalacheva T.P., Akbasheva O.E., Rachkovskij M.I., Burkovskaja V.A. Immunogenetics and progression of chronic viral hepatitis. Eksperimental’naya i klinicheskaya gastroenterologiya = Experimental and Clinical Gastroenterology, 2015, vol. 3, no. 115, pp. 45–49. (In Russ.)]Белобородова Е.В., Гончарова И.А., Рязанцева Н.В., Белобородова Э.И., Пурлик И.Л., Калачева Т.П. Роль иммуногенетики в прогрессировании хронических вирусных гепатитов // Клинические перспективы гастроэнтерологии, гепатологии. 2014. № 2. С. 11–14. [Beloborodova E.V., Goncharova I.A., Rjazanceva N.V., Beloborodova E.I., Purlik I.L., Kalacheva T.P. Role of immunogenetics in progression of chronic viral hepatitis. Klinicheskie perspektivy gastroenterologii, gepatologii = Clinical Perspectives of Gastroenterology, Hepatology, 2014, no. 2, pp. 11–14. (In Russ.)]Гепатит С // Всемирная организация здравоохранения, 2024. [Hepatitis C. World Health Organization, 2024. (In Russ.)] URL: https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/hepatitis-c (17.07.2025)Гончарова И.А., Белобородова Е.В., Фрейдин М.Б., Белобородова Э.И., Черногорюк Г.Э., Пузырев В.П. Генетические факторы подверженности к хронизации вирусного гепатита и фиброзу в печени // Молекулярная биология. 2008. Т. 42, № 2. С. 238–241. [Goncharova I.A., Beloborodova E.V., Frejdin M.B., Beloborodova E.I., Chernogorjuk G.E., Puzyrev V.P. Genetic factors of susceptibility to chronic viral hepatitis and liver fibrosis. Molekulyarnaya biologiya = Molecular Biology, 2008, vol. 42, no. 2, pp. 238–241. (In Russ.)]Гончарова И.А., Назаренко М.С., Тарасенко Н.В., Марков А.В., Белобородова Е.В., Пузырев В.П. Генетические маркеры фиброгенеза при хроническом вирусном гепатите С // Медицинская генетика. 2016. Т. 15, № 12. С. 29–36. [Goncharova I.A., Nazarenko M.S., Tarasenko N.V., Markov A.V., Beloborodova E.V., Puzyrev V.P. Genetic markers of fibrogenesis in determining susceptibility to chronic hepatitis C virus infection. Meditsinskaya genetika = Medical Genetics, 2016, vol. 15, no. 12, pp. 29–36. (In Russ.)]Гончарова И.А., Фрейдин М.Б., Дунаева Л.Е., Белобородова Е.В., Белобородова Э.И., Пузырев В.П. Анализ связи полиморфизма Ile50Val гена рецептора интерлейкина-4 (IL4RA) с хроническим вирусным гепатитом // Молекулярная биология. 2005. Т. 39, № 3. С. 379–384. [Goncharova I.A., Frejdin M.B., Dunaeva L.E., Beloborodova E.V., Beloborodova E.I., Puzyrev V.P. Association of the ile50Val polymorphism of the interleukin-4 receptor gene IL4RA with chronic viral hepatitis. Molekulyarnaya biologiya = Molecular Biology, 2005, vol. 39, no. 3, pp. 379–384. (In Russ.)]Лифшиц В.М., Сидельникова В.И. Биохимические анализы в клинике. 2-е изд. М.: Медицинское информационное агентство, 2001. 303 с. [Lifshic V.M., Sidel’nikova V.I. Biochemical analyses in clinic. 2nd ed. Moscow: Medicinskoe informacionnoe agentstvo, 2001. 303 p. (In Russ.)]Нурмагомаев М.С., Магомедова З.С., Каграманова З.С. Хронические гепатиты в клинике внутренних болезней // Научное обозрение. Медицинские науки. 2016. № 5. С. 77–91. [Nurmagomaev M.S., Magomedova Z.S., Kagramanova Z.S. Chronic hepatitis in the clinic of internal diseases. Nauchnoe obozrenie. Meditsinskie nauki = Scientific Review. Medical Sciences, 2016, no. 5, pp. 77–91. (In Russ.)]