<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">17758</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-ROI-17758</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Regulation of immune response by permafrost microorganism metabolites via effector T-lymphocytes</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Регуляция иммунного ответа метаболитами микроорганизмов многолетнемерзлых пород через эффекторные Т-лимфоциты</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Petrov</surname><given-names>Sergei A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Петров</surname><given-names>Сергей Анатольевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Medicine), Professor, Head Researcher, Department of Cryosphere Bioresources</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., профессор, главный научный сотрудник отдела биоресурсов криосферы</p></bio><email>tumiki@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sukhovey</surname><given-names>Yuri G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Суховей</surname><given-names>Юрий Геннадиевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Medicine), Professor, Head Researcher, Department of Cryosphere Bioresources</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.м.н., профессор, главный научный сотрудник отдела биоресурсов криосферы</p></bio><email>i_yura62@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kalenova</surname><given-names>Lyudmila F.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Каленова</surname><given-names>Людмила Федоровна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Medicine), Head Researcher, Department of Cryosphere Bioresources</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.б.н., главный научный сотрудник отдела биоресурсов криосферы</p></bio><email>lkalenova@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kostolomova</surname><given-names>Elena G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Костоломова</surname><given-names>Елена Геннадиевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Associate Professor, Department of Microbiology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., доцент кафедры микробиологии</p></bio><email>lenakost@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kastornov</surname><given-names>Alexander A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Касторнов</surname><given-names>Александр Александрович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Junior Researcher, Department of Cryosphere Bioresources</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>младший научный сотрудник отдела биоресурсов криосферы</p></bio><email>alexkastornov@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Tyumen Scientific Centre SB RAS</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБУН ФИЦ Тюменский научный центр СО РАН</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Tyumen State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБОУ ВО Тюменский государственный медицинский университет Минздрава России</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2025-01-20" publication-format="electronic"><day>20</day><month>01</month><year>2025</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2025-09-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>09</month><year>2025</year></pub-date><volume>15</volume><issue>3</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>543</fpage><lpage>550</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2024-08-14"><day>14</day><month>08</month><year>2024</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2024-11-29"><day>29</day><month>11</month><year>2024</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2025, Petrov S.A., Sukhovey Y.G., Kalenova L.F., Kostolomova E.G., Kastornov A.A.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2025, Петров С.А., Суховей Ю.Г., Каленова Л.Ф., Костоломова Е.Г., Касторнов А.А.</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Petrov S.A., Sukhovey Y.G., Kalenova L.F., Kostolomova E.G., Kastornov A.A.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Петров С.А., Суховей Ю.Г., Каленова Л.Ф., Костоломова Е.Г., Касторнов А.А.