<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="other" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Infection and Immunity</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Инфекция и иммунитет</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2220-7619</issn><issn publication-format="electronic">2313-7398</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">SPb RAACI</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">1379</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.15789/2220-7619-TMO-1379</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>ORIGINAL ARTICLES</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject></subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">The mechanisms of antibiotic resistance in major pathogens of purulent-inflammatory complications in cancer patients</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Механизмы антибиотикорезистентности основных возбудителей гнойно-воспалительных осложнений у онкологических больных</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-2829-5117</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Khokhlova</surname><given-names>O. Е.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Хохлова</surname><given-names>О. Е.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Olga E. Khokhlova - Ph.D., Associate Professor Department of Microbiology named after Assoc. B.M. Zelmanovich.</p><p>660022, Krasnoyarsk, Partizan Zheleznyak str., 1.</p><p>Phone: +7 (391) 220-13-61 (office); +7 (908) 018-99-84 (mobile)</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Хохлова Ольга Евгеньевна - доктор биологических наук, доцент кафедры микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.</p><p>660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1.</p><p>Тел.: 8 (391) 220-13-61 (раб.); 8 (908) 018-99-84 (моб.)</p></bio><email>khokhlovaol@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Larionova</surname><given-names>I. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Ларионова</surname><given-names>И. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Senior Lecturer, Department of Microbiology named after B.M. Zelmanovitch, Krasnoyarsk State Medical University named after professor V.F. Voyno-Yasenetsky.</p><p>660022, Krasnoyarsk, str. Partizan Zheleznyak, 1.</p><p>Tel.: 8 908 018 99 84, tel. +7 (391) 220-13-61</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Старший преподаватель кафедры микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.</p><p>660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, д. 1.</p><p>Тел. 8 908 018 99 84; тел. +7 (391) 220-13-61</p></bio><email>vova_lar@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Perianova</surname><given-names>O. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Перьянова</surname><given-names>О. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Head of the Department of Microbiology named after B.M. Zelmanovitch.</p><p>660022, Krasnoyarsk, str. Partizan Zheleznyak, 1.</p><p>Tel.: +7 (391) 220-13-61, 8 913 569 83 68</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Кандидат биологических наук, заведующий кафедрой микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.</p><p>660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, д. 1.</p><p>Тел. +7 (391) 220-13-61; 8 913 569 83 68</p></bio><email>perianova@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kozlov</surname><given-names>R. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Козлов</surname><given-names>Р. С.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Professor, RAS Full Member, Rector of Smolensk State Medical University.</p><p>214019, Smolensk, str. Krupskaya, 28.</p><p>Tel.: +7 (481) 255 02 75</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Доктор медицинских наук, профессор, член-корреспондент РАН, ректор.</p><p>214019, Смоленская обл., Смоленск, ул. Крупской, 28.</p><p>Тел. +7 (481) 255 02 75</p></bio><email>roman.kozlov@antibiotic.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Eidelshtein</surname><given-names>M. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Эйдельштейн</surname><given-names>М. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Head of the Laboratory of the Research Institute of Antimicrobial Chemotherapy, Smolensk State Medical University.</p><p>214019, Smolensk Region, Smolensk, str. Krupskaya, 28.</p><p>Tel.:+7 (481) 255 02 75</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Кандидат биологических наук, заведующий лабораторией НИИ антимикробной химиотерапии.</p><p>214019, Смоленская обл., Смоленск, ул. Крупской, 28.</p><p>Тел. +7 (481) 255 02 75</p></bio><email>adm@smolgmu.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Modestov</surname><given-names>A. