Russian Journal of Infection and ImmunityRussian Journal of Infection and ImmunityИнфекция и иммунитет2220-76192313-7398SPb RAACI148010.15789/2220-7619-MGC-1480ORIGINAL ARTICLESОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИMolecular genetic characteristics of the carbapenem resistant Klebsiella pneumoniae KP254 strain as a representative of the highly virulent strain evolutionary branchМолекулярногенетическая характеристика карбапенем-устойчивого штамма Klebsiella pneumoniae KP254 как представителя эволюционной ветки высоковирулентных штаммовhttps://orcid.org/0000-0001-6482-0268AlekseevaA. E.АлексееваА. Е.
Russian Federation

Anna E. Alekseeva - PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of Metagenomics and Molecular Indication of Pathogens, Blokhina I.N. Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology of Nizhny Novgorod.

603950, Nizhniy Novgorod, Malaya Yamskaya str., 71.

Phone: +7 (831) 432-87-91; Fax: +7 (831) 469-79-20

Алексеева Анна Евгеньевна - кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории метагеномики и молекулярной индикации патогенов.

603950, Нижний Новгород, ул. Малая Ямская, 71.

Тел.: 8 (831) 432-87-91; Факс: 8 (831) 469-79-20

a.e.alexeeva79@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-4582-5623BrusniginaN. F.БруснигинаН. Ф.
Russian Federation

PhD (Medicine), Associate Professor, Head of the Laboratory of Metagenomics and Molecular Indication of Pathogens, Blokhina I.N. Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology of Nizhny Novgorod.

Nizhny Novgorod.

Кандидат медицинских наук, доцент, заведующий лабораторией метагеномики и молекулярной индикации патогенов.

Нижний Новгород.

nfbrusnigina@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0002-4146-0332GordinskayaN. A.ГординскаяН. А.
Russian Federation

PhD, MD (Medicine), Senior Researcher, Laboratory of Metagenomics and Molecular Indication of Pathogens, Blokhina I.N. Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology of Nizhny Novgorod.

Nizhny Novgorod.

Доктор медицинских наук, старший научный сотрудник лаборатории метагеномики и молекулярной индикации патогенов.

Нижний Новгород.

gordinskaya.nata@yandex.ruI.N. Blokhina Scientific Research Institute of Epidemiology and Microbiology of Nizhny NovgorodНижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора230620211135065160605202004072020Copyright ©; 2020, Alekseeva A.E., Brusnigina N.F., Gordinskaya N.A.Copyright ©; 2020, Алексеева А.Е., Бруснигина Н.Ф., Гординская Н.А.2020Alekseeva A.E., Brusnigina N.F., Gordinskaya N.A.Алексеева А.Е., Бруснигина Н.Ф., Гординская Н.А.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://iimmun.ru/iimm/article/view/1480

Here we provide molecular and genetic characteristics of the Klebsiella pneumoniae KP254 clinical strain belonging to clonal group 23 based on the genome-wide sequencing data. It is known that representatives of such clonal group exert highly virulent properties and cause community-acquired infections. Phenotypically, K. pneumoniae KP254 strain is characterized by multidrug resistance, including carbapenems. The determinants of antibiotic resistance (blaSHV-1, oqxAB, fosA) and pathogenicity encoding fimbriae 1, 3 types and the siderophore yersineobactin synthesis were found in the chromosome structure. However, there was uncovered the lack of conjugative element ICEKp1, the pathogenicity island KPHPI208, and the allantoin regulon genes which are often found in highly virulent strains. Analyzing nucleotide sequences in silico allowed to reveal the replicons of incompatibility group plasmids for FII, FIAHI1/FIIK, Col440I, ColpVC, FIBK, FIIpCRY. Combining contigs relative to reference sequences by using the BLASTN service allowed to identify two putative antibiotic resistance plasmids IncFII and IncFIIpCRY as well as one virulence plasmid IncFIBK. The determinants of the aerobactin siderophore, the RmpA2 mucoid phenotype regulator as well as heavy metal resistance genes constitute the virulence plasmid structure. The virulence plasmid nucleotide sequence coverage comprised 93% relative to the virulence plasmid pK2044 with 99.38% identity level; the genomic regions responsible for the salmochelin and RmpA protein synthesis were deleted. The set of antibiotic resistance determinants identified in the mobilome structure includes the genes for beta-lactamase LAP-2 (IncFIIpCRY plasmid) — a TEM-1 analogue, as well as extended-spectrum beta-lactamase CTX-M-55 (IncFII plasmid), both of which are rarely recorded in the Russian Federation. Additionally, widespread genes blaOXA-1, aac(3’)-IIa, ΔcatB4, aac (6’)-Ib-cr, tet(A), qnrSI, sul2, catA2 were also found in the plasmid DNA. The carbapenemase genes are absent in the resistome structure, whereas the examined strain exerts carbapenem resistance. The analysis of the ompK35 and ompK36 porin gene translated sequences revealed mutational changes which resulted in emerged stop codon within the ompK35 gene, whereas OmpK36 amino acid sequence contains a large number of substitutions, insertions, and deletions. The changes identified serve as one of the factors determining the carbapenem resistance. A synergistic effect may be accounted for by activity of the efflux pumps found in the structure of the K. pneumoniae KP254 genome, particularly AcrAB-TolC and KpnEF. Thus, the strain examined by us preserves the most significant signs specific to the highly virulent evolutionary branch Klebsiella strains, and at the same time, acquires the multidrug resistance genetic determinants.

