<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="brief-report" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">17800</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-ROT-17800</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT COMMUNICATIONS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Short Communication</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Role of Toll-like receptors polymorphisms in the development of extremely severe COVID-19</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Роль полиморфизмов Toll-подобных рецепторов в развитии крайне тяжелого состояния при COVID-19</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Ashchina</surname><given-names>Lyudmila A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Ащина</surname><given-names>Людмила Андреевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of Molecular and Personalised Medicine</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной и персонализированной медицины</p></bio><email>pushino2008@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Baranova</surname><given-names>N. I.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Баранова</surname><given-names>Н. И.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Biology), Professor, Leading Researcher, Laboratory of Molecular and Personalised Medicine</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.б.н., профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории молекулярной и персонализированной медицины</p></bio><email>pushino2008@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kulieva</surname><given-names>O. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Кулиева</surname><given-names>О. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Assistant Professor, Department of Medical Microbiology and Laboratory Medicine</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>ассистент кафедры медицинской микробиологии и лабораторной медицины</p></bio><email>pushino2008@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bolgova</surname><given-names>A. I.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Болгова</surname><given-names>А. И.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD Student, Department of Infectious Diseases; Head of the Infectious Diseases Department</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>аспирант кафедры инфекционных болезней; зав. инфекционным отделением</p></bio><email>pushino2008@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Penza Institute for Further Training of Physicians – Branch of the “Russian Medical Academy of Continuing Professional Education” of the Ministry of Healthcare of the Russian Federation</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Пензенский институт усовершенствования врачей — филиал ГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава РФ</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Penza Regional Clinical Center of Specialized Types of Medical Care</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ГБУЗ Пензенский областной клинический центр специализированных видов медицинской помощи</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2024-11-18" publication-format="electronic"><day>18</day><month>11</month><year>2024</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2025-04-30" publication-format="electronic"><day>30</day><month>04</month><year>2025</year></pub-date><volume>15</volume><issue>1</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>185</fpage><lpage>189</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2024-11-06"><day>06</day><month>11</month><year>2024</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2024-11-15"><day>15</day><month>11</month><year>2024</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2025, Ashchina L.A., Baranova N.I., Kulieva O.A., Bolgova A.I.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2025, Ащина Л.А., Баранова Н.И., Кулиева О.А., Болгова А.И.</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Ashchina L.A., Baranova N.I., Kulieva O.A., Bolgova A.I.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Ащина Л.А., Баранова Н.И., Кулиева О.А., Болгова А.И.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/17800">https://iimmun.ru/iimm/article/view/17800</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>COVID-19 is a respiratory disease caused by the SARS-CoV-2 virus that can proceed to acute respiratory distress syndrome (ARDS) and trigger immunopathological mechanisms that lead to excessive inflammation. Toll-like receptors, as pattern recognition receptors, play an indispensable role in virus identification and activate the innate immune system, which can lead to the secretion of proinflammatory cytokines such as IL-1, IL-6, TNFα, and type I IFN. Antiviral toll-like receptors, including TLR3, TLR7, and TLR9, can activate the TRIF-dependent pathway, induce the production of proinflammatory