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Модестов</surname><given-names>А. А.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Medicine), Chief Doctor, Krasnoyarsk Regional Clinical Oncology Center named after A.I. Kryzhanovsky.</p><p>660133 Krasnoyarsk Territory, Krasnoyarsk, str. 1st Smolenskaya, 16.</p><p>Tel.: 222-40-01</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Кандидат медицинских наук, главный врач.</p><p>660133 Красноярский край, Красноярск, ул. 1-я Смоленская, 16.</p><p>Тел.: 222-40-01</p></bio><email>priem@onkolog24.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff4"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Eremeeva</surname><given-names>O. G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Еремеева</surname><given-names>О. Г.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Intensivist, Head of the Intensive Care Unit, Krasnoyarsk Regional Clinical Oncology Center named after A.I. Kryzhanovskyю</p><p>660133 Krasnoyarsk Territory, Krasnoyarsk, str. 1st Smolenskaya, 16ю</p><p>Tel.: 222-40-01</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Врач анестезиолог-реаниматолог, заведующий отделением анестезиологии-реанимации.</p><p>660133 Красноярский край, Красноярск, ул. 1-я Смоленская, 16.</p><p>Тел.: 222-40-01</p></bio><email>priem@onkolog24.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff4"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Lazareva</surname><given-names>I. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Лазарева</surname><given-names>И. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Researcher, Department of Medical Microbiology and Molecular Epidemiology, Research Institute for Children's Infections of the Federal Medical and Biological Agency.</p><p>197022, St. Petersburg.</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Научный сотрудник отдела медицинской микробиологии и молекулярной эпидемиологии.</p><p>197022, Санкт-Петербург.</p></bio><email>partina-irina@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff5"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Akusheva</surname><given-names>D. N.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Акушева</surname><given-names>Д. Н.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Lecturer, Department of Microbiology named after B.M. Zelmanovitch, Krasnoyarsk State Medical University named after professor V.F. Voyno-Yasenetsky.</p><p>660022, Krasnoyarsk, str. Partizan Zheleznyak, 1.</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Преподаватель кафедры микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.</p><p>660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, д. 1.</p></bio><email>kalllissto@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Lobova</surname><given-names>T. I.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Лобова</surname><given-names>Т. И.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Senior Lecturer, Department of Microbiology named after B.M. Zelmanovitch, Krasnoyarsk State Medical University named after professor V.F. Voyno-Yasenetsky.</p><p>660022, Krasnoyarsk, str. Partizan Zheleznyak, 1.</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Кандидат биологических наук, старший преподаватель кафедры микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича.</p><p>660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, д. 1.</p></bio><email>yani.lobv@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Potkina</surname><given-names>N. K.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Поткина</surname><given-names>Н. К.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Researcher, Russia-Japan Center of Microbiology, Metagenomics and Infectious Diseases, Krasnoyarsk State Medical University.</p><p>660022, Krasnoyarsk, str. Partizan Zheleznyak, 1.</p><p>Tel.: 8 950 401 97 7</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Научный сотрудник.</p><p>660022, Красноярск, ул. Партизана Железняка, д. 1.</p><p>Тел. 8 950 401 97 47</p></bio><email>potnad@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff6"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Sidorenko</surname><given-names>S. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Сидоренко</surname><given-names>С. В.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Medicine), Professor, Head of the Department of Medical Microbiology and Molecular Epidemiology, Research Institute for Children's Infections of the Federal Medical and Biological Agency.</p><p>197022, St. Petersburg, str. Professor Popov, 9.</p><p>Tel.: +7 (812) 234-16-70</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Доктор медицинских наук, профессор, руководитель отдела медицинской микробиологии и молекулярной эпидемиологии.