На основании результатов полногеномного секвенирования дана молекулярно-генетическая характеристика клинического штамма Klebsiella pneumoniae KP254, принадлежащего к клональной группе 23. Известно, что представители данной клональной группы могут обладать высокой вирулентностью и являться возбудителями внебольничных инфекций. Фенотипически штамм K. pneumoniae KP254 характеризуется множественной лекарственной устойчивостью, включая карбапенемы. В структуре хромосомы обнаружены детерминанты антибиотикорезистентности (blaSHV-1, oqxAB, fosA) и патогенности, кодирующие фимбрии 1 и 3 типов и синтез белка-сидерофора иерсинеобактина. Установлено отсутствие конъюгативного элемента ICEKp1, острова патогенности KPHPI208, а также генов аллантоинового регулона, которыми часто обладают высоковирулентные штаммы. Анализ нуклеотидных последовательностей in silico позволил выявить репликоны плазмид групп несовместимости FII, FIAHI1/FIIK, Col440I, ColpVC, FIBK, FIIpCRY. В результате объединения контигов относительно референсных последовательностей с использованием сервиса BLASTN определено наличие предположительно двух плазмид антибиотикорезистентности IncFII и IncFIIpCRY и одной плазмиды вирулентности IncFIBK. В структуру плазмиды вирулентности входят детерминанты белка-сидерофора аэробактина, регулятора мукоидного фенотипа RmpA2, а также гены устойчивости к тяжелым металлам. Покрытие нуклеотидной последовательности плазмиды вирулентности составило 93% относительно плазмиды вирулентности pK2044 с уровнем идентичности 99,38%, делетированными оказались области, ответственные за синтез сальмохелина и белка RmpA. Набор детерминант антибиотикорезистентности, выявленных в структуре мобилома, включает гены бета-лактамазы LAP-2 (плазмида IncFIIpCRY) — аналога TEM-1, — а также бета-лактамазы расширенного спектра CTX-X-55 (плазмида IncFII). Обе детерминанты являются редко регистрируемыми на территории Российской Федерации. Дополнительно в составе плазмидной ДНК обнаружены широко распространенные гены blaOXA-1, aac(3’)-IIa, ΔcatB4, aac(6’)-Ib-cr, tet(A), qnrSI, sul2, catA2. В структуре резистома отсутствую гены карбапенемаз, в то время как исследуемый штамм обладает устойчивостью к карбапенемам. В результате анализа транслированных последовательностей генов пориновых белков OmpK35 и OmpK36 обнаружены мутационные изменения, которые привели к формированию стоп-кодона в гене ompK35. Также установлено, что аминокислотная последовательность OmpK36 содержит большое количество замен, вставок и делеций.. Наличие подобных изменений является одним из факторов, определяющих устойчивость к карбапенемам. Синергетический эффект может оказывать активность эффлюксных насосов, присутствующих в структуре генома K. pneumoniae KP254, в частности AcrAB-TolC и KpnEF. Таким образом, у исследуемого штамма наблюдается сохранение наиболее значимых признаков, характерных для представителей эволюционной ветки высоковирулентных штаммов клебсиелл, и в тоже время приобретение генетических детерминант множественной лекарственной устойчивости.

