<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="brief-report" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">17873</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-CFO-17873</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT COMMUNICATIONS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Short Communication</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Comparative features of the biological diversity of the gut microbiota in people, receiving nutrition in standardized conditions of isolated community</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Сравнительные характеристики биологического разнообразия микробиоты кишечника у людей, получающих питание в стандартных условиях изоляционного сообщества</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-8864-4956</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">6991-8918</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Alekseev</surname><given-names>Dmitriy V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Алексеев</surname><given-names>Дмитрий Владимирович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Specialist of Laboratory of Cultural and Proteomic Research in Microbiology, Research and Educational Professional Center for Genetic and Laboratory Technologies</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>специалист лаборатории культуромных и протеомных исследований в микробиологии Научно-образовательного профессионального центра генетических и лабораторных технологий</p></bio><email>d.v.alekseev@samsmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-4044-9139</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">1541-8495</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Ermolaev</surname><given-names>A. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Ермолаев</surname><given-names>А. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Assistant Professor, Department of General Hygiene</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>ассистент кафедры общей гигиены</p></bio><email>a.v.ermolaev@samsmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-5905-1895</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">6607-8990</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Lyamin</surname><given-names>A. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Лямин</surname><given-names>А. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Medicine), Associate Professor, Director of Research and Educational Professional Center for Genetic and Laboratory Technologies</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>доктор медицинских наук, доцент, директор Научно-образовательного профессионального центра генетических и лабораторных технологий</p></bio><email>a.v.lyamin@samsmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-8044-9806</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">1276-2740</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Gorbachev</surname><given-names>D. O.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Горбачев</surname><given-names>Д. О.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Medicine), Associate Professor, Head of the Department of General Hygiene</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>доктор медицинских наук, доцент, зав. кафедрой общей гигиены</p></bio><email>d.o.gorbachev@samsmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Samara State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Самарский государственный медицинский университет Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2025-06-20" publication-format="electronic"><day>20</day><month>06</month><year>2025</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2025-12-08" publication-format="electronic"><day>08</day><month>12</month><year>2025</year></pub-date><volume>15</volume><issue>5</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>988</fpage><lpage>992</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-03-02"><day>02</day><month>03</month><year>2025</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2025-06-08"><day>08</day><month>06</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2025, Alekseev D.V., Ermolaev A.V., Lyamin A.V., Gorbachev D.O.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2025, Алексеев Д.В., Ермолаев А.В., Лямин А.В., Горбачев Д.О.</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Alekseev D.V., Ermolaev A.V., Lyamin A.V., Gorbachev D.O.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Алексеев Д.В., Ермолаев А.В., Лямин А.В., Горбачев Д.О.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/17873">https://iimmun.ru/iimm/article/view/17873</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>The issue of the human gut microbiota influence on various chronic diseases has been raised in the scientific literature for quite a long time. In this regard, the study of various means to correct the microbiota via dietary changes has becoming increasingly relevant. However, microbiological diversity can also be affected by many external factors, such as acute infections, immune system disorders, antibiotics intake or chronic stress. Considering these facts, a promising approach is to examine functional nutrition in an organized isolated community. The study included 120 males aged 18 to 22 years, who formed an organized strictly isolated community. The study was conducted in two stages: before the community formation and 9 months afterwards. Actual nutrition of the study participants was assessed using the 24-hour diet reproduction method, during which the