</p><p>197022, Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д.9.</p><p>Тел. +7(812) 234-16-70</p></bio><email>sidorserg@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff5"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Yamamoto</surname><given-names>T</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Ямамото</surname><given-names>Т.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="JP">Japan</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Medicine), Professor, Director of the International Medical Education and Research Center; Curator of the Russia-Japan Center of Microbiology, Metagenomics and Infectious Diseases, Krasnoyarsk State Medical University.</p><p>Niigata; Krasnoyarsk.</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>Кандидат медицинских наук, профессор, директор Международного медицинского образовательно-исследовательского центра (IMERC); куратор Российско-Японского центра микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний.</p><p>Ниигата; Красноярск.</p></bio><email>tatsuoy@imerc.jp</email><xref ref-type="aff" rid="aff7"/><xref ref-type="aff" rid="aff8"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Krasnoyarsk State Medical University named after professor V.F. Voyno-Yasenetsky</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Krasnoyarsk State Medical University named after professor V.F. Voyno-Yasenetsky, Krasnoyarsk</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения Российской Федерации</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff3"><aff><institution xml:lang="en">Smolensk State Medical University, Ministry of Health of Russia</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Смоленский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения России</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff4"><aff><institution xml:lang="en">Krasnoyarsk Regional Clinical Oncology Center named after A.I. Kryzhanovsky</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Красноярский краевой клинический онкологический диспансер имени А.И. Крыжановского</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff5"><aff><institution xml:lang="en">Research Institute for Children's Infections of the Federal Medical and Biological Agency</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Детский научно-клинический центр инфекционных болезней ФМБА</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff6"><aff><institution xml:lang="en">Russia-Japan Center of Microbiology, Мetagenomics and Infectious Diseases, Krasnoyarsk State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Российско-Японский центр микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff7"><aff><institution xml:lang="en">International Medical Education and Research Center</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Международный медицинский образовательно-исследовательский центра (IMERC)</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff8"><aff><institution xml:lang="en">Russia-Japan Center of Microbiology, Мetagenomics and Infectious Diseases</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Российско-Японский центр микробиологии, метагеномики и инфекционных заболеваний</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2021-03-24" publication-format="electronic"><day>24</day><month>03</month><year>2021</year></pub-date><volume>11</volume><issue>2</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>324</fpage><lpage>336</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2020-02-14"><day>14</day><month>02</month><year>2020</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2020-06-03"><day>03</day><month>06</month><year>2020</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2020, Khokhlova O.Е., Larionova I.A., Perianova O.V., Kozlov R.S., Eidelshtein M.V., Modestov A.A., Eremeeva O.G., Lazareva I.V., Akusheva D.N., Lobova T.I., Potkina N.K., Sidorenko S.V., Yamamoto T.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2020, Хохлова О.Е., Ларионова И.А., Перьянова О.В., Козлов Р.С., Эйдельштейн М.В., Модестов А.А., Еремеева О.Г., Лазарева И.В., Акушева Д.Н., Лобова Т.И., Поткина Н.К., Сидоренко С.В., Ямамото Т.</copyright-statement><copyright-year>2020</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Khokhlova O.Е., Larionova I.A., Perianova O.V., Kozlov R.S., Eidelshtein M.V., Modestov A.A., Eremeeva O.G., Lazareva I.V., Akusheva D.N., Lobova T.I., Potkina N.K., Sidorenko S.V., Yamamoto T.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Хохлова О.Е., Ларионова И.А., Перьянова О.В., Козлов Р.С., Эйдельштейн М.В., Модестов А.А., Еремеева О.Г., Лазарева И.В., Акушева Д.Н., Лобова Т.И., Поткина Н.