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/17758">https://iimmun.ru/iimm/article/view/17758</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Infectious agents have closely interacted with the human immune system, acquiring a set of highly sophisticated mechanisms for modulating immunity. One of the survival strategies for viruses, bacteria, protozoa, helminths and fungi is to target the regulatory T cell network (Treg: CD4+CD25hiCD127–) that controls immunopathogenic responses in many infections. Not only pathogens but also commensals are able to directly induce the conversion of naive T cells into suppressive Foxp3-expressing Tregs, while others activate pre-existing natural Tregs, in both cases suppressing pathogen-specific effector responses. However, Tregs can also contribute to immunity under certain conditions, such as at the initial stages of infection when effector cells must gain access to the site of infection, and subsequently in ensuring the generation of effector memory cells. It is noteworthy that currently little information on whether infections selectively drive pathogen-specific Tregs, and if so, whether such cells are also reactive to autoantigens are available. Further analysis of Treg subset specificity, along with a clearer picture of relative dynamics during the disease, should lead to rational strategies of immune intervention to optimize immunity and eliminate the infectious process. Thus, restoration of Treg function is important in the treatment of infectious, autoimmune and other diseases and can serve as a marker of their successful treatment. The article assesses the effect of exometabolites of derived from permafrost Bacillus bacteria obtained at different temperature conditions of their cultivation on the activity of Treg and effector T lymphocyte differentiation. Significant differences were established: secondary microbial exometabolites affect Treg (CD4+CD25hiCD127–) differentiation and expression of activation markers (CD69, CD25, HLA-DR) on CD4+ and CD8+ T lymphocytes. This effect is regulated by the type of metabolites obtained at different temperatures — “cold” (obtained at 5°C of bacterial incubation), “medium-temperature” (at 22°C) and “heat” (at 37°C) metabolites. In this case, an increase in the Treg level is associated with lower differentiation activity of CD4+ T-lymphocytes exposed to “cold” secondary exometabolites, a decrease in the differentiation activity of CD8+ T-lymphocytes treated with “warm” secondary exometabolites, and a roughly equivalent effect on the differentiation activity of CD4+ and CD8+ T-lymphocytes acted upon by “medium-temperature” secondary exometabolites.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Инфекционные агенты тесно взаимодействовали с иммунной системой человека, приобретая набор очень сложных механизмов для модуляции иммунитета. Одна из стратегий выживания вирусов, бактерий, простейших, гельминтов и грибов — воздействие на регуляторную сеть Т-клеток (Treg: CD4+CD25hiCD127–), которые контролируют иммунопатогенные реакции при многих инфекциях. Не только патогены, но и комменсалы способны напрямую индуцировать превращение наивных Т-клеток в супрессивные Foxp3-экспрессирующие Treg, в то время как другие активируют ранее существовавшие естественные Treg, в обоих случаях подавляя специфические для патогенов эффекторные реакции. Тем не менее Treg также могут способствовать укреплению иммунитета в определенных условиях, например на начальных стадиях инфекции, когда эффекторные клетки должны получить доступ к месту инфекции, и впоследствии при обеспечении генерации эффекторной памяти. Примечательно, что в настоящее время имеется мало информации о том, являются ли инфекции селективным приводом к патоген-специфическим Treg, и если да, то являются ли эти клетки также реактивными к аутоантигенам. Дальнейший анализ специфичности, наряду с более четкой картиной относительной динамики подмножеств Treg в течение заболевания, должен привести к рациональным стратегиям иммунного вмешательства для оптимизации иммунитета и ликвидации инфекционного процесса. Таким образом, восстановление функции Treg значимо при лечения инфекционных, аутоиммунных и других заболеваний и может служить маркером успешного лечения данных патологий. В статье проведена оценка влияния экзометаболитов бактерий рода Bacillus из многолетних мерзлых пород, полученных при разных температурных режимах их культивирования, на активность дифференцировки Тreg и эффекторных Т-лимфоцитов. Установлены значимые различия: вторичные экзометаболиты микроорганизмов оказывают влияние на дифференцировку Treg (CD4+CD25hiCD127–) и экспрессию активационных маркеров (CD69, CD25, HLA-DR) на CD4+ и CD8+ Т-лимфоцитах. Данное воздействие регулируется видом метаболитов, полученных при различных температурах — «холодовые» (полученные при 5°C инкубации бактерий), «среднетемпературные» (при 22°C) и «тепловые» (при 37°C) метаболиты. При этом повышение уровня Treg ассоциируется при влиянии «холодовых» вторичных экзометаболитов со снижением активности дифференцировки CD4+ Т-лимфоцитов, «тепловых» вторичных экзометаболитов — со снижением активности дифференцировки CD8+ Т-лимфоцитов, а «среднетемпературные» метаболиты оказывают примерно равнозначное влияние на активность дифференцировки CD4+ и CD8+ T-лимфоцитов.