Офицеров В.И. Подклассы иммуноглобулина G: возможности использования в диагностической практике. Методическое пособие. Кольцово: ЗАО «Вектор-Бест», 2005. [Oficerov V.I. Immunoglobulin G subclasses: possibilities of use in diagnostic practice. Methodological manual. Koltsovo: ZAO “Vektor-Best”, 2005. (In Russ.)]Стяжкина С.Н., Глушкова Т.Г., Кирьянов Н.А., Зайцев Д.В., Ленцова С.И., Горбунова М.А. Морфофункциональная характеристика печени и поджелудочной железы при воздействии гепатопротектора Ремаксол на фоне острого алкогольного воздействия у крыс // Эффективная фармакотерапия. 2024. Т. 20, № 2. С. 26–29. [Stjazhkina S.N., Glushkova T.G., Kir’janov N.A., Zajcev D.V., Lencova S.I., Gorbunova M.A. Morphofunctional Characteristic of the Hepar and Pancreas When Exposed to the Hepatoprotector Remaxol in Cases of Acute Alcohol Damage in Rats. Effektivnaya farmakoterapiya = Effective Pharmacotherapy, 2024, vol. 20, no. 2, pp. 26–29. (In Russ.)] doi: 10.33978/2307-3586-2024-20-2-26-29Трошина Е.А., Сенюшкина Е.С. Вклад центральных регуляторов иммунного ответа в развитие заболеваний щитовидной железы // Проблемы эндокринологии. 2019. Т. 65, № 6. С. 458–465. [Troshina E.A., Senjushkina E.S. The value of central regulators of the immune response in the development of autoimmune thyroid diseases. Problemy endokrinologii = Problems of Endocrinology, 2019, vol. 65, no. 6, pp. 458–465. (In Russ.)] doi: 10.14341/probl10304Яковенко Э.П., Григорьев П.Я. Хронические заболевания печени: диагностика и лечение // Русский медицинский журнал. 2003. Т. 5. С. 291. [Yakovenko E.P., Grigoriev P.Ya. Chronic liver diseases: diagnosis and treatment. Russkij medicinskij zhurnal = Russian Medical Journal, 2003, vol. 5, p. 291. (In Russ.)]Almeida Pereira Leite S.T., Marques-Guimarães N., Silva-Oliveira J.C., Dutra-Souto F.J., Alves-dos-Santos R., Bassi-Branco C.L. The X-ray repair cross complementing protein 1 (XRCC1) rs25487 polymorphism and susceptibility to cirrhosis in Brazilian patients with chronic viral hepatitis. Ann. Hepatol., 2013, vol. 12, no. 5, pp. 733–739.Ariumi Y., Kuroki M., Dansako H., Abe K., Ikeda M., Wakita T., Kato N. The DNA-damage sensors ataxia-telangiectasia mutated kinase and checkpoint kinase 2 are required for hepatitis C virus RNA replication. J. Virol., 2008, vol. 82, no. 19, pp. 9639–9646. doi: 10.1128/JVI.00351-08Basyte-Bacevice V., Skieceviciene J., Valantiene I., Sumskiene J., Petrenkiene V., Kondrackiene J., Petrauskas D., Lammert F., Kupcinskas J. SERPINA1 and HSD17B13 gene variants in patients with liver fibrosis and cirrhosis. J. Gastrointestin. Liver Dis., 2019, vol. 28, no. 3, pp. 297–302. doi: 10.15403/jgld-168Bochud P.Y., Bibert S., Kutalik Z., Patin E., Guergnon J., Nalpas B., Goossens N., Kuske L., Müllhaupt B., Gerlach T., Heim M.H., Moradpour D., Cerny A., Malinverni R., Regenass S., Dollenmaier G., Hirsch H., Martinetti G., Gorgiewski M., Bourlière M., Poynard T., Theodorou I., Abel L., Pol S., Dufour J.F., Negro F. IL28B alleles associated with poor hepatitis C virus clearance protect against inflammation and fibrosis in patients infected with non-1 HCV genotypes. Hepatology, 2012, vol. 55, no. 2, pp. 384–394. doi: 10.1002/hep.24678Bredemeyer A.L., Sharma G.G., Huang C.Y., Helmink B.A., Walker L.M., Khor