К., Сидоренко С.В., Ямамото Т.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://iimmun.ru/iimm/article/view/1379">https://iimmun.ru/iimm/article/view/1379</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>The problem of microbial antibiotic resistance and investigation of its underlying mechanisms is of paramount importance for all fields of clinical medicine, including oncology. The aim of the study was to examine the mechanisms of antibiotic resistance for major pathogens causing purulent-inflammatory complications in cancer patients. <italic>Materials and methods</italic>. In 2012—2015 there was conducted a prospective examination of 184 cancer patients, including 67 patients at the Department of Surgery no. 1 and 117 patients at the Intensive Care Unit of the Krasnoyarsk Regional Clinical Oncology Center named after A.I. Kryzhanovsky. For this, we collected bronchoalveolar lavage fluid, wound discharge and investigated the material by using bacteriological method, as well as MALDI-TOF. Antibiotic sensitivity was studied as follows: disco-diffusion, double disc method, carbapenem inactivation method, staphylococcal sensitivity — by screening method, PCR, E-test method, and serial dilutions in Muller-Hinton broth. Genotyping and antibiotic resistance mechanisms study were performed by using PCR, M-PCR, and sequencing. The WHONET program (WHO) was used, with significance level set at p &lt; 0.05. <italic>Results</italic>. Microbiological examination of bronchoalveolar lavage fluid and wound discharge samples allowed to uncover prevalent associations of multi-resistant (MDR) and extremely resistant pathogens (XDR). The microflora of the lower respiratory tract and in the wound secretion in cancer patients were found to be dominated by non-fermenting Gram-negative bacteria reaching up to 44.5% and 48%, respectively; as well as order <italic>Enterobacteriales</italic> found in 24% and 34.9%, respectively; Gram-positive bacteria — 24% and 17.1%, respectively. Imipenem- and/or meropenem-resistant P. aeruginosa and <italic>A. baumannii, K. pneumoniae</italic> strains, were assessed for MBL production phenotypically, as well as the genes of the most common VIM, IMP types, whereas <italic>A. baumannii</italic> — for OXA-23, OXA-40, and OXA-58; and <italic>K. pneumoniae</italic> — for OXA-48. 20 strains and 16 strains of <italic>P. aeruginosa</italic> and <italic>A. baumannii</italic>, respectively, were studied by PCR. It was found that <italic>A. baumannii</italic> strains formed no MBL, but 56.3% of <italic>A. baumannii</italic> isolates (9 strains) produced OXA-23 and OXA-40 carbapenemases. Among <italic>P. aeruginosa</italic> strains there were three of them which possessed VIM (15.0%), whereas the remaining strains formed no MBL, but were resistant to carbapenems being associated with other resistance mechanisms, e.g. efflux, decreased permeability of cell wall etc. Among 6 isolates of <italic>K. pneumoniae</italic>, 1 strain produced OXA-48. In cancer patients, the percentage of methicillin-resistant strains among all members of the genus Staphylococcus was 48.9% (4 strains belonged to MRSA). PVL- MRSA strains belonged to the clones ST239/spa3(t037)/SCCmecIIIA<italic>/tst,sek,seq</italic>+ (75%) and ST8/ spa1(t008)/SCCmecIVc<italic>/sea</italic>+ (25%). MRSA ST239 showed multiple antibiotic resistance: to aminoglycosides (<italic>aacA-aphD, aadD</italic> genes were detected), linkcosamides/macrolides (the <italic>ermA</italic> gene was detected), fluoroquinolones (mutations in the <italic>GyrA</italic> gene — Ser84Leu; in <italic>GrlA</italic>- Ser80Phe), rifampicin (MIC more than 128 gg/ml; mutations in the <italic>rpoB</italic> gene are His481Asn, Ile527Met), sulfamethoxazole, tetracycline (<italic>tetM </italic>gene), and chloramphenicol (66.7% of isolates, the <italic>cat</italic> gene encoding chloramphenicol acetyl transferase was detected); but sensitive to vancomycin (MIC 1.0 gg/ ml), linezolid in 100% of cases. MRSA ST8 are resistant to aminoglycosides (<italic>aacA-aphD, aadD</italic> genes), lincosamides/macrolides (<italic>ermC</italic> gene), tetracyclines (<italic>tetK</italic> gene), chloramphenicol (<italic>cat</italic> gene); and 100% sensitive to fluoroquinolones, rifampicin (MIC 0.006 gg/ml), sulfamethaxazole, vancomycin (MIC 1.0 gg/ml), daptomycin (MIC 0.094 gg/ml), linezolid (MIC 0.75 gg/ml). <italic>Conclusion</italic>. Thus, it was found that members of the order <italic>Enterobacteriales, A. baumannii, P. aeruginosa</italic> and MRSA retain high resistance to a large number of antibacterial drugs of almost all classes. These data should be taken into account while choosing proper antibiotic therapy, as well as controlling spread of nosocomial infections caused by multiresistant microorganisms.