Klesiella pneumoniaesequence type 23CTX-M-55LAP-2determinants of resistance and pathogenicityplasmidsvirulenceporinsKlesiella pneumoniaeсиквенс-тип 23CTX-M-55LAP-2детерминанты резистентности и патогенностиплазмидывирулентностьпорины.1. Алексеева А.Е., Бруснигина Н.Ф., Солнцев Л.А., Гординская Н.А. Молекулярное типирование клинических изолятов Klebsiella pneumoniae, продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра действия // Клиническая лабораторная диагностика. 2017. Т. 62, № 11. С. 699—704. doi: 10.18821/0869-20842017-62-11-699-7042. Комисарова Е.В., Воложанцев Н.В. Гипервирулентная Klebsiella pneumoniae — новая инфекционная угроза // Инфекционные болезни. 2019. Т. 17, № 3. С. 81—89. doi: 10.20953/17299225-2019-3-81-893. Bertels F., Silander O.K., Pachkov M., Rainey P.B., van Nimwegen E. Automated reconstruction of whole-genome phylogenies from short-sequence reads. Mol. Biol. Evol, 2014, vol. 31, no. 5, pp. 1077—1088. doi: 10.1093/molbev/msu0884. Bhagirath A.Y., Li Y., Patidar R., Yerex K., Ma X., Kumar A., Duan K. Two component regulatory systems and antibiotic resistance in gram-negative pathogens. Int. J. Mol. Sci., 2019, vol. 20, no. 7: 1781. doi: 10.3390/ijms200717815. Bialek-Davenet S., Criscuolo A., Ailloud F., Passet V., Jones L., Delannoy-Vieillard A., Garin B., Le Hello S., Arlet G., Nicolas-Chanoine M.-H., Decre D., Brisse S. Genomic definition of hypervirulent and multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae clonal groups. Emerg. Infect. Dis, 2014, vol. 20, no. 11, pp. 1812—1820. doi: 10.3201/eid2011.1402066. Bulger J., MacDonald U., Olson R., Beanan J., Russo T.A. Metabolite transporter PEG344 is required for full virulence of hy-pervirulent Klebsiella pneumoniae strain hvKP1 after pulmonary but not subcutaneous challenge. Infect. Immun., 2017, vol. 85, no. 10: e00093-17. doi: 10.1128/IAI.00093-177. Cabral L., Junior G.V.L., Pereira de Sousa S.T., Dias A.C.F., Lira Cadete L., Andreote F.D., Hess M., de Oliveira V.M. Anthropogenic impact on mangrove sediments triggers differential responses in the heavy metals and antibiotic resistomes of microbial communities. Environ. Pollut., 2016, vol. 216, pp. 460— 469. doi: 10.1016/j.envpol.2016.05.0788. Carattoli A., Hasman H. PlasmidFinder and in silico pMLST: identification and typing of plasmid replicons in whole-genome sequencing (WGS). Methods Mol. Biol, 2020, vol. 2075, pp. 285-294. doi: 10.1007/978-1-4939-9877-7_209. Chen X., He L., Li Y., Zeng Z., Deng Y., Liu Y., Liu J.-H. Complete sequence of a F2:A-:B- plasmid pHN3A11 carrying rmtB and qepA, and its dissemination in China. Vet. Microbiol., 2014, vol. 174, no. 1-2, pp. 267-271. doi: 10.1016/j.vetmic.2014.08.02310. Chen Y.T., Chang H.Y., Lai Y.C., Pan C.C., Tsai S.F., Peng H.L. Sequencing and analysis of the large virulence plasmid pLVPK of Klebsiella pneumoniae. Gene, 2004, vol. 337, pp. 189-198. doi: 10.1016/j.gene.2004.05.00811. Cheong H.S., Chung D.R., Park M., Kim S.H., Ko K.S., Ha Y.E., Kang C.I., Peck K.R., Song J.H. Emergence of an extended-spectrum в-lactamase-producing serotype K1 Klebsiella pneumoniae ST23 strain from Asian countries. Epidemiol. Infect., 2017, vol. 145, no. 5, pp. 990-994. doi: 10.1017/S095026881600311312. Chou H.C., Lee C.Z., Ma L.C., Fang C.T., Chang S.C., Wang J.T. Isolation of a chromosomal region of Klebsiella pneumoniae