Russian Journal of Infection and ImmunityRussian Journal of Infection and ImmunityИнфекция и иммунитет2220-76192313-7398SPb RAACI12010.15789/2220-7619-2013-1-29-36ORIGINAL ARTICLESОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИENTEROBACTERIACAE, PRODUCING ESBLS AND METALLO-β-LACTAMASE NDM-1, ISOLATED IN HOSPITALS OF BALTIC REGION COUNTRIESШТАММЫ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ, ПРОДУЦИРУЮЩИЕ БЕТА-ЛАКТАМАЗЫ РАСШИРЕННОГО СПЕКТРА И МЕТАЛЛО-β-ЛАКТАМАЗУ NDM-1, ВЫДЕЛЕННЫЕ В СТАЦИОНАРАХ В СТРАНАХ БАЛТИЙСКОГО РЕГИОНАEgorovaS. A.ЕгороваС. А.
Russian Federation

к.м.н., научный сотрудник лаборатории кишечных инфекций

197101, Санкт-Петербург, ул. Мира, 14

egorova72@mail.ruKaftyrevaL. A.КафтыреваЛ. А.
Russian Federation
egorova72@mail.ruLipskayaL. V.ЛипскаяЛ. В.
Russian Federation
egorova72@mail.ruKonovalenkoI. B.КоноваленкоИ. Б.
Russian Federation
egorova72@mail.ruPyasetskayaM. F.ПясетскаяМ. Ф.
Russian Federation
egorova72@mail.ruKurchikovaT. S.КурчиковаТ. С.
Russian Federation
egorova72@mail.ruVedernikovaN. B.ВедерниковаН. Б.
Russian Federation
egorova72@mail.ruMorozovaO. T.МорозоваО. Т.
Russian Federation
egorova72@mail.ruSmirnovaM. V.СмирноваМ. В.
Russian Federation
egorova72@mail.ruPopenkoL. N.ПопенкоЛ. Н.
Russian Federation
egorova72@mail.ruLubushkinaM. I.ЛюбушкинаМ. И.
Russian Federation
egorova72@mail.ruSavochkinaJ. A.СавочкинаЮ. А.
Russian Federation
egorova72@mail.ruMakarovaM. A.МакароваМ. А.
Russian Federation
egorova72@mail.ruSuzhaevaL. V.СужаеваЛ. В.
Russian Federation
egorova72@mail.ruOstankovaJ. V.ОстанковаЮ. В.
Russian Federation
egorova72@mail.ruIvanovaM. N.ИвановаМ. Н.
Estonia
egorova72@mail.ruPavelkovichA. M.ПавелковичА. М.
Estonia
egorova72@mail.ruNaaberP.НааберП.
Estonia
egorova72@mail.ruSeppE.СеппЭ.
Estonia
egorova72@mail.ruKõljalgS.КыльялгС.
Estonia
egorova72@mail.ruMiciulevicieneJ.MицюлявичeнeИ.
Lithuania
egorova72@mail.ruBalodeA.БалодеА.
Latvia
egorova72@mail.ruФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера, Санкт-ПетербургГородская клиническая больница № 40, Санкт-ПетербургГородская клиническая больница № 31, Санкт-ПетербургДетская городская клиническая больница № 5, Санкт-ПетербургДетская городская больница № 17, Санкт-ПетербургГородская больница Святого Великомученика Георгия, Санкт-ПетербургДетская городская больница № 1, Санкт-ПетербургГородская Мариинская больница, Санкт-ПетербургНИИ скорой помощи имени И.И. Джанелидзе, Санкт-ПетербургФБУН Центральный НИИ эпидемиологии, МоскваВосточная Центральная больница, ТаллинУниверситет Тарту, ТартуВильнюсскaя городская клиническая больница, ВильнюсУниверситетская клиническая больница им. Пaула Страдыня, Рига040120133129360707201407072014Copyright ©; 2014, Egorova S.A., Kaftyreva L.A., Lipskaya L.V., Konovalenko I.B., Pyasetskaya M.F., Kurchikova T.S., Vedernikova N.B., Morozova O.T., Smirnova M.V., Popenko L.N., Lubushkina M.I., Savochkina J.A., Makarova M.A., Suzhaeva L.V., Ostankova J.V., Ivanova M.N., Pavelkovich A.M., Naaber P., Sepp E., Kõljalg S., Miciuleviciene J., Balode A.Copyright ©; 2014, Егорова С.А., Кафтырева Л.А., Липская Л.В., Коноваленко И.Б., Пясетская М.Ф., Курчикова Т.С., Ведерникова Н.Б., Морозова О.Т., Смирнова М.В., Попенко Л.Н., Любушкина М.И., Савочкина Ю.А., Макарова М.А., Сужаева Л.В., Останкова Ю.В., Иванова М.Н., Павелкович А.М., Наабер П., Сепп Э., Кыльялг С., Mицюлявичeнe И., Балоде А.2014Egorova S.A., Kaftyreva L.A., Lipskaya L.V., Konovalenko I.B., Pyasetskaya M.F., Kurchikova T.S., Vedernikova N.B., Morozova O.T., Smirnova M.V., Popenko L.N., Lubushkina M.I., Savochkina J.A., Makarova M.A., Suzhaeva L.V., Ostankova J.V., Ivanova M.N., Pavelkovich A.M., Naaber P., Sepp E., Kõljalg S., Miciuleviciene J., Balode A.Егорова С.А., Кафтырева Л.А., Липская Л.В., Коноваленко И.Б., Пясетская М.Ф., Курчикова Т.С., Ведерникова Н.Б., Морозова О.Т., Смирнова М.В., Попенко Л.Н., Любушкина М.И., Савочкина Ю.А., Макарова М.А., Сужаева Л.В., Останкова Ю.В., Иванова М.Н., Павелкович А.М., Наабер П., Сепп Э., Кыльялг С., Mицюлявичeнe И., Балоде А.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://iimmun.ru/iimm/article/view/120