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>factors regulating lymphocyte differentiation</kwd><kwd>permafrost microorganisms</kwd><kwd>secondary exometabolites of Bacillus bacteria</kwd><kwd>CD4+CD25hiCD127– Treg</kwd><kwd>CD69</kwd><kwd>CD25</kwd><kwd>HLA-DR T-lymphocytes</kwd><kwd>temperature</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>факторы регуляции дифференцировки лимфоцитов</kwd><kwd>микроорганизмы многолетнемерзлых пород</kwd><kwd>вторичные экзометаболиты бактерий рода Bacillus</kwd><kwd>CD4+CD25hiCD127– Тreg</kwd><kwd>CD69</kwd><kwd>CD25</kwd><kwd>HLA-DR Т-лимфоциты</kwd><kwd>температура</kwd></kwd-group><funding-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">Министерство науки и высшего образования РФ</institution></institution-wrap><institution-wrap><institution xml:lang="en">Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation</institution></institution-wrap></funding-source><award-id>121041600041-0</award-id></award-group></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Гариб Ф.Ю., Ризопулу А.П. Использование Т-регуляторных клеток хозяина в стратегии иммунной эвазии патогенов (обзор) // Биохимия. 2015. Т. 80, вып. 8. С. 1141–1159. [Garib F.Yu., Rizopulu A.P. T-regulatory cells as part of the strategy of immune evasion by pathogens. Biokhimiya = Biochemistry (Moscow), 2015, vol. 80, iss. 8, pp. 1141–1159. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Литвинова Л.С., Гуцол А.А., Сохоневич Н.А., Кофанова К.А., Хазиахматова О.Г., Шуплецова В.В., Кайгородова Е.В., Гончаров А.Г. Основные поверхностные маркеры функциональной активности Т-лимфоцитов // Медицинская иммунология. 2014. Т. 6, № 1. С. 7–26. [Litvinova L.S., Gutsol A.A., Sokhonevich N.A., Kofanova K.A., Khaziakhmatova O.G., Shupletsova V.V., Kaigorodova E.V., Goncharov A.G. Basic surface markers of functional activity T-lymphocytes. Meditsinskaya immunologiya = Medical Immunology (Russia), 2014, vol. 6, no. 1, pp. 7–26. (In Russ.)] doi: 10.15789/1563-0625-2014-1-7-26</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Юрова К.А., Хазиахматова О.Г., Тодосенко Н.М., Литвинова Л.С. Оценка влияния γC-цитокинов (IL-2, IL-7 и IL-15) на экспрессию молекул поздней активации и апоптоза (CD95 И HLA-DR) CD4+/CD8+ Т-лимфоцитами в популяции CD45RA Т-клеток in vitro // Иммунология. 2018. Т. 39, № 1. С. 20–25. [Yurova K.A., Khaziakhmatova O.G., Todosenko N.M., Litvinova L.S. Evaluation of the effect of γccytokines (IL-2, IL-7 and IL-15) on expression of the late activation molecules and apoptosis (CD95 and HLA-DR) CD4+/CD8+ T-lymphocytes in a population of CD45RA T cells in vitro. Immunologiya = Immunologiya, 2018, vol. 39, no. 1, pp. 20–25 (In Russ.)] doi: 10.18821/0206-4952-2018-39-1-20-25</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Atarashi K., Tanoue T., Shima T., Imaoka A., Kuwahara T., Momose Y., Cheng G., Yamasaki S., Saito T., Ohba Y., Taniguchi T., Takeda K., Hori S., Ivanov I.I., Umesaki Y., Itoh K., Honda K. Induction of colonic regulatory T cells by indigenous Clostridium species. Science, 2011, vol. 331, pp. 337–341. doi: 10.1126/science.1198469</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Caramalho I., Lopes Carvalho T., Ostler D., Zelenay S., Haury M., Demengeot J. Regulatory T cells selectively express toll like receptors and are activated by lipopolysaccharide. J. Exp. Med., 2003, vol. 197, pp. 403–411. doi: 10.1084/jem.20021633</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Cibrián D., Sánchez-Madrid F. CD69: from activation marker to metabolic gatekeeper. Eur. J. Immunol., 2017, vol. 47, no. 6, pp. 946–953. doi: 10.1002/eji.201646837</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Kalenova L.F., Kolyvanova S.S. Effects of temperature on the ability of metabolites