associated with allantoin metabolism and liver infection. Infect. Immun., 2004, vol. 72, no. 7, pp. 3783-3792. doi: 10.1128/IAI.72.7.3783-3792.200413. Deng Y., He L., Chen S., Zheng H., Zeng Z., Liu Y., Sun Y., Ma J., Chen Z., Liu J.H. F33:A-:B- and F2:A-:B- plasmids mediate dissemination of rmtB-blaCTX-M-9 group genes and rmtB-qepA in Enterobacteriaceae isolates from pets in China. Antimicrob. Agents Chemother., 2011, vol. 55, no. 10, pp. 4926-4929. doi: 10.1128/AAC.00133-1114. Edelstein M., Pimkin M., Palagin I., Edelstein I., Stratchounski L. Prevalence and molecular epidemiology of CTX-M extended-spectrum в-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Russian hospitals. Antimicrob. Agents Chemother., 2003, vol. 47, no. 12, pp. 3724-3732. doi: 10.1128/aac.47.12.3724-3732.200315. Fang C.T., Chuang Y.P., Shun C.T., Chang S.C., Wang J.T. A novel virulence gene in Klebsiella pneumoniae strains causing primary liver abscess and septic metastatic complications. J. Exp. Med., 2004, vol. 199, no. 5, pp. 697-705. doi: 10.1084/jem.2003085716. Gu D., Dong N., Zheng Z., Lin D., Huang M., Wang L., Chan E.W., Shu L., Yu J., Zhang R., Chen S. A fatal outbreak of ST11 carbapenem-resistant hypervirulent Klebsiella pneumoniae in a Chinese hospital: a molecular epidemiological study. Lancet Infect. Dis., 2017, vol. 18, no. 1, pp. 37-46. doi: 10.1016/S1473-3099(17)30489-917. Hobbs E.C., Yin X., Paul B.J., Astarita J.L., Storz G. Conserved small protein associates with the multidrug efflux pump AcrB and differentially affects antibiotic resistance. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2012, vol. 109, no. 41, pp. 16696-16701. doi: 10.1073/pnas.1210093118. Holdsworth S.R., Law C.J. The major facilitator superfamily transporter MdtM contributes to the intrinsic resistance of Escherichia coli to quaternary ammonium compounds. J. Antimicrob. Chemother., 2013, vol. 68, no. 4, pp. 831—839. doi: 10.1093/jac/dks49119. Hu X., Gou J., Guo X., Cao Z., Li Y., Jiao H., He X., Ren Y., Tian F. Genetic contexts related to the diffusion of plasmid-mediated CTX-M-55 extended-spectrum beta-lactamase isolated from Enterobacteriaceae in China. Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob., 2018, vol. 17, no. 1. doi: 10.1186/s12941-018-0265-x20. Izquierdo L., Coderch N., Pique N., Bedini E., Corsaro M.M., Merino S., Fresno S., Tomas J.M., Regue M. The Klebsiella pneumoniae wabG gene: role in biosynthesis of the core lipopolysaccharide and virulence. J. Bacteriol., 2003, vol. 185, no. 24, pp. 7213-7221. doi: 10.1128/jb.185.24.7213-7221.200321. Kiratisin P., Apisarnthanarak A., Saifon P., Laesripa C., Kitphati R., Mundy L.M. The emergence of a novel ceftazidime-resistant CTX-M extended-spectrum beta-lactamase, CTX-M-55, in both community-onset and hospital-acquired infections in Thailand. Diagn. Microbiol. Infect. Dis., 2007, vol. 58, no. 3, pp. 349-355. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2007.02.00522. Kucken D., Feucht H., Kaulfers P. Association of qacE and qacEDelta1 with multiple resistance to antibiotics and antiseptics in clinical isolates of Gram-negative bacteria. FEMS Microbiol. Lett., 2000, vol. 183, iss. 1, pp. 95-98. doi: 10.1111/j.1574-6968.2000.tb08939.x23. Lai Y.C., Lin A.C., Chiang M.K., Dai Y.H., Hsu C.C., Lu M.C., Liau C.Y., Chen Y.T. Genotoxic Klebsiella pneumoniae in Taiwan. PLoS One, 2014, vol. 9, no. 5: e96292. doi: 10.1371/journal.pone.009629224. Lev A.I., Astashkin E.I., Kislichkina A.A., Solovieva E.V., Kombarova T.I., Korobova O.V., Ershova O.N., Alexandrova I.A., Malikov V.E., Bogun A.G., Borzilov A.I., Volozhantsev N.V., Svetoch E.A., Fursova N.K. Comparative analysis of Klebsiella pneumoniae strains isolated in 2012—2016 that differ by antibiotic resistance genes and virulence genes profiles. Pathog. Glob. Health, 2018, vol. 112, no. 3, pp. 142-151. doi: 10.1080/20477724.2018.146094925. Li J., Zhang H., Ning J., Sajid A., Cheng G., Yuan Z., Hao H. The nature and epidemiology of OqxAB, a multidrug efflux pump. Antimicrob. Resist. Infect. Control., 2019, vol. 8, no. 44. doi: 10.1186/s13756-019-0489-326. Li X.-Z., Plesiat P., Nikaido H. The challenge of efflux mediated antibiotic resistance in gram-negative bacteria. Clin. Microbiol. Rev., 2015, vol. 28, no. 2, pp. 337-418. doi: 10.1128/CMR.00117-1427. Lin T.L., Lee C.Z., Hsieh P.F., Tsai S.F., Wang J.T. Characterization of integrative and conjugative element ICEKp1-associated genomic heterogeneity in a Klebsiella pneumoniae strain isolated from a primary liver abscess. J. Bacteriol., 2008, vol. 190, no. 2, pp. 515-526. doi: 10.1128/JB.01219-0728. Ma L.-C., Fang C.-T., Lee C.-Z., Shun C.-T., Wang J.-T., Genomic heterogeneity in Klebsiella pneumoniae strains is associated with primary pyogenic liver abscess and metastatic infection. J. Infect. Dis., 2005, vol. 192, no. 1, pp. 117-128. doi: 10.1086/43061929. Moura A., Soares M., Pereira C., Leitao N., Henriques I., Correia A. INTEGRALL: a database and search engine for integrons, integrases and gene cassettes. Bioinformatics, 2009, vol. 25, no. 8, pp. 1096-1098. doi: 10.1093/bioinformatics/btp10530. Nzakizwanayo J., Scavone P., Jamshidi S., Hawthorne J.A., Pelling H., Dedi C., Salvage J.P., Hind C.K., Guppy F.M., Barnes L.M., Patel B.A., Rahman K.M., Sutton M.J., Jones B.V. Fluoxetine and thioridazine inhibit efflux and attenuate crystalline biofilm formation by Proteus mirabilis. Sci. Rep., 2017, vol. 7: 12222. doi: 10.1038/s41598-017-12445-w31. Pan Y.S., Liu J.H., Hu H., Zhao J.F., Yuan L., Wu H., Wang L.F., Hu G.Z. Novel arrangement of the blaCTX-M-55 gene in an Escherichia coli isolate coproducing 16S rRNA methylase. J. Basic. Microbiol., 2013, vol. 53, no. 11, pp. 928-933. doi: 10.1002/jobm.20120031832. Poirel L., Cattoir V., Soares A., Soussy C.J., Nordmann P. Novel Ambler class A beta-lactamase LAP-1 and its association with the plasmid-mediated quinolone resistance determinant QnrS1. Antimicrob. Agents Chemother., 2007, vol. 51, no. 2, pp. 631- 637. doi: 10.1128/AAC.01082-0633. Russo T.A., Olson R., Fang C.-T., Stoesser N., Miller M., MacDonald U., Hutson A., Barker J.H., La Hoz R.M., Johnson J.R. for the Hypervirulent Klebsiella pneumoniae Investigator Group (HVKPIG). Identification of biomarkers for differentiation of hypervirulent Klebsiella pneumoniae from classical K. pneumoniae. J. Clin. Microbiol., 2018, vol. 56 (9): e00776-18. doi: 10.1128/JCM.00776-1834. Russo T.A., Olson R., Macdonald U., Metzger D., Maltese L.M., Drake E.J., Gulick A.M. Aerobactin mediates virulence and accounts for increased siderophore production under iron-limiting conditions by hypervirulent (hypermucoviscous) Klebsiella pneumoniae. Infect. Immun., 2014, vol. 82, no. 6, pp. 