Abstract. We studied the prevalence of K. pneumoniae and E. coli resistance to extended spectrum cephalosporins and carbapenems, isolated from patients of eight hospitals in St-Petersburg from January to May, 2012. Prevalence of cephalosporin resistant isolates varied in different hospitals: E. coli – from 7,8 to 50%, K. pneumoniae – from 25,4 to 88,4%. Isolates produced extended spectrum beta-lactamases СТХ-М, mainly СТХ-М-1, also СТХ-М-2 and СТХ-М-9. Twenty two carbapenem-resistant K. pneumoniae strains (also resistant to other antimicrobials) were isolated in three hospitals. MALDI-TOF MS showed that carbapenem resistance was caused by carbapenemase. Carbapenemases of all isolates belonged to metallo-β-lactamases according to results of the ROSCO Diagnostica tests. The gene coding production of New Delhi metallo-β-lactamase (blaNDM-1) were detected in all strains. Our data confirmed that the main cephalosporin resistance mechanism of E. coli и K. pneumoniae in Baltic region (including Russia, St-Petersburg) is CTX-M-1 production. For the first time in Russia K. pneumoniae strains  producing metallo-β-lactamases NDM-1 were isolated in several hospitals of St-Petersburg.

Резюме. Изучали распространенность штаммов, устойчивых к цефалоспоринам расширенного спектра и карбапенемам, среди K. pneumoniae и E. coli, выделенных из клинического материала пациентов семи стационаров Санкт-Петербурга в период с января по май 2012 г. Доля штаммов, устойчивых к цефалоспоринам, колебалась в различных стационарах: E. coli — от 7,8 до 50%, K. pneumoniae — от 25,4 до 88,4%. Устойчивость была обусловлена продукцией бета-лактамаз расширенного спектра семейства СТХ-М, которые относились главным образом к группе СТХ-М-1, а также СТХ-М-2 и СТХ-М-9. В трех стационарах выявили 22 полирезистентных штамма K. pneumoniae, устойчивых к карбапенемам. Метод MАLDI-TOF MS показал, что резистентность к карбапенемам у всех штаммов была обусловлена продукцией карбапенемаз, которые согласно результатам тестов ROSCO Diagnostica относились к классу металло-β-лактамаз. У всех изученных штаммов выявлен ген металло-β-лактамазы New Delhi metallo-β-lactamase (blaNDM-1). Результаты проведенных исследований показали, что в странах Балтийского региона (включая Россию, Санкт-Петербург) ведущим механизмом резистентности к цефалоспоринам штаммов E. coli и K. pneumoniae, выделенных в стационарах, является продукция СТХ-М-1. Впервые в России выделены штаммы K. pneumoniae, продуцирующие металло-β-лактамазу NDM-1, причем одновременно в нескольких стационарах Санкт-Петербурга.

