<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">17525</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-OPO-17525</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Optimized properties of live vaccine influenza reassortant strains obtained by reverse genetics</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Оптимизация свойств реассортантных штаммов живой гриппозной вакцины, полученных методом обратной генетики</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Larionova</surname><given-names>N. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Ларионова</surname><given-names>Н. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Biology), Leading Researcher, Laboratory of General Virology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории общей вирусологии</p></bio><email>nvlarionova@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kiseleva</surname><given-names>I. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Киселева</surname><given-names>И. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Biology), Professor, Head of Laboratory of General Virology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.б.н., профессор, зав. лабораторией общей вирусологии </p></bio><email>nvlarionova@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bazhenova</surname><given-names>E. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Баженова</surname><given-names>Е. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of General Virology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории общей вирусологии</p></bio><email>nvlarionova@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Stepanova</surname><given-names>E. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Степанова</surname><given-names>Е. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Leading Researcher, Laboratory of General Virology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории общей вирусологии</p></bio><email>nvlarionova@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Rudenko</surname><given-names>L. G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Руденко</surname><given-names>Л. Г.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>DSc (Biology), Professor, Head of the A.A. Smorodintsev Department of Virology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.б.н., профессор, зав. отделом вирусологии им. А.А. Смородинцева</p></bio><email>nvlarionova@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Institute of Experimental Medicine</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБНУ "Институт экспериментальной медицины"</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2023-12-12" publication-format="electronic"><day>12</day><month>12</month><year>2023</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2023-12-25" publication-format="electronic"><day>25</day><month>12</month><year>2023</year></pub-date><volume>13</volume><issue>6</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>1018</fpage><lpage>1026</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2023-11-05"><day>05</day><month>11</month><year>2023</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2023-12-05"><day>05</day><month>12</month><year>2023</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2023, Larionova N.V., Kiseleva I.V., Bazhenova E.A., Stepanova E.A., Rudenko L.G.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2023, Ларионова Н.В., Киселева И.В., Баженова Е.А., Степанова Е.А., Руденко Л.Г.</copyright-statement><copyright-year>2023</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Larionova N.V., Kiseleva I.V., Bazhenova E.A., Stepanova E.A., Rudenko L.G.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Ларионова Н.В., Киселева И.В., Баженова Е.А., Степанова Е.А., Руденко Л.Г.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/17525">https://iimmun.ru/iimm/article/view/17525</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Classical reassortment in developing chicken eggs is a well-established technique for obtaining LAIV strains. Naturally generated reassortant vaccine strains are characterized by high reproductive capacity, genetically stable characteristics of temperature sensitivity and cold resistance, which correspond to the characteristics of the MDV involved in crossing with the epidemic virus. Along with antigenic relevance, natural reassortment ensures attenuation of vaccine strains, good reproduction capacity in upper respiratory tract cells and inability to reproduction in the lower respiratory tract. With classical reassortment, the speed and efficiency of obtaining vaccine reassortants largely depend on the properties of epidemic virus, and therefore cannot be stable. The potential of reverse genetics is attractive because it allows to obtain vaccine reassortants quickly and efficiently, reduce the likelihood of spontaneous mutations; however, the vaccine strain is deprived of the