2356-2367. doi: 10.1128/IAI.01667-1335. Russo T.A., Marr C.M. Hypervirulent Klebsiella pneumoniae. Clin. Microbiol. Rev., 2019, vol. 32 (3): e00001-19. doi: 10.1128/CMR.00001-1936. Siguier P., Perochon J., Lestrade L., Mahillon J., Chandler M. ISfinder: the reference centre for bacterial insertion sequences. Nucleic Acids Res., 2005, vol. 34, pp. D32-D36. doi: 10.1093/nar/gkj01437. Srinivasan V.B., Rajamohan G. KpnEF, a new member of the Klebsiella pneumoniae cell envelope stress response regulon, is an SMR-type efflux pump involved in broad-spectrum antimicrobial resistance. Antimicrob. Agents Chemother., 2013, vol. 57, no. 9, pp. 4449-4462. doi: 10.1128/AAC.02284-1238. Struve C., Roe C.C., Stegger M., Stahlhut S.G., Hansen D.S., Engelthaler D.M., Andersen P.S., Driebe E.M., Keim P., Krogfelt K.A. Mapping the evolution of hypervirulent Klebsiella pneumoniae. mBio, 2015, vol. 6 (4): e00630-15. doi: 10.1128/mBio.00630-1539. Sugawara E., Kojima S., Nikaido H. Klebsiella pneumoniae major porins OmpK35 and OmpK36 allow more efficient diffusion of в-lactams than their Escherichia coli homologs OmpF and OmpC. J. Bacteriol., 2016, vol. 198, no. 23, pp. 3200-3208. doi: 10.1128/JB.00590-1640. Surgers L., Boyd A., Girard P.M., Arlet G., Decre D. ESBL-producing strain of hypervirulent Klebsiella pneumoniae K2, France. Emerg. Infect. Dis., 2016, vol. 22, no. 9, pp. 1687-1688. doi: 10.3201/eid2209.16068141. Tsai Y.-K., Fung C.-P., Lin J.-C., Chen J.-H., Chang F.-Y., Chen T.-L., Siu L.K. Klebsiella pneumoniae outer membrane porins OmpK35 and OmpK36 play roles in both antimicrobial resistance and virulence. Antimicrob. Agents Chemother., 2011, vol. 55, no. 4, pp. 1485-1493. doi: 10.1128/AAC.01275-1042. Villa L., Garci'a-Fernandez A., Fortini D., Carattoli A. Replicon sequence typing of IncF plasmids carrying virulence and resistance determinants. J. Antimicrob. Chemother., 2010, vol. 65, no. 12, pp. 2518—2529. doi: 10.1093/jac/dkq34743. Wang L., Fang H., Feng J., Yin Z., Xie X., Zhu X., Wang J., Chen W., Yang R., Du H., Zhou D. Complete sequences of KPC-2-encoding plasmid p628-KPC and CTX-M-55-encoding p628-CTXM coexisted in Klebsiella pneumoniae. Front. Microbiol., 2015, 6: 838. doi: 10.3389/fmicb.2015.0083844. Weston N., Sharma P., Ricci V., Piddock L.J.V. Regulation of the AcrAB-TolC efflux pump in Enterobacteriaceae. Res. Microbiol., 2018, vol. 169, no. 7-8, pp. 425-431. doi: 10.1016/j.resmic.2017.10.00545. Wu K.M., Li L.H., Yan J.J., Tsao N., Liao T.L., Tsai H.C., Fung C.P., Chen H.J., Liu Y.M., Wang J.T., Fang C.T., Chang S.C., Shu H.Y., Liu T.T., Chen Y.T., Shiau Y.R., Lauderdale T.L., Su I.J., Kirby R., Tsai S.F. Genome sequencing and comparative analysis of Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044, a strain causing liver abscess and meningitis. J. Bacteriol., 2009, vol. 191, no. 14, pp. 4492-4501. doi: 10.1128/JB.00315-0946. Yuan Y., Li Y., Wang G., Li C., Chang Y.F., Chen W., Nian S., Mao Y., Zhang J., Zhong F., Zhang L. BlaNDM-5 carried by a hypervirulent Klebsiella pneumoniae with sequence type 29. Antimicrob. Resist. Infect. Control, 2019, vol. 8: 140. doi: 10.1186/s13756-019-0596-147. Zhao W.H., Hu Z.Q. Epidemiology and genetics of CTX-M extended-spectrum в-lactamases in Gram-negative bacteria. Crit. Rev. Microbiol., 2013, vol. 39, no. 1, pp. 79-101. doi: 10.3109/1040841X.2012.691460