nutrition models were emphasized at two stages. The microbiological study consisted in seeding feces samples on an expanded list of solid growth media under anaerobic conditions. To analyze intestinal microbiota diversity, a coefficient of constancy (C) was used, according to which the taxa of microorganisms were included in constant, additional or transient groups of colon luminal microbiota. During the study, three types of tendencies were identified: an increase in the constant microbiota group due to the transition of microorganisms from the transient or additional group; an increase in the additional microbiota group due to the transition of microorganisms from the constant or transient group; absence of changes regardless of the study stage. The first group included taxa such as <italic>Enterococcus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Klebsiella</italic><italic> </italic>spp., <italic>Lactobacillus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Staphylococcus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Streptococcus</italic><italic> </italic>spp., the second group included <italic>Bifidobacterium</italic><italic> </italic>spp., <italic>Citrobacter</italic><italic> </italic>spp., <italic>Aspergillus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Bacillus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Clostridium</italic><italic> </italic>spp., <italic>Lactococcus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Micrococcus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Pseudomonas</italic><italic> </italic>spp. Representatives of the third group (transient microbiota) became the most prevalent microbial community in our study. <italic>Bacteroides</italic><italic> </italic>spp. and <italic>Enterobacter</italic><italic> </italic>spp. had boundary values of the coefficient of constancy between the transient and additional microbiota. Therefore, our study demonstrated specific changes in intestinal microbiota diversity among subjects who formed an organized isolated community.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>В научной литературе уже довольно продолжительное время поднимается вопрос влияния кишечной микробиоты человека на различные хронические заболевания. В связи с этим становится все более актуальной и такая тема, как различные способы коррекции микробиоты с помощью изменений в рационе питания. Однако на микробиологическое разнообразие может оказывать влияние и множество сторонних факторов, таких как острые инфекции, нарушения в работе иммунной системы, прием антибиотиков или хронический стресс. Учитывая данные факты, перспективным видом исследования является изучение функционального питания в организованном коллективе закрытого типа. В исследование были включены 120 человек мужского пола в возрасте от 18 до 22 лет, которые сформировали организованный строго изолированный коллектив закрытого типа. Исследование было проведено в два этапа: до формирования коллектива и через 9 месяцев после его формирования. Была проведена оценка фактического питания участников исследования с помощью метода 24-часового воспроизведения рациона, в ходе чего установили модели питания участников исследования на двух этапах. Микробиологическое исследование заключалось в посеве образцов кала участников исследования на расширенный перечень плотных питательных сред в анаэробных условиях. Для анализа разнообразия кишечной микробиоты применяли коэффициент постоянства (C), при установлении которого таксоны микроорганизмов относили к постоянной, добавочной или случайной группам просветной микробиоты толстой кишки. В ходе исследования было выявлено три типа закономерностей: увеличение представителей группы постоянной микробиоты кишечника за счет перехода микроорганизмов из транзиторной или добавочной группы; увеличение представителей группы добавочной микробиоты кишечника за счет перехода микроорганизмов из постоянной или транзиторной группы; отсутствие изменений независимо от этапа исследования. К первой группе были отнесены такие таксоны как <italic>Enterococ</italic><italic>с</italic><italic>us</italic> spp., <italic>Klebsiella</italic><italic> </italic>spp., <italic>Lactobacillus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Staphylococcus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Streptococcus</italic><italic> </italic>spp., ко второй группе — <italic>Bifidobacterium</italic><italic> </italic>spp., <italic>Citrobacter</italic><italic> </italic>spp., <italic>Aspergillus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Bacillus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Clostridium</italic><italic> </italic>spp., <italic>Lactococcus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Micrococcus</italic><italic> </italic>spp., <italic>Pseudomonas</italic><italic> </italic>spp. Представители третьей группы (транзиторной микробиоты) стали самым обширным микробным сообществом в нашем исследовании, при этом <italic>Bacteroides</italic><italic> </italic>spp. и <italic>Enterobacter</italic><italic> </italic>spp. имели пограничные значения коэффициента постоянства между транзиторной и добавочной микробиотой. Таким образом, в нашем исследовании были продемонстрированы определенные изменения в разнообразии состава кишечной микробиоты у группы людей, сформировавших организованный коллектив закрытого типа.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>gut microbiota</kwd><kwd>nutritive status</kwd><kwd>biological diversity</kwd><kwd>organized isolated community</kwd><kwd>nutrition</kwd><kwd>microbiome</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>кишечная микробиота</kwd><kwd>пищевой статус</kwd><kwd>биологическое разнообразие</kwd><kwd>организованный закрытый коллектив</kwd><kwd>питание</kwd><kwd>микробиом</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Ермолаев А.