K.C., Nuskey B., Sullivan K.E., Pandita T.K., Bassing C.H., Sleckman B.P. ATM stabilizes DNA double-strand-break complexes during V(D)J recombination. Nature, 2006, vol. 442, no. 7101, pp. 466–470. doi: 10.1038/nature04866Chahwan R., Edelmann W., Scharff M.D., Roa S. Mismatch-mediated error-prone repair at the immunoglobulin genes. Biomed. Pharmacother., 2011, vol. 65, no. 8, pp. 529–536. doi: 10.1016/j.biopha.2011.09.001Chahwan R., van Oers J.M., Avdievich E., Zhao C., Edelmann W., Scharff M.D., Roa S. The ATPase activity of MLH1 is required to orchestrate DNA double-strand breaks and end processing during class-switch recombination. J. Exp. Med., 2012, vol. 209, no. 4, pp. 671–678. doi: 10.1084/jem.20111531Chen H.T., Bhandoola A., Difilippantonio M.J., Zhu J., Brown M.J., Tai X., Rogakou E.P., Brotz T.M., Bonner W.M., Ried T., Nussenzweig A. Response to RAG-mediated VDJ cleavage by NBS1 and γ-H2AX. Science, 2000, vol. 290, no. 5498, pp. 1962–1965. doi: 10.1126/science.290.5498.1962Cui A., Li B., Wallace M.S., Gonye A.L.K., Oetheimer C., Patel H., Tonnerre P., Holmes J.A., Lieb D., Yao B.S., Ma A., Roberts K., Damasio M., Chen J.H., Piou D., Carlton-Smith C., Brown J., Mylvaganam R., Hon Fung J.M., Sade-Feldman M., Aneja J., Gustafson J., Epstein E.T., Salloum S., Brisac C., Thabet A., Kim A.Y., Lauer G.M., Hacohen N., Chung R.T., Alatrakchi N. Single-cell atlas of the liver myeloid compartment before and after cure of chronic viral hepatitis. J. Hepatol., 2024, vol. 80, no. 2, pp. 251–267. doi: 10.1016/j.jhep.2023.02.040Desbois A.C., Cacoub P. Diabetes mellitus, insulin resistance and hepatitis C virus infection: a contemporary review. World J. Gastroenterol., 2017, vol. 23, no. 9, pp. 1697–1711. doi: 10.3748/wjg.v23.i9.1697Dinkelmann M., Spehalski E., Stoneham T., Buis J., Wu Y., Sekiguchi J.M., Ferguson D.O. Multiple functions of MRN in end-joining pathways during isotype class switching. Nat. Struct. Mol. Biol., 2009, vol. 16, no. 8, pp. 808–813. doi: 10.1038/nsmb.1639Douam F., Bobay L.M., Maurin G., Fresquet J., Calland N., Maisse C., Durand T., Cosset F.L., Féray C., Lavillette D. Specialization of hepatitis C virus envelope glycoproteins for B lymphocytes in chronically infected patients. J. Virol., 2015, vol. 90, no. 2, pp. 992–1008. doi: 10.1128/JVI.02516-15Du F., Zhang M., Li X., Yang C., Meng H., Wang D., Chang S., Xu Y., Price B., Sun Y. Dimer–monomer transition and dimer re-formation play important roles for ATM cellular function during DNA repair. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2014, vol. 452, no. 4, pp. 1034–1039. doi: 10.1016/j.bbrc.2014.09.038Durand T., Di Liberto G., Colman H., Cammas A., Boni S., Marcellin P., Cahour A., Vagner S., Féray C. Occult infection of peripheral B cells by hepatitis C variants which have low translational efficiency in cultured hepatocytes. Gut, 2010, vol. 59, no. 7, pp. 934–942. doi: 10.1136/gut.2009.192088Elgretli W., Chen T., Kronfli N., Sebastiani G. Hepatitis C virus — lipid interplay: pathogenesis and clinical impact. Biomedicines, 2023, vol. 11, no. 2: 271. doi: 10.3390/biomedicines11020271Fabris C., Falleti E., Cussigh A., Bitetto D., Fontanini E., Colletta C., Vandelli C., Cmet S., Ceriani E., Smirne C., Toniutto P., Pirisi M. The