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Цель работы — изучение механизмов антибиотикорезистентности основных возбудителей гнойно-воспалительных осложнений у онкологических больных. <italic>Материалы и методы</italic>. В 2012—2015 гг. проспективно обследовано 184 онкологических больных: 67 больных хирургического отделения № 1 и 117 больных отделения анестезиологии-реанимации Красноярского краевого клинического онкологического диспансера им. А.И. Крыжановского. Материал от больных — бронхоальвеолярная лаважная жидкость, раневое отделяемое — исследовали бактериологическим методом, а также MALDI-TOF. Для изучения антибиотикочувствительности применяли такие методы, как диско-диффузионный, метод «двойных дисков», инактивации карбапенемов, скрининга, ПЦР, Е-тест, метод серийных разведений в бульоне Мюллера-Хинтон. Генотипирование и определение механизмов резистентности осуществлялось с помощью ПЦР, М-ПЦР, секвенирования. Была использована программа WHONET, уровень значимости p &lt; 0,05. <italic>Результаты</italic>. Установлено превалирование ассоциаций мультирезистентных и экстремально резистентных возбудителей. В микрофлоре нижних отделов дыхательных путей, раневом отделяемом у онкологических больных превалировали неферментирующие грамотрицательные бактерии — 44,5 и 48% соответственно, а также представители порядка <italic>Enterobacterales</italic> — 24 и 34,9% соответственно; грамположительные бактерии — 24 и 17,1% соответственно. У штаммов <italic>P. aeruginosa</italic> и <italic>A. baumannii</italic>, <italic>K. pneumoniae</italic>, устойчивых к имипенему и/или меропенему, проверяли продукцию МБЛ фенотипически, а также наличие генов наиболее распространенных VIM-, IMP-типов, а у <italic>A</italic><italic>. </italic><italic>baumanni</italic><italic> </italic><italic>i</italic>также генов OXA-23, OXA-40, OXA-58; у <italic>K</italic><italic>. </italic><italic>pneumoniae</italic> — OXA-48. Штаммы <italic>A</italic><italic>. </italic><italic>baumannii</italic> не образуют МБЛ, но 56,3% изолятов (9 штаммов из 16) являлись продуцентами карбапенемаз OXA-23 и OXA-40. Штаммы <italic>P</italic><italic>. </italic><italic>aeruginosa</italic> 15,0% (3 из 20) обладали VIM. 16,7% (1 из 6) изолятов K. pneumoniae являлся продуцентом OXA-48. Удельный вес метициллин-резистентных штаммов рода <italic>Staphylococcus</italic> составил 48,9%, 4 штамма относились к MRSA. Штаммы MRSA PVL- относились к клонам ST239/spa3(t037)/SCCmecIIIA<italic>/</italic><italic>tst</italic><italic>,</italic><italic>sek</italic><italic>,</italic><italic>seq</italic>+ (75%) и ST8/spa1(t008)/SCCmecIVc<italic>/</italic><italic>sea</italic>+ (25%). MRSA ST239 резистентны к аминогликозидам (<italic>aacA</italic><italic>-</italic><italic>aphD</italic><italic>, </italic><italic>aadD</italic>), линкозамидам/макролидам (<italic>ermA</italic>), фторхинолонам (мутации <italic>GyrA</italic> — Ser84Leu; в <italic>GrlA</italic> — Ser80Phe), рифампицину (мутации <italic>rpoB</italic> — His481Asn, Ile527Met), сульфаметоксазолу, тетрациклину (<italic>tetM</italic>), а также к хлорамфениколу (у 66,7% изолятов <italic>cat</italic>); чувствительны к ванкомицину (МПК 1,0 мкг/мл), линезолиду в 100% случаев. MRSA ST8 устойчивы к аминогликозидам (<italic>aacA</italic><italic>-</italic><italic>aphD</italic><italic>, </italic><italic>aadD</italic>), линкозамидам/макролидам (<italic>ermC</italic>), тетрациклинам (<italic>tetK</italic>), хлорамфениколу (<italic>cat</italic>); 100% чувствительны к фторхинолонам, рифампицину, сульфаметаксазолу, ванкомицину (МПК 1,0 мкг/мл), даптомицину, линезолиду. <italic>Выводы</italic>. Установлено, что представители порядка <italic>Enterobacterales</italic><italic>, А. </italic><italic>baumannii</italic><italic>, </italic><italic>P</italic><italic>. </italic><italic>aeruginosa</italic>, MRSA сохраняют высокую антибиотикорезистентность, механизмы которой связаны с мутациями, в том числе с изменением мишени действия, наличием генов, обеспечивающих продукцию модифицирующих ферментов, инактивацию антибактериального препарата, защиту рибосом.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>multi-resistance strains</kwd><kwd>molecular genetic mechanisms</kwd><kwd>cancer patients</kwd><kwd>purulent-inflammatory complications</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>штаммы со множественной резистентностью</kwd><kwd>молекулярно-генетические механизмы</kwd><kwd>онкологические больные</kwd><kwd>гнойно-воспалительные осложнения</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="ru">Работа выполнена в рамках государственного задания Министерства здравоохранения РФ по теме АААА-А18-118122990007-0 «Молекулярно-генетические основы патогенности и антибиотикорезистентности актуальных нозокомиальных и внебольничных возбудителей гнойно-воспалительных заболеваний различного генеза» (2015—2016 гг. и 2017—2018 гг.) и поддержана Российским научным фондом в рамках конкурса 2018 г. «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными, по проекту «Механизмы формирования успешных генетических линий множественно резистентных гипервирулентных Kleb siella pneumoniae» (проект № 18-75-10117).