K. pneumoniaE. coliresistanceСТХ-МNDM-1K. pneumoniaeE. ColiрезистентностьСТХ-М, NDM-11. Кафтырева Л.А., Егорова С.А., Макарова М.А., Забровская А.В., Матвеева З.Н., Сужаева Л.В., Артамонова Ю.А. Характеристика биологических свойств E. coli O104:H4 — возбудителя крупной пищевой вспышки, возникшей в Германии в мае 2011 г. // Клиническая лабораторная диагностика. — 2012. — № 1. — С. 44–46.2. Решедько Г.К., Шебников А.Г., Морозов М.В., Решедько Л.А. Escherichia coli как возбудитель нозокомиальных инфекций в ОРИТ // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. — 2011. — Т. 13, № 4. — С. 314–321.3. Рябкова Е.Л., Иванчик Н.В., Сухорукова М.В., Шебников А.Г., Решедько Г.К. Резистентность нозокомиальных штаммов Escherichia coli в стационарах России // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. — 2009. — Т. 11, № 2. — С. 161–169.4. Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Шевченко О.В. Распространенность и молекулярная эпидемиология грамотрицательных бактерий, продуцирующих металло-бета-лактамазы, в России, Беларуси и Казахстане // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. — 2012. — Т. 14, № 2. — С. 132–152.5. Antimicrobial resistance surveillance in Europe 2011. Surveillance report http://www.ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/antimicrobial-resistance-surveillance-europe-2011.pdf.6. Birkett C.I., Ludlam H.А., Woodford N., Brown D.F.J., Brown N.M., Roberts M.T.M., Milner N., Curran M.D. Real-time TaqMan PCR for rapid detection and typing of genes encoding CTX-M extendedspectrum b-lactamases // J. Medical. Microbiol. — 2007. — Vol. 56. — P. 52–55.7. Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae containing New Delhi metallo-beta-lactamase in two patients — Rhode Island, March 2012. CDC Morbidity and Mortality Weekly Report. — 2012. — Vol. 61, N 24. — P. 446–448. — Режим доступа: http://www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtml/mm6124a3.htm?s_cid=mm6124a3_w.8. Chihara S., Okuzumi K., Yamamoto Y., Oikawa S., Hishinuma A. First case of New Delhi metallo-β-lactamase 1-producing Escherichia coli infection in Japan // Clin. Infect. Dis. — 2011. — Vol. 52, N 1. — P. 153–154.9. Danny C.T. Ong, Tse-Hsien Koh, Nur Syahidah, Prabha Krishnan, Thean Yen Tan. Rapid detection of the blaNDM-1 gene by real-time PCR // J. Antimicrob. Chemother. — 2011. — Vol. 66, N 7. — P. 1647–1649.10. Dortet L., Poirel L., Anguel N., Nordmann P. New Delhi metallo β-lactamase 4-producing Escherichia coli in Cameroon // Emerg. Infect. Dis. — 2012. — Vol. 18, N 9. — P. 1540–1542.11. Egorova S., Kaftyreva L., Grimont P.A.D., Weill F.-X. Prevalence and characterization of extended-spectrum cephalosporin-resistant nontyphoidal Salmonella isolates in adults in Saint Petersburg, Russia (2002–2005) // Microb. Drug. Resist. — 2007. — Vol. 13, N 2. — P. 102–107.12. Kumarasamy K.K., Toleman M.A., Walsh T.R., Bagaria J., Butt F., Balakrishnan R., Chaudhary U., Doumith M., Giske C.G., Irfan S., Krishnan P., Kumar A.V., Maharjan S., Mushtaq S., Noorie T., Paterson D.L., Pearson A., Perry C., Pike R., Rao B., Ray U., Sarma J.B., Sharma M., Sheridan E., Thirunarayan M.A., Turton J., Upadhyay S., Warner M., Welfare W., Livermore D.M., Woodford N. Emergence of a new antibiotic resistance mechanism in India, Pakistan, and the UK: a molecular, biological, and epidemiological study // Lancet Infect. Dis. — 2010. — Vol. 10, N 9. — P. 597–602.13. Mulvey M.R., Grant J.M., Plewes K., Roscoe D., Boyd D.A. New Delhi metallo-β-lactamase in Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli, Canada // Emerg. Infect. Dis. — 2011. — Vol. 17, N 1. — P. 103–106.14. Nordmann P., Naas T., Poirel L. Global spread of carbapenemase-producing Enterobacteriacae // Emerg. Infect. Dis. — 2011. — Vol. 17, N 10. — P. 1791–1798.15. Poirel L., Lagrutta E., Taylor P., Pham J., Nordmann P. Emergence of metallo-β-lactamase NDM-1-producing multidrug-resistant Escherichia coli in Australia // Antimicrob. Agents Chemother. — 2010. — Vol. 54, N 11. — P. 4914 – 4916.16. Poirel L., Revathi G., Bernabeu S., Nordmann P. Detection of NDM-1-producing Klebsiella pneumoniae in Kenya // Antimicrob. Agents Chemother. — 2011. — Vol. 55, N 2. — P. 934–936.17. Shevchenko O.V., Mudrak D.Y., Skleenova E.Y., Kozyreva V.K., Ilina E.N., Ikryannikova L.N., Alexandrova I.A., Sidorenko S.V., Edelstein M.V. First detection of VIM-4metallo-beta-lactamase-producing Escherichia coli in Russia // Clin. Microbiol. Infect. — 2012. — Vol. 18. — P. 214–217.18. Sparbier K., Schubert S., Weller U., Boogen C., Kostrzewa M. Matrix-assisted laser desorption ionization — time of flight mass spectrometry-based functional assay for rapid detection of resistance against β-lactam antibiotics // J. Clin. Microbiol. — 2012. — Vol. 50, N 3. — P. 927–937.19. Updated ECDC risk assessment on the spread of New Delhi metallo-β-lactamase and its variants within Europe. ECDC Technical report. (http://www.ecdc.europa.eu/en/publications/Publications/1111_TER_Risk-assessment-NDM.pdf).20. Walsh T.R., Weeks J., Livermore D.M., Toleman M.A. Dissemination of NDM-1 positive bacteria in the New Delhi environment and its implications for human health: an environmental point prevalence study // Lancet Infect. Dis. — 2011. — Vol. 11, N 5. — P. 355–362.