advantages of natural selection, in which the most viable clones are selected. This study presents the results of comparatively assessed A(H3N2) LAIVs obtained in parallel by classical reassortment and reverse genetics according to criteria confirming that vaccine strains inherit the necessary properties that guarantee their harmlessness and high reproduction in chicken embryos. Strains for LAIV obtained by both methods retained all attenuating mutations inherited from the MDV, were highly reproductive at the optimal temperature, with temperature sensitivity corresponded to the MDV. However, strains obtained by reverse genetics, was observed to have partial loss of cold resistance in comparison with that of the MDV and classical reassortants. Reduced cold adaptation may negatively affect vaccine effectiveness. It is important that after several additional passages in chicken embryos at low temperature, the cold resistance of the vaccine strain, assembled by reverse genetics, was increased. Credibly that cold resistance is a phenotypic trait, the degree of manifestation of which depends on the temperature conditions of virus multiplication. The selective factor of reduced incubation temperature is missing in reverse genetics. In order for the cold-adapted phenotype to be fully realized, additional passages at low temperature of RG-reassortants are necessary. Thus, the reverse genetics method using plasmid technology allows to effectively prepare reassortant strains for LAIV. An important stage in obtaining vaccine strains using genetic engineering techniques should be the control of their cold-adapted phenotype and its optimization by additional passages at low temperature.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Классическая реассортация в развивающихся куриных эмбрионах является хорошо отработанной методикой для получения штаммов живой гриппозной вакцины. Сформированные естественным путем реассортантные вакцинные штаммы характеризуются высокой репродуктивностью, генетически стабильными признаками температурочувствительности и холодоустойчивости, полностью соответствующими характеристикам донора аттенуации, участвующего в скрещивании с эпидемическим вирусом. Наряду с антигенной актуальностью, естественная реассортация гарантирует аттенуацию вакцинных штаммов, хорошую репродуктивность в клетках верхних дыхательных путей и неспособность к репродукции в нижних отделах респираторного тракта. Однако при классической реассортации скорость и эффективность получения вакцинных реассортантов в существенной степени зависят от уникальных свойств эпидемического вируса, и поэтому не могут быть стабильными. Возможности генно-инженерных технологий привлекают тем, что позволяют получать вакцинные реассортанты быстро и эффективно, снижают вероятность появления спонтанных мутаций, позволяют работать с высокопатогенными вирусами, однако вакцинный штамм лишается преимуществ естественного отбора, при котором происходит селекция наиболее жизнеспособных клонов. В настоящем исследовании представлены результаты сравнительной оценки штаммов живой гриппозной вакцины А(Н3N2), полученных параллельно методами классической реассортации и генно-инженерной сборки по критериям, подтверждающим наследование вакцинными штаммами необходимых свойств, гарантирующих их безвредность и высокую репродуктивность в куриных эмбрионах. Реассортантные штаммы для живой гриппозной вакцины, полученные обоими методами, сохраняли все аттенуирующие мутации, унаследованные от донора аттенуации, были высокорепродуктивными при оптимальной температуре, их температурочувствительность соответствовала этому признаку у донора аттенуации. Однако у штаммов, полученных методом обратной генетики, наблюдалась частичная утрата холодоустойчивости по сравнению с холодоустойчивостью донора аттенуации и реассортантов из классического скрещивания. Снижение холодоустойчивости может негативно повлиять на эффективность вакцины. Важно, что за несколько дополнительных пассажей в куриных эмбрионах при пониженной температуре холодоустойчивость вакцинного реассортантного штамма, собранного генно-инженерным путем, удалось повысить. Из этого следует, что холодоустойчивость вирусов является фенотипическим признаком, степень проявления которого зависит от температурных условий культивирования вируса. При конструировании реассортантов методами обратной генетики отсутствует необходимый селективный фактор — пониженная температура инкубации. Чтобы холодоустойчивый фенотип реализовался в полной мере, необходимо дополнительное культивирование генно-инженерных реассортантов при пониженной температуре. Таким образом, метод обратной генетики с использованием плазмидной технологии дает возможность эффективной подготовки реассортантных штаммов для живой гриппозной вакцины. Важным этапом получения вакцинных штаммов с помощью генно-инженерных приемов должен быть контроль их холодоадаптированного фенотипа и, при необходимости, оптимизация холодоустойчивого фенотипа дополнительными пассажами при пониженной температуре.