cytokines, chemokines, and type I and type III interferons, participate in recognition of dsRNA and detection of unmethylated CpG DNA. In addition, an important role of TLR2 in COVID-19, which recognizes peptide glycans on the surface of gram-positive bacteria, and TLR4, which recognizes gram-negative bacteria lipopolysaccharide and plays a role in hyperinflammation in COVID-19, has been shown. It was confirmed that TLRs can be involved both in the initial failure of virus clearance and in the subsequent development of severe COVID-19 clinical manifestations mainly acute respiratory distress syndrome (ARDS) with fatal respiratory failure. The aim of this work was to study the polymorphisms of TLR3 (rs3775291), TLR9 (rs352140), TLR7 (rs3853839), TLR4 (rs4986790), TLR4 (rs4986791), TLR2 (rs574708) in patients with COVID-19 depending on disease outcome. The study included 187 patients, of whom 157 recovered and 30 deceased. Genetic analysis for polymorphisms of the TLR3 (rs3775291), TLR9 (rs352140), TLR7 (rs3853839), TLR4 (rs4986790), TLR4 (rs4986791), TLR2 (rs574708) genes was performed by real-time PCR. Statistical processing of the obtained results was performed using Statistica 12.0 (USA) software. The inter-group difference was considered statistically significant at p &lt; 0.05. The strength of associations was estimated and presented as odds ratio (OR) and 95% confidence interval. It was noted that the genotypes GC TLR7 (rs3853839), AG TLR2 (rs574708), GG TLR4 (rs4986790), TT TLR4 (rs4986791) can be predictors of a fatal COVID-19 outcome. On the contrary, the genotypes GG TLR7 (rs3853839), AA TLR2 (rs574708), AA TLR4 (rs4986790), CC TLR4 (rs4986791) can be protective and contribute to the recovery of patients.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>COVID-19 — это респираторное заболевание, вызванное вирусом SARS-CoV-2, которое может прогрессировать до острого респираторного дистресс-синдрома (ОРДС) и запускать иммунопатологические механизмы, приводящие к чрезмерному воспалению. Toll-подобные рецепторы, как рецепторы распознавания образов, выполняют незаменимую функцию при идентификации вируса и активируют врожденную иммунную систему, что может приводить к секреции провоспалительных цитокинов, таких IL-1, IL-6, TNFα и IFNγ. Противовирусные Toll-подобные рецепторы, включающие TLR3, TLR7 и TLR9 способны активировать TRIF-зависимый путь, индуцировать продукцию провоспалительных цитокинов, хемокинов и интерферонов типа I и типа III, участвовать в распознавании dsRNA, а также участвовать в обнаружении неметилированной CpG-ДНК. Кроме того, показана немаловажная роль TLR2 при COVID-19, который распознает пептидогликаны поверхности грамположительных бактерий и TLR4, который распознает липополисахарид грамотрицательных бактерий и играет роль в гипервоспалении у пациентов с COVID-19. Доказано, что TLR могут быть вовлечены как в первоначальный срыв клиренса вируса, так и в последующее развитии тяжелых клинических проявлений COVID-19, в основном острого респираторного дистресс-синдрома (ОРДС) с фатальной дыхательной недостаточностью. Целью данной работы явилось изучение полиморфизмов TLR3 (rs3775291), TLR9 (rs352140), TLR7 (rs3853839), TLR4 (rs4986790), TLR4 (rs4986791), TLR2 (rs574708) у пациентов с COVID-19 в зависимости от исхода заболевания. В исследование вошли 187 пациентов, из которых выздоровевшие составили 157 человек, со смертельным исходом — 30. Генетический анализ на полиморфизмы генов TLR3 (rs3775291), TLR9 (rs352140), TLR7 (rs3853839), TLR4 (rs4986790), TLR4 (rs4986791), TLR2 (rs574708) был проведен методом ПЦР с детекцией результатов в режиме «реального времени». Статистическую обработку полученных результатов проводили при помощи программ Statistica 12.0 (США). Различие групп считали статистически значимым при р &lt; 0,05. Силу ассоциаций оценивали в значениях показателя отношения шансов оdds ratio (OR) и 95% доверительному интервалу. Отмечено, что генотипы GС TLR7 (rs3853839), АG TLR2 (rs574708), GG TLR4 (rs4986790), ТТ TLR4 (rs4986791) могут является предикторами летального исхода COVID-19. Напротив, генотипы GG TLR7 (rs3853839), АА TLR2 (rs574708), АА TLR4 (rs4986790), СС TLR4 (rs4986791) могут является протективными и способствовать выздоровлению пациентов.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>COVID-19</kwd><kwd>convalescence</kwd><kwd>mortality</kwd><kwd>PCR</kwd><kwd>polymorphisms</kwd><kwd>Toll-like receptors</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>COVID-19</kwd><kwd>выздоровление</kwd><kwd>смертельный исход</kwd><kwd>ПЦР</kwd><kwd>полиморфизмы</kwd><kwd>Toll-подобные рецепторы</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Белоглазов В.А., Яцков И.А., Камший А.А., Агзамова Ю.М. Роль полиморфизма генов Toll-like рецепторов в патогенезе новой коронавирусной инфекции // Медицинская иммунология. 