interleukin 28B rs12979860 C/T polymorphism and serum cholesterol as predictors of fibrosis progression in patients with chronic hepatitis C and persistently normal transaminases. J. Med. Virol., 2012, vol. 84, no. 5, pp. 747–755. doi: 10.1002/jmv.23259Ferreira J., Bicho M., Serejo F. ABCA1 polymorphism R1587K in chronic hepatitis C is gender-specific and modulates liver disease severity through its influence on cholesterol metabolism and liver function: a preliminary study. Genes (Basel), 2022, vol. 13, no. 11: 2095. doi: 10.3390/genes13112095Frey S., Bertocci B., Delbos F., Quint L., Weill J.C., Reynaud C.A. Mismatch-repair deficiency interferes with the accumulation of mutations in chronically stimulated B cells and not with the hypermutation process. Immunity, 1998, vol. 9, no. 1, pp. 127–134. doi: 10.1016/S1074-7613(00)80594-4Ge D., Fellay J., Thompson A.J., Simon J.S., Shianna K.V., Urban T.J., Heinzen E.L., Qiu P., Bertelsen A.H., Muir A.J., Sulkowski M., McHutchison J.G., Goldstein D.B. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance. Nature, 2009, vol. 461, no. 7262, pp. 399–401. doi: 10.1038/nature08309GTEx Consortium. GTExPortal – the genotype-tissue expression project data portal. GTExPortal, 2025. URL: https://www.gtexportal.org/homeGWAS Catalog — The NHGRI-EBI Catalog of human genome-wide association studies. URL: https://www.ebi.ac.uk/gwas/efotraits/EFO_0003047 GWAS CatalogHardy L.C., Smeekens J.M., Raghuwanshi D., Sarkar S., Daskhan G.C., Rogers S., Nycholat C., Maleki S., Burks A.W., Paulson J.C., Macauley M.S., Kulis M.D. Targeting CD22 on memory B cells to induce tolerance to peanut allergens. J. Allergy. Clin. Immunol., 2022, vol. 150, no. 6, pp. 1476–1485. doi: 10.1016/j.jaci.2022.06.022Helmink B.A., Bredemeyer A.L., Lee B.S., Huang C.Y., Sharma G.G., Walker L.M., Bednarski J.J., Lee W.L., Pandita T.K., Bassing C.H., Sleckman B.P. MRN complex function in the repair of chromosomal RAG-mediated DNA double-strand breaks. J. Exp. Med., 2009, vol. 206, no. 3, pp. 669–679. doi: 10.1084/jem.20081326Hesselink L., Spijkerman R., van Wessem K.J.P., Koenderman L., Leenen L.P.H., Huber-Lang M., Hietbrink F. Neutrophil heterogeneity and its role in infectious complications after severe trauma. World J. Emerg. Surg., 2019, vol. 14: 24. doi: 10.1186/s13017-019-0244-3Hinrichsen I., Kemp M., Peveling-Oberhag J., Passmann S., Plotz G., Zeuzem S., Brieger A. Promoter methylation of MLH1, PMS2, MSH2 and p16 is a phenomenon of advanced-stage HCCs. PLoS One, 2014, vol. 9, no. 1: e84453. doi: 10.1371/journal.pone.0084453Lahdesmaki A., Taylor A.M., Chrzanowska K.H., Pan-Hammarström Q. Delineation of the role of the MRE11 complex in class-switch recombination. J. Biol. Chem., 2004, vol. 279, no. 17, pp. 16479–16487. doi: 10.1074/jbc.M312796200Li F., Qu H., Li Y., Liu J., Fu H. Establishment and assessment of a mortality-risk prediction model in patients with sepsis based on early-stage peripheral lymphocyte subsets. Aging (Albany N. Y.), 2024, vol. 16, no. 8, pp. 7460–7473. doi: 10.18632/aging.205772Liu B., Wang K., Wu J., Hu Y., Yang X., Xu L., Sun W., Jia X., Wu J., Fu S., Qiao Y., Zhang X. Association of APEX1 and XRCC1 gene polymorphisms with HIV-1 infection susceptibility and AIDS progression in a northern