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>influenza virus</kwd><kwd>live attenuated influenza vaccine (LAIV)</kwd><kwd>cold adaptation (ca-sign)</kwd><kwd>temperature sensitivity (ts-sign)</kwd><kwd>attenuation (att)</kwd><kwd>natural reassortment (NR)</kwd><kwd>reverse genetic reassortment (RGR)</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>вирус гриппа</kwd><kwd>живая гриппозная вакцина (ЖГВ)</kwd><kwd>холодоадаптированность (са-признак)</kwd><kwd>температурочувствительность (ts-признак)</kwd><kwd>аттенуация (att)</kwd><kwd>классическая реассортация (NR)</kwd><kwd>генно-инженерная сборка реассортантов (RGR)</kwd></kwd-group><funding-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">Государственное задание</institution></institution-wrap><institution-wrap><institution xml:lang="en">The framework</institution></institution-wrap></funding-source><award-id>122020300200-8</award-id></award-group></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Александрова Г.И. Применение метода генетической рекомбинации для получения вакцинных штаммов вируса гриппа // Вопросы вирусологии. 1977. Т. 22, № 4. С. 387–395. [Alexandrova G.I. Use of the genetic recombination method for obtaining vaccinal strains of the influenza virus. Voprosy virusologii = Problems of Virology, 1977, vol. 22, no. 4, pp. 387–395. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Александрова Г.И., Климов А.И. Живая вакцина против гриппа. СПб.: Наука, 1994. 152 с. [Alexandrova G.I., Klimov A.I. Live influenza vaccine. St. Petersburg: Nauka, 1994. 152 p. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Киселева И.В., Ларионова Н.В., Исакова И.Н., Руденко Л.Г. Генетическая стабильность холодоадаптированных вирусов гриппа // Вопросы вирусологии. 2006. Т. 51, № 4. С. 13–16. [Kiseleva I.V., Larionova N.V., Isakova I.N., Rudenko L.G. Genetic stability of cold-adapted influenza viruses. Voprosy virusologii = Problems of Virology, 2006, vol. 51, no. 4, pp. 13–16. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Киселева И.В., Руденко Л.Г. Разработка реассортантных гриппозных вакцин: классическое скрещивание или обратная генетика? // Инфекция и иммунитет. 2023. Т. 13, № 2. C. 209–218. [Kiseleva I.V., Rudenko L.G. Development of reassortant influenza vaccines: classical reassortment or reverse genetics? Infektsiya i immunitet = Russian Journal of Infection and Immunity, 2023, vol. 13, no. 2, pp. 209–218. (In Russ.)] doi: 10.15789/2220-7619-DOR-2449</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Ларионова Н.В., Киселева И.В., Баженова Е.А., Григорьева Е.П., Руденко Л.Г. Влияние биологических свойств сезонных вирусов гриппа на эффективность подготовки штаммов живой гриппозной вакцины // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2019. № 5. С. 24–34. [Larionova N.V., Kiseleva I.V., Bazhenova E.A., Grigorieva E.P., Rudenko L.G. The influence of seasonal influenza viruses biological features on the effectiveness of development strains for live influenza vaccine. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii = Journal of Microbiology, Epidemiology and Immunobiology, 2019, no. 5, pp. 24–34. (In Russ.)] doi: 10.36233/0372-9311-2019-5-24-34</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Степанова Е.А., Крутикова Е.В., Киселева И.В., Руденко Л.Г. Разработка протокола пиросеквенирования для анализа происхождения генов реассортантов при подготовке штаммов живой гриппозной вакцины // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2018. Т. 36, № 2. C. 101–107. [Stepanova E.A., Krutikova E.V., Kiseleva I.V., Rudenko L.G. Development of pyrosequencing-based assay for analyzing the origin of genes in preparing reassortant LAIV candidates. Molekulyarnaya genetika, mikrobiologiya i virusologiya = Molecular Genetics, Microbiology and Virology, 2018, vol. 36, no. 2, pp. 101–107. (In Russ.)] doi: 10.18821/0208-0613-2018-36-2-98-103</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Allen J.D., Ross T.M. H3N2 influenza viruses in humans: viral mechanisms, evolution, and evaluation. Hum. Vaccin. Immunother., 2018, vol. 14, no. 8, pp. 1840–1847. doi: 10.1080/21645515.2018.1462639.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Cheng X., Zengel J.R., Suguitan A.L. Jr., Xu Q., Wang W., Lin J., Jin H. Evaluation of the humoral and cellular immune responses elicited by the live attenuated and inactivated influenza vaccines and their roles in heterologous protection in ferrets. J. Infect. Dis., 2013, vol. 208, no. 4, pp. 594–602. doi: 10.1093/infdis/jit207</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Herlocher M.L., Clavo A.C., Maassab H.F. Sequence comparisons of A/AA/6/60 influenza viruses: mutations which may contribute to attenuation. Virus Res., 1996, vo. 42, no. 1–2, pp. 11–25. doi: 10.1016/0168-1702(96)01292-0</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Hoffmann E., Neumann G., Kawaoka Y., Hobom G., Webster R.G. A DNA transfection system for generation of influenza A virus from eight plasmids. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 2000, vol. 97, no. 11, pp. 6108–6113. doi: 10.1073/pnas.100133697</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Hoffmann E., Krauss S., Perez D., Webby R., Webster R.G. Eight-plasmid system for rapid generation of influenza virus vaccines. Vaccine, 2002, vol. 20, no. 25–26, pp. 3165–3170. doi: 10.1016/s0264-410x(02)00268-2</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Isakova-Sivak I., Matyushenko V., Stepanova E., Matushkina A., Kotomina T., Mezhenskaya D., Prokopenko P., Kudryavtsev I., Kopeykin P., Sivak K., Rudenko L. Recombinant live attenuated influenza vaccine viruses carrying conserved T-cell epitopes of human adenoviruses induce functional cytotoxic T-cell responses and protect mice against both infections. Vaccines (Basel), 2020, vol. 8, no. 2: 196. doi: 10.3390/vaccines8020196</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Isakova-Sivak I., Chen L.M., Matsuoka Y., Voeten J.T., Kiseleva I., Heldens J.G., den Bosch Hv., Klimov A., Rudenko L., Cox N.J., Donis R.O. Genetic bases of the temperature-sensitive phenotype of a master donor virus used in live attenuated influenza vaccines: A/Leningrad/134/17/57 (H2N2). Virology, 2011, vol. 412, no. 2, pp. 297–305. doi: 10.1016/j.virol.2011.01.004</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Jin H., Lu B., Zhou H., Ma C., Zhao J., Yang C.F., Kemble G., Greenberg H. Multiple amino acid residues confer temperature sensitivity to human influenza virus vaccine strains (FluMist) derived from cold-adapted A/Ann Arbor/6/60. Virology, 2003, vol. 306, no. 1, pp. 18–24. doi: 10.1016/s0042-6822(02)00035-1</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Klimov A.I., Kiseleva I.V., Desheva J.A., Cox N.J., Alexandrova G.I., Rudenko L.G. Live attenuated reassortant influenza vaccine prepared using A/Leningrad/134/17/57 (H2N2) donor strain is genetically stable after replication in children 3–6 years of age. International Congress Series, 2001, vol. 1219, no. 2001, pp. 951–954. doi: 10.1016/S0531-5131(01)00020-6</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Klimov A.I., Kiseleva I.V., Alexandrova G.I., Cox N.J. Genes coding for polymerase proteins are essential for attenuation of the cold-adapted A/Leningrad/134/17/57 (H2N2) influenza virus. International Congress Series, 2001, vol. 1219, no. 2001, pp. 955–959. doi: 10.1016/S0531-5131(01)00369-7</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Kiseleva I. Current opinion in LAIV: a matter of parent virus choice. Int. J. Mol. Sci., 2022, vol. 23, no. 12: 6815. doi: 10.3390/ijms23126815</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Kurhade C., Xie X., Shi P.Y. Reverse genetic systems of SARS-CoV-2 for antiviral research. Antiviral. Res., 2023, vol. 210: 105486. doi: 10.1016/j.antiviral.2022</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Okonechnikov K., Golosova O., Fursov M.; UGENE team. Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit. Bioinformatics, 2012, vol. 28, no. 8, pp. 1166–1167. doi: 10.1093/bioinformatics/bts091</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Reed L., Muench H. A simple method of estimating fifty per cent endpoints. Am. J. Epidemiol, 1938, vol. 27, iss. 3, pp. 493–497. doi: 10.1093/oxfordjournals.aje.a118408</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Sanger F., Nicklen S., Coulson A.R. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 1977, vol. 74, no. 12, pp. 5463–5467. doi: 10.1073/pnas.74.12.5463</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>Smolonogina T.A., Isakova-Sivak I.N., Kotomina T.S., Evsina A.S., Stepanova E.A., Prokopenko P.I., Leontieva G.F., Suvorov A.N., Rudenko L.G. Generation of a vaccine against group B streptococcal infection on the basis of a cold-adapted influenza A virus. Mol. Genet. Microbiol. Virol., 2019, vol. 34, pp. 25–34. doi:10.3103/S0891416819010087.</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>Wareing M.D., Marsh G.A., Tannock G.A. Preparation and characterization of attenuated cold-adapted influenza A reassortants derived from the A/Leningrad/134/17/57 donor strain. Vaccine, 2002, vol. 20, no. 16, pp. 2082–2090. doi: 10.1016/s0264-410x(02)00056-7</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>WHO. Initiative for Vaccine Research (IVR). Options for Live Attenuated Influenza Vaccines (LAIV) In the Control of Epidemic and Pandemic Influenza 12–13 June 2007. URL: http://www.who.int/vaccine_research/di seases/influenza/ meeting_120707/en/index.html (18.10.2023)</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>Wong S.S., Webby R.J. Traditional and new influenza vaccines. Clin. Microbiol. Rev., 2013, vol. 26, no. 3, pp. 476–492. doi: 10.1128/CMR.00097-12</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