2023. Т. 25, № 6. С. 1299–1306. [Beloglazov V.A., Yatskov I.A., Kamshiy A.A., Agzamova U.M. Role of polymorphism of Toll-like receptor genes in the pathogenesis of a new coronavirus infection. Meditsinskaya immunologiya = Medical Immunology (Russia), 2023, vol. 25, no. 6, pp. 1299–1306. (In Russ.)] doi: 10.15789/1563-0625-ROT-2607</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Бурместер Г.Р., Пецутто А. Наглядная иммунология. М.: Лаборатория знаний, 2022. 320 с. [Burmester G.R., Petsutto A. Visual immunology. Moscow: Laboratoriya znaniy, 2022. 320 p. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Йокота Ш., Куройва Е., Нишиока К. Новая коронавирусная болезнь (COVID-19) и «цитокиновый шторм». Перспективы эффективного лечения с точки зрения патофизиологии воспалительного процесса // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2020. Т. 9, № 4. С. 13–25. [Yokota S.H., Kuroiwa E., Nishioka K. New coronavirus disease (COVID-19) and the «cytokine storm». Prospects for effective treatment from the perspective of inflammatory pathophysiology. Infektsionnye bolezni: novosti, mneniya, obuchenie = Infectious Diseases: News, Opinions, Training, 2020, vol. 9, no. 4, рp. 13–25. (In Russ.)] doi: 10.33029/2305-3496-2020-9-4-13-25</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Синякин И.А., Андриевская И.А., Ишутина Н.А., Баталова Т.А., Григорьев Н.Р. Роль Toll-подобных рецепторов в патогенезе COVID-19 // Бюллетень физиологии и патологии дыхания. 2021. T. 82. С. 107–115 [Sinyakin I.A., Andrievskaya I.A., Ishutina N.A., Batalova T.A., Grigoriev N.R. Role of Toll-like receptors in COVID-19 pathogenesis. Byulleten’ fiziologii i patologii dykhaniya = Bulletin Physiology and Pathology of Respiration, 2021, vol. 82, pp. 107–115. (In Russ.)] doi: 10.36604/1998-5029-2021-82-107-115</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Alhabibi A., Hassan A., 1 Mohamed Abd Elbaky N., Asaad Eid H., Aldeen Abd Alzaher Khalifa M., Wahab M., Ali Althoqapy A., E Abdou A., Zakaria D., Mostafa Nassef E., Kasim S., Saleh O., Elsheikh A., Lotfy M., Sayed A. Impact of Toll-like receptor 2 and 9 gene polymorphisms on COVID-19: susceptibility, severity, and thrombosis. J. Inflamm. Res., 2023, vol. 16, pp. 665–675. doi: 10.2147/JIR.S394927</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Bakaros E., Voulgaridi I., Paliatsa V., Gatselis N., Germanidis G., Asvestopoulou E., Alexiou S., Botsfari E., Lygoura V., Tsachouridou O., Mimtsoudis I., Tseroni M., Sarrou S., Mouchtouri V., Dadouli K., Kalala F., Metallidis S., Dalekos G., Christos Hadjichristodoulou C., Speletas M. Innate immune gene polymorphisms and COVID-19 prognosis. Viruses, 2023, vol. 15, no. 9, pp. 1784. doi: 10.3390/v15091784</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Bortolotti D., Gentili V., Rizzo S., Schiuma G., Beltrami S., Strazzabosco G., Fernandez M., Caccuri F., Caruso A., Rizzo R. TLR3 and TLR7 RNA sensor activation during SARS-CoV-2 infection. Microorganisms, 2021, vol. 9, no. 9: 1820. doi: 10.3390/microorganisms9091820</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Choudhury A., Mukherjee S. In silico studies on the comparative characterization of the interactions of SARS-CoV-2 spike glycoprotein with ACE-2 receptor homologs and human TLRs. J. Med. Virol., 2020, vol. 92, pp. 2105–2113. doi: 10.1002/jmv.25987</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Crane M.J., Lee K.M., FitzGerald E.S., Jamieson A.M. Surviving deadly lung infections: innate host tolerance mechanisms in the pulmonary system. Front. Immunol., 2018, vol. 9: 1421. doi: 10.3389/fimmu.2018.01421</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Flores-Gonzalez J., Chavez-Galan L., Falfán-Valencia R., Roldán I., Fricke-Galindo I., Veronica-Aguilar A., Martínez-Morales A., Hernández-Zenteno R., Guzmán-Guzmán I., Pérez-Rubio G. Variant rs4986790 of toll-like receptor 4 affects the signaling and induces cell dysfunction in patients with severe COVID-19. Int. J. Infect. Dis., 2024, vol. 138, pp. 102–109. doi: 10.1016/j.ijid.2023.11.032</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Pirofski L.-A., Casadevall A. Pathogenesis of COVID-19 from the perspective of the damage-response framework. mBio, 2020, vol. 11, no. 4, pp. 1–12. doi: 10.1128/mBio.01175-20</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>El-Hefnawy S., Eid H., Mostafa R., Soliman S., Omar T., Azmy R. COVID-19 susceptibility, severity, clinical outcome and Toll-like receptor (7) mRNA expression driven by TLR7 gene polymorphism (rs3853839) in middle-aged individuals without previous comorbidities. Gene Rep., 2022, vol. 27, no. 8, pp. 101612. doi: 10.1016/j.genrep.2022.101612</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Ziakas P.D., Prodromou M.L., El Khoury J., Zintzaras E., Mylonakis E. The role of TLR4 896 AG and 1196 CT in susceptibility to infections: a review and meta-analysis of genetic association studies. PLoS One, 2013, vol. 8, no. 11, pp. 10–13. doi: 10.1371/journal.pone.0081047</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