Chinese MSM population. Front. Genet., 2022, vol. 13: 861355. doi: 10.3389/fgene.2022.861355Liu C., Qiao Y., Xu L., Wu J., Mei Q., Zhang X., Wang K., Li Q., Jia X., Sun H., Wu J., Sun W., Fu S. Association between polymorphisms in MRE11 and HIV-1 susceptibility and AIDS progression in a northern Chinese MSM population. J. Antimicrob. Chemother., 2019, vol. 74, no. 7, pp. 2009–2018. doi: 10.1093/jac/dkz132Liu Y., Dong J., Zhang Z., Liu Y., Wang Y. Regulatory T cells: a suppressor arm in post-stroke immune homeostasis. Neurobiol. Dis., 2023, vol. 189: 106350. doi: 10.1016/j.nbd.2023.106350Mirman Z., de Lange T. 53BP1: a DSB escort. Genes Dev., 2020, vol. 34, no. 1–2, pp. 7–23. doi: 10.1101/gad.333237.119Mizutani T., Kato N., Ikeda M., Sugiyama K., Shimotohno K. Long-term human T-cell culture system supporting hepatitis C virus replication. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1996, vol. 227, no. 3, pp. 822–826. doi: 10.1006/bbrc.1996.1591Ohta K., Ito M., Chida T., Nakashima K., Sakai S., Kanegae Y., Kawasaki H., Aoshima T., Takabayashi S., Takahashi H., Kawata K., Shoji I., Sawasaki T., Suda T., Suzuki T. Role of hepcidin upregulation and proteolytic cleavage of ferroportin 1 in hepatitis C virus-induced iron accumulation. PLoS Pathog., 2023, vol. 19, no. 8: e1011591. doi: 10.1371/journal.ppat.1011591Pan-Hammarström Q., Dai S., Zhao Y., van Dijk-Härd I.F., Gatti R.A., Børresen-Dale A.L., Hammarström L. ATM is not required in somatic hypermutation of VH, but is involved in the introduction of mutations in the switch μ region. J. Immunol., 2003, vol. 170, no. 7, pp. 3707–3716. doi: 10.4049/jimmunol.170.7.3707Peron S., Metin A., Gardes P., Alyanakian M.A., Sheridan E., Kratz C.P., Fischer A., Durandy A. Human PMS2 deficiency is associated with impaired immunoglobulin class-switch recombination. J. Exp. Med., 2008, vol. 205, no. 11, pp. 2465–2472. doi: 10.1084/jem.20080789Reina-San-Martin B., Chen J., Nussenzweig A., Nussenzweig M.C. Enhanced intra-switch region recombination during immunoglobulin class-switch recombination in 53BP1–/– B cells. Eur. J. Immunol., 2007, vol. 37, no. 1, pp. 235–239. doi: 10.1002/eji.200636789Rybicka M., Woziwodzka A., Sznarkowska A., Romanowski T., Stalke P., Dręczewski M., Verrier E.R., Baumert T.F., Bielawski K.P. Liver cirrhosis in chronic hepatitis B patients is associated with genetic variations in DNA-repair pathway genes. Cancers (Basel), 2020, vol. 12, no. 11: 3295. doi: 10.3390/cancers12113295Saidi A., Li T., Weih F., Concannon P., Wang Z.Q. Dual functions of Nbs1 in the repair of DNA breaks and proliferation ensure proper V(D)J recombination and T-cell development. Mol. Cell. Biol., 2010, vol. 30, no. 22, pp. 5572–5581. doi: 10.1128/MCB.00917-10Sarhan M.A., Pham T.N., Chen A.Y., Michalak T.I. Hepatitis C virus infection of human T lymphocytes is mediated by CD5. J. Virol., 2012, vol. 86, no. 7, pp. 3723–3735. doi: 10.1128/JVI.06956-11Schrader C.E., Edelmann W., Kucherlapati R., Stavnezer J. Reduced isotype switching in splenic B cells from mice deficient in mismatch-repair enzymes. J. Exp. Med., 1999, vol. 190, no. 3, pp. 323–330. doi: 10.1084/jem.190.3.323Sharkawy R.E., Bayoumi A., Metwally M., Mangia A., Berg T., Romero-Gomez M., Abate M.L., Irving W.L., Sheridan