</funding-statement></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>1.	Белоусова Т.А. Инфекционные осложнения в колоректальной хирургии // Вопросы онкологии. 2012. Т. 58, № 6. С. 736—743.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>2.	Григорьевская З.В., Петухова И.Н., Багирова Н.С., Шильникова И.И., Терещенко И.В., Григорьевский Е.Д., Дмитриева Н.В. Нозокомиальные инфекции у онкологических больных: проблема нарастающей резистентности грамотрицательных микроорганизмов // Сибирский онкологический журнал. 2017. Т. 16, № 1. С. 91—97.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>3.	Давыдов М.И., Дмитриева Н.В. Инфекции в онкологии. М.: Практическая медицина, 2009. 472 с.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>4.	Дмитриева Н.В., Петухова И.Н. Инфекционные осложнения в онкологической клинике // Практическая онкология. 2001. Т. 2, № 1 (5). С. 18-20.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>5.	Дмитриева Н.В., Эйдельштейн М.В., Агинова В.В., Григорьевская З.В., Петухова И.Н., Терещенко И.В., Багирова Н.С., Дьякова С.А., Калинчук Т.А., Дмитриева А.И., Шек Е.А., Склеенова Е.Ю. Инфекции, вызванные Acinetobacter bau-mannii, у онкологических больных // Сибирский онкологический журнал. 2019. Т. 18, № (3). С. 26-33.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>6.	Дрие Л., Броссье Ф., Сугаков В., Жарлье В. Фенотипическое определение Enterobacter — продуцентов в-лактамаз расширенного спектра: обзор и руководство по проведению испытаний // Клиническая микробиология и инфекционные заболевания. 2008. Т. 14 (Прил. 1). С. 90-103.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>7.	Карабак В.И. Микробиологический мониторинг за возбудителями нозокомиальных инфекций (на примере отделений реанимации и интенсивной терапии) // Антибиотики и химиотерапия. 2000. Т. 45, № 3. С. 20-23.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>8.	Лазарева И.В., Агеевец В.А., Ершова Т.А., Зуева Л.П., Гончаров А.Е., Дарьина М.Г., Светличная Ю.С., Усков А.Н., Сидоренко С.В. Распространение и антибактериальная резистентность грамотрицательных бактерий, продуцентов карбапенемаз, в Санкт-Петербурге и некоторых других регионах Российской Федерации // Антибиотики и химиотерапия. 2000. Т. 61. С. 11-12.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>9.	Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии / Под ред. Л.С. Страчунского, Ю.Б. Белоусова, С.Н. Козлова. 2007. URL: http://www.antibiotic.ru/ab/index.shtml (25.11.2020)</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>10.	Сидоренко С.В., Резван С.П., Еремина Л.В. Этиология тяжелых госпитальных инфекций в отделениях реанимации и антибиотикорезистентность среди их возбудителей // Антибиотики и химиотерапия. 2005, Т. 50, № 2-3. С. 33-41.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>11.	Туркутюков В.Б. Молекулярно-генетический мониторинг резистентности микроорганизмов к антибиотикам // Тихоокеанский медицинский журнал. 2011. № 2. С. 28-31.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>12.	Хирургические инфекции: руководство / Под ред. И.А. Ерюхина, Б.Р. Гельфанда, С.А. Шляпникова. СПб.: Питер, 2003. 864 с.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>13.	Хохлова О.Е., Перьянова О.В., Боброва О.П., Сергеева В.В., Модестов А.А., Еремеева О.Г., Поткина Н.К., Капшук Д.Н., Алабушева А.В., Дыхно Ю.А., Ямамото Т. Микробиологический мониторинг гнойных осложнений у онкологических больных // Вопросы онкологии. 2018. Т. 64, № 1. С. 121-125.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>14.	Яковлев С.В. Госпитальные инфекции, вызванные резистентными грамотрицательными микроорганизмами, клиническое значение и современные возможности терапии // Инфекции и антимикробная терапия. 2004. Т. 6, № 4. С. 133-136.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>15.	Akiyoshi T., Ueno M., Fukunaga Y., Nagayama S., Fujimoto Y., Konishi T., Kuroyanagi H., Yamaguchi T. Effect of body mass index on short-term outcomes of patients undergoing laparoscopic resection for colorectal cancer: a single institution experience in Japan. Surg. Laparosc. Endosc. Percutan. Tech., 2011, vol. 21, pp. 409—414. doi: 10.1097/SLE.0b013e31822e5fdc</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>16.	