В., Лямин А.В., Горбачев Д.О., Курганов О.А. Современные данные о видовом разнообразии микробиоты кишечника у взрослых в организованном коллективе закрытого типа // Военно-медицинский журнал. 2023. Т. 344, № 11. С. 46–51. [Ermolaev A.V., Lyamin A.V., Gorbachev D.O., Kurganov O.A. Modern data on the species diversity of the intestinal microbiota in adults in an organized group of a closed type. Voenno-meditsinskii zhurnal = Military Medical Journal, 2023, vol. 344, no. 11, pp. 46–51. (In Russ.)] doi: 10.52424/00269050_2023_344_11_46</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Правосудова Н.А., Марфина О.В., Мельников В.Л. Влияние диет на состав микрофлоры кишечника и на иммунные процессы в организме человека // Вестник Пермского университета. Серия: Биология. 2024. № 2. С. 190–204. [Pravosudova N.A., Marfina O.V., Melnikov V.L. The effect of diets on the composition of the intestinal microflora and on immune processes in the human body. Vestnik Permskogo universiteta. Seriya: Biologiya = Perm University Biological Science Bulletin, 2024, no. 2, pp. 190–204. (In Russ.)] doi: 10.17072/1994-9952-2024-2-190-204</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Brostow D.P., Stamper C.E., Stanislawski M.A., Stearns-Yoder K.A., Schneider A., Postolache T.T., Brenner L.A., Forster J.E., Lowry C.A. Dietary habits and the gut microbiota in military Veterans: results from the United States-Veteran Microbiome Project (US-VMP). Gut Microbiome, 2021, vol. 2: e1. doi: 10.1017/gmb.2021.1</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Javelle E., Mayet A., Million M., Levasseur A., Allodji R.S., Marimoutou C., Delvecchio F., Delorme J., Gautret P., Raoult D., Parola P. Gut Microbiota in Military International Travelers with Doxycycline Malaria Prophylaxis: Towards the Risk of a Simpson Paradox in the Human Microbiome Field. Pathogens, 2021, vol. 10, no. 8, pp. 1063–1063. doi: 10.3390/pathogens10081063</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Karl J.P., Armstrong N.J., McClung H.L., Player R.A., Rood J.C., Racicot K., Young A.J., Pantoja-Feliciano I.G., Tuckow A.P., Steelman R.A., Hatch A.M., Gaffney-Stomberg E., Cooper K.A., Farina E.K., Martini S., Montain S.J., Pasiakos S.M., Young M.E., Lieberman H.R., McClung J.P. A diet of U.S. military food rations alters gut microbiota composition and does not increase intestinal permeability. J. Nutr. Biochem., 2019, vol. 72: 108217. doi: 10.1016/j.jnutbio.2019.108217</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Karl J.P., Armstrong N.J., Player R.A., Rood J.C., Soares J.W., McClung H.L., Pantoja-Feliciano I.G., Tuckow A.P., Steelman R.A., Hatch A.M., Gaffney-Stomberg E., Cooper K.A., Farina E.K., Martini S., Montain S.J., Pasiakos S.M., Young M.E., Lieberman H.R., McClung J.P. The Fecal Metabolome Links Diet Composition, Food Processing, and the Gut Microbiota to Gastrointestinal Health in a Randomized Trial of Adults Consuming a Processed Diet. J. Nutr., 2022, vol. 152, no. 11, pp. 2343–2357. doi: 10.1093/jn/nxac161</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Karl J.P., Margolis L.M., Madslien E.H., Murphy N.E., Castellani J.W., Gundersen Y., Hoke A.V., Levangie M.W., Kumar R., Martini S., Montain S.J., Pasiakos S.M., Young A.J., Teien H.K., Børsheim E., Young M.E., Lieberman H.R., McClung J.P. Changes in intestinal microbiota composition and metabolism coincide with increased intestinal permeability in young adults under prolonged physiological stress. Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol., 2017, vol. 312, no. 6, pp. G559–G571. doi: 10.1152/ajpgi.00066.2017</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>McClung H.L., Armstrong N.J., Hennigar S.R., Staab J.S., Montain S.J., Karl J.P. Randomized Trial Comparing Consumption of Military Rations to Usual Intake for 21 Consecutive Days: Nutrient Adequacy and Indicators of Health Status. J. Acad. Nutr. Diet., 2020, vol. 120, no. 11, pp. 1791–1804. doi: 10.1016/j.jand.2020.06.018</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Pantoja-Feliciano I.G., Soares J.W., Doherty L.A., Karl J.P., McClung H.L., Armstrong N.J., Hatch A.M., Gaffney-Stomberg E., Cooper K.A., Farina E.K., Martini S., Montain S.J., Pasiakos S.M., Young M.E., Lieberman H.R., McClung J.P. Acute stressor alters inter-species microbial competition for resistant starch-supplemented medium. Gut Microbes, 2019, vol. 10, no. 4, pp. 439–446. doi: 10.1080/19490976.2018.1554962</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Partula V., Mondot S., Torres M.J., Kesse-Guyot E., Deschasaux M., Assmann K., Latino-Martel P., Buscail C., Julia C., Galan P., Hercberg S., Cloarec D., Le Chatelier E., Leclercq S., Dumas M.E., Lantz O., Touvier M., Severi G., Druesne-Pecollo N. Associations between usual diet and gut microbiota composition: results from the Milieu Intérieur cross-sectional study. Am. J. Clin. Nutr., 2019, vol. 109, no. 5, pp. 1472–1483. doi: 10.1093/ajcn/nqz029</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Singh R.K., Chang H.W., Yan D., Lee K.M., Ucmak D., Wong K., Abrouk M., Farahnik B., Nakamura M., Zhu T.H., Bhutani T., Liao W. Influence of diet on the gut microbiome and implications for human health. J. Transl. Med., 2017, vol. 15, no. 1: 73. doi: 10.1186/s12967-017-1175-y</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