from permafrost microorganisms to activate the synthesis of systemic cytokines by mononuclear cells. Bull. Exp. Biol. Med., 2019, vol. 168, no. 1, pp. 72–75. doi: 10.1007/s10517-019-04650-6</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Kalenova L.F., Petrov S.A., Bazhin A.S. Dose-dependent effect of Bacillus sp. metabolites from permafrost on lymphocyte differentiation in the thymus. Bull. Exp. Biol. Med., 2020, vol. 169, no. 1, pp. 67–70. doi: 10.1007/s10517-020-04826-5</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Kalenova L.F., Petrov S.A., Subbotin A.M., Narushko M.V., Bazhin A.S. Influence of paleobacteria on the proliferative activity of human lymphocytes in vitro. Bull. Exp. Biol. Med., 2023, vol. 174, no. 6, pp. 758–761. doi: 10.1007/s10517-023-05787-1</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Kalenova L.F., Petrov S.A., Sukhovei Yu.G. Reparative and immunomodulatory potential of low-molecular-weight fractions of secondary metabolites of Bacillus sp. Bull. Exp. Biol. Med., 2022, vol. 172, no. 3, pp. 332–336. doi: 10.1007/s10517-022-05387-5</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Kullberg M.C., Jankovic D., Gorelick P.L., Caspar P., Letterio J.J., Cheever A.W., Sher A. Bacteria-triggered CD4(+) T regulatory cells suppress Helicobacter hepaticusinduced colitis. J. Exp. Med., 2002, vol. 196, pp. 505–515. doi: 10.1084/jem.20020556</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Maizels R.M., Smith K.A. Regulatory T cells in infection. Adv. Immunol., 2011, vol. 112, pp. 73–136. doi: 10.1016/B978-0-12-387827-4.00003-6</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Mertens J., Fabri M., Zingarelli A., Kubacki T., Meemboor S., Groneck L., Seeger J., Bessler M., Hafke H., Odenthal M., Bieler J.G., Kalka C., Schneck J.P., Kashkar H., Kalka-Moll W.M. Streptococcus pneumoniae serotype 1 capsular polysaccharide induces CD8CD28 regulatory T lymphocytes by TCR crosslinking. PLoS Pathog., 2009, vol. 5: e100059. doi: 10.1371/journal.ppat.1000596</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>O’Mahony C., Scully P., O’Mahony D., Murphy S., O’Brien F., Lyons A., Sherlock G., MacSharry J., Kiely B., Shanahan F., O’Mahony L. Commensal-induced regulatory T cells mediate protection against pathogen-stimulated NF-kB activation. PLoS Pathog., 2008, vol. 4: e1000112. doi: 10.1371/journal.ppat.1000112</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Petrov S.A., Sukhovei Yu.G, Kalenova L.F, Kostolomova E.G, Subbotin A.M, Kastornov A.A. The influence of permafrost microorganisms on monocytes differentiation in vitro. Bull. Exp. Biol. Med., 2023, vol. 175, no. 3, pp. 362–366. doi: 10.1007/s10517-023-05868-1</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Round J.L., Mazmanian S.K. Inducible Foxp3+ regulatory T-cell development by a commensal bacterium of the intestinal microbiota. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 2010, vol. 107, pp. 12204–12209. doi: 10.1073/pnas.0909122107</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Round J.L., Lee S.M., Li J., Tran G., Jabri B., Chatila T.A., Mazmanian S.K. The Toll-like receptor 2 pathway establishes colonization by a commensal of the human microbiota. Science, 2011, vol. 332, pp. 974–977. doi: 10.1126/science.1206095</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Sing A., Rost D., Tvardovskaia N., Roggenkamp A., Wiedemann A., Kirschning C.J., Aepfelbacher M., Heesemann J. Yersinia V antigen exploits toll like receptor 2 and CD14 for interleukin 10 mediated immunosuppression. J. Exp. Med., 2002, vol. 196, pp. 1017–1024. doi: 10.1084/jem.20020908</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Shipkova M., Wieland E. Surface markers of lymphocyte activation and markers of cell proliferation. Clin. Chim. Acta, 2012, vol. 413, no. 17–18, pp. 1338–1349. doi: 10.1016/j.cca.2011.11.006</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Sutmuller R.P., Morgan M.E., Netea M.G., Grauer O., Adema G.J. Toll-like receptors on regulatory T cells: expanding immune regulation. Trends Immunol., 2006, vol. 27, no. 8, pp. 387–393. doi: 10.1016/j.it.2006.06.005</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Wieland E., Shipkova M. Lymphocyte surface molecules as immune activation biomarkers. Clin. Biochem., 2016, vol. 49, no. 4–5, pp. 347–354. doi: 10.1016/j.clinbiochem.2015.07.099</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