Alberti C., Brun-Buisson C., Burchardi H., Martin C., Goodman S., Artigas A., Sicignano A., Palazzo M., Moreno R., Boulme R., Lepage E., Gall Le R. Epidemiology of sepsis and infection in ICU patients from an international multicentre cohort study. Intens. Care Med, 2002, vol. 28, pp. 108-121. doi: 10.1007/s00134-001-1143-z</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>17.	Avritscher E.B., Cooksley C.D., Rolston K.V., Swint J.M., Delclos G.L., Franzini L., Swisher S.G., Walsh G.L., Mansfield P.F., Elting L.S. Serious postoperative infections following resection of common solid tumors: outcomes, costs, and impact of hospital surgical volume. Support. Care Cancer, 2014, no. 22, pp. 527-535. doi: 10.1007/s00520-013-2006-1</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>18.	Choi S.M., Kim S.H., Kim H.J., Lee D.G., Choi J.H., Yoo J.H., Kang J.H., Shin W.S., Kang M.W. Multiplex PCR for the detection of genes encoding aminoglycoside modifying enzymes and methicillin resistance among Staphylococcus species. J. Korean Med. Sci., 2003, vol. 18, no. 5, pp. 631-636. doi: 10.3346/jkms.2003.18.5.631</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>19.	David M.Z., Daum R.S. Community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus: epidemiology and clinical consequences of an emerging epidemic. Clin. Microbiol. Rev., 2010, vol. 23, no. 3, pp. 616-687. doi: 10.1128/CMR.00081-09</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>20.	Ellington M.J., Hope R., Livermore D.M., Kearns A.M., Henderson K., Cookson B.D., Pearson A., Johnson A.P. Decline of EMRSA-16 amongst methicillin-resistant Staphylococcus aureus causing bacteraemias in the UK between 2001 and 2007. J. Antimicrob. Chemother., 2010, vol. 65, no. 3, pp. 446-448. doi: 10.1093/jac/dkp448</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>21.	Evans B.A., Amyes S.G. OXA Р-Lactamases. Clin. Microbiol. Rev, 2014, vol. 27, no. 2, pp. 241-263. doi: 10.1128/CMR.00117-13</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>22.	Fagon J.Y., Chastre J., Vuagnat A., Trouillet J.L., Novara A., Gibert C. Nosocomial pneumonia and mortality among patients in intensive care units. JAMA, 1996, vol. 275, no. 11, pp. 866-869. doi:10.1001/jama.1996.03530350048033</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>23.	Falagas M.E., Bakossi A., Pappas V.D., Holevas P.V., Bouras A., Stamata E. Secular trends of blood isolates in patients from a rural area population hospitalized in a tertiary center in a small city in Greece. BMC Microbiol., 2006, vol. 6, no. 1: 41. doi: 10.1186/14712180-6-41</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>24.	International Working Group on the Classification of Staphylococcal Cassette Chromosome Elements (IWG-SCC). Classification of staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec): guidelines for reporting novel SCCmec elements. Agents Chemother., 2009, vol. 53, pp. 4961-4967. doi: 10.1128/AAC.00579-09</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>25.	Johnson A.P., Pearson A., Duckworth G. Surveillance and epidemiology of MRSA bacteraemia in the UK. J. Antimicrob. Chemother., 2005, vol. 56, no. 3, pp. 455-462. doi: 10.1093/jac/dki266</mixed-citation></ref><ref id="B26"><label>26.</label><mixed-citation>26.	Khokhlova O.E., Hung W.C., Wan T.W., Iwao Y., Takano T., Higuchi W., Yachenko S.V., Teplyakova O.V., Kamshilova V.V., Kotlovsky Y.V., Nishiyama A., Reva I.V., Sidorenko S.V., Peryanova O.V., Reva G.V., Teng L.J., Salmina A.B., Yamamoto T. Healthcare- and community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and fatal pneumonia with pediatric deaths in Krasnoyarsk, Siberian Russia: unique MRSA's multiple virulence factors, genome, and stepwise evolution. PLoS One, 2015, vol. 1, pp. 1-30. doi: 10.1371/journal.pone.0128017</mixed-citation></ref><ref id="B27"><label>27.</label><mixed-citation>27.	Kondo Y., Ito T., Ma X.X., Watanabe S., Kreiswirth B.N., Etienne J., Hiramatsu K. Combination of multiplex PCRs for staphylococcal cassette chromosome mec type assignment: rapid identification system for mec, ccr, and major differences in junkyard regions. Antimicrob. Agents Chemother., 2007, vol. 51, pp. 264-274. doi: 10.1128/AAC.00165-06</mixed-citation></ref><ref id="B28"><label>28.</label><mixed-citation>28.	Lee H.G., Jang J., Choi J.E. Blood stream infections in patients in the burn intensive care unit. Infect. Chemother., 2013, vol. 45, no. 2, pp. 194-201. doi: 10.3947/ic.2013.45.2.194</mixed-citation></ref><ref id="B29"><label>29.</label><mixed-citation>29.	Mandel G.L. Principles and practice of infections diseases. 9th ed. London: Churchill Livingstone, 2019. 4176 р.</mixed-citation></ref><ref id="B30"><label>30.</label><mixed-citation>30.	