Background. Mycobacterium abscessus complex is one of the most abundant groups of rapidly growing non-tuberculous mycobacteria that has been increasingly more common causing infections of various localization, especially in cystic fibrosis (CF) patients. Microbiological diagnosis of such infections in case of using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-ToF) mass spectrometry is often complicated due to mycobacterial cell features, which requires to perform a diagnostic optimization. The aim of the study was to evaluate the accuracy of Mycobacterium abscessus strains identification isolated on universal chromogenic medium and selective medium for Burkholderia cepacia complex (BCC) isolation. Materials and methods. Total number of 64 strains were selected for the study cultured in parallel on universal chromogenic medium and selective medium for BCC isolation. The identification of isolated microorganisms was carried out using the MALDI-ToF mass spectrometry on Microflex LT device. Statistical data processing was carried out using the StatTech program v.2.1.0. Results. The correlation analysis between identified data and used nutrient media was carried out showing that identification of mycobacteria isolated on chromogenic medium vs. medium for BCC isolation was more accurate. Conclusion. The study revealed that the composition of the nutrient medium affects the accuracy of MABSc member identification, which can be taken into account while developing protocols for optimizing and increasing the accuracy for this group of bacteria using MALDI-ToF mass spectrometry. Despite this, in the context of such a complex pathology with high comorbidity as CF, taking into account the universality of chromogenic medium we studied and often polymicrobial nature of infections in CF, it is rational to use selective media for primary inoculation of the studied material, including the medium for BCC isolation. However, after the initial inoculation, mycobacteria can be subcultured on chromogenic medium to assess cultural properties and improve the quality of species identification.
Введение. Mycobacterium abscessus complex — одна из наиболее распространенных групп быстрорастущих нетуберкулезных микобактерий. Эта группа микроорганизмов все чаще становится причиной инфекций различной локализации, особенно у пациентов с муковисцидозом (МВ). Микробиологическая диагностика таких инфекций при использовании матрично активированной лазерной десорбции-ионизации с времяпролетной масс-спектрометрией (MALDI-ToF) часто затруднена из-за особенностей микобактериальных клеток, что вызывает необходимость оптимизации методики. Целью исследования стала оценка точности идентификации штаммов Mycobacterium abscessus, выделенных на универсальной хромогенной среде и на селективной среде для выделения Burkholderia cepacia complex (BCC). Материалы и методы. Для исследования было отобрано в общей сложности 64 штамма Mycobacterium abscessus. Все штаммы культивировали одновременно на универсальной хромогенной среде и на селективной среде для выделения BCC. Идентификацию выделенных микроорганизмов проводили с помощью MALDI-ToF масс-спектрометрии на приборе Microflex LT. Статистическую обработку полученных результатов проводили с использованием программы StatTech v.2.1.0. Результаты. Был проведен анализ корреляции между результатами идентификации и используемыми питательными средами. Анализ показал, что идентификация микобактерий, выделенных на хромогенной среде, была более точной, чем идентификация микобактерий, выделенных на среде для выделения BCC. Заключение. В ходе проведенного исследования было выявлено, что состав питательной среды влияет на точность идентификации представителей MABSc, что может учитываться при разработке протоколов оптимизации и повышения точности идентификации этой группы бактерий с помощью MALDI-ToF масс-спектрометрии. Несмотря на это, в контексте такой сложной патологии с высокой коморбидностью, как МВ, учитывая универсальность исследованной нами хромогенной среды и зачастую полимикробный характер инфекций при МВ, рационально для первичного посева исследуемого материала использовать селективные среды, в том числе среду для выделения BCC. Однако после первичного посева микобактерии можно пересевать на хромогенную среду для оценки культуральных свойств и улучшения качества видовой идентификации.