D., Dore G.J., Spengler U., Lampertico P., Bugianesi E., Weltman M., Mollison L., Cheng W., Riordan S., Santoro R., Gallego-Durán R., Fischer J., Nattermann J., D’Ambrosio R., McLeod D., Powell E., Latchoumanin O., Thabet K., Najim M.A.M., Douglas M.W., Liddle C., Qiao L., George J., Eslam M. A variant in the MICA gene is associated with liver fibrosis progression in chronic hepatitis C through TGF-β1-dependent mechanisms. Sci. Rep., 2019, vol. 9, no. 1: 1439. doi: 10.1038/s41598-018-35736-2Sun Y., Lu Y., Li T., Xie L., Deng Y., Li S., Qin X. Interferon γ +874T/A polymorphism increases the risk of hepatitis virus-related diseases: evidence from a meta-analysis. PLoS One, 2015, vol. 10, no. 5: e0121168. doi: 10.1371/journal.pone.0121168Świątek-Kościelna B., Kałużna E., Strauss E., Nowak J., Bereszyńska I., Gowin E., Wysocki J., Rembowska J., Barcińska D., Mozer-Lisewska I., Januszkiewicz-Lewandowska D. Prevalence of IFNL3 rs4803217 single-nucleotide polymorphism and clinical course of chronic hepatitis C. World J. Gastroenterol., 2017, vol. 23, no. 21, pp. 3815–3824. doi: 10.3748/wjg.v23.i21.3815Thanapirom K., Suksawatamnuay S., Sukeepaisarnjaroen W., Tangkijvanich P., Treeprasertsuk S., Thaimai P., Wasitthankasem R., Poovorawan Y., Komolmit P. Association between CXCL10 and DPP4 gene polymorphisms and a complementary role for unfavorable IL28B genotype in prediction of treatment response in Thai patients with chronic hepatitis C virus infection. PLoS One, 2015, vol. 10, no. 9: e0137365. doi: 10.1371/journal.pone.0137365Thanapirom K., Suksawatamnuay S., Sukeepaisarnjaroen W., Tangkijvanich P., Treeprasertsuk S., Thaimai P., Wasitthankasem R., Poovorawan Y., Komolmit P. Vitamin D-related gene polymorphism predicts treatment response to pegylated interferon-based therapy in Thai chronic hepatitis C patients. BMC Gastroenterol., 2017, vol. 17: 54. doi: 10.1186/s12876-017-0613-xTon Tran H.T., Li C., Chakraberty R., Cairo C.W. NEU1 and NEU3 enzymes alter CD22 organization on B cells. Biophys. Rep. (N. Y.), 2022, vol. 2, no. 3: 100064. doi: 10.1016/j.bpr.2022.100064Wang J., Sadeghi C.A., Le L.V., Le Bouteiller M., Frock R.L. ATM and 53BP1 regulate alternative end joining-mediated V(D)J recombination. Sci. Adv., 2024, vol. 10, no. 31: e4682. doi: 10.1126/sciadv.adn4682WEB-based GEne SeT AnaLysis Toolkit. URL: https://www.webgestalt.orgYang Y., Tu Z.K., Liu X.K., Zhang P. Mononuclear phagocyte system in hepatitis C virus infection. World J. Gastroenterol., 2018, vol. 24, no. 44, pp. 4962–4973. doi: 10.3748/wjg.v24.i44.4962Yee L.J., Im K., Borg B., Yang H., Liang T.J. Interleukin-6 haplotypes and the response to therapy of chronic hepatitis C virus infection. Genes Immun., 2009, vol. 10, no. 4, pp. 365–372. doi: 10.1038/gene.2009.26Yun M.H., Hiom K. Understanding the functions of BRCA1 in the DNA-damage response. Biochem. Soc. Trans., 2009, vol. 37, no. 4, pp. 597–604. doi: 10.1042/BST0370597Zhao J., Dang X., Zhang P., Nguyen L.N., Cao D., Wang L., Wu X., Morrison Z.D., Zhang Y., Jia Z., Xie Q., Wang L., Ning S., El Gazzar M., Moorman J.P., Yao Z.Q. Insufficiency of DNA-repair enzyme ATM promotes naive CD4 T-cell loss in chronic hepatitis C virus infection. Cell Discov., 2018, vol. 4: 16. doi: 10.1038/s41421-018-0015-4