Mariani-Kurkdjian P., Doit C., Bingen E. Extended-spectrum beta-lactamase producing-enterobacteriaceae. Arch. Pediatr., 2012, no. 3, pp. 93-96. doi: 10.1016/S0929-693X(12)71280-0</mixed-citation></ref><ref id="B31"><label>31.</label><mixed-citation>31.	Martineau F., Picard F.J., Lansac N., Menard C., Roy P.H., Ouellette M., Bergeron M.G. Correlation between the resistance genotype determined by multiplex PCR assays and the antibiotic susceptibility patterns of Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis. Antimicrob. Agents Chemother., 2000, vol. 44, no. 2, pp. 231-238. doi: 10.1128/aac.44.2.231-238.2000</mixed-citation></ref><ref id="B32"><label>32.</label><mixed-citation>32.	McManus B.A., Coleman D.C., Deasy E.C., Brennan G.I., Connell B.O., Monecke S., Ehricht R., Leggett B., Leonard N., Shore A.C. Comparative genotypes, staphylococcal cassette chromosome mec (sccmec) genes and antimicrobial resistance amongst Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus haemolyticus isolates from infections in humans and companion animals. PLoS One, 2015, no. 9, pp. 1-18. doi: 10.1371/journal.pone.0138079</mixed-citation></ref><ref id="B33"><label>33.</label><mixed-citation>33.	Peleg A.Y., Seifert H., Paterson D.L. Acinetobacter baumannii: emergence of a successful pathogen. Clin. Microbiol. Rev., 2008, no. 21, pp. 538-582. doi: 10.1128/CMR.00058-07</mixed-citation></ref><ref id="B34"><label>34.</label><mixed-citation>34.	Pulcini C., Binda F., Lamkang A.S., Trett A., Charani E. Developing core elements in checklist items fro global hospital antimicrobial stewardship programmes: a consensus approach. Clin. Microbiol. Inf., 2019, vol. 25, no. 1, pp. 20-25. doi: 10.1016/j.cmi.2018.03.033</mixed-citation></ref><ref id="B35"><label>35.</label><mixed-citation>35.	Ray S., Anand D., Purwar S., Samanta A., Upadhey K.V. Association of high mortility with extended-spectrum-beta-lacta-mases (ESBL) positive cultures in community aquired infections. J. Critical Care, 2018, no. 44, pp. 255-260. doi: 10.1016/j.jcrc.2017.10.036</mixed-citation></ref><ref id="B36"><label>36.</label><mixed-citation>36.	Rolston K.V., Nesher L., Tarrand T.J. Current microbiology of surgical site infections in patients with cancer: a retrospective review. Inf. Dis. Ther., 2014, no. 3, pp. 245-256. doi: 10.1007/s40121-014-0048-4</mixed-citation></ref><ref id="B37"><label>37.</label><mixed-citation>37.	Takano T., Higuchi W., Zaraket H., Otsuka T., Baranovich T., Enany S., Saito K., Isobe H., Dohmae S., Ozaki K., Takano M., Iwao Y., Shibuya M., Okubo T., Yabe S., Shi D., Reva I., Teng L.J., Yamamoto T. Novel characteristics of community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains belonging to multilocus sequence type 59 in Taiwan. Antimicrob. Agents Chemother., 2012, vol. 56, no. 12, pp. 6441-6441. doi: 10.1128/AAC.01001-07</mixed-citation></ref><ref id="B38"><label>38.</label><mixed-citation>38.	Takano T., Hung W.C., Shibuya M., Higuchi W., Iwao Y., Nishiyama A., Reva I., Khokhlova O.E., Yabe S., Ozaki K., Takano M., Yamamoto T. A new local variant (ST764) of the globall y disseminated ST5 lineage of hospital-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) carrying the virulence determinants of community-associated MRSA. Antimicrob. Agents Chemother. 2013, vol. 57, pp. 1589-1595. doi: 10.1128/AAC.01147-12</mixed-citation></ref><ref id="B39"><label>39.</label><mixed-citation>39.	Unal S., Garcia-Rodriguez J.A. Activity of meropenem and comparators against Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter spp. Isolated in the MYSTIC Program, 2002—2004. Diagn. Microbiol. Infect. Dis., 2005, vol. 53, no. 4, pp. 256—271. doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2005.10.002</mixed-citation></ref><ref id="B40"><label>40.</label><mixed-citation>40.	Warnes S.L., Highmore C.J., Keevil C.W. Horizontal transfer of antibiotic resistance genes on abiotic touch surfaces: implications for public health. mBio, 2012, vol. 3, no. 6, pp. 489—501. doi: 10.1128/mBio.00489-12</mixed-citation></ref><ref id="B41"><label>41.</label><mixed-citation>41.	Wilson H., Torok M.E. Extended-spectrum-beta-lactamases-producing and carbapenem-producing Enterobacteriaceae. Microb. Genom., 2018, vol. 4, pp. 1—14. doi: 10.1099/mgen.0.000218</mixed-citation></ref><ref id="B42"><label>42.</label><mixed-citation>42.	Zwaluw K. van der, Haan A. de, Pluister G.N., Bootsma H.J., Neeling A.J. de, Schouls L.M. The carbapenem inactivation method (CIM), a simple and low-cost alternative for the Carba NP test to assess phenotypic carbapenemase activity in gram-negative rods. PLoS One, 2015, vol. 10, no. 3: e0123690